الوحدة الفرعية الريبوسومية الصغيرة بدائية النواة

التركيب الذري للوحدة الفرعية 30S من بكتيريا Thermus thermophilus . تظهر البروتينات باللون الأزرق وشريط الحمض النووي الريبي المفرد باللون البرتقالي. [ 1 ]

الوحدة الفرعية الصغيرة للريبوسوم بدائيات النوى ، أو الوحدة الفرعية 30S ، هي الوحدة الفرعية الأصغر من الريبوسوم 70S الموجود في بدائيات النوى . وهي عبارة عن مُركّب من الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي 16S (rRNA) و19 بروتينًا . [ 1 ] يُشارك هذا المُركّب في ربط الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) بالحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA). [ 2 ] الوحدة الفرعية الصغيرة مسؤولة عن ربط وقراءة mRNA أثناء عملية الترجمة . تتحد الوحدة الفرعية الصغيرة، بما في ذلك rRNA وبروتيناتها، مع الوحدة الفرعية الكبيرة 50S لتكوين الريبوسوم 70S بدائيات النوى في الخلايا بدائية النوى. يُستخدم هذا الريبوسوم 70S بعد ذلك لترجمة mRNA إلى بروتينات.

وظيفة

تُعد الوحدة الفرعية 30S جزءًا لا يتجزأ من عملية ترجمة mRNA . وهي ترتبط بثلاثة عوامل بدء بدائية النواة : IF-1 و IF-2 و IF-3. [ 3 ]

يقوم جزء من الوحدة الفرعية 30S ( الرنا الريبوسومي 16S ) بتوجيه كودون البدء (5′)-AUG-(3′) في الرنا الرسول إلى موضعه الصحيح من خلال التعرف على تسلسل شاين-دالغارنو ، وهو موقع ارتباط مكمل يقع على بعد حوالي 8 أزواج قاعدية قبل كودون البدء. [ 4 ] يضمن هذا أن يبدأ الريبوسوم عملية الترجمة من الموقع الصحيح. وتحدد قوة الارتباط بين تسلسل شاين-دالغارنو على الرنا الرسول والرنا الريبوسومي 16S مدى كفاءة عملية الترجمة. [ 4 ] بمجرد أن يتعرف الرنا الريبوسومي 16S على كودون البدء في الرنا الرسول، يرتبط به رنا ناقل خاص ، وهو f-Met -tRNA، وتبدأ عملية ترجمة البروتين. [ 5 ] يُطلق على موقع ارتباط f-Met-tRNA على الوحدة الفرعية 30S للريبوسوم اسم "الموقع D". [ 6 ] هذه الخطوة ضرورية لحدوث عملية تخليق البروتين . ثم ترتبط الوحدة الريبوسومية الكبيرة، ويستمر تخليق البروتين. [ 7 ] يؤدي ارتباط الوحدة الكبيرة إلى تغيير في بنية الوحدة 70S، مما يفتح موقعًا آخر لترجمة البروتين. [ 6 ]

لتكوين معقد الترجمة مع الوحدة الفرعية 50S، يجب أن ترتبط الوحدة الفرعية 30S بعوامل بدء الترجمة IF-1 وIF-2 وIF-3، بالإضافة إلى mRNA وf-met-tRNA. بعد ذلك، ترتبط الوحدة الفرعية 50S، ويتم فصل غوانوزين ثلاثي الفوسفات إلى غوانوزين ثنائي الفوسفات وفوسفات غير عضوي ، مما يؤدي إلى انفصال عوامل بدء الترجمة وبدء عملية ترجمة البروتين. [ 8 ] [ 5 ] تُسمى هذه العملية "بدء الترجمة"، وهي أبطأ مراحل الترجمة. [ 5 ]

بناء

تتكون الوحدة الفرعية الصغيرة للريبوسوم من الحمض النووي الريبوزي 16S و19 بروتينًا كاملًا. [ 9 ] كما تحتوي على سلسلة ببتيدية واحدة تتألف من 26 حمضًا أمينيًا . [ 10 ] يُشار إلى الحمض النووي الريبوزي عادةً بالرمز "H#" للدلالة على رقم اللولب في الصور عالية الدقة. أما البروتينات، فتُشار إليها بالرمز "S#" للدلالة على الببتيدات المختلفة المشاركة في تثبيت الحمض النووي الريبوزي. يقع كل من S11 وH45 بالقرب من موقع ارتباط شاين-دالغارنو، والذي يقع أيضًا بالقرب من موقع ارتباط عامل بدء الترجمة 3 (IF-3). تقع البروتينات S3 وS4 وS5 وS12، بالإضافة إلى H18، بالقرب من القناة التي يوجد فيها الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) في الوحدة الفرعية 30S. [ 1 ]

التثبيط

تُعدّ الوحدة الفرعية 30S هدفًا للمضادات الحيوية مثل التتراسيكلين والجنتاميسين . [ 11 ] تستهدف هذه المضادات الحيوية الريبوسومات بدائية النواة على وجه التحديد، ومن هنا فائدتها في علاج العدوى البكتيرية في حقيقيات النوى . يتفاعل التتراسيكلين مع H27 في الوحدة الفرعية الصغيرة، كما يرتبط بالموقع A في الوحدة الفرعية الكبيرة. [ 11 ] يُعدّ البوروميسين مثبطًا لترجمة الريبوسوم. [ 6 ] يُعطّل البكتامايسين الارتباط في منطقة شاين-دالغارنو في الوحدة الفرعية الصغيرة، مما يُعطّل نشاطها. يتفاعل الهيغرومايسين B أيضًا مع H44 ويُثبّط حركة الانتقال الضرورية أثناء تخليق البروتين. [ 11 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 3 شلوينزن، فرانك؛ توسيلج، أنتي؛ زاريفاتش، راز؛ هارمز، يورج؛ جلوهمان، ماركو؛ جانيل، دانييلا؛ باشان، عنات؛ بارتلز، هايك؛ أغمون، إيلانا (2000-09-01). "بنية الوحدة الفرعية الريبوسومية الصغيرة المنشطة وظيفيًا بدقة 3.3 Å" . خلية . 102 (5): 615–623 . دوى : 10.1016/S0092-8674(00)00084-2 . بميد 11007480 . 
  2. تومسون، جون ف.؛ هيرست (1983). "علاقات البنية والوظيفة في الحمض النووي الريبوزي 16S في الإشريكية القولونية" (ملف PDF) . الخلية . 33 ( 1): 19-24 . CiteSeerX 10.1.1.625.7760 . doi : 10.1016/0092-8674(83)90330-6 . PMID 6380748. S2CID 13069755 .   
  3. ل. جولد؛ د. بريبناو؛ ت. شنايدر؛ س. شينيدلينج؛ ب. س. سينجر؛ ستورمو، و ج. (1981). "بدء الترجمة في بدائيات النوى". المراجعة السنوية لعلم الأحياء الدقيقة . 35 (1): 365-403 . doi : 10.1146/annurev.mi.35.100181.002053 . PMID 6170248 . 
  4. 1 2 ماليس، ناجليس (2012-01-01). "تسلسل شاين-دالغارنو لبكتيريا العاثية T4: يسود تسلسل GAGG في الجينات المبكرة". تقارير البيولوجيا الجزيئية . 39 (1): 33-39 . doi : 10.1007/s11033-011-0707-4 . ISSN 0301-4851 . PMID 21533668. S2CID 17854788 .   
  5. 1 2 3 غواليرزي، كلاوديو أو.؛ ​​بون، سينثيا ل. (1990). "بدء ترجمة الحمض النووي الريبوزي الرسول في بدائيات النوى". الكيمياء الحيوية . 29 (25): 5881-5889 . doi : 10.1021/bi00477a001 . PMID 2200518 . 
  6. 1 2 3 إيغاراشي، كازوي؛ تاناكا، شيجياكي؛ كاجي، أكيرا (11 فبراير 1971). "حول موقع ارتباط أمينو أسيل-tRNA بالوحدة الفرعية 30S للريبوسوم وعلاقته بموقع بدء سلسلة الريبوسوم". مجلة بيوكيميكا وبيوفيزيكا أكتا (BBA) - الأحماض النووية وتخليق البروتين . 228 (3): 728-731 . doi : 10.1016/0005-2787(71)90737-4 . PMID 4929429 . 
  7. سلوبين، لورانس آي (ديسمبر 1972). "الخواص التركيبية والوظيفية للريبوسومات المرتبطة بروابط ثنائية ميثيل سوبيريميدات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 69 ( 12): 3769-3773 . Bibcode : 1972PNAS...69.3769S . doi : 10.1073/pnas.69.12.3769 . PMC 389868. PMID 4566460 .  
  8. ميلون ب، كاروتي م، كونيفيكا أ.ل، وينترماير و، رودنينا م.ف، غواليرزي س.و (2010). "يقوم عامل بدء الترجمة 2 المرتبط بالريبوسوم بتجنيد الحمض النووي الريبوزي الناقل البادئ إلى معقد بدء الترجمة 30S" . تقارير EMBO . 11 (4): 312-316 . doi : 10.1038/embor.2010.12 . PMC 2854590. PMID 20224578 .  
  9. تسيبولي، باراسكيفي؛ هيرفورث، إلكي؛ تشولي، ثيودورا (1994-11-01). "تنقية وتوصيف البروتينات الريبوزومية 30S من بكتيريا ثيرموس ثيرموفيلوس". المجلة الأوروبية للكيمياء الحيوية . 226 (1): 169-177 . doi : 10.1111/j.1432-1033.1994.0t169.x . ISSN 1432-1033 . PMID 7957245 .  
  10. تشولي تي، فرانشيسكي إف، يونات إيه، ويتمان-ليبولد بي (1993). "عزل وتوصيف بروتين ريبوسومي جديد من البكتيريا الحقيقية المحبة للحرارة، ثيرموس ثيرموفيلوس، وثيرموس أكواتيكوس، وثيرموس فلافوس" (ملف PDF) . الكيمياء الحيوية هوب-سيلر . 374 (6): 377-383 . doi : 10.1515/bchm3.1993.374.1-6.377 . PMID 8357533 . 
  11. 1 2 3 برودرسن، ديتليف إي.؛ كليمونز، ويليام إم.؛ كارتر، أندرو بي.؛ مورغان-وارين، روبرت جيه.؛ ويمبرلي، برايان تي.؛ راماكريشنان، في. (22-12-2000). "الأساس البنيوي لتأثير المضادات الحيوية التتراسيكلين، والباكتاميسين، والهيغروميسين ب على الوحدة الفرعية 30S للريبوسوم" . الخلية . 103 (7): 1143-1154 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)00216-6 . PMID 11163189 .