Addgene

Addgene هو مستودع بلازميدات غير ربحي . يُسهّل Addgene تبادل المواد الوراثية بين المختبرات من خلال توفير البلازميدات وبيانات الاستنساخ المرتبطة بها للمختبرات غير الربحية والأكاديمية حول العالم. يوفر Addgene قاعدة بيانات مجانية على الإنترنت لمعلومات ومراجع استنساخ البلازميدات، بما في ذلك قوائم هياكل النواقل الشائعة الاستخدام، وبلازميدات الفيروسات البطيئة الشائعة ، وبروتوكولات الاستنساخ الجزيئي .

تأسست Addgene عام 2004 على يد ميلينا فان، وكينيث فان، وبنجي تشين. ^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]} وقد أُنشئ هذا المستودع استجابةً للحاجة إلى خدمة تدعم الوصول إلى مواد البحث القائمة على الحمض النووي ومشاركتها بين أفراد المجتمع العلمي. ^{[ 3 ]}

يقع المقر الرئيسي لشركة Addgene في ووترتاون، ماساتشوستس .

تقبل Addgene البلازميدات من الباحثين، ثم تقوم بأرشفتها وتوزيعها عند الطلب.

تغطي المنظمة تكاليف تشغيل صيانة المجموعة وتحسينها من خلال فرض رسوم رمزية على العلماء الذين يطلبون البلازميدات. ^{[ 4 ] [ 5 ]}

في عام 2014، ضمّ مستودع Addgene ثلاثين ألف بلازميد، أودعتها سبعة عشر مختبرًا. ^{[ 6 ]} وبحلول عام 2024، نما حجم المجموعة إلى أكثر من 147 ألف بلازميد، وقدّمت خدماتها لأكثر من مليوني ناقل في أكثر من 110 دول. ^{[ 3 ]} تحتوي مجموعة البلازميدات على بلازميدات تُستخدم في وظائف مثل هندسة الجينوم (بما في ذلك تقنية CRISPR)، والتعبير الجيني ، وإسكات الجينات باستخدام shRNA ، ونقل الجينات بواسطة الفيروسات، والكشف عن miRNA ونشاط المحفزات. تشمل مجموعة البلازميدات ما يلي:

• هندسة الجينوم
  • تقنية كريسبر
  • مجموعات نوكليازات المؤثرات الشبيهة بمنشطات النسخ (TALEN)
  • مجموعات نوكلياز أصابع الزنك
• العمود الفقري الفارغ
  • التعبير الخاص بالنوع
  • علامات الإبيتوب
  • بروتينات الاندماج
  • علامات قابلة للتحديد
  • علامة فلورية
• النواقل الفيروسية
  • الفيروسات القهقرية/الفيروسات البطيئة
  • الفيروس الغدي
  • فيروس AAV
• التعبير عن الحمض النووي التكميلي (cDNA)
• التعبير عن shRNA

أدوات البيولوجيا الجزيئية

قاعدة بيانات المتجهات - قائمة منسقة تضم أكثر من 4000 هيكل ناقل، بما في ذلك معلومات الاستنساخ ذات الصلة وظروف نمو البكتيريا.

محلل التسلسل — أداة برمجية من Addgene لإنشاء خرائط البلازميد من التسلسلات ذات الميزات المشروحة ومواقع التقييد.

مرجع البيولوجيا الجزيئية - مجموعة من المراجع الخاصة بكواشف البيولوجيا الجزيئية، مثل البادئات، وإنزيمات التقييد، وتركيزات المضادات الحيوية.

أدلة استنساخ البلازميد

أدلة الاستنساخ الجزيئي - مراجع لمساعدة العلماء في تصميم تجارب استنساخ البلازميد، بما في ذلك دروس تعليمية حول هضم إنزيمات التقييد والاستنساخ القائم على تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR).

بروتوكولات الاستنساخ الجزيئي - بروتوكولات محددة لمجموعة متنوعة من تقنيات استنساخ البلازميد، مثل عزل المستعمرات البكتيرية، وتنقية الحمض النووي عن طريق الترحيل الكهربائي الهلامي والتحويل البكتيري.

تتعاون Addgene مع المعاهد والاتحادات لتنظيم مجموعات البلازميدات لأغراض محددة. ومن أمثلة هذه التعاونات مجموعات خاصة من اتحاد علم الجينوم البنيوي ، واتحاد أصابع الزنك، واتحاد هجرة الخلايا، ومجموعة KLF ، ومؤسسة مايكل جيه فوكس . ^{[ 7 ]} وتتوفر البلازميدات لكل من المختبرات الأكاديمية والصناعية.

في عام 2020، تلقت شركة Addgene تمويلًا من برنامج المنح السريعة لدعم تكلفة الكواشف لأبحاث كوفيد-19 . ^{[ 8 ]}

ومن بين المودعين البارزين:

• 13 فائزًا بجائزة نوبل؛ جون جوردون ، شينيا ياماناكا ، بروس بوتلر ، ماريو كابيكي ، أندرو فاير ، ريتشارد أكسل ، إريك فيشاوس ، فيليب شارب ، روبرت ليفكوفيتز ، مارتن تشالفي ، روجر تسين ، جينيفر دودنا ، ويوهان ديزنهوفر .
• 8 فائزين بجائزة الاختراق في علوم الحياة؛ كوري بارجمان ، ديفيد بوتستين ، لويس سي. كانتلي ، هانز كليفرز ، تيتيا دي لانج ، بيرت فوجلستين ، روبرت واينبرج وشينيا ياماناكا .

تشترط شركة Addgene اتفاقيات نقل المواد (MTAs) لجميع المواد المنقولة عبرها لحماية الملكية الفكرية لمودعي البلازميدات. وقد طورت Addgene أحد أوائل الأنظمة الإلكترونية لإدارة اتفاقيات نقل المواد. ^{[ 9 ]} وباستخدام اتفاقية نقل المواد البيولوجية العالمية القياسية (UBMTA) وتطبيق التوقيعات الإلكترونية، يُسرّع نظام اتفاقيات نقل المواد الإلكترونية (eMTA) الخاص بشركة Addgene عملية الموافقة على طلبات البلازميدات.

حصلت شركة Addgene على جوائز للابتكار والبحث، بما في ذلك جائزة شبكة ماساتشوستس غير الربحية للتميز في الابتكارات، ^{[ 10 ] [ 11 ]} وجائزة برنامج كامبريدج لعام 2014 لمختبرات البحث والتطوير، ^{[ 12 ]} وجائزة ماساتشوستس للقيادة التكنولوجية (المرشح النهائي) لعام 2012. ^{[ 13 ]}

• الموقع الرسمي