ستيفان شوستر

ستيفان شوستر (مواليد 7 نوفمبر 1961 في مايسن ) هو عالم فيزياء حيوية ألماني. وهو أستاذ المعلوماتية الحيوية في جامعة يينا .

حياة

درس ستيفان شوستر الفيزياء الحيوية في جامعة هومبولت ببرلين، وكتب أطروحته للدكتوراه تحت إشراف البروفيسور راينهارت هاينريش في قسم الفيزياء الحيوية النظرية بجامعة هومبولت ببرلين (عنوان الأطروحة: " دراسات نظرية حول العلاقة المتبادلة بين التسلسل الزمني في أنظمة التفاعلات الإنزيمية ومبادئ التحسين "). وفي عام 2003، حصل على منصب أستاذ في قسم المعلوماتية الحيوية بجامعة فريدريش شيلر في يينا.

ستيفان شوستر هو أحد المتحدثين باسم مركز يينا للمعلوماتية الحيوية (JCB).

يشغل ستيفان شوستر حاليًا منصب محرر مجلة "بيوسيستمز" التابعة لدار النشر "إلسيفير" .

شقيقه الأصغر هو المخرج المسرحي روبرت شوستر .

بحث

يشمل بحث ستيفان شوستر مجموعة واسعة من المواضيع في المعلوماتية الحيوية وعلم الأحياء النظمي . ومن بين هذه المواضيع :

ساهم ستيفان شوستر بشكلٍ كبير في تطوير تحليل الأنماط الأولية . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] وقد استُخدمت هذه الطريقة على نطاق واسع منذ ذلك الحين لتحديد المسارات الأيضية وتطبيقات متنوعة في مجال التقنية الحيوية، مثل حساب العوائد المولية المثلى . استخدم شوستر وزملاؤه هذه الطريقة، على سبيل المثال، لتحليل إنتاج البنسلين [ 9 ] واستقلاب NAD + [ 10 ] ، بالإضافة إلى التنبؤ ببقاء طفرات الإشريكية القولونية . [ 11 ] كما ساهم في تطوير برامج لتحليل المسارات الأيضية. [ 12 ]

من التطبيقات ذات الأهمية البيوكيميائية الكبيرة مسألة قدرة الإنسان والحيوانات العليا الأخرى على تحويل الأحماض الدهنية إلى سكر . فبينما تشير المعارف البيوكيميائية إلى استحالة ذلك، أظهرت تحليلات حاسوبية أجراها كريستوف كاليتا وستيفان شوستر وزملاؤهما وجود مسارات متشابكة متعددة، من حيث المبدأ، تجعل عملية استحداث الجلوكوز من الأحماض الدهنية ممكنة. وقد حظي هذا التوقع النظري باهتمام كبير في المقالات المنشورة على الإنترنت . [ 13 ] [ 14 ]

تشمل الأبحاث المتعلقة بالمسارات الأيضية تحليل توازن التدفق ، والذي يستخدم، على سبيل المثال، لشرح تأثير واربورغ . [ 15 ]

قام أثيل كورنيش-باودن بمراجعة كتاب راينهارد هاينريش وستيفان شوستر " تنظيم الأنظمة الخلوية " [ 16 ] [ 17 ] . وكتب: "بالنسبة للقراء عمومًا، سيكون من التقدم الكبير أن تساعد كتب كهذه في دحض فكرة الخطوات المحددة لمعدل التفاعلات، والتي لطالما أعاقت المفهوم البيوكيميائي لعملية الأيض، ومنعت التكنولوجيا الحيوية من تحقيق العديد من الأهداف التي وُعد بها عند ظهور الهندسة الوراثية. أما بالنسبة للمتخصصين المهتمين بالفعل بالسلوك الحركي لأنظمة الإنزيمات المتعددة، فهذا كتاب لا غنى عنه" .

مراجع

  1. فايفر، ت.؛ شوستر، س. (2005). "مناهج نظرية الألعاب لدراسة تطور الأنظمة البيوكيميائية". اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 30 (1): 20-25 . doi : 10.1016/j.tibs.2004.11.006 . PMID 15653322 . 
  2. شوستر، س. (1996). "تحليل التحكم من حيث المتغيرات المعممة التي تميز الأنظمة الأيضية". مجلة البيولوجيا النظرية . 182 (3): 259-268 . Bibcode : 1996JThBi.182..259S . doi : 10.1006/jtbi.1996.0163 . PMID 8944157 . 
  3. شوستر، س.؛ مارل، م.؛ هوفر، ت. (2002). "نمذجة تذبذبات الكالسيوم البسيطة والمعقدة: من استجابات الخلية الواحدة إلى الإشارات بين الخلايا". المجلة الأوروبية للكيمياء الحيوية . 269 (5): 1333-1355 . doi : 10.1046/j.0014-2956.2001.02720.x . PMID 11874447 . 
  4. بودنشتاين، سي.؛ هايلاند، آي.؛ شوستر، إس. (2012). "التعويض الحراري والتزامن في الإيقاعات اليومية". علم الأحياء الفيزيائي . 9 (3) 036011. Bibcode : 2012PhBio...9c6011B . doi : 10.1088/1478-3975/9/3/036011 . ISSN 1478-3967 . PMID 22683844. S2CID 22888493 .   
  5. شوستر، س.؛ دي فيغيريدو، ل. ف.؛ شروتر، أ.؛ كاليتا، س. (2011). "دمج تحليل المسارات الأيضية مع نظرية الألعاب التطورية. شرح حدوث المسارات منخفضة الإنتاجية من خلال نهج التحسين التحليلي". بيوسيستمز . 105 (2): 147-153 . Bibcode : 2011BiSys.105..147S . doi : 10.1016/j.biosystems.2011.05.007 . PMID 21620931 . 
  6. شوستر، س.؛ هيلجيتاج، س.؛ وودز، ج.هـ.؛ فيل، د.أ. (2002). "مسارات التفاعل في أنظمة التفاعلات الكيميائية الحيوية: الخصائص الجبرية، وإجراءات الحساب المعتمدة، ومثال من استقلاب النيوكليوتيدات". مجلة البيولوجيا الرياضية . 45 (2): 153-181 . doi : 10.1007/s002850200143 . ISSN 0303-6812 . PMID 12181603. S2CID 18109186 .   
  7. شوستر، إس؛ دانديكار، تي؛ فيل، دي إيه (1999). "الكشف عن أنماط التدفق الأولية في الشبكات البيوكيميائية: أداة واعدة لتحليل المسارات والهندسة الأيضية". اتجاهات في التكنولوجيا الحيوية . 17 (2): 53-60 . doi : 10.1016/S0167-7799(98)01290-6 . PMID 10087604 . 
  8. شوستر، س.؛ فيل، د.أ.؛ دانديكار، ت. (2000). "تعريف عام للمسارات الأيضية مفيد للتنظيم المنهجي وتحليل الشبكات الأيضية المعقدة". مجلة نيتشر للتكنولوجيا الحيوية . 18 (3): 326-332 . doi : 10.1038/73786 . ISSN 1087-0156 . PMID 10700151. S2CID 7742485 .   
  9. براوسه، إم تي إي؛ شوبل، إس؛ غوثكه، آر؛ شوستر، إس (2016). "حساب المسارات المختلفة لتخليق البنسلين وعوائدها المولية". التكنولوجيا الحيوية والهندسة الحيوية . 113 (1): 173-181 . doi : 10.1002/bit.25694 . PMID 26134880. S2CID 31216001 .  
  10. دي فيغيريدو، إل إف؛ غوسمان، تي آي؛ زيغلر، إم؛ شوستر، إس. (2011). "تحليل مسار استقلاب NAD+" (ملف PDF) . مجلة الكيمياء الحيوية . 439 (2): 341-348 . doi : 10.1042/BJ20110320 . ISSN 0264-6021 . PMID 21729004 .  
  11. ستيلينغ، ج.؛ كلامت، س.؛ بيتنبروك، ك.؛ شوستر، س.؛ جيلز، إي. دي. (2002). "بنية الشبكة الأيضية تحدد الجوانب الرئيسية للوظائف والتنظيم". نيتشر . 420 ( 6912): 190-193 . Bibcode : 2002Natur.420..190S . doi : 10.1038/nature01166 . ISSN 0028-0836 . PMID 12432396. S2CID 4301741 .   
  12. كامب، أ. فون؛ شوستر، س. (2006). "Metatool 5.0: تحليل سريع ومرن للأنماط الأولية" . المعلوماتية الحيوية . 22 (15): 1930-1931 . doi : 10.1093/bioinformatics/btl267 . ISSN 1367-4803 . PMID 16731697 .  
  13. ^ معلوماتية Wissenschaft
  14. مجلة الأطباء 2011
  15. شوستر، س.؛ بولي، د.؛ مولر، ب.؛ ستارك، هـ.؛ كاليتا، س. (2015). "النماذج الرياضية لتفسير تأثير واربورغ: مراجعة تركز على إنتاج الأدينوسين ثلاثي الفوسفات والكتلة الحيوية". معاملات الجمعية الكيميائية الحيوية . 43 (6): 1187-1194 . doi : 10.1042/BST20150153 . ISSN 0300-5127 . PMID 26614659 .  
  16. هاينريش، ر.؛ شوستر، س. (1996). تنظيم الأنظمة الخلوية . بوسطن، ماساتشوستس: سبرينغر الولايات المتحدة. ISBN 978-1-4613-1161-4. OCLC 840281317 . 
  17. كورنيش-باودن، أ. (1998). "تنظيم الأنظمة الخلوية، بقلم راينهارت هاينريش وستيفان شوستر، تشابمان وهول، نيويورك، 1996. 372 صفحة". نشرة البيولوجيا الرياضية . 59 (5): 1027-1028 . doi : 10.1016/S0092-8240(97)00050-5 .