الفاجيوم

الفاجيوم هو مجتمع من العاثيات البكتيرية وميتاجينوماتها المتمركزة في بيئة معينة، على غرار الميكروبيوم . [ 1 ] [ 2 ] يُعد الفاجيوم فئة فرعية من الفيروم ، الذي يشمل جميع الفيروسات المرتبطة بمضيف أو بيئة معينة. [ 3 ] استُخدم المصطلح لأول مرة في مقال لمودي وآخرون عام 2013 [ 4 ] ، وما زال يُستخدم في المقالات العلمية المتعلقة بالعاثيات البكتيرية وميتاجينوماتها. العاثية البكتيرية ، أو الفيروس اختصارًا، هي فيروس قادر على إصابة البكتيريا والعتائق ، والتكاثر داخلها. تُشكل العاثيات غالبية معظم الفيرومات، وتُعتبر حاليًا أكثر الكائنات الحية وفرة. [ 5 ] غالبًا ما يركز العلماء على الفاجيوم فقط بدلًا من الفيروم أثناء إجراء البحوث. كما تم استكشاف الاختلافات الناتجة عن عوامل عديدة، مثل النظام الغذائي والعمر والموقع الجغرافي. تمت دراسة الفاجيوم في البشر فيما يتعلق بمجموعة واسعة من اضطرابات الجسم البشري، بما في ذلك داء الأمعاء الالتهابي، ومتلازمة القولون العصبي، وسرطان القولون والمستقيم. [ 6 ]
عند البشر

على الرغم من أن العاثيات لا تستطيع إصابة الخلايا البشرية، إلا أنها توجد بكثرة في الفيروسات البشرية . [ 7 ] ركزت أبحاث العاثيات في البشر بشكل كبير على الأمعاء، ولكنها تُجرى أيضًا في مناطق أخرى مثل الجلد، [ 8 ] والدم، [ 9 ] والفم. [ 10 ] لا يزال تركيب العاثيات التي تُشكل عاثيات الأمعاء البشرية السليمة محل نقاش، نظرًا لأن طرق البحث المختلفة قد تؤدي إلى نتائج متباينة. [ 11 ] عند الولادة، تكون العاثيات البشرية، والفيروسات بشكل عام، شبه معدومة. [ 12 ] يُعتقد أن العاثيات البشرية تتكون لدى حديثي الولادة من خلال تحفيز العاثيات الأولية بواسطة البكتيريا المنتقلة من الأم عن طريق المهبل أثناء الولادة. [ 12 ] ومع ذلك، يمكن أن تنتقل العاثيات عن طريق الرضاعة الطبيعية، وهو ما يتضح من خلال الدراسات التي وجدت تطابقًا شبه تام لتسلسلات عاثيات crAssphage بين الأم والطفل. [ 12 ] تستمر الاختلافات في عاثيات الأمعاء البشرية طوال فترة الحياة. تُعدّ فيروسات Siphoviridae و Myoviridae الأكثر وفرةً لدى الرضع، ويتناقص عددها مع تقدم العمر، بينما تهيمن فيروسات Crassvirales لدى البالغين. [ 13 ] كما يمكن أن يشهد الفاجيوم تغيرات نتيجةً للنظام الغذائي، الذي قد يُدخل فيروسات جديدة موجودة في طعامنا. [ 6 ] على سبيل المثال، لوحظ ارتفاع وفرة فيروس crAssphage لدى متبعي الحميات الخالية من الغلوتين، إلى جانب انخفاض في عائلات Podoviridae . [ 13 ] وقد لوحظت اختلافات جغرافية عالمية في تكوين الفاجيوم، مع وجود تباين إضافي بين الأفراد الذين يعيشون في المناطق الريفية والحضرية. [ 13 ] فعلى سبيل المثال، وُجد أن سكان هونغ كونغ، الصين، لديهم عدد أقل من الفيروسات المرتبطة باستهداف البكتيريا الممرضة مقارنةً بسكان مقاطعة يونان. [ 14 ] علاوةً على ذلك، ارتبطت الإقامة لفترات أطول في المناطق الحضرية بزيادة فيروسات Lactobacillus و Lactococcus . [ 14 ]
في المرض
لوحظت تغيرات في العاثيات في العديد من الاضطرابات التي تصيب جسم الإنسان. في الأمعاء، وُصفت تغيرات فريدة في العاثيات في كل من داء الأمعاء الالتهابي ومتلازمة القولون العصبي . [ 12 ] وتوجد تغيرات أكثر تحديدًا في الأنواع الفرعية لهذين الاضطرابين. فقد شهدت الأنواع الفرعية من متلازمة القولون العصبي، وهي متلازمة القولون العصبي المصحوبة بالإسهال (IBS-D) ومتلازمة القولون العصبي المصحوبة بالإمساك (IBS-C)، زيادة في أنواع مختلفة تنتمي إلى عائلتي Microviridae و Myoviridae . [ 12 ] وفي التهاب القولون التقرحي وداء كرون ، وهما نوعان فرعيان من داء الأمعاء الالتهابي، وُجدت اختلافات في مستويات ثراء أنواع Caudovirales . [ 15 ] علاوة على ذلك، وُجدت عاثيات تستهدف بكتيريا Acinetobacter في دم مرضى داء كرون. [ 9 ] ويُعتقد أن هذا يحدث نتيجة لضعف حاجز الأمعاء والتهابه، مما يسمح بانتقال العاثيات. [ ٩ ] في الفم، ارتبط التهاب دواعم السن بوجود فيروسات Myoviridae تحت اللثة، بالإضافة إلى عاثية بكتيرية غير محددة حاليًا من عائلة Siphoviridae . [ ١٠ ] كما وُصفت تغيرات في جينوم العاثيات في الاضطرابات الأيضية، بما في ذلك داء السكري من النوع الأول ، وداء السكري من النوع الثاني، ومتلازمة الأيض . في داء السكري من النوع الأول، لوحظت تحولات عامة في فيروسات Myoviridae و Podoviridae. [ ٦ ] وقد تبين أن جينوم العاثيات البكتيرية الموجودة في أمعاء مرضى داء السكري من النوع الثاني يحتوي على العديد من الجينات المتورطة في تطور المرض. [ ٦ ] يكون التمثيل الكلي للعاثيات في الفيروسوم أعلى لدى الأفراد المصابين بأمراض القلب والأوعية الدموية مقارنةً بالأفراد الأصحاء، حيث يبلغ ٦٣٪ و١٨٪ على التوالي. [ ٦ ] أخيرًا، لاحظ الباحثون الذين يدرسون سرطان القولون والمستقيم زيادة في تنوع أجناس العاثيات، مع وجود اختلافات ملحوظة في فيروسات Inovirus و Tunalikevirus. [ 13 ]
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ ما ي، يو إكس، ماي جي، توكوياسو تي، ليو سي (فبراير 2018). "فهرس عاثيات الأمعاء البشرية يربط بين عاثيات الأمعاء وداء السكري من النوع الثاني" . ميكروبيوم . 6 ( 1) 24. doi : 10.1186/s40168-018-0410-y . PMC 5796561. PMID 29391057 .
- ↑ تاونسند إي إم، كيلي إل، موسكات جي، بوكس جي دي، هارجريفز إن، ليلي دي، وآخرون . (4 يونيو 2021). " البلعميات المعوية البشرية: أصولها وأدوارها في الميكروبيوم المعوي البشري" . مجلة فرونتيرز في علم الأحياء الخلوي والعدوى . 11 643214. doi : 10.3389/fcimb.2021.643214 . PMC 8213399. PMID 34150671 .
- ↑ فيرجن ، هـ. و. (مارس 2014). "الفيروسوم في فسيولوجيا الثدييات وأمراضها" . مجلة الخلية . 157 (1): 142-150 . doi : 10.1016/j.cell.2014.02.032 . PMC 3977141. PMID 24679532 .
- ↑ مودي إس آر، لي إتش إتش، سبينا سي إس، كولينز جيه جيه (يوليو 2013). "العلاج بالمضادات الحيوية يُوسّع نطاق مقاومة الفيروسات وشبكتها البيئية في الميتاجينوم الفيروسي" . مجلة نيتشر . 499 (7457): 219-222 . Bibcode : 2013Natur.499..219M . doi : 10.1038/nature12212 . PMC 3710538. PMID 23748443 .
- ↑ كين ، إي سي (يناير 2015). "قرن من أبحاث العاثيات: العاثيات البكتيرية وتشكيل علم الأحياء الحديث" . BioEssays . 37 (1): 6-9 . doi : 10.1002/bies.201400152 . PMC 4418462. PMID 25521633 .
- 1 2 3 4 5 نبي أفجادي م، تيموري س، منفرد ف ن، فارنوسفادراني س م، حليمي ح (11 أغسطس 2023). "البلعميات المعوية البشرية: تحديدها وأدوارها في الأمراض" . مجلة الإشارات الخلوية . 4 (3): 128-141 . doi : 10.33696/Signaling.4.100 . ISSN 2692-0638 .
- ↑ غورسكا أ، بيتر س، ويلمان م، أوتينريث إ، شلابيرغ ر، هوسون د.هـ (يونيو 2018). "ديناميكيات البلعمة المعوية البشرية أثناء العلاج بالمضادات الحيوية". علم الأحياء الحاسوبي والكيمياء . 74 : 420-427 . doi : 10.1016/j.compbiolchem.2018.03.011 . PMID 29567068. S2CID 4222429 .
- ↑ ويلشر م، بفايسترر ك، ساماردزيتش د، بالسيني ب، بانجرت س، ياغر ك، وآخرون . (سبتمبر 2023). " الفاجيوم في الجلد البشري الطبيعي والملتهب" . ساينس أدفانسز . 9 (39) eadg4015. Bibcode : 2023SciA....9G4015W . doi : 10.1126/sciadv.adg4015 . PMC 10541010. PMID 37774017 .
- 1 2 3 لامي-بيسنييه كيو، ثيودورو آي، بيلو إم، زانغ إتش، بروت إل، كولوت إيه، وآخرون (19 سبتمبر 2024). "يحتوي دم الإنسان على باجيوم يختلف في مرض كرون". bioRxiv 10.1101/2024.06.04.597176 .
- 1 2 Szafrański SP, Slots J, Stiesch M (يونيو 2021). "الفاجيوم الفموي البشري" . طب اللثة 2000. 86 ( 1): 79-96 . doi : 10.1111/prd.12363 . PMID 33690937 .
- ↑ شكوبوروف، أ.ن.، وريان، ف.ج.، ودريبر، ل.أ.، وفورد، أ.، وستوكديل، س.ر.، ودالي، ك.م.، وآخرون . (أبريل 2018). " بروتوكولات قابلة للتكرار لتحليل الميتاجينوم لبكتيريا البراز البشري" . ميكروبيوم . 6 (1) 68. doi : 10.1186/s40168-018-0446-z . PMC 5892011. PMID 29631623 .
- 1 2 3 4 5 Zhang Y, Wang R (5 يوليو 2023). " البلعميات المعوية البشرية: التركيب والتطور والتغيرات في الأمراض" . Frontiers in Microbiology . 14 1213625. doi : 10.3389/fmicb.2023.1213625 . PMC 10354272. PMID 37476672 .
- 1 2 3 4 توبين، سي. أ.، هيل، سي.، شكوبوروف، أ. ن. (15 سبتمبر 2023). "العوامل المؤثرة على تنوع الفاجيوم المعوي البشري" . المراجعة السنوية لعلم الأحياء الدقيقة . 77 : 363-379 . doi : 10.1146/annurev-micro-032421-105754 . ISSN 1545-3251 . PMID 37307857 .
- 1 2 زو تي، صن واي، وان واي، يوه واي كيه، تشانغ إف، تشيونغ سي بي، وآخرون . (11 نوفمبر 2020). “الاختلافات الفيروسية بين الإنسان والأمعاء والحمض النووي عبر الجغرافيا والعرق والتحضر” . مضيف الخلية والميكروب . 28 (5): 741-751.e4. دوى : 10.1016/j.chom.2020.08.005 . ردمك 1934-6069 . بميد 32910902 .
- ↑ نورمان جيه إم، وهاندلي إس إيه، وبالدريدج إم تي، ودرويت إل، وليو سي واي، وكيلر بي سي، وآخرون . (يناير 2015). "تغيرات خاصة بالمرض في الفيروسات المعوية في داء الأمعاء الالتهابي" . مجلة Cell . 160 (3): 447-460 . Bibcode : 2015Cell..160..447N . doi : 10.1016/ j.cell.2015.01.002 . PMC 4312520. PMID 25619688 .
- علم الأحياء الدقيقة
- العاثيات البكتيرية
- الميكروبيومات
