KDM5A
إنزيم دي ميثيلاز 5A الخاص بالليسين هو إنزيم يتم ترميزه في البشر بواسطة جين KDM5A . [ 5 ] [ 6 ]
وظيفة
البروتين الذي يُشفّره هذا الجين هو بروتين نووي يُعبّر عنه في جميع أنحاء الجسم. يرتبط هذا البروتين مباشرةً، مع عدة بروتينات أخرى، ببروتين الورم الأرومي الشبكي الذي يُنظّم تكاثر الخلايا. كان يُعرف سابقًا باسم بروتين ربط الورم الأرومي الشبكي 2 (RBP2). يتفاعل هذا البروتين أيضًا مع بروتين رومبوتين-2 الذي يؤدي وظائف مميزة في تكوين خلايا الدم الحمراء وفي تكوين سرطان الدم الليمفاوي التائي. يُعتقد أن بروتين رومبوتين-2 إما يؤثر بشكل مباشر على نشاط البروتين المُشفّر أو قد يُعدّل وظائف بروتين الورم الأرومي الشبكي بشكل غير مباشر عن طريق الارتباط بهذا البروتين. وقد تم العثور على نسخ مُعدّلة مُتغايرة مُشفّرة تُشفّر أشكالًا مُختلفة من هذا الجين. [ 6 ]
تم اكتشاف أن نظير ذبابة الفاكهة ، LID، هو إنزيم نازع لمجموعة الميثيل من الهيستون H3K4 يرتبط بـ c-Myc . [ 7 ] وقد أعيد تسميته مؤخرًا إلى إنزيم نازع لمجموعة الميثيل من الليسين 5 (KDM5).
يمكن تصنيفها إنزيميًا على أنها ديوكسيجيناز ثلاثي ميثيل ليسين ، وهو عضو في عائلة الهيدروكسيلاز المعتمدة على ألفا كيتوجلوتارات ( EC 1.14.11.8 ).
التفاعلات
وقد ثبت أن JARID1A يتفاعل مع مستقبلات الإستروجين ألفا ، [ 8 ] و LMO2 [ 9 ] وبروتين الورم الشبكي . [ 8 ] [ 10 ]
يُعدّ JARID1A مكونًا رئيسيًا للساعة البيولوجية، ويؤدي ارتفاع مستواه في نهاية مرحلة النوم إلى تثبيط نشاط HDAC1. وينتج عن تثبيط نشاط HDAC1 ارتفاع في مستوى CLOCK وBMAL1، وبالتالي ارتفاع في مستوى بروتينات PER. يقوم عامل التضفير المرتبط ببروتين ربط مسار البوليبيريميدين (PSF) ضمن مُركّب PER بتجنيد SIN3A، وهو بروتين داعم لتجميع مُركّبات تثبيط النسخ، ويُوصل بشكل دوري إنزيمات هيستون ديأسيتيلاز إلى مُحفّز Per1، مما يُثبّط نسخ Per1. [ 11 ] [ 12 ]
أدى تثبيط جين JARID1A إلى تعزيز التمايز العظمي للخلايا السدوية المشتقة من الأنسجة الدهنية البشرية في المختبر وفي الجسم الحي، ونتج عنه زيادة ملحوظة في التعبير الجيني لـ mRNA للجينات المرتبطة بتكوين العظام، مثل الفوسفاتاز القلوي (ALP) والأوستيوكالسين (OC) والأوستيريكس (OSX). وقد أظهرت فحوصات الترسيب المناعي للكروماتين أن البروتين الرابط للبروتين RBP2 يرتبط بمحفزات OSX وOC للحفاظ على مستوى علامة H3K4me3 . كما ارتبط RBP2 فيزيائيًا ووظيفيًا بـ RUNX2، وهو عامل نسخ أساسي يتحكم في التمايز العظمي. وأدى تثبيط RUNX2 إلى إضعاف النشاط الكابت لـ RBP2 في التمايز العظمي للخلايا السدوية المشتقة من الأنسجة الدهنية البشرية. [ 13 ]
مراجع
- 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000073614 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000030180 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ ديفيو-جونز د، هوانغ ب س، جونز ر إ، هاسكل ك م، فوكولو ج أ، هانوبيك م ج، هوبر ه إ، أوليف أ (يوليو 1991). "استنساخ الحمض النووي التكميلي للبروتينات الخلوية التي ترتبط بمنتج جين الورم الأرومي الشبكي". نيتشر . 352 ( 6332): 251-254 . Bibcode : 1991Natur.352..251D . doi : 10.1038/352251a0 . PMID 1857421. S2CID 4357523 .
- 1 2 "Entrez Gene: JARID1A jumonji, AT rich interactive domain 1A" .
- ↑ سيكومب جيه، لي إل، كارلوس إل، أيزنمان آر إن (مارس 2007). "بروتين Lid من مجموعة Trithorax هو نازع ميثيل ثلاثي ميثيل الهيستون H3K4، وهو ضروري لنمو الخلايا المحفز بواسطة dMyc" . الجينات والتطور . 21 (5): 537-551 . doi : 10.1101/gad.1523007 . PMC 1820896. PMID 17311883 .
- 1 2 تشان إس دبليو، هونغ دبليو (يوليو 2001). "بروتين ربط الورم الأرومي الشبكي 2 (Rbp2) يعزز النسخ بوساطة مستقبلات الهرمونات النووية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 276 (30): 28402-12 . doi : 10.1074/jbc.M100313200 . PMID 11358960 .
- ↑ ماو إس، نيل جي إيه، غورها آر إم (أبريل 1997). "يتفاعل جين الورم التائي رومبوتين-2 مع البروتين الرابط لورم الشبكية 2" . أونكوجين . 14 (13): 1531-1539 . doi : 10.1038/sj.onc.1200988 . PMID 9129143 .
- ↑ كيم واي دبليو، أوتيرسون جي إيه، كراتزكي آر إيه، كوكسون إيه بي، كاي إف جيه (نوفمبر 1994). "الخصوصية التفاضلية لارتباط بروتين ربط الورم الشبكي 2 بـ RB وp107 وبروتين ربط TATA" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 14 (11): 7256-64 . doi : 10.1128/mcb.14.11.7256 . PMC 359260. PMID 7935440 .
- ↑ ديتاكيو إل، لي إتش دي، فولمرز سي، هاتوري إم، ويتشر إم، سيكومب جيه، باندا إس (2011). " إنزيم نازع مثيل الليسين من الهيستون JARID1a يُنشّط CLOCK-BMAL1 ويؤثر على الساعة البيولوجية" . مجلة ساينس . 333 (6051): 1881-1885 . Bibcode : 2011Sci...333.1881D . doi : 10.1126/science.1206022 . PMC 3204309. PMID 21960634 .
- ↑ دوونغ، هـ. أ.، روبليس، م. س.، نوتي، د.، ويتز، س. ج. (2011). " آلية جزيئية للتغذية الراجعة السلبية للساعة البيولوجية" . مجلة ساينس . 332 (6036): 1436-1439 . Bibcode : 2011Sci...332.1436D . doi : 10.1126/science.1196766 . PMC 3859310. PMID 21680841 .
- ↑ جي دبليو، شي إل، تشو واي، ليو واي، ما جي إي، جيانغ واي، شو واي، تشانغ إكس، فينغ إتش (2011). "تثبيط التمايز العظمي للخلايا السدوية المشتقة من الأنسجة الدهنية البشرية عن طريق تثبيط بروتين ربط الورم الأرومي الشبكي 2 لعملية النسخ المنشطة بواسطة RUNX2" . الخلايا الجذعية . 29 (7): 1112-25 . doi : 10.1002/stem.663 . PMID 21604327. S2CID 41977627 .
للمزيد من القراءة
- كيم واي دبليو، أوتيرسون جي إيه، كراتزكي آر إيه، كوكسون إيه بي، كاي إف جيه (نوفمبر 1994). "التخصص التفاضلي لارتباط بروتين ربط الورم الشبكي 2 بـ RB وp107 وبروتين ربط TATA" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 14 (11): 7256-64 . doi : 10.1128/mcb.14.11.7256 . PMC 359260. PMID 7935440 .
- ماروياما ك، سوغانو س (يناير 1994). "التغطية بالأوليغو: طريقة بسيطة لاستبدال بنية غطاء الحمض النووي الريبوزي الرسول في حقيقيات النوى بالأوليغوريبونوكليوتيدات". جين . 138 ( 1-2 ): 171-174 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- Fattaey AR، Helin K، Dembski MS، Dyson N، Harlow E، Vuocolo GA، Hanobik MG، Haskell KM، Oliff A، Defeo-Jones D (نوفمبر 1993). "توصيف البروتينات المرتبطة بالورم الأرومي الشبكي RBP1 وRBP2". الجين الورمي . 8 (11): 3149-56 . بميد 8414517 .
- Baens M، Aerssens J، van Zand K، Van den Berghe H، Marynen P (Sep 1995). “العزلة والتخصيص الإقليمي للكروموسوم البشري 12p cDNAs”. علم الجينوم . 29 (1): 44-52 . دوى : 10.1006/geno.1995.1213 . بميد 8530100 .
- أندرسون ب، وينتلاند إم إيه، ريكافرينتي جيه واي، ليو دبليو، جيبس آر إيه (أبريل 1996). "طريقة "المحول المزدوج" لتحسين بناء مكتبة الشوتجن". الكيمياء الحيوية التحليلية . 236 (1): 107-113 . doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
- Hillier LD، Lennon G، Becker M، Bonaldo MF، Chiapelli B، Chissoe S، Dietrich N، DuBuque T، Favello A، Gish W، Hawkins M، Hultman M، Kucaba T، Lacy M، Le M، Le N، Mardis E، Moore B، Morris M، Parsons J، Prange C، Rifkin L، Rohlfing T، Schellenberg K، Bento Soares M، Tan F، تييري-ميج جيه، تريفاسكيس إي، أندروود كيه، وولدمان بي، واترستون آر، ويلسون آر، مارا إم (سبتمبر 1996). "إنشاء وتحليل 280.000 علامة تسلسل بشرية معبر عنها" . أبحاث الجينوم . 6 (9): 807-28 . دوى : 10.1101/gr.6.9.807 . بميد 8889549 .
- يو دبليو، أندرسون بي، وورلي كيه سي، موزني دي إم، دينغ واي، ليو دبليو، ريكافرينتي جيه واي، وينتلاند إم إيه، لينون جي، جيبس آر إيه (أبريل 1997). "تسلسل الحمض النووي المكمل المتسلسل على نطاق واسع" . أبحاث الجينوم . 7 (4): 353-358 . doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146. PMID 9110174 .
- ماو إس، نيل جي إيه، غورها آر إم (أبريل 1997). "يتفاعل جين الورم التائي رومبوتين-2 مع البروتين الرابط لبروتين الورم الشبكي 2" . أونكوجين . 14 (13): 1531-1539 . doi : 10.1038/sj.onc.1200988 . PMID 9129143 .
- سوزوكي واي، يوشيتومو-ناكاجاوا كيه، ماروياما كيه، سوياما إيه، سوجانو إس (أكتوبر 1997). "بناء وتوصيف مكتبة cDNA غنية بالطول الكامل ومكتبة غنية بالنهاية 5'". جين . 200 ( 1-2 ): 149-156 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- تشان إس دبليو، وهونغ دبليو (يوليو 2001). "بروتين ربط الورم الأرومي الشبكي 2 (Rbp2) يعزز النسخ بوساطة مستقبلات الهرمونات النووية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 276 (30): 28402-12 . doi : 10.1074/jbc.M100313200 . PMID 11358960 .
- ساندروك ب، إيغلي جيه إم (سبتمبر 2001). "نظام التفاعل الرباعي في الخميرة يُحدد كيناز تنشيط Cdk كمنظم لهيليكاز XPD، وهو وحدة فرعية من عامل النسخ IIH" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 276 (38): 35328-35333 . doi : 10.1074/jbc.M105570200 . PMID 11445587 .
- بوسوليل إس إيه، جيدريتشوفسكي إم، شوارتز دي، إلياس جيه إي، فيلين جيه، لي جيه، كوهن إم إيه، كانتلي إل سي، جيجي إس بي (أغسطس 2004). "توصيف واسع النطاق للبروتينات النووية الفسفورية في خلايا هيلا" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 101 (33): 12130-12135 . Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
- بينيفولينسكايا إي في، موراي إتش إل، برانتون بي، يونغ آر إيه، كايلين دبليو جي (يونيو 2005). "ارتباط بروتين pRB ببروتين PHD المسمى RBP2 يعزز التمايز الخلوي" . الخلية الجزيئية . 18 (6): 623-35 . doi : 10.1016/j.molcel.2005.05.012 . PMID 15949438 .
- كيمورا ك، واكاماتسو أ، سوزوكي واي، أوتا تي، نيشيكاوا تي، ياماشيتا آر، ياماموتو جي، سيكين إم، تسوريتاني ك، واكاجوري إتش، إيشي إس، سوجياما تي، سايتو ك، إيسونو واي، إيري آر، كوشيدا إن، يونياما تي، أوتسوكا آر، كاندا ك، يوكوي تي، كوندو إتش، واجاتسوما إم، موراكاوا ك، إيشيدا إس، إيشيباشي تي، تاكاهاشي-فوجي إيه، تاناس تي، ناجاي كيه، كيكوتشي إتش، ناكاي كيه، إيسوغاي تي، سوغانو إس (يناير 2006). "تنويع التعديل النسخي: تحديد وتوصيف المروجين البديلين المفترضين للجينات البشرية على نطاق واسع" . أبحاث الجينوم . 16 (1): 55-65 . دوى : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
- تزتشاخ أ، لينزنر س، موزر ب، راينهارت ر، شيلي ج، فرينز ج ب، كليفسترا ت، رينو م، تيرنر ج، روبرز هـ هـ، كوس أ، جنسن ل ر (أبريل 2006). "طفرات جديدة في جين JARID1C/SMCX لدى مرضى التخلف العقلي المرتبط بالكروموسوم X" . الطفرات البشرية . 27 (4): 389. doi : 10.1002/humu.9420 . PMID 16541399. S2CID 25318561 .
- روش أ، بيكر ب، شنايدر-براشرت و، هاجن إ، لاندثالر م، فوغت ت (أغسطس 2006). "إعادة التعبير عن البروتين الرابط لبروتين الورم الأرومي الشبكي 2-المتماثل 1 يكشف عن وظائف كابحة للأورام في خلايا الورم الميلانيني عالية الانتشار" . مجلة الأمراض الجلدية الاستقصائية . 126 (8): 1850-1859 . doi : 10.1038/sj.jid.5700324 . PMID 16645588 .
- أولسن جيه في، بلاغويف بي، غناد إف، ماسيك بي، كومار سي، مورتنسن بي، مان إم (نوفمبر 2006). " ديناميكيات الفسفرة العالمية، والحيوية، والموضعية في شبكات الإشارات" . مجلة الخلية . 127 (3): 635-48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573 .
روابط خارجية
- JARID1A+بروتين،+بشري في رؤوس الموضوعات الطبية (MeSH) التابعة للمكتبة الوطنية الأمريكية للطب
تتضمن هذه المقالة نصًا من المكتبة الوطنية الأمريكية للطب ، وهو متاح للعموم .
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري رقم 12
- عوامل النسخ
- أوكسيجينازات 2OG البشرية
- EC 1.14.11
