تشيبي
 | |
| محتوى | |
|---|---|
| وصف | قاعدة البيانات الكيميائية |
| أنواع البيانات الملتقطة | المركبات الكيميائية الصغيرة |
| اتصال | |
| مركز الأبحاث | المختبر الأوروبي لعلم الأحياء الجزيئي  |
| معمل | المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية  |
| الاستشهاد الأساسي | دي ماتوس وآخرون [1] |
| وصول | |
| موقع إلكتروني | www.ebi.ac.uk/chebi |
| رابط التحميل | ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi |
| عنوان URL لخدمة الويب | www.ebi.ac.uk/chebi/webServices.do |
| نقطة نهاية Sparql | بيو2RDF |
| أدوات | |
| الويب | www.ebi.ac.uk/chebi |
| متنوع | |
تردد إصدار البيانات | شهريا |
| سياسة التحرير | تم تنظيمها يدويًا |
الكيانات الكيميائية ذات الأهمية البيولوجية ، والمعروفة أيضًا باسم ChEBI ، [1] [2] هي قاعدة بيانات كيميائية وعلم وجود للكيانات الجزيئية تركز على المركبات الكيميائية "الصغيرة"، وهي جزء من جهود علم الوجود الطبي الحيوي المفتوح (OBO) في المعهد الأوروبي لعلم المعلومات الحيوية ( EBI). يشير مصطلح "الكيان الجزيئي" إلى أي " ذرة أو جزيء أو أيون أو زوج أيونات أو جذر أو أيون جذري أو مركب أو مطابق متميز دستوريًا أو نظيريًا، يمكن التعرف عليه ككيان مميز بشكل منفصل". [ 3] الكيانات الجزيئية المعنية هي إما منتجات طبيعية أو منتجات صناعية لها نشاط حيوي محتمل. الجزيئات المشفرة مباشرة بواسطة الجينوم، مثل الأحماض النووية والبروتينات والببتيدات المشتقة من البروتينات عن طريق الانقسام البروتيني ، ليست مدرجة كقاعدة في ChEBI.
يستخدم ChEBI التسمية والرمزية والمصطلحات المعتمدة من قبل الاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية (IUPAC) ولجنة التسمية التابعة للاتحاد الدولي للكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية (NC-IUBMB).
النطاق والوصول
جميع البيانات الموجودة في قاعدة البيانات غير مملوكة أو مستمدة من مصدر غير مملوك. وبالتالي فهي متاحة للجميع ويمكن الوصول إليها بحرية. بالإضافة إلى ذلك، يمكن تتبع كل عنصر بيانات بالكامل والإشارة إليه صراحةً بالمصدر الأصلي. وهي مرتبطة في نطاقها بقواعد بيانات أخرى مثل ChEMBL و ChemSpider و DrugBank و MetaboLights و PubChem .
تتوفر بيانات ChEBI من خلال تطبيق ويب عام وخدمات الويب ونقطة نهاية SPARQL والتنزيلات. [1] [2]
مراجع
- ^ abc de Matos P, Alcántara R, Dekker A, Ennis M, Hastings J, Haug K, Spiteri I, Turner S, Steinbeck C (2010). "الكيانات الكيميائية ذات الأهمية البيولوجية: تحديث". أبحاث الأحماض النووية . 38 (إصدار قاعدة البيانات): D249-54. doi :10.1093/nar/gkp886. PMC 2808869. PMID 19854951 .
- ^ ab Degtyarenko K, de Matos P, Ennis M, Hastings J, Zbinden M, McNaught A, Alcántara R, Darsow M, Guedj M, Ashburner M (2008). "ChEBI: قاعدة بيانات وعلم مصطلحات للكيانات الكيميائية ذات الأهمية البيولوجية". Nucleic Acids Research . 36 (إصدار قاعدة البيانات): D344-50. doi :10.1093/nar/gkm791. PMC 2238832. PMID 17932057 .
- ^ IUPAC ، Compendium of Chemical Terminology ، الطبعة الثانية ("الكتاب الذهبي") (1997). النسخة المصححة على الإنترنت: (2006–) "الكيان الجزيئي". doi :10.1351/goldbook.M03986
معرف ChEBI (P683) (انظر الاستخدامات )
