مركز تسلسل الجينوم البشري

📅 آخر تحديث: ٤ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٤ أغسطس ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

تأسس مركز تسلسل الجينوم البشري التابع لكلية بايلور للطب ( BCM -HGSC ) على يد ريتشارد أ. جيبس ​​عام 1996 عندما تم اختيار كلية بايلور للطب كواحدة من ستة مواقع عالمية لإكمال المرحلة النهائية من مشروع الجينوم البشري الدولي . [ 1 ] [ 2 ] جيبس ​​هو المدير الحالي لمركز BCM-HGSC.

يشغل المركز مساحة تزيد عن 36,000 قدم مربع (3,300 متر مربع ) ، ويعمل به أكثر من 180 موظفًا، وهو أحد ثلاثة مراكز جينوم ممولة من المعاهد الوطنية للصحة، شاركت في إنجاز أول تسلسل للجينوم البشري. ساهم مركز BCM-HGSC بنحو 10% من إجمالي المشروع من خلال تسلسل الكروموسومات 3 و12 وX. [ 3 ] تعاون المركز مع باحثين في مختبر لورانس بيركلي الوطني التابع لوزارة الطاقة الأمريكية وشركة Celera Genomics لتسلسل أول نوع من ذبابة الفاكهة ، Drosophila melanogaster . [ 4 ] كما أنجز المركز تسلسل النوع الثاني من ذبابة الفاكهة ( Drosophila pseudoobscura )، [ 5 ] ونحلة العسل ( Apis mellifera )، [ 6 ] وقاد اتحادًا دوليًا لتسلسل جرذ النرويج البني . [ 7 ] 

قام مركز BCM-HGSC لاحقًا بتسلسل وشرح جينوم البقرة ( Bos taurus )، وقنفذ البحر ، وقرد المكاك الريسوسي ، والكنغر التماري ، وDictyostelium discoideum ، وعدد من البكتيريا المسببة للعدوى الخطيرة ( Rickettsia typhi ، و Enterococcus faecium ، و Mannheimia haemolytica ، و Fusobacterium nucleatum ). وكان مركز BCM-HGSC مساهمًا رئيسيًا في برنامج مجموعة جينات الثدييات [ 8 ] لتسلسل جميع الحمض النووي التكميلي البشري (cDNA )، بالإضافة إلى مشروع رسم خرائط النمط الفرداني الدولي ( HapMap ).

تشمل الأبحاث الأخرى في مركز BCM-HGSC تقنيات جزيئية جديدة لرسم الخرائط والتسلسل، وكيمياء مبتكرة لوسم الحمض النووي، وأجهزة لمعالجة الحمض النووي ، وبرامج حاسوبية جديدة لتحليل البيانات الجينومية، والجينات المُعبر عنها في سرطانات الدم لدى الأطفال ، والاختلافات الجينومية التي تؤدي إلى تغيرات تطورية، ودور التباين الجيني للمضيف في مسار الأمراض المعدية، والأساس الجزيئي لأمراض وراثية محددة. وقد أُجري تسلسل لوحة مرجعية جينية لذبابة الفاكهة (DGRP) هنا. وتُعدّ DGRP جهدًا تعاونيًا بدأته ترودي ماكاي لوضع معيار موحد لأبحاث ذبابة الفاكهة (Drosophila melanogaster ). ويضم مركز HGSC برنامجًا نشطًا في المعلوماتية الحيوية ، مع مشاريع بحثية تشمل علماء الأحياء وعلماء الحاسوب. وتركز المشكلات قيد الدراسة على تطوير أدوات لتوليد بيانات الجينوم ومعالجتها وتحليلها.

يشارك مركز BCM-HGSC أيضًا في اتحاد الوراثة البشرية والصحة في أفريقيا (H3Africa) . وقد أسفر هذا التعاون عن دراسة رئيسية بقيادة نيل هانشارد ، حيث تم فيها إجراء تسلسل الجينوم الكامل لـ 426 فردًا من 50 مجموعة عرقية لغوية في جميع أنحاء أفريقيا. [ 9 ] وكجزء من هذه الدراسة، تم الكشف عن أكثر من 3 ملايين متغير لم يسبق وصفها.

مراجع

  1. ↑ "مواقع أبحاث مشروع الجينوم البشري" . web.ornl.gov . تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 فبراير 2021 .
  2. ↑ بيرغر، إريك (28 أكتوبر 2007). "خيارات حياة الأستراليين تضع هيوستن على خريطة الجينوم" . كرون . تم الاسترجاع في 14 فبراير 2021 .
  3. ↑ "نبذة عن مركز BCM-HGSC" . مركز BCM-HGSC . 2016-03-04 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2021-02-14 .
  4. ↑ آدامز، مارك د.؛ سيلنيكر، سوزان إي.؛ هولت، روبرت أ .؛ إيفانز، شيريل أ.؛ جوكين، جينين د.؛ أماناتيدس، بيتر ج.؛ شيرر، ستيفن إي.؛ لي، بيتر و.؛ هوسكينز، روجر أ.؛ جالي، ريتشارد ف.؛ جورج، ريد أ. (24 مارس 2000). "تسلسل جينوم ذبابة الفاكهة (دروسوفيلا ميلانوجاستر)" . مجلة ساينس . 287 (5461): 2185-2195 . رمز Bibcode : 2000Sci...287.2185. doi : 10.1126 /science.287.5461.2185 . ISSN 0036-8075 . PMID 10731132 .  
  5. ↑ ريتشاردز، ستيفن؛ ليو، يو؛ بيتنكورت، برايان ر.؛ هراديكي، بافيل؛ ليتوفسكي، ستان؛ نيلسن، راسموس؛ ثورنتون، كيفن؛ هوبيز، ميليسا ج.؛ تشين، روي؛ ميسيل، ريتشارد ب.؛ كورون، أوليفييه (يناير 2005). " التسلسل الجينومي المقارن لذبابة الفاكهة الكاذبة: تطور الكروموسومات والجينات والعناصر التنظيمية" . أبحاث الجينوم . 15 (1): 1-18 . doi : 10.1101/gr.3059305 . ISSN 1088-9051 . PMC 540289. PMID 15632085 .   
  6. ↑ سولينياك، ميشيل؛ تشانغ، لان؛ موجيل، فلورنس؛ لي، بينغشان؛ فوتران، دومينيك؛ مونيرو، مونيك؛ كورنيه، جان ماري؛ وورلي، كيم سي؛ وينستوك، جورج إم؛ جيبس، ريتشارد إيه. (19 مارس 2007). "جينوم نحل العسل Apis mellifera: حوار بين رسم الخرائط الجينية وتجميع التسلسل" . علم الأحياء الجينومي . 8 (3): 403. doi : 10.1186/gb-2007-8-3-403 . ISSN 1474-760X . PMC 1868943. PMID 17381825 .   
  7. ↑ جيبس، ريتشارد أ.؛ وينستوك، جورج م.؛ ميتزكر، مايكل ل.؛ موزني، دونا م.؛ سودرغرين، إريكا ج.؛ شيرر، ستيفن؛ سكوت، غراهام؛ ستيفن، ديفيد؛ وورلي، كيم س.؛ بيرش، بولا إي.؛ أوكوونو، جيفري (1 أبريل 2004). "تسلسل جينوم جرذ النرويج البني يُلقي الضوء على تطور الثدييات" . مجلة نيتشر . 428 (6982): 493-521 . Bibcode : 2004Natur.428..493G . doi : 10.1038/nature02426 . ISSN 1476-4687 . PMID 15057822 .  
  8. ↑ "الفرق" . genecollections.nci.nih.gov . مؤرشف من الأصل في 19 يوليو 2015. تم الاسترجاع في 14 فبراير 2021 .
  9. ^ شودري، أنانيو؛ آرون، شون. بوتيغي، لورا ر.؛ سينغوبتا، دريتي؛ بوتا، جيريت. بنسلاق، توفيق؛ ويلز، جوردون. كوموثيني، جوديت؛ شرينر، دانيال. فقيم، ياسمينة ج.؛ غورة، أنيسة و. (أكتوبر 2020). “الجينومات الأفريقية عالية العمق تُعلم الهجرة البشرية والصحة” . طبيعة . 586 (7831): 741-748 . دوى : 10.1038 / s41586-020-2859-7 . ردمك 1476-4687 . بمك 7759466 . بميد 33116287 .