الأكتينوميسيتات

الأكتينوميسيتات (المعروفة سابقًا باسم "الأكتينوبكتيريا" ) هي شعبة متنوعة من البكتيريا موجبة الجرام ذات محتوى عالٍ من الجوانين والسيتوزين ( محتوى GC أو محتوى G+C). [ 5 ] يمكن أن تكون هذه البكتيريا أرضية أو مائية . [ 6 ] وهي ذات أهمية بالغة للنباتات البرية نظرًا لمساهمتها في أنظمة التربة . ففي التربة، تساعد على تحلل المواد العضوية للكائنات الميتة، مما يسمح للنباتات بامتصاص الجزيئات مجددًا . ورغم أن الفطريات تؤدي هذا الدور أيضًا ، إلا أن الأكتينوميسيتات أصغر حجمًا بكثير، ومن المرجح أنها لا تشغل نفس الحيز البيئي . وفي هذا السياق، غالبًا ما تُنمي مستعمراتها خيوطًا فطرية واسعة ، كما تفعل الفطريات، ويعكس اسم رتبة مهمة من هذه الشعبة، وهي الأكتينوميسيتاليس (الأكتينوميسيتات)، الاعتقاد السائد لفترة طويلة بأنها من الفطريات. تعيش بعض أنواع الأكتينوميسيتات الموجودة في التربة (مثل فرانكيا ) في علاقة تكافلية مع النباتات التي تخترق جذورها التربة، حيث تثبت النيتروجين للنباتات مقابل حصولها على بعض السكريات النباتية . أما أنواع أخرى، مثل العديد من أنواع جنس المتفطرة ، فهي مسببات أمراض مهمة .

إلى جانب الاهتمام الكبير الذي تحظى به الأكتينوميسيتات لدورها في التربة، لا يزال هناك الكثير مما يجب معرفته عنها. ورغم أنها تُعرف حاليًا بشكل أساسي كبكتيريا تربة، إلا أنها قد تكون أكثر وفرة في المياه العذبة. [ 7 ] تُعد الأكتينوميسيتات إحدى الشعب البكتيرية السائدة، وتضم أحد أكبر الأجناس البكتيرية: الستربتوميسيس . [ 8 ] تُساهم الستربتوميسيس وغيرها من الأكتينوميسيتات بشكل كبير في التوازن البيولوجي للتربة. [ 9 ] كما أنها مصدر للعديد من المضادات الحيوية . [ 10 ] [ 11 ]

تُعدّ بكتيريا جنس بيفيدوباكتيريوم من شعبة الأكتينوميسيتوتا الأكثر شيوعًا في الميكروبيوم المعوي لدى الرضع. [ 12 ] وعلى الرغم من أن البالغين لديهم عدد أقل من بكتيريا بيفيدوباكتيريوم، إلا أن بكتيريا بيفيدوباكتيريوم المعوية تُساعد في الحفاظ على الحاجز المخاطي وتقليل الليبوبوليسكاريد في الأمعاء. [ 13 ]

على الرغم من أن بعضًا من أكبر الخلايا البكتيرية وأكثرها تعقيدًا تنتمي إلى شعبة الأكتينوميسيتوتا، فقد وُصفت مجموعة الأكتينوماريناليس البحرية بأنها تمتلك أصغر الخلايا بدائية النواة الحرة المعيشة. [ 14 ]

يُقال إن بعض الأغشية الحيوية لهذه البكتيريا في سيبيريا أو أنتاركتيكا تتمتع بأطول عمر بين جميع الكائنات الحية على وجه الأرض، حيث تجمدت في التربة الصقيعية منذ حوالي نصف مليون سنة. [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ]

عام

معظم الأكتينوميسيتات ذات الأهمية الطبية أو الاقتصادية تنتمي إلى فئة الأكتينوميسيتات ، ورتبة الأكتينوميسيتاليس . وبينما يُسبب العديد منها أمراضًا لدى البشر، فإن جنس الستربتوميسيس يُعدّ مصدرًا بارزًا للمضادات الحيوية . [ 11 ]

من بين أنواع الأكتينوميسيتات التي لا تنتمي إلى رتبة الأكتينوميسيتات، تُعدّ غاردنريلا واحدة من أكثرها بحثًا. ويُعتبر تصنيف غاردنريلا مثيرًا للجدل، حيث يصنفها نظام MeSH ككائن حي موجب الغرام وسالب الغرام . [ 18 ]

تُعرف الأكتينوميسيتات، وخاصةً أنواع الستربتوميسيس ، بإنتاجها للعديد من المستقلبات النشطة بيولوجيًا ذات الفائدة للإنسان في الطب، مثل المضادات الحيوية [ 19 ] ، ومضادات الفطريات [ 20 ] ، ومضادات الفيروسات ، ومضادات التخثر ، ومعدلات المناعة ، وأدوية الأورام ، ومثبطات الإنزيمات ؛ وفي الزراعة، بما في ذلك المبيدات الحشرية ، ومبيدات الأعشاب ، ومبيدات الفطريات ، والمواد المحفزة لنمو النباتات والحيوانات. [ 21 ] تشمل المضادات الحيوية المشتقة من الأكتينوميسيتات ذات الأهمية في الطب الأمينوغليكوزيدات ، والأنثراسيكلينات ، والكلورامفينيكول ، والماكروليدات ، والتتراسيكلينات ، وغيرها.

تحتوي الأكتينوميسيتات على نسبة عالية من الجوانين والسيتوزين في حمضها النووي . [ 22 ] قد تصل نسبة محتوى الجوانين والسيتوزين في الأكتينوميسيتات إلى 70%، على الرغم من أن بعضها قد يحتوي على نسبة منخفضة من الجوانين والسيتوزين. [ 23 ]

تم اقتراح تحليل تسلسل إنزيم غلوتامين سينثيتاز لإجراء التحليل التطوري لشعبة الأكتينوميسيتوتا. [ 24 ]

نسالة

يعتمد التصنيف المقبول حاليًا على قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) [ 2 ] والمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI). [ 3 ]

علم الوراثة القائم على الجينوم الكامل [ 25 ]LTP القائم على 16S rRNA _10_2024 [ 26 ] [ 27 ] [ 28 ]120 بروتينًا دلاليًا بناءً على GTDB 10-RS226 [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ]
الأكتينوميسيتات

" الطاقة الحرارية الأرضية " جياو وآخرون. 2021

" هيوميميكروبيا " جياو وآخرون. 2021

" الطاقة الحرارية الأرضية " جياو وآخرون. 2021 {CALKMS01}

" أكويكولتوريا " جياو وآخرون. 2021

كوريوباكتيريا كونيغ 2013

روبروبكتيريا سوزوكي 2013

ثيرموليوفيليا سوزوكي وويتمان 2013

أسيدميكروبيا نوريس 2013

نيتريلروبتوريا لودفيج وآخرون. 2013

أكتينوميسيتيا سلام وآخرون 2020

انظر أيضاً

مراجع

  1. أورين أ، غاريتي جي إم (2021). "نشر أسماء اثنتين وأربعين شعبة من بدائيات النوى بشكل صحيح" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987. S2CID 239887308 .  
  2. 1 2 الأكتينوميسيتوتا في LPSN ؛ فريز، إتش إم؛ ماير-كولثوف، جيه بي؛ ساردا كارباس، جيه؛ أفولايان، إيه أو؛ جوكر، إم. (29 أكتوبر 2025). "TYGS وLPSN في عام 2025: مورد بيانات حيوية أساسي عالمي للتصنيف والتسمية الجينية للكائنات بدائية النواة ضمن التنوع الرقمي DSMZ". أبحاث الأحماض النووية . 53 : D1– D12. doi : 10.1093/nar/gkaf1110 .
  3. 1 2 سي. إل. شوخ وآخرون . "أكتينوميسيتوتا" . قاعدة بيانات التصنيف التابعة للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) . تم الاسترجاع في 28 فبراير 2025 . 
  4. غودفيلو م (2012). "الشعبة السادسة والعشرون. شعبة الأكتينوبكتيريا الجديدة". في غودفيلو م، كامبفر ب، تروخيو م.إ، سوزوكي ك، لودفيغ و، ويتمان و.ب (محررون). دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . المجلد 5 ( الطبعة الثانية). نيويورك، نيويورك: سبرينغر. الصفحات 33-34 .   
  5. غاو ب، غوبتا ر.س. (مارس 2012). "الإطار التطوري والبصمات الجزيئية للفروع الرئيسية لشعبة الأكتينوبكتيريا" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 76 (1): 66-112 . Bibcode : 2012MMBR...76...66G . doi : 10.1128/MMBR.05011-11 . PMC 3294427. PMID 22390973 .  
  6. سيرفين، جيه إيه، هيربولد، سي دبليو، سكوبامر، آر جي، ليك، جيه إيه (يناير 2008). "أدلة تستبعد أصل شجرة الحياة من الأكتينوبكتيريا" . بيولوجيا الجزيئات والتطور . 25 (1): 1-4 . doi : 10.1093/molbev/msm249 . PMID 18003601 . 
  7. غاي ر، رودريغيز-فاليرا ف، ماكماهون ك د، توياما د، رينكه ر، كريستينا سوزا دي أوليفيرا ت، وآخرون (2011). لوبيز-غارسيا ب (محرر). "علم الجينوم البيئي لعمود الماء في المجرى العلوي البكر لنهر الأمازون" . PLOS ONE . 6 (8) e23785. Bibcode : 2011PLoSO...623785G . doi : 10.1371/journal.pone.0023785 . PMC 3158796. PMID 21915244 .   
  8. هوجان، سي إم (2010). "البكتيريا" . في: دراجان، إس، وكليفلاند، سي جيه (محرران). موسوعة الأرض . واشنطن العاصمة: المجلس الوطني للعلوم والبيئة. مؤرشف من الأصل بتاريخ 11 مايو 2011.
  9. نينغثوجام دي إس، ساناسام إس، تامريهاو كيه، نيمايشاند إس (نوفمبر 2009). "الأنشطة المضادة لعزلات الأكتينوميسيت المحلية ضد مسببات الأمراض الفطرية للأرز". المجلة الأفريقية لبحوث علم الأحياء الدقيقة . 3 (11): 737-742 .
  10. دونالد، لافينيا؛ بيبيت، أتاناس؛ سوبراماني، راميش؛ أوين، جيريمي؛ كيزرز، روبرت أ.؛ تاوفا، تايتوسي (2022). "ستربتوميسيس: لا تزال أكبر منتج للمستقلبات الثانوية الطبيعية الجديدة، منظور حديث" . بحوث علم الأحياء الدقيقة . 13 (3): 418-465 . doi : 10.3390/microbiolres13030031 . ISSN 2036-7481 . 
  11. 1 2 بروكوبيو، رودي إيمرسون دي ليما؛ سيلفا، إنغريد ريس دا؛ مارتينز، مايرا كاسوارا؛ أزيفيدو، جواو لوسيو دي؛ أراوجو، جانيت ماجالي دي (2012). "المضادات الحيوية التي تنتجها الستربتوميسيس" . المجلة البرازيلية للأمراض المعدية . 16 (5): 466-471 . دوى : 10.1016/j.bjid.2012.08.014 . ردمك 1678-4391 . بميد 22975171 .  
  12. ^ Turroni F، Peano C، Pass DA، Foroni E، Severgnini M، Claesson MJ، Kerr C، Hourihane J، Murray D، Fuligni F، Gueimonde M، Margolles A، De Bellis G، O'Toole PW، van Sinderen D، Marchesi JR، Ventura M (2012/05/11). "تنوع البكتيريا المشقوقة داخل الكائنات الحية الدقيقة في أمعاء الرضع" . بلوس واحد . 7 (5) هـ36957. بيب كود : 2012PLoSO...736957T . دوى : 10.1371/journal.pone.0036957 . بمك 3350489 . بميد 22606315 .  
  13. بينزون إم آر، سيليسيا بي إم، دي روزا إم، كاكوباردو بي، نوناري جي (2012). " انتقال الميكروبات في أمراض الكبد المزمنة" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة . 2012 694629. doi : 10.1155/2012/694629 . PMC 3405644. PMID 22848224 .  
  14. غاي ر، ميزونو س م، بيكازو أ، كاماتشو أ، رودريغيز-فاليرا ف (2013). "علم الميتاجينوميات يكشف عن مجموعة جديدة من البكتيريا الشعاوية البحرية ذات المحتوى المنخفض من الجوانين والسيتوزين والصغيرة جدًا" . التقارير العلمية . 3 2471. Bibcode : 2013NatSR...3.2471G . doi : 10.1038/srep02471 . PMC 3747508. PMID 23959135 .  
  15. نموذج 1 (2 مايو 2010). "أقدم الكائنات الحية: ناجون قدماء بمستقبل هش" . صحيفة الغارديان . مؤرشف من الأصل في 2 مارس 2013.
  16. هانسون ج. "أقدم كائن حي في العالم" . لا بأس أن تكون ذكيًا . مؤرشف من الأصل بتاريخ 13 يوليو 2018. تم الاطلاع عليه بتاريخ 13 يوليو 2018 .
  17. جونسون إس إس، هيبسجارد إم بي، كريستنسن تي آر، ماستيبانوف إم، نيلسن آر، مونش كيه، وآخرون . (سبتمبر 2007). " البكتيريا القديمة تُظهر أدلة على إصلاح الحمض النووي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 104 (36): 14401-14405 . Bibcode : 2007PNAS..10414401J . doi : 10.1073/pnas.0706787104 . PMC 1958816. PMID 17728401 .   
  18. غاردنريلا في رؤوس الموضوعات الطبية (MeSH) التابعة للمكتبة الوطنية الأمريكية للطب
  19. ماهاجان جي بي (2012). "العوامل المضادة للبكتيريا من الأكتينوميسيتات - مراجعة". فرونتيرز إن بيوساينس . 4 373: 240-53 . doi : 10.2741/e373 .
  20. غوبتي م، كولكارني ب، غانغولي ب ن (يناير 2002). "المضادات الحيوية المضادة للفطريات". علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والتكنولوجيا الحيوية . 58 (1): 46-57 . doi : 10.1007/s002530100822 . PMID 11831475. S2CID 8015426 .  
  21. بريسان، دبليو (2003). "المكافحة البيولوجية للفطريات الممرضة لبذور الذرة باستخدام الأكتينوميسيتات". المكافحة البيولوجية . 48 (2): 233-240 . Bibcode : 2003BioCo..48..233B . doi : 10.1023/a:1022673226324 . S2CID 29320215 . 
  22. فينتورا م، كانشايا س، تاوخ أ، تشاندرا ج، فيتزجيرالد ج ف، تشاتر ك ف، فان سينديرين د (سبتمبر 2007). " علم جينوم الأكتينوبكتيريا: تتبع التاريخ التطوري لشعبة قديمة" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 71 (3): 495-548 . Bibcode : 2007MMBR...71..495V . doi : 10.1128/MMBR.00005-07 . hdl : 11381/1721088 . PMC 2168647. PMID 17804669 .  
  23. غاي ر، ماكماهون ك د، رودريغيز-فاليرا ف (فبراير 2012). "كسر النموذج السائد: البكتيريا الشعاعية المنتشرة والوفيرة في المياه العذبة ذات محتوى منخفض من الجوانين والسيتوزين". تقارير علم الأحياء الدقيقة البيئية . 4 (1): 29-35 . Bibcode : 2012EnvMR...4...29G . doi : 10.1111/j.1758-2229.2011.00274.x . PMID 23757226 . 
  24. هايوارد د، فان هيلدن ب د، ويد آي ج (2009). "تطور تسلسل سينثيتاز الغلوتامين في المتفطرات واستخدامه كعلامات جزيئية لتحديد أنواع الأكتينوميسيتوتا" . بي إم سي إيفول. بيول . 9 : 48. doi : 10.1186/1471-2148-9-48 . PMC 2667176. PMID 19245690 .  
  25. نويوي، إي.، كارو، ل.، غارسيا لوبيز، م.، ماير كولثوف، ج. ب.، وويك، ت.، كيربيدس، ن. س.، بوكال، ر.، كلينك، هـ. ب.، غودفيلو، م.، ماركوس غوكر، م. (2018). " التصنيف الجينومي لشعبة الأكتينوبكتيريا " . فرونت . ميكروبيول . 9 2007. doi : 10.3389/fmicb.2018.02007 . PMC 6113628. PMID 30186281 .  
  26. "برنامج النقل طويل الأجل" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
  27. "شجرة LTP_all بتنسيق نيوك" . تم الاطلاع عليها بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
  28. "ملاحظات إصدار LTP_10_2024" (ملف PDF) . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 ديسمبر 2024 .
  29. "إصدار GTDB 10-RS226" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
  30. "bac120_r226.sp_label" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
  31. "تاريخ التصنيف" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .

للمزيد من القراءة

  • بالتز، ر. هـ. (2005). "اكتشاف المضادات الحيوية من الأكتينوميسيتات: هل ستعقب عملية التراجع والسقوط نهضة؟". أخبار معهد علوم الميكروبات . 55 : 186-196 .
  • بالتز، ر. هـ. (2007). "مضادات الميكروبات من الأكتينوميسيتات: العودة إلى المستقبل" . مجلة ميكروب . 2 (3): 125-131 . مؤرشف من الأصل بتاريخ 31-12-2013.
  • باندي ب، غيمير ب، أغراوال ف ب (12-15 يناير 2004). دراسات حول النشاط المضاد للبكتيريا للأكتينوميسيتات المعزولة من منطقة خومبو في نيبال (ملف PDF) . المؤتمر الدولي حول جبال الهيمالايا الكبرى: المناخ، الصحة، البيئة، الإدارة والحفظ. كاتماندو. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) بتاريخ 10 أغسطس 2013.