أطلس جينوم السرطان

📅 آخر تحديث: ٣١ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٣١ يوليو ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

مشروع أطلس جينوم السرطان ( TCGA ) هو مشروع يهدف إلى فهرسة التغيرات الجينية المسؤولة عن السرطان باستخدام تقنيات تسلسل الجينوم والمعلوماتية الحيوية . [ 1 ] [ 2 ] ويتمثل الهدف الرئيسي في تطبيق تقنيات تحليل الجينوم عالية الإنتاجية لتحسين القدرة على تشخيص السرطان وعلاجه والوقاية منه من خلال فهم أفضل للأساس الجيني للمرض.

أُشرف على مشروع TCGA مركز علم جينوم السرطان التابع للمعهد الوطني للسرطان والمعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري ، بتمويل من الحكومة الأمريكية. ركز مشروع تجريبي مدته ثلاث سنوات، بدأ عام 2006، على توصيف ثلاثة أنواع من السرطانات البشرية: الورم الأرومي الدبقي متعدد الأشكال ، وسرطان الخلايا الحرشفية في الرئة ، وسرطان المبيض الغدي المصلي . [ 3 ] في عام 2009، توسع المشروع إلى المرحلة الثانية، التي كان من المخطط لها إكمال التوصيف الجينومي وتحليل التسلسل لما بين 20 و25 نوعًا مختلفًا من الأورام بحلول عام 2014. في نهاية المطاف، تجاوز مشروع TCGA هذا الهدف، حيث قام بتوصيف 33 نوعًا من السرطان، بما في ذلك 10 أنواع نادرة. [ 4 ] [ 5 ]

بدأ المشروع بجمع وتوصيف 500 عينة من المرضى، وهو عدد يفوق معظم الدراسات الجينومية في ذلك الوقت، واستخدم تقنيات جزيئية متنوعة. شملت هذه التقنيات تحليل التعبير الجيني ، وتحليل تباين عدد النسخ ، وتحديد النمط الجيني للنيوكليوتيدات المفردة المتغيرة ، وتحليل مثيلة الحمض النووي على مستوى الجينوم، وتحليل الحمض النووي الريبوزي الميكروي ، وتسلسل الإكسونات . ونظرًا لمحدودية التقنيات الناشئة والتكاليف في بداية المشروع، تم استخدام العديد من التقنيات القائمة على المصفوفات وتسلسل الجينات المستهدفة بشكل محدود. خلال المرحلة الثانية، تمكن مشروع TCGA من البدء في إجراء تسلسل الإكسوم الكامل وتسلسل النسخ الكامل لجميع الحالات، وتسلسل الجينوم الكامل لـ 10% من الحالات المستخدمة في المشروع.

الأهداف

كان هدف المشروع التجريبي لمشروع TCGA هو إنشاء بنية تحتية لجمع 500 عينة من السرطان، وتوصيفها جزيئيًا، وتحليلها، بالإضافة إلى عينات ضابطة مطابقة. تطلّب هذا العمل تعاونًا مكثفًا بين فريق من العلماء من مؤسسات مختلفة، وتقييم العديد من التقنيات الحديثة عالية الإنتاجية. لم يقتصر هدف TCGA على توليد بيانات جينومية عالية الجودة وذات دلالة بيولوجية فحسب، بل شمل أيضًا إتاحة هذه البيانات مجانًا لمجتمع أبحاث السرطان. [ 6 ]

تم خلال المرحلة التجريبية دراسة ثلاثة أنواع من الأورام، وهي: الورم الأرومي الدبقي متعدد الأشكال (GBM)، وسرطان المبيض الغدي المصلي عالي الدرجة، وسرطان الرئة الحرشفية. وبعد نجاح المرحلة التجريبية، وسّع مشروع TCGA نطاق جهوده لتوصيف أنواع إضافية من السرطان وتوفير مجموعة بيانات جينومية غنية وكبيرة لمزيد من الاكتشافات البحثية في مجال السرطان.

إدارة

أُدير مشروع TCGA بشكل مشترك من قبل علماء ومديرين من المعهد الوطني للسرطان (NCI) والمعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري (NHGRI). ومع توسع مشروع TCGA من المرحلة التجريبية إلى المرحلة الثانية في أكتوبر 2009، أنشأ المعهد الوطني للسرطان مكتبًا خاصًا ببرنامج TCGA للمساعدة في إدارة المشروع. ويتولى جان كلود زينكلوسن إدارة هذا المكتب منذ أغسطس 2013.

كان مكتب برنامج TCGA مسؤولاً عن تشغيل ستة مراكز لتوصيف الجينوم، وسبعة مراكز لتحليل الجينوم، ووحدة الموارد الأساسية للعينات البيولوجية، ومركز تنسيق البيانات، بالإضافة إلى ما يقارب ثلث عمليات التسلسل التي أُجريت للمشروع بواسطة مراكز تسلسل الجينوم الثلاثة. [ 7 ] علاوة على ذلك، كان مكتب مشروع TCGA مسؤولاً عن تنسيق جمع الأنسجة لمشروع TCGA. وقد أشرفت كارولين هوتر، مديرة المشروع في المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري (NHGRI)، على ثلثي عمليات التسلسل في مراكز تسلسل الجينوم.

تألفت اللجنة التوجيهية من أعضاء من فريقي المعهد الوطني للسرطان والمعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري، بالإضافة إلى الباحثين الرئيسيين الممولين من المشروع. وكُلفت اللجنة التوجيهية بالإشراف على الصلاحية العلمية للمشروع، بينما حرص الفريق الإداري للمعهد الوطني للسرطان/المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري على ضمان تحقيق التقدم العلمي وأهداف المشروع، وإنجازه في الوقت المحدد وفي حدود الميزانية المخصصة، وتكامل مختلف مكوناته.

تراكم الأنسجة

تفاوتت متطلبات الأنسجة باختلاف أنواع الأنسجة وأنواع السرطان. وقد ساهم خبراء الأمراض من فرق العمل المعنية بالأمراض في المشروع في تحديد خصائص عينات الأنسجة النموذجية التي تُجمع كـ"معيار رعاية" في الولايات المتحدة، وكيفية استفادة مشروع TCGA من هذه الأنسجة على النحو الأمثل. فعلى سبيل المثال، قرر فريق العمل المعني بأمراض الدماغ أن العينات التي تحتوي على أكثر من 50% من النخر غير مناسبة لمشروع TCGA، وأن 80% من نوى الخلايا السرطانية مطلوبة في الجزء الحيوي من الورم. واتبع مشروع TCGA بعض الإرشادات العامة كنقطة انطلاق لجمع العينات من أي نوع من الأورام، بما في ذلك حد أدنى للحجم يبلغ 200 ملغ ، ونسبة لا تقل عن 80% من نوى الخلايا السرطانية، ومصدر مطابق للحمض النووي الجرثومي (مثل الدم أو الحمض النووي النقي ). [ 8 ] إضافةً إلى ذلك، كان على المؤسسات التي تُرسل الأنسجة إلى مشروع TCGA تضمين مجموعة بيانات سريرية أساسية كما حددها فريق العمل المعني بالأمراض، وموافقات موقعة معتمدة من قبل لجنة المراجعة المؤسسية التابعة لمؤسستها، فضلاً عن اتفاقية نقل المواد مع مشروع TCGA. 

في عام ٢٠٠٩، سحب المعهد الوطني للسرطان (NCI) ما يقارب ١٣٠ مليون دولار من مخصصات قانون الإنعاش وإعادة الاستثمار الأمريكي (ARRA) من "العقد الرئيسي" المبرم بين المعهد وشركة ساينس أبليكيشنز إنترناشونال (SAIC) لتمويل تجميع الأنسجة ومجموعة متنوعة من الأنشطة الأخرى من خلال مكتب الاستحواذ التابع للمعهد. وتم تخصيص ٤٢ مليون دولار لتجميع الأنسجة من خلال المعهد باستخدام "طلبات عروض الأسعار" (RFQs) و"طلبات تقديم العروض" (RFPs) لإصدار أوامر الشراء والعقود، على التوالي. استُخدمت طلبات عروض الأسعار بشكل أساسي لجمع العينات بأثر رجعي من بنوك الأنسجة القائمة، بينما استُخدمت طلبات تقديم العروض لجمع العينات بشكل استباقي. أنهى مشروع أطلس جينوم السرطان (TCGA) عملية جمع العينات في ديسمبر ٢٠١٣، حيث بلغ عدد العينات ما يقارب ٢٠,٠٠٠ عينة بيولوجية. [ ٩ ]

حصلت المؤسسات التي ساهمت بعينات في مشروع TCGA على مقابل مادي، كما حصلت على حق الوصول المسبق إلى البيانات الجزيئية المُستخلصة من عيناتهم، مع الحفاظ على الربط بين المعرّف الفريد الخاص بمشروع TCGA ومعرّفها الفريد. وقد مكّن هذا المؤسسات المساهمة من ربط بياناتها بالبيانات السريرية لعيناتها، والدخول في تعاون مع مؤسسات أخرى لديها بيانات مماثلة عن عينات TCGA، مما زاد من فعالية تحليل النتائج.

منظمة

أدار مشروع TCGA عددًا من المراكز المختلفة التي مُوّلت لإنتاج البيانات وتحليلها. وكان TCGA أول مشروع جينومي واسع النطاق يُموّله المعهد الوطني للصحة (NIH) ويتضمن موارد كبيرة للاكتشافات المعلوماتية الحيوية. وقد خصص المعهد الوطني للسرطان (NCI) 50% من مخصصات TCGA، أي ما يقارب 12 مليون دولار أمريكي سنويًا، لتمويل هذه الاكتشافات. أنتجت مراكز توصيف الجينوم ومراكز تسلسل الجينوم البيانات، بينما استخدم مركزان منفصلان لتحليل بيانات الجينوم هذه البيانات في الاكتشافات المعلوماتية الحيوية. ومُوّل مركزان لعزل الجزيئات الحيوية من عينات المرضى، بينما مُوّل مركز واحد لتخزين البيانات. وقد تطورت آلية العمل هذه على مر السنين، وتُعرف الآن باسم "خط أنابيب توصيف الجينوم" التابع للمعهد الوطني للسرطان. [ 10 ]

مورد أساسي للعينات البيولوجية

كان مركز موارد العينات البيولوجية (BCR) مسؤولاً عن التحقق من جودة وكمية الأنسجة المُرسلة من مواقع مصادر الأنسجة، وعزل الحمض النووي (DNA) والحمض النووي الريبوزي (RNA) من العينات، وإجراء مراقبة الجودة لهذه الجزيئات الحيوية، وشحن العينات المُعالجة إلى مراكز علوم الجينوم (GSCs) ومراكز علوم الجينوم العالمية (GCCs). مُنح الاتحاد الدولي لعلم الجينوم عقد إنشاء مركز موارد العينات البيولوجية للمشروع التجريبي. كان هناك مركزان لموارد العينات البيولوجية ممولين من قِبل المعهد الوطني للسرطان (NCI) في بداية المشروع الكامل: مستشفى نيشن وايد للأطفال والاتحاد الدولي لعلم الجينوم. أُعيد طرح مركزي موارد العينات البيولوجية للمنافسة في عام 2010، ومُنح العقد لمستشفى نيشن وايد للأطفال. [ 11 ]

مراكز تسلسل الجينوم

تم تمويل ثلاثة مراكز لتسلسل الجينوم (GCCs) بشكل مشترك من قبل المعهد الوطني للسرطان (NCI) والمعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري (NHGRI): معهد برود ، ومعهد ماكدونيل للجينوم في جامعة واشنطن، وكلية بايلور للطب . وقد تحولت جميع هذه المراكز الثلاثة من تسلسل سانجر إلى تسلسل الجيل التالي (NGS). وتم اختبار وتطبيق مجموعة متنوعة من تقنيات NGS في آن واحد.

مراكز توصيف الجينوم

قام المعهد الوطني للسرطان بتمويل سبعة مراكز لتوصيف الجينوم: معهد برود، وجامعة هارفارد، وجامعة نورث كارولينا، ومركز إم دي أندرسون للسرطان ، ومعهد فان أنديل، وكلية بايلور للطب، ومركز السرطان في كولومبيا البريطانية.

مركز تنسيق البيانات

كان مركز تنسيق البيانات (DCC) المستودع المركزي لبيانات مشروع أطلس جينوم السرطان (TCGA). كما كان مسؤولاً عن مراقبة جودة البيانات المُدخلة إلى قاعدة بيانات TCGA. وتولى المركز أيضاً إدارة بوابة بيانات TCGA، حيث كان بإمكان المستخدمين الوصول إلى بيانات TCGA المُعالجة. أُنجز هذا العمل بموجب عقد من قِبل علماء ومطوري المعلوماتية الحيوية من شركة SRA International . مع ذلك، لم يستضيف مركز تنسيق البيانات بيانات التسلسل الخام. أما مركز جينوم السرطان التابع للمعهد الوطني للسرطان (CGHub) فكان المستودع الآمن لتخزين وفهرسة والوصول إلى البيانات المتعلقة بالتسلسل. أُنجز هذا العمل من قِبل علماء وموظفين في معهد الجينوم بجامعة كاليفورنيا، سانتا كروز . ومنذ عام 2017، نُقلت جميع أنواع البيانات إلى مركز بيانات الجينوم التابع للمعهد الوطني للسرطان. [ 12 ]

مراكز تحليل بيانات الجينوم

تولت سبعة مراكز لتحليل بيانات الجينوم (GDACs)، ممولة من المعهد الوطني للسرطان/المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري، مسؤولية دمج البيانات من جميع مراكز توصيف وتسلسل الجينوم، بالإضافة إلى التفسير البيولوجي لبيانات مشروع أطلس جينوم السرطان (TCGA). وشملت هذه المراكز: معهد برود، وجامعة نورث كارولينا، وجامعة أوريغون للصحة والعلوم، وجامعة كاليفورنيا في سانتا كروز، ومركز إم دي أندرسون للسرطان، ومركز ميموريال سلون كيترينج للسرطان ، ومعهد بيولوجيا الأنظمة . وقد تعاونت هذه المراكز السبعة جميعها لتطوير آلية متكاملة لتحليل البيانات.

أنواع السرطان المختارة للدراسة

تم إعداد قائمة أولية بالأورام التي سيدرسها مشروع TCGA من خلال تجميع إحصاءات الإصابة والبقاء على قيد الحياة من موقع SEER لإحصاءات السرطان. بالإضافة إلى ذلك، روعي "المعيار العلاجي" الحالي في الولايات المتحدة عند اختيار أكثر 25 نوعًا من الأورام شيوعًا، حيث كان مشروع TCGA يستهدف أنواع الأورام التي يُعد فيها الاستئصال الجراحي قبل العلاج المساعد هو المعيار العلاجي. كما لعب توفر العينات دورًا حاسمًا في تحديد أنواع الأورام التي ستُدرس وترتيب بدء مشاريع الأورام؛ فكلما كان نوع السرطان أكثر شيوعًا، زادت احتمالية جمع العينات بسرعة للدراسة. ونتيجة لذلك، أصبحت أنواع الأورام الشائعة، مثل سرطان القولون والرئة والثدي، أول أنواع الأورام التي أُدرجت في المشروع، قبل أنواع الأورام النادرة.

شملت أنواع السرطان التي اختارها مشروع TCGA للدراسة ما يلي: سرطان الخلايا الحرشفية في الرئة ، وسرطان الخلايا الحليمية في الكلى ، وسرطان الخلايا الصافية في الكلى ، وسرطان القنوات في الثدي ، وسرطان الخلايا الكلوية ، وسرطان عنق الرحم (الحرشفي)، وسرطان القولون الغدي ، وسرطان المعدة الغدي ، وسرطان المستقيم ، وسرطان الخلايا الكبدية ، وسرطان الخلايا الحرشفية في الرأس والرقبة (الفم) ، وسرطان الغدة الدرقية ، وسرطان الخلايا البولية في المثانة (غير الحليمي )، وسرطان بطانة الرحم، وسرطان القنوات البنكرياسية الغدي ، وسرطان الدم النخاعي الحاد ، وسرطان البروستاتا الغدي ، وسرطان الرئة الغدي ، وسرطان الجلد الميلانيني ، وسرطان فصيصات الثدي والورم الدبقي منخفض الدرجة ، وسرطان المريء ، وسرطان المبيض الغدي الكيسي المصلي ، وسرطان الخلايا الحرشفية في الرئة . ، سرطان قشرة الكظر ، سرطان الغدد الليمفاوية الكبيرة المنتشرة من النوع B ، ورم الخلايا شبه العقدية وورم القواتم ، سرطان الأقنية الصفراوية ، سرطان الرحم المختلط ، ورم الميلانوما العنبية ، ورم الغدة الزعترية ، ساركوما ، ورم المتوسطة ، وسرطان الخلايا الجرثومية الخصوية.

بدأ مشروع TCGA بجمع عينات لجميع أنواع الأورام هذه في آنٍ واحد. أُدخلت أنواع الأورام التي جُمعت منها أكبر عدد من العينات في مسار توصيفها أولًا. أما أنواع الأورام النادرة، التي كان جمع عينات منها أكثر صعوبة، وأنواع الأورام التي لم يتمكن مشروع TCGA من تحديد مصدر لعينات عالية الجودة لها، فقد أُدخلت في مسار إنتاج مشروع TCGA في السنة الثانية من المشروع. وقد أتاح ذلك لمكتب برنامج TCGA وقتًا إضافيًا لجمع عينات كافية للمشروع.

تم تطوير مشروع أطلس جينوم السرطان (TCGA) وأطلس تكوين الخلايا في الفئران (MOCA) باستخدام تقنيات التعلم الآلي والتعلم العميق لمقارنة الخلايا السرطانية والخلايا الجنينية في مراحل التطور والتمايز الخلوي المبكرة، وإيجاد علاقة بينهما . كما تم تطبيقهما لتمييز التغيرات في أنماط التعبير الجيني بين أنواع مختلفة من الأورام ذات المصدر غير المعروف. [ 13 ]

منشورات TCGA

التقدم المحرز حتى 15 أكتوبر 2018
نوع السرطان الذي تمت دراستهأخير

الرقم الذي تم تحليله في ورقة التحديد الأصلية

نتائج تحليل TCGA
الورم الأرومي الدبقي متعدد الأشكال206يتم تعريف الأنواع الفرعية لورم الأرومة الدبقية متعددة الأشكال الكلاسيكية، والمتوسطية، والعصبية الأولية بواسطة طفرات EGFR و NF1 و PDGFRA / IDH1 على التوالي؛ [ 14 ] أكثر من 40% من الأورام بها طفرات في جينات تعديل الكروماتين؛ [ 15 ] تشمل الجينات الأخرى التي تطرأ عليها طفرات بشكل متكرر TP53 و PlK3R1 و PIK3CA و IDH1 و PTEN و RB1 و LZTR1 [ 16 ]
ورم دبقي منخفض الدرجة293تم تحديد ثلاثة أنواع فرعية مرتبطة بنتائج المرضى: طفرة IDH1 مع حذف 1p/19q، وطفرة IDH بدون حذف 1p/19q، ونمط IDH البري؛ نمط IDH البري مشابه جينوميًا لورم الأرومة الدبقية [ 17 ].
سرطان فصيصي في الثدي203سرطان الفصيصات يختلف عن سرطان القنوات؛ FOXA1 مرتفع في سرطان الفصيصات، GATA3 مرتفع في سرطان القنوات؛ سرطان الفصيصات غني بفقدان PTEN وتفعيل Akt [ 18 ] [ 19 ]
سرطان القنوات الثديية784أربعة أنواع فرعية جينومية متميزة: القاعدي، Her2، اللمعي A، اللمعي B؛ الطفرات المحركة الأكثر شيوعًا TP53 ، PIK3CA ، GATA3 ؛ النوع الفرعي القاعدي مشابه لسرطان المبيض المصلي [ 18 ]
سرطان غدي في القولون والمستقيم276تتشابه سرطانات القولون والمستقيم في خصائصها الجينية؛ ويوجد النمط الفرعي شديد التحور (16% من العينات) في الغالب في القولون الأيمن ويرتبط بتوقعات جيدة؛ ومن العوامل المحركة المحتملة الجديدة: ARlD1A و SOX9 و FAM123B / WTX ؛ والإفراط في التعبير عن: ERBB2 و IGF2 ؛ والطفرات في مسار WNT [ 20 ].
سرطان غدي في المعدة295تم تحديد أربعة أنواع فرعية: EBV يتميز بعدوى فيروس إبشتاين-بار، MSI (عدم استقرار الميكروساتلايت) يتميز بالطفرات المفرطة، GS يتميز بالاستقرار الجينومي، CIN يتميز بعدم استقرار الكروموسومات؛ CIN غني بالطفرات في التيروزين كيناز [ 21 ].
سرطان المريء164تختلف الخلايا الحرشفية والسرطان الغدي على المستوى الجزيئي؛ كانت سرطانات الخلايا الحرشفية مشابهة لسرطانات الخلايا الحرشفية في الرأس والرقبة، وكان لديها تضخيم متكرر لـ CCND1 و SOX2 و TP63؛ كانت السرطانات الغدية مشابهة لسرطان المعدة الغدي غير المستقر كروموسوميًا، وكان لديها تضخيم متكرر في ERBB2 و VEGFA و GATA4 و GATA6 [ 22 ].
سرطان غدي كيسي مصلي مبيضي489حدثت طفرات في TP53 في 96٪ من الحالات التي تمت دراستها؛ [ 23 ] وحدثت طفرات في BRCA1 و BRCA2 في 21٪ من الحالات وارتبطت بنتائج أكثر ملاءمة [ 24 ].
سرطان بطانة الرحم373تم تصنيف سرطانات بطانة الرحم إلى أربع فئات: POLE فائقة التحور، MSI (عدم استقرار الميكروساتلايت) مفرط التحور، عدد النسخ منخفض، وعدد النسخ مرتفع؛ كانت سرطانات الرحم المصلية مشابهة لسرطانات المبيض المصلية وسرطانات الثدي القاعدية ولها تشخيصات أقل مواتاة من سرطانات بطانة الرحم [ 25 ].
سرطان الخلايا الحرشفية في عنق الرحم وسرطان الغدد228تحديد سرطانات عنق الرحم السلبية لفيروس الورم الحليمي البشري، الشبيهة ببطانة الرحم مع طفرات في جينات KRAS و ARID1A و PTEN ؛ تضخيم جينات نقطة التفتيش المناعية CD274 و PDCD1LG2 ؛ تغييرات في الجينات بما في ذلك MED1 و ERBB3 و CASP8 و HLA-A و TGFBR2 والاندماجات التي تشمل lncRNA BCAR4 ؛ ما يقرب من ثلاثة أرباع العينات لديها تغييرات في واحد أو كل من مسارات إشارات PI3K/MAPK و TGF-beta [ 26 ] .
سرطان الخلايا الحرشفية في الرأس والرقبة279تم تحديد السمات الجينومية للسرطانات المرتبطة بفيروس الورم الحليمي البشري والتدخين: السرطانات الإيجابية لفيروس الورم الحليمي البشري تتميز بتقصير أو حذف TRAF3 ، والسرطانات السلبية لفيروس الورم الحليمي البشري تتميز بالتضخيم المشترك لـ 11q13 و 11q22، والسرطانات المرتبطة بالتدخين تتميز بطفرات TP53 ، وتعطيل CDKN2A ، وتغيرات في عدد النسخ [ 27 ].
سرطان الغدة الدرقية496معظمها مدفوع بطفرات RAS أو BRAFV600E؛ الأورام التي تحركها هذه الطفرات متميزة [ 28 ]
ابيضاض الدم النخاعي الحاد200انخفاض عبء الطفرات، مع 13 طفرة ترميزية فقط في المتوسط ​​لكل ورم؛ تم تصنيف أحداث المحرك إلى تسع فئات بما في ذلك اندماجات عامل النسخ، وطفرات معدل الهيستون، وطفرات الجسيم الرابط وغيرها [ 29 ].
الورم الميلانيني الجلدي331تم تحديد أربعة أنواع فرعية: طفرة BRAF ، وطفرة RAS ، وطفرة NF1 ، والنوع البري الثلاثي بناءً على الطفرات المحركة؛ ترتبط المستويات الأعلى من ارتشاح الخلايا الليمفاوية المناعية بتحسن بقاء المريض على قيد الحياة [ 30 ].
سرطان غدي رئوي230عبء طفرات مرتفع؛ 76% من الأورام أظهرت تنشيط مسارات مستقبلات التيروزين كيناز [ 31 ]
سرطان الخلايا الحرشفية في الرئة178ارتفاع متوسط ​​عدد الطفرات واختلالات عدد النسخ؛ مثل سرطان الغدد الكيسية المصلية المبيضية، تحتوي جميع سرطانات الخلايا الحرشفية الرئوية تقريبًا على طفرة في TP53 ؛ تحتوي العديد من الأورام على طفرات معطلة في HLA-A والتي قد تساعد السرطان على تجنب الكشف المناعي [ 32 ].
سرطان الخلايا الكلوية الصافية446تشمل الجينات المتحولة الشائعة VHL المشاركة في استشعار الأكسجين، وSED2 المشاركة في التعديلات اللاجينية التي تؤدي إلى نقص الميثيل العالمي، وجينات مسار PI3K/AKT/mTOR؛ يرتبط التحول الأيضي المشابه لـ "تأثير واربورغ" بتشخيص سيئ [ 33 ].
سرطان حليمي كلوي16181% من أورام النوع 1 تحتوي على تغيير في MET؛ كانت الملفات الجينية لأورام النوع 2 غير متجانسة، مع تغييرات في CDKN2A أو SETD2 أو TFE3 أو زيادة في التعبير عن مسار NRF2-ARE؛ ارتبط فقدان التعبير عن CDKN2A ونمط مثيلة جزر CpG بنتائج سيئة [ 34 ].
سرطان المثانة الظهاري الغازي131يرتبط التدخين بزيادة المخاطر؛ وتشمل الجينات المتحولة بشكل متكرر TP53، الذي تم تعطيله في 76٪ من الأورام و ERBB2 (HER2)، وهي جينات في مسارات مستقبلات التيروزين كيناز (RTK)/RAS التي تغيرت في 44٪ من الأورام؛ [ 35 ]
سرطان غدي في البروستاتا333غير متجانس للغاية مع 26٪ من العينات مدفوعة بتغيرات جزيئية غير معروفة؛ 7 أنواع فرعية محددة من خلال اندماجات جين عامل النسخ ETS أو الطفرات في SPOP أو FOXA1 أو IDH1 ؛ آفات قابلة للتنفيذ في مسارات PI3K و MAPK وإصلاح الحمض النووي [ 36 ].
سرطان الخلايا الكلوية الكروموفوبية66عبء طفرات منخفض للغاية؛ ينشأ السرطان من مناطق أبعد من الكلية مقارنة بسرطان الخلايا الصافية، الذي ينشأ في المقام الأول من المناطق القريبة؛ تحول أيضي متميز عن تحول "تأثير واربورغ" الملاحظ في سرطان الخلايا الصافية؛ تم تحوير جينات كابتة الورم TP53 و PTEN بشكل متكرر؛ تم تغيير محفز جين TERT بشكل متكرر [ 37 ]
سرطان قشرة الكظر91كان الإفراط في التعبير عن IGF2 والطفرات في TP53 و PRKAR1A وجينات أخرى وتغيرات عدد النسخ من السمات المميزة الشائعة؛ وقد يكون نقص الصبغيات متبوعًا بمضاعفة الجينوم الكامل آلية دافعة لتطور الورم [ 38 ].
ورم الخلايا شبه العقدية وورم القواتم173أربعة أنواع فرعية متميزة: Wnt-altered، والاختلاط القشري، ونقص الأكسجة الكاذب، وإشارات الكيناز؛ يحدد جين الاندماج MAML3 والطفرة الجسدية CSDE1 ويقودان التشخيص السيئ، النوع الفرعي Wnt-altered [ 39 ].
سرطان الأقنية الصفراوية38انخفاض التعبير عن جينات CDKN2 وBAP1 وARID1 وزيادة التعبير عن جينات FGFR2 وIDH1/2؛ أربعة أنواع فرعية، يتميز أحدها بتغيرات في IDH، وإسكات ARID1A، وانخفاض التعبير عن معدلات الكروماتين الأخرى، وارتفاع التعبير عن جينات الميتوكوندريا؛ ونوع فرعي آخر يتميز بطفرات BAP1 واندماجات جين FGFR2؛ قد يوجد السرطان على طيف متصل مع مجموعة فرعية من سرطانات الكبد مع طفرات IDH أو FGFR [ 40 ].
سرطان الخلايا الكبدية363تم تحديد طفرات محفز TERT في 44٪ من الأورام، وترتبط بزيادة استطالة التيلوميرات وإسكات CDKN2A؛ TP53 عادة ما يكون متحورًا أو منخفض التعبير؛ CTNNBB1 متحورًا بشكل كبير؛ العديد من الأورام ذات مستويات عالية من ارتشاح الخلايا الليمفاوية أو التعبير المفرط عن جينات نقاط التفتيش المناعية CTLA4 و PD-1 و PD-L1 [ 41 ].
سرطان غدي في القناة البنكرياسية150تم استخدام التسلسل العميق والمستهدف لتحليل الخلايا الورمية المنخفضة بشكل أفضل؛ طفرات KRAS موجودة في 93٪ من الأورام؛ طفرات في RREB1 أو أعضاء آخرين من مسار إشارات RAS-MAPK [ 42 ].
سرطانة ساركومية رحمية57تم تحديد درجة قوية ومتنوعة من التحول الظهاري-اللحمي؛ طفرات TP53 موجودة في 91٪ من العينات؛ تغييرات في PI3K موجودة في نصف العينات [ 43 ].
ورم ميلانيني عنبي80طفرات معقدة في BAP1؛ تم تحديد تقسيمات فرعية متميزة من النمط الصبغي 3 (D3) والنمط الصبغي 3 (M3)؛ في M3، فإن طفرات EIF1AX وSRSF2/SF3B1 الحصرية المتبادلة لها أنماط مثيلة وتوقعات متميزة [ 44 ].
ورم الغدة الزعترية117تم العثور على أربعة أنواع فرعية جزيئية رئيسية تتوافق مع الأنواع الفرعية النسيجية المرضية المعروفة B وTC وAB ومزيج من A وAB؛ عبء طفرات منخفض؛ لوحظ إثراء HRAS و NRAS و TP53 وطفرات GTF2I المتكررة ؛ يرتبط التعبير عن أهداف المناعة الذاتية واختلال الصيغة الصبغية بالورم التوتي بالوهن العضلي الشديد. [ 45 ]
ساركوما206تُعدّ الجينات TP53 وATRX وRB1 من بين الجينات القليلة التي تتكرر طفراتها عبر أنواع الساركوما المختلفة؛ وتحدث تغيرات في عدد النسخ بشكل متكرر في الساركوما ذات النمط النووي المعقد، مما يؤثر على دورة الخلية p53 وRB1 ومسارات أخرى؛ وتُظهر الساركوما الزلالية اندماجات في SSX1 أو SSX2 وTERT؛ وبالنسبة للساركوما الشحمية غير المتمايزة، يرتبط تضخيم JUN بانخفاض معدل البقاء على قيد الحياة؛ ويتغير مسار PI3K-AKT-mTOR في الساركوما العضلية الملساء؛ وقد تكون الساركوما متعددة الأشكال غير المتمايزة والساركوما الليفية المخاطية مدفوعة بتغيرات في مسار Hippo [ 46 ].
ورم الظهارة المتوسطة74تم تحديد نمط فرعي جينومي جديد يمثل حوالي 3% من العينات، ويتميز بطفرات في جيني TP53 وSETDB1 وفقدان نسخة واحدة من جميع الكروموسومات تقريبًا (وهو ما أطلق عليه الباحثون اسم "شبه أحادية الصيغة الصبغية" الجينومية)؛ كما وُجدت تغيرات في جين BAP1 في أكثر من نصف الحالات المدروسة، وقد تؤثر على نشاط عامل النسخ والإشارات المناعية؛ وتم التعبير بقوة عن جين نقطة التفتيش المناعية VISTA في ورم الظهارة المتوسطة الظهاري. [ 47 ]
سرطان الخلايا الجرثومية الخصوية137تتميز الأنماط النسيجية الرئيسية للمرض (الورم المنوي، والسرطان الجنيني، وكيس المح، والورم المسخي) بأنماط جزيئية مميزة؛ إذ أظهرت جميع الأنماط النسيجية اختلالًا واسع النطاق في عدد الكروموسومات وانخفاضًا في معدل الطفرات، ولكن بأنماط مميزة من مثيلة الحمض النووي وتعبير الحمض النووي الريبوزي الميكروي؛ وتُعرَّف مجموعة فرعية من الأورام المنوية النقية بطفرات في جين KIT ، وملامح مميزة لمثيلة الحمض النووي والتسلل المناعي، وانخفاض عدد نسخ جين KRAS . وتوجد طفرات جسدية مهمة فقط في الأورام التي تحتوي على مكونات الورم المنوي. [ 48 ]

الورم الأرومي الدبقي متعدد الأشكال

في عام ٢٠٠٨، نشر مشروع أطلس جينوم السرطان (TCGA) نتائجه الأولى حول ورم الأرومة الدبقية متعددة الأشكال (GBM) في مجلة Nature . [ ٤٩ ] وقد وصفت هذه النتائج الأولية ٩١ زوجًا متطابقًا من الأورام والأنسجة الطبيعية، وحللتها. وبينما جُمعت ٥٨٧ عينة بيولوجية للدراسة، رُفض معظمها خلال عملية مراقبة الجودة: إذ كان من الضروري أن تحتوي عينات الورم على ٨٠٪ على الأقل من نوى الخلايا الورمية، وألا تتجاوز نسبة النخر ٥٠٪، وأن يؤكد تقييمٌ ثانٍ لعلم الأمراض دقة التشخيص الأصلي لورم الأرومة الدبقية متعددة الأشكال. كما استُبعدت دفعة أخيرة من العينات لأن الحمض النووي (DNA) أو الحمض النووي الريبوزي (RNA) المُستخلص لم يكن بجودة أو كمية كافية لتحليله بواسطة جميع المنصات المختلفة المستخدمة في الدراسة.

أُتيحت جميع بيانات هذه الدراسة، بالإضافة إلى البيانات التي جُمعت منذ نشرها، للجمهور في مركز تنسيق البيانات التابع لمشروع أطلس جينوم السرطان (TCGA) (نُقلت لاحقًا إلى مركز بيانات الجينوم). [ 50 ] معظم بيانات TCGA المُعالجة متاحة للجميع بشكل كامل. أما بالنسبة للبيانات التي قد تُساعد في تحديد هوية مرضى مُعينين، فيتقدم المستخدمون بطلب للحصول على إذن وصول مُقيد إلى لجنة الوصول إلى البيانات (DAC)، التي تُقيّم ما إذا كان المستخدم النهائي باحثًا مُعتمدًا ويطرح سؤالًا علميًا مشروعًا يستحق الوصول إلى البيانات على مستوى الأفراد. [ 51 ] تُدار بيانات اعتماد الوصول إلى البيانات حاليًا من خلال قاعدة بيانات dbGAP التابعة للمعاهد الوطنية للصحة (NIH) .

منذ نشر الورقة البحثية الأولى حول المؤشرات الجينية، قدمت عدة مجموعات تحليلية ضمن شبكة TCGA تحليلات أكثر تفصيلًا لبيانات الورم الأرومي الدبقي . وقد نجحت مجموعة تحليلية بقيادة الدكتور رويل فيرهاك، والدكتورة كاثرين أ. هودلي ، والدكتور د . نيل هايز ، في ربط أنماط التعبير الجيني في الورم الدبقي بالتشوهات الجينية. [ 52 ] كما حدد فريق تحليل بيانات مثيلة الحمض النووي ، بقيادة الدكتور هوتان نوشمير والدكتور بيتر ليرد، مجموعة فرعية مميزة من عينات الورم الدبقي تُظهر فرط مثيلة متناسق في عدد كبير من المواقع، مما يشير إلى وجود نمط ظاهري لمثيلة جزر CpG في الورم الدبقي ( G-CIMP ). تنتمي أورام G-CIMP إلى المجموعة الفرعية العصبية، وترتبط ارتباطًا وثيقًا بالطفرات الجسدية في جين IDH1 . [ 53 ] [ 54 ]

سرطان غدي مصلّي في المبيض

نشرت TCGA تقريرًا عن التعبير الجيني للـ mRNA، والتعبير الجيني للـ microRNA، ومثيلة المحفز، وعدد نسخ الحمض النووي، وتسلسل الإكسوم لـ 316 عينة ورمية من سرطان المبيض المصلي عالي الدرجة في مجلة Nature في يونيو 2011. [ 55 ] وجد الباحثون طفرات في جين TP53 في نسبة ساحقة بلغت 96% من الحالات التي تم تحليلها، وتم العثور على طفرات متكررة بتردد أقل في عدد قليل من الجينات الأخرى، بما في ذلك NF1 و BRCA1 و BRCA2 و RB1 و CDK12 .

تمكن باحثو مشروع TCGA أيضًا من تحديد أنماط التعبير الجيني المرتبطة ببقاء المرضى على قيد الحياة. وقد حددوا أربعة أنواع فرعية من السرطان وفقًا لأنماط التعبير الجيني ومثيلة الحمض النووي: المناعي، والمتمايز، والتكاثري، واللحمي المتوسط. كما حددوا 68 جينًا كأهداف دوائية محتملة.

سرطان القولون والمستقيم

نشر مشروع TCGA تقريرًا عن تسلسل الإكسوم، وعدد نسخ الحمض النووي، ومثيلة المحفز، وتوصيف الحمض النووي الريبوزي الرسول لـ 276 عينة ورمية من سرطانات القولون والمستقيم في مجلة Nature في يوليو 2012. [ 56 ] كما خضعت 97 عينة لتسلسل الجينوم الكامل بتغطية منخفضة للغاية.

اكتشف باحثو مشروع TCGA نفس نوع التغيرات في أورام القولون والمستقيم، مما يشير إلى أنها نوع واحد من السرطان. وقد ظهرت بعض الاختلافات، مثل فرط المثيلة، في الأورام التي تنشأ في القولون الأيمن. وتبين أن مجموعة فرعية من الأورام تعاني من طفرات مفرطة؛ كما أن معظمها يتميز بعدم استقرار عالٍ في الميكروساتلايت . وتم العثور على 24 جينًا متحولًا بشكل ملحوظ وتغيرات متكررة في عدد النسخ. وقد أشارت الدراسة إلى مؤشرات جديدة لسرطان القولون والمستقيم العدواني، ودور هام لتنشيط وتثبيط النسخ الموجه بواسطة جين MYC.

المرحلة الثانية: توسيع نطاق مشروع TCGA ليشمل 33 نوعًا من السرطان

بفضل قانون الإنعاش الاقتصادي الأمريكي لعام 2009، وسّعت المعاهد الوطنية للصحة نطاق مشروع أطلس جينوم السرطان (TCGA) ليشمل 20 نوعًا من السرطان. وشمل ذلك جهودًا لدراسة أنواع السرطان النادرة، والتي تحققت بدعم من المرضى وجماعات مناصرة المرضى والأطباء. وابتداءً من عام 2011، بدأ مشروع أطلس جينوم السرطان (TCGA) بعقد ندوات علمية سنوية لمناقشة وتبادل الاكتشافات البيولوجية الحديثة المتعلقة بالسرطان، والأساليب التحليلية، والنهج التطبيقية التي تستخدم البيانات.

في ديسمبر 2013، اختتم مشروع TCGA جمع العينات، بعد شحن ومعالجة أكثر من 20,000 عينة. ومع اكتمال المشروع، نشر TCGA أوراقًا بحثية مرجعية تصف خصائص وتحليلات أساسية تغطي 33 نوعًا من السرطان. وبالنسبة لبعض أنواع السرطان، مثل سرطان الخلايا البولية في المثانة وسرطان الدماغ الأرومي الدبقي، جُمعت حالات إضافية وأُجري تحليل ثانٍ.

تحليلات أطلس السرطان الشامل

في عام 2013، نشر مشروع أطلس جينوم السرطان (TCGA) تحليلًا أوليًا شاملًا للسرطانات، يصف "الخريطة الطفرية" التي تُعرَّف بأنها الطفرات المتكررة التي تم تحديدها من خلال تسلسل الإكسوم لـ 3281 ورمًا من 12 نوعًا فرعيًا شائعًا من السرطان. وشملت الأنواع الفرعية الاثنا عشر التي دُرست: سرطان غدي في الثدي ، وسرطان غدي في الرئة، وسرطان الخلايا الحرشفية في الرئة ، وسرطان بطانة الرحم ، والورم الأرومي الدبقي متعدد الأشكال ، وسرطان الخلايا الحرشفية في الرأس والرقبة ، وسرطان القولون ، وسرطان المستقيم، وسرطان المثانة ، وسرطان الخلايا الصافية في الكلى ، وسرطان المبيض ، وسرطان الدم النخاعي الحاد . [ 57 ]

في عام 2018، نشرت شبكة أبحاث TCGA ما يُعرف مجتمعًا باسم أطلس السرطان الشامل: وهو عبارة عن مجموعة من 35 ورقة بحثية تلخص العمل الذي أنجزته TCGA وتصف المواضيع الشاملة لبيولوجيا السرطان التي تم توضيحها من خلال تحليل جميع بيانات TCGA ككل.

المواضيع الرئيسية هي (1) أنماط أصل الخلية، والتي تقوم بتجميع وتحليل الأورام بناءً على النظام البيولوجي أو النمط النسيجي الفرعي؛ (2) العمليات المسببة للأورام، والتي تأخذ في الاعتبار التأثيرات المعقدة اللاحقة التي قد تحدثها التغييرات على المسارات الجزيئية والبيئة الدقيقة، و(3) مسارات الإشارات، والتي تستعرض الدور الذي تلعبه المسارات المختلفة في أنواع السرطان المختلفة ونقاط ضعفها المحتملة.

شكّل إنجاز مشروع أطلس السرطان الشامل نهايةً رسميةً لبرنامج TCGA، إلا أن البيانات وأساليب التحليل والموارد الأخرى التي أنتجها البرنامج لا تزال تُشكّل مرجعًا للباحثين. فعلى سبيل المثال، تم تحليل بيانات الجينوم الكامل لبرنامج TCGA كجزء من مشروع تحليل الجينومات الكاملة للسرطان الشامل (PCAWG)، وهو جهد دولي لتحليل 2600 جينوم كامل للسرطان لفهم الاختلافات الجسدية والوراثية في كلٍ من المناطق المشفرة وغير المشفرة.

سمةمنشور
أنماط منشأ الخليةأنماط أصل الخلية تهيمن على التصنيف الجزيئي لـ 10000 ورم من 33 نوعًا من السرطان (ورقة موجزة) [ 58 ]
التعلم الآلي يحدد سمات الخلايا الجذعية المرتبطة بالتحول السرطاني [ 59 ]
دراسة جزيئية شاملة لجميع أنواع السرطان لأورام الجهاز التناسلي الأنثوي وسرطانات الثدي [ 60 ]
التحليل الجزيئي المقارن للأورام الغدية المعدية المعوية [ 61 ]
السمات الجينومية، وشبكة المسارات، والمناعية التي تميز سرطان الخلايا الحرشفية [ 62 ]
أطلس جينوم السرطان: توصيف جزيئي شامل لسرطان الخلايا الكلوية [ 63 ]
العمليات السرطانيةمنظور حول العمليات المسببة للأورام في نهاية بداية علم جينوم السرطان (ورقة ملخصة) [ 64 ]
المتغيرات الجرثومية المسببة للأمراض في 10389 حالة سرطان لدى البالغين [ 65 ]
توصيف شامل للجينات والطفرات المحركة للسرطان [ 66 ]
اندماجات المحرك وآثارها في تطور وعلاج السرطانات البشرية [ 67 ]
المشهد المناعي للسرطان [ 68 ]
التنظيم المكاني والارتباط الجزيئي للخلايا الليمفاوية المتسللة إلى الورم باستخدام التعلم العميق على صور علم الأمراض [ 69 ]
الأساليب الجينومية والوظيفية لفهم اختلال الصيغة الصبغية للسرطان [ 70 ]
تحليل شامل لتعبير المعزز في ما يقرب من 9000 عينة من المرضى [ 71 ]
تحليل المشهد الجيني لـ lncRNA يحدد EPIC1 كـ lncRNA مسرطن يتفاعل مع MYC ويعزز تقدم دورة الخلية في السرطان [ 72 ].
تحليل شامل للسرطان لتنظيم الحمض النووي الريبي غير المشفر الطويل يدعم استهدافهم لجينات السرطان في كل سياق ورم [ 73 ].
التحليل المنهجي للطفرات التي تُنشئ مواقع الربط في السرطان [ 74 ]
نهج العلوم المفتوحة القابل للتطوير لتحديد الطفرات في إكسومات الأورام باستخدام خطوط أنابيب جينومية متعددة [ 75 ]
مورد بيانات سريرية متكاملة لسرطان TCGA لدفع تحليلات نتائج البقاء على قيد الحياة عالية الجودة [ 76 ]
تحليل شامل للتضفير البديل عبر الأورام من 8705 مريضًا [ 77 ]
مسارات الإشارةمسارات الإشارات السرطانية في أطلس جينوم السرطان (ورقة ملخصة) [ 78 ]
التغيرات الشاملة للسرطان في جين MYC الورمي وشبكته القريبة عبر أطلس جينوم السرطان [ 79 ]
يكشف التعلم الآلي عن تنشيط مسار Ras الشامل للسرطان في أطلس جينوم السرطان [ 80 ]
المشهد الجينومي والجزيئي لنقص إصلاح تلف الحمض النووي عبر أطلس جينوم السرطان [ 81 ]
التوصيف الجزيئي والأهمية السريرية لأنواع التعبير الأيضي الفرعية في السرطانات البشرية [ 82 ]
التحليل الجينومي المتكامل لمسار اليوبيكويتين عبر أنواع السرطان [ 83 ]
المشهد الطفري الجسدي لجينات عامل التضفير وعواقبها الوظيفية عبر 33 نوعًا من السرطان [ 84 ]
تحليل شامل للسرطان يكشف عن تغيرات جينية عالية التردد في وسائط الإشارات بواسطة عائلة TGF-β الفائقة [ 85 ]
توصيف جزيئي شامل لمسار إشارات Hippo في السرطان [ 86 ]

تحليل المناطق غير المشفرة

شرع باحثو مشروع أطلس جينوم السرطان (TCGA) في دراسة منهجية للمناطق غير المشفرة في جينوم أنواع متعددة من السرطانات. استخدم الفريق تقنية تحليل الكروماتين القابل للوصول بواسطة الترانسبيوزاز باستخدام التسلسل (ATAC-seq) على 410 عينة ورمية من مشروع TCGA، تغطي 23 نوعًا من السرطانات الأولية، بهدف فهم خلل تنظيم الجينات في السرطان. تُعدّ تقنية ATAC-seq طريقة منخفضة التكلفة لتحديد مناطق الكروماتين المفتوح أو النشط، ومواقع البروتينات الرابطة للحمض النووي.

باستخدام تقنية ATAC-seq، تمكن الباحثون من تحديد عشرات الآلاف من العناصر التنظيمية المحتملة للحمض النووي، والتي تختص بأنواع مختلفة من السرطانات والخلايا. وقد أتاح ذلك فهمًا أعمق لكيفية مساهمة خلل تنظيم الجينات في بدء السرطان وتطوره. كما ساهم فهم إمكانية وصول الكروماتين إلى العناصر التنظيمية المعروفة الخاصة بالخلايا المناعية في تقديم أدلة حول البيئة المناعية الدقيقة ومدى توافر أهداف العلاج المناعي. نُشرت الدراسة، بعنوان "مشهد الكروماتين في سرطانات الإنسان الأولية"، في عام 2018 في مجلة Science . [ 87 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ "الصفحة الرئيسية لأطلس جينوم السرطان" . المعهد الوطني للسرطان والمعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري . تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 أبريل 2009 .{{cite web}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
  2. ↑ معاهد الصحة الوطنية تطلق مشروع جينوم السرطان، صحيفة واشنطن بوست، 14 ديسمبر 2005
  3. ↑ دانييلا س. جيرهارد (27 مايو 2008). "مشروع أطلس جينوم السرطان يدفع علم الأورام الجزيئي إلى الأمام" . نشرة السرطان الصادرة عن المعهد الوطني للسرطان، تحديث المدير . المعهد الوطني للسرطان . مؤرشف من الأصل في 21 ديسمبر 2010. تم الاطلاع عليه في 27 أغسطس 2009 .
  4. ↑ "أنواع السرطان المختارة للدراسة" . أطلس جينوم السرطان - المعهد الوطني للسرطان . مؤرشف من الأصل في 27 فبراير 2011. تم الاطلاع عليه في 2 نوفمبر 2015 .
  5. ↑ "مشاريع توصيف الأورام النادرة" . أطلس جينوم السرطان - المعهد الوطني للسرطان . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2015-11-02 .{{cite web}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
  6. ↑ ماكليندون، ر.؛ فريدمان، آلان؛ بيغنر، داريل؛ فان مير، إروين ج.؛ برات، دانيال ج.؛ ماستروجياناكيس، جينا؛ أولسون، جيفري ج.؛ ميكلسن، توم؛ وآخرون . (23 أكتوبر 2008). "توصيف جينومي شامل يُحدد جينات الورم الأرومي الدبقي البشري ومساراته الأساسية" . مجلة نيتشر . 455 (7216): 1061-1068 . Bibcode : 2008Natur.455.1061M . doi : 10.1038/nature07385 . PMC 2671642. PMID 18772890 .   
  7. ↑ "الفائز بجائزة ساميز لعام 2015: جائزة اختيار الجمهور" . ميداليات الخدمة لأمريكا . مؤرشف من الأصل بتاريخ 16 مارس 2023. تم الاطلاع عليه بتاريخ 15 أكتوبر 2015 .
  8. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان (23 أكتوبر 2008). "توصيف جينومي شامل يُحدد جينات الورم الأرومي الدبقي البشري ومساراته الأساسية" . مجلة نيتشر . 455 (7216): 1061-1068 . Bibcode : 2008Natur.455.1061M . doi : 10.1038 / nature07385 . ISSN 0028-0836 . PMC 2671642. PMID 18772890 .   
  9. ↑ "التاريخ والجدول الزمني" . أطلس جينوم السرطان - المعهد الوطني للسرطان . مؤرشف من الأصل في 24 أغسطس 2011. تم الاطلاع عليه في 2 نوفمبر 2015 .
  10. ↑ "خط أنابيب توصيف الجينوم التابع للمعهد الوطني للسرطان" . 4 أغسطس 2017.
  11. ↑ "بوابة بيانات أطلس جينوم السرطان: المورد الأساسي للعينات البيولوجية" . المعهد الوطني للسرطان والمعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري . مؤرشف من الأصل في 19 يونيو 2011. تم الاطلاع عليه في 24 يناير 2014 .
  12. ↑ "الصفحة الرئيسية | مركز بيانات الجينوم التابع للمعهد الوطني للسرطان" . gdc.cancer.gov .
  13. ↑ مويسو، إي.؛ فرحاني، أ.؛ ماربل، إتش دي؛ هندريكس، أ.؛ ميلدروم، إس.؛ ليفين، إس.؛ لينيرز، جيه كيه؛ غارغ، إس. (5 سبتمبر 2022). "نهج جديد للتعلم العميق طُوِّر في معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا يُحدِّد أنواع السرطان غير القابلة للتشخيص من خلال إلقاء نظرة فاحصة على برامج التعبير الجيني المتعلقة بالتطور الخلوي المبكر والتمايز" . مجلة اكتشاف السرطان . 12 (11): 2566-2585 . doi : 10.1158/2159-8290.CD-21-1443 . PMC 9627133. PMID 36041084 .  {{cite journal}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
  14. ↑ فيرهاك، رويل جي دبليو؛ هودلي، كاثرين أ؛ بوردوم، إليزابيث؛ وانغ، فيكتوريا؛ تشي، يوان؛ ويلكرسون، ماثيو د؛ ميلر، سي رايان؛ دينغ، لي ؛ غولوب، تود (19 يناير 2010). "تحليل جينومي متكامل يُحدد أنماطًا فرعية ذات صلة سريريًا من الورم الأرومي الدبقي، تتميز بوجود تشوهات في PDGFRA وIDH1 وEGFR وNF1" . خلية السرطان . 17 (1): 98-110 . doi : 10.1016/j.ccr.2009.12.020 . ISSN 1535-6108 . PMC 2818769. PMID 20129251 .   
  15. ↑ برينان، كاميرون دبليو؛ فيرهاك، رويل جي دبليو؛ ماكينا، آرون؛ كامبوس، بينيتو؛ نوشمير، هوتان؛ سلامة، صوفي آر؛ تشنغ، سيوان؛ تشاكرافارتي، ديبياني؛ سانبورن، جيه. زاكاري (10 أكتوبر 2013). "الخريطة الجينومية الجسدية لورم الأرومة الدبقية" . مجلة Cell . 155 (2): 462-477 . doi : 10.1016/j.cell.2013.09.034 . ISSN 1097-4172 . PMC 3910500. PMID 24120142 .   
  16. ↑ ماكليندون، روجر؛ فريدمان، آلان؛ بيجنر، داريل؛ مير، إروين جي. فان؛ برات، دانيال جيه؛ ماستروجياناكيس، جينا إم؛ أولسون، جيفري جيه؛ ميكلسن، توم؛ ليمان، نورمان (23 أكتوبر 2008). "توصيف جينومي شامل يُحدد جينات الورم الأرومي الدبقي البشري ومساراته الأساسية" . مجلة نيتشر . 455 (7216): 1061-1068 . Bibcode : 2008Natur.455.1061M . doi : 10.1038/nature07385 . ISSN 0028-0836 . PMC 2671642. PMID 18772890 .   
  17. ^ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان. شقي، دي جي؛ فيرهاك، RG. ألدابي، دينار كويتي؛ يونغ، وك. سلامة، ريال؛ كوبر، لوس أنجلوس؛ راينباي، إي. ميلر، سي آر؛ فيتوتشي، م.؛ موروزوفا، O.؛ روبرتسون، AG. نوشمهر، هـ؛ ليرد، PW. تشيرنياك، م. أكباني، ر. هاوس، جي تي؛ سيرييلو، ج.؛ بواسون، إل إم؛ بارنهولتز سلون، JS؛ بيرغر، MS؛ برينان، C .؛ كولن، ر. كولمان، ه.؛ فلاندرز، الإمارات العربية المتحدة؛ جيانيني، C .؛ جريفورد، م. يافرون، أ.؛ جاين، ر. وآخرون . (2015/06/25). "التحليل الجينومي الشامل والتكاملي للأورام الدبقية المنتشرة ذات الدرجة المنخفضة" . مجلة نيو إنجلاند الطبية . 372 (26): 2481–2498 . doi : 10.1056/NEJMoa1402121 . ISSN 0028-4793 . PMC 4530011. PMID 26061751 .    
  18. شبكة 1 2 ، أطلس جينوم السرطان (2012-10-04). "صور جزيئية شاملة لأورام الثدي البشرية" . مجلة نيتشر . 490 (7418): 61-70 . Bibcode : 2012Natur.490...61T . doi : 10.1038 / nature11412 . ISSN 0028-0836 . PMC 3465532. PMID 23000897 .   
  19. ↑ سيريلو، جيوفاني؛ جاتزا، مايكل ل.؛ بيك، أندرو هـ.؛ ويلكرسون، ماثيو د.؛ ري، سون ك.؛ باستوري، أليساندرو؛ تشانغ، هايلي؛ ماكليلان، مايكل؛ ياو، كريستينا (10 أغسطس/آب 2015). "صور جزيئية شاملة لسرطان الثدي الفصيصي الغازي" . مجلة Cell . 163 (2): 506-519 . doi : 10.1016/j.cell.2015.09.033 . ISSN 0092-8674 . PMC 4603750. PMID 26451490 .   
  20. ↑ شبكة، أطلس جينوم السرطان (19 يوليو 2012). "التوصيف الجزيئي الشامل لسرطان القولون والمستقيم البشري" . مجلة نيتشر . 487 (7407): 330-337 . Bibcode : 2012Natur.487..330T . doi : 10.1038 / nature11252 . ISSN 0028-0836 . PMC 3401966. PMID 22810696 .   
  21. ↑ باس، آدم جيه؛ ثورسون، فيستين؛ شموليفيتش، إيليا؛ رينولدز، شيلا إم؛ ميلر، مايكل؛ برنارد، برادي؛ هينوي، توشينوري؛ ليرد، بيتر دبليو؛ كورتيس، كريستينا (23 يوليو 2014). "التوصيف الجزيئي الشامل لسرطان غدي معدي" . مجلة نيتشر . 513 (7517): 202-209 . Bibcode : 2014Natur.513..202T . doi : 10.1038/nature13480 . PMC 4170219. PMID 25079317 .  
  22. ↑ كيم، جيهون؛ بولبي، ريان؛ مونغال، أندرو جيه؛ روبرتسون، أ. غوردون؛ أودزي، روبرت د؛ تشيرنياك، أندرو د؛ شيه، جوليان؛ بيدامالو، تشاندرا سيخار؛ سيبولسكيس، كاري (2017-01-04). "التوصيف الجينومي المتكامل لسرطان المريء" . مجلة نيتشر . 541 (7636): 169-175 . Bibcode : 2017Natur.541..169K . doi : 10.1038/nature20805 . ISSN 1476-4687 . PMC 5651175. PMID 28052061 .   
  23. ^ بيل، د.؛ بيرشوك، أ. بيرير، م. شين، J.؛ كريمر ، دويتشه فيله. داو، ف. ضهير، ر. ديسايا، ب. جبرا، ه.؛ جلين، ب. جودوين، أيه كيه؛ الإجمالي، J.؛ هارتمان، L.؛ هوانغ، م. هانتسمان، المدير العام؛ إياكوكا، م. إميلينسكي، م.؛ كالوجر، س. كارلان، بي. ليفين، دا؛ ميلز، GB؛ موريسون، سي. ماتش، د.؛ أولفيرا، ن.؛ أورسوليك، س. بارك، ك. بيتريللي، ن.؛ رابينو، ب. رادر، شبيبة. وآخرون . (2011/06/29). "التحليلات الجينومية المتكاملة لسرطان المبيض" . طبيعة . 474 (7353): 609– 615. doi : 10.1038/nature10166 . ISSN 0028-0836 . PMC 3163504 . PMID 21720365 .    
  24. ^ بولتون، كيلي إل. تشينيفيكس-ترينش، جي؛ جوه، سي. ساديتسكي، س. راموس، إس جيه؛ كارلان، بي. لامبريشتس، د.؛ ديسبير، إي. بارودال، د.؛ ماكجوفوغ، L.؛ هيلي، س. ايستون، DF؛ سينيلنيكوفا، O.؛ بينيتيز، J .؛ غارسيا، MJ. نيوهاوزن، S .؛ غيل، MH؛ هارتج، ص. بيوك، س. فروست، د.؛ إيفانز، المدير العام؛ إيليس، ر. جودوين، أيه كيه؛ دالي، ميغابايت؛ كوونغ، أ. ما، إس. لازارو، سي. بلانكو، أنا. مونتاجنا، م. وآخرون . (2012/01/25). "العلاقة بين طفرات BRCA1 وBRCA2 وبقاء النساء المصابات بسرطان المبيض الظهاري الغازي" . مجلة الجمعية الطبية الأمريكية (JAMA ) . 307 (4): 382-389 . doi : 10.1001/jama.2012.20 . ISSN 0098-7484 . PMC 3727895. PMID 22274685 .    
  25. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان (2013-05-02). "التوصيف الجينومي المتكامل لسرطان بطانة الرحم" . مجلة نيتشر . 497 (7447): 67-73 . Bibcode : 2013Natur.497...67T . doi : 10.1038 / nature12113 . ISSN 0028-0836 . PMC 3704730. PMID 23636398 .   
  26. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان؛ كلية ألبرت أينشتاين للطب؛ الخدمات البيولوجية التحليلية؛ مستشفى باريتوس للسرطان؛ كلية بايلور للطب؛ معهد بيكمان للأبحاث التابع لمدينة الأمل؛ معهد باك لأبحاث الشيخوخة؛ مركز مايكل سميث لعلوم الجينوم في كندا؛ كلية الطب بجامعة هارفارد (16 مارس 2017). "التوصيف الجينومي والجزيئي المتكامل لسرطان عنق الرحم" . مجلة نيتشر . 543 (7645): 378-384 . Bibcode : 2017Natur.543..378B . doi : 10.1038 / nature21386 . ISSN 1476-4687 . PMC 5354998. PMID 28112728 .   
  27. ↑ شبكة أطلس جينوم السرطان؛ وآخرون (29 يناير 2015). "التوصيف الجينومي الشامل لسرطانات الخلايا الحرشفية في الرأس والرقبة" . مجلة نيتشر . 517 (7536): 576-582 . Bibcode : 2015Natur.517..576T . doi : 10.1038 / nature14129 . ISSN 0028-0836 . PMC 4311405. PMID 25631445 .    
  28. ↑ أغراوال، نيشانت؛ أكباني، ريحان؛ أكسوي، ب. أرمان؛ آلي، أدريان؛ أراشي، هاريندرا؛ آسا، سيلفيا ل.؛ أومان، ج. تود؛ بالاسوندارام، ميرونا؛ بالو، ساياناند (2014). "التوصيف الجينومي المتكامل لسرطان الغدة الدرقية الحليمي" . مجلة Cell . 159 (3): 676-690 . doi : 10.1016/j.cell.2014.09.050 . ISSN 0092-8674 . PMC 4243044. PMID 25417114 .   
  29. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان؛ لي، تيموثي جيه؛ ميلر، كريستوفر؛ دينغ، لي ؛ رافائيل، بنجامين جيه؛ مونغال، أندرو جيه؛ روبرتسون، أ. غوردون؛ هودلي، كاثرين؛ تريش، تيموثي جيه. (30 مايو 2013). " الخرائط الجينومية والإبيجينومية لسرطان الدم النخاعي الحاد حديث الظهور لدى البالغين" . مجلة نيو إنجلاند الطبية . 368 (22): 2059-2074 . doi : 10.1056/NEJMoa1301689 . ISSN 1533-4406 . PMC 3767041. PMID 23634996 .   
  30. ↑ شبكة أطلس جينوم السرطان (18 يونيو 2015). " التصنيف الجينومي لسرطان الجلد الميلانيني" . مجلة Cell . 161 (7): 1681-1696 . doi : 10.1016/j.cell.2015.05.044 . ISSN 1097-4172 . PMC 4580370. PMID 26091043 .   
  31. ^ كوليسون، إريك أ. كامبل، جوشوا د.؛ بروكس، أنجيلا ن.؛ بيرغر، أليس ه.؛ لي ويليام. شميليكي، جوليان؛ البيرة، ديفيد ج. كوب، ليزلي؛ كريتون، تشاد J .؛ دانيلوفا، لودميلا؛ دينغ، لي؛ جيتز، جاد. هامرمان، بيتر س.؛ نيل هايز، د.؛ هيرنانديز، بريان. هيرمان، جيمس ج. هيماتش، جون ف . جوريسيكا، ايجور. كوتشرلاباتي، راجو؛ كوياتكوفسكي، ديفيد؛ لاداني، مارك؛ روبرتسون، جوردون. شولتز، نيكولاس. شين، رونغلاي؛ سينها، ريلين؛ سوجنيز، كاري. تساو، مينغ ساوند؛ ترافيس، وليام D.؛ وينشتاين، جون N.؛ وآخرون . (2014/07/31). "تحليل جزيئي شامل لسرطان غدي رئوي" . مجلة نيتشر . 511 (7511): 543-550 . رمز Bibcode : 2014Natur.511..543T . doi : 10.1038/nature13385 . ISSN 0028-0836 . PMC 4231481. PMID 25079552 .    
  32. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان (27-09-2012). "التوصيف الجينومي الشامل لسرطانات الرئة ذات الخلايا الحرشفية" . مجلة نيتشر . 489 (7417): 519-525 . Bibcode : 2012Natur.489..519T . doi : 10.1038 / nature11404 . ISSN 0028-0836 . PMC 3466113. PMID 22960745 .   
  33. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان (2013-07-04). "التوصيف الجزيئي الشامل لسرطان الخلايا الكلوية الصافية" . مجلة نيتشر . 499 (7456): 43-49 . Bibcode : 2013Natur.499...43T . doi : 10.1038 / nature12222 . ISSN 0028-0836 . PMC 3771322. PMID 23792563 .   
  34. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان؛ لينهان، دبليو. مارستون؛ سبلمان، بول تي.؛ ريكيتس، كريستوفر جيه.؛ كريتون، تشاد جيه.؛ فاي، سوزان إس.؛ ديفيس، كاليب؛ ويلر، ديفيد إيه.؛ موراي، برادلي إيه. (14 يناير 2016). "التوصيف الجزيئي الشامل لسرطان الخلايا الكلوية الحليمي" . مجلة نيو إنجلاند الطبية . 374 (2): 135-145 . doi : 10.1056/NEJMoa1505917 . ISSN 1533-4406 . PMC 4775252. PMID 26536169 .   
  35. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان (20 مارس 2014). "التوصيف الجزيئي الشامل لسرطان الظهارة البولية في المثانة" . مجلة نيتشر . 507 (7492): 315-322 . Bibcode : 2014Natur.507..315T . doi : 10.1038/nature12965 . ISSN 0028-0836 . PMC 3962515. PMID 24476821 .   
  36. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان (2015-11-05). " التصنيف الجزيئي لسرطان البروستاتا الأولي" . مجلة Cell . 163 (4): 1011-1025 . doi : 10.1016/j.cell.2015.10.025 . ISSN 1097-4172 . PMC 4695400. PMID 26544944 .   
  37. ↑ ديفيس، كاليب ف.؛ ريكيتس، كريستوفر ج.؛ وانغ، مين؛ يانغ، ليكسينغ؛ تشيرنياك، أندرو د.؛ شين، هوي؛ بوهاي، كريستيان؛ كانغ، هيوجين؛ كيم، سانغ تشول (2014-09-08). "المشهد الجينومي الجسدي لسرطان الخلايا الكلوية الكروموفوبي" . خلية السرطان . 26 (3): 319-330 . doi : 10.1016/j.ccr.2014.07.014 . PMC 4160352. PMID 25155756 .  
  38. ^ تشنغ، سيوان. تشيرنياك، أندرو د.؛ ديوال، نيناد؛ موفيت، ريتشارد أ. دانيلوفا، لودميلا؛ موراي، برادلي أ. ليراريو، أنطونيو م.؛ آخر، توبياس؛ كنيجنينبورج، ثيو أ. (2016/05/09). "التوصيف الشامل للجينوم لسرطان قشر الكظر" . الخلية السرطانية . 29 (5): 723-736 . دوى : 10.1016/j.ccell.2016.04.002 . ردمك 1878-3686 . بمك 4864952 . بميد 27165744 .   
  39. ↑ فيشبين، لورين؛ ليشينر، إغناتي؛ والتر، فون؛ دانيلوفا، لودميلا؛ روبرتسون، أ. غوردون؛ جونسون، إيمي ر.؛ ليشتنبرغ، تارا م.؛ موراي، برادلي أ.؛ غايي، هانز ك. (13 فبراير 2017). "التوصيف الجزيئي الشامل لورم القواتم وورم جار العقدة" . خلية السرطان . 31 (2): 181-193 . doi : 10.1016/j.ccell.2017.01.001 . ISSN 1878-3686 . PMC 5643159. PMID 28162975 .   
  40. ↑ فرشيدفار، فرشاد؛ تشنغ، سييوان؛ جينغراس، ماري كلود؛ نيوتن، يوليا؛ شيه، جوليان؛ روبرتسون، أ. غوردون؛ هينوي، توشينوري؛ هودلي، كاثرين أ.؛ جيب، إيوان أ. (14 مارس 2017). "تحليل جينومي تكاملي لسرطان الأقنية الصفراوية يُحدد أنماطًا جزيئية مميزة لطفرة IDH" . تقارير الخلية . 18 (11): 2780-2794 . doi : 10.1016/j.celrep.2017.02.033 . ISSN 2211-1247 . PMC 5493145. PMID 28297679 .   
  41. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان. البريد الإلكتروني: wheeler@bcm.edu؛ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان (15 يونيو 2017). "التوصيف الجينومي الشامل والمتكامل لسرطان الخلايا الكبدية" . مجلة Cell . 169 (7): 1327–1341.e23. doi : 10.1016/j.cell.2017.05.046 . ISSN 1097-4172 . PMC 5680778. PMID 28622513 .   
  42. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان. البريد الإلكتروني: andrew_aguirre@dfci.harvard.edu؛ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان (14 أغسطس/آب 2017). "التوصيف الجينومي المتكامل لسرطان غدي قنوي البنكرياس" . خلية السرطان . 32 (2): 185-203.e13. doi : 10.1016/j.ccell.2017.07.007 . ISSN 1878-3686 . PMC 5964983. PMID 28810144 .   
  43. ^ تشيرنياك، أندرو د. شين، هوي؛ والتر، فون. ستيوارت، تشيب؛ موراي، برادلي أ. بولبي، رين؛ هو، شين؛ لينغ، شيون. سوسلو، روبرت أ. (2017/03/13). "التوصيف الجزيئي المتكامل لسرطان الرحم" . الخلية السرطانية . 31 (3): 411-423 . دوى : 10.1016/j.ccell.2017.02.010 . ردمك 1878-3686 . بمك 5599133 . بميد 28292439 .   
  44. ↑ روبرتسون، أ. جوردون؛ شيه، جوليان؛ ياو، كريستينا؛ جيب، إيوان أ.؛ أوبا، جونا؛ مونغال، كارين ل.؛ هيس، جوليان م.؛ أوزونانجيلوف، فلاديسلاف؛ والتر، فون (14 أغسطس/آب 2017). "تحليل تكاملي يُحدد أربع مجموعات فرعية جزيئية وسريرية في ورم الميلانوما العنبية" . خلية السرطان . 32 (2): 204-220.e15. doi : 10.1016/j.ccell.2017.07.003 . ISSN 1878-3686 . PMC 5619925. PMID 28810145 .   
  45. ↑ رادوفيتش، ميلان؛ بيكرينغ، كورتيس ر.؛ فيلاو، إينا؛ ها، غافين؛ تشانغ، هايلي؛ جو، هيجون؛ هودلي، كاثرين أ.؛ أنور، بافانا؛ تشانغ، جيكسين؛ ماكليلان، مايك؛ بولبي، ريان (فبراير 2018). " المشهد الجينومي المتكامل لأورام الظهارة الزعترية" . خلية السرطان . 33 (2): 244-258.e10. doi : 10.1016/j.ccell.2018.01.003 . ISSN 1535-6108 . PMC 5994906. PMID 29438696 .   
  46. ↑ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان. البريد الإلكتروني: elizabeth.demicco@sinaihealthsystem.ca؛ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان (2017-11-02). "التوصيف الجينومي الشامل والمتكامل لأورام الأنسجة الرخوة لدى البالغين" . مجلة Cell . 171 (4): 950–965.e28. doi : 10.1016/j.cell.2017.10.014 . ISSN 1097-4172 . PMC 5693358. PMID 29100075 .   
  47. ↑ هملياك، جوليا؛ سانشيز-فيغا، فرانسيسكو؛ هودلي، كاثرين أ.؛ شيه، جوليان؛ ستيوارت، تشيب؛ هايمان، ديفيد؛ تاربي، باتريك؛ دانيلوفا، لودميلا؛ دريل، إستر؛ جيب، إيوان أ.؛ بولبي، ريان (2018-12-03). "التوصيف الجزيئي المتكامل لورم الظهارة المتوسطة الخبيث في غشاء الجنب" . مجلة اكتشاف السرطان . 8 (12): 1548-1565 . doi : 10.1158/2159-8290.CD-18-0804 . ISSN 2159-8274 . PMC 6310008. PMID 30322867 .   
  48. ↑ شين، هوي؛ شيه، جوليان؛ هولرن، دانيال ب.؛ وانغ، لينغوا؛ بولبي، ريان؛ تيكو، ساتيش ك.؛ ثورسون، فيستين؛ مونغال، أندرو ج.؛ نيوتن، يوليا؛ هيغدي، أبورفا م.؛ أرمينيا، جوشوا (12 يونيو 2018). " التوصيف الجزيئي المتكامل لأورام الخلايا الجرثومية الخصوية" . تقارير الخلية . 23 (11): 3392-3406 . doi : 10.1016/j.celrep.2018.05.039 . ISSN 2211-1247 . PMC 6075738. PMID 29898407 .   
  49. ^ ماكليندون ، روجر. فريدمان، ألان؛ بيجنر، داريل؛ فان مئير، اروين G.؛ برات، دانيال ج. م. ماستروجياناكيس، جينا؛ أولسون، جيفري J.؛ ميكلسن، توم؛ ليمان، نورمان. ألدابي، كين؛ ألفريد يونج، WK؛ بوغلر، أوليفر. فاندنبرج، سكوت؛ بيرغر، ميتشل؛ برادوس، مايكل. مزني، دونا؛ مورغان، مارغريت. شيرير، ستيف؛ سابو، أنيكو؛ الناصرة، لين؛ لويس، لورا. هول، أوتيس؛ تشو، ييمينغ؛ رن، يانرو؛ علوي، عمر؛ ياو، جيتشيانغ؛ هاوز، أليسيا؛ جانجياني، شاليني؛ فاولر، جيرالد. وآخرون . (أكتوبر 2008). "التوصيف الجينومي الشامل يحدد جينات ورم أرومي دبقي بشري ومسارات أساسية" . طبيعة . 455 (7216): 1061– 8. Bibcode : 2008Natur.455.1061M . doi : 10.1038/ nature07385 . PMC 2671642. PMID 18772890 .   
  50. ↑ "بوابة بيانات أطلس جينوم السرطان" . المعهد الوطني للسرطان والمعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري . تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 أبريل 2009 .{{cite web}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
  51. ↑ "بوابة بيانات أطلس جينوم السرطان" . المعهد الوطني للصحة . تم الاطلاع عليه في 2 نوفمبر 2010 .{{cite web}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
  52. ↑ فيرهاك، رويل جي دبليو؛ هودلي، كاثرين أ.؛ بوردوم، إليزابيث؛ وانغ، فيكتوريا؛ تشي، يوان؛ ويلكرسون، ماثيو د.؛ ميلر، سي. رايان؛ دينغ، لي؛ غولوب، تود؛ ميسيروف، جيل ب .؛ أليكس، غابرييل؛ لورانس، مايكل؛ أوكيلي، مايكل؛ تامايو، بابلو؛ وير، باربرا أ.؛ غابرييل، ستايسي؛ وينكلر، ويندي؛ غوبتا، سوبريا؛ جاكولا، لاكشمي؛ فيلر، هايدي س.؛ هودجسون، جيه. غرايم؛ جيمس، سي. ديفيد؛ ساركاريا، جان ن.؛ برينان، كاميرون؛ خان، آري؛ سبلمان، بول ت.؛ ويلسون، ريتشارد ك .؛ سبيد، تيرينس ب .؛ غراي، جو دبليو.؛ مايرسون، ماثيو؛ غيتز، غاد؛ بيرو، تشارلز م.؛ هايز، د. نيل (2010). "تحليل جينومي متكامل يُحدد أنماطًا فرعية ذات أهمية سريرية من الورم الأرومي الدبقي تتميز بوجود تشوهات في جينات PDGFRA و IDH1 وEGFR وNF1" . مجلة Cancer Cell . 17 (1): 98-110 . doi : 10.1016/j.ccr.2009.12.020 . PMC 2818769. PMID 20129251 .  
  53. ↑ نوشمهر هـ؛ وايزنبرغر دي جيه؛ ديفيس ك؛ وآخرون . (مايو 2010). "تحديد نمط ظاهري لمثيلة جزر CpG يُعرّف مجموعة فرعية متميزة من الورم الدبقي" . خلية السرطان . 17 (5): 510-22 . doi : 10.1016/j.ccr.2010.03.017 . PMC 2872684. PMID 20399149 .   
  54. ↑ "نوع فرعي من الورم الدبقي ذو نتائج أقل حدة" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 6 مارس 2011 .{{cite web}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
  55. ^ بيل، د.؛ بيرشوك، أ. بيرير، م. شين، J.؛ كريمر ، دويتشه فيله. داو، ف. ضهير، ر. ديسايا، ب. جبرا، ه.؛ جلين، ب. جودوين، أيه كيه؛ الإجمالي، J.؛ هارتمان، L.؛ هوانغ، م. هانتسمان، المدير العام؛ إياكوكا، م. إميلينسكي، م.؛ كالوجر، س. كارلان، بي. ليفين، دا؛ ميلز، GB؛ موريسون، سي. ماتش، د.؛ أولفيرا، ن.؛ أورسوليك، س. بارك، ك. بيتريللي، ن.؛ رابينو، ب. رادر، شبيبة. وآخرون . (2011). "التحليلات الجينومية المتكاملة لسرطان المبيض" . طبيعة . 474 (7353): 609– 15. doi : 10.1038/nature10166 . PMC 3163504 . PMID 21720365 .   
  56. ↑ شبكة أطلس جينوم السرطان؛ وآخرون (2012). "التوصيف الجزيئي الشامل لسرطان القولون والمستقيم البشري" . مجلة نيتشر . 487 (7407): 330-337 . Bibcode : 2012Natur.487..330T . doi : 10.1038 / nature11252 . PMC 3401966. PMID 22810696 .   
  57. ↑ كاندوث سي، ماكليلان إم دي، فاندين إف، يي كيه، نيو بي، لو سي، شي إم، تشانغ كيو، ماكمايكل جيه إف، ويتشالكوفسكي إم إيه، ليسرسون إم دي، ميلر سي إيه، ويلش جيه إس، والتر إم جيه، ويندل إم سي ، لي تي جيه ، ويلسون آر كيه ، رافائيل بي جيه، دينغ إل (2013). "الخريطة الطفرية وأهميتها عبر 12 نوعًا رئيسيًا من السرطان" . نيتشر . 502 ( 7471): 333-339 . Bibcode : 2013Natur.502..333K . doi : 10.1038/nature12634 . PMC 3927368. PMID 24132290 .  
  58. ^ هودلي، كاثرين أ. ياو، كريستينا؛ هينو، توشينوري؛ وولف، دينيس م.؛ لازار، الكسندر J .؛ حفر، استير؛ شين، رونغلاي؛ تايلور، أليسون م.؛ تشيرنياك، أندرو د.؛ ثورسون، فيستين؛ اكباني ، ريحان (2018-04-05). "أنماط الخلايا الأصلية تهيمن على التصنيف الجزيئي لـ 10000 ورم من 33 نوعًا من السرطان" . خلية . 173 (2): 291–304.e6. دوى : 10.1016/j.cell.2018.03.022 . ردمك 1097-4172 . بمك 5957518 . بميد 29625048 .   
  59. ^ مالطا، تاثيان م. سوكولوف، أرتيم؛ جنتلز، أندرو ج.؛ بورزيكوفسكي، توماسز؛ بواسون، ليلى؛ وينشتاين، جون N.؛ كامينسكا، بوزينا؛ هويلسكين، يورغ. أومبيرج، لارسون؛ جيفيرت، أوليفييه. كولابريكو ، أنطونيو (2018/04/05). "التعلم الآلي يحدد السمات الجذعية المرتبطة باختلاف التمايز الجيني" . خلية . 173 (2): 338-354.e15. دوى : 10.1016/j.cell.2018.03.034 . ردمك 1097-4172 . بمك 5902191 . بميد 29625051 .   
  60. ↑ بيرغر، أشتون سي؛ كوركوت، أنيل؛ كانشي، روبا إس؛ هيغدي، أبورفا إم؛ لينوار، والتر؛ ليو، وينبين؛ ليو، يوكسين؛ فان، هوي هوي؛ شين، هوي؛ رافيكومار، فيسويسواران؛ راو، أرفيند (9 أبريل 2018). "دراسة جزيئية شاملة لسرطانات الجهاز التناسلي الأنثوي وسرطانات الثدي" . خلية السرطان . 33 (4): 690-705.e9. doi : 10.1016/j.ccell.2018.03.014 . ISSN 1878-3686 . PMC 5959730. PMID 29622464 .   
  61. ^ ليو، يانغ؛ سيثي، نيلاي S .؛ هينو، توشينوري؛ شنايدر، باربرا ج. تشيرنياك، أندرو د.؛ سانشيز فيجا، فرانسيسكو؛ سيوان، خوسيه أ؛ فرشدفار، فرشاد؛ بولبي، رين؛ إسلام ميرازول. كيم ، جايجيل (2018/04/09). "التحليل الجزيئي المقارن لأورام سرطانية الجهاز الهضمي" . الخلية السرطانية . 33 (4): 721-735.e8. دوى : 10.1016/j.ccell.2018.03.010 . ردمك 1878-3686 . بمك 5966039 . بميد 29622466 .   
  62. ↑ كامبل، جوشوا د.؛ ياو، كريستينا؛ بولبي، ريان؛ ليو، يوكسين؛ برينان، كيفن؛ فان، هوي هوي؛ تايلور، أليسون م.؛ وانغ، تشين؛ والتر، فون؛ أكباني، ريحان؛ بايرز، لورين أفيريت (2018-04-03). " الخصائص الجينومية، وشبكة المسارات، والمناعية التي تميز سرطان الخلايا الحرشفية" . تقارير الخلية . 23 (1): 194-212.e6. doi : 10.1016/j.celrep.2018.03.063 . ISSN 2211-1247 . PMC 6002769. PMID 29617660 .   
  63. ↑ ريكيتس، كريستوفر جيه؛ دي كوباس، أغيري أ؛ فان، هوي هوي؛ سميث، كريستوف سي؛ لانغ، مارتن؛ ريزنيك، إد؛ بولبي، ريان؛ جيب، إيوان أ؛ أكباني، ريحان؛ بيروخيم، رامين؛ بوتارو، دونالد ب. (2018-04-03). "أطلس جينوم السرطان : توصيف جزيئي شامل لسرطان الخلايا الكلوية" . تقارير الخلية . 23 (1): 313-326.e5. doi : 10.1016/j.celrep.2018.03.075 . ISSN 2211-1247 . PMC 6075733. PMID 29617669 .   
  64. ↑ دينغ، لي ؛ بيلي، ماثيو هـ.؛ بورتا-باردو، إدوارد؛ ثورسون، فيستين؛ كولابريكو، أنطونيو؛ بيرتراند، دينيس؛ غيبس، ديفيد ل.؛ ويراسينغ، أميلا؛ هوانغ، كوان-لين؛ توكهايم، كولين؛ كورتيس-سيريانو، إيسيدرو (2018-04-05). " منظور حول العمليات السرطانية في نهاية بداية علم جينوم السرطان" . مجلة Cell . 173 (2): 305–320.e10. doi : 10.1016/j.cell.2018.03.033 . ISSN 1097-4172 . PMC 5916814. PMID 29625049 .   
  65. ^ هوانغ، كوان لين؛ مشل، ر. جاي؛ وو، ييغ؛ ريتر، ديبورا الأول. وانغ، جيايين؛ أوه، كلارا؛ باكزكوسكا، مارتا؛ رينولدز، شيلا. ويكزالكوفسكي، ماثيو أ.؛ اوك، نيناد؛ سكوت ، آدم د. (2018-04-05). "متغيرات السلالة الجرثومية المسببة للأمراض في 10389 حالة سرطانية للبالغين" . خلية . 173 (2): 355–370.e14. دوى : 10.1016/j.cell.2018.03.039 . ردمك 1097-4172 . بمك 5949147 . بميد 29625052 .   
  66. ↑ بيلي، ماثيو هـ.؛ توكهايم، كولين؛ بورتا-باردو، إدوارد؛ سينغوبتا، سوهيني؛ بيرتراند، دينيس؛ ويراسينغ، أميلا؛ كولابريكو، أنطونيو؛ ويندل، مايكل س.؛ كيم، جايجيل؛ ريردون، بريندان؛ نغ، باتريك كوك-شينغ (2018-04-05). " التوصيف الشامل لجينات وطفرات محركة للسرطان" . مجلة Cell . 173 (2): 371–385.e18. doi : 10.1016/j.cell.2018.02.060 . ISSN 1097-4172 . PMC 6029450. PMID 29625053 .   
  67. ↑ غاو، تشينغسونغ؛ ليانغ، وين-وي؛ فولتر، ستيفن م.؛ موثاراسو، غنانافيل؛ جاياسينغ، ريكا ج.؛ كاو، سونغ؛ لياو، وين-وي؛ رينولدز، شيلا م.؛ ويتشالكوفسكي، ماثيو أ.؛ ياو، ليجون؛ يو، ليهوا (2018-04-03). " اندماجات المحفزات وآثارها في تطور وعلاج السرطانات البشرية" . تقارير الخلية . 23 (1): 227-238.e3. doi : 10.1016/j.celrep.2018.03.050 . ISSN 2211-1247 . PMC 5916809. PMID 29617662 .   
  68. ^ ثورسون ، فيستين. جيبس، ديفيد L.؛ براون، سكوت د.؛ وولف، دينيس؛ بورتوني، دانتي S .؛ أو يانغ، تاي هسين؛ بورتا باردو، إدوارد؛ جاو، جالين F .؛ بليسير، كريستوفر إل. إدي، جيمس أ. زيف ، العاد (2018-04-17). "المشهد المناعي للسرطان" . الحصانة . 48 (4): 812-830.e14. دوى : 10.1016/j.immuni.2018.03.023 . ردمك 1097-4180 . بمك 5982584 . بميد 29628290 .   
  69. ↑ سالتز، جويل؛ غوبتا، راجارسي؛ هو، لي؛ كورك، تحسين؛ سينغ، بانكاج؛ نغوين، فو؛ ساماراس، ديميتريس؛ شروير، كينيث ر.؛ تشاو، تيانهاو؛ باتيست، ريبيكا؛ فان أرنام، جون (2018-04-03). " التنظيم المكاني والترابط الجزيئي للخلايا اللمفاوية المتسللة إلى الورم باستخدام التعلم العميق على صور علم الأمراض" . تقارير الخلية . 23 (1): 181-193.e7. doi : 10.1016/j.celrep.2018.03.086 . ISSN 2211-1247 . PMC 5943714. PMID 29617659 .   
  70. ↑ تايلور، أليسون م.؛ شيه، جوليان؛ ها، جافين؛ جاو، جالين ف.؛ تشانغ، شياويانغ؛ بيرغر، أشتون س.؛ شوماخر، ستيفن إي.؛ وانغ، تشين؛ هو، هاي؛ ليو، جيانفانغ؛ لازار، ألكسندر ج. (2018-04-09). " المناهج الجينومية والوظيفية لفهم اختلال الصيغة الصبغية في السرطان" . خلية السرطان . 33 (4): 676-689.e3. doi : 10.1016/j.ccell.2018.03.007 . ISSN 1878-3686 . PMC 6028190. PMID 29622463 .   
  71. ↑ تشين، هان؛ لي، تشونيان؛ بنغ، شينشين؛ تشو، تشيتشنغ؛ وينشتاين، جون ن.؛ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان؛ ليانغ، هان (2018-04-05). "تحليل شامل لتعبير المُحسِّن في ما يقرب من 9000 عينة من المرضى" . مجلة Cell . 173 (2): 386–399.e12. doi : 10.1016/j.cell.2018.03.027 . ISSN 1097-4172 . PMC 5890960. PMID 29625054 .   
  72. ↑Wang, Zehua; Yang, Bo; Zhang, Min; Guo, Weiwei; Wu, Zhiyuan; Wang, Yue; Jia, Lin; Li, Song; Cancer Genome Atlas Research Network; Xie, Wen; Yang, Da (2018-04-09). "lncRNA Epigenetic Landscape Analysis Identifies EPIC1 as an Oncogenic lncRNA that Interacts with MYC and Promotes Cell-Cycle Progression in Cancer". Cancer Cell. 33 (4): 706–720.e9. doi:10.1016/j.ccell.2018.03.006. ISSN 1878-3686. PMC 6143179. PMID 29622465.
  73. ↑Chiu, Hua-Sheng; Somvanshi, Sonal; Patel, Ektaben; Chen, Ting-Wen; Singh, Vivek P.; Zorman, Barry; Patil, Sagar L.; Pan, Yinghong; Chatterjee, Sujash S.; Cancer Genome Atlas Research Network; Sood, Anil K. (2018-04-03). "Pan-Cancer Analysis of lncRNA Regulation Supports Their Targeting of Cancer Genes in Each Tumor Context". Cell Reports. 23 (1): 297–312.e12. doi:10.1016/j.celrep.2018.03.064. ISSN 2211-1247. PMC 5906131. PMID 29617668.
  74. ↑Jayasinghe, Reyka G.; Cao, Song; Gao, Qingsong; Wendl, Michael C.; Vo, Nam Sy; Reynolds, Sheila M.; Zhao, Yanyan; Climente-González, Héctor; Chai, Shengjie; Wang, Fang; Varghese, Rajees (2018-04-03). "Systematic Analysis of Splice-Site-Creating Mutations in Cancer". Cell Reports. 23 (1): 270–281.e3. doi:10.1016/j.celrep.2018.03.052. ISSN 2211-1247. PMC 6055527. PMID 29617666.
  75. ↑Ellrott, Kyle; Bailey, Matthew H.; Saksena, Gordon; Covington, Kyle R.; Kandoth, Cyriac; Stewart, Chip; Hess, Julian; Ma, Singer; Chiotti, Kami E.; McLellan, Michael; Sofia, Heidi J. (2018-03-28). "Scalable Open Science Approach for Mutation Calling of Tumor Exomes Using Multiple Genomic Pipelines". Cell Systems. 6 (3): 271–281.e7. doi:10.1016/j.cels.2018.03.002. ISSN 2405-4712. PMC 6075717. PMID 29596782.
  76. ↑ ليو، جيان فانغ؛ ليشتنبرغ، تارا؛ هودلي، كاثرين أ.؛ بواسون، ليلى م.؛ لازار، ألكسندر ج.؛ تشيرنياك، أندرو د.؛ كوفاتيتش، ألبرت ج.؛ بنز، كريستوفر س.؛ ليفين، دوغلاس أ.؛ لي، أدريان ف.؛ أومبرغ، لارسون (2018-04-05). "مورد بيانات سريرية متكامل لسرطان TCGA لتحسين تحليل نتائج البقاء على قيد الحياة عالية الجودة" . مجلة Cell . 173 (2): 400–416.e11. doi : 10.1016/j.cell.2018.02.052 . ISSN 1097-4172 . PMC 6066282. PMID 29625055 .   
  77. ↑ كاهلز، أندريه؛ ليمان، كيونغ-فان؛ توسان، نورا سي؛ هوسر، ماتياس؛ ستارك، ستيفان جي؛ ساكسنبرغ، تيمو؛ ستيجل، أوليفر؛ كولباخر، أوليفر؛ ساندر، كريس؛ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان؛ راتش، غونار (13 أغسطس/آب 2018). " تحليل شامل للتضفير البديل عبر الأورام من 8705 مريضًا" . خلية السرطان . 34 (2): 211-224.e6. doi : 10.1016/j.ccell.2018.07.001 . ISSN 1878-3686 . PMC 9844097. PMID 30078747. S2CID 51923069 .    
  78. ^ سانشيز فيجا، فرانسيسكو؛ مينا ماركو. أرمينيا، جوشوا؛ شاتيلا، وليد ك.؛ لونا، أوغسطين. لا، كونور سي؛ ديميتريادوي، صوفيا؛ ليو، ديفيد L.؛ كانثيتي، هافيش إس؛ سقافينيا، صادق؛ تشاكرافارتي ، ديبياني (2018-04-05). "مسارات الإشارة الجينية في أطلس جينوم السرطان" . خلية . 173 (2): 321-337.e10. دوى : 10.1016/j.cell.2018.03.035 . ردمك 1097-4172 . بمك 6070353 . بميد 29625050 .   
  79. ↑ شوب، فرانز إكس؛ دانكاني، فارشا؛ بيرغر، أشتون سي؛ تريفيدي، ميهير؛ ريتشاردسون، آن بي؛ شو، ريد؛ تشاو، وي؛ تشانغ، شياويانغ؛ فينتورا، أندريا؛ ليو، يوكسين؛ آير، دونالد إي. (28 مارس 2018). " التغيرات الشاملة للسرطان في جين MYC الورمي وشبكته القريبة عبر أطلس جينوم السرطان" . أنظمة الخلية . 6 (3): 282-300.e2. doi : 10.1016/j.cels.2018.03.003 . ISSN 2405-4712 . PMC 5892207. PMID 29596783 .   
  80. ^ الطريق ، جريجوري ب. سانشيز فيجا، فرانسيسكو؛ لا كونور. أرمينيا، جوشوا؛ شاتيلا، وليد ك.؛ لونا، أوغسطين. ساندر، كريس؛ تشيرنياك، أندرو د.؛ مينا ماركو. سيريلو، جيوفاني؛ شولتز ، نيكولاس (2018-04-03). "التعلم الآلي يكتشف تنشيط مسار رأس السرطان في أطلس جينوم السرطان" . تقارير الخلية . 23 (1): 172-180.e3. دوى : 10.1016/j.celrep.2018.03.046 . ISSN 2211-1247 . بمك 5918694 . بميد 29617658 .   
  81. ↑ كنيجنبورغ، ثيو أ.؛ وانغ، لينغوا؛ زيمرمان، مايكل ت.؛ تشامبوي، نياشا؛ غاو، غالين ف.؛ تشيرنياك، أندرو د.؛ فان، هوي هوي؛ شين، هوي؛ واي، غريغوري ب.؛ غرين، كيسي س.؛ ليو، يوكسين (2018-04-03). " الخريطة الجينومية والجزيئية لنقص إصلاح تلف الحمض النووي عبر أطلس جينوم السرطان" . تقارير الخلية . 23 (1): 239-254.e6. doi : 10.1016/j.celrep.2018.03.076 . ISSN 2211-1247 . PMC 5961503. PMID 29617664 .   
  82. ↑ بنغ، شينشين؛ تشين، تشونغ يوان؛ فرشيد فر، فرشاد؛ شو، شياويان؛ لورينزي، فيليب ل.؛ وانغ، يومنغ؛ تشنغ، فيكسيونغ؛ تان، لين؛ موجومدار، كماليكا؛ دو، دي؛ غي، تشونغ تشي (2018-04-03). " التوصيف الجزيئي والأهمية السريرية لأنماط التعبير الأيضي الفرعية في السرطانات البشرية" . تقارير الخلية . 23 (1): 255-269.e4. doi : 10.1016/j.celrep.2018.03.077 . ISSN 2211-1247 . PMC 5916795. PMID 29617665 .   
  83. ^ قه، تشونغ تشي؛ لايتون، جيك S.؛ وانغ، يومينج؛ بنغ، شينشين؛ تشن، تشونغ يوان. تشن، هو؛ صن، يوتونغ؛ ياو، فان؛ لي، يونيو؛ تشانغ، هويوين؛ ليو ، جيان فانغ (2018/04/03). "التحليل الجينومي المتكامل لمسار اليوبيكويتين عبر أنواع السرطان" . تقارير الخلية . 23 (1): 213-226.e3. دوى : 10.1016/j.celrep.2018.03.047 . ISSN 2211-1247 . بمك 5916807 . بميد 29617661 .   
  84. ↑ سيلر، مايكل؛ بينغ، شويونغ؛ أغراوال، أنانت أ.؛ بالاسينو، جيمس؛ تينغ، تينغ؛ تشو، بينغ؛ سميث، بيتر ج.؛ شبكة أبحاث أطلس جينوم السرطان؛ بوناميتشي، سيلفيا؛ يو، ليهوا (2018-04-03). "المشهد الطفري الجسدي لجينات عامل التضفير وعواقبه الوظيفية عبر 33 نوعًا من السرطان" . تقارير الخلية . 23 (1): 282-296.e4. doi : 10.1016/j.celrep.2018.01.088 . ISSN 2211-1247 . PMC 5933844. PMID 29617667 .   
  85. ↑ كوركوت، أنيل؛ زيدي، سوبيا؛ كانشي، روبا س.؛ راو، شويون؛ غوف، نانسي ر.؛ شولتز، أندريه؛ لي، شوبين؛ لورينزي، فيليب ل.؛ بيرغر، أشتون س.؛ روبرتسون، غوردون؛ كوونغ، لورانس ن. (24 أكتوبر 2018). "تحليل شامل للسرطان يكشف عن تغيرات جينية عالية التردد في وسائط الإشارات بواسطة عائلة TGF-β الفائقة" . أنظمة الخلية . 7 (4): 422-437.e7. doi : 10.1016/j.cels.2018.08.010 . ISSN 2405-4712 . PMC 6370347. PMID 30268436 .   
  86. ^ وانغ ، يومينج. شو، شياو يان؛ ماجليك، ديان؛ الشبت، مايكل T.؛ موجومدار، كماليكة؛ إن جي، باتريك كووك شينج؛ جيونج، كانغ جين؛ تسانغ، يو هوين؛ مورينو، دانييلا؛ بهافانا، فينكاتا هيمانجاني؛ بنغ ، شينشين (2018/10/30). "التوصيف الجزيئي الشامل لمسار إشارات فرس النهر في السرطان" . تقارير الخلية . 25 (5): 1304-1317.هـ5. دوى : 10.1016/j.celrep.2018.10.001 . ISSN 2211-1247 . بمك 6326181 . بميد 30380420 .   
  87. ↑ كورسيس، إم. رايان؛ غرانجا، جيفري إم.؛ شمس، شادي؛ لوي، برايان إتش.؛ سيوان، خوسيه إيه.؛ تشو، واندينغ؛ سيلفا، تياغو سي.؛ غرونيفيلد، كلاريس؛ وونغ، كريستوفر كيه.؛ تشو، سيونغ وو؛ ساتباثي، أنسومان تي. (26-10-2018). "مشهد إمكانية الوصول إلى الكروماتين في سرطانات الإنسان الأولية" . مجلة ساينس . 362 (6413). Bibcode : 2018Sci...362.1898C . doi : 10.1126/science.aav1898 . ISSN 0036-8075 . PMC 6408149. PMID 30361341 .