جوليان غوف (عالم)

كان جوليان جون ثورستان غوف (مواليد 1974) [ 2 ] رئيسًا لمجموعة بحثية في مختبر البيولوجيا الجزيئية التابع لمجلس البحوث الطبية . [ 3 ] [ 7 ] [ 8 ] وقد شغل سابقًا منصب أستاذ المعلوماتية الحيوية في جامعة بريستول . [ 9 ]

تعليم

تلقى غوف تعليمه في مدرسة بيرس [ 10 ] في كامبريدج وجامعة بريستول حيث حصل على درجة شرف مشتركة في الرياضيات والفيزياء عام 1998. [ 9 ] [ 10 ] ثم أكمل درجة الدكتوراه في مختبر البيولوجيا الجزيئية (LMB) تحت إشراف سايروس تشوثيا حول تحليل الجينوم وبنية البروتين كطالب دراسات عليا في كلية سيدني ساسكس، كامبريدج ، وتخرج عام 2001. [ 6 ]

المسار الوظيفي والبحث

بعد حصوله على الدكتوراه، أكمل غوف أبحاث ما بعد الدكتوراه في مختبر البيولوجيا الجزيئية وجامعة ستانفورد ، مع مايكل ليفيت . ثم عمل كعالم في معهد ريكين في طوكيو، وأستاذًا في قسم علوم الحاسوب بجامعة بريستول ، حيث عمل من عام ٢٠٠٧ إلى ٢٠١٧، ثم قائدًا لبرنامج في مختبر البيولوجيا الجزيئية التابع لمجلس البحوث الطبية في كامبريدج حتى عام ٢٠٢٣. [ ١٠ ] كما عمل كعالم زائر في معهد باستور في باريس، وأستاذًا مشاركًا في جامعة طوكيو الطبية وطب الأسنان . [ ٩ ] يشغل غوف حاليًا منصب الرئيس التنفيذي ومؤسس شركة OutSee Limited، [ ١١ ] [ ١٢ ] وهي شركة متخصصة في علم الجينوم القائم على الذكاء الاصطناعي في كامبريدج، والحائزة على جائزة "أفضل شركة ناشئة" من جوائز كامبريدج المستقلة للعلوم والتكنولوجيا لعام ٢٠٢٥. [ ١٣ ]

تتركز اهتمامات غوف البحثية في المعلوماتية الحيوية ، وعلم الأحياء الحاسوبي ، وعلم الأحياء الجزيئي ، وعلم الجينوم [ 3 ] مما أدى إلى إنشاء قاعدة بيانات Superfamily [ 14 ] [ 15 ] لنماذج ماركوف المخفية (HMMs) التي تمثل جميع البروتينات ذات البنية المعروفة. نُشرت أبحاثه في مجلات علمية رائدة محكمة ، منها: Nature [ 16 ] [ 17 ] ، Science [ 18 ] [ 19 ] ، Cell [ 20 Nucleic Acids Research [ 21 ] [ 22] [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] ، PNAS [ 26 ] [ 27 ] ، The Biochemical Journal [ 28 The Journal of Molecular Biology [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ] ، Genome Research [ 32 Bioinformatics [ 33 ] ، PLOS Genetics [ 34 Nature Genetics [ 35 ] ، و Journal of Bacteriology [ 36 ] .

تم تمويل أبحاث غوف من قبل مجلس أبحاث التكنولوجيا الحيوية والعلوم البيولوجية (BBSRC)، ومجلس أبحاث الهندسة والعلوم الفيزيائية (EPSRC)، ومجلس أبحاث البيئة الطبيعية (NERC)، [ 37 ] وبرنامج الإطار البحثي السابع للاتحاد الأوروبي ( FP7)، والجمعية اليابانية لتعزيز العلوم (JSPS)، والجمعية الملكية في لندن. [ 9 ]

مراجع

  1. "فهرس أطروحات مكتبة الجامعة: جوليان جون ثورستان جوف" . جامعة كامبريدج.{{cite web}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
  2. 1 2 3 4 5 "جوليان جوف" . لندن: سجل الشركات، حكومة المملكة المتحدة. مؤرشف من الأصل في 18 يوليو 2016.
  3. 1 2 3 منشورات جوليان جوف المفهرسة بواسطة جوجل سكولار
  4. "جهاز Genetrainer (اللياقة البدنية الموجهة وراثيًا) مرشح لجائزة تقنية كبرى" . جامعة بريستول. 3 يونيو 2013. مؤرشف من الأصل في 11 نوفمبر 2014.
  5. جوليان غوف في مشروع علم الأنساب الرياضي
  6. 1 2 غوف، جوليان (2001). نماذج ماركوف المخفية وتطبيقها على تحليل الجينوم في سياق بنية البروتين (ملف PDF) (أطروحة دكتوراه ) . جامعة كامبريدج. OCLC 879396947. EThOS 599547. مؤرشفة من الأصل (ملف PDF) في 11 مارس 2015.  
  7. جوليان غوف في خادم ببليوغرافيا DBLP
  8. منشورات جوليان غوف المفهرسة في قاعدة بيانات سكوبس الببليوغرافية. (الاشتراك مطلوب)
  9. 1 2 3 4 "مجموعة علم الجينوم الحاسوبي: البروفيسور جوليان جوف" . جامعة بريستول. مؤرشف من الأصل في 11 مارس 2015.
  10. 1 2 3 "ملف جوليان جوف الشخصي" . لينكد إن .{{cite web}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
  11. url= https://www.businessweekly.co.uk/posts/cambridge-startup-outsee-ltd-aims-to-unearth-new-drug-targets-with-its-ai-genomics-tech
  12. https://www.cambridgeindependent.co.uk/business/outsee-starts-reformatting-how-genomic-disease-treatments-ar-9402370/
  13. url= https://www.cambridgeindependent.co.uk/business/winners-of-the-cambridge-independent-science-and-technology-9417396/
  14. غوف، جتشوثيا، س. (2002). "العائلة الفائقة: نماذج ماركوف المخفية التي تمثل جميع البروتينات ذات البنية المعروفة . عمليات بحث تسلسل SCOP، والمحاذاة، وتحديد الجينوم" . أبحاث الأحماض النووية . 30 (1): 268-272 . doi : 10.1093/nar/30.1.268 . PMC 99153. PMID 11752312 .  
  15. دي ليما مورايس، د.أ.؛ فانغ، هـ.؛ راكهام، أ.ج.ل.؛ ويلسون، د.؛ بيثيكا، ر.؛ تشوثيا، س .؛ غوف، ج. (2010). "SUPERFAMILY 1.75 بما في ذلك طريقة علم الوجود الجيني المرتكزة على النطاق" . أبحاث الأحماض النووية . 39 (عدد قواعد البيانات): D427– D434 . doi : 10.1093/nar/gkq1130 . PMC 3013712. PMID 21062816 .  
  16. اتحاد فانتوم وRIKEN PMI وCLST (DGT)؛ فورست، أر. كواجي، ح؛ رحلي، م؛ بيلي، جك؛ دي هون، إم جي؛ هابرل، الخامس؛ لاسمان ، تي ؛ كولاكوفسكي، الرابع؛ ليزيو، م؛ إيتو، م؛ أندرسون، ر. مونجال، سي جيه؛ ميهان، TF. شمير، س. بيرتين، ن؛ يورجنسن، م؛ ديمونت، إي؛ أرنر ، إي. شميدل، سي؛ شيفر، يو؛ ميدفيديفا، يا؛ بليسي، سي؛ فيتزيتش، م؛ سيفيرين، J؛ سمبل، ج؛ إيشيزو، Y؛ يونغ، RS. فرانشيسكاتو، م؛ وآخرون . (2014). "أطلس تعبير الثدييات على مستوى المروج" . طبيعة . 507 (7493): 462– 70. Bibcode : 2014Natur.507..462T . doi : 10.1038/ nature13182 . PMC 4529748. PMID 24670764 .   
  17. ^ أوكازاكي، ي.؛ فورونو، م.؛ كاسوكاوا، ت.؛ أداتشي، J.؛ بونو، ه.؛ كوندو، س.؛ نيكايدو، أنا. أوساتو، ن.؛ سايتو، ر. سوزوكي، ه.؛ ياماناكا، أنا؛ كيوساوا، هـ؛ ياجي، ك. تومارو، Y.؛ هاسيغاوا، Y.؛ نوغامي، أ.؛ شونباخ، C .؛ جوجوبوري، ت . بالداريلي، ر. هيل، دى بى؛ بولت، C.؛ هيوم، دا. كواكنبوش، J .؛ شريمل، إل إم؛ كانابين، أ.؛ ماتسودا، ه.؛ باتالوف، س. بيزل، كيلوواط. بليك، جا؛ وآخرون . (2002). "تحليل نسخة الفأر بناءً على شرح وظيفي لـ 60770 cDNAs كاملة الطول" . طبيعة . 420 (6915): 563– 573. Bibcode : 2002Natur.420..563O . doi : 10.1038/nature01266 . hdl : 10161/11223 . PMID 12466851 .  
  18. تشوثيا، سي ؛ غوف، جيه ؛ فوغل، سي؛ تايخمان، إس إيه (2003). "تطور مجموعة البروتينات". مجلة ساينس . 300 (5626): 1701-1703 . رمز Bibcode : 2003Sci...300.1701C . doi : 10.1126/science.1085371 . PMID 12805536. S2CID 27681885 .  
  19. ^ كارنينسي، ف. كاسوكاوا، تي؛ كاتاياما ، إس . غوف, J ; فريث، MC. مايدا ، ن. أوياما، ر. رافاسي، تي؛ لينهارد، ب؛ ويلز، سي؛ كودزيوس، ر. شيموكاوا، ك. باجيك، VB. الأماكن القريبة : باتالوف ، س . فورست، أر. زافولان، م؛ ديفيس، MJ. ويلمنج، إل جي؛ ايدينيس، الخامس؛ ألين، جي. أمبيسي-إمبيومباتو، أ؛ الأماكن القريبة : أتراليا، RN؛ بيلي، TL؛ بانسال، م؛ باكستر ، إل. بيزل، كيلوواط. بيرسانو، تي؛ وآخرون . (2005). “المشهد النسخي لجينوم الثدييات”. علوم . 309 (5740): 1559– 63. Bibcode : 2005Sci...309.1559F . doi : 10.1126/ science.1112014 . PMID 16141072. S2CID 8712839 .   
  20. ^ رافاسي، تي؛ سوزوكي، ح؛ كانيستراتشي، السيرة الذاتية؛ كاتاياما ، إس . باجيك، VB. تان، ك. أكالين، أ؛ شمير، س. كاناموري-كاتاياما، م؛ بيرتين، ن؛ كارنينسي، ف؛ داوب، أول أكسيد الكربون؛ فورست، أر. غوف، J. جريموند ، س. هان، ج.ه. هاشيموتو، تي؛ إخفاء، دبليو؛ هوفمان، أو. كامبوروف، أ؛ كور، م؛ كواجي، ح؛ كوبوساكي، أ؛ لاسمان ، تي ؛ فان نيمويجن، إي؛ ماكفيرسون، سي آر؛ أوجاوا، سي؛ رادوفانوفيتش، أ؛ شوارتز، أ؛ تيسديل، أردي؛ تيجنر ، ج. لينهارد، ب؛ الأماكن القريبة : أراكاوا، تي؛ نينوميا، ن؛ موراكامي، ك. تاجامي، م؛ فوكودا ، إس . إيمامورا، ك؛ كاي، سي؛ إيشيهارا، آر؛ كيتازومي، واي؛ كاواي، جيه؛ هيوم، دي إيه؛ أيديكر، تي ؛ هاياشيزاكي، واي (2010). "أطلس للتنظيم النسخي التوافقي في الفأر والإنسان" . مجلة الخلية . 140 (5): 744-752 . doi : 10.1016 / j.cell.2010.01.044 . PMC 2836267. PMID 20211142 .  أيقونة الوصول المفتوح
  21. لويس، تي إي؛ سيليتو، آي؛ أندريفا، إيه؛ بلونديل، تي إل؛ بوكان، دي دبليو ؛ تشوثيا ، سي؛ كوزيتو، دي؛ دانا، جي إم؛ فيليبيس، آي؛ غوف ، جيه؛ جونز، دي تي؛ كيلي ، إل إيه؛ كليويغت، جي جيه ؛ مينيسي، إف؛ ميستري، جيه؛ مورزين، إيه جي؛ أوتشوا-مونتانو، بي؛ أوتس، إم إي؛ بونتا، إم؛ راكهام، أو جيه؛ ستالهاكي ، جيه؛ ستيرنبرغ، إم جيه ؛ فيلانكار، إس؛ أورينغو، سي (2015). "Genome3D: استغلال البنية لمساعدة المستخدمين على فهم تسلسلاتهم" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 43 (عدد قواعد البيانات): D382–6. doi : 10.1093/nar/gku973 . PMC 4384030 . PMID 25348407 .  
  22. ميتشل، أ؛ تشانغ، هـ.ي؛ دورتي، ل؛ فريزر، م؛ هنتر، س؛ لوبيز، ر؛ ماكانولا، س؛ ماكمينامين، س؛ نوكا، ج؛ بيسيت، س؛ سانغرادور-فيغاس، أ؛ شيريميتجيو، م؛ راتو، س؛ يونغ، س.ي؛ باتمان، أ ؛ بونتا، م؛ أتوود، ت.ك ؛ سيغريست، س.ج؛ ريداشي، ن؛ ريفوار، س؛ زيناريوس، إ؛ خان، د؛ غيوت، د؛ بورك، ب ؛ ليتونيك، إ؛ غوف، ج ؛ أوتس، م؛ هافت، د؛ هوانغ، هـ؛ ناتالي، د.أ (2015). "قاعدة بيانات عائلات بروتينات InterPro: مورد التصنيف بعد 15 عامًا" . أبحاث الأحماض النووية . 43 (عدد قواعد البيانات): D213–21. doi : 10.1093/nar/ gku1243 . PMC 4383996. PMID 25428371 .  أيقونة الوصول المفتوح
  23. هانتر، س.؛ جونز، ب.؛ ميتشل، أ.؛ أبوايلر، ر.؛ أتوود، ت.ك.؛ باتمان، أ.؛ برنارد، ت.؛ بينز، د.؛ بورك، ب.؛ بيرج، س.؛ دي كاسترو، إ.؛ كوجيل، ب.؛ كوربيت، م.؛ داس، يو.؛ دورتي، ل.؛ دوكين، ل.؛ فين، ر.د.؛ فريزر، م.؛ جوف، ج.؛ هافت، د.؛ هولو، ن.؛ خان، د.؛ كيلي، إ.؛ ليتونيك، إ.؛ لونسديل، د.؛ لوبيز، ر.؛ ماديرا، م.؛ ماسلين، ج.؛ ماكانولا، س.؛ ماكدويل، ج. (2011). "InterPro في عام 2011: تطورات جديدة في قاعدة بيانات التنبؤ بالعائلات والمجالات" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 40 (عدد خاص بقاعدة البيانات): D306– D312 . doi : 10.1093/nar/gkr948 . PMC 3245097. PMID 22096229 .  
  24. هانتر، س.؛ أبويلر، رأتوود، تبايروش، أباتمان، أ .؛ بينز، د.؛ بورك، ب .؛ داس، يو.؛ دورتي، ل.؛ دوكين، ل.؛ فين، ر.د.؛ غوف، ج .؛ هافت، د.؛ هولو، ن.؛ خان، د.؛ كيلي، إ.؛ لوغراود، أ.؛ ليتونيك، إ.؛ لونسديل، د.؛ لوبيز، ر.؛ ماديرا، م.؛ ماسلين، ج.؛ ماكانولا، س.؛ ماكدويل، ج.؛ ميستري، ج.؛ ميتشل، أ.؛ مولدر، ن.؛ ناتالي، د.؛ أورينغو، س.؛ كوين، أ.ف. (يناير 2009). "إنتربرو: قاعدة بيانات التوقيع البروتيني التكاملية" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 37 (عدد قواعد البيانات): D211– D215 . doi : 10.1093/nar/gkn785 . ISSN 0305-1048 . PMC 2686546. PMID 18940856 .   أيقونة الوصول المفتوح
  25. ^ مولدر، نيوجيرسي؛ الأماكن القريبة : الأماكن القريبة : بيروش, أ ; بيتمان, أ ; بينز، د؛ برادلي، ف. بورك, ف ; بوشر، ف؛ شيروتي، إل؛ كوبلي، آر؛ كورسيل، إي؛ داس، يو؛ الأماكن القريبة : فليشمان، دبليو؛ غوف, J ; هفت ، د. هارت، ن؛ هولو ، ن. كان، د؛ كانابين، أ؛ كريستيانينوفا، م؛ لونسديل، د؛ لوبيز، ر. ليتونيك، أنا؛ ماديرا، م؛ ماسلن، J. ماكدوال، J؛ ميتشل، أ؛ وآخرون . (2005). "InterPro والتقدم والحالة في عام 2005" . أبحاث الأحماض النووية . 33 (إصدار قاعدة البيانات): D201–5. دوى : 10.1093/نار/gki106 . PMC 540060 . PMID 15608177 .   أيقونة الوصول المفتوح
  26. فينوغرادوف، إس إن؛ هوغويجس، دي؛ بايلي، إكس؛ أريدوندو-بيتر، آر؛ غيرتان، إم؛ غوف، جيه؛ ديوايلد، إس؛ موينز، إل؛ فانفليترين، جيه آر (2005). "ثلاثة سلالات من الغلوبين تنتمي إلى فئتين بنيويتين في جينومات من ممالك الحياة الثلاث" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 102 (32): 11385-9 . Bibcode : 2005PNAS..10211385V . doi : 10.1073/pnas.0502103102 . PMC 1183549. PMID 16061809 .  
  27. غيراردي، إي؛ يوليس، إم إي؛ ميغيل، آر إن؛ بلونديل، تي إل؛ إياميل، إل؛ غوف، جيه؛ بانديوبادياي، إيه؛ هارتمان، جي؛ بتلر، بي جيه (2003). "الخريطة الوظيفية وبنية نطاق MET، وهو نتاج الجين الأولي c-met ومستقبل عامل نمو الخلايا الكبدية/عامل التشتت" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 100 (21): 12039-44 . Bibcode : 2003PNAS..10012039G . doi : 10.1073/pnas.2034936100 . PMC 218709. PMID 14528000 .  
  28. تشوثيا، سي؛ غوف، جيه (2009). "الجوانب الجينومية والبنيوية لتطور البروتين". مجلة الكيمياء الحيوية . 419 (1): 15-28 . doi : 10.1042/BJ20090122 . PMID 19272021 . 
  29. أبيك، جي؛ غوف، جيه ؛ تيشمان، إس إيه (2001). "تراكيب النطاقات في بروتينات العتائق والبكتيريا الحقيقية وحقيقيات النوى". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 310 (2): 311-25 . doi : 10.1006/jmbi.2001.4776 . PMID 11428892 . 
  30. غوف، ج.؛ كاربلوس، ك.؛ هيغي، ر.؛ تشوثيا، س. (2001). "تحديد التماثل لتسلسلات الجينوم باستخدام مكتبة من نماذج ماركوف المخفية التي تمثل جميع البروتينات ذات البنية المعروفة1". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 313 (4): 903-919 . CiteSeerX 10.1.1.144.6577 . doi : 10.1006/jmbi.2001.5080 . PMID 11697912 .  
  31. تايخمان، إس. أ .؛ ريسون، إس. سي.؛ ثورنتون، جيه. إم .؛ رايلي، إم.؛ غوف، جيهتشوثيا، سي. (2001). "تطور وبنية مسارات استقلاب الجزيئات الصغيرة في الإشريكية القولونية". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 311 (4): 693-708 . CiteSeerX 10.1.1.121.1628 . doi : 10.1006/jmbi.2001.4912 . PMID 11518524 .  
  32. كاسوكاوا، ت؛ فورونو، م؛ نيكيدو، إ؛ بونو، هـ؛ هيوم، د.أ؛ بولت، س؛ هيل، د.ب؛ بالداريلي، ر؛ غوف، ج ؛ كانابين، أ؛ ماتسودا، هـ؛ شريمل، ل.م؛ هاياشيزاكي، ي؛ أوكازاكي، ي؛ كواكنبوش، ج (2003). "تطوير وتقييم نظام آلي لشرح البيانات وشرح الحمض النووي المكمل" . أبحاث الجينوم . 13 (6ب): 1542-1551 . doi : 10.1101/gr.992803 . PMC 403710. PMID 12819153 .  أيقونة الوصول المفتوح
  33. شهاب، ح. أ.؛ غوف، ج.؛ كوبر، د. ن.؛ داي، إ. ن.؛ غونت، ت. ر. (2013). "التنبؤ بالعواقب الوظيفية لاستبدال الأحماض الأمينية المرتبطة بالسرطان" . المعلوماتية الحيوية . 29 (12): 1504-1510 . doi : 10.1093/bioinformatics/btt182 . PMC 3673218. PMID 23620363 .  
  34. ليو، ج.؛ غوف، جروست، ب. (2006). "تمييز الحمض النووي الريبوزي المشفر للبروتين عن الحمض النووي الريبوزي غير المشفر باستخدام آلات المتجهات الداعمة" . مجلة PLOS Genetics . 2 (4): e29. doi : 10.1371/journal.pgen.0020029 . PMC 1449884. PMID 16683024 .  
  35. ^ فانتوم، الكونسورتيوم. سوزوكي، ح؛ فورست، أر. فان نيمويجن، إي؛ داوب، أول أكسيد الكربون؛ بالويرز، بيجاي؛ ايرفين، كم. لاسمان ، تي ؛ رافاسي، تي؛ هاسيغاوا، ص. دي هون، إم جي؛ كاتاياما ، إس . شرودر ، ك. كارنينسي، ف؛ تومارو، واي؛ كاناموري-كاتاياما، م؛ كوبوساكي، أ؛ أكالين، أ؛ أندو، ص. أرنر ، إي. أسادا، م؛ اساهارا، ح؛ بيلي، تي؛ باجيك، VB. باور، د؛ بيكهاوس، AG. بيرتين، ن؛ بيوركيغرين، J. برومباخر، ف؛ وآخرون . (2009). "الشبكة النسخية التي تتحكم في توقف النمو والتمايز في خط خلايا سرطان الدم النخاعي البشري" . علم الوراثة الطبيعة . 41 (5): 553-62 . دوى : 10.1038 / ng.375 . بمك 6711855 . بميد 19377474 .   
  36. بابو، م.م.؛ بريا، م.ل.؛ سيلفان، أ.ت.؛ ماديرا، م.؛ غوف، ج.؛ أرافيند، ل.؛ سانكاران، ك. (2006). " قاعدة بيانات للبروتينات الدهنية البكتيرية (DOLOP) مع تحديدات وظيفية للبروتينات الدهنية المتوقعة" . مجلة علم البكتيريا . 188 (8): 2761-2773 . doi : 10.1128/JB.188.8.2761-2773.2006 . PMC 1446993. PMID 16585737 .  
  37. «منح الحكومة البريطانية لجوليان غوف» . مجالس البحوث في المملكة المتحدة . مؤرشف من الأصل في 15 مارس 2015.