رقم لجنة الإنزيمات

📅 آخر تحديث: ٢٥ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٥ يوليو ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

رقم لجنة الإنزيمات ( رقم EC ) هو نظام تصنيف رقمي للإنزيمات ، يعتمد على التفاعلات الكيميائية التي تحفزها . [ 1 ] وكنظام لتسمية الإنزيمات ، يرتبط كل رقم EC باسم موصى به للتفاعل المحفز بالإنزيم المقابل.

لا تُحدد أرقام EC الإنزيمات، بل تُحدد التفاعلات التي تُحفزها الإنزيمات. فإذا حفزت إنزيمات مختلفة (مثلاً من كائنات حية مختلفة) التفاعل نفسه، فإنها تحصل على رقم EC نفسه. [ 2 ] علاوة على ذلك، من خلال التطور التقاربي ، يمكن لبروتينات ذات طيات مختلفة تمامًا أن تُحفز التفاعل نفسه (وتُسمى أحيانًا بالإنزيمات غير المتجانسة متساوية الوظيفة ) [ 3 ] ، وبالتالي تُخصص لها نفس رقم EC. في المقابل، تُحدد مُعرفات UniProt البروتين بشكل فريد من خلال تسلسل الأحماض الأمينية الخاص به. [ 4 ]

تنسيق الرقم

يتكون كل رمز إنزيمي من الأحرف "EC" متبوعة بأربعة أرقام مفصولة بنقاط. تمثل هذه الأرقام تصنيفًا أدق تدريجيًا للإنزيم. توجد أرقام EC أولية تحتوي على الحرف "n" كجزء من الرقم الرابع (التسلسلي) (مثل EC 3.5.1.n3). [ 2 ]

على سبيل المثال، تحمل أمينوببتيدازات ثلاثي الببتيد الرمز "EC 3.4.11.4"، وتشير مكوناتها إلى المجموعات التالية من الإنزيمات:

رموز المستوى الأعلى

ملاحظة: رقم تصنيف الإنزيم يختلف عن "رقم التنسيق".

أرقام المفوضية الأوروبية من المستوى الأعلى [ 5 ]
فصلالتفاعل المحفزرد الفعل النموذجيمثال (أمثلة) على إنزيم ذي اسم شائع
إنزيمات الأكسدة والاختزال EC 1

تفاعلات الأكسدة والاختزال؛ انتقال ذرات الهيدروجين والأكسجين أو الإلكترونات من مادة إلى أخرى

AH + B → A + BH ( مختزل ) A + O → AO ( مؤكسد )نازعة الهيدروجين ، أوكسيداز
ناقلات EC 2نقل مجموعة وظيفية من مادة إلى أخرى. قد تكون هذه المجموعة مجموعة ميثيل، أو أسيل، أو أمينو، أو فوسفات.AB + C → A + BCناقلة الأمين ، كيناز
هيدرولازات EC 3تكوين منتجين من مادة أساسية عن طريق التحلل المائيAB + H₂O → AOH + BHالليباز ، الأميليز ، الببتيداز ، الفوسفاتاز
ليازات EC 4إضافة أو إزالة مجموعات من الركائز دون تحلل مائي. يمكن كسر روابط CC أو CN أو CO أو CS.RCOCOOH → RCOH + CO 2 أو [X-A+BY] → [A=B + XY]ديكاربوكسيلاز
إيزوميرازات EC 5إعادة ترتيب داخل الجزيء، أي تغيرات التماثل داخل جزيء واحدABC → BCAإيزوميراز ، ميوتيز
إنزيمات الربط EC 6يتم ربط جزيئين معًا عن طريق تكوين روابط جديدة من نوع CO أو CS أو CN أو CC مع التحلل المتزامن لجزيء ATPX + Y + ATP → XY + ADP + Piسينثاز
ناقلات EC 7تحفيز حركة الأيونات أو الجزيئات عبر الأغشية أو فصلها داخل الأغشيةAX + B الجانب 1 = A + X + B الجانب 2ناقل ، ناقل الأورنيثين ، مضخة الصوديوم والبوتاسيوم

تشابه التفاعل

يمكن حساب التشابه بين التفاعلات الإنزيمية باستخدام تغيرات الروابط أو مراكز التفاعل أو مقاييس البنية الفرعية (المعروفة سابقًا باسم EC-BLAST، وهي الآن بوابة EMBL-EBI للإنزيمات). [ 6 ]

تاريخ

قبل تطوير نظام ترقيم EC، كانت الإنزيمات تُسمى بطريقة عشوائية، وكانت أسماء مثل "الإنزيم الأصفر القديم" و "إنزيم الماليك" - التي لا تُشير إلا قليلاً أو لا تُشير إطلاقاً إلى التفاعل الذي يُحفزه الإنزيم - شائعة الاستخدام. وقد هُجرت معظم هذه الأسماء، مع أن بعضها، وخاصة الإنزيمات المحللة للبروتين ذات التخصص المنخفض جداً، مثل البيبسين والباباين ، لا يزال يُستخدم، نظراً لصعوبة التصنيف المنطقي القائم على التخصص.

بحلول خمسينيات القرن العشرين، باتت الفوضى لا تُطاق، وبعد أن اقترح هوفمان-أوستنهوف [ 7 ] وديكسون وويب [ 8 ] مخططات متشابهة إلى حد ما لتصنيف التفاعلات المحفزة بالإنزيمات، أنشأ المؤتمر الدولي للكيمياء الحيوية في بروكسل لجنة الإنزيمات برئاسة مالكولم ديكسون عام 1955. نُشرت النسخة الأولى عام 1961، وحُلّت لجنة الإنزيمات في ذلك الوقت، مع أن اسمها لا يزال يُستخدم في مصطلح " رقم EC" . تحتوي الطبعة السادسة الحالية، التي نشرها الاتحاد الدولي للكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية عام 1992 كآخر نسخة مطبوعة، على 3196 إنزيمًا مختلفًا. نُشرت الملاحق من 1 إلى 4 بين عامي 1993 و1999. أما الملاحق اللاحقة، فقد نُشرت إلكترونيًا على موقع لجنة التسميات التابعة للاتحاد الدولي للكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية. [ 5 ] في أغسطس 2018، قام الاتحاد الدولي للكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية بتعديل النظام بإضافة فئة EC 7 ذات المستوى الأعلى والتي تحتوي على ناقلات. [ 9 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ ويب، إي سي (1992). تسمية الإنزيمات 1992: توصيات لجنة التسمية التابعة للاتحاد الدولي للكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية بشأن تسمية وتصنيف الإنزيمات . دار النشر الأكاديمية. ISBN 978-0-12-227164-9.
  2. 1 2 "ENZYME (قاعدة بيانات تسمية الإنزيمات)" . ExPASy. مؤرشف من الأصل في 21 مارس 2019. تم الاطلاع عليه في 24 أبريل 2019 .
  3. ↑ أوميلتشينكو إم في، غالبرين إم واي، وولف واي آي، كونين إي في (2010). "الإنزيمات غير المتجانسة متساوية الوظائف: تحليل منهجي للحلول البديلة في تطور الإنزيمات" . بيولوجي دايركت . 5 (1) 31. doi : 10.1186/1745-6150-5-31 . PMC 2876114. PMID 20433725 .  
  4. ↑ Apweiler R، Bairoch A، Wu CH، Barker WC، Boeckmann B، Ferro S، Gasteiger E، Huang H، Lopez R، Magrane M، Martin MJ، Natale DA، O'Donovan C، Redaschi N، Yeh LS (يناير 2004). "UniProt: قاعدة المعرفة العالمية للبروتين" . أبحاث الأحماض النووية . 32 (إصدار قاعدة البيانات): D115–9. دوى : 10.1093/نار/gkh131 . بمك 308865 . بميد 14681372 .  
  5. 1 2 موس، جي بي. "توصيات لجنة التسمية" . الاتحاد الدولي للكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية بشأن تسمية وتصنيف الإنزيمات حسب التفاعلات التي تحفزها. مؤرشف من الأصل بتاريخ 10 سبتمبر 2018. تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 مارس 2006 .
  6. ↑ رحمن، س. أ.، كويستا، س. م.، فورنهام، ن.، هوليداي، ج. ل.، ثورنتون، ج. م. (فبراير 2014). " EC-BLAST: أداة للبحث والمقارنة التلقائية لتفاعلات الإنزيمات" . Nature Methods . 11 (2): 171–174 . doi : 10.1038/nmeth.2803 . PMC 4122987. PMID 24412978 .  
  7. ↑ هوفمان-أوستنهوف، أ. (1953). "مقترحات لتصنيف وتسمية أكثر عقلانية للإنزيمات". التقدم في علم الإنزيمات والمجالات ذات الصلة في البيولوجيا الجزيئية . المجلد 14. الصفحات 219-260 . doi : 10.1002/9780470122594.ch7 . ISBN   9780470122594PMID 13057718​​ {{cite book}}عدم توافق رقم ISBN / التاريخ ( مساعدة )
  8. ↑ ديكسون، م؛ ويب، إي سي (1958). الإنزيمات . لندن: لونجمانز جرين. ص 183-227 . 
  9. ↑ تيبتون، كيث (أغسطس 2018). "أخبار تسمية الإنزيمات: ناقلات الإنزيمات (EC 7): فئة EC جديدة" . ExplorEnz: المصدر الرئيسي لقائمة إنزيمات الاتحاد الدولي للكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية. مؤرشف من الأصل في 10 سبتمبر 2018. تم الاطلاع عليه في 3 نوفمبر 2018 .