إيوان بيرني

📅 آخر تحديث: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 3 صور
الموسوعة الحرة

جون فريدريك ويليام بيرني (المعروف باسم إيوان بيرني ) (مواليد 6 ديسمبر 1972) [ 19 ] [ 4 ] [ 6 ] [ 7 ] هو مدير المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية (EMBL-EBI). [ 20 ] كما يشغل منصب مدير غير تنفيذي في مؤسسة جينوميكس إنجلاند ، [ 21 ] ورئيس التحالف العالمي لعلم الجينوم والصحة (GA4GH)، [ 22 ] [ 23 ] وأستاذ فخري في المعلوماتية الحيوية بجامعة كامبريدج . [ 24 ] قدم بيرني إسهاماتٍ جليلة في علم الجينوم ، من خلال تطويره لأدوات مبتكرة في المعلوماتية الحيوية وعلم الأحياء الحاسوبي . [ 13 ] وقد عمل سابقًا كعضو هيئة تدريس مشارك في معهد ويلكوم ترست سانجر . [ 25 ]

تعليم

تلقى بيرني تعليمه الخاص في كلية إيتون كطالب متفوق . [ 6 ] [ 26 ] قبل التحاقه بالجامعة، أكمل بيرني سنة تدريبية في مختبر كولد سبرينغ هاربور تحت إشراف جيمس واتسون [ 7 ] [ 27 ] وأدريان كراينر . [ 27 ] [ 28 ]

أكمل بيرني درجة البكالوريوس في الكيمياء الحيوية من جامعة أكسفورد عام ١٩٩٦، حيث كان طالبًا جامعيًا في كلية باليول، أكسفورد . [ ٦ ] [ ٧ ] [ ٢٩ ] وحصل على درجة الدكتوراه من جامعة كامبريدج أثناء عمله في معهد سانجر ، تحت إشراف ريتشارد دوربين [ ١٨ ] ، وذلك خلال دراسته العليا في كلية سانت جون، كامبريدج . [ ٣٠ ] استخدم في بحثه للدكتوراه البرمجة الديناميكية ، [ ٣١ ] وآلات الحالة المحدودة، والأتمتة الاحتمالية لمحاذاة التسلسلات . [ ١٨ ]

أثناء دراسته، أكمل فترات تدريب في مكتب عمدة بالتيمور ، وكذلك في مجال الخدمات المالية في تقييم الخيارات لصالح شركة سويس بنك كوربوريشن . [ 26 ] [ 27 ]

البحث والمسار الوظيفي

في الفترة من عام 2000 إلى عام 2003، نظم بيرني مسابقة علمية ويانصيبًا عُرفت باسم GeneSweep ، [ 32 ] [ 9 ] لمجتمع علم الجينوم، حيث تم قبول الرهانات على تقديرات العدد الإجمالي للجينات ( والحمض النووي غير المشفر [ 33 ] ) في الجينوم البشري. [ 27 ] [ 34 ] [ 35 ]

يُعد بيرني أحد مؤسسي متصفح جينوم Ensembl وقواعد بيانات أخرى، وقد ساهم في تسلسل الجينوم البشري عام 2000 وتحليل وظائف الجينوم في مشروع ENCODE . [ 35 ] [ 36 ] كما ساهم في شرح تسلسلات جينومات الإنسان، [ 37 ] والفأر، [ 38 ] والدجاج ، [ 39 ] والعديد من الكائنات الحية الأخرى. ويركز فريقه البحثي على علم الجينوم الحاسوبي والاختلافات بين الأفراد في الإنسان والحيوانات الأخرى . [ 12 ] [ 40 ] [ 33 ] [ 41 ] [ 42 ] [ 43 ]

يشتهر بيرني بدوره في اتحاد ENCODE . [ 17 ] [ 44 ] قبل مشروع ENCODE، شارك بيرني في إنشاء عدد من أدوات المعلوماتية الحيوية وعلم الأحياء الحاسوبي واسعة الاستخدام، إما بشكل مباشر (PairWise، [ 45 ] GeneWise، [ 46 ] GenomeWise، [ 47 ] )، أو بالتعاون مع الطلاب والباحثين ما بعد الدكتوراه ، على سبيل المثال Exonerate [ 48 ] (مع جاي سلاتر)، وEnredo (خافيير هيريرو [ 49 ] )، وPecan (بينيديكت باتن [ 50 ] )، ومجمع Velvet (دانيال زيربينو [ 51 ] )، وCRAM (ماركوس هسي-يانغ فريتز، [ 52 ] راسكو لينونين [ 53 ] وفاديم زالونين). كما ساهم بيرني في العديد من المشاريع الأخرى بما في ذلك قاعدة بيانات Pfam [ 54 ] ، وInterPro [ 55 ] ، و BioPerl [ 56 ] [ 57 ] ، و HMMER [ 58 ] ، ومشروع قاعدة بيانات جينوم Ensembl [ 59 ] .

اعتبارًا من عام 2015يركز فريق بيرني البحثي على الخوارزميات الجينومية ودراسة الاختلافات بين الأفراد، سواءً في البشر أو في الأنواع الأخرى. وقد أشرف على العديد من طلاب الدكتوراه [ 60 ] وباحثي ما بعد الدكتوراه الذين عملوا في مختبره. [ 61 ] [ 62 ] وقد مُوِّل بحثه من قِبَل مجلس أبحاث التكنولوجيا الحيوية والعلوم البيولوجية (BBSRC)، ومجلس البحوث الطبية (MRC) [ 63 ]، والمعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري (NHGRI) [ 3 ] ، ومؤسسة ويلكوم ترست ، والاتحاد الأوروبي . [ 64 ]

يعمل بيرني مستشارًا لشركة أوكسفورد نانوبور تكنولوجيز [ 65 ] وعضوًا في المجلس الاستشاري العلمي لمعهد إيرلهام (المعروف سابقًا باسم TGAC) في نورويتش. [ 66 ] [ 67 ] ومنذ عام 2022، يشغل عضوية مجلس إدارة كلية إيتون . [ 68 ] كما شغل عضوية مجالس إدارة كل من مجلس أبحاث التكنولوجيا الحيوية والعلوم البيولوجية (BBSRC)، والمركز الألماني لأبحاث السرطان (DKFZ)، ومعهد أبحاث السرطان (ICR)، ومعهد أونتاريو لأبحاث السرطان (OICR)، ومعهد باستور ، ومعهد ريكين . [ 69 ]

الجوائز والتكريمات

في عام ٢٠٠٢، اختير بيرني ضمن قائمة أفضل ١٠٠ مبتكر في العالم ممن تقل أعمارهم عن ٣٥ عامًا، وفقًا لمجلة MIT Technology Review TR100. [ ٧٠ ] وفي عام ٢٠٠٣، ألقى محاضرة فرانسيس كريك الافتتاحية في الجمعية الملكية . [ ١٣ ] وفي عام ٢٠٠٥، مُنح جائزة أوفرتون من الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي (ISCB) تقديرًا لدفاعه عن المعلوماتية الحيوية مفتوحة المصدر ، ومساهماته في مجتمع BioPerl، وقيادته لمشروع Ensembl لترميز الجينوم. [ ١٤ ] وفي عام ٢٠٠٥ أيضًا، مُنح بيرني جائزة بنجامين فرانكلين في المعلوماتية الحيوية . [ ٧١ ]

كما ذكر مُرشّحوه، كان بيرني قوةً مؤثرةً في مجال المصادر المفتوحة في المعلوماتية الحيوية والعلوم. وقد كان من أشدّ المُدافعين عن إتاحة معلومات الجينوم مجانًا للجميع. وقد أتاح عمله في قيادة مشروع Ensembl، الذي شارك في قيادته، إمكانية الوصول المجاني إلى بيانات الجينوم عالية الجودة عبر الإنترنت، مما حال دون وجود نظام تصنيفي للمختبرات القادرة على دفع رسوم الاشتراك في البيانات الاحتكارية وغير القادرة على ذلك. وقد بذل المشروع جهودًا حثيثةً لإتاحة البيانات بطرقٍ مُتعددةٍ لتسهيل الوصول إليها واستخراج المعلومات منها. وكان مشروع Ensembl مفتوح المصدر منذ البداية، مما مكّن الباحثين والشركات على حدٍ سواء من إعادة استخدام نظام البرمجيات وتطويره. كما كان بيرني من دعاة العلم المفتوح . وقد انتقد، إلى جانب شون إيدي ، قرارات المجلات العلمية التي تسمح بنشر الأبحاث دون إتاحة بيانات تسلسل الجينوم في الوقت نفسه. وهو أيضًا مؤلف حزمة أدوات Wise المجانية، والتي تُعدّ جزءًا أساسيًا من مسارات عمل بيانات الجينوم. وهو يشغل منصب القائد المشارك لمجموعة أدوات المعلوماتية الحيوية مفتوحة المصدر Bioperl، كما شارك في تأسيس مؤسسة المعلوماتية الحيوية المفتوحة ويشغل حاليًا منصب رئيسها ، وهي منظمة تدعم تطوير العديد من مجموعات أدوات المعلوماتية الحيوية.

حصل بيرني على عضوية المنظمة الأوروبية لعلم الأحياء الجزيئي (EMBO) [ 15 ] في عام 2012 [ 16 ] وانتُخب زميلًا في الجمعية الملكية (FRS) في عام 2014. [ 2 ] [ 13 ] وجاء في شهادة انتخابه وترشيحه: [ 72 ]

برز إيوان كشخصية مؤثرة في علم الجينوم بفضل ابتكاراته في تحليل الجينوم، سواءً التحليلات الخوارزمية أو التكاملية. فقد كتب أول برنامج لمحاذاة البروتينات يتحمل الأخطاء ويراعي مواقع الربط ، والذي استُخدم في تحليل الجينوم البشري وما تلاه من تحليلات. كما شارك في تأليف أحد أوائل وأكثر برامج تجميع القراءات القصيرة استخدامًا . وفي مجال تكامل البيانات ، قاد إيوان التحليل في العديد من اتحادات علم الجينوم، ولا سيما مشروع ENCODE ، حيث قاد عملية دمج العديد من التحليلات الجينومية؛ على سبيل المثال، وضع تنبؤات دقيقة للمُحسِّنات والمُحفِّزات ودمجها مع المناطق المرتبطة بالأمراض. كما شارك في تطوير العديد من موارد المعلوماتية الحيوية واسعة الانتشار .

حصل بيرني على درجة الدكتوراه الفخرية في العلوم (DSc): في عام 2014 من جامعة برونيل بلندن [ 73 ] وفي عام 2021 من جامعة تارتو [ 74 ] في إستونيا . وفي عام 2015، انتُخب بيرني زميلًا في أكاديمية العلوم الطبية (FMedSci). [ 75 ] كما عُيّن قائدًا لوسام الإمبراطورية البريطانية (CBE) في قائمة تكريمات رأس السنة الجديدة لعام 2019. [ 76 ] [ 8 ]

الحياة الشخصية

تزوج بيرني عام 2003 [ 12 ] ولديه طفلان. [ 6 ]

مراجع

  1. ↑ مجهول (4 نوفمبر 1993). "جون فريدريك ويليام بيرني" . جريدة جامعة أكسفورد . 124 (4305). مطبعة جامعة أكسفورد . مؤرشف من الأصل في 16 يونيو 2015.
  2. 1 2 مجهول (2015). "زمالة الجمعية الملكية 1660-2015" . لندن: الجمعية الملكية . مؤرشف من الأصل في 15 أكتوبر 2015.
  3. 1 2 ORCID الخاص بإيوان بيرني 0000-0001-8314-8497 
  4. 1 2 مجهول (2017). "إذن، أنا إيوان بيرني" (ملف PDF) . genome.gov . المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري . مؤرشف من الأصل (ملف PDF) في 4 يوليو 2017.
  5. ↑ مجهول (2016). "جون فريدريك ويليام بيرني، شركة إيجل جينوميكس المحدودة" . لندن: سجل الشركات . مؤرشف من الأصل في 25 أبريل 2016.
  6. 1 2 3 4 5 6 7 8 مجهول (2025). "بيرني، الدكتور جون فريدريك ويليام، (إيوان)" . موسوعة الشخصيات (إصدار إلكتروني من مطبعة جامعة أكسفورد ). دار نشر A & C Black. doi : 10.1093/ww/9780199540884.013.U281970 .   (يلزم الاشتراك أو عضوية المكتبة العامة في المملكة المتحدة .)
  7. 1 2 3 4 هوبكين، كارين (يونيو 2005). "أحضروا لي جينوماتكم: قصة إيوان بيرني" . مجلة ساينتست . 19 (11): 60. تاريخ الاسترجاع: 10 يونيو 2011 .{{cite journal}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
  8. 1 2 مجهول (2018). "جون بيرني: البروفيسور جون فريدريك ويليام بيرني، زميل الجمعية الملكية". جريدة لندن الرسمية . لندن. مؤرشف من الأصل في 28 ديسمبر 2019.
  9. بينيسي ، إي. ( 2003). " الجينوم البشري: عدد قليل يفوز في مسابقة GeneSweep". مجلة ساينس . 300 (5625): 1484ب–1484. doi : 10.1126/science.300.5625.1484b . ISSN 0036-8075 . PMID 12791949. S2CID 82493401 .   رمز الوصول المغلق
  10. ↑ اتحاد مشروع ENCODE؛ بيرني إي؛ ستاماتويانوبولوس جيه إيه ؛ دوتا إيه؛ غيغو آر؛ جينجيراس تي آر؛ مارغوليس إي إتش؛ وينغ زد؛ سنايدر إم؛ ديرميتزاكيس إي تي؛ وآخرون . (2007). "تحديد وتحليل العناصر الوظيفية في 1% من الجينوم البشري بواسطة مشروع ENCODE التجريبي" . مجلة Nature . 447 (7146): 799-816 . Bibcode : 2007Natur.447..799B . doi : 10.1038/nature05874 . PMC 2212820. PMID 17571346 .   
  11. ↑ هوبارد، ت .؛ باركر، د.؛ بيرني، إ .؛ كاميرون، ج.؛ تشين، ي.؛ كلارك، ل.؛ كوكس، ت.؛ كوف، ج.؛ كورون، ف.؛ داون، ت.؛ دوربين، ر.؛ إيراس، إ.؛ جيلبرت، ج.؛ هاموند، م.؛ هومينيكي، ل.؛ كاسبرزيك، أ.؛ ليفاسلايهو، هـ.؛ لينزاد، ب.؛ ميلسوب، س.؛ مونجين، إ.؛ بيتيت، ر.؛ بوكوك، م.؛ بوتر، س.؛ راست، أ.؛ شميدت، إ.؛ سيرل، س.؛ سلاتر، ج.؛ سميث، ج.؛ سبونر، و.؛ ستابناو، أ. (2002). "مشروع قاعدة بيانات جينوم إنسيمبل" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 30 (1): 38– 41. doi : 10.1093/nar/30.1.38 . PMC 99161 . PMID 11752248 .  
  12. 1 2 3 بينيسي، إليزابيث (2012). "نبذة عن إيوان بيرني: المتحدث البارز في علم الجينوم". مجلة ساينس . 337 (6099): 1167-1169 . doi : 10.1126/science.337.6099.1167 . PMID 22955814 . 
  13. 1 2 3 4 مجهول (2014). "الدكتور إيوان بيرني، زميل الجمعية الطبية للعلوم، زميل الجمعية الملكية" . لندن: الجمعية الملكية . مؤرشف من الأصل في 17 نوفمبر 2015.تتضمن جملة واحدة أو أكثر من الجمل السابقة نصًا من موقع royalsociety.org الإلكتروني حيث:
    جميع النصوص المنشورة تحت عنوان "السيرة الذاتية" في صفحات تعريف الزملاء متاحة بموجب ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 الدولي . -- "شروط وأحكام وسياسات الجمعية الملكية" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 25 سبتمبر 2015. تم الاطلاع عليه بتاريخ 9 مارس 2016 .{{cite web}}: CS1 maint: bot: حالة عنوان URL الأصلي غير معروفة ( رابط )
  14. ١ ٢ "نشرة الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي ٨-٢: الدكتور إيوان بيرني يُعلن فوزه بجائزة أوفرتون لعام ٢٠٠٥!" . مؤرشف من الأصل بتاريخ ٢٢ أكتوبر ٢٠١٥.
  15. 1 2 "دليل EMBO المختصر" (ملف PDF) . المنظمة الأوروبية لعلم الأحياء الجزيئي. مؤرشف من الأصل في 16 مارس 2015.
  16. 1 2 مجهول (2012). "عضو في منظمة البيولوجيا الجزيئية الأوروبية: إيوان بيرني" . people.embo.org . هايدلبرغ: منظمة البيولوجيا الجزيئية الأوروبية.
  17. 1 2 3 4 منشورات إيوان بيرني المفهرسة بواسطة جوجل سكولار
  18. 1 2 3 بيرني، إيوان ( 2000). محاذاة التسلسل في المعلوماتية الحيوية . cam.ac.uk (أطروحة دكتوراه). جامعة كامبريدج. OCLC 894597337. EThOS uk.bl.ethos.621653 . مؤرشف (PDF) من الأصل في 9 يوليو 2019. تم الاسترجاع في 19 نوفمبر 2017 .  
  19. ↑ مجموعة التاريخ الشفوي للمعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري: مقابلة مع إيوان بيرني على يوتيوب
  20. ↑ EMBL (2025). "التغييرات في قيادة EMBL" . embl.org . هايدلبرغ: مختبر البيولوجيا الجزيئية الأوروبي.
  21. ↑ مجهول (2016). "تعيين البروفيسور إيوان بيرني في مجلس إدارة جينوميكس إنجلاند" . genomicsengland.co.uk . جينوميكس إنجلاند. مؤرشف من الأصل في 11 يوليو 2017.
  22. ↑ إيوان بيرني على X
  23. ↑ بيرني، إيوان (2017). "نبذة عن إيوان بيرني" . ewanbirney.com . مؤرشف من الأصل في 1 ديسمبر 2017. تم الاطلاع عليه في 19 نوفمبر 2017 .
  24. ↑ مجهول (12 ديسمبر 2014). "الأساتذة الفخريون" . مراسل جامعة كامبريدج . CXLV (5). جامعة كامبريدج. مؤرشف من الأصل في 15 مارس 2015.
  25. ↑ مجهول (2015). "أعضاء هيئة التدريس في سانجر" . معهد ويلكوم ترست سانجر. مؤرشف من الأصل في 16 مارس 2015.
  26. 1 2 مجهول (2015). "الدكتور إيوان بيرني، زميل الجمعية الملكية" . thescientific23.com . مؤرشف من الأصل في 6 يوليو 2015.
  27. 1 2 3 4 الخليلي، جيم (2013). "الحياة العلمية، إيوان بيرني" . bbc.co.uk. بي بي سي .
  28. ↑ بيرني، إيوان (10 فبراير 2013). "العلماء ومشاعرهم: لحظات الفرح... ولحظات الحزن: عالم أحياء حاسوبية يصف نشوة تحقيق إنجاز علمي - وحزن عدم تحقيقه - بينما يخبرنا ثلاثة علماء آخرون كيف يؤثر عملهم على مشاعرهم" . theguardian.com . لندن: ذا أوبزرفر.
  29. ↑ مجهول (2012). "عصر الجينوم، إيوان بيرني في فلوريت دوموس" . balliol.ox.ac.uk . صحيفة كلية باليول. مؤرشفة من الأصل في 24 فبراير 2012.
  30. ↑ سماغليك، بول (2012). "نقطة تحول: إيوان بيرني" . مجلة نيتشر . 482 (7383): 123-728 . doi : 10.1038/nj7383-123a . S2CID 144288448 . 
  31. ↑ بيرني، إيوان؛ دوربين، ريتشارد (1997). "ديناميت: لغة مرنة لتوليد التعليمات البرمجية لأساليب البرمجة الديناميكية المستخدمة في مقارنة التسلسلات". وقائع المؤتمر الدولي للأنظمة الذكية في البيولوجيا الجزيئية . 5 : 56-64 . PMID 9322016 . 
  32. ↑ بيرسون، هيلين (2003). " علماء الوراثة يلعبون لعبة الأرقام عبثًا" . مجلة نيتشر . 423 (6940): 576. Bibcode : 2003Natur.423..576P . doi : 10.1038/423576a . ISSN 0028-0836 . PMID 12789304. S2CID 54588944 .   
  33. هول ، ستيفن س. (2012). "رحلة إلى باطن الجينات. ما كان يُعرف سابقًا بالحمض النووي غير الوظيفي ، اتضح أنه يحوي كنوزًا خفية، كما يقول عالم الأحياء الحاسوبية إيوان بيرني". مجلة ساينتفك أمريكان . 307 (4): 80-82 ، 84. doi : 10.1038/scientificamerican1012-80 . PMID 23029896 . 
  34. ↑ بيرتيا، م.؛ سالزبرغ، س. ل. (2010). "بين الدجاجة والعنب: تقدير عدد الجينات البشرية" . علم الأحياء الجينومي . 11 (5): 206. doi : 10.1186/gb-2010-11-5-206 . PMC 2898077. PMID 20441615 .  
  35. 1 2 غراور، د .؛ تشنغ، ي.؛ برايس، ن.؛ أزيفيدو، ر.ب.ر.؛ زوفال، ر.أ.؛ إلحايك، إ. (2013). "حول خلود أجهزة التلفزيون: "الوظيفة" في الجينوم البشري وفقًا لإنجيل ENCODE الخالي من التطور" . علم الأحياء التطوري وعلم الجينوم . 5 (3): 578-590 . doi : 10.1093/gbe/evt028 . PMC 3622293. PMID 23431001 .  
  36. ↑ "ENCODE: موسوعة عناصر الحمض النووي" على يوتيوب
  37. ^ لاندر، إس . لينتون، م. بيرين، ب. نوسباوم، C .؛ زودي، سي. بالدوين، J.؛ ديفون، ك.؛ ديوار، ك.؛ دويل، م. فيتزهوغ، دبليو؛ فونك، ر. غيج، د.؛ هاريس، ك. هيفورد، أ. هاولاند، J.؛ كان، ل.؛ ليهوكزكي، J .؛ ليفين، ر. ماك إيوان، ص. ماكيرنان، ك.؛ ميلدريم، J.؛ ميسيروف، جي بي؛ ميراندا، C .؛ موريس، دبليو؛ نايلور، J.؛ ريموند، سي. روزيتي، م.؛ سانتوس، ر. شيريدان، أ.؛ وآخرون . (فبراير 2001). “التسلسل الأولي وتحليل الجينوم البشري” (PDF) . طبيعة . 409 (6822): 860– 921. Bibcode : 2001Natur.409..860L . doi : 10.1038/35057062 . ISSN 0028-0836 . PMID 11237011 .   
  38. ↑ تشينوالا، أ.ت.؛ ووترستون، ل.ل.؛ ليندبلاد-توه، ك.د.؛ بيرني، ج.أ.؛ روجرز، ل.أ.؛ أبريل، ر.س.؛ أغاروال، ت.أ.؛ أغاروالا، ل.و.؛ أينسكوف، إ.ر.؛ ألكسندرسون، ج.د.؛ آن، ت.ل.؛ أنتوناراكيس، و.إ.؛ أتوود، ج.أ.؛ بيرتش، م.ن.؛ بيلي، ك.ه.؛ بارلو، س.س.؛ بيك، ت.س.؛ بيري، ب.؛ بيرين، ج.؛ بلوم، إ.؛ بورك، ر.ه.؛ بوتشربي، م.س.؛ براي، ر.ك.؛ برينت، س.ب.؛ براون، ب.؛ براون، إ.؛ بولت، ب.؛ بيرتون، ت.؛ بتلر، د.ج.؛ وآخرون . (2002). "التسلسل الأولي والتحليل المقارن لجينوم الفأر" . مجلة نيتشر . 420 (6915): 520– 562. Bibcode : 2002Natur.420..520W . doi : 10.1038/nature01262 . PMID 12466850 .  
  39. ^ ايراس، إي. ريموند، أ. كاستيلو، ر.؛ وداعا، جي إم؛ كامارا، ف؛ فليك، ب. هاكل، إي جيه؛ بارا، ج. شتاينبرغ، د. ويس، C.؛ روجرز، J .؛ أنتوناراكيس، SE؛ بيرني، إي. جويجو، ر. برنت، مر (2005). "اكتشاف الجين في جينوم الدجاج" . بي إم سي للمعلوماتية الحيوية . 6 131. دوى : 10.1186/1471-2105-6-131 . بمك 1174864 . بميد 15924626 .  
  40. ↑ منشورات إيوان بيرني من أوروبا PubMed Central
  41. ↑ "كلية تشرشل: سير ذاتية: إيوان بيرني" . chu.cam.ac.uk. مؤرشف من الأصل في 3 أبريل 2011.
  42. ↑ "مقابلة مع إيوان بيرني: المتحدث الرئيسي في مؤتمر أورايلي لتكنولوجيا المعلوماتية الحيوية" . oreilly.com . أورايلي ميديا . مؤرشف من الأصل بتاريخ 27 مايو 2015.
  43. ↑ منشورات إيوان بيرني المفهرسة في قاعدة بيانات سكوبس الببليوغرافية. (الاشتراك مطلوب)
  44. ↑ إيوان بيرني على خادم ببليوغرافيا DBLP
  45. ↑ بيرني، إي .؛ طومسون، ج.؛ جيبسون، ت. (1996). "PairWise وSearchWise: إيجاد المحاذاة المثلى في مقارنة متزامنة لملف تعريف البروتين مقابل جميع أطر ترجمة الحمض النووي" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 24 (14): 2730-2739 . doi : 10.1093/nar/24.14.2730 . PMC 145991. PMID 8759004 .  
  46. ↑ بيرني، إي .؛ دوربين، ر. (2000). " استخدام برنامج GeneWise في تجربة ترميز جينات ذبابة الفاكهة" . أبحاث الجينوم . 10 (4): 547-548 . doi : 10.1101/gr.10.4.547 . PMC 310858. PMID 10779496 .  
  47. ↑ بيرني، إي .؛ كلامب، إم.؛ دوربين، آر. (2004). "جين وايز وجينوم وايز" . أبحاث الجينوم . 14 (5): 988-995 . doi : 10.1101/gr.1865504 . PMC 479130. PMID 15123596 .  
  48. ↑ سلاتر، ج.؛ بيرني، إ. ( 2005). "التوليد الآلي للأساليب الاستدلالية لمقارنة التسلسلات البيولوجية" . بي إم سي بيوانفورماتيكس . 6 31. doi : 10.1186/1471-2105-6-31 . PMC 553969. PMID 15713233 .  
  49. ↑ باتن، ب.؛ هيريرو، ج.؛ بيل، ك.؛ فيتزجيرالد، س.؛ بيرني، إ. (2008). "إنريدو وبيكان: محاذاة متعددة قائمة على الاتساق على مستوى الجينوم للثدييات مع الجينات المتشابهة" . أبحاث الجينوم . 18 (11): 1814-1828 . doi : 10.1101/gr.076554.108 . PMC 2577869. PMID 18849524 .  أيقونة الوصول المفتوح
  50. ↑ باتن، بنديكت جون (2006). محاذاة متعددة واسعة النطاق واكتشاف الأنماط المرتبطة بالنسخ في جينومات الفقاريات ( أطروحة دكتوراه). جامعة كامبريدج. OCLC 890155216. EThOS uk.bl.ethos.612811 .  
  51. ↑ زيربينو، د. ر.؛ بيرني، إ. (2008). "فيلفيت: خوارزميات لتجميع قراءات قصيرة جديدة باستخدام رسوم بيانية دي بروين" . أبحاث الجينوم . 18 (5): 821-829 . doi : 10.1101/gr.074492.107 . ISSN 1088-9051 . PMC 2336801. PMID 18349386 .   
  52. ↑ فريتز، ماركوس (2011). استغلال بيانات تسلسل الحمض النووي عالي الإنتاجية للتحليل الجينومي (أطروحة دكتوراه). جامعة كامبريدج. OCLC 890152397. EThOS uk.bl.ethos.610819 . مؤرشف من الأصل في 30 أغسطس 2018. تم الاسترجاع في 30 أغسطس 2018 .  
  53. ↑ لينونين، ر.؛ أختار، ر.؛ بيرني، إ.؛ بونفيلد، ج.؛ باور، ل.؛ كوربيت، م.؛ تشينغ، ي.؛ ديميرالب، ف.؛ فاروق، ن.؛ غودغيم، ن.؛ جيبسون، ر.؛ هواد، ج.؛ هنتر، س.؛ جانغ، م.؛ ليونارد، س.؛ لين، ك.؛ لوبيز، ر.؛ ماغواير، م.؛ ماكويليام، هـ.؛ بلايستر، س.؛ رادهاكريشنان، ر.؛ سوباني، س.؛ سلاتر، ج.؛ تين هوبن، ب.؛ فالنتين، ف.؛ فوغان، ر.؛ زالونين، ف.؛ زيربينو، د.؛ كوكرين، ج. (2009). "تحسينات على الخدمات في الأرشيف الأوروبي للنيوكليوتيدات" . أبحاث الأحماض النووية . 38 (عدد خاص بقاعدة البيانات): D39– D45. doi : 10.1093/nar/ gkp998 . PMC 2808951. PMID 19906712 .  
  54. ↑ باتمان، أ .؛ بيرني، إ .؛ سيروتي، ل.؛ دوربين، ر .؛ إتويلر، ل.؛ إيدي، س .؛ غريفيثس-جونز، س.؛ هاو، ك.؛ مارشال، م.؛ سونهمر، إي. إل. (2002). "قاعدة بيانات عائلات بروتينات Pfam" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 30 (1): 276-280 . doi : 10.1093/nar/30.1.276 . PMC 99071. PMID 11752314 .  
  55. ^ أبويلر، ر . الأماكن القريبة : بيروش، أ . بيتمان، أ . بيرني، إي . بيسواس، م.؛ بوشر، P.؛ سيروتي، L.؛ كوربيت، ف؛ كرونينغ، دكتوراه في الطب؛ دوربين، ر. فالكيت، ل.؛ فليشمان، دبليو؛ جوزي، J.؛ هيرمياكوب، هـ؛ هولو، ن.؛ جوناسن، أنا. كان، د.؛ كانابين، أ.؛ كارافيدوبولو، Y .؛ لوبيز، ر. ماركس، ب. مولدر، نيوجيرسي؛ أوين، TM؛ باجني، م.؛ خادم، ف؛ سيجريست ، سي جيه. زدوبنوف، م (2001). "قاعدة بيانات InterPro، مصدر توثيق متكامل لعائلات البروتين والمجالات والمواقع الوظيفية" . أبحاث الأحماض النووية . 29 (1): 37– 40. doi : 10.1093/nar/29.1.37 . PMC 29841 . PMID 11125043 .  
  56. ↑ ستاييتش، جيه إي؛ بلوك، دي؛ بوليز، ك؛ برينر، إس ؛ تشيرفيتز، إس؛ داغديجيان، سي؛ فيولين، جي؛ جيلبرت، جيه؛ كورف، آي؛ لاب، إتش؛ ليفاسلايهو، إتش؛ ماتسالا، سي؛ مونغال، سي جيه؛ أوزبورن، بي آي؛ بوكوك، إم آر؛ شاتنر، بي؛ سينغر، إم؛ شتاين، إل دي ؛ ستوبكا، إي؛ ويلكنسون، إم دي؛ بيرني، إي. (2002). "مجموعة أدوات BioPerl: وحدات Perl لعلوم الحياة" . أبحاث الجينوم . 12 (10): 1611-1618 . doi : 10.1101/gr.361602 . PMC 187536. PMID 12368254 .  
  57. ↑ مجهول (2013). "إيوان بيرني - بايو بيرل" . bioperl.org . مؤرشف من الأصل في 12 ديسمبر 2012.
  58. ↑ باتمان، أ.؛ بيرني، إ .؛ دوربين، ر .؛ إيدي، س .؛ فين، ر.؛ سونهمر، إ. (1999). "Pfam 3.1: 1313 محاذاة متعددة وملفات تعريف HMMs تتطابق مع غالبية البروتينات" . أبحاث الأحماض النووية . 27 (1): 260-262 . doi : 10.1093 / nar/27.1.260 . PMC 148151. PMID 9847196 .  
  59. ^ فليك، ص. أحمد، أنا؛ أمود، السيد. باريل، د.؛ بيل، ك.؛ برنت، س. كارفاليو سيلفا، د.؛ كلافام، ب. كوتس، ج.؛ فيرلي، س. فيتزجيرالد، S .؛ جيل، ل.؛ جارسيا جيرون، سي. جوردون، L.؛ هورليير، تي؛ هانت، س. جويتمان، T .؛ كاهاري، ألاسكا؛ كينان، س.؛ كوموروفسكا، م.؛ كوليشا، إي. لونغدن، أنا. موريل، T.؛ ماكلارين، دبليو إم؛ موفاتو، م.؛ ناج، ر. أوفيردوين، ب. بيجناتيللي، م. بريتشارد، ب. بريتشارد، إي. (2012). "فرقة 2013" . أبحاث الأحماض النووية . 41 (D1): D48– D55. doi : 10.1093/nar/gks1236 . PMC 3531136 . PMID 23203987 .  
  60. ↑ بيرني، إيوان (10 أبريل 2018). "أفضل هدية كمشرف..." twitter.com . مؤرشف من الأصل في 10 أبريل 2018. تم الاطلاع عليه في 30 أغسطس 2018 .
  61. ↑ "برنامج الدكتوراه الدولي التابع للمعهد الأوروبي للبيولوجيا الجزيئية - أطروحات مكتملة | تدريب المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 22 فبراير 2013.
  62. ↑ "أطروحات الدكتوراه المشتركة بين EMBL وEBI" . ebi.ac.uk. المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية.
  63. ↑ «منح بحثية من الحكومة البريطانية مُنحت لإيوان بيرني» . سويندون: مجالس البحوث في المملكة المتحدة . مؤرشف من الأصل في 4 يونيو 2015.
  64. ↑ "محاضرة جوجل التقنية 12-07-2012: علم الوراثة البشرية وعلم الجينوم: علم القرن الحادي والعشرين، بقلم إيوان بيرني" على يوتيوب
  65. ↑ كوكسون، كلايف (17 فبراير 2012). "أكسفورد نانوبور تكشف النقاب عن قارئ مصغر للحمض النووي" . فايننشال تايمز . لندن. مؤرشف من الأصل في 11 ديسمبر 2022. تم الاطلاع عليه في 20 أكتوبر 2014 .
  66. ↑ «مجلس استشاري علمي جديد لمركز تحليل الجينوم: مجموعة متعددة التخصصات من الخبراء الرئيسيين» . tgac.ac.uk. مركز تحليل الجينوم، نورويتش. مؤرشف من الأصل بتاريخ 23 ديسمبر 2015.
  67. ↑ "مختبر إيوان بيرني الأوروبي لعلم الأحياء الجزيئي - البيانات الضخمة 2014 - ميديا ​​سبيس - كلية الطب بجامعة ستانفورد" . mediaspace.stanford.edu .
  68. ↑ والدغريف، ويليام (2022). "الهيئة الإدارية لإيتون" . etoncollege.com . مؤرشف من الأصل في 16 يوليو 2023.
  69. ↑ مجهول (2024). "إيوان بيرني: نائب المدير العام للمعهد الأوروبي للبيولوجيا الجزيئية والمدير المشارك للمعهد الأوروبي للبيولوجيا الجزيئية" . ebi.ac.uk. مؤرشف من الأصل في 12 فبراير 2024.
  70. ↑ "المبتكرون الشباب تحت سن 35 لعام 2002: إيوان بيرني، 29 عامًا" . مجلة التكنولوجيا . 2002. مؤرشف من الأصل في 29 مارس 2011. تم الاطلاع عليه في 22 يونيو 2011 .
  71. ↑ "بيان صحفي: إيوان بيرني يفوز بجائزة بنجامين فرانكلين لعام 2005 في المعلوماتية الحيوية" . bioinformatics.org .
  72. ↑ "شهادة انتخاب EC/2014/06: إيوان بيرني، زميل الجمعية الملكية" . لندن: الجمعية الملكية . مؤرشفة من الأصل في 9 يوليو 2019.
  73. ↑ «تقديراً لخدماته الجليلة في مجال العلوم، مُنح الدكتور إيوان بيرني درجة الدكتوراه الفخرية في العلوم» . brunel.ac.uk . جامعة برونيل لندن . مؤرشف من الأصل بتاريخ ٢١ أبريل ٢٠١٥.
  74. منحت جامعة تارتو درجة الدكتوراه الفخرية في المعلوماتية الحيوية للأستاذ إيوان بيرني تقديرًا لأبحاثه المتميزة، وتعاوناته الدولية، ودوره في دعم العلوم المفتوحة . www.ut.ee. جامعة تارتو .
  75. ↑ مجهول (2015). "الدكتور إيوان بيرني، زميل الجمعية الملكية، زميل أكاديمية العلوم الطبية" . acmedsci.ac.uk . لندن: أكاديمية العلوم الطبية. مؤرشف من الأصل في 6 يوليو 2015.
  76. ↑ "جامعة كامبريدج ضمن قائمة تكريمات رأس السنة الجديدة لعام 2019" . cam.ac.uk. جامعة كامبريدج. 28 ديسمبر 2018.

 تتضمن هذه المقالة نصًا متاحًا بموجب ترخيص CC BY 4.0 .