إنزيم ديفورميلاز الببتيد

في علم الإنزيمات ، فإن إنزيم ببتيد ديفورميلاز ( EC 3.5.1.88 ) هو إنزيم يزيل مجموعة الفورميل من الطرف الأميني لسلاسل الببتيد الوليدة في البكتيريا الحقيقية والميتوكوندريا والبلاستيدات الخضراء . ^{[ 1 ]}

إنزيمات إزالة الفورميل الببتيدية هي إنزيمات معدنية أحادية الوحدات، وترتبط بعامل مساعد معدني، عادةً ما يكون الحديد الثنائي أو الزنك، في الموقع النشط. تؤثر هوية العامل المساعد على الكفاءة التحفيزية. ^{[ 2 ]}

يوجد نوعان من إنزيمات إزالة الفورميل الببتيدية، النوع الأول والنوع الثاني، والتي تختلف في التركيب بشكل رئيسي في السطح الخارجي للبروتين.

يمتلك جين PDF البشري هذه الخاصية.

يزيل إنزيم ديفورميلاز الببتيد مجموعة الفورميل من الطرف الأميني (N) للبروتينات حديثة التكوين أثناء تصنيعها بواسطة الريبوسوم . ويمكن وصف وظيفة هذا الإنزيم بالمعادلة التالية، حيث يتفاعل فورميل-L-ميثيونيل ببتيد مع الماء لتكوين الفورمات وميثيونيل ببتيد:

H₂O + _ببتيد فورميل-L-ميثيونيل${\displaystyle \rightleftharpoons }$ببتيد الميثيونيل + فورمات

يحدث هذا التفاعل على سطح الريبوسوم، حيث يتفاعل الحلزون ألفا الطرفي C لإنزيم ديفورميلاز الببتيد مع أخدود بين البروتينات الريبوسومية uL22 و bL32، و rRNA. ^{[ 3 ]}

ينتمي هذا الإنزيم، من حيث وظيفته، إلى عائلة الهيدرولازات ، وهي تلك التي تعمل على روابط الكربون-نيتروجين غير الروابط الببتيدية، وتحديداً في الأميدات الخطية. والاسم النظامي لهذه الفئة من الإنزيمات هو فورميل-إل-ميثيونيل ببتيد أميدوهيدرولاز .

حتى أواخر عام 2007، تم تحديد 34 بنية لهذه الفئة من الإنزيمات، مع رموز الوصول PDB التالية : PDB : 1IX1 ​,PDB : 1LM4 ​,PDB : 1LM6 ​,PDB : 1LME ​,PDB : 1LQW ​,PDB : 1LQY ​,PDB : 1LRU ​,PDB : 1LRY ​,PDB : 1N5N ​,PDB : 1Q1Y ​,PDB : 1S17 ​,PDB : 1SV2 ​,PDB : 1SZZ ​,PDB : 1V3Y ​,PDB : 1VEV ​,PDB : 1VEY ​,PDB : 1VEZ ​,PDB : 1WS0 ​,PDB : 1WS1 ​,PDB : 1XEM ​,PDB : 1XEN ​,PDB : 1XEO ​,PDB : 1Y6H ​,PDB : 1ZXZ ​,PDB : 1ZY0 ​,PDB : 1ZY1 ​,PDB : 2AI7 ​,PDB : 2AI8 ​,PDB : 2AI9 ​,PDB : 2AIA ​,PDB : 2AIE ​,PDB : 2EW5 ​,PDB : 2EW6 ​, and PDB : 2EW7 ​.

• أكتينونين