NCI-60

تُعدّ مجموعة خطوط الخلايا السرطانية NCI -60 مجموعة من 60 خطًا من الخلايا السرطانية البشرية التي يستخدمها المعهد الوطني للسرطان (NCI) لفحص المركبات للكشف عن النشاط المحتمل المضاد للسرطان. [ 1 ]

غاية

يُطلق على إجراء الفحص اسم فحص خطوط خلايا الأورام البشرية NCI-60 ، وهو أحد خدمات الاكتشاف والتطوير التابعة لبرنامج العلاجات التنموية (DTP) التابع للمعهد الوطني للسرطان (NCI ). [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] وتُظهر معدلات الفحص لكل خط خلوي التأثير المثبط للخلايا والسام للخلايا للمواد المختبرة. [ 2 ]

نظراً لتنوع سلالات الخلايا، يُمكن مقارنة المركبات المختبرة من خلال أنماط تأثيرها، حيث يُحتمل أن يُشير الارتباط العالي إلى آليات تأثير متشابهة. [ 2 ] أُجريت مقارنة آلية مع قاعدة بيانات تضم أكثر من 88000 مركب نقي وأكثر من 34000 مستخلص خام ( حتى 6 يناير 2017) .  يتم توفير ) بواسطة أداة المقارنة ، التي تعرض قائمة بالمواد مرتبة حسب معاملات ارتباط بيرسون لمادة اختبار معينة. [ 5 ]

تُستخدم نفس اللوحة في برنامج الهدف الجزيئي لتوصيف الأهداف الجزيئية. وتشمل القياسات مستويات البروتين، وقياسات الحمض النووي الريبي، وحالة الطفرات، ومستويات نشاط الإنزيم . [ 6 ]

خطوط الخلايا

تحتوي اللوحة على خطوط خلوية تمثل سرطان الدم ، وسرطان الجلد ، وسرطان الرئة غير صغير الخلايا ، وسرطانات الدماغ ، والمبيض ، والثدي ، والقولون ، والكلى ، والبروستاتا . [ 1 ] [ 2 ]

يتم تقييم 13 سلالة خلوية إضافية لاستخدامها في برنامج الفحص، من بينها سلالتان مشتقتان من سرطان الرئة ذي الخلايا الصغيرة الذي لم يتم تمثيله حتى الآن . [ 1 ]

جميع خطوط الخلايا باستثناء واحد ( اعتبارًا من 6 يناير 2017)  (متوفرة للمختبرات الأخرى، بما في ذلك خطوط الخلايا الإضافية. [ 1 ]

سوء تحديد الهوية وسوء التصنيف

Starting around the turn of the millennium, several cell lines were found to be misidentified or misclassified at the time of investigation or earlier:[7][8][9]

MDA-MB-435, originally classified as breast cancer cell line, was identified as being a melanoma cell line.[7] When investigated further, current MDA-MB-435 appeared to be derived from the same individual as cell line M14.[7] An examination of clones made clear that the mixup with M14 happened very early in the history of MDA-MB-435, before establishment in the Developmental Therapeutics Program.[7]

NCI/ADR-RES, originally classified as breast cancer cell line, was identified as being an ovarian tumor cell line.[8] NCI/ADR-RES appears to have been derived at some point in time from cell line OVCAR-8.[8] Originally the cell line was named MCF-7/ADR-RES; it was renamed together with the change in classification.[8]

Two brain cancer cell lines, SNB-19 and U251, were discovered to come from the same person.[9] This makes a mixup likely.

A 61st cell line, MDA-N, has been confirmed to being derived from the misclassified MDA-MB-435 cell line.[7] So it is also misclassified, really being a melanoma cell line, but as of 6 January 2018 the official website still lists it as breast cancer cell line.[1] This cell line is not available as of 6 January 2018.[1]

The International Cell Line Authentication Committee maintains a list of contaminated cell lines.[10] It includes the cell lines reported above, although usually with reporting dates and articles considerably later than the first dates and articles rising specific concern regarding the respective cell line.[10][7][8][9]

Continued Use of Wrong Classification

As of 2014لا تزال مئات الدراسات البحثية تستخدم خلايا MDA-MB-435 كنموذج لسرطان الثدي، حتى بعد أن تم تصنيفها رسميًا كخط خلوي لسرطان الجلد الميلانيني في عام 2007، وحتى في المجلات الدولية المحكمة ذات التصنيف الأعلى. [ 11 ] وينطبق الأمر نفسه على خطوط الخلايا الأخرى التي تم تحديدها بشكل خاطئ. [ 11 ]

قائمة خطوط الخلايا NCI-60

تم استخدام خطوط الخلايا NCI-60 في برنامج فحص خطوط خلايا الأورام البشرية التابع للمعهد الوطني للسرطان، كما هو موضح على موقع برنامج العلاجات التنموية. [ 1 ] [ 12 ] أُضيفت روابط إلى أوصاف Cellosaurus المقابلة ومعرّفات موارد البحث (RRID). [ 12 ] مُعرّف Cellosaurus هو مزيج من اسم خط الخلية المُختار من قِبل Cellosaurus، مع مُعرّف الوصول الخاص بـ Cellosaurus، والذي يُكتب على النحو التالي: RRID.
خط الهاتف المحمولتصنيف الأورام(ربما) تم التعرف عليه بشكل خاطئالتصنيف الأصليغير متاحوقت التضاعف (ساعات)كثافة التلقيحمُعرِّف ورابط Cellosaurus
CCRF-CEMسرطان الدم26.740000CCRF-CEM (RRID:CVCL_0207)
HL-60(TB)سرطان الدم28.640000HL-60(TB) (RRID:CVCL_A794)
K-562سرطان الدم19.65000K-562 (RRID:CVCL_0004)
مولت-4سرطان الدم27.930000MOLT-4 (RRID:CVCL_0013)
RPMI-8226سرطان الدم33.520000RPMI-8226 (RRID:CVCL_0014)
SR-786سرطان الدم28.720000SR (RRID:CVCL_1711)
A549الرئة غير صغيرة الخلايا22.97500A-549 (RRID:CVCL_0023)
EKVXالرئة غير صغيرة الخلايا43.620000EKVX (RRID:CVCL_1195)
هوب-62الرئة غير صغيرة الخلايا3910000HOP-62 (RRID:CVCL_1285)
هوب-92الرئة غير صغيرة الخلايا79.520000HOP-92 (RRID:CVCL_1286)
NCI-H226الرئة غير صغيرة الخلايا6120000NCI-H226 (RRID:CVCL_1544)
NCI-H23الرئة غير صغيرة الخلايا33.420000NCI-H23 (RRID:CVCL_1547)
NCI-H322Mالرئة غير صغيرة الخلايا35.320000NCI-H322M (RRID:CVCL_1557)
NCI-H460الرئة غير صغيرة الخلايا17.87500NCI-H460 (RRID:CVCL_0459)
NCI-H522الرئة غير صغيرة الخلايا38.220000NCI-H522 (RRID:CVCL_1567)
كولو 205القولون23.815000COLO 205 (RRID:CVCL_0218)
HCC-2998القولون31.515000HCC2998 (RRID:CVCL_1266)
HCT116القولون17.45000HCT 116 (RRID:CVCL_0291)
HCT-15القولون20.610000HCT 15 (RRID:CVCL_0292)
HT-29القولون19.55000HT-29 (RRID:CVCL_0320)
KM12القولون23.715000KM12 (RRID:CVCL_1331)
SW-620القولون20.410000SW620 (RRID:CVCL_0547)
SF-268الجهاز العصبي المركزي33.115000SF268 (RRID:CVCL_1689)
SF-295الجهاز العصبي المركزي29.510000SF295 (RRID:CVCL_1690)
SF-539الجهاز العصبي المركزي35.415000SF539 (RRID:CVCL_1691)
SNB-19الجهاز العصبي المركزينعمالجهاز العصبي المركزي34.615000SNB-19 (RRID:CVCL_0535)
SNB-75الجهاز العصبي المركزي62.820000SNB-75 (RRID:CVCL_1706)
U251الجهاز العصبي المركزينعمالجهاز العصبي المركزي23.87500U-251MG (RRID:CVCL_0021)
LOX IMVIسرطان الجلد20.57500LOX-IMVI (RRID:CVCL_1381)
مالم-3مسرطان الجلد46.220000مالمي-3 إم (RRID:CVCL_1438)
M14سرطان الجلد26.315000M14 (RRID:CVCL_1395)
MDA-MB-435سرطان الجلدنعمصدر25.815000MDA-MB-435 (RRID:CVCL_0417)
SK-MEL-2سرطان الجلد45.520000SK-MEL-2 (RRID:CVCL_0069)
SK-MEL-28سرطان الجلد35.110000SK-MEL-28 (RRID:CVCL_0526)
SK-MEL-5سرطان الجلد25.210000SK-MEL-5 (RRID:CVCL_0527)
UACC-257سرطان الجلد38.520000UACC-257 (RRID:CVCL_1779)
UACC-62سرطان الجلد31.310000UACC-62 (RRID:CVCL_1780)
IGROV-1المبيض3110000IGROV-1 (RRID:CVCL_1304)
OVCAR-3المبيض34.710000OVCAR-3 (RRID:CVCL_0465)
OVCAR-4المبيض41.415000OVCAR-4 (RRID:CVCL_1627)
OVCAR-5المبيض48.820000OVCAR-5 (RRID:CVCL_1628)
OVCAR-8المبيض26.110000OVCAR-8 (RRID:CVCL_1629)
NCI/ADR-RES (أصلاً MCF-7/ADR-RES)المبيضنعمصدر3415000NCI-ADR-RES (RRID:CVCL_1452)
SK-OV-3المبيض48.720000SK-OV-3 (RRID:CVCL_0532)
786-Oالكلى22.410000786-O (RRID:CVCL_1051)
A498الكلى66.825000A-498 (RRID:CVCL_1056)
أكينالكلى27.510000ACHN (RRID:CVCL_1067)
CAKI-1الكلى3910000Caki-1 (RRID:CVCL_0234)
RXF 393الكلى62.915000RXF 393L (RRID:CVCL_1673)
SN12Cالكلى29.515000SN12C (RRID:CVCL_1705)
TK-10الكلى51.315000TK-10 (RRID:CVCL_1773)
UO-31الكلى41.715000UO-31 (RRID:CVCL_1911)
PC-3البروستات27.17500PC-3 (RRID:CVCL_0035)
DU-145البروستات32.310000DU145 (RRID:CVCL_0105)
MCF7صدر25.410000MCF-7 (RRID:CVCL_0031)
MDA-MB-231صدر41.920000MDA-MB-231 (RRID:CVCL_0062)
MDA-MB-468صدر622000MDA-MB-468 (RRID:CVCL_0419)
HS 578Tصدر53.820000Hs 578T (RRID:CVCL_0332)
إم دي إيه-إنسرطان الجلدنعمصدرغير متاح22.515000MDA-N (RRID:CVCL_1910)
BT-549صدر53.920000BT-549 (RRID:CVCL_1092)
تي-47 ديصدر45.520000T-47D (RRID:CVCL_0553)

قائمة خطوط الخلايا الإضافية

تم تقييم سلالات خلوية إضافية لاستخدامها في فحص سلالات الخلايا السرطانية التابع للمعهد الوطني للسرطان، كما هو موضح على موقع برنامج العلاجات التنموية. [ 1 ] أُضيفت روابط لأوصاف Cellosaurus المقابلة ومعرفات موارد البحث (RRID)، بالإضافة إلى معلومات عن النوع. [ 13 ]
خط الهاتف المحمولتصنيف الأورامصِنفكثافة التلقيحمُعرِّف ورابط Cellosaurus
LXFL 529الرئة غير صغيرة الخلايابشر10000LXFL 529L (RRID:CVCL_D085)
DMS 114الرئة ذات الخلايا الصغيرةبشر20000DMS 114 (RRID:CVCL_1174)
SHP-77الرئة ذات الخلايا الصغيرةبشر40000SHP-77 (RRID:CVCL_1693)
DLD-1القولونبشر50000DLD-1 (RRID:CVCL_0248)
KM20L2القولونبشر10000KM20L2 (RRID:CVCL_D889)
SNB-78الجهاز العصبي المركزيبشر20000SNB-78 (RRID:CVCL_B321)
XF 498الجهاز العصبي المركزيبشر20000XF 498 (RRID:CVCL_8928)
RPMI-7951سرطان الجلدبشر20000RPMI-7951 (RRID:CVCL_1666)
M19-MELسرطان الجلدبشر10000M19-MEL (RRID:CVCL_B415)
RXF-631الكلىبشر10000RXF 631L (RRID:CVCL_A780)
SN12K1الكلىبشر10000SN12K1 (RRID:CVCL_D106)
ص388سرطان الدمفأرة الماوس50000P388 (RRID:CVCL_7222)
P388/ADRسرطان الدمفأرة الماوس50000P388/ADR (RRID:CVCL_IZ75)

مراجع

  1. 1 2 3 4 5 6 7 8 "خطوط الخلايا في الفحص المختبري" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 8 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
  2. 1 2 3 4 "فحص خطوط خلايا الأورام البشرية NCI-60" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 26 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
  3. "خدمات الاكتشاف والتطوير" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 26 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
  4. "مرحباً بكم في برنامج العلاجات التنموية" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . تم الاطلاع عليه بتاريخ 6 يناير 2018 .
  5. "تحليل المقارنة" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 11 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
  6. "الأهداف الجزيئية" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان. 12 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 7 يناير 2018 .
  7. ١ ٢ ٣ ٤ ٥ ٦ "إنّ MDA-MB-435، ومشتقّها MDA-N، هما سلالات خلايا سرطان الجلد الميلانيني، وليستا سلالات خلايا سرطان الثدي" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . ٨ مايو ٢٠١٥. تاريخ الاطلاع: ٦ يناير ٢٠١٨ .
  8. 1 2 3 4 5 "خط الخلايا NCI/ADR-RES هو خط خلايا ورم المبيض، وليس خط خلايا ورم الثدي" . برنامج العلاجات التجريبية . المعهد الوطني للسرطان . 8 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
  9. ١ ٢ ٣ "سلالات خلايا الجهاز العصبي المركزي SNB-19 وU251 مشتقة من نفس الفرد" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . ٨ مايو ٢٠١٥. تم الاطلاع عليه بتاريخ ٦ يناير ٢٠١٨ .
  10. 1 2 قاعدة بيانات خطوط الخلايا الملوثة أو التي تم تحديدها بشكل خاطئ (PDF) ، الإصدار 8.0، اللجنة الدولية لتوثيق خطوط الخلايا (ICLAC)، 1 ديسمبر 2016 ، تم استرجاعها في 6 يناير 2018
  11. 1 2 براساد، فيدودالا في تي إس؛ جوبالان، رامبراساد أو جي (2 يونيو 2015). "استمرار استخدام خط خلايا الورم الميلانيني MDA-MB-435 كنموذج لسرطان الثدي البشري، حتى عام 2014" . مجلة npj لسرطان الثدي . 1 : 15002–. doi : 10.1038/npjbcancer.2015.2 . PMC 5515196. PMID 28721362 .  
  12. 1 2 "نتيجة بحث Cellosaurus: 61 نتيجة لـ "لوحة خطوط الخلايا السرطانية NCI60"" . Cellosaurus . المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية . تم الاطلاع عليه بتاريخ 7 يناير 2018. " يتضمن المرجع قائمة الصفحات المرتبطة في نتائج البحث.
  13. "سيلوسورس - مصدر معرفي حول خطوط الخلايا" . سيلوسورس . المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية . تم الاطلاع عليه بتاريخ 17 يناير 2018 . يتضمن المرجع الصفحات التي تم العثور عليها من خلال البحث باستخدام أسماء خطوط الخلايا المعنية كما هو موضح في قائمة خطوط الخلايا الإضافية .