نطاق NACHT

يُعد نطاق NACHT نطاقًا بروتينيًا محفوظًا تطوريًا . يوجد هذا النطاق NTPase في بروتينات موت الخلايا المبرمج ، وكذلك في البروتينات المشاركة في نسخ MHC . [ 1 ] ويعكس اسمه بعض البروتينات التي تحتوي عليه: NAIP ( بروتين مثبط موت الخلايا المبرمج من عائلة NLP )، وCIITA (أي C2TA أو منشط نسخ MHC من الفئة الثانية )، وHET-E (بروتين موقع عدم التوافق من Podospora anserina )، و TEP1 (أي TP1 أو البروتين المرتبط بالتيلوميراز).

يحتوي نطاق NACHT على ما بين 300 و400 حمض أميني . وهو نطاق نيوكليوزيد ثلاثي الفوسفاتاز (NTPase) متوقع، ويوجد في البروتينات الحيوانية والفطرية والبكتيرية . ويرتبط هذا النطاق بنطاقات أخرى، مثل نطاق تجنيد الكاسبيز ( InterPro : IPR001315ونطاق البيرين ( InterPro : IPR004020ونطاق تكرار HEAT ( InterPro : IPR004155وتكرار WD40 ( InterPro : IPR001680وتكرار الليوسين الغني (LRR)، أو تكرار BIR ( InterPro : IPR001370 ). [ 1 ]     

يتكون نطاق NACHT من سبعة أنماط محفوظة مميزة، تشمل حلقة P الخاصة بـ ATP/GTPase، وموقع ارتباط أيون المغنيسيوم ( نمطي Walker A وB على التوالي)، وخمسة أنماط أخرى أكثر تحديدًا. ومن السمات الفريدة لنطاق NACHT شيوع بقايا صغيرة (جليسين، ألانين، أو سيرين) تقع مباشرةً في الطرف الكربوكسيلي لحمض الأسبارتيك المنسق لأيون المغنيسيوم في نمط Walker B، بدلاً من بقايا حمضية ثانية شائعة في أنواع NTPase الأخرى. توجد البقايا الحمضية الثانية عادةً في البروتينات الحاوية على نطاق NACHT في موقعين لاحقين. علاوة على ذلك، يحتوي النمط السابع البعيد على نمط محفوظ من البقايا القطبية والعطرية والكارهة للماء، وهو نمط غير موجود في أي عائلة أخرى من NTPase. [ 1 ]

أمثلة

تشمل البروتينات البشرية التي تحتوي على هذا النطاق ما يلي:

مراجع

  1. 1 2 3 كونين إي في، أرافيند إل (مايو 2000). "عائلة NACHT - مجموعة جديدة من NTPases المتوقعة والمتورطة في موت الخلايا المبرمج وتنشيط نسخ MHC". اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 25 (5): 223-224 . doi : 10.1016/S0968-0004(00)01577-2 . PMID 10782090 .