جاكوبا

جاكوبا جنسٌ ضمن تصنيف إكسكافاتا ، ^{[ 1 ] [ 2 ]} ويضم حاليًا نوعًا واحدًا موصوفًا، هو جاكوبا ليبرا الذي وصفه باترسون عام 1990، ^{[ 3 ]} وسُمّي تكريمًا لعالم النبات الهولندي (علم الطحالب، وعلم الفطريات، وعلم الأشنات) جاكوبا روينن. ^{[ 4 ]} ( أُعيد تسمية جاكوبا إنكارسيراتا، التي وُصفت سابقًا، إلى أندلوسيا إنكارسيراتا ، أما جاكوبا باهامينسيس / جاكوبا باهامينسيس فلم يُوصف رسميًا بعد.) ^{[ 5 ]}

الياكوبا هي كائنات سوطية صغيرة تتغذى على البكتيريا ( الجاكوبيات ) توجد في البيئات البحرية ^{[ 6 ]} والبيئات شديدة الملوحة . ^{[ 5 ]} وهي خلايا غذائية حرة السباحة ذات سوطين ، ويتراوح طولها بين خمسة وعشرة ميكرومترات. تدور الخلايا حول محورها الطولي لتتمكن من السباحة في خطوط مستقيمة ^{[ 6 ]،} إلا إذا حدث تشوه أو "تلوٍّ" نتيجةً للضغط على الحطام. أثناء التغذية، تُزال البكتيريا من عمود الماء بواسطة تيار يُحدثه السوط الخلفي . يتسبب هذا التيار في تجمع البكتيريا في الأخدود ^{[ 7 ]} على الجانب البطني الأيمن للخلية ^{[ 6 ]} ، مما يُساعد في ابتلاعها وتكوين فجوات غذائية . ^{[ 7 ]}

لا تُعدّ المكونات الخلوية لبكتيريا جاكوبا فريدةً بشكلٍ خاص. فهي تحتوي على نواة واحدة تقع بالقرب من قواعد الأسواط ، وجهاز غولجي واحد ، كما أن أعراف الميتوكوندريا مُسطّحة، مما يُشير إلى صلة قرابة مع أنواع أخرى من البكتيريا ذات الأعراف المُسطّحة. وتُعتبر ميتوكوندريا جاكوبا ذات أهمية خاصة من الناحية التطورية نظرًا لجينوماتها الميتوكوندرية الفريدة الشبيهة بالبكتيريا . وقد وُجد أن جينوماتها الميتوكوندرية تحتوي على عدد أكبر بكثير من الجينات الوظيفية مقارنةً بجينومات مجموعات حقيقيات النوى الأخرى ، ويبدو أنها احتفظت ببوليميراز الحمض النووي الريبي (RNA) الخاص بالبكتيريا الحقيقية ، والذي استُبدل ببوليميراز من النوع الفيروسي في جميع حقيقيات النوى الميتوكوندرية الأخرى. وبشكل عام، تُعتبر جينومات ميتوكوندريا جاكوبا مُعقّدة بشكلٍ بدائي، حيث تُشبه أسلافها من البروتيوكتيريا أكثر من أي ميتوكوندريا أخرى . ^{[ 8 ]}

تتكاثر طحالب جاكوبا لا جنسياً عن طريق الانشطار الثنائي . ولم يُلاحظ التكاثر الجنسي أو تكوين الأكياس . ^{[ 6 ]}

يبلغ حجم الجينوم الميتوكوندري الدائري لسلالة جاكوبا ليبرا ATCC 50422 حوالي 96.6 كيلو قاعدة. وقد أوشك تسلسله على الانتهاء. حتى الآن، تم تحديد 77 جينًا، لا يحتوي أي منها على إنترون. تشكل المناطق بين الجينات حوالي 30% من الجينوم، وتحتوي على تجمعات من التكرارات المتتالية التي يبلغ طول الوحدة الواحدة منها حوالي 20 قاعدة. توجد الجينات المنسوخة على كلا شريطي الحمض النووي . تُستخدم الشفرة الوراثية القياسية للترجمة . تشمل الجينات المشفرة تلك الموجودة عادةً في الحمض النووي الميتوكوندري ، بما في ذلك الجينات المشفرة للبروتين nad1، 2، 3، 4، 4L، 5، 6، cob، cox1، 2، 3، وatp6، 8، 9، بالإضافة إلى جينات الحمض النووي الريبوزي للوحدة الفرعية الكبيرة (rnl) والوحدة الفرعية الصغيرة (rns)، وأكثر من 22 جينًا للحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA ). كما يوجد عدد من جينات البروتين النموذجية للطلائعيات، ولكنها غير موجودة في الحمض النووي الميتوكوندري للحيوانات أو الفطريات . وتشمل هذه تتضمن الجينات المشفرة بواسطة الحمض النووي للميتوكوندريا في فطر J. libera الجينات nad7 و9 و11 وatp1 وrpl2 و5 و6 و14 و16 وrps2-4 و11-14 و19. كما يحتوي الحمض النووي للميتوكوندريا في هذا الفطر على عدد من الإطارات المفتوحة للقراءة الفريدة. وتُعد بعض جينات الميتوكوندريا في فطر J. libera نادرة أو غائبة في جينومات الميتوكوندريا الأخرى، ولكنها موجودة في البكتيريا . ومن بين هذه الجينات النادرة أو الفريدة المشفرة بواسطة الحمض النووي للميتوكوندريا: dpo وrpoB وC وrrn5 وrnpB وtufA وyejU-W، بالإضافة إلى العديد من جينات البروتينات الريبوزومية. "تُظهر مقارنة ترتيب الجينات في الحمض النووي للميتوكوندريا (mtDNA) لبكتيريا J. libera ..." تجمعات جينية غير موجودة في البكتيريا ، ولكنها ظهرت بوضوح خلال تطور جينوم الميتوكوندريا بعد انفصال الميتوكوندريا الأولية عن السلالة البكتيرية. ومن الأمثلة على ذلك التجمعات الجينية من sdh3 إلى nad5 (التي تضم 5 جينات)، وatp8-[trn]-rps4-atp9، وnad11-nad1-cox11-cox3-tufA." ^{[ 9 ]}

تتوفر حاليًا ثلاثة سلالات من فطر جاكوبا ليبرا للزراعة. لا يمكن زراعتها في بيئة خالية من الكائنات الحية الأخرى ، ولكن يمكن تربيتها بسهولة في بيئات غذائية بسيطة مع إضافة بكتيريا ( كليبسيلا أيروجينز ) ^{[ 6 ].}

الياكوبيد ( جاكوبيدا أو جاكوبيا )

• هيستونا : 2-3 أنواع
• Reclinomonas : نوع واحد ^{[ 10 ]}

مالاوي موناس : نوع واحد موصوف

ريتورتاموناد :

• ريتورتاموناس
• شيلوماستيكس ^{[ 6 ]}

الكائنات الحية الشبيهة بـ Carpediemonas :

• كاربيديموناس
• خلل الانسداد
• هيكانونكتس
• إرغوبيباموس
• كيبفيرليا