NCI-60
تُعدّ مجموعة خطوط الخلايا السرطانية NCI -60 مجموعة من 60 خطًا من الخلايا السرطانية البشرية التي يستخدمها المعهد الوطني للسرطان (NCI) لفحص المركبات للكشف عن النشاط المحتمل المضاد للسرطان. [ 1 ]
غاية
يُطلق على إجراء الفحص اسم فحص خطوط خلايا الأورام البشرية NCI-60 ، وهو أحد خدمات الاكتشاف والتطوير التابعة لبرنامج العلاجات التنموية (DTP) التابع للمعهد الوطني للسرطان (NCI ). [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] وتُظهر معدلات الفحص لكل خط خلوي التأثير المثبط للخلايا والسام للخلايا للمواد المختبرة. [ 2 ]
نظراً لتنوع سلالات الخلايا، يُمكن مقارنة المركبات المختبرة من خلال أنماط تأثيرها، حيث يُحتمل أن يُشير الارتباط العالي إلى آليات تأثير متشابهة. [ 2 ] أُجريت مقارنة آلية مع قاعدة بيانات تضم أكثر من 88000 مركب نقي وأكثر من 34000 مستخلص خام ( حتى 6 يناير 2017) . يتم توفير ) بواسطة أداة المقارنة ، التي تعرض قائمة بالمواد مرتبة حسب معاملات ارتباط بيرسون لمادة اختبار معينة. [ 5 ]
تُستخدم نفس اللوحة في برنامج الهدف الجزيئي لتوصيف الأهداف الجزيئية. وتشمل القياسات مستويات البروتين، وقياسات الحمض النووي الريبي، وحالة الطفرات، ومستويات نشاط الإنزيم . [ 6 ]
خطوط الخلايا
تحتوي اللوحة على خطوط خلوية تمثل سرطان الدم ، وسرطان الجلد ، وسرطان الرئة غير صغير الخلايا ، وسرطانات الدماغ ، والمبيض ، والثدي ، والقولون ، والكلى ، والبروستاتا . [ 1 ] [ 2 ]
يتم تقييم 13 سلالة خلوية إضافية لاستخدامها في برنامج الفحص، من بينها سلالتان مشتقتان من سرطان الرئة ذي الخلايا الصغيرة الذي لم يتم تمثيله حتى الآن . [ 1 ]
جميع خطوط الخلايا باستثناء واحد ( اعتبارًا من 6 يناير 2017) (متوفرة للمختبرات الأخرى، بما في ذلك خطوط الخلايا الإضافية. [ 1 ]
سوء تحديد الهوية وسوء التصنيف
ابتداءً من مطلع الألفية، تم العثور على العديد من سلالات الخلايا التي تم تحديدها أو تصنيفها بشكل خاطئ في وقت التحقيق أو قبل ذلك: [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
تم تصنيف خط خلايا MDA-MB-435 في الأصل على أنه خط خلايا سرطان الثدي، ثم تبين أنه خط خلايا سرطان الجلد الميلانيني. [ 7 ] وعند إجراء المزيد من التحقيقات، تبين أن خط خلايا MDA-MB-435 الحالي مشتق من نفس الفرد الذي اشتق منه خط الخلايا M14 . [ 7 ] وقد أوضح فحص المستنسخات أن الخلط مع M14 حدث في وقت مبكر جدًا من تاريخ MDA-MB-435، قبل إدراجه في برنامج العلاجات التجريبية. [ 7 ]
تم تحديد سلالة الخلايا NCI/ADR-RES ، التي صُنفت في الأصل على أنها سلالة خلايا سرطان الثدي، على أنها سلالة خلايا ورم المبيض. [ 8 ] ويبدو أن سلالة الخلايا NCI/ADR-RES قد اشتُقت في وقت ما من سلالة الخلايا OVCAR-8 . [ 8 ] في الأصل، كانت سلالة الخلايا تُسمى MCF-7/ADR-RES ؛ وقد أُعيد تسميتها مع تغيير التصنيف. [ 8 ]
تم اكتشاف أن سلالتين من خلايا سرطان الدماغ، SNB-19 و U251 ، تعودان إلى نفس الشخص. [ 9 ] وهذا يجعل حدوث خطأ محتملاً.
تم تأكيد أن سلالة الخلايا رقم 61، MDA-N ، مشتقة من سلالة الخلايا MDA-MB-435 المصنفة خطأً. [ 7 ] لذا فهي مصنفة خطأً أيضاً، إذ أنها في الواقع سلالة خلايا سرطان الجلد الميلانيني، ولكن اعتباراً من 6 يناير 2018 لا يزال الموقع الرسمي يدرجها على أنها سلالة خلايا سرطان الثدي. [ 1 ] هذه السلالة الخلوية غير متاحة اعتبارًا من 6 يناير 2018. [ 1 ]
تحتفظ اللجنة الدولية لتوثيق خطوط الخلايا بقائمة لخطوط الخلايا الملوثة . [ 10 ] وتشمل هذه القائمة خطوط الخلايا المذكورة أعلاه، وإن كانت تواريخ الإبلاغ والمقالات المنشورة فيها عادةً ما تكون لاحقة بفترة طويلة عن التواريخ الأولى، بالإضافة إلى المقالات التي تُثير مخاوف محددة بشأن خط الخلية المعني. [ 10 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
الاستمرار في استخدام التصنيف الخاطئ
اعتبارًا من عام 2014لا تزال مئات الدراسات البحثية تستخدم خلايا MDA-MB-435 كنموذج لسرطان الثدي، حتى بعد أن تم تصنيفها رسميًا كخط خلوي لسرطان الجلد الميلانيني في عام 2007، وحتى في المجلات الدولية المحكمة ذات التصنيف الأعلى. [ 11 ] وينطبق الأمر نفسه على خطوط الخلايا الأخرى التي تم تحديدها بشكل خاطئ. [ 11 ]
قائمة خطوط الخلايا NCI-60
| خط الهاتف المحمول | تصنيف الأورام | (ربما) تم التعرف عليه بشكل خاطئ | التصنيف الأصلي | غير متاح | وقت التضاعف (ساعات) | كثافة التلقيح | مُعرِّف ورابط Cellosaurus |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CCRF-CEM | سرطان الدم | 26.7 | 40000 | CCRF-CEM (RRID:CVCL_0207) | |||
| HL-60(TB) | سرطان الدم | 28.6 | 40000 | HL-60(TB) (RRID:CVCL_A794) | |||
| K-562 | سرطان الدم | 19.6 | 5000 | K-562 (RRID:CVCL_0004) | |||
| مولت-4 | سرطان الدم | 27.9 | 30000 | MOLT-4 (RRID:CVCL_0013) | |||
| RPMI-8226 | سرطان الدم | 33.5 | 20000 | RPMI-8226 (RRID:CVCL_0014) | |||
| SR-786 | سرطان الدم | 28.7 | 20000 | SR (RRID:CVCL_1711) | |||
| A549 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 22.9 | 7500 | A-549 (RRID:CVCL_0023) | |||
| EKVX | الرئة غير صغيرة الخلايا | 43.6 | 20000 | EKVX (RRID:CVCL_1195) | |||
| هوب-62 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 39 | 10000 | HOP-62 (RRID:CVCL_1285) | |||
| هوب-92 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 79.5 | 20000 | HOP-92 (RRID:CVCL_1286) | |||
| NCI-H226 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 61 | 20000 | NCI-H226 (RRID:CVCL_1544) | |||
| NCI-H23 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 33.4 | 20000 | NCI-H23 (RRID:CVCL_1547) | |||
| NCI-H322M | الرئة غير صغيرة الخلايا | 35.3 | 20000 | NCI-H322M (RRID:CVCL_1557) | |||
| NCI-H460 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 17.8 | 7500 | NCI-H460 (RRID:CVCL_0459) | |||
| NCI-H522 | الرئة غير صغيرة الخلايا | 38.2 | 20000 | NCI-H522 (RRID:CVCL_1567) | |||
| كولو 205 | القولون | 23.8 | 15000 | COLO 205 (RRID:CVCL_0218) | |||
| HCC-2998 | القولون | 31.5 | 15000 | HCC2998 (RRID:CVCL_1266) | |||
| HCT116 | القولون | 17.4 | 5000 | HCT 116 (RRID:CVCL_0291) | |||
| HCT-15 | القولون | 20.6 | 10000 | HCT 15 (RRID:CVCL_0292) | |||
| HT-29 | القولون | 19.5 | 5000 | HT-29 (RRID:CVCL_0320) | |||
| KM12 | القولون | 23.7 | 15000 | KM12 (RRID:CVCL_1331) | |||
| SW-620 | القولون | 20.4 | 10000 | SW620 (RRID:CVCL_0547) | |||
| SF-268 | الجهاز العصبي المركزي | 33.1 | 15000 | SF268 (RRID:CVCL_1689) | |||
| SF-295 | الجهاز العصبي المركزي | 29.5 | 10000 | SF295 (RRID:CVCL_1690) | |||
| SF-539 | الجهاز العصبي المركزي | 35.4 | 15000 | SF539 (RRID:CVCL_1691) | |||
| SNB-19 | الجهاز العصبي المركزي | نعم | الجهاز العصبي المركزي | 34.6 | 15000 | SNB-19 (RRID:CVCL_0535) | |
| SNB-75 | الجهاز العصبي المركزي | 62.8 | 20000 | SNB-75 (RRID:CVCL_1706) | |||
| U251 | الجهاز العصبي المركزي | نعم | الجهاز العصبي المركزي | 23.8 | 7500 | U-251MG (RRID:CVCL_0021) | |
| LOX IMVI | سرطان الجلد | 20.5 | 7500 | LOX-IMVI (RRID:CVCL_1381) | |||
| مالم-3م | سرطان الجلد | 46.2 | 20000 | مالمي-3 إم (RRID:CVCL_1438) | |||
| M14 | سرطان الجلد | 26.3 | 15000 | M14 (RRID:CVCL_1395) | |||
| MDA-MB-435 | سرطان الجلد | نعم | صدر | 25.8 | 15000 | MDA-MB-435 (RRID:CVCL_0417) | |
| SK-MEL-2 | سرطان الجلد | 45.5 | 20000 | SK-MEL-2 (RRID:CVCL_0069) | |||
| SK-MEL-28 | سرطان الجلد | 35.1 | 10000 | SK-MEL-28 (RRID:CVCL_0526) | |||
| SK-MEL-5 | سرطان الجلد | 25.2 | 10000 | SK-MEL-5 (RRID:CVCL_0527) | |||
| UACC-257 | سرطان الجلد | 38.5 | 20000 | UACC-257 (RRID:CVCL_1779) | |||
| UACC-62 | سرطان الجلد | 31.3 | 10000 | UACC-62 (RRID:CVCL_1780) | |||
| IGROV-1 | المبيض | 31 | 10000 | IGROV-1 (RRID:CVCL_1304) | |||
| OVCAR-3 | المبيض | 34.7 | 10000 | OVCAR-3 (RRID:CVCL_0465) | |||
| OVCAR-4 | المبيض | 41.4 | 15000 | OVCAR-4 (RRID:CVCL_1627) | |||
| OVCAR-5 | المبيض | 48.8 | 20000 | OVCAR-5 (RRID:CVCL_1628) | |||
| OVCAR-8 | المبيض | 26.1 | 10000 | OVCAR-8 (RRID:CVCL_1629) | |||
| NCI/ADR-RES (أصلاً MCF-7/ADR-RES) | المبيض | نعم | صدر | 34 | 15000 | NCI-ADR-RES (RRID:CVCL_1452) | |
| SK-OV-3 | المبيض | 48.7 | 20000 | SK-OV-3 (RRID:CVCL_0532) | |||
| 786-O | الكلى | 22.4 | 10000 | 786-O (RRID:CVCL_1051) | |||
| A498 | الكلى | 66.8 | 25000 | A-498 (RRID:CVCL_1056) | |||
| أكين | الكلى | 27.5 | 10000 | ACHN (RRID:CVCL_1067) | |||
| CAKI-1 | الكلى | 39 | 10000 | Caki-1 (RRID:CVCL_0234) | |||
| RXF 393 | الكلى | 62.9 | 15000 | RXF 393L (RRID:CVCL_1673) | |||
| SN12C | الكلى | 29.5 | 15000 | SN12C (RRID:CVCL_1705) | |||
| TK-10 | الكلى | 51.3 | 15000 | TK-10 (RRID:CVCL_1773) | |||
| UO-31 | الكلى | 41.7 | 15000 | UO-31 (RRID:CVCL_1911) | |||
| PC-3 | البروستات | 27.1 | 7500 | PC-3 (RRID:CVCL_0035) | |||
| DU-145 | البروستات | 32.3 | 10000 | DU145 (RRID:CVCL_0105) | |||
| MCF7 | صدر | 25.4 | 10000 | MCF-7 (RRID:CVCL_0031) | |||
| MDA-MB-231 | صدر | 41.9 | 20000 | MDA-MB-231 (RRID:CVCL_0062) | |||
| MDA-MB-468 | صدر | 62 | 2000 | MDA-MB-468 (RRID:CVCL_0419) | |||
| HS 578T | صدر | 53.8 | 20000 | Hs 578T (RRID:CVCL_0332) | |||
| إم دي إيه-إن | سرطان الجلد | نعم | صدر | غير متاح | 22.5 | 15000 | MDA-N (RRID:CVCL_1910) |
| BT-549 | صدر | 53.9 | 20000 | BT-549 (RRID:CVCL_1092) | |||
| تي-47 دي | صدر | 45.5 | 20000 | T-47D (RRID:CVCL_0553) |
قائمة خطوط الخلايا الإضافية
| خط الهاتف المحمول | تصنيف الأورام | صِنف | كثافة التلقيح | مُعرِّف ورابط Cellosaurus |
|---|---|---|---|---|
| LXFL 529 | الرئة غير صغيرة الخلايا | بشر | 10000 | LXFL 529L (RRID:CVCL_D085) |
| DMS 114 | الرئة ذات الخلايا الصغيرة | بشر | 20000 | DMS 114 (RRID:CVCL_1174) |
| SHP-77 | الرئة ذات الخلايا الصغيرة | بشر | 40000 | SHP-77 (RRID:CVCL_1693) |
| DLD-1 | القولون | بشر | 50000 | DLD-1 (RRID:CVCL_0248) |
| KM20L2 | القولون | بشر | 10000 | KM20L2 (RRID:CVCL_D889) |
| SNB-78 | الجهاز العصبي المركزي | بشر | 20000 | SNB-78 (RRID:CVCL_B321) |
| XF 498 | الجهاز العصبي المركزي | بشر | 20000 | XF 498 (RRID:CVCL_8928) |
| RPMI-7951 | سرطان الجلد | بشر | 20000 | RPMI-7951 (RRID:CVCL_1666) |
| M19-MEL | سرطان الجلد | بشر | 10000 | M19-MEL (RRID:CVCL_B415) |
| RXF-631 | الكلى | بشر | 10000 | RXF 631L (RRID:CVCL_A780) |
| SN12K1 | الكلى | بشر | 10000 | SN12K1 (RRID:CVCL_D106) |
| ص388 | سرطان الدم | فأرة الماوس | 50000 | P388 (RRID:CVCL_7222) |
| P388/ADR | سرطان الدم | فأرة الماوس | 50000 | P388/ADR (RRID:CVCL_IZ75) |
مراجع
- 1 2 3 4 5 6 7 8 "خطوط الخلايا في الفحص المختبري" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 8 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
- 1 2 3 4 "فحص خطوط خلايا الأورام البشرية NCI-60" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 26 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
- ↑ "خدمات الاكتشاف والتطوير" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 26 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
- ↑ "مرحباً بكم في برنامج العلاجات التنموية" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . تم الاطلاع عليه بتاريخ 6 يناير 2018 .
- ↑ "تحليل المقارنة" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . 11 أغسطس 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
- ↑ "الأهداف الجزيئية" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان. 12 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 7 يناير 2018 .
- ١ ٢ ٣ ٤ ٥ ٦ "إنّ MDA-MB-435، ومشتقّها MDA-N، هما سلالات خلايا سرطان الجلد الميلانيني، وليستا سلالات خلايا سرطان الثدي" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . ٨ مايو ٢٠١٥. تاريخ الاطلاع: ٦ يناير ٢٠١٨ .
- 1 2 3 4 5 "خط الخلايا NCI/ADR-RES هو خط خلايا ورم المبيض، وليس خط خلايا ورم الثدي" . برنامج العلاجات التجريبية . المعهد الوطني للسرطان . 8 مايو 2015. تم الاطلاع عليه في 6 يناير 2018 .
- ١ ٢ ٣ "سلالات خلايا الجهاز العصبي المركزي SNB-19 وU251 مشتقة من نفس الفرد" . برنامج العلاجات التنموية . المعهد الوطني للسرطان . ٨ مايو ٢٠١٥. تم الاطلاع عليه بتاريخ ٦ يناير ٢٠١٨ .
- 1 2 قاعدة بيانات خطوط الخلايا الملوثة أو التي تم تحديدها بشكل خاطئ (PDF) ، الإصدار 8.0، اللجنة الدولية لتوثيق خطوط الخلايا (ICLAC)، 1 ديسمبر 2016 ، تم استرجاعها في 6 يناير 2018
- 1 2 براساد، فيدودالا في تي إس؛ جوبالان، رامبراساد أو جي (2 يونيو 2015). "استمرار استخدام خط خلايا الورم الميلانيني MDA-MB-435 كنموذج لسرطان الثدي البشري، حتى عام 2014" . مجلة npj لسرطان الثدي . 1 : 15002–. doi : 10.1038/npjbcancer.2015.2 . PMC 5515196. PMID 28721362 .
- 1 2 "نتيجة بحث Cellosaurus: 61 نتيجة لـ "لوحة خطوط الخلايا السرطانية NCI60"" . Cellosaurus . المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية . تم الاطلاع عليه بتاريخ 7 يناير 2018. " يتضمن المرجع قائمة الصفحات المرتبطة في نتائج البحث.
- ↑ "سيلوسورس - مصدر معرفي حول خطوط الخلايا" . سيلوسورس . المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية . تم الاطلاع عليه بتاريخ 17 يناير 2018 . يتضمن المرجع الصفحات التي تم العثور عليها من خلال البحث باستخدام أسماء خطوط الخلايا المعنية كما هو موضح في قائمة خطوط الخلايا الإضافية .
- خطوط الخلايا السرطانية
- خطوط الخلايا البشرية
- سرطان المبيض
