ألفونسو فالنسيا

📅 آخر تحديث: ٣ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٣ أغسطس ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 1 صور
الموسوعة الحرة

ألفونسو فالنسيا عالم أحياء إسباني، وأستاذ في مؤسسة ICREA، والمدير الحالي لقسم علوم الحياة في مركز برشلونة للحوسبة الفائقة ، [ 9 ] والمعهد الوطني الإسباني للمعلوماتية الحيوية (INB-ISCIII)، ومنسق ركيزة البيانات في مبادرة الطب الشخصي الإسبانية، IMPaCT. وشغل منصب رئيس الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي من عام 2015 إلى عام 2018. [ 10 ]

ينصب اهتمامه البحثي على تطوير أساليب البيولوجيا الحاسوبية وتطبيقها على المشكلات الطبية الحيوية. وتُعتبر بعض الأساليب الحاسوبية التي طورها أعمالًا رائدة في مجالات مثل استخراج البيانات من النصوص البيولوجية، والتطور المشترك للبروتينات، وشبكات الأمراض، ومؤخرًا نمذجة الأنظمة الخلوية (التوائم الرقمية). وهو عضو في بعض أهم الاتحادات الدولية المعنية بالسرطان. أما على صعيد خدمة المجتمع، فهو من أوائل الداعمين لبنية ELIXIR التحتية، ومؤسس شبكات المعلوماتية الحيوية الإسبانية والدولية، والرئيس السابق للجمعية الدولية للمعلوماتية الحيوية (ISCB). كما يشغل منصب رئيس تحرير المجلة الرئيسية في هذا المجال (Bioinformatics OUP).

يركز بحثه على دراسة الأنظمة الطبية الحيوية باستخدام مناهج البيولوجيا الحاسوبية والمعلوماتية الحيوية. [ 5 ]

تعليم

درس فالنسيا علم الأحياء في جامعة كومبلوتنسي بمدريد ، وتدرب في علم الوراثة السكانية والفيزياء الحيوية . [ 11 ] في عام 1987، كان باحثًا زائرًا في مختبر الصليب الأحمر الأمريكي. [ 12 ] حصل على درجة الدكتوراه في البيولوجيا الجزيئية عام 1988 من جامعة مدريد المستقلة . [ 13 ] من عام 1989 إلى عام 1994، عمل كباحث ما بعد الدكتوراه في مختبر كريس ساندر في المختبر الأوروبي للبيولوجيا الجزيئية (EMBL) في هايدلبرغ ، حيث درس تطور وظائف البروتينات باستخدام مناهج تعتمد على التسلسل والبنية . [ 12 ] [ 14 ]

أرست ورقة بحثية نُشرت عام 1994 بعنوان "الطفرات المترابطة وتلامس الأحماض الأمينية في البروتينات" [ 15 ] ، والتي كان فالنسيا مؤلفها الرئيسي، فكرة أن الطفرات المترابطة في مواقع متناظرة في تسلسلات الحمض النووي في الكائنات الحية المختلفة قد تشير إلى أن تلك المواقع تتوافق مع بقايا الأحماض الأمينية المتقاربة فيزيائيًا في البروتين النهائي، مما يُسهم في التنبؤ بخرائط التلامس . وقد استُخدم هذا المصدر غير المُستغل سابقًا للمعلومات الجانبية في التنبؤ ببنية البروتين بفعالية متزايدة في العقد الثاني من الألفية الثانية، مما أدى في النهاية إلى نجاح خوارزمية AlphaFold 2 من DeepMind في عام 2020. [ 16 ]

بحث

في عام 1994، أسس فالنسيا مجموعة تصميم البروتين في المركز الوطني الإسباني للتكنولوجيا الحيوية (CNB) . [ 13 ] وكان رئيسًا لمجموعة البيولوجيا الهيكلية والحسابية في المركز الوطني الإسباني لأبحاث السرطان (CNIO). [ 13 ] وفي عام 2006، انتقل إلى المركز الوطني الإسباني لأبحاث السرطان (CNIO) مديرًا لبرنامج البيولوجيا الهيكلية والحوسبة الحيوية.

يشغل منذ عام 2016 منصب أستاذ في مؤسسة ICREA [ 17 ] ومدير قسم علوم الحياة في مركز برشلونة للحوسبة الفائقة (BSC). [ 18 ] [ 19 ]

بصفته عالم أحياء حاسوبية، ينصبّ تركيز عمله على الفهم الآلي للأنظمة البيولوجية، بما في ذلك السرطان وأمراض أخرى، وذلك من خلال الجمع بين المعلوماتية الحيوية، وعلم الأحياء الشبكي، وتقنيات التعلّم الآلي. وقد طوّر فريقه أنظمة في مجالات التنبؤ ببنية البروتين، وتفاعلات البروتين وشبكاته، وعلم الأحياء النظمي ، واستخراج النصوص والبيانات، مع تطبيقات في علم التخلق، وعلم جينوم السرطان [ 20 ] ، والأمراض المصاحبة. وتتلاقى كل هذه الأنشطة في موضوع الطب الشخصي، مع اهتمام خاص بالتفاعل مع الذكاء الاصطناعي والحوسبة عالية الأداء.

اعتبارًا من عام 2024نشرت فالنسيا أكثر من 450 ورقة بحثية محكمة ، [ 5 ] [ 21 ] [ 22 ] والتي تم الاستشهاد بها أكثر من 92000 مرة، [ 11 ] في مجلات علمية مرموقة ، منها Nature ، [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] وPNAS ، [ 6 ] وNucleic Acids Research ، [ 26 ] [ 27 ] وJournal of Molecular Biology ، [ 28 ] [ 29 ] [ 30 ] وBioinformatics ، [ 31 ] [ 32 ] [ 33 ] [ 34 ] وGenome Biology ، [ 2 ] [ 3 ] [ 35 ] [ 36 ] وPLOS Computational Biology ، [ 37 ] وPLOS Biology ، [ 38 ] و Nature Genetics ، [ 39 ] [ 40 ] و Nature Biotechnology [ 4 ] [ 41 ] أبحاث الجينوم ، [ 42 ] الكيمياء الحيوية ، [ 7 ] الرأي الحالي في البيولوجيا التركيبية ، [ 43 ] بيولوجيا الطبيعة التركيبية ، [ 8 ] اتجاهات في علم الوراثة ، [ 44 ] ومؤتمر الأنظمة الذكية للبيولوجيا الجزيئية . [ 45 ]

الجوائز والتكريمات

تم ترشيح فالنسيا كعضو مراسل في أكاديمية الطب في سرقسطة، إسبانيا، عام 2024. كما عُيّن أستاذاً باحثاً في المركز الوطني للبيولوجيا الجزيئية (CNB) عام 2005. [ 13 ] وكان عضواً مؤسساً في الجمعية الدولية للبيولوجيا الحاسوبية (ISCB)، وحصل على زمالة الجمعية عام 2010. [ 46 ] وشغل فالنسيا أيضاً منصب نائب رئيس الجمعية، وفي عام 2013 انتُخب رئيساً لها. [ 11 ] ومن عام 2015 إلى عام 2018، ترأس فالنسيا الجمعية خلفاً لبوركهارد روست . حصل فالنسيا على الدكتوراه الفخرية من جامعة الدنمارك التقنية (DTU)، وهو عضو منتخب في المنظمة الأوروبية للبيولوجيا الجزيئية (EMBO) . [ 47 ]

تشارك فالنسيا في العديد من الاتحادات الدولية، مثل Genecode/ ENCODE ، [ 23 ] [ 38 ] [ 42 ] والاتحاد الدولي لجينوم السرطان ، والاتحاد الدولي لأبحاث الأمراض النادرة (IRDiRC)، والاتحاد الدولي لعلم التخلق البشري . [ 41 ] تشغل فالنسيا منصب مديرة المعهد الوطني الإسباني للمعلوماتية الحيوية، وهو منصة تابعة لمعهد كارلوس الثالث الصحي (ISCIII)، وهو الفرع الإسباني للبنية التحتية الأوروبية لعلوم الحياة للمعلومات البيولوجية (ELIXIR) . [ 11 ]

يشغل حاليًا منصب المحرر التنفيذي المشارك لمجلة المعلوماتية الحيوية ، وهو عضو في هيئات التحرير لمجلات eLIFE وFEBS Letters وPeerJ وF1000 Prime.

مراجع

  1. ↑ هيرشمان، ل.؛ يه، أ.؛ بلاشكه، س.؛ فالنسيا، أ. (2005). "نظرة عامة على BioCreAtIvE: تقييم نقدي لاستخلاص المعلومات في علم الأحياء" . BMC Bioinformatics . 6 (ملحق 1): S1. doi : 10.1186/1471-2105-6-S1-S1 . PMC 1869002. PMID 15960821 .  
  2. 1 2 كرالينجر، م؛ مورغان، أ؛ سميث، ل؛ لايتنر، ف؛ تانابي، ل؛ ويلبر، ج؛ هيرشمان، ل؛ فالنسيا، أ (2008). "تقييم أنظمة استخراج النصوص في علم الأحياء: نظرة عامة على التحدي الثاني لمجتمع الإبداع البيولوجي" . علم الأحياء الجينومي . 9 (ملحق 2): S1. doi : 10.1186/gb-2008-9-s2- s1 . PMC 2559980. PMID 18834487 .  
  3. 1 2 كرالينجر، م؛ لايتنر، ف؛ رودريغيز-بيناغوس، س؛ فالنسيا، أ (2008). "نظرة عامة على مهمة استخراج بيانات التفاعل بين البروتينات في برنامج Bio Creative II" . علم الأحياء الجينومي . 9 (ملحق 2): S4. doi : 10.1186/gb-2008-9-s2-s4 . PMC 2559988. PMID 18834495 .  
  4. 1 2 لايتنر، ف؛ شاتر-أريامونتري، أ؛ مارديس، س.أ؛ سيول، أ؛ كرالينجر، م؛ ليكاتا، ل؛ هيرشمان، ل؛ سيزاريني، ج؛ فالنسيا، أ (2010). "تجربة FEBS Letters/Bio Creative II.5: إتاحة المعلومات البيولوجية". Nature Biotechnology . 28 (9): 897-9 . doi : 10.1038/nbt0910-897 . PMID 20829821. S2CID 5648695 .  
  5. 1 2 3 منشورات ألفونسو فالنسيا المفهرسة بواسطة جوجل سكولار
  6. 1 2 بورك، ب؛ ساندر، س؛ فالنسيا، أ (1992). "نطاق ATPase مشترك بين بروتينات دورة الخلية بدائية النواة، وكينيزات السكر، والأكتين، وبروتينات الصدمة الحرارية hsp70" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 89 (16 ) : 7290-4 . Bibcode : 1992PNAS...89.7290B . doi : 10.1073/pnas.89.16.7290 . PMC 49695. PMID 1323828 .  
  7. 1 2 فالنسيا، أ.؛ شاردان، ب.؛ ويتينغهوفر، أ.؛ ساندر، س. (1991). "عائلة بروتين راس: الشجرة التطورية ودور الأحماض الأمينية المحفوظة". الكيمياء الحيوية . 30 (19): 4637-4648 . doi : 10.1021/bi00233a001 . PMID 2029511. S2CID 43450157 .  
  8. 1 2 كاساري، ج؛ ساندر، س؛ فالنسيا، أ (1995). "طريقة للتنبؤ بالبقايا الوظيفية في البروتينات". بيولوجيا التركيب الطبيعي . 2 (2): 171-178 . doi : 10.1038/nsb0295-171 . PMID 7749921. S2CID 9454891 .  
  9. ^ "ملف ألفونسو فالنسيا يستعيد برشلونة كعاصمة للمعلومات الحيوية" . لا فانجارديا. 2017-03-07.
  10. ↑ "المسؤولون والمديرون السابقون" . www.iscb.org . مؤرشف من الأصل بتاريخ 10 أغسطس 2020. تم الاطلاع عليه بتاريخ 12 أبريل 2018 .
  11. 1 2 3 4 "ألفونسو فالنسيا، الرئيس المنتخب للاتحاد الدولي للبيسبول" (ملف PDF) . مؤرشف من النسخة الأصلية (ملف PDF) بتاريخ 10 يناير 2014..
  12. 1 2 "الكلمة الرئيسية - التفاصيل" . ISMB/ECCB 2011. الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي . تم الاطلاع عليه في 7 يناير 2014 .
  13. 1 2 3 4 "ألفونسو فالنسيا - cnio.es" . المركز الوطني للتحقيقات في الأورام . مؤرشفة من الأصلي بتاريخ 2014-07-20.
  14. ↑ "ألفونسو فالنسيا - احتضان" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 10 يناير 2014. تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 يناير 2014 .
  15. ↑ يو غوبل 1، سي ساندر، آر شنايدر، إيه فالنسيا، الطفرات المترابطة وتفاعلات البقايا في البروتينات ، بروتينات 18 (4): 309-17. (1994) doi : 10.1002/prot.340180402
  16. ↑ كريستينا سايز، آخر التطورات الأساسية في علم الأحياء تعتمد على البحث العلمي الإسباني ، لا فانجارديا ، 2 ديسمبر 2020
  17. ↑ "ICREA" . www.icrea.cat . تم الاطلاع عليه بتاريخ 27-10-2018 .
  18. ↑ «تم تعيين ألفونسو فالنسيا مديرًا لقسم علوم الحياة في مركز العلوم البيولوجية (BSC) | BSC-CNS» . www.bsc.es. تاريخ الوصول: ٢٧ أكتوبر ٢٠١٨ .
  19. ^ "ملف ألفونسو فالنسيا يستعيد برشلونة كعاصمة للمعلومات الحيوية" . لا فانجارديا . تم الاسترجاع 2018/10/27 .
  20. ^ "مجموعة البيولوجيا الحسابية الإنشائية: نظرة عامة – cnio.es" . المركز الوطني للتحقيقات في الأورام . أرشفة من الأصلي في 27 ديسمبر 2017 . تم الاسترجاع 10 يناير 2014 .
  21. ↑ منشورات ألفونسو فالنسيا من أوروبا PubMed Central
  22. ↑ منشورات ألفونسو فالنسيا مفهرسة في قاعدة بيانات سكوبس الببليوغرافية. (الاشتراك مطلوب)
  23. 1 2 اتحاد مشروع ENCODE؛ بيرني إي ؛ ستاماتويانوبولوس جيه إيه ؛ دوتا إيه ؛ غيغو آر؛ جينجيراس تي آر؛ مارغوليس إي إتش؛ وينغ زد؛ سنايدر إم؛ ديرميتزاكيس إي تي؛ وآخرون . (2007). "تحديد وتحليل العناصر الوظيفية في 1% من الجينوم البشري بواسطة مشروع ENCODE التجريبي" . مجلة Nature . 447 (7146): 799-816 . Bibcode : 2007Natur.447..799B . doi : 10.1038/nature05874 . PMC 2212820. PMID 17571346 .   
  24. ^ بوينتي، XS؛ بينيول، م؛ كيسادا، الخامس؛ كوندي ، إل. أوردونيز، GR؛ فيلامور ، ن. إسكاراميس، جي؛ جاريس ، ف. بيا، س؛ غونزاليس دياز، م؛ باساجانياس، إل؛ بومان، تي؛ خوان، م؛ لوبيز جويرا، م؛ كولومر، د؛ توبيو، JM. لوبيز، سي؛ نافارو، أ؛ تورنادور ، سي . أيميريتش، م؛ روزمان، م؛ هيرنانديز، JM. بوينتي، دا؛ فريج، JM. فيلاسكو، جي؛ جوتيريز فرنانديز، أ؛ كوستا، د؛ كاريو، أ؛ جويجارو، س؛ وآخرون . (2011). "تسلسل الجينوم الكامل يحدد الطفرات المتكررة في سرطان الدم الليمفاوي المزمن" . مجلة نيتشر . 475 (7354): 101-105 . doi : 10.1038/nature10113 . PMC 3322590. PMID 21642962 .   
  25. ↑ اتحاد الجينوم السرطاني الدولي؛ هدسون، تي جيه؛ أندرسون، دبليو؛ أرتيز، إيه؛ باركر، إيه دي؛ بيل، سي؛ بيرنابي، آر آر؛ بهان، إم كيه؛ كالف، إف؛ إيرولا، آي؛ جيرهارد، دي إس؛ جوتماخر، إيه؛ جايير، إم؛ هيمسلي، إف إم؛ جينينغز، جيه إل؛ كير، دي؛ كلات، بي؛ كولار، بي؛ كوسادا، جيه؛ لين، دي بي؛ لابلاس، إف؛ يويونغ، إل؛ نيتيكوفن، جي؛ أوزنبرغر، بي؛ بيترسون، جيه؛ راو، تي إس؛ ريماكل، جيه؛ شيفر، إيه جيه؛ شيباتا، تي؛ وآخرون . (2010). "الشبكة الدولية لمشاريع جينوم السرطان" . نيتشر . 464 (7291): 993-998 . Bibcode : 2010Natur.464..993T . doi : 10.1038/ nature08987 . PMC 2902243. PMID 20393554 .   
  26. ^ هيرمياكوب، هـ؛ مونتيتشي-بالازي، إل؛ لوينجتون، C .؛ مودالي، س. كيرين، S .؛ بستان، S.؛ فينجرون، م.؛ روشرت، ب. روبستورف، ب. فالنسيا، أ . مارغاليت، H .؛ ارمسترونج، J.؛ بيروخ, عاموس ; سيزاريني، ج.؛ شيرمان، د.؛ أبويلر، ر. (2004). "IntAct: قاعدة بيانات مفتوحة المصدر للتفاعل الجزيئي" . أبحاث الأحماض النووية . 32 (90001): D452-5. دوى : 10.1093/نار/gkh052 . بمك 308786 . بميد 14681455 .  
  27. ^ فان هام، RC. كامربيك، J؛ بالاسيوس، سي؛ راسيل، سي؛ أباسكال، ف؛ باستولا، يو؛ فرنانديز، JM. خيمينيز، إل. بوستيجو، م؛ سيلفا، ف.ج. تاماميس، ج؛ فيجويرا، إي؛ لاتوري، أ؛ فالنسيا، أ؛ موران، ف؛ مويا، أ (2003). "تطور الجينوم الاختزالي في Buchnera aphidicola" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 100 (2): 581– 6. بيب كود : 2003PNAS..100..581V . دوى : 10.1073/pnas.0235981100 . بمك 141039 . بميد 12522265 .  
  28. ↑ بازوس، ف؛ هيلمر-سيتريش، م؛ أوسييلو، ج؛ فالنسيا، أ (1997). "الطفرات المترابطة تحتوي على معلومات حول تفاعل البروتين-البروتين". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 271 (4): 511-23 . CiteSeerX 10.1.1.360.2386 . doi : 10.1006/jmbi.1997.1198 . PMID 9281423 .  
  29. ↑ جينسن، إل جيه؛ غوبتا، آر؛ بلوم، إن؛ ديفوس، دي؛ تاماميس، جيه؛ كيسمير، سي؛ نيلسن، إتش؛ ستيرفيلدت، إتش إتش؛ راباكي، كيه؛ وركمان، سي؛ أندرسن، سي إيه؛ كنودسن، إس؛ كروغ، إيه؛ فالنسيا، إيه؛ بروناك، إس (2002). "التنبؤ بوظيفة البروتين البشري من التعديلات ما بعد الترجمة وخصائص التموضع". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 319 (5): 1257-1265 . CiteSeerX 10.1.1.139.2639 . doi : 10.1016/S0022-2836(02)00379-0 . PMID 12079362 .  
  30. ↑ أولميا، أ؛ روست، ب؛ فالنسيا، أ (1999). "الاستخدام الفعال لارتباط التسلسل وحفظه في التعرف على الطي". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 293 (5): 1221-1239 . doi : 10.1006/jmbi.1999.3208 . PMID 10547297. S2CID 16167106 .  
  31. ↑ هيريرو، ج؛ فالنسيا، أ؛ دوبازو، ج (2001). "شبكة عصبية متنامية غير خاضعة للإشراف هرمية لتجميع أنماط التعبير الجيني" . المعلوماتية الحيوية . 17 (2): 126-136 . doi : 10.1093/bioinformatics/17.2.126 . PMID 11238068 . 
  32. ↑ هوفمان، ر؛ فالنسيا، أ (2005). "تطبيق مفهوم iHOP لتصفح الأدبيات الطبية الحيوية" . المعلوماتية الحيوية . 21 (ملحق 2): ii252–8. doi : 10.1093/bioinformatics/bti1142 . PMID 16204114 . 
  33. ↑ بينغ، هانشوان؛ باتمان، أليكس ؛ فالنسيا، ألفونسو ؛ رين، جوناثان د. (2012). "معلوماتية الصور الحيوية: فئة جديدة في المعلوماتية الحيوية" . المعلوماتية الحيوية . 28 (8): 1057. doi : 10.1093/bioinformatics/bts111 . PMC 3324521. PMID 22399678 .  
  34. ↑ باتمان، أليكس ؛ فالنسيا، ألفونسو (2006). "علم الجينوم البنيوي يلتقي بعلم الأحياء الحاسوبي" . المعلوماتية الحيوية . 22 (19): 2319. doi : 10.1093/bioinformatics/btl426 . PMID 17032684 . 
  35. ^ يونكر، AS؛ جنسن، LJ. بيرليوني، أ؛ بيرنسيل، أ؛ خصلة شعر، مل . بورك، ف. فون هيجن، ج؛ فالنسيا، أ؛ أوزونيس، كاليفورنيا؛ كاساديو، ر. بروناك، س (2009). "التنبؤ بالميزات المستندة إلى التسلسل وشرح البروتينات" . بيولوجيا الجينوم . 10 (2): 206. دوى : 10.1186/gb-2009-10-2-206 . بمك 2688272 . بميد 19226438 .  
  36. ↑ بودو، أ؛ غوميز-لوبيز، ج؛ فالنسيا، أ (2009). "تفسير الأمراض الانتقالي باستخدام الشبكات الجزيئية" . علم الأحياء الجينومي . 10 (6): 221. doi : 10.1186 / gb-2009-10-6-221 . PMC 2718486. PMID 19591646 .  
  37. ↑ فازكيز، م؛ دي لا توري، ف؛ فالنسيا، أ (2012). "الفصل 14: تحليل جينوم السرطان" . مجلة PLOS لعلم الأحياء الحاسوبي . 8 (12) e1002824. رمز Bibcode : 2012PLSCB...8E2824V . doi : 10.1371/journal.pcbi.1002824 . PMC 3531315. PMID 23300415 .  
  38. 1 2 اتحاد مشروع ENCODE (2011). بيكر، بي. بي. (محرر). "دليل المستخدم لموسوعة عناصر الحمض النووي (ENCODE)" . مجلة PLOS Biology . 9 (4) e1001046. doi : 10.1371/journal.pbio.1001046 . PMC 3079585. PMID 21526222 .  أيقونة الوصول المفتوح
  39. ↑ هوفمان، ر؛ فالنسيا، أ (2004). "شبكة جينية لتصفح الأدبيات" . علم الوراثة الطبيعية . 36 (7): 664. doi : 10.1038/ng0704-664 . PMID 15226743 . 
  40. ^ كيسادا، ف. كوندي ، إل. فيلامور ، ن. أوردونيز، GR؛ جاريس ، ف. باساجانياس، إل؛ رامزي، AJ. بيا، س؛ بينيول، م؛ مارتينيز تريلوس، أ؛ لوبيز جويرا، م؛ كولومر، د؛ نافارو، أ؛ بومان، تي؛ أيميريتش، م؛ روزمان، م؛ ديلجادو ، ج. جيني ، إي. هيرنانديز، JM. غونزاليس دياز، م؛ بوينتي، دا؛ فيلاسكو، جي؛ فريج، JM. توبيو، JM. رويو، ر. جيلبي، JL. أوروزكو، م؛ بيسانو، المدير العام؛ زامورا، ج؛ وآخرون . (2011). "تحديد تسلسل الإكسوم يكشف عن طفرات متكررة في جين عامل التضفير SF3B1 في ابيضاض الدم الليمفاوي المزمن". مجلة Nature Genetics ، 44 (1): 47-52 . doi : 10.1038/ng.1032 . hdl : 10651/8189 . PMID: 22158541. S2CID : 205343043 .   
  41. 1 2 آدامز، د؛ ألتوتشي، إل؛ أنتوناراكيس، SE؛ باليستيروس، J؛ بيك، س؛ بيرد، أ؛ بوك، سي؛ بوهم، ب؛ كامبو، إي؛ كاريكاسول، أ؛ دال، ف؛ ديرميتزاكيس، إت؛ إنفر، تي؛ إستلر، م؛ إستيفيل، إكس؛ فيرغسون سميث، أ؛ فيتزجيبون، J؛ فليك، ف. جيل، سي؛ غراف، تي؛ جروسفيلد، ف. جويجو، آر؛ القناة الهضمية، أنا؛ هيلين، ك. جارفيوس، J. كوبرز، آر؛ ليراش، ح؛ لينجاور، تي؛ ليرنمارك، آك؛ وآخرون . (2012). “مخطط لفك تشفير التوقيع اللاجيني المكتوب بالدم”. التكنولوجيا الحيوية الطبيعية . 30 (3): 224– 6. doi : 10.1038/nbt.2153 . hdl : 11858/00-001M-0000-000E-E88D-5 . PMID 22398613 . S2CID 5116136 .   
  42. 1 2 هارو، جي؛ فرانكيش، أ؛ جونزاليس، JM. تاباناري ، إي . ديخانس، م؛ كوكوسينسكي، ف. أكين، بي إل؛ باريل، د؛ زاديسا، أ؛ سيرل، س؛ بارنز، أنا؛ بيجنيل، أ؛ بويتشينكو ، ف. هانت، تي؛ كاي، م. موخيرجي، ج؛ راجان، ج؛ ديسباسيو رييس، ج؛ سوندرز، جي؛ ستيوارد، ج؛ هارت، ر. لين، م؛ هوالد، C؛ تنزر، أ؛ ديرين، تي؛ كرست، J؛ والترز، ن؛ بالاسوبرامانيان ، س . بي، ب؛ وآخرون . (2012). "GENCODE: شرح الجينوم البشري المرجعي لمشروع ENCODE" . أبحاث الجينوم . 22 (9): 1760– 74. doi : 10.1101/gr.135350.111 . PMC 3431492 . PMID 22955987 .   
  43. ↑ فالنسيا، أ؛ بازوس، ف (2002). "الأساليب الحسابية للتنبؤ بتفاعلات البروتين". الرأي الحالي في البيولوجيا التركيبية . 12 (3): 368-373 . doi : 10.1016/s0959-440x(02)00333-0 . PMID 12127457 . 
  44. ↑ ديفوس، د؛ فالنسيا، أ (2001). "الأخطاء الجوهرية في ترميز الجينوم". اتجاهات في علم الوراثة . 17 (8): 429-31 . doi : 10.1016/s0168-9525(01)02348-4 . PMID 11485799 . 
  45. ↑ بلاشكه، سي؛ أندرادي، إم إيه؛ أوزونيس، سي؛ فالنسيا، إيه (1999). "الاستخلاص الآلي للمعلومات البيولوجية من النصوص العلمية: تفاعلات البروتين-البروتين". وقائع المؤتمر الدولي حول الأنظمة الذكية لعلم الأحياء الجزيئي : 60-7 . PMID 10786287 . 
  46. ↑ "زملاء الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي" . www.iscb.org . الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي. مؤرشف من الأصل بتاريخ 28-03-2015.
  47. ↑ "ابحث عن عضو في منظمة EMBO" . المنظمة الأوروبية لعلم الأحياء الجزيئي. مؤرشف من الأصل بتاريخ 21 مارس 2020. تم الاطلاع عليه بتاريخ 2 أبريل 2015 .