RFX1
إن عامل تنظيم MHC من الفئة الثانية RFX1 هو بروتين يتم ترميزه في البشر بواسطة جين RFX1 الموجود على الذراع القصير للكروموسوم 19. [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
بناء
يُعدّ جين RFX1 أحد أفراد عائلة جينات العامل التنظيمي X (RFX)، التي تُشفّر عوامل نسخ تحتوي على خمسة نطاقات محفوظة، بما في ذلك نطاق ارتباط الحمض النووي DNA ذو اللولب المجنح ، وهو نطاق محفوظ للغاية ويقع في المنتصف، بالإضافة إلى نطاق التماثل الثنائي الموجود في المنطقة الطرفية C من التسلسل. [ 8 ] وبصرف النظر عن هذه النطاقات الخمسة المحفوظة، تتباين بروتينات RFX بشكل كبير. ولا تُظهر نطاقات ارتباط الحمض النووي DNA والتماثل الثنائي لبروتينات عائلة RFX أي تشابه مع النطاقات الأخرى ذات الوظائف نفسها في البروتينات الأخرى. [ 6 ]
توزيع الأنواع
تُعدّ عائلة بروتينات RFX محفوظة في الخميرة الانشطارية (S. pombe) ، والخميرة الجعوية (S. cerevisiae) ، والديدان الأسطوانية (C. elegans ) ، والفئران، والبشر. [ 9 ] يوجد ثمانية بروتينات RFX معروفة في البشر، واثنان في ذباب الفاكهة، وواحد في الديدان الأسطوانية ، وتسعة في الأسماك، [ 10 ] وواحد في كلٍّ من نوعي الخميرة. [ 9 ] [ 11 ]
وظيفة
البروتين المُشفَّر بواسطة هذا الجين مُرتبط بنيويًا بالعوامل التنظيمية X2 و X3 و X4 و X5 . وهو مُنشِّط نسخ قادر على الارتباط بالحمض النووي كجزيء أحادي أو كجزيء ثنائي غير متجانس مع أفراد عائلة RFX X2 وX3 وX5، ولكن ليس مع X4. يرتبط هذا البروتين بمواقع Xbox في جينات معقد التوافق النسيجي الرئيسي من الفئة الثانية ، وهو ضروري لتعبيرها. كما أنه قادر على الارتباط بتكرار معكوس مطلوب لتعبير جينات فيروس التهاب الكبد B. [ 7 ] تم استنساخ بروتينات RFX وتوصيفها في الأصل نظرًا لتقاربها العالي مع تسلسل مُحفِّز يعمل في نفس الجزيء، يُسمى Xbox، والموجود في جميع جينات معقد التوافق النسيجي الرئيسي من الفئة الثانية. [ 6 ]
وُجد أن مستويات الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) الذي يشفر هذا البروتين، بالإضافة إلى RFX2 وRFX3، مرتفعة باستمرار في الخصية ، وتختلف في الأنسجة الأخرى في جميع أنحاء الجسم. [ 6 ]
يحتوي بروتين RFX1 على تسلسل طرفي كربوكسيلي لا يُظهر أي تشابه واضح مع بروتينات RFX الأخرى. يحتوي هذا الطرف الكربوكسيلي على منطقة حمضية يُعتقد أنها تُساعد في عبور الغشاء النووي. يُفترض وجود وظيفتين رئيسيتين لهذا النطاق: المساهمة في إشارة التموضع النووي (NLS)، بالإضافة إلى التثبيط المتناقض لارتباط الحمض النووي والارتباط النووي. تم تحديد هاتين الوظيفتين في الأصل من خلال طفرات في التسلسل والاندماجات الترجمية مع بروتين الفلورسنت الأخضر (GFP )، ولا يزال الأمر بحاجة إلى تأكيد. [ 12 ]
التفاعلات
مراجع
- 1 2 3 ENSG00000288283 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000132005، ENSG00000288283 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000031706 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ بوغلياتي إل، ديري جيه، بيرغر آر، أوكلا سي، ريث دبليو، ماتش بي (سبتمبر 1992). "تقع جينات عوامل تنظيم معقد التوافق النسيجي الرئيسي من الفئة الثانية RFX1 وRFX2 على الذراع القصير للكروموسوم 19" . علم الجينوم . 13 (4): 1307-1310 . doi : 10.1016/0888-7543(92)90052-T . PMID 1505960 .
- 1 2 3 4 ريث دبليو، يو سي إل إيه سي، باراس إي، غود إيه، دوراند بي، هيريرو-سانشيز سي، كوبر إم، ماتش بي (فبراير 1994). "RFX1، وهو مُنشِّط نسخ مُحسِّن فيروس التهاب الكبد ب الأول، ينتمي إلى عائلة جديدة من البروتينات المتجانسة وغير المتجانسة المرتبطة بالحمض النووي" . بيولوجيا الخلية الجزيئية . 14 (2): 1230-1244 . doi : 10.1128/mcb.14.2.1230 . PMC 358479. PMID 8289803 .
- 1 2 "Entrez Gene: RFX1 regulatory factor X, 1 (influences HLA class II expression)" .
- ↑ إيمري ب، دوراند ب، ماخ ب، ريث و (مارس 1996). "بروتينات RFX، عائلة جديدة من البروتينات الرابطة للحمض النووي محفوظة في مملكة حقيقيات النوى" . أبحاث الأحماض النووية . 24 (5): 803-807 . doi : 10.1093/nar/24.5.803 . PMC 145730. PMID 8600444 .
- 1 2 3 أغامي ر، شاؤول ي (أبريل 1998). "يتم تعزيز نشاط الكيناز لـ c-Abl، وليس v-Abl، من خلال التفاعل المباشر مع RFXI، وهو بروتين يرتبط بمُحسِّنات العديد من الفيروسات والجينات المنظمة لدورة الخلية" . Oncogene . 16 (14): 1779–88 . doi : 10.1038/sj.onc.1201708 . PMID 9583676 .
- ↑ سوغيامان-ترابمان د، فيتيزيتش م، جوهيلاهتي إي إم، ماتيليه أ، لاوتر ج، ميسرا س، داوب سي أو، كير ج، سوبودا ب (2018-03-06). "توصيف عائلة عامل النسخ RFX البشري من خلال تحليل الجينات التنظيمية والمستهدفة" . بي إم سي جينوميكس . 19 (1) 181. doi : 10.1186/ s12864-018-4564-6 . PMC 5838959. PMID 29510665 .
- ↑ أفتاب س، سيمينيك ل، تشو جيه إس، تشين ن (2008). "تحديد وتوصيف عوامل النسخ RFX الجديدة الخاصة بأنسجة الإنسان" . BMC Evol. Biol . 8 (1) 226. Bibcode : 2008BMCEE...8..226A . doi : 10.1186/1471-2148-8-226 . PMC 2533330. PMID 18673564 .
- ↑ كاتان-خايكوفيتش، ي.، وشاؤول، ي. (مايو 2001). "الاستيراد النووي ونشاط ارتباط الحمض النووي لـ RFX1. دليل على آلية تثبيط ذاتي" . المجلة الأوروبية للكيمياء الحيوية . 268 (10): 3108-3116 . doi : 10.1046/j.1432-1327.2001.02211.x . PMID 11358531 .
للمزيد من القراءة
- هيريرو سانشيز سي، ريث دبليو، سيلاسي بي، ماتش بي (1992). "يتعلق خلل ارتباط الحمض النووي الملاحظ في الطفرات التنظيمية للمعقد الرئيسي للتوافق النسيجي من الفئة الثانية بعضو واحد فقط من عائلة من المعقدات المرتبطة بصناديق X لمحفزات الفئة الثانية" . بيولوجيا الخلية الجزيئية 12 ( 9): 4076-4083 . doi : 10.1128/ mcb.12.9.4076 . PMC 360302. PMID 1508204 .
- ريث وآخرون (1991). "يحتوي عامل تنظيم معقد التوافق النسيجي الرئيسي من الفئة الثانية RFX على نطاق ارتباط جديد بالحمض النووي ونطاق تماثل ثنائي مستقل وظيفيًا" . جينز ديف . 4 (9): 1528-1540 . doi : 10.1101/gad.4.9.1528 . PMID 2253877 .
- سافراني جي، وبيري آر بي (1993). "يساعد عامل النسخ RFX1 في التحكم في مُحفِّز جين rpL30 المُشفِّر لبروتين الريبوسوم في الفأر عن طريق الارتباط بعنصره ألفا". جين . 132 (2): 279-283 . doi : 10.1016/0378-1119(93)90208-K . PMID 8224874 .
- سيغريست، سي. أ.، دوراند، ب.، إيمري، ب.، وآخرون (1993). "يُطابق RFX1 عامل المُعزز C ويعمل كمنشط نسخ لمُعزز فيروس التهاب الكبد B" . بيولوجيا الخلية الجزيئية 13 ( 10): 6375-84 . doi : 10.1128/mcb.13.10.6375 . PMC 364696. PMID 8413236 .
- إيمري، ب.، دوراند، ب.، ماخ، ب.، ريث، و. (1996). "بروتينات RFX، عائلة جديدة من البروتينات الرابطة للحمض النووي محفوظة في مملكة حقيقيات النوى" . مجلة أبحاث الأحماض النووية ، 24 (5): 803-807 . doi : 10.1093/nar/24.5.803 . PMC 145730. PMID 8600444 .
- دويل جيه، هوفمان إس، يو سي إل إيه سي، وآخرون (1996). "مواقع الجينات البشرية والفأرية التي تشفر بروتينات عامل النسخ RFX1 وRFX2" . علم الجينوم . 35 (1): 227-230 . doi : 10.1006/geno.1996.0343 . PMID 8661125 .
- كاتان-خايكوفيتش، ي.، وشاؤول، ي. (1998). "RFX1، بروتين واحد رابط للحمض النووي ذو نطاق تماثل ثنائي منقسم، يُولّد مُركّبات بديلة" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 273 (38): 24504-24512 . doi : 10.1074/jbc.273.38.24504 . PMID 9733744 .
- إيواما أ، بان ج، تشانغ ب، وآخرون (1999). "تساهم بروتينات RFX الثنائية في نشاط وتحديد سلالة مُحفِّز مستقبل الإنترلوكين-5 ألفا من خلال نطاقات التنشيط والتثبيط" . بيولوجيا الخلية الجزيئية 19 (6): 3940-3950 . doi : 10.1128/mcb.19.6.3940 . PMC 104353. PMID 10330134 .
- زاجاك-كاي إم، بن-باروخ إن، كستانوس إي، وآخرون (2000). "تحفيز عديدات الببتيد المرتبطة بإنترون Myc، وهما MIBP1 وRFX1، أثناء تمايز الخلايا المكونة للدم بوساطة حمض الريتينويك" . مجلة الكيمياء الحيوية ، 345 ( 3): 535-541 . doi : 10.1042/0264-6021:3450535 . PMC 1220788. PMID 10642512 .
- موروتومي-يانو ك، يانو ك، سايتو هـ، وآخرون (2002). "العامل التنظيمي البشري X 4 (RFX4) هو بروتين ثنائي الوحدات يرتبط بالحمض النووي، خاص بالخصية، ويتعاون مع أعضاء آخرين من عائلة RFX البشرية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 277 (1): 836-42 . doi : 10.1074/jbc.M108638200 . PMID 11682486 .
- سينغوبتا، ب.ك.، فارغو، ج.، سميث، ب.د. (2002). "تتفاعل عائلة RFX عند موقع بدء الكولاجين (COL1A2) وتثبط عملية النسخ" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 277 (28): 24926-37 . doi : 10.1074/jbc.M111712200 . PMID 11986307 .
- ناكاياما أ، موراكامي هـ، ماياما ن، وآخرون (2003). "دور عوامل النسخ RFX في تعطيل مُحفِّز بروتين MAP1A المرتبط بالأنيبيبات الدقيقة في الخلايا غير العصبية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 278 (1): 233-240 . doi : 10.1074/jbc.M209574200 . PMID 12411430 .
- ستراوسبرغ آر إل، فينغولد إي إيه، غراوس إل إتش، وآخرون (2003). "توليد وتحليل أولي لأكثر من 15000 تسلسل كامل الطول من الحمض النووي المكمل (cDNA) البشري والفأري" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 99 (26): 16899-1903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- نوركواي إل دي، يانغ إكس، شيبارد بي، وآخرون (2003). "يرتبط كل من RFX1 وNF-1 بتسلسلات P لموقع هرمون النمو البشري في كروماتين الغدة النخامية". علم الغدد الصماء الجزيئي . 17 (6): 1027-38 . CiteSeerX 10.1.1.325.4046 . doi : 10.1210/me.2003-0025 . PMID 12624117 .
- مايغرين إس، سور آي، نيلسون إم، توفتغارد آر (2004). "دور بروتينات RFX في تنشيط النسخ من عنصر مُحسِّن مُستجيب لـ Ras". أرشيف أبحاث الأمراض الجلدية . 295 (11): 482-489 . doi : 10.1007/s00403-004-0456-5 . PMID 15024578. S2CID 2408607 .
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "توصيف واسع النطاق للبروتينات الفسفورية النووية لخلايا هيلا" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 101 (33): 12130-5 . Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
روابط خارجية
- RFX1+بروتين،+بشري في رؤوس الموضوعات الطبية (MeSH) التابعة للمكتبة الوطنية الأمريكية للطب
تتضمن هذه المقالة نصًا من المكتبة الوطنية الأمريكية للطب ، وهو متاح للعموم .
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 19
- عوامل النسخ
