ماثيو بلانشيت (عالم الأحياء الحاسوبية)
ماثيو دانيال بلانشيت عالم أحياء حاسوبية ومدير كلية علوم الحاسوب في جامعة ماكجيل . يركز بحثه على تطوير خوارزميات جديدة للكشف عن المناطق الوظيفية في تسلسلات الحمض النووي . [ 1 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]
تعليم
درس بلانشيت الرياضيات وعلوم الحاسوب في مرحلة البكالوريوس (1997)، ثم درس علوم الحاسوب في مرحلة الماجستير (1998)، وكلاهما في جامعة مونتريال . حصل على درجة الدكتوراه من جامعة واشنطن عام 2002، تحت إشراف مارتن تومبا. [ 2 ] [ 11 ] وقدّم في أطروحته، بعنوان "خوارزميات البصمة التطورية" ، [ 2 ] أول خوارزمية معقولة لتصنيف الجينات حسب ترتيبها ، وتناول بالتفصيل مفهوم البصمة التطورية . [ 12 ] بعد ذلك، عمل باحثًا ما بعد الدكتوراه في مركز العلوم والهندسة الجزيئية الحيوية بجامعة كاليفورنيا، سانتا كروز ، مع ديفيد هاوسلر . [ 11 ] [ 12 ]
بحث
أصبح بلانشيت أستاذاً مشاركاً في كلية علوم الحاسوب بجامعة ماكجيل عام ٢٠٠٢. ويركز بحثه [ ١ ] [ ٤ ] [ ٥ ] على تطوير أساليب حسابية للكشف عن المناطق الوظيفية في تسلسلات الحمض النووي. وقد طوّر خلال فترة ما بعد الدكتوراه خوارزميات لإعادة بناء جينومات الثدييات السلفية. ويواصل عمله الأخير هذا المسار، لا سيما فيما يتعلق بتطوير خوارزميات لاستنتاج تنظيم الجينات. [ ٣ ] [ ١٢ ] [ ١٣ ] [ ١٤ ] [ ١٥ ]
الجوائز والتكريمات
حصل بلانشيت على جائزة أوفرتون من الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي عام 2006، تقديراً لمساهماته الأساسية والموثوقة في العديد من مجالات المعلوماتية الحيوية. [ 12 ] كما حصل على زمالة سلون البحثية عام 2007. [ 16 ]
عملت بلانشيت في هيئة تحرير مجلة أبحاث الجينوم ، ومنذ عام 2014، تعمل في هيئة تحرير مجلة خوارزميات البيولوجيا الجزيئية . [ 11 ] [ 17 ]
مراجع
- 1 2 3 منشورات ماثيو بلانشيت المفهرسة بواسطة جوجل سكولار
- 1 2 3 بلانشيت، ماثيو دانيال (2002). خوارزميات البصمة الوراثية (أطروحة دكتوراه). جامعة واشنطن. بروكويست 305515226 .
- 1 2 "ماثيو بلانشيت - أستاذ مساعد، كلية علوم الحاسوب، جامعة ماكجيل" . تم الاطلاع عليه في 2 مارس 2014 .
- 1 2 ماثيو بلانشيت في خادم ببليوغرافيا DBLP
- 1 2 منشورات بلانشيت، ماثيو مفهرسة في قاعدة بيانات سكوبس الببليوغرافية. (الاشتراك مطلوب)
- ↑ بلانشيت، م.؛ كينت، و.ج.؛ ريمر، س.؛ إلنيتسكي، ل.؛ سميت، أ.ف.؛ روسكين، ك.م.؛ بيرتش، ر.؛ روزنبلوم، ك.؛ كلاوسون، هـ.؛ غرين، إ.د.؛ هاوسلر، د.؛ ميلر، و. (2004). "محاذاة تسلسلات جينومية متعددة باستخدام أداة محاذاة مجموعات الكتل المترابطة" . أبحاث الجينوم . 14 (4): 708-715 . doi : 10.1101/gr.1933104 . PMC 383317. PMID 15060014 .
- ↑ توماس، جيه دبليو؛ توتشمان، جيه دبليو؛ بليكيسلي، آر دبليو؛ بوفارد، جي جي؛ بيكستروم-ستيرنبرغ، إس إم؛ مارغوليس، إي إتش؛ بلانشيت، إم؛ سيبل، إيه سي؛ توماس، بي جيه؛ ماكدويل، جيه سي؛ ماسكيري، بي؛ هانسن، إن إف؛ شوارتز، إم إس؛ ويبر، آر جيه؛ كينت، دبليو جيه؛ كارولتشيك، دي؛ بروين، تي سي؛ بيفان، آر؛ كاتلر، دي جيه؛ شوارتز، إس؛ إلنيتسكي، إل؛ أيدول، جيه آر؛ براساد، إيه بي؛ لي-لين، إس كيو؛ مادورو، في في؛ سامرز، تي جيه؛ بورتنوي، إم إي؛ ديتريش، إن إل؛ أختر، إن؛ وآخرون . (2003). "تحليلات مقارنة لتسلسلات متعددة الأنواع من مناطق جينومية مستهدفة" . نيتشر . 424 (6950): 788–93 . Bibcode : 2003Natur.424..788T . doi : 10.1038 / nature01858 . PMID 12917688. S2CID 2419233 .
- ↑ بلانشيت، م؛ تومبا، م (2002). " اكتشاف العناصر التنظيمية باستخدام طريقة حسابية للبصمة التطورية" . أبحاث الجينوم . 12 (5): 739-48 . doi : 10.1101/gr.6902 . PMC 186562. PMID 11997340 .
- ↑ غيليميت، ب؛ باتاي، أ.ر؛ جيفري، ن؛ آدم، م؛ بلانشيت، م؛ روبرت، ف؛ غودرو، ل (2005). "يُتمركز الهيستون المتغير H2A.Z بشكل عام في محفزات جينات الخميرة غير النشطة وينظم موضع النيوكليوسوم" . مجلة PLOS Biology . 3 (12): e384. doi : 10.1371/journal.pbio.0030384 . PMC 1275524. PMID 16248679 .

- ↑ مارغوليس، إي إتش؛ بلانشيت، إم؛ برنامج التسلسل المقارن التابع للمركز الوطني لعلوم الجينوم؛ هاوسلر، دي؛ غرين، إي دي (2003). " تحديد وتوصيف التسلسلات المحفوظة متعددة الأنواع" . أبحاث الجينوم . 13 (12): 2507-18 . doi : 10.1101/gr.1602203 . PMC 403793. PMID 14656959 .
- 1 2 3 "CompleteCV-2015" (ملف PDF) . تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 أبريل 2021 .
- 1 2 3 4 مايزل، م. (2006). "الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي تُكرّم مايكل س. ووترمان وماثيو بلانشيت" . مجلة PLOS لعلم الأحياء الحاسوبي . 2 (8): e105. رمز Bibcode : 2006PLSCB...2..105M . doi : 10.1371/journal.pcbi.0020105 . PMC 1526462 .

- ↑ بلانشيت، م؛ غرين، إي دي؛ ميلر، دبليو؛ هاوسلر، دي (2004). "إعادة بناء مناطق واسعة من جينوم ثديي سلفي باستخدام المحاكاة الحاسوبية" . أبحاث الجينوم . 14 (12): 2412-2423 . doi : 10.1101/gr.2800104 . PMC 534665. PMID 15574820 .
- ↑ بلانشيت، م (2012). "استغلال جينومات الثدييات السلفية للتنبؤ بمواقع ارتباط عوامل النسخ البشرية" . بي إم سي بيوانفورماتيكس . 13 (ملحق 19): S2. doi : 10.1186/1471-2105-13-S19- S2 . PMC 3526440. PMID 23281809 .

- ↑ تشين، إكس؛ بلانشيت، إم (2007). "التنبؤ بالوحدات التنظيمية الخاصة بالأنسجة باستخدام الشبكات البايزية وأشجار الانحدار" . بي إم سي بيوانفورماتيكس . 8 (ملحق 10): S2. doi : 10.1186/1471-2105-8-S10-S2 . PMC 2230503. PMID 18269696 .

- ↑ "جامعة ماكجيل تحصل على أربع منح سلون" . www.mcgill.ca . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2 مارس 2014 .
- ↑ "خوارزميات البيولوجيا الجزيئية - هيئة التحرير" . www.almob.org . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2 مارس 2014 .
- علماء المعلوماتية الحيوية الكنديون
- الناس الأحياء
- خريجو جامعة مونتريال
- خريجو جامعة واشنطن
- أعضاء الهيئة التدريسية في جامعة ماكجيل
- الفائزون بجائزة أوفرتون
