ثيرموتوغا
Thermotoga هو جنس من شعبة Thermotogota . أعضاء Thermotoga هي بكتيريا محبة للحرارة الشديدة، وخلاياها مغلفة بغشاء خارجي فريد يشبه الغلاف، يسمى "التوغا".
تتصبغ أفراد هذه الشعبة بصبغة غرام السالبة لوجود طبقة رقيقة من الببتيدوغليكان بين طبقتين دهنيتين، على الرغم من أن كلتيهما غير مألوفتين. [ 2 ] يتميز الببتيدوغليكان بكونه غير عادي، إذ أن الرابطة المتشابكة ليست فقط من نوع ميزو-ديامينوبيميلات كما هو الحال في الزائفة ، بل من نوع دي-لايسين أيضًا. [ ملاحظة 1 ] [ 3 ]
هذه الأنواع من الكائنات اللاهوائية ذات درجات متفاوتة من تحمل الأكسجين. وهي قادرة على اختزال الكبريت العنصري (SO ) إلى كبريتيد الهيدروجين. [ 2 ]
لا يزال من غير الواضح ما إذا كانت القدرة على تحمل الحرارة سمة وراثية أم ابتكارًا في السلالة، ولا يمكن تحديد ذلك. تم فك شفرة جينوم Thermotoga maritima في عام 1999، مما كشف عن وجود عدة جينات من أصل أثري، ربما سمحت لها بالتكيف مع الحرارة. [ 4 ] تبلغ نسبة السيتوزين-جوانين (CG) في T. maritima 46.2%؛ [ 2 ] في الواقع، تتميز معظم الكائنات المحبة للحرارة بنسبة عالية من CG؛ وقد أدى ذلك إلى التكهن بأن نسبة CG قد تكون نتيجة غير أساسية للقدرة على تحمل الحرارة، وليست المحرك الرئيسي لها. [ 5 ] [ 6 ]
اسم
تم تأليف الورقة والفصل الموجود في دليل بيرجي من قبل العديد من المؤلفين بما في ذلك علماء الأحياء الدقيقة كارل شتتر وكارل ووز . [ 2 ]
الاسم المؤنث اللاتيني الحديث "thermotoga" يعني "الرداء الخارجي الساخن"، وهو مزيج من الاسم اليوناني θέρμη ( therme ، حرارة) [ 7 ] أو بشكل أدق الصفة θερμός, ή, όν ( thermos, e, on ، ساخن) [ 8 ] والاسم المؤنث اللاتيني toga (الرداء الخارجي الروماني). [ 2 ]
الأعضاء والأقارب
إن العلاقة الدقيقة بين شعبة Thermotogota والشعب الأخرى محل نقاش ( مقارنة بالشعب البكتيرية ): فقد وجدت العديد من الدراسات أنها متفرعة بعمق (في دليل بيرجي ظهرت في الواقع في "المجلد الأول: العتائق والبكتيريا المتفرعة بعمق والبكتيريا الضوئية")، [ 9 ] بينما وجدت دراسات أخرى أن شعبة Firmicutes متفرعة بعمق مع تجمع شعبة Thermotogota بعيدًا عن القاعدة.
النوع النمطي للجنس هو T. maritima ، الذي وُصف لأول مرة عام 1986. [ 2 ] في ذلك الوقت، كان أول نوع يُوصف من هذه الشعبة. يضم جنس Thermotoga حاليًا ثلاثة أنواع رسمية. [ 1 ] نُقلت مؤخرًا ثمانية أنواع من هذا الجنس، وانتهى المطاف بمعظمها ضمن جنس Pseudothermotoga بواسطة بهانداري وغوبتا عام 2014. عُثر على سلالة T. subterranea SL1 في خزان نفط قاري عميق تبلغ درجة حرارته 70 درجة مئوية في حوض شرق باريس، فرنسا . [ 10 ]
نسالة
يعتمد التصنيف المقبول حاليًا على قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) [ 1 ] والمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) [ 11 ].
| LTP القائم على 16S rRNA _10_2024 [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] | 120 بروتينًا دلاليًا بناءً على GTDB 09-RS220 [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
الحواشي
- ↑ جميع الأحماض الأمينية المكونة للبروتين لها التكوين L؛ في الببتيدوغليكان، توجد بعض الأحماض الأمينية ذات التكوين D. يتم تصنيع الليسين من ميزو-ديامينوبيميلات بواسطة ديكاربوكسيلاز ديامينوبيميلات
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 3 ج.ب. أوزيبي. "ثيرموتوغا" . قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) . تم الاسترجاع في 2022-09-09 .
- 1 2 3 4 5 6 هوبر، ر.؛ ت. أ. لانغورثي؛ هـ. كونيغ؛ م. ثوم؛ س. ر. ووز؛ يو. ب. سليتر؛ ك. أ. شتتر (1986). "Thermotoga maritima sp. nov. يمثل جنسًا جديدًا من البكتيريا الحقيقية المحبة للحرارة الشديدة، والتي تنمو حتى 90 درجة مئوية" (ملف PDF) . أرشيف علم الأحياء الدقيقة . 144 (4): 324-333 . doi : 10.1007/BF00409880 . S2CID 12709437 .
- ↑ بونيفاس، أ.؛ باركيه، س.؛ آرثر، م.؛ مينجين-ليكرو، د.؛ بلانو، د. (2009). " توضيح بنية ببتيدوغليكان ثيرموتوغا ماريتيما يكشف عن نوعين جديدين من الروابط المتشابكة" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 284 (33): 21856-21862 . doi : 10.1074/jbc.M109.034363 . PMC 2755910. PMID 19542229 .
- ↑ فريزر، سي إم؛ كلايتون، كي إي؛ جيل، آر إيه؛ جوين، إس آر؛ دودسون، إم إل؛ هافت، آر جيه؛ هيكي، دي إتش؛ بيترسون، إي كيه؛ نيلسون، جيه دي؛ كيتشوم، دبليو سي؛ ماكدونالد، كيه إيه؛ أترباك، إل؛ مالك، تي آر؛ لينهر، جيه إيه؛ جاريت، كيه دي؛ ستيوارت، إم إم؛ كوتون، إيه إم؛ برات، إم دي؛ فيليبس، إم إس؛ ريتشاردسون، سي إيه؛ هايدلبرغ، دي؛ ساتون، جيه؛ فليشمان، جي جي؛ آيزن، آر دي؛ وايت، جيه إيه؛ سالزبرغ، أو؛ سميث، إس إل؛ فينتر، إتش أو؛ فريزر، جيه سي (1999). "دليل على انتقال الجينات الأفقي بين العتائق والبكتيريا من تسلسل جينوم ثيرموتوغا ماريتيما". نيتشر . 399 (6734): 323– 329. Bibcode : 1999Natur.399..323N . doi : 10.1038/20601 . PMID 10360571 .
- ↑ باسيمونتس، أ.؛ غارسيا-فالفي، س. (2006). "استخدام طريقة متعددة الاتجاهات لتحليل تركيب الأحماض الأمينية لمجموعة محفوظة من البروتينات المتماثلة في بدائيات النوى" . بي إم سي بيوانفورماتيكس . 7 : 257. doi : 10.1186/1471-2105-7-257 . PMC 1489954. PMID 16709240 .
- ^ بويغبو، ص. باسامونتس، أ.؛ غارسيا فالفي، س. (2008). “اكتساب وفقدان التكيف الحراري في بدائيات النوى”. الاتجاهات في علم الوراثة . 24 (1): 10-14 . دوى : 10.1016/j.tig.2007.10.005 . بميد 18054113 .
- ↑ θέρμη . ليدل، هنري جورج ؛ سكوت، روبرت ؛ معجم يوناني-إنجليزي في مشروع بيرسيوس
- ↑ ثيرموس . ليدل، هنري جورج ؛ سكوت، روبرت ؛ معجم يوناني-إنجليزي في مشروع بيرسيوس
- ↑ بون، ديفيد ر.؛ كاستنهولز، ريتشارد و. (18 مايو 2001) [1984 (ويليامز وويلكنز)]. جورج م. غاريتي (محرر). العتائق والبكتيريا المتفرعة بعمق والبكتيريا الضوئية . دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا. المجلد 1 ( الطبعة الثانية). نيويورك: سبرينغر. ص 721. ISBN 978-0-387-98771-2رقم المكتبة البريطانية: GBA561951.
- ↑ لي هـ، يانغ س ز، مو ب ز، رونغ ز ف، تشانغ ج (2007). "التنوع الوراثي الجزيئي للمجتمع الميكروبي المرتبط بخزان نفطي ذي درجة حرارة عالية في حقل نفط بحري" . مجلة FEMS لعلم البيئة الميكروبية . 60 (1): 74-84 . doi : 10.1111/j.1574-6941.2006.00266.x . PMID 17286581 .
- ↑ سايرز وآخرون . "ثيرموتوغا" . قاعدة بيانات التصنيف التابعة للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) . تم الاسترجاع في 9 سبتمبر 2022 .
- ↑ "برنامج النقل طويل الأجل" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
- ↑ "شجرة LTP_all بتنسيق نيوك" . تم الاطلاع عليها بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
- ↑ "ملاحظات إصدار LTP_10_2024" (ملف PDF) . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
- ↑ "إصدار GTDB 09-RS220" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 10 مايو 2024 .
- ↑ "bac120_r220.sp_labels" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 10 مايو 2024 .
- ↑ "تاريخ التصنيف" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 10 مايو 2024 .
- أجناس البكتيريا
- ثيرموتوغوتا
