NCI-60
تُعدّ مجموعة خطوط الخلايا السرطانية NCI -60 مجموعة من 60 خطًا من الخلايا السرطانية البشرية التي يستخدمها المعهد الوطني للسرطان (NCI) لفحص المركبات للكشف عن النشاط المحتمل المضاد للسرطان. [ 1 ]
غاية
يُطلق على إجراء الفحص اسم فحص خطوط خلايا الأورام البشرية NCI-60 ، وهو أحد خدمات الاكتشاف والتطوير التابعة لبرنامج العلاجات التنموية (DTP) التابع للمعهد الوطني للسرطان (NCI ). [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] وتُظهر معدلات الفحص لكل خط خلوي التأثير المثبط للخلايا والسام للخلايا للمواد المختبرة. [ 2 ]
نظراً لتنوع سلالات الخلايا، يُمكن مقارنة المركبات المختبرة من خلال أنماط تأثيرها، حيث يُحتمل أن يُشير الارتباط العالي إلى آليات تأثير متشابهة. [ 2 ] أُجريت مقارنة آلية مع قاعدة بيانات تضم أكثر من 88000 مركب نقي وأكثر من 34000 مستخلص خام ( حتى 6 يناير 2017) . يتم توفير ) بواسطة أداة المقارنة ، التي تعرض قائمة بالمواد مرتبة حسب معاملات ارتباط بيرسون لمادة اختبار معينة. [ 5 ]
تُستخدم نفس اللوحة في برنامج الهدف الجزيئي لتوصيف الأهداف الجزيئية. وتشمل القياسات مستويات البروتين، وقياسات الحمض النووي الريبي، وحالة الطفرات، ومستويات نشاط الإنزيم . [ 6 ]
خطوط الخلايا
تحتوي اللوحة على خطوط خلوية تمثل سرطان الدم ، وسرطان الجلد ، وسرطان الرئة غير صغير الخلايا ، وسرطانات الدماغ ، والمبيض ، والثدي ، والقولون ، والكلى ، والبروستاتا . [ 1 ] [ 2 ]
يتم تقييم 13 سلالة خلوية إضافية لاستخدامها في برنامج الفحص، من بينها سلالتان مشتقتان من سرطان الرئة ذي الخلايا الصغيرة الذي لم يتم تمثيله حتى الآن . [ 1 ]
جميع خطوط الخلايا باستثناء واحد ( اعتبارًا من 6 يناير 2017) (متوفرة للمختبرات الأخرى، بما في ذلك خطوط الخلايا الإضافية. [ 1 ]
سوء تحديد الهوية وسوء التصنيف
Starting around the turn of the millennium, several cell lines were found to be misidentified or misclassified at the time of investigation or earlier:[7][8][9]
MDA-MB-435, originally classified as breast cancer cell line, was identified as being a melanoma cell line.[7] When investigated further, current MDA-MB-435 appeared to be derived from the same individual as cell line M14.[7] An examination of clones made clear that the mixup with M14 happened very early in the history of MDA-MB-435, before establishment in the Developmental Therapeutics Program.[7]
NCI/ADR-RES, originally classified as breast cancer cell line, was identified as being an ovarian tumor cell line.[8] NCI/ADR-RES appears to have been derived at some point in time from cell line OVCAR-8.[8] Originally the cell line was named MCF-7/ADR-RES; it was renamed together with the change in classification.[8]
Two brain cancer cell lines, SNB-19 and U251, were discovered to come from the same person.[9] This makes a mixup likely.
A 61st cell line, MDA-N, has been confirmed to being derived from the misclassified MDA-MB-435 cell line.[7] So it is also misclassified, really being a melanoma cell line, but as of 6 January 2018 the official website still lists it as breast cancer cell line.[1] This cell line is not available as of 6 January 2018.[1]
The International Cell Line Authentication Committee maintains a list of contaminated cell lines.[10] It includes the cell lines reported above, although usually with reporting dates and articles considerably later than the first dates and articles rising specific concern regarding the respective cell line.[10][7][8][9]
Continued Use of Wrong Classification
As of 2014لا تزال مئات الدراسات البحثية تستخدم خلايا MDA-MB-435 كنموذج لسرطان الثدي، حتى بعد أن تم تصنيفها رسميًا كخط خلوي لسرطان الجلد الميلانيني في عام 2007، وحتى في المجلات الدولية المحكمة ذات التصنيف الأعلى. [ 11 ] وينطبق الأمر نفسه على خطوط الخلايا الأخرى التي تم تحديدها بشكل خاطئ. [ 11 ]
قائمة خطوط الخلايا NCI-60
| خط الهاتف المحمول | تصنيف الأورام | (ربما) تم التعرف عليه بشكل خاطئ | التصنيف الأصلي | غير متاح | وقت التضاعف (ساعات) | كثافة التلقيح | مُعرِّف ورابط Cellosaurus |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CCRF-CEM | سرطان الدم | 26.7 | 40000 | CCRF-CEM (RRID:CVCL_0207) | |||
| HL-60(TB) | سرطان الدم | 28.6 | 40000 | HL-60(TB) (RRID:CVCL_A794) | |||
| K-562 | سرطان الدم | 19.6 | 5000 | K-562 (RRID:CVCL_0004) | |||
| مولت-4 | سرطان الدم | 27.9 | 30000 | MOLT-4 (RRID:CVCL_0013) | |||
| RPMI-8226 | سرطان الدم | 33.5 | 20000 | RPMI-8226 (RRID:CVCL_0014) | |||
| SR-786 | سرطان الدم | 28.7 | 20000 | SR (RRID:CVCL_1711) | |||
| A549 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 22.9 | 7500 | A-549 (RRID:CVCL_0023) | |||
| EKVX | الرئة غير صغيرة الخلايا | 43.6 | 20000 | EKVX (RRID:CVCL_1195) | |||
| هوب-62 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 39 | 10000 | HOP-62 (RRID:CVCL_1285) | |||
| هوب-92 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 79.5 | 20000 | HOP-92 (RRID:CVCL_1286) | |||
| NCI-H226 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 61 | 20000 | NCI-H226 (RRID:CVCL_1544) | |||
| NCI-H23 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 33.4 | 20000 | NCI-H23 (RRID:CVCL_1547) | |||
| NCI-H322M | الرئة غير صغيرة الخلايا | 35.3 | 20000 | NCI-H322M (RRID:CVCL_1557) | |||
| NCI-H460 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 17.8 | 7500 | NCI-H460 (RRID:CVCL_0459) | |||
| NCI-H522 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 38.2 | 20000 | NCI-H522 (RRID:CVCL_1567) | |||
| كولو 205 | القولون | 23.8 | 15000 | COLO 205 (RRID:CVCL_0218) | |||
| HCC-2998 | القولون | 31.5 | 15000 | HCC2998 (RRID:CVCL_1266) | |||
| HCT116 | القولون | 17.4 | 5000 | HCT 116 (RRID:CVCL_0291) | |||
| HCT-15 | القولون | 20.6 | 10000 | HCT 15 (RRID:CVCL_0292) | |||
| HT-29 | القولون | 19.5 | 5000 | HT-29 (RRID:CVCL_0320) | |||
| KM12 | القولون | 23.7 | 15000 | KM12 (RRID:CVCL_1331) | |||
| SW-620 | القولون | 20.4 | 10000 | SW620 (RRID:CVCL_0547) | |||
| SF-268 | الجهاز العصبي المركزي | 33.1 | 15000 | SF268 (RRID:CVCL_1689) | |||
| SF-295 | الجهاز العصبي المركزي | 29.5 | 10000 | SF295 (RRID:CVCL_1690) | |||
| SF-539 | الجهاز العصبي المركزي | 35.4 | 15000 | SF539 (RRID:CVCL_1691) | |||
| SNB-19 | الجهاز العصبي المركزي | نعم | الجهاز العصبي المركزي | 34.6 | 15000 | SNB-19 (RRID:CVCL_0535) | |
| SNB-75 | الجهاز العصبي المركزي | 62.8 | 20000 | SNB-75 (RRID:CVCL_1706) | |||
| U251 | الجهاز العصبي المركزي | نعم | الجهاز العصبي المركزي | 23.8 | 7500 | U-251MG (RRID:CVCL_0021) | |
| LOX IMVI | سرطان الجلد | 20.5 | 7500 | LOX-IMVI (RRID:CVCL_1381) | |||
| مالم-3م | سرطان الجلد | 46.2 | 20000 | مالمي-3 إم (RRID:CVCL_1438) | |||
| M14 | سرطان الجلد | 26.3 | 15000 | M14 (RRID:CVCL_1395) | |||
| MDA-MB-435 | سرطان الجلد | نعم | صدر | 25.8 | 15000 | MDA-MB-435 (RRID:CVCL_0417) | |
| SK-MEL-2 | سرطان الجلد | 45.5 | 20000 | SK-MEL-2 (RRID:CVCL_0069) | |||
| SK-MEL-28 | سرطان الجلد | 35.1 | 10000 | SK-MEL-28 (RRID:CVCL_0526) | |||
| SK-MEL-5 | سرطان الجلد | 25.2 | 10000 | SK-MEL-5 (RRID:CVCL_0527) | |||
| UACC-257 | سرطان الجلد | 38.5 | 20000 | UACC-257 (RRID:CVCL_1779) | |||
| UACC-62 | سرطان الجلد | 31.3 | 10000 | UACC-62 (RRID:CVCL_1780) | |||
| IGROV-1 | المبيض | 31 | 10000 | IGROV-1 (RRID:CVCL_1304) | |||
| OVCAR-3 | المبيض | 34.7 | 10000 | OVCAR-3 (RRID:CVCL_0465) | |||
| OVCAR-4 | المبيض | 41.4 | 15000 | OVCAR-4 (RRID:CVCL_1627) | |||
| OVCAR-5 | المبيض | 48.8 | 20000 | OVCAR-5 (RRID:CVCL_1628) | |||
| OVCAR-8 | المبيض | 26.1 | 10000 | OVCAR-8 (RRID:CVCL_1629) | |||
| NCI/ADR-RES (أصلاً MCF-7/ADR-RES) | المبيض | نعم | صدر | 34 | 15000 | NCI-ADR-RES (RRID:CVCL_1452) | |
| SK-OV-3 | المبيض | 48.7 | 20000 | SK-OV-3 (RRID:CVCL_0532) | |||
| 786-O | الكلى | 22.4 | 10000 | 786-O (RRID:CVCL_1051) | |||
| A498 | الكلى | 66.8 | 25000 | A-498 (RRID:CVCL_1056) | |||
| أكين | الكلى | 27.5 | 10000 | ACHN (RRID:CVCL_1067) | |||
| CAKI-1 | الكلى | 39 | 10000 | Caki-1 (RRID:CVCL_0234) | |||
| RXF 393 | الكلى | 62.9 | 15000 | RXF 393L (RRID:CVCL_1673) | |||
| SN12C | الكلى | 29.5 | 15000 | SN12C (RRID:CVCL_1705) | |||
| TK-10 | الكلى | 51.3 | 15000 | TK-10 (RRID:CVCL_1773) | |||
| UO-31 | الكلى | 41.7 | 15000 | UO-31 (RRID:CVCL_1911) | |||
| PC-3 | البروستات | 27.1 | 7500 | PC-3 (RRID:CVCL_0035) | |||
| DU-145 | البروستات | 32.3 | 10000 | DU145 (RRID:CVCL_0105) | |||
| MCF7 | صدر | 25.4 | 10000 | MCF-7 (RRID:CVCL_0031) | |||
| MDA-MB-231 | صدر | 41.9 | 20000 | MDA-MB-231 (RRID:CVCL_0062) | |||
| MDA-MB-468 | صدر | 62 | 2000 | MDA-MB-468 (RRID:CVCL_0419) | |||
| HS 578T | صدر | 53.8 | 20000 | Hs 578T (RRID:CVCL_0332) | |||
| إم دي إيه-إن | سرطان الجلد | نعم | صدر | غير متاح | 22.5 | 15000 | MDA-N (RRID:CVCL_1910) |
| BT-549 | صدر | 53.9 | 20000 | BT-549 (RRID:CVCL_1092) | |||
| تي-47 دي | صدر | 45.5 | 20000 | T-47D (RRID:CVCL_0553) |
قائمة خطوط الخلايا الإضافية
| خط الهاتف المحمول | تصنيف الأورام | صِنف | كثافة التلقيح | مُعرِّف ورابط Cellosaurus |
|---|---|---|---|---|
| LXFL 529 | الرئة غير صغيرة الخلايا | بشر | 10000 | LXFL 529L (RRID:CVCL_D085) |
| DMS 114 | الرئة ذات الخلايا الصغيرة | بشر | 20000 | DMS 114 (RRID:CVCL_1174) |
| SHP-77 | الرئة ذات الخلايا الصغيرة | بشر | 40000 | SHP-77 (RRID:CVCL_1693) |
| DLD-1 | القولون | بشر | 50000 | DLD-1 (RRID:CVCL_0248) |
| KM20L2 | القولون | بشر | 10000 | KM20L2 (RRID:CVCL_D889) |
| SNB-78 | الجهاز العصبي المركزي | بشر | 20000 | SNB-78 (RRID:CVCL_B321) |
| XF 498 | الجهاز العصبي المركزي | بشر | 20000 | XF 498 (RRID:CVCL_8928) |
| RPMI-7951 | سرطان الجلد | بشر | 20000 | RPMI-7951 (RRID:CVCL_1666) |
| M19-MEL | سرطان الجلد | بشر | 10000 | M19-MEL (RRID:CVCL_B415) |
| RXF-631 | الكلى | بشر | 10000 | RXF 631L (RRID:CVCL_A780) |
| SN12K1 | الكلى | بشر | 10000 | SN12K1 (RRID:CVCL_D106) |
| ص388 | سرطان الدم | فأرة الماوس | 50000 | P388 (RRID:CVCL_7222) |
| P388/ADR | سرطان الدم | فأرة الماوس | 50000 | P388/ADR (RRID:CVCL_IZ75) |
مراجع
- 1 2 3 4 5 6 7 8 "خطوط الخلايا في الفحص المختبري" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 8 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
- 1 2 3 4 "فحص خطوط خلايا الأورام البشرية NCI-60" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 26 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
- ↑ "خدمات الاكتشاف والتطوير" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 26 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
- ↑ "مرحباً بكم في برنامج العلاجات التنموية" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . تم الاطلاع عليه بتاريخ 6 يناير 2018 .
- ↑ "تحليل المقارنة" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 11 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
- ↑ "الأهداف الجزيئية" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان. 12 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 7 يناير 2018 .
- ١ ٢ ٣ ٤ ٥ ٦ "إنّ MDA-MB-435، ومشتقّها MDA-N، هما سلالات خلايا سرطان الجلد الميلانيني، وليستا سلالات خلايا سرطان الثدي" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . ٨ مايو ٢٠١٥. تاريخ الاطلاع: ٦ يناير ٢٠١٨ .
- 1 2 3 4 5 "خط الخلايا NCI/ADR-RES هو خط خلايا ورم المبيض، وليس خط خلايا ورم الثدي" . برنامج العلاجات التجريبية . المعهد الوطني للسرطان . 8 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
- ١ ٢ ٣ "سلالات خلايا الجهاز العصبي المركزي SNB-19 وU251 مشتقة من نفس الفرد" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . ٨ مايو ٢٠١٥. تم الاطلاع عليه بتاريخ ٦ يناير ٢٠١٨ .
- 1 2 قاعدة بيانات خطوط الخلايا الملوثة أو التي تم تحديدها بشكل خاطئ (PDF) ، الإصدار 8.0، اللجنة الدولية لتوثيق خطوط الخلايا (ICLAC)، 1 ديسمبر 2016 ، تم استرجاعها في 6 يناير 2018
- 1 2 براساد، فيدودالا في تي إس؛ جوبالان، رامبراساد أو جي (2 يونيو 2015). "استمرار استخدام خط خلايا الورم الميلانيني MDA-MB-435 كنموذج لسرطان الثدي البشري، حتى عام 2014" . مجلة npj لسرطان الثدي . 1 : 15002–. doi : 10.1038/npjbcancer.2015.2 . PMC 5515196. PMID 28721362 .
- 1 2 "نتيجة بحث Cellosaurus: 61 نتيجة لـ "لوحة خطوط الخلايا السرطانية NCI60"" . Cellosaurus . المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية . تم الاطلاع عليه بتاريخ 7 يناير 2018. " يتضمن المرجع قائمة الصفحات المرتبطة في نتائج البحث.
- ↑ "سيلوسورس - مصدر معرفي حول خطوط الخلايا" . سيلوسورس . المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية . تم الاطلاع عليه بتاريخ 17 يناير 2018 . يتضمن المرجع الصفحات التي تم العثور عليها من خلال البحث باستخدام أسماء خطوط الخلايا المعنية كما هو موضح في قائمة خطوط الخلايا الإضافية .
- خطوط الخلايا السرطانية
- خطوط الخلايا البشرية
- سرطان المبيض
