كابيج

كانت شبكة المعلوماتية الطبية الحيوية للسرطان ( caBIG ) برنامجًا حكوميًا أمريكيًا لتطوير شبكة معلومات مفتوحة المصدر ومتاحة للجميع تُسمى caGrid ، وذلك لتبادل البيانات بشكل آمن في أبحاث السرطان. طُوّرت هذه المبادرة من قِبل المعهد الوطني للسرطان (التابع للمعاهد الوطنية للصحة )، وتولى صيانتها مركز المعلوماتية الطبية الحيوية وتكنولوجيا المعلومات (CBIIT)، وأدارتها شركة بوز ألين هاملتون . في عام 2011، أثار تقريرٌ حول caBIG تساؤلاتٍ جوهرية حول فعاليتها وآلية الرقابة عليها، ما أدى إلى تقليص ميزانيتها ونطاق عملها بشكلٍ كبير. وفي مايو 2012، أُنشئ البرنامج الوطني لمعلوماتية السرطان (NCIP) كبرنامجٍ خلفٍ لـ caBIG.

تاريخ

موّل المعهد الوطني للسرطان (NCI) في الولايات المتحدة مبادرة شبكة المعلوماتية الطبية الحيوية للسرطان (caBIG) في ربيع عام 2004، برئاسة كينيث بيوتو. ^{[ 1 ]} وكان الهدف منها ربط باحثي السرطان في مجال الطب الحيوي في الولايات المتحدة باستخدام تقنية تُعرف باسم الحوسبة الشبكية . بدأ البرنامج، بقيادة مركز المعلوماتية الحيوية وتكنولوجيا المعلومات (CBIIT)، بمرحلة تجريبية مدتها ثلاث سنوات. اختُتمت المرحلة التجريبية في مارس 2007، وأُعلن عن بدء تجربة سريرية. ^{[ 2 ]} روّج بيوتو للبرنامج في عام 2008. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}

بالإضافة إلى caGrid، وهي البنية التحتية الأساسية لتبادل البيانات بين المؤسسات، قامت caBIG بتطوير أدوات برمجية وسياسات لتبادل البيانات ومعايير ومفردات مشتركة لتسهيل تبادل البيانات .

الأدوات البرمجية المستهدفة:

جمع وتحليل وإدارة بيانات البحوث الأساسية
إدارة التجارب السريرية ، بدءًا من تسجيل المرضى وحتى الإبلاغ عن الأحداث الضارة وتحليلها
جمع بيانات التصوير الطبي وتصنيفها ومشاركتها وتخزينها
إدارة العينات البيولوجية

سعت شركة caBIG إلى توفير تقنية أساسية لنهج في الطب الحيوي أطلقت عليه اسم "نظام الرعاية الصحية التعلّمي". ^{[ 4 ]} يعتمد هذا النهج على التبادل السريع للمعلومات بين جميع قطاعات البحث والرعاية، بحيث يتمكن الباحثون والأطباء من مراجعة أحدث النتائج ودمجها بدقة في عملهم. وكان الهدف النهائي هو تسريع عملية البحث الطبي الحيوي. كما تم الترويج له لما يُعرف غالبًا بالطب الشخصي . استُخدمت تقنية caBIG في تجارب سريرية تكيفية ، مثل دراسة "التحقيق في الدراسات المتسلسلة للتنبؤ بالاستجابة العلاجية باستخدام التصوير والتحليل الجزيئي 2" (I-SPY2)، المصممة لاستخدام المؤشرات الحيوية لتحديد العلاج المناسب للنساء المصابات بسرطان الثدي المتقدم . ^{[ 5 ]}

تكنولوجيا المعلومات الصحية

تم الترويج لتكنولوجيا المعلومات الصحية (HIT) لإدارة وتبادل المعلومات الطبية بشكل آمن بين الباحثين ومقدمي الرعاية الصحية والمستهلكين. ومن مبادرات تكنولوجيا المعلومات الصحية التي أشارت إلى caBIG: تعاون المعهد الوطني للسرطان والجمعية الأمريكية لعلم الأورام السريري لإنشاء نظام سجلات صحية إلكترونية خاص بالأورام، باستخدام معايير caBIG لضمان قابلية التشغيل البيني، مما يُمكّن أطباء الأورام من إدارة معلومات المرضى إلكترونيًا بدقة، بما يُغطي المشكلات التدخلية الخاصة بعلم الأورام. كما كانت الشبكة الوطنية لمعلومات الصحة مبادرة لتبادل البيانات السريرية للمرضى من مصادر جغرافية متباعدة، وإنشاء نظام تبادل معلومات صحية وطني مرتبط إلكترونيًا . وقد يكون هناك صلة ما بينهما.

التعاون

تأسس اتحاد "أ بيغ هيلث" عام 2008 لتعزيز الطب الشخصي، لكنه حُلّ عام 2012. ^{[ 6 ]} في يوليو/تموز 2009، أعلن "أ بيغ" عن تعاونه مع مؤسسة الدكتورة سوزان لوف للأبحاث لإنشاء قاعدة بيانات إلكترونية للنساء الراغبات في المشاركة في التجارب السريرية. ^{[ 7 ]} أُطلق على هذه القاعدة اسم "جيش النساء"، وكان هدفها الوصول إلى مليون امرأة في قاعدة بياناتها؛ وبحلول ديسمبر/كانون الأول 2009، تم إطلاق الموقع، وسجّل فيه حوالي 30 ألف امرأة ورجل بحلول عام 2010. ^{[ 8 ]}

هدف مشروع أطلس جينوم السرطان إلى توصيف أكثر من 10,000 ورم في 20 نوعًا من السرطان على الأقل بحلول عام 2015. ووفرت منصة caBIG الاتصال ومعايير البيانات والأدوات اللازمة لجمع وتنظيم ومشاركة وتحليل بيانات الأبحاث المتنوعة في قاعدة بياناتها. ومنذ عام 2007، تعاون المعهد الوطني للسرطان (NCI) مع المعهد الوطني لأبحاث السرطان في المملكة المتحدة (NCRI). وتبادلت المنظمتان التقنيات اللازمة للبحوث التعاونية والتبادل الآمن لبيانات الأبحاث باستخدام منصة caGrid وبوابة تبادل معلومات الأورام التابعة للمعهد الوطني لأبحاث السرطان (ONIX) التي أُعلن عنها في أغسطس 2009. ^{[ 9 ]} أُغلقت بوابة ONIX في مارس 2012. ^{[ 10 ]} واستخدم معهد ديوك للسرطان أدوات التجارب السريرية الخاصة بمنصة caBIG في تعاونه مع مستشفى بكين للسرطان التابع لجامعة بكين . ^{[ 11 ]}

تطبيق

يهدف المشروع إلى ربط 65 مركزًا متخصصًا في علاج السرطان معتمدًا من المعهد الوطني للسرطان، لتمكين البحث التعاوني. ويمكن للمؤسسات المشاركة إما "تبني" أدوات caBIG لتبادل البيانات مباشرةً عبر caGrid، أو "تكييف" البرامج التجارية أو المطورة داخليًا لتكون متوافقة مع caBIG. وقد طوّر برنامج caBIG مجموعات تطوير برمجية (SDKs) لأدوات برمجية قابلة للتشغيل البيني، بالإضافة إلى إرشادات حول عملية تكييف الأدوات الحالية أو تطوير التطبيقات لتكون متوافقة مع caBIG.

تضمن برنامج شبكة دعم المؤسسات خبرات متخصصة في مجالات محددة، ومقدمي خدمات دعم، ومنظمات خارجية تقدم المساعدة بموجب عقود خدمات. ^{[ 12 ]} وكانت بوابة إلكترونية تستخدم برنامج Liferay متاحة من عام 2008 إلى عام 2013. ^{[ 13 ]}

المصادر المفتوحة

منذ عام 2004، اعتمد برنامج caBIG على مجتمعات المصادر المفتوحة ، المقتبسة من شراكات أخرى بين القطاعين العام والخاص. وقد أنتج برنامج caBIG برمجيات بموجب عقود مع فرق تطوير البرمجيات، التي تنتمي في معظمها إلى مجتمع البحث التجاري.

بشكل عام، تُعتبر البرامج المطورة بموجب عقود مع الحكومة الأمريكية ملكًا للحكومة الأمريكية ودافعي الضرائب الأمريكيين. وبحسب بنود العقود، قد لا يُتاح الوصول إليها إلا من خلال طلب بموجب قانون حرية المعلومات . وقد يحول تأخر الاستجابة لهذه الطلبات دون استفادة مقدم الطلب من أي منفعة ثانوية من البرامج التي تم الكشف عنها بموجب هذا القانون.

وضع برنامج caBIG جميع برامجه في مستودع برمجيات متاح للتنزيل مجانًا. يعني المصدر المفتوح أنه بإمكان أي شخص تعديل البرنامج المُنزّل؛ ومع ذلك، فإن الترخيص المطبق على البرنامج المُنزّل يمنح مرونة أكبر من المعتاد. يُسمح للأفراد أو المؤسسات بالمساهمة بالكود المُعدّل في برنامج caBIG، ولكن ليس ذلك إلزاميًا. وبالمثل، يمكن إتاحة التعديلات كمصدر مفتوح، ولكن ليس إلزاميًا. بل يسمح ترخيص caBIG أيضًا باستخدام تطبيقات ومكونات caBIG، بالإضافة إلى الإضافات والتعديلات، وإصدارها كمنتجات تجارية. تُشجع هذه الجوانب من برنامج caBIG على تسويق تقنية caBIG.

نتائج

في عام 2008، أعلنت شركة جلاكسو سميث كلاين أنها ستشارك بيانات الجينوم الخلوي السرطاني مع شركة caBIG. ^{[ 14 ]} وادّعت بعض الشركات الخاصة أنها استفادت من تقنية caBIG في عام 2010. ^{[ 15 ]}

أُنشئ موقع ويب خاص بمجتمع caGrid في عام 2007. ^{[ 16 ]} أُضيفت النسخة 1.x من البرنامج الأساسي إلى مشروع على GitHub في منتصف عام 2013، بموجب ترخيص BSD ثلاثي البنود . ^{[ 17 ]} استخدم الإصدار 4.03 من Globus Toolkit، ونظام Taverna لإدارة سير العمل ولغة تنفيذ العمليات التجارية . ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]} طُوّر برنامج يُسمى Introduce حوالي عام 2006. ^{[ 20 ]} شمل المساهمون مركز العلوم السريرية والترجمية بجامعة ولاية أوهايو ، وجامعة ديوك ، وجامعة شيكاغو - مختبر أرغون الوطني ، وشركات خاصة هي بوز ألين هاملتون ، وإيكاغرا سوفتوير تكنولوجيز، وسيمانتيك بتس. ^{[ 16 ]}

نقد

بحلول عام 2008، تساءل البعض عما إذا كان البرنامج يُفيد شركات الأدوية الكبرى. ^{[ 21 ]} وبحلول عام 2011، أنفق المشروع ما يُقدّر بنحو 350 مليون دولار. ^{[ 22 ]} ورغم أن الهدف كان يُعتبر نبيلًا، إلا أن استخدام جزء كبير من البرنامج لم يكن متساويًا بعد تطويره بتكلفة باهظة لمنافسة المنتجات التجارية. في مارس 2011، خلص تقييمٌ أجرته مجموعة عمل تابعة للمعهد الوطني للسرطان إلى أن برنامج caBIG "...تجاوز بكثير تلك الأهداف لتنفيذ منظومة برمجية معقدة وطموحة للغاية من الأدوات التي تحمل علامة المعهد الوطني للسرطان، لا سيما في مجال أنظمة إدارة التجارب السريرية (CTMS). وقد حققت هذه الأدوات انتشارًا محدودًا في أوساط مجتمع السرطان، وتنافس الموردين التجاريين الراسخين، وتُنشئ التزامات صيانة ودعم طويلة الأجل غير مستدامة ماليًا للمعهد الوطني للسرطان". ^{[ 2 ]} في عام 2012، أعلن المعهد الوطني للسرطان عن برنامج جديد هو البرنامج الوطني لمعلوماتية السرطان (NCIP) كخليفة لبرنامج caBIG. ^{[ 23 ]}^{[ 24 ]}^{[ 25 ]}

شبكة كاغريد

دعمت شبكة الحاسوب والبرمجيات الخاصة بـ caGrid مبادرة شبكة المعلوماتية الطبية الحيوية للسرطان (caBIG) التابعة للمعهد الوطني للسرطان التابع للمعاهد الوطنية للصحة في الولايات المتحدة .

كانت caBIG عبارة عن بنية تحتية افتراضية تطوعية للمعلوماتية تربط البيانات وأدوات البحث والعلماء والمنظمات.

في عام 2013، أعاد البرنامج الوطني لمعلومات السرطان (NCIP) إصدار caGrid بموجب ترخيص BSD 3-Clause ، ونقل مستودع المصدر إلى github .

استخدم caGrid الإصدار 4.03 من مجموعة أدوات Globus، التي أنتجها تحالف Globus.

إدارة البرامج

تم إدارة مشروع caGrid وجزء كبير من تمويله بواسطة شركة بوز ألين هاملتون .

منفذ

كانت بوابة caGrid تطبيقًا قائمًا على الويب مبنيًا على منصة Liferay ، يُمكّن المستخدمين من اكتشاف الخدمات المتاحة على بنية caGrid التحتية والتفاعل معها. وتُعدّ البوابة أداة العرض المرئي الرئيسية لبرمجيات caGrid الوسيطة ، كما تُشكّل مصدرًا لمعلومات caBIG. ومن خلال بوابة caGrid، يُمكن للمستخدمين الوصول إلى معلومات حول المشاركين في caBIG، ونقاط الاتصال الخاصة بـ caGrid، والأخبار والفعاليات المتعلقة بها.

سير العمل

يستخدم سير عمل caGrid ما يلي:

BPEL النشط
حانة

المساهمون

نقد

في مارس 2011، نشر المعهد الوطني للسرطان مراجعة شاملة لبرنامج CaBIG، وهو برنامج CBIIT التابع للمعهد الوطني للسرطان الذي موّل تطوير برنامج caGrid (انظر،)، والذي تضمن قائمة طويلة من المشاكل المتعلقة بالبرنامج، وأوصى بإيقاف معظم مشاريع تطوير البرمجيات.

مراجع

1 2 كينيث بيوتو (1 أبريل 2008). "التوجه نحو الشهرة" (ملف PDF) . مجلة العالم . المجلد 22، العدد 4. صفحة 60. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) في 4 مارس 2012. تم الاطلاع عليه في 9 سبتمبر 2013 .
1 2 مجلس المستشارين العلميين، فريق العمل المخصص (3 مارس 2011). "تقييم أثر شبكة المعلوماتية الطبية الحيوية للسرطان التابعة للمعهد الوطني للسرطان (caBIG®)" (ملف PDF) . المعهد الوطني للسرطان. مؤرشف من النسخة الأصلية (ملف PDF) بتاريخ 25 مارس 2016. تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 أغسطس 2017 .
↑ لوري ويغلر (14 يوليو/تموز 2008). "ربط مجتمع مرضى السرطان على نطاق واسع" . عالم تكنولوجيا المعلومات الحيوية . مؤرشف من الأصل في 10 يونيو/حزيران 2011. تم الاطلاع عليه في 10 سبتمبر/أيلول 2013 .
↑ "نظام رعاية صحية تعليمي لعلاج السرطان" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 7 مارس 2010. تم الاطلاع عليه بتاريخ 9 مارس 2010 .
↑ باركر إيه دي، سيغمان سي سي، كيلوف جي جي، هيلتون إن إم، بيري دي إيه، إيسرمان إل جي (يوليو 2009). "I-SPY 2: تصميم تجريبي تكيفي لسرطان الثدي في سياق العلاج الكيميائي المساعد الجديد". علم الأدوية السريرية والعلاجات . 86 (1): 97-100 . doi : 10.1038/clpt.2009.68 . PMID 19440188. S2CID 22909517 .
↑ "مجموعة الصحة الكبرى" . مؤرشف من الأصل في 13 فبراير 2009. تم الاطلاع عليه في 10 يونيو 2013 .
↑ إيديتا زيلينسكا (22 يوليو/تموز 2009). "المعهد الوطني للسرطان يتناول مسألة تسجيل المرضى في التجارب السريرية" . مجلة ساينتست . مؤرشف من الأصل في 16 أغسطس/آب 2011. تم الاطلاع عليه في 4 أكتوبر/تشرين الأول 2011 .
↑ "دراسة صحة المرأة" . موقع جيش النساء . مؤرشف من الأصل في 30 مايو 2010. تم الاطلاع عليه في 4 أكتوبر 2011 .
↑ "المعهد الوطني لأبحاث السرطان يطلق بوابة ONIX الإلكترونية المجانية لأبحاث السرطان" . مجلة أونكولوجي تايمز البريطانية . أغسطس 2009. ص 4.
↑ "مبادرة المعلوماتية التابعة للمعهد الوطني للبحوث الجنائية" . المعهد الوطني للبحوث الجنائية. مؤرشف من الأصل بتاريخ 22 أغسطس 2013. تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 سبتمبر 2013 .
↑ «تلعب جامعة ديوك دورًا رئيسيًا في مشروع وطني لتحسين رعاية مرضى السرطان» (ملف PDF) . ملاحظات مركز السرطان . مركز ديوك الشامل للسرطان. مارس 2004. ص 6. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) بتاريخ 4 مارس 2016. تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 يونيو 2013 .
↑ "شبكة دعم المؤسسات" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 28-05-2010 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 09-03-2010 .
↑ "بوابة إلى شبكة المعلوماتية الطبية الحيوية للسرطان" . بوابة ويب قديمة . مؤرشفة من الأصل في 7 سبتمبر 2008.
↑ «تتعاون شركة جلاكسو سميث كلاين مع المعهد الوطني للسرطان لإتاحة مجموعة كبيرة من البيانات الجينومية لخلايا السرطان لجميع باحثي السرطان» . بيان صحفي . بيانات جينومية لخلايا السرطان متاحة. مؤرشف من الأصل في 27 يونيو 2008. تم الاطلاع عليه في 10 يونيو 2013 .
↑ "تآزر غير متوقع وموفق: BIGR® و caBIG®" . موقع الشركة الإلكتروني . شركة HealthCare IT. مؤرشف من الأصل بتاريخ 18 أكتوبر 2010. تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 يونيو 2013 .
1 2 "CaGrid" . موقع ويب . مؤرشف من الأصل في 1 يوليو 2007. تم الاطلاع عليه في 10 سبتمبر 2013 .
1 2 "مرحباً بكم في مشروع caGrid الأساسي" . GitHub . تم الاطلاع عليه في 9 سبتمبر 2013 .
↑ وي تان؛ باولو ميسير؛ رافي مادوري؛ إيان فوستر (2009). "بناء سير عمل علمي باستخدام تافيرنا وBPEL: دراسة مقارنة في كاغريد". الحوسبة الموجهة نحو الخدمات - المؤتمر الدولي للحوسبة الموجهة نحو الخدمات 2007 (ملف PDF) . سلسلة محاضرات في علوم الحاسوب. المجلد 5472. الصفحات 118-129 . doi : 10.1007/978-3-642-01247-1_11 . ISBN 978-3-642-01246-4.
↑ وي تان؛ إيان فوستر ؛ رافي مادوري (نوفمبر-ديسمبر 2008). "دمج قوة تافيرنا وكاغريد: سير العمل العلمي الذي يُمكّن التعاون على نطاق واسع عبر الإنترنت". مجلة IEEE للحوسبة عبر الإنترنت . 12 (6): 61-68 . doi : 10.1109/MIC.2008.120 . S2CID 2690862 .
↑ شانون هاستينغز؛ سكوت أوستر؛ ستيفن لانجيلا؛ ديفيد إرفين؛ تحسين كورك وجويل سالتز (ديسمبر 2007). "تقديم: مجموعة أدوات مفتوحة المصدر للتطوير السريع لخدمات الشبكة ذات الأنواع القوية" . مجلة الحوسبة الشبكية . 5 (4): 407-427 . doi : 10.1007/s10723-007-9074-8 .
↑ غاريث هالفكري (23 يونيو 2008). "أبحاث السرطان تصبح مفتوحة" . بيت-تك. مؤرشف من الأصل في 20 مارس 2012. تم الاطلاع عليه في 10 يونيو 2013 .
↑ جون فولي (8 أبريل 2011). "تقرير ينتقد شبكة أبحاث السرطان التي تعاني من مشاكل عديدة" . أسبوع المعلومات . تم الاطلاع عليه في 10 يونيو 2013 .
↑ أودواك غريس توماس (20 أبريل 2012). "المعهد الوطني للسرطان يعيد تنظيم جهود المعلوماتية المتعلقة بالسرطان؛ ويخفض بعض برامج caBIG، وينقل برامج أخرى إلى البرنامج الوطني للمعلوماتية المتعلقة بالسرطان" . مجلة المعلوماتية الحيوية . تم الاطلاع عليه في 25 أبريل 2012 .
↑ جورج أ. كوماتسوليس. "إعلان البرنامج" . المعهد الوطني للسرطان. مؤرشف من الأصل في 30 يوليو 2012. تم الاطلاع عليه في 10 يونيو 2013 .
↑ هارولد فارموس. "حول البرنامج الوطني للوقاية من السرطان" . المعهد الوطني للسرطان. مؤرشف من الأصل في 6 أغسطس 2013. تم الاطلاع عليه في 9 سبتمبر 2013 .

للمزيد من القراءة

أبرنيثي إيه بي، كويتاوز آر، رو كيه، ويلر جيه إل، لايرلي إتش كيه ^{[ تم حذف الرابط ]} . جمع البيانات الإلكترونية التي يُبلغ عنها المريض كأساس لنظام رعاية صحية قائم على التعلم. مجلة علم الأورام السريري. 2009؛27:6522.
بيوتو كيه إتش. ^{[ تم حذف الرابط ]} caBIG: إثبات مفهوم الرعاية الشخصية لمرضى السرطان. مجلة علم الأورام السريري. 2009:27 ملحق 15S:e20712.
هولفورد، إم إي، راجيفان، إتش، تشاو، إتش، كيد، كيه كيه، تشيونغ، كيه إتش (2009). " التكامل القائم على الويب الدلالي لمسارات السرطان وبيانات تردد الأليلات" . معلوماتية السرطان . 8 : 19-30 . doi : 10.4137/CIN.S1006 . PMC 2664696. PMID 19458791 .
هوانغ تي، شينوي بي جيه، سينها آر، غرايزر إم، بامبرز كيه دبليو، فلاورز سي آر (2009). "تطوير قاعدة بيانات بنية المؤسسة لسرطان الغدد الليمفاوية: نظام متوافق مع معيار caBIG الفضي" . معلوماتية السرطان . 8 : 45-64 . doi : 10.4137/CIN.S940 . PMC 2675136. PMID 19492074 .
كونز، آي.، لين ، إم. سي.، وفري، إل. (2009). "رسم خرائط البيانات الوصفية وإعادة استخدامها في caBIG" . مجلة BMC Bioinformatics . 10 (ملحق 2): S4. doi : 10.1186/1471-2105-10-S2-S4 . PMC 2646244. PMID 19208192 .
أومان سي، كوشينك دبليو (2009). "التطورات المستقبلية للمعلوماتية الطبية من منظور البحث السريري الشبكي: قابلية التشغيل البيني والتكامل" . أساليب المعلومات في الطب . 48 (1): 45-54 . doi : 10.3414/me9137 . PMID 19151883. S2CID 23089030 . {{cite journal}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
فان جيه إتش، موفيت آر إيه، ستوكس تي إتش، وآخرون (يونيو 2009). "تقارب المؤشرات الحيوية والمعلوماتية الحيوية وتقنية النانو لعلاج السرطان المُخصَّص" . اتجاهات في التكنولوجيا الحيوية . 27 (6): 350-358 . doi : 10.1016/j.tibtech.2009.02.010 . PMC 3779321. PMID 19409634 .
ستايس سي جيه، شو دبليو، ليفيفري إس دي، وآخرون (2009). "دراسة حالة لاستخدام بنية الشبكة في المعلوماتية الصحية العامة على مستوى الولايات: منظور ولاية يوتا" . مجلة بي إم سي للمعلوماتية الطبية وصنع القرار . 9 : 32. doi : 10.1186/1472-6947-9-32 . PMC 2707374. PMID 19545428 .
بيتر أ. كوفيتز؛ فرانك هارتل؛ كارل شيفر؛ شيري دي كورونادو؛ جيلبرتو فراغوسو؛ هيمانسو ساهني؛ سكوت غوستافسون؛ وكينيث هـ. بيوتو (23 أبريل 2003). "caCORE: بنية تحتية مشتركة لمعلوماتية السرطان". المعلوماتية الحيوية . 19 (18): 2404-2412 . doi : 10.1093/bioinformatics/btg335 . PMID 14668224 .
"تكنولوجيا المعلومات الصحية تصبح شخصية"، InformationWeek (13/11/2009)
"البيانات الصحية الخام"، مؤرشفة بتاريخ 26-12-2010 في Wayback Machine، تكنولوجيا المعلومات الصحية الحكومية (11/6/09)
"المعهد الوطني للسرطان يفتح شبكة بحثية أمام "جيش" مرضى السرطان"، مؤرشف بتاريخ 26-11-2010 في Wayback Machine، تكنولوجيا المعلومات الصحية الحكومية (9/10/2009)
"GridBriefing: مستقبل الرعاية الصحية - الصحة الإلكترونية والحوسبة الشبكية"، GridTalk (9/09)
"التعاون والاستدامة في صميم احتفال caBIG بالذكرى السنوية الخامسة"، GenomeWeb/BioInform (7/09)
"مشاركة ثروة البيانات"، مجلة ساينتفك أمريكان (5/09)
"البحوث الانتقالية تدفع الطلب على بنوك البيانات الحيوية "الافتراضية" المبنية على أدوات caBIG"، GenomeWeb/BioInfom (4/3/09)
"caGrid" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 2012-02-05 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2016-11-22 .
"caGrid 1.0: بنية تحتية شبكية مؤسسية للبحوث الطبية الحيوية" .
"تمكين توفير وإدارة بنية الثقة للشبكة الموحدة" .
"تقديم: مجموعة أدوات مفتوحة المصدر للتطوير السريع لخدمات الشبكة ذات الأنواع القوية" .
"caGrid: تصميم وتنفيذ البنية الأساسية لشبكة المعلوماتية الطبية الحيوية للسرطان" .
تان، وي؛ فوستر، إيان؛ مادوري، رافي (2008). "دمج قوة تافيرنا وكاغريد: سير العمل العلمي الذي يُمكّن التعاون على نطاق واسع عبر الإنترنت". مجلة IEEE للحوسبة عبر الإنترنت . 12 (6): 61-68 . doi : 10.1109/MIC.2008.120 . S2CID 2690862 .

روابط خارجية

موقع caBIG الإلكتروني للمستهلكين/المستخدمين (غير تقني)
موقع مجتمع caBIG (تقني)
ويكي كاغريد
مشروع caGrid gforge
بوابة كاغريد

عناصر

تقديم مجموعة الأدوات ، وهو أيضًا مشروع حاضنة غلوبوس
خدمات البيانات
البيانات الوصفية
حماية
- خدمة تفويض الاعتماد (CDS)
- دوريان
- غاردز
- سمكة الهامور الشبكية
- خدمة الثقة الشبكية (GTS)
- WebSSO - مكون تسجيل الدخول الموحد عبر الويب ، يعتمد على JASIG CAS

[Buetow08-1] 1 2 كينيث بيوتو (1 أبريل 2008). "التوجه نحو الشهرة" (ملف PDF) . مجلة العالم . المجلد 22، العدد 4. صفحة 60. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) في 4 مارس 2012. تم الاطلاع عليه في 9 سبتمبر 2013 .

[assess-2] 1 2 مجلس المستشارين العلميين، فريق العمل المخصص (3 مارس 2011). "تقييم أثر شبكة المعلوماتية الطبية الحيوية للسرطان التابعة للمعهد الوطني للسرطان (caBIG®)" (ملف PDF) . المعهد الوطني للسرطان. مؤرشف من النسخة الأصلية (ملف PDF) بتاريخ 25 مارس 2016. تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 أغسطس 2017 .

[3] لوري ويغلر (14 يوليو/تموز 2008). "ربط مجتمع مرضى السرطان على نطاق واسع" . عالم تكنولوجيا المعلومات الحيوية . مؤرشف من الأصل في 10 يونيو/حزيران 2011. تم الاطلاع عليه في 10 سبتمبر/أيلول 2013 .

[4] "نظام رعاية صحية تعليمي لعلاج السرطان" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 7 مارس 2010. تم الاطلاع عليه بتاريخ 9 مارس 2010 .

[5] باركر إيه دي، سيغمان سي سي، كيلوف جي جي، هيلتون إن إم، بيري دي إيه، إيسرمان إل جي (يوليو 2009). "I-SPY 2: تصميم تجريبي تكيفي لسرطان الثدي في سياق العلاج الكيميائي المساعد الجديد". علم الأدوية السريرية والعلاجات . 86 (1): 97-100 . doi : 10.1038/clpt.2009.68 . PMID 19440188. S2CID 22909517 .

[6] "مجموعة الصحة الكبرى" . مؤرشف من الأصل في 13 فبراير 2009. تم الاطلاع عليه في 10 يونيو 2013 .

[7] إيديتا زيلينسكا (22 يوليو/تموز 2009). "المعهد الوطني للسرطان يتناول مسألة تسجيل المرضى في التجارب السريرية" . مجلة ساينتست . مؤرشف من الأصل في 16 أغسطس/آب 2011. تم الاطلاع عليه في 4 أكتوبر/تشرين الأول 2011 .

[8] "دراسة صحة المرأة" . موقع جيش النساء . مؤرشف من الأصل في 30 مايو 2010. تم الاطلاع عليه في 4 أكتوبر 2011 .

[9] "المعهد الوطني لأبحاث السرطان يطلق بوابة ONIX الإلكترونية المجانية لأبحاث السرطان" . مجلة أونكولوجي تايمز البريطانية . أغسطس 2009. ص 4.

[10] "مبادرة المعلوماتية التابعة للمعهد الوطني للبحوث الجنائية" . المعهد الوطني للبحوث الجنائية. مؤرشف من الأصل بتاريخ 22 أغسطس 2013. تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 سبتمبر 2013 .

[11] «تلعب جامعة ديوك دورًا رئيسيًا في مشروع وطني لتحسين رعاية مرضى السرطان» (ملف PDF) . ملاحظات مركز السرطان . مركز ديوك الشامل للسرطان. مارس 2004. ص 6. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) بتاريخ 4 مارس 2016. تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 يونيو 2013 .

[12] "شبكة دعم المؤسسات" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 28-05-2010 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 09-03-2010 .

[13] "بوابة إلى شبكة المعلوماتية الطبية الحيوية للسرطان" . بوابة ويب قديمة . مؤرشفة من الأصل في 7 سبتمبر 2008.

[14] «تتعاون شركة جلاكسو سميث كلاين مع المعهد الوطني للسرطان لإتاحة مجموعة كبيرة من البيانات الجينومية لخلايا السرطان لجميع باحثي السرطان» . بيان صحفي . بيانات جينومية لخلايا السرطان متاحة. مؤرشف من الأصل في 27 يونيو 2008. تم الاطلاع عليه في 10 يونيو 2013 .

[15] "تآزر غير متوقع وموفق: BIGR® و caBIG®" . موقع الشركة الإلكتروني . شركة HealthCare IT. مؤرشف من الأصل بتاريخ 18 أكتوبر 2010. تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 يونيو 2013 .

[grid-16] 1 2 "CaGrid" . موقع ويب . مؤرشف من الأصل في 1 يوليو 2007. تم الاطلاع عليه في 10 سبتمبر 2013 .

[v1-17] 1 2 "مرحباً بكم في مشروع caGrid الأساسي" . GitHub . تم الاطلاع عليه في 9 سبتمبر 2013 .

[18] وي تان؛ باولو ميسير؛ رافي مادوري؛ إيان فوستر (2009). "بناء سير عمل علمي باستخدام تافيرنا وBPEL: دراسة مقارنة في كاغريد". الحوسبة الموجهة نحو الخدمات - المؤتمر الدولي للحوسبة الموجهة نحو الخدمات 2007 (ملف PDF) . سلسلة محاضرات في علوم الحاسوب. المجلد 5472. الصفحات 118-129 . doi : 10.1007/978-3-642-01247-1_11 . ISBN 978-3-642-01246-4.

[19] وي تان؛ إيان فوستر ؛ رافي مادوري (نوفمبر-ديسمبر 2008). "دمج قوة تافيرنا وكاغريد: سير العمل العلمي الذي يُمكّن التعاون على نطاق واسع عبر الإنترنت". مجلة IEEE للحوسبة عبر الإنترنت . 12 (6): 61-68 . doi : 10.1109/MIC.2008.120 . S2CID 2690862 .

[20] شانون هاستينغز؛ سكوت أوستر؛ ستيفن لانجيلا؛ ديفيد إرفين؛ تحسين كورك وجويل سالتز (ديسمبر 2007). "تقديم: مجموعة أدوات مفتوحة المصدر للتطوير السريع لخدمات الشبكة ذات الأنواع القوية" . مجلة الحوسبة الشبكية . 5 (4): 407-427 . doi : 10.1007/s10723-007-9074-8 .

[21] غاريث هالفكري (23 يونيو 2008). "أبحاث السرطان تصبح مفتوحة" . بيت-تك. مؤرشف من الأصل في 20 مارس 2012. تم الاطلاع عليه في 10 يونيو 2013 .

[22] جون فولي (8 أبريل 2011). "تقرير ينتقد شبكة أبحاث السرطان التي تعاني من مشاكل عديدة" . أسبوع المعلومات . تم الاطلاع عليه في 10 يونيو 2013 .

[23] أودواك غريس توماس (20 أبريل 2012). "المعهد الوطني للسرطان يعيد تنظيم جهود المعلوماتية المتعلقة بالسرطان؛ ويخفض بعض برامج caBIG، وينقل برامج أخرى إلى البرنامج الوطني للمعلوماتية المتعلقة بالسرطان" . مجلة المعلوماتية الحيوية . تم الاطلاع عليه في 25 أبريل 2012 .

[24] جورج أ. كوماتسوليس. "إعلان البرنامج" . المعهد الوطني للسرطان. مؤرشف من الأصل في 30 يوليو 2012. تم الاطلاع عليه في 10 يونيو 2013 .

[25] هارولد فارموس. "حول البرنامج الوطني للوقاية من السرطان" . المعهد الوطني للسرطان. مؤرشف من الأصل في 6 أغسطس 2013. تم الاطلاع عليه في 9 سبتمبر 2013 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

اللغة	العربية (RTL)
روابط موسوعية	30 رابطاً
المصدر الأصلي	ويكيبيديا ↗