NCI-60

تُعدّ مجموعة خطوط الخلايا السرطانية NCI -60 مجموعة من 60 خطًا من الخلايا السرطانية البشرية التي يستخدمها المعهد الوطني للسرطان (NCI) لفحص المركبات للكشف عن النشاط المحتمل المضاد للسرطان. [ 1 ]

غاية

يُطلق على إجراء الفحص اسم فحص خطوط خلايا الأورام البشرية NCI-60 ، وهو أحد خدمات الاكتشاف والتطوير التابعة لبرنامج العلاجات التنموية (DTP) التابع للمعهد الوطني للسرطان (NCI ). [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] وتُظهر معدلات الفحص لكل خط خلوي التأثير المثبط للخلايا والسام للخلايا للمواد المختبرة. [ 2 ]

نظراً لتنوع سلالات الخلايا، يُمكن مقارنة المركبات المختبرة من خلال أنماط تأثيرها، حيث يُحتمل أن يُشير الارتباط العالي إلى آليات تأثير متشابهة. [ 2 ] أُجريت مقارنة آلية مع قاعدة بيانات تضم أكثر من 88000 مركب نقي وأكثر من 34000 مستخلص خام ( حتى 6 يناير 2017) .  يتم توفير ) بواسطة أداة المقارنة ، التي تعرض قائمة بالمواد مرتبة حسب معاملات ارتباط بيرسون لمادة اختبار معينة. [ 5 ]

تُستخدم نفس اللوحة في برنامج الهدف الجزيئي لتوصيف الأهداف الجزيئية. وتشمل القياسات مستويات البروتين، وقياسات الحمض النووي الريبي، وحالة الطفرات، ومستويات نشاط الإنزيم . [ 6 ]

خطوط الخلايا

تحتوي اللوحة على خطوط خلوية تمثل سرطان الدم ، وسرطان الجلد ، وسرطان الرئة غير صغير الخلايا ، وسرطانات الدماغ ، والمبيض ، والثدي ، والقولون ، والكلى ، والبروستاتا . [ 1 ] [ 2 ]

يتم تقييم 13 سلالة خلوية إضافية لاستخدامها في برنامج الفحص، من بينها سلالتان مشتقتان من سرطان الرئة ذي الخلايا الصغيرة الذي لم يتم تمثيله حتى الآن . [ 1 ]

جميع خطوط الخلايا باستثناء واحد ( اعتبارًا من 6 يناير 2017)  (متوفرة للمختبرات الأخرى، بما في ذلك خطوط الخلايا الإضافية. [ 1 ]

سوء تحديد الهوية وسوء التصنيف

ابتداءً من مطلع الألفية، تم العثور على العديد من سلالات الخلايا التي تم تحديدها أو تصنيفها بشكل خاطئ في وقت التحقيق أو قبل ذلك: [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]

تم تصنيف خط خلايا MDA-MB-435 في الأصل على أنه خط خلايا سرطان الثدي، ثم تبين أنه خط خلايا سرطان الجلد الميلانيني. [ 7 ] وعند إجراء المزيد من التحقيقات، تبين أن خط خلايا MDA-MB-435 الحالي مشتق من نفس الفرد الذي اشتق منه خط الخلايا M14 . [ 7 ] وقد أوضح فحص المستنسخات أن الخلط مع M14 حدث في وقت مبكر جدًا من تاريخ MDA-MB-435، قبل إدراجه في برنامج العلاجات التجريبية. [ 7 ]

تم تحديد سلالة الخلايا NCI/ADR-RES ، التي صُنفت في الأصل على أنها سلالة خلايا سرطان الثدي، على أنها سلالة خلايا ورم المبيض. [ 8 ] ويبدو أن سلالة الخلايا NCI/ADR-RES قد اشتُقت في وقت ما من سلالة الخلايا OVCAR-8 . [ 8 ] في الأصل، كانت سلالة الخلايا تُسمى MCF-7/ADR-RES ؛ وقد أُعيد تسميتها مع تغيير التصنيف. [ 8 ]

تم اكتشاف أن سلالتين من خلايا سرطان الدماغ، SNB-19 و U251 ، تعودان إلى نفس الشخص. [ 9 ] وهذا يجعل حدوث خطأ محتملاً.

تم تأكيد أن سلالة الخلايا رقم 61، MDA-N ، مشتقة من سلالة الخلايا MDA-MB-435 المصنفة خطأً. [ 7 ] لذا فهي مصنفة خطأً أيضاً، إذ أنها في الواقع سلالة خلايا سرطان الجلد الميلانيني، ولكن اعتباراً من 6 يناير 2018  لا يزال الموقع الرسمي يدرجها على أنها سلالة خلايا سرطان الثدي. [ 1 ] هذه السلالة الخلوية غير متاحة اعتبارًا من 6 يناير 2018.  [ 1 ]

تحتفظ اللجنة الدولية لتوثيق خطوط الخلايا بقائمة لخطوط الخلايا الملوثة . [ 10 ] وتشمل هذه القائمة خطوط الخلايا المذكورة أعلاه، وإن كانت تواريخ الإبلاغ والمقالات المنشورة فيها عادةً ما تكون لاحقة بفترة طويلة عن التواريخ الأولى، بالإضافة إلى المقالات التي تُثير مخاوف محددة بشأن خط الخلية المعني. [ 10 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]

الاستمرار في استخدام التصنيف الخاطئ

اعتبارًا من عام 2014لا تزال مئات الدراسات البحثية تستخدم خلايا MDA-MB-435 كنموذج لسرطان الثدي، حتى بعد أن تم تصنيفها رسميًا كخط خلوي لسرطان الجلد الميلانيني في عام 2007، وحتى في المجلات الدولية المحكمة ذات التصنيف الأعلى. [ 11 ] وينطبق الأمر نفسه على خطوط الخلايا الأخرى التي تم تحديدها بشكل خاطئ. [ 11 ]

قائمة خطوط الخلايا NCI-60

تم استخدام خطوط الخلايا NCI-60 في برنامج فحص خطوط خلايا الأورام البشرية التابع للمعهد الوطني للسرطان، كما هو موضح على موقع برنامج العلاجات التنموية. [ 1 ] [ 12 ] أُضيفت روابط إلى أوصاف Cellosaurus المقابلة ومعرّفات موارد البحث (RRID). [ 12 ] مُعرّف Cellosaurus هو مزيج من اسم خط الخلية المُختار من قِبل Cellosaurus، مع مُعرّف الوصول الخاص بـ Cellosaurus، والذي يُكتب على النحو التالي: RRID.
خط الهاتف المحمولتصنيف الأورام(ربما) تم التعرف عليه بشكل خاطئالتصنيف الأصليغير متاحوقت التضاعف (ساعات)كثافة التلقيحمُعرِّف ورابط Cellosaurus
CCRF-CEMسرطان الدم26.740000CCRF-CEM (RRID:CVCL_0207)
HL-60(TB)سرطان الدم28.640000HL-60(TB) (RRID:CVCL_A794)
K-562سرطان الدم19.65000K-562 (RRID:CVCL_0004)
مولت-4سرطان الدم27.930000MOLT-4 (RRID:CVCL_0013)
RPMI-8226سرطان الدم33.520000RPMI-8226 (RRID:CVCL_0014)
SR-786سرطان الدم28.720000SR (RRID:CVCL_1711)
A549الرئة غير صغيرة الخلايا22.97500A-549 (RRID:CVCL_0023)
EKVXالرئة غير صغيرة الخلايا43.620000EKVX (RRID:CVCL_1195)
هوب-62الرئة غير صغيرة الخلايا3910000HOP-62 (RRID:CVCL_1285)
هوب-92الرئة غير صغيرة الخلايا79.520000HOP-92 (RRID:CVCL_1286)
NCI-H226الرئة غير صغيرة الخلايا6120000NCI-H226 (RRID:CVCL_1544)
NCI-H23الرئة غير صغيرة الخلايا33.420000NCI-H23 (RRID:CVCL_1547)
NCI-H322Mالرئة غير صغيرة الخلايا35.320000NCI-H322M (RRID:CVCL_1557)
NCI-H460الرئة غير صغيرة الخلايا17.87500NCI-H460 (RRID:CVCL_0459)
NCI-H522الرئة غير صغيرة الخلايا38.220000NCI-H522 (RRID:CVCL_1567)
كولو 205القولون23.815000COLO 205 (RRID:CVCL_0218)
HCC-2998القولون31.515000HCC2998 (RRID:CVCL_1266)
HCT116القولون17.45000HCT 116 (RRID:CVCL_0291)
HCT-15القولون20.610000HCT 15 (RRID:CVCL_0292)
HT-29القولون19.55000HT-29 (RRID:CVCL_0320)
KM12القولون23.715000KM12 (RRID:CVCL_1331)
SW-620القولون20.410000SW620 (RRID:CVCL_0547)
SF-268الجهاز العصبي المركزي33.115000SF268 (RRID:CVCL_1689)
SF-295الجهاز العصبي المركزي29.510000SF295 (RRID:CVCL_1690)
SF-539الجهاز العصبي المركزي35.415000SF539 (RRID:CVCL_1691)
SNB-19الجهاز العصبي المركزينعمالجهاز العصبي المركزي34.615000SNB-19 (RRID:CVCL_0535)
SNB-75الجهاز العصبي المركزي62.820000SNB-75 (RRID:CVCL_1706)
U251الجهاز العصبي المركزينعمالجهاز العصبي المركزي23.87500U-251MG (RRID:CVCL_0021)
LOX IMVIسرطان الجلد20.57500LOX-IMVI (RRID:CVCL_1381)
مالم-3مسرطان الجلد46.220000مالمي-3 إم (RRID:CVCL_1438)
M14سرطان الجلد26.315000M14 (RRID:CVCL_1395)
MDA-MB-435سرطان الجلدنعمصدر25.815000MDA-MB-435 (RRID:CVCL_0417)
SK-MEL-2سرطان الجلد45.520000SK-MEL-2 (RRID:CVCL_0069)
SK-MEL-28سرطان الجلد35.110000SK-MEL-28 (RRID:CVCL_0526)
SK-MEL-5سرطان الجلد25.210000SK-MEL-5 (RRID:CVCL_0527)
UACC-257سرطان الجلد38.520000UACC-257 (RRID:CVCL_1779)
UACC-62سرطان الجلد31.310000UACC-62 (RRID:CVCL_1780)
IGROV-1المبيض3110000IGROV-1 (RRID:CVCL_1304)
OVCAR-3المبيض34.710000OVCAR-3 (RRID:CVCL_0465)
OVCAR-4المبيض41.415000OVCAR-4 (RRID:CVCL_1627)
OVCAR-5المبيض48.820000OVCAR-5 (RRID:CVCL_1628)
OVCAR-8المبيض26.110000OVCAR-8 (RRID:CVCL_1629)
NCI/ADR-RES (أصلاً MCF-7/ADR-RES)المبيضنعمصدر3415000NCI-ADR-RES (RRID:CVCL_1452)
SK-OV-3المبيض48.720000SK-OV-3 (RRID:CVCL_0532)
786-Oالكلى22.410000786-O (RRID:CVCL_1051)
A498الكلى66.825000A-498 (RRID:CVCL_1056)
أكينالكلى27.510000ACHN (RRID:CVCL_1067)
CAKI-1الكلى3910000Caki-1 (RRID:CVCL_0234)
RXF 393الكلى62.915000RXF 393L (RRID:CVCL_1673)
SN12Cالكلى29.515000SN12C (RRID:CVCL_1705)
TK-10الكلى51.315000TK-10 (RRID:CVCL_1773)
UO-31الكلى41.715000UO-31 (RRID:CVCL_1911)
PC-3البروستات27.17500PC-3 (RRID:CVCL_0035)
DU-145البروستات32.310000DU145 (RRID:CVCL_0105)
MCF7صدر25.410000MCF-7 (RRID:CVCL_0031)
MDA-MB-231صدر41.920000MDA-MB-231 (RRID:CVCL_0062)
MDA-MB-468صدر622000MDA-MB-468 (RRID:CVCL_0419)
HS 578Tصدر53.820000Hs 578T (RRID:CVCL_0332)
إم دي إيه-إنسرطان الجلدنعمصدرغير متاح22.515000MDA-N (RRID:CVCL_1910)
BT-549صدر53.920000BT-549 (RRID:CVCL_1092)
تي-47 ديصدر45.520000T-47D (RRID:CVCL_0553)

قائمة خطوط الخلايا الإضافية

تم تقييم سلالات خلوية إضافية لاستخدامها في فحص سلالات الخلايا السرطانية التابع للمعهد الوطني للسرطان، كما هو موضح على موقع برنامج العلاجات التنموية. [ 1 ] أُضيفت روابط لأوصاف Cellosaurus المقابلة ومعرفات موارد البحث (RRID)، بالإضافة إلى معلومات عن النوع. [ 13 ]
خط الهاتف المحمولتصنيف الأورامصِنفكثافة التلقيحمُعرِّف ورابط Cellosaurus
LXFL 529الرئة غير صغيرة الخلايابشر10000LXFL 529L (RRID:CVCL_D085)
DMS 114الرئة ذات الخلايا الصغيرةبشر20000DMS 114 (RRID:CVCL_1174)
SHP-77الرئة ذات الخلايا الصغيرةبشر40000SHP-77 (RRID:CVCL_1693)
DLD-1القولونبشر50000DLD-1 (RRID:CVCL_0248)
KM20L2القولونبشر10000KM20L2 (RRID:CVCL_D889)
SNB-78الجهاز العصبي المركزيبشر20000SNB-78 (RRID:CVCL_B321)
XF 498الجهاز العصبي المركزيبشر20000XF 498 (RRID:CVCL_8928)
RPMI-7951سرطان الجلدبشر20000RPMI-7951 (RRID:CVCL_1666)
M19-MELسرطان الجلدبشر10000M19-MEL (RRID:CVCL_B415)
RXF-631الكلىبشر10000RXF 631L (RRID:CVCL_A780)
SN12K1الكلىبشر10000SN12K1 (RRID:CVCL_D106)
ص388سرطان الدمفأرة الماوس50000P388 (RRID:CVCL_7222)
P388/ADRسرطان الدمفأرة الماوس50000P388/ADR (RRID:CVCL_IZ75)

مراجع

  1. 1 2 3 4 5 6 7 8 "خطوط الخلايا في الفحص المختبري" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 8 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
  2. 1 2 3 4 "فحص خطوط خلايا الأورام البشرية NCI-60" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 26 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
  3. "خدمات الاكتشاف والتطوير" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 26 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
  4. "مرحباً بكم في برنامج العلاجات التنموية" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . تم الاطلاع عليه بتاريخ 6 يناير 2018 .
  5. "تحليل المقارنة" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 11 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
  6. "الأهداف الجزيئية" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان. 12 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 7 يناير 2018 .
  7. ١ ٢ ٣ ٤ ٥ ٦ "إنّ MDA-MB-435، ومشتقّها MDA-N، هما سلالات خلايا سرطان الجلد الميلانيني، وليستا سلالات خلايا سرطان الثدي" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . ٨ مايو ٢٠١٥. تاريخ الاطلاع: ٦ يناير ٢٠١٨ .
  8. 1 2 3 4 5 "خط الخلايا NCI/ADR-RES هو خط خلايا ورم المبيض، وليس خط خلايا ورم الثدي" . برنامج العلاجات التجريبية . المعهد الوطني للسرطان . 8 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
  9. ١ ٢ ٣ "سلالات خلايا الجهاز العصبي المركزي SNB-19 وU251 مشتقة من نفس الفرد" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . ٨ مايو ٢٠١٥. تم الاطلاع عليه بتاريخ ٦ يناير ٢٠١٨ .
  10. 1 2 قاعدة بيانات خطوط الخلايا الملوثة أو التي تم تحديدها بشكل خاطئ (PDF) ، الإصدار 8.0، اللجنة الدولية لتوثيق خطوط الخلايا (ICLAC)، 1 ديسمبر 2016 ، تم استرجاعها في 6 يناير 2018
  11. 1 2 براساد، فيدودالا في تي إس؛ جوبالان، رامبراساد أو جي (2 يونيو 2015). "استمرار استخدام خط خلايا الورم الميلانيني MDA-MB-435 كنموذج لسرطان الثدي البشري، حتى عام 2014" . مجلة npj لسرطان الثدي . 1 : 15002–. doi : 10.1038/npjbcancer.2015.2 . PMC 5515196. PMID 28721362 .  
  12. 1 2 "نتيجة بحث Cellosaurus: 61 نتيجة لـ "لوحة خطوط الخلايا السرطانية NCI60"" . Cellosaurus . المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية . تم الاطلاع عليه بتاريخ 7 يناير 2018. " يتضمن المرجع قائمة الصفحات المرتبطة في نتائج البحث.
  13. "سيلوسورس - مصدر معرفي حول خطوط الخلايا" . سيلوسورس . المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية . تم الاطلاع عليه بتاريخ 17 يناير 2018 . يتضمن المرجع الصفحات التي تم العثور عليها من خلال البحث باستخدام أسماء خطوط الخلايا المعنية كما هو موضح في قائمة خطوط الخلايا الإضافية .