الطرف الكربوكسيلي
الطرف الكربوكسيلي (المعروف أيضًا باسم الطرف الكربوكسيلي ، أو ذيل الكربوكسيل ، أو الطرف الكربوكسيلي ، أو الطرف الكربوكسيلي ، أو الطرف الكربوكسيلي ، أو الطرف الكربوكسيلي ) هو نهاية سلسلة الأحماض الأمينية ( بروتين أو عديد ببتيد )، وينتهي بمجموعة كربوكسيل حرة (-COOH). عند ترجمة البروتين من الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA )، يتم تكوينه من الطرف الأميني (N) إلى الطرف الكربوكسيلي (C). ويُكتب تسلسل الببتيدات عادةً بوضع الطرف الكربوكسيلي على اليمين، ثم يُكتب التسلسل من الطرف الأميني إلى الطرف الكربوكسيلي.
كيمياء
يحتوي كل حمض أميني على مجموعة كربوكسيل ومجموعة أمين . ترتبط الأحماض الأمينية ببعضها لتكوين سلسلة من خلال تفاعل نزع الماء الذي يربط مجموعة الأمين في حمض أميني بمجموعة الكربوكسيل في الحمض الأميني التالي. وبالتالي، تحتوي سلاسل الببتيد على طرف يحتوي على مجموعة كربوكسيل غير مرتبطة، يُسمى الطرف الكربوكسيلي (C-terminus)، وطرف يحتوي على مجموعة أمين غير مرتبطة، يُسمى الطرف الأميني ( N-terminus) . تُصنّع البروتينات طبيعيًا بدءًا من الطرف الأميني (N-terminus) وانتهاءً بالطرف الكربوكسيلي (C-terminus). [ 1 ]
وظيفة
إشارات الاحتفاظ الطرفية C
بينما يحتوي الطرف الأميني (N-terminus) للبروتين غالبًا على إشارات توجيه ، قد يحتوي الطرف الكربوكسيلي (C-terminus) على إشارات احتجاز لفرز البروتينات. أكثر إشارات الاحتجاز شيوعًا في الشبكة الإندوبلازمية هي تسلسل الأحماض الأمينية -KDEL ( لايسين - أسبارتات - غلوتامات - ليوسين ) أو -HDEL ( هيستيدين - أسبارتات - غلوتامات - ليوسين) في الطرف الكربوكسيلي. يحافظ هذا التسلسل على البروتين داخل الشبكة الإندوبلازمية ويمنعه من دخول المسار الإفرازي .
إشارة استهداف البيروكسيسوم
يعمل التسلسل -SKL (Ser-Lys-Leu) أو ما شابه ذلك بالقرب من الطرف C كإشارة استهداف البيروكسيسوم 1، مما يوجه البروتين إلى البيروكسيسوم .
تعديلات الطرف الكربوكسيلي
يمكن تعديل الطرف الكربوكسيلي للبروتينات بعد الترجمة ، وغالبًا ما يتم ذلك عن طريق إضافة مرساة دهنية إلى الطرف الكربوكسيلي مما يسمح بإدخال البروتين في غشاء دون وجود نطاق عبر الغشاء .
البرينيليشن
يُعدّ البرينيل أحد أشكال تعديل الطرف الكربوكسيلي . خلال عملية البرينيل، تُضاف رابطة غشائية من نوع فارنيسيل أو جيرانيل جيرانيل إيزوبرينويد إلى بقايا السيستين القريبة من الطرف الكربوكسيلي. غالبًا ما تُعدّل بروتينات G الصغيرة المرتبطة بالغشاء بهذه الطريقة.
نقاط ارتكاز مؤشر الأداء العالمي
يُعدّ إضافة جزيء فوسفوجليكان، وهو جليكوزيل فوسفاتيديل إينوزيتول (GPI)، شكلاً آخر من أشكال تعديل الطرف الكربوكسيلي ، حيث يعمل كمرساة غشائية. ترتبط مرساة GPI بالطرف الكربوكسيلي بعد انقسام بروتيني لببتيد أولي طرفي كربوكسيلي. ويُعدّ بروتين البريون المثال الأبرز لهذا النوع من التعديل .
المثيلة
يتم مثيلة الليوسين الطرفي C عند مجموعة الكربوكسيل بواسطة إنزيم ناقل ميثيل كربوكسيل الليوسين 1 في الفقاريات، مما يؤدي إلى تكوين إستر الميثيل . [ 2 ]
نطاق الطرف الكربوكسيلي
يؤدي النطاق الطرفي الكربوكسيلي لبعض البروتينات وظائف متخصصة. في البشر، يتكون النطاق الطرفي الكربوكسيلي لبوليميراز الحمض النووي الريبي II عادةً من 52 تكرارًا للتسلسل Tyr -Ser - Pro - Thr -Ser-Pro-Ser. [ 3 ] يسمح هذا للبروتينات الأخرى بالارتباط بالنطاق الطرفي الكربوكسيلي لبوليميراز الحمض النووي الريبي لتنشيط نشاط البوليميراز. تشارك هذه النطاقات بعد ذلك في بدء نسخ الحمض النووي، وتغطية نسخة الحمض النووي الريبي ، والارتباط بالجسيم الرابط لعملية ربط الحمض النووي الريبي . [ 4 ]
انظر أيضاً
- الطرف الأميني
- TopFIND ، قاعدة بيانات علمية تغطي البروتيازات ، وخصوصية مواقع الانقسام الخاصة بها، والركائز، والمثبطات، ونهايات البروتين الناتجة عن نشاطها
مراجع
- ↑ ألبرتس، بروس؛ جونسون، ألكسندر؛ لويس، جوليان؛ راف، مارتن؛ روبرتس، كيث؛ والتر، بيتر (2002). "من الحمض النووي الريبوزي إلى البروتين" . البيولوجيا الجزيئية للخلية. الطبعة الرابعة . جارلاند ساينس.
- ↑ "RHEA:48544" . المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية .
- ↑ مينهارت أ، كرامر ب (يوليو 2004). "التعرف على النطاق الكربوكسيلي الطرفي لإنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي II بواسطة عوامل معالجة الحمض النووي الريبي 3'" . نيتشر . 430 (6996): 223-226 . Bibcode : 2004Natur.430..223M . doi : 10.1038/nature02679 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0015-8512-8 . PMID 15241417. S2CID 4418258 .
- ↑ بريكي دبليو جيه، غرينليف إيه إل (يونيو 1995). "دراسات وظيفية لنطاق التكرار الطرفي الكربوكسيلي لبوليميراز الحمض النووي الريبي II في ذبابة الفاكهة في الكائن الحي" . علم الوراثة . 140 (2): 599-613 . doi : 10.1093/genetics/140.2.599 . PMC 1206638. PMID 7498740 .
- التعديل ما بعد الترجمة
- بنية البروتين