bioRxiv

bioRxiv (يُنطق "بيو-أرشيف" ^{[ 1 ] [ 2 ]} ) هو مستودع مفتوح الوصول للمطبوعات الأولية في العلوم البيولوجية ، أسسه جون إنجليس وريتشارد سيفر في نوفمبر 2013. ^{[ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]} استضافه مختبر كولد سبرينغ هاربور (CSHL) حتى 11 مارس 2025، عندما انتقلت ملكيته إلى openRxiv ، وهي منظمة غير ربحية حديثة التأسيس ، مخصصة لـ bioRxiv و medRxiv . ^{[ 6 ]}

لا تخضع الأبحاث المنشورة على موقع bioRxiv، باعتبارها نسخًا أولية، لمراجعة الأقران (مع أن بعض الأبحاث قد تخضع لمراجعة الأقران، وقد تُنشر مراجعات من مصادر أخرى بجانب النسخ الأولية). ومع ذلك، تخضع جميع الأبحاث لعملية تدقيق أساسية، تشمل فحوصات الحماية، وفحصًا آليًا للكشف عن الانتحال، وتقييمًا لمدى ملاءمتها. كما يمكن للقراء إضافة تعليقاتهم.

تشير التقديرات إلى أن ثلثي الأبحاث المنشورة على موقع bioRxiv تُنشر لاحقًا في مجلات علمية محكمة. ^{[ 7 ]} وقد شكّل موقعا bioRxiv و medRxiv ، وهما موقعان شقيقان له ، مصدرين رئيسيين لنشر أبحاث كوفيد-19 . ^{[ 8 ] [ 9 ]}

استُلهم موقع BioRxiv من مستودع arXiv ، الذي يركز في معظمه على الرياضيات والفيزياء والتخصصات ذات الصلة، ويهدف إلى استكماله. أُطلق هذا المستودع عام 1991 على يد بول جينسبارج (العضو أيضًا في المجلس الاستشاري لـ BioRxiv). وقد تلقى دعمًا من كلٍّ من مختبر كولد سبرينغ هاربور ومؤسسة لوري. ^{[ 10 ]} كما تم تأكيد تمويل إضافي من مبادرة تشان زوكربيرج في أبريل 2017. ^{[ 11 ] [ 12 ]}

قبل إنشاء موقع bioRxiv، انقسم علماء الأحياء حول مسألة وجود مستودع مخصص للمطبوعات الأولية مفتوح الوصول . ^{[ 4 ]} كان لدى الكثيرين مخاوف من أن يسبقهم المنافسون في نشر أبحاثهم ، وبالتالي فقدان حقهم في الاكتشاف . مع ذلك، قام العديد من علماء الوراثة بنشر أوراق بحثية في قسم " علم الأحياء الكمي " في مستودع arXiv (الذي أُطلق عام 2003)، ولم تعد لديهم تلك المخاوف، إذ أصبح بإمكانهم الاستناد إلى المطبوعات الأولية لدعم ادعاءاتهم بالاكتشاف. ^{[ 4 ] [ 13 ]}

ذكرت جوسلين كايزر من مجلة ساينس أن المستودع في عامه الأول "استقطب تدفقًا متواضعًا ولكنه متزايد من الأبحاث"، حيث استضاف 824 نسخة أولية. ^{[ 14 ]} وتم نشر أكثر من 20,000 تغريدة حول النسخ الأولية المستضافة على bioRxiv في عام 2015. ^{[ 10 ]}

في فبراير 2016، ارتفع معدل تقديم الأبحاث إلى موقع bioRxiv بشكل مطرد من حوالي 60 إلى حوالي 200 بحث شهريًا. ^{[ 10 ]} وفي عام 2017، ارتفع عدد الأبحاث المقدمة شهريًا من أكثر من 800 بحث في مارس ^{[ 15 ]} إلى أكثر من 1000 بحث في يوليو ^{[ 16 ]،} ليصل إجمالي عدد الأبحاث المقدمة في عام 2017 إلى 10722 بحثًا. ^{[ 17 ]}

في عام 2018، تم تقديم ما مجموعه 20000 مخطوطة، مما ينتج عنه متوسط ​​شهري قدره 1600 ورقة بحثية. ^{[ 18 ]}

في عام 2019، تم تقديم أكثر من 31000 مخطوطة، مما ينتج عنه متوسط ​​شهري قدره 2600 ورقة بحثية (والذي تسارع إلى ما يزيد قليلاً عن 3000 ورقة بحثية شهريًا في الربع الأخير من عام 2019). ^{[ 19 ]}

ارتفع عدد المخطوطات السنوية إلى 38,088 مخطوطة في عام 2020، ثم زاد قليلاً إلى 40,223 مخطوطة في عام 2021، تلاه نشر 36,417 مخطوطة في عام 2022. وحتى 31 ديسمبر 2022، تم قبول ما يقرب من 180,000 نسخة أولية إجمالاً. ^{[ 20 ]}

يقبل موقع bioRxiv النسخ الأولية في التخصصات التالية

نتيجة لشعبية bioRxiv، قامت العديد من المجلات البيولوجية بتحديث سياساتها بشأن النسخ الأولية، ^{[ 10 ] [ 14 ]} موضحة أنها لا تعتبر النسخ الأولية "منشورًا سابقًا" لغرض قاعدة إنجلفينجر .

تتيح مبادرة bioRxiv إلى المجلات (B2J) للمؤلفين إمكانية تقديم مخطوطاتهم مباشرةً إلى نظام تقديم المجلات عبر bioRxiv. اعتبارًا من مايو 2020، شاركت 177 مجلة في هذه المبادرة. ^{[ 1 ]}

في عام 2019، بدأ موقع BioRxiv بالسماح بنشر المراجعات بجانب النسخ الأولية، بالإضافة إلى السماح بالتعليقات عليها. ويمكن أن تأتي المراجعات من المجلات أو من منصات مثل Review Commons. ^{[ 21 ]}

• قائمة مستودعات ما قبل النشر
• ArXiv
• ChemRxiv
• MedRxiv

• يانسن، جاكلين (12 نوفمبر 2013). "مختبر كولد سبرينغ هاربور يُطلق bioRxiv، وهو خادم مجاني متاح للاستشهاد به للمطبوعات الأولية في علم الأحياء" . مختبر كولد سبرينغ هاربور . مؤرشف من الأصل في 20 ديسمبر 2016. تم الاطلاع عليه في 11 سبتمبر 2016 .
• كايزر، جوسلين (12 نوفمبر 2013). "خادم جديد للمطبوعات الأولية يهدف إلى أن يكون رد علماء الأحياء على موقع arXiv الخاص بعلماء الفيزياء" . مجلة ساينس . تاريخ الاسترجاع: 30 أكتوبر 2016 .
• "إطلاق خادم ما قبل النشر على موقع BioRxiv" . أخبار مكتبة جامعة كاليفورنيا في بيركلي . 15 نوفمبر 2013. تاريخ الاسترجاع : 11 سبتمبر 2016 .
• كالاواي، إيوين؛ باول، كيندال (16 فبراير 2016). "حثّ علماء الأحياء على التمسك بنسخة أولية من البحث" . مجلة نيتشر . 530 (7590): 265. رمز Bibcode : 2016Natur.530..265C . doi : 10.1038/530265a . PMID 26887471 . 
• إنجليس، جون (22 سبتمبر 2016). "خدمة ما قبل الطباعة bioRxiv" (ملف PDF) . مؤتمر COASP 2016. مؤرشف من النسخة الأصلية (ملف PDF) بتاريخ 28 يناير 2020. تاريخ الاطلاع: 17 مارس 2018 .

• الموقع الرسمي