CHD1L
إنزيم ALC1 ( بروتين ربط الحمض النووي ذو نطاق الكرومودومين-الهيليكاز 1 ) هو إنزيم يُشفَّر في البشر بواسطة جين CHD1L . [ 5 ] [ 6 ] وقد ثبت تورطه في إعادة تشكيل الكروماتين وعملية استرخاء الحمض النووي اللازمة لتضاعف الحمض النووي وإصلاحه ونسخه. يتكون ALC1 من نطاق ATPase ونطاق كبير. وبناءً على التشابه في نطاق ATPase، ينتمي ALC1 إلى عائلة Snf2. [ 7 ]
يحتوي على 897 حمضًا أمينيًا ويبلغ حجمه حوالي 101 كيلو دالتون. [ 8 ]
وظيفة
قيد التطوير
يمتلك CHD1L، وهو إنزيم حالّ للولب DNA، نشاطًا في إعادة تشكيل الكروماتين ويتفاعل مع PARP1 /PARylation في تنظيم القدرة على التمايز إلى أنواع متعددة من الخلايا أثناء إعادة البرمجة التطورية . يتفاعل النطاق الكبير لـ CHD1L مع جزء PAR من PARP1 المُعدّل بـ PAR لتسهيل إعادة البرمجة في المراحل المبكرة والقدرة على التمايز إلى أنواع متعددة من الخلايا الجذعية. [ 9 ] يبدو أن التعبير عن CHD1L ضروري للأحداث المبكرة في التطور الجنيني . [ 10 ] يرتبط دور CHD1L في التطور الجنيني بدوره كمنشط نسخ لعدة جينات (Akt، METP2، TCF4) مما يؤدي إلى التحول الظهاري-الميزانشيمي (EMT). [ 11 ] والجدير بالذكر أن EMT متورط أيضًا في انتشار الأورام، [ 12 ] مما يزيد من تعقيد دور CHD1L في كل من الخلايا السليمة والمريضة.
في إصلاح الحمض النووي
للسماح بعملية إصلاح الحمض النووي الخلوية الحيوية، يجب إعادة تشكيل الكروماتين في مواقع التلف. يعمل بروتين CHD1L (ALC1)، وهو بروتين لإعادة تشكيل الكروماتين ، في وقت مبكر جدًا من عملية إصلاح الحمض النووي. يحدث استرخاء الكروماتين بسرعة في موقع تلف الحمض النووي. [ 13 ] تبدأ هذه العملية ببروتين PARP1 الذي يبدأ بالظهور في موقع تلف الحمض النووي في أقل من ثانية، ويبلغ نصف الحد الأقصى لتراكمه خلال 1.6 ثانية من حدوث التلف. [ 14 ] ثم يقوم PARP1 بإضافة سلاسل PAR إلى نفسه، حيث تجذب هذه السلاسل النطاق الكبير لبروتين CHD1L، مما يزيل التثبيط الذاتي ويسمح للنطاقات الطرفية N بالتفاعل مع الكروماتين. [ 15 ] يلتف الرابط بين النطاق الكبير والنطاق الطرفي N حول الهيستون، ويتفاعل مع رقعة النيوكليوسوم الحمضية عبر مرساة R611. [ 16 ] بعد ذلك، يرتبط مُعدِّل الكروماتين CHD1L (ALC1) بسرعةٍ بمنتج PARP1، ويُكمل وصوله إلى موضع تلف الحمض النووي في غضون 10 ثوانٍ من حدوثه. [ 13 ] ويحدث حوالي نصف أقصى استرخاء للكروماتين، بفضل عمل CHD1L (ALC1)، في غضون 10 ثوانٍ. [ 13 ] وهذا بدوره يسمح باستقطاب إنزيم إصلاح الحمض النووي MRE11 ، لبدء عملية إصلاح الحمض النووي، في غضون 13 ثانية. [ 14 ] ويشارك MRE11 في إصلاح إعادة التركيب المتماثل . كما أن CHD1L (ALC1) ضروريٌّ لإصلاح الكروماتين المتضرر من الأشعة فوق البنفسجية من خلال إصلاح استئصال النيوكليوتيدات . [ 17 ]
مشاكل جينية ذات صلة
في متلازمة حذف 1q21.1، يحدث خلل يؤدي إلى زيادة في انقطاعات الحمض النووي. ويشابه دور CHD1L دور إنزيم الهيليكاز في متلازمة ويرنر [ 18 ].
مراجع
- 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000131778 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000028089 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ ماو م، فو ج، وو ج س، تشانغ كيو إتش، تشو ج، كان إل إكس، وآخرون . (يوليو 1998). "تحديد الجينات المُعبر عنها في الخلايا الجذعية/الخلايا السلفية المكونة للدم CD34(+) البشرية بواسطة علامات التسلسل المُعبر عنها والاستنساخ الفعال للحمض النووي التكميلي كامل الطول" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 95 (14): 8175-8180 . Bibcode : 1998PNAS...95.8175M . doi : 10.1073/pnas.95.14.8175 . PMC 20949. PMID 9653160 .
- ↑ "Entrez Gene: CHD1L chromodomain helicase DNA binding protein 1-like" .
- ↑ فلاوس أ، مارتن د.م، بارتون ج.ج، أوين-هيوز ت (31 مايو 2006). "تحديد عائلات فرعية متعددة ومتميزة من Snf2 ذات أنماط هيكلية محفوظة" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 34 (10): 2887-2905 . doi : 10.1093/nar/gkl295 . PMC 1474054. PMID 16738128 .
- ↑ "UniProt" . UniProt .
- ↑ جيانغ بي إتش، تشين دبليو واي، لي إتش واي، تشين واي، تشانغ دبليو سي، هسيه بي سي، وآخرون . (أكتوبر 2015). "تنظيم CHD1L للقدرة على التمايز وإعادة تشكيل الكروماتين بواسطة PARP1 خلال المراحل المبكرة من إعادة برمجة الخلايا" . الخلايا الجذعية . 33 (10). دايتون، أوهايو: 2961-2972 . doi : 10.1002/stem.2116 . PMC 4832376. PMID 26201266 .
- ↑ سنايدر إيه سي، ليونغ دي، وانغ كيو تي، ويسوكا جيه، ياو إم دبليو، سكوت إم بي (فبراير 2013). " عامل إعادة تشكيل الكروماتين Chd1l ضروري في الجنين قبل الانغراس" . بيولوجي أوبن . 2 (2): 121-131 . doi : 10.1242/bio.20122949 . PMC 3575647. PMID 23429299 .
- ↑ شيونغ إكس، لاي إكس، لي إيه، ليو زد، ما إن (مارس 2021). "أدوار متنوعة لـ CHD1L في وظيفة الخلية الطبيعية وتكوّن الأورام" . أبحاث المؤشرات الحيوية . 9 (1) 16. doi : 10.1186/s40364-021-00269-w . PMC 7934534. PMID 33663617 .
- ↑ هيربوث إس، هاوسمان جي، ليري إم، لونغاكر إم، بايلر إس، لابينسكا كيه، وآخرون (2015). " التحول الظهاري-الميزانشيمي وانتقال الورم" . الطب السريري والتحويلي . 4 (1): 6. doi : 10.1186/s40169-015-0048-3 . PMC 4385028. PMID 25852822 .
- 1 2 3 سيلو إتش، لوبوبين تي، شابوي سي، سميث آر، هيجيل إيه، سينغ إتش آر، وآخرون . (ديسمبر 2016). "يحفز مُعدِّل الكروماتين Alc1 المعتمد على عديد (أدينوزين ثنائي الفوسفات-ريبوز) استرخاء الكروماتين الموضعي عند تلف الحمض النووي" . علم الأحياء الجزيئي للخلية . 27 (24): 3791-3799 . doi : 10.1091/mbc.E16-05-0269 . PMC 5170603. PMID 27733626 .
- 1 2 هاينس جيه إف، ماكدونالد دي، رودريغ إيه، ديري يو، ماسون جيه واي، هندزل إم جيه، وآخرون . (يناير 2008). "حركية استقطاب بروتينات MRE11 وNBS1 إلى مواقع تلف الحمض النووي المتعددة، المعتمدة على PARP1" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 283 (2): 1197-1208 . doi : 10.1074/jbc.M706734200 . PMID 18025084 .
- ↑ وانغ ل، تشين ك، تشين ز (يوليو 2021). "الأساس البنيوي للتثبيط الذاتي لـ ALC1/CHD1L وآلية التنشيط بواسطة النيوكليوسوم" . نيتشر كوميونيكيشنز . 12 (1) 4057. doi : 10.1038/s41467-021-24320-4 . PMC 8249414. PMID 34210977 .
- ↑ ليمان إل سي، باسيك إل، هيويت جي، براكمان كيه، سابانتسيف إيه، غولييه جي، وآخرون . (ديسمبر 2020). " رؤى آلية حول تنظيم مُعدِّل ALC1 بواسطة الرقعة الحمضية للنيوكليوسوم" . تقارير الخلية . 33 (12) 108529. doi : 10.1016/j.celrep.2020.108529 . PMC 7116876. PMID 33357431 .
- ↑ باينز أ، فرووي إم جي، مارتين جيه إيه، تيباس دي، لويجستربرغ إم إس، كانسوي إم، وآخرون . (أكتوبر 2012). " يعزز PARP1 إصلاح استئصال النيوكليوتيدات من خلال تثبيت DDB2 واستقطاب ALC1" . مجلة بيولوجيا الخلية . 199 (2): 235-249 . doi : 10.1083/jcb.201112132 . PMC 3471223. PMID 23045548 .
- ↑ هارفارد سي (2011). "فهم تأثير تباين عدد النسخ في المنطقة 1q21.1" . مجلة أورفانيت للأمراض النادرة . 6 54. doi : 10.1186/1750-1172-6-54 . PMC 3180300. PMID 21824431 .
روابط خارجية
- موقع جينوم CHD1L البشري وصفحة تفاصيل جين CHD1L في متصفح جينوم UCSC .
للمزيد من القراءة
- ماتوبا ر، أوكوبو ك، هوري ن، فوكوشيما أ، ماتسوبارا ك (سبتمبر 1994). "إضافة معلومات الترميز 5' إلى مكتبة cDNA موجهة 3' تُحسّن تحليل التعبير الجيني". جين . 146 (2): 199-207 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90293-3 . PMID 8076819 .
- ماروياما ك، سوغانو س (يناير 1994). "التغطية بالأوليغو: طريقة بسيطة لاستبدال بنية غطاء الحمض النووي الريبوزي الرسول في حقيقيات النوى بالأوليغوريبونوكليوتيدات". جين . 138 ( 1-2 ): 171-174 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- سوزوكي واي، يوشيتومو-ناكاجاوا كيه، ماروياما كيه، سوياما إيه، سوجانو إس (أكتوبر 1997). "بناء وتوصيف مكتبة cDNA غنية بالطول الكامل ومكتبة غنية بالنهاية 5'". جين . 200 ( 1-2 ): 149-156 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- تشانغ كيو إتش، يي إم، وو إكس واي، رين إس إكس، تشاو إم، تشاو سي جيه، وآخرون (أكتوبر 2000). "استنساخ وتحليل وظيفي للحمض النووي المكمل (cDNA) ذي الأطر المفتوحة للقراءة لـ 300 جين غير محدد سابقًا، معبر عنها في الخلايا الجذعية/الخلايا السلفية المكونة للدم CD34+" . أبحاث الجينوم . 10 (10): 1546-1560 . doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934. PMID 11042152 .
- هارينغتون جيه جيه، شيرف بي، راندليت إس، جاكسون بي دي، بيري آر، كاين إس، وآخرون . (مايو 2001). " إنشاء مكتبات التعبير البروتيني على مستوى الجينوم باستخدام التنشيط العشوائي للتعبير الجيني". مجلة نيتشر للتكنولوجيا الحيوية . 19 (5): 440-445 . doi : 10.1038/88107 . PMID 11329013. S2CID 25064683 .
- كاراس جي آي، كوستاتشر جي، بوهيشا إتش آر، ألين إم دي، بوجيو سي، سيت إف، وآخرون (يونيو 2005). " النطاق الكبير هو وحدة ربط ADP-ribose" . مجلة EMBO . 24 (11): 1911-1920 . doi : 10.1038/sj.emboj.7600664 . PMC 1142602. PMID 15902274 .
- كيمورا ك، واكاماتسو أ، سوزوكي ي، أوتا ت، نيشيكاوا ت، ياماشيتا ر، وآخرون . (يناير 2006). "تنويع التعديل النسخي: تحديد وتوصيف واسع النطاق للمحفزات البديلة المحتملة للجينات البشرية" . أبحاث الجينوم . 16 (1): 55-65 . doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129. PMID 16344560 .
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 1
- أجزاء جينية من الكروموسوم البشري 1
