الارتباط الجيني
الارتباط الجيني هو عندما يتزامن وجود نمط جيني واحد أو أكثر داخل مجموعة سكانية مع سمة ظاهرية أكثر مما هو متوقع من حدوثها بالصدفة .
تهدف دراسات الارتباط الجيني إلى اختبار ما إذا كانت ترددات الأليلات أحادية الموضع أو الأنماط الجينية، أو بشكل أعم، ترددات الأنماط الفردانية متعددة المواضع ، تختلف بين مجموعتين من الأفراد (عادةً مرضى وأفراد أصحاء ). وتستند دراسات الارتباط الجيني إلى مبدأ إمكانية مقارنة الأنماط الجينية "مباشرةً"، أي مع تسلسلات الجينومات أو الإكسومات الفعلية عبر تسلسل الجينوم الكامل أو تسلسل الإكسوم الكامل . قبل عام 2010، كانت تُستخدم طرق تسلسل الحمض النووي .
وصف
قد يكون الارتباط الجيني بين الأنماط الظاهرية، مثل الخصائص المرئية كلون الزهرة أو طولها، أو بين نمط ظاهري وتعدد أشكال جينية، مثل تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP)، أو بين تعدد أشكال جينية. ويحدث الارتباط بين تعدد الأشكال الجينية عندما يكون هناك ارتباط غير عشوائي بين أليلاتها نتيجة لتقاربها على نفس الكروموسوم؛ وهذا ما يُعرف بالارتباط الجيني .
يُستخدم مصطلح عدم التوازن الارتباطي (LD) في دراسة علم الوراثة السكانية لوصف الارتباط غير العشوائي للأليلات في موقعين جينيين أو أكثر، ليس بالضرورة على نفس الكروموسوم. وهو يختلف عن الارتباط الجيني، الذي يُشير إلى ظاهرة انخفاض معدل إعادة التركيب بين موقعين جينيين أو أكثر على كروموسوم واحد بسبب قربهما الفيزيائي. يصف عدم التوازن الارتباطي حالةً تظهر فيها بعض تراكيب الأليلات أو المؤشرات الجينية بتردد أعلى أو أقل في مجتمع ما مقارنةً بما هو متوقع من تكوين عشوائي للأنماط الفردية من الأليلات بناءً على تردداتها.
تُجرى دراسات الارتباط الجيني لتحديد ما إذا كان هناك ارتباط بين متغير جيني ومرض أو صفة معينة. في حال وجود هذا الارتباط، سيظهر أليل أو نمط جيني أو نمط فرداني معين من تعدد الأشكال الجينية (أو تعدد الأشكال الجينية) بتردد أعلى من المتوقع عشوائيًا لدى الفرد الحامل للصفة. وبالتالي، فإن الشخص الحامل لنسخة واحدة أو نسختين من متغير عالي الخطورة يكون أكثر عرضة للإصابة بالمرض المرتبط أو امتلاك الصفة المرتبطة به.
دراسات
تصميمات دراسة الحالات والشواهد
تُعدّ دراسات الحالات والشواهد أداةً وبائيةً كلاسيكية. تستخدم هذه الدراسات أفرادًا مصابين بالفعل بمرض أو سمة أو حالة أخرى، لتحديد ما إذا كانت هناك خصائص لدى هؤلاء المرضى تختلف عن خصائص الأفراد غير المصابين بالمرض أو السمة. في دراسات الحالات والشواهد الجينية، تتم مقارنة تردد الأليلات أو الأنماط الجينية بين الحالات والشواهد. تكون الحالات قد شُخِّصت بالمرض قيد الدراسة، أو تحمل السمة قيد الاختبار؛ أما الشواهد، فإما أنها معروفة بأنها غير مصابة، أو أنها اختيرت عشوائيًا من المجتمع. يشير اختلاف تردد أليل أو نمط جيني للتعدد الشكلي قيد الاختبار بين المجموعتين إلى أن المؤشر الجيني قد يزيد من خطر الإصابة بالمرض أو احتمالية وجود السمة، أو أنه في حالة عدم توازن ارتباطي مع تعدد شكلي آخر يزيد من هذا الخطر. كما يمكن أن تُظهر الأنماط الفردانية ارتباطًا بالمرض أو السمة. كان أحد النجاحات المبكرة في هذا المجال هو العثور على طفرة قاعدة واحدة في المنطقة غير المشفرة من جين APOC3 (جين البروتين الشحمي C3) والتي ارتبطت بمخاطر أعلى لفرط ثلاثي غليسيريد الدم وتصلب الشرايين [ 1 ] باستخدام تصميم دراسة الحالات والشواهد.
تتمثل إحدى مشكلات تصميم دراسة الحالات والشواهد في اختلاف ترددات الأنماط الجينية والأنماط الفردية بين المجموعات العرقية أو الجغرافية. فإذا لم تكن مجموعتا الحالات والشواهد متطابقتين جيدًا من حيث العرق أو الأصل الجغرافي، فقد يحدث ارتباط إيجابي خاطئ بسبب تأثيرات التباين السكاني .
تصاميم عائلية
تهدف تصميمات الارتباط القائمة على العائلة إلى تجنب التأثيرات المحتملة لتداخل التركيبة السكانية، وذلك باستخدام الوالدين أو الأشقاء غير المصابين كعناصر تحكم للحالة (النسل/الشقيق المصاب). يُستخدم اختباران متشابهان بشكل شائع، وهما اختبار اختلال التوازن في الانتقال (TDT) واختبار المخاطر النسبية للفرد الواحد (HRR). يقيس كلا الاختبارين ارتباط المؤشرات الجينية في العائلات النووية عن طريق الانتقال من الوالدين إلى الأبناء. إذا كان أحد الأليلات يزيد من خطر الإصابة بمرض ما، فمن المتوقع أن ينتقل هذا الأليل من الوالدين إلى الأبناء بشكل متكرر في المجتمعات التي ينتشر فيها المرض.
ارتباط الصفات الكمية
الصفة الكمية (انظر: موقع الصفة الكمية ) هي صفة قابلة للقياس تُظهر تباينًا مستمرًا، مثل الطول أو الوزن. غالبًا ما تتبع الصفات الكمية التوزيع الطبيعي في المجتمع. بالإضافة إلى تصميم دراسة الحالات والشواهد، يمكن أيضًا إجراء دراسة ارتباط الصفات الكمية باستخدام عينة من مجتمع غير مرتبط أو ثلاثيات عائلية تُقاس فيها الصفة الكمية لدى النسل.
شهادة
تستند الأدلة على وجود ارتباط بين المتغيرات الجينية إلى تحليلات الارتباط الجيني، والتي عادةً ما تستند إلى دراسات تتضمن أحجام عينات كبيرة، مثل دراسات الارتباط على مستوى الجينوم. ونظرًا لقلة البيانات التجريبية التي تربط بين نتائج الدراسة وتصميمها، فإن التحيز في دراسات الارتباط الجيني غير مفهوم جيدًا. [ 2 ]
الإبلاغ عن النتائج
بناءً على السمات المستمرة أو الثنائية، يتم عادةً الإبلاغ عن نتائج التوريث (التي تتراوح من 0 إلى 1 حيث 0 تعني عدم التوريث) على التوالي من خلال نسبة التباين الظاهري الذي يمكن أن يُعزى إلى التباين الجيني أو نسبة التباين المنسوب إلى التباين الجيني. [ 3 ]
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ ريس، أ؛ شولدرز، س.س؛ غالتون، د.ج؛ بارال، ف.إ (1983). "تعدد أشكال الحمض النووي المجاور لجين البروتين الشحمي البشري A-1: علاقته بفرط ثلاثي غليسيريد الدم". لانسيت . 321 ( 8322): 444-446 . doi : 10.1016/s0140-6736(83)91440-x . PMID 6131168. S2CID 29511911 .
- ↑ ساجو، جورديب س؛ ليتل، جوليان؛ هيغينز، جوليان ب. ت (2009-03-03). "مراجعات منهجية لدراسات الارتباط الجيني" . مجلة PLOS Medicine . 6 (3) e1000028. مكتبة العلوم العامة (PLoS). doi : 10.1371/journal.pmed.1000028 . ISSN 1549-1676 . PMC 2650724. PMID 19260758 .
- ↑ دالكيست، إليزابيث؛ ماغنوسون، باتريك ك. إي.؛ باويتان، يودي؛ سيولاندر، أرفيد (2019). "حول العلاقة بين قابلية التوريث والكسر المنسوب" . علم الوراثة البشرية . 138 (4). سبرينغر ساينس آند بيزنس ميديا ذ.م.م.: 425-435 . doi : 10.1007/s00439-019-02006-8 . ISSN 0340-6717 . PMC 6483966. PMID 30941497 .
روابط خارجية
- قائمة ببرامج الحاسوب لتحليل الجينات، بما في ذلك تحليل الارتباط الجيني
- GWAS Central - قاعدة بيانات مركزية لنتائج الارتباط الجيني على مستوى الملخص.
- علم الوراثة الكلاسيكي
