الببتيد الحلقي

ألفا-أمانيتين
باسيتراسين
سيكلوسبورين

الببتيدات الحلقية هي سلاسل عديد الببتيد تحتوي على تسلسل دائري من الروابط. [ 1 ] قد يكون ذلك من خلال اتصال بين طرفي الأمين والكربوكسيل للببتيد، كما في السيكلوسبورين ؛ أو اتصال بين طرف الأمين وسلسلة جانبية، كما في الباسيتراسين ؛ أو بين طرف الكربوكسيل وسلسلة جانبية، كما في الكوليستين ؛ أو سلسلتين جانبيتين أو ترتيبات أكثر تعقيدًا، كما في ألفا-أمانيتين . تم اكتشاف العديد من الببتيدات الحلقية في الطبيعة، وتم تصنيع العديد منها في المختبر. يتراوح طولها من حمضين أمينيين فقط إلى مئات الأحماض الأمينية. في الطبيعة، غالبًا ما تكون مضادة للميكروبات أو سامة؛ وفي الطب، لها تطبيقات متنوعة، مثل المضادات الحيوية ومثبطات المناعة. [ 2 ] يُعدّ الفصل الكروماتوغرافي ذو الطبقة الرقيقة (TLC) طريقة ملائمة للكشف عن الببتيدات الحلقية في المستخلص الخام من الكتلة الحيوية. [ 3 ]

تصنيف

يمكن تصنيف الببتيدات الحلقية وفقًا لأنواع الروابط التي تشكل الحلقة.

  • الببتيدات الحلقية المتجانسة، مثل السيكلوسبورين أ، هي تلك التي تتكون حلقتها حصريًا من روابط ببتيدية عادية (أي بين مجموعة الكربوكسيل ألفا لحمض أميني ومجموعة الأمين ألفا لحمض أميني آخر). أصغر هذه الأنواع هي 2،5-دايكيتوبيبرازين ، [ 4 ] وهي مشتقة من عملية تحلق ثنائي الببتيد.
  • تحتوي الببتيدات الحلقية على رابطة واحدة على الأقل غير رابطة أميد ألفا، مثل الرابطة بين السلسلة الجانبية لبقايا واحدة ومجموعة الكربوكسيل ألفا لبقايا أخرى، كما هو الحال في الميكروسيستين والباسيتراسين.
  • تحتوي الببتيدات الحلقية ، مثل أوريوباسيدين أ وHUN-7293، على رابطة لاكتون (إستر) واحدة على الأقل بدلاً من إحدى روابط الأميد. وتتكون بعض الببتيدات الحلقية من حلقة بين مجموعة الكربوكسيل الطرفية وسلسلة جانبية لحمض ثريونين أو سيرين في السلسلة، مثل كاهالاليد ف، وثيونيللابيبتوليد، وديدمنين ب.
  • تحتوي الببتيدات ثنائية الحلقة، مثل الأمانيتين والفالويدين ، على مجموعة رابطة، عادةً ما تكون بين سلسلتين جانبيتين. في الأماتوكسينات، تتشكل هذه المجموعة على هيئة جسر سلفوكسيد بين بقايا التربتوفان والسيستين. ومن الببتيدات ثنائية الحلقة الأخرى: الإكينوميسين، والتريوستين أ، والسيلوجينتين ج.
  • هناك عدد من الببتيدات ثنائية الحلقات وأحادية الحلقات التي يتم تكوينها من خلال رابطة ثنائية الكبريتيد بين اثنين من السيستين ، ويُعد الناقل العصبي الأوكسيتوسين مثالًا بارزًا على ذلك.
  • السيكلوتيدات هي عائلة من الببتيدات الغنية بالسيستين، وتتميز بستة سيستينات محفوظة تشكل ثلاث روابط ثنائية الكبريتيد داخل البنية الحلقية، مكونةً عقدة السيستين الحلقية المميزة (CCK) التي تمنح هذه الببتيدات بنيتها ثلاثية الأبعاد المميزة، ويُعتقد أنها مسؤولة بشكل كبير عن استقرار وخصائص السيكلوتيدات. [ 5 ]

التخليق الحيوي

تُصنّع الببتيدات الحلقية في النباتات عبر عملية من خطوتين؛ الأولى هي تحويل سلسلة ببتيدية خطية، والثانية هي تحويلها إلى بنية حلقية من خلال نشاط إنزيم شبيه بالبروتياز أو بطرق أخرى. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]

بعض الببتيدات، مثل السيكلوتيدات، هي منتجات مشفرة جينياً تُستخلص من معالجة بروتينات طليعية أكبر حجماً. يتكون التركيب العام للبروتين الطليعي من تسلسل إشارة الشبكة الإندوبلازمية، ومنطقة أولية غير محفوظة، ومنطقة محفوظة للغاية تُعرف باسم التكرار الطرفي الأميني (NTR)، ونطاق السيكلوتيد الناضج، وأخيراً ذيل طرفي كربوكسيلي قصير كاره للماء. [ 9 ] [ 10 ]

الخصائص والتطبيقات

تميل الببتيدات الحلقية إلى أن تكون شديدة المقاومة لعملية الهضم، مما يجعلها ذات أهمية للعلماء الذين يعملون على تطوير أدوية فموية جديدة. [ 11 ]

ومن الأمثلة على ذلك:

انظر أيضاً

مراجع

  1. صالحي، ديفيد؛ مظفري، ساغار؛ زغبي، خالد؛ لوهان، سانديب؛ ماندال، دينديال؛ تيواري، راكيش ك.؛ بارانغ، كيكافوس (29-03-2022). "ببتيدات أمفيباثية تخترق الخلايا وتحتوي على أحماض أمينية طبيعية وغير طبيعية كعوامل توصيل دوائي" . الخلايا . 11 (7): 1156. doi : 10.3390/cells11071156 . ISSN 2073-4409 . PMC 8997995. PMID 35406720 .   
  2. جنسن، كنود (1 سبتمبر 2009). تصميم الببتيدات والبروتينات للتطبيقات الصيدلانية الحيوية . جون وايلي وأولاده. ISBN 9780470749715.
  3. ^ وينيان، شو؛ يونيو، تانغ؛ تشانغجيو، جي؛ ونجون، هو؛ نينغهوا، تان (2008). "تطبيق الطريقة الكيميائية TLC للكشف عن السيكلوتيدات في النباتات". نشرة العلوم . 53 (11): 1671– 1674. بيب كود : 2008SciBu..53.1671W . دوى : 10.1007/s11434-008-0178-8 .
  4. بورثويك، أ.د. (مايو 2012). "2،5-ديكيتوبيبرازين: التخليق، والتفاعلات، والكيمياء الطبية، والمنتجات الطبيعية النشطة بيولوجيًا". مراجعات كيميائية . 112 (7): 3641-3716 . doi : 10.1021/cr200398y . PMID 22575049 . 
  5. دي فير، سيمون جيه؛ كان، مينغ-وي؛ كريك، ديفيد جيه. (26-12-2019). "السيكلوتيدات: من البنية إلى الوظيفة" . مراجعات كيميائية . 119 (24): 12375-12421 . doi : 10.1021/acs.chemrev.9b00402 . ISSN 0009-2665 . PMID 31829013 .  
  6. باربر، كارلا جيه إس؛ بوجارا، باريشكومار تي؛ ريد، داروين دبليو؛ تشيوتشا، شيلا؛ تشانغ، هايكسيا؛ كوفيلو، باتريك إس. (2013). "التخليق الحيوي ثنائي الخطوات للببتيدات الحلقية من سلائف خطية في أحد أفراد عائلة نباتات القرنفلية يتضمن عملية التدوير بواسطة إنزيم شبيه ببروتياز السيرين" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 288 (18): 12500-12510 . doi : 10.1074/jbc.M112.437947 . PMC 3642298. PMID 23486480 .  
  7. وينيان شو وآخرون (2011). "آليات متنوعة في إنتاج الببتيدات الحلقية من سلائف مُصنّعة بشكل مستقل عن مُصنّعات الببتيدات غير الريبوزومية" . مجلة Acta Biochimica et Biophysica Sinica . 43 (10): 757–762 . doi : 10.1093/abbs/gmr062 . PMC 3180235. PMID 21764803 .   
  8. وينيان شو؛ وآخرون . "الببتيدات الحلقية النباتية والآليات الحيوية المحتملة" . {{cite journal}}يتطلب الاستشهاد بالمجلة ( مساعدة )|journal=
  9. داتون، جولي ل.؛ ريندا، روزماري ف.؛ واين، كليمنت؛ كلارك، ريتشارد ج.؛ دالي، نوريل ل.؛ جينينغز، كاميرون ف.؛ أندرسون، مارلين أ.؛ كريك، ديفيد ج. (نوفمبر 2004). "العناصر البنيوية والتسلسلية المحفوظة المتورطة في معالجة البروتينات الدائرية المشفرة جينياً" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 279 (45): 46858-46867 . doi : 10.1074/jbc.M407421200 . PMID 15328347 . 
  10. شافي، توماس؛ هاريس، كارين؛ أندرسون، مارلين (2015)، "التخليق الحيوي للسيكلوتيدات" ، التقدم في البحوث النباتية ، المجلد 76، إلسيفير، الصفحات 227-269 ، doi : 10.1016/bs.abr.2015.08.005 ، ISBN   978-0-12-800030-4تم الاطلاع عليه بتاريخ 25 سبتمبر 2024
  11. ديفيد ج. كريك (17 مارس 2006). "البروتينات السلسة تُحكم ربط أطرافها غير المترابطة". مجلة ساينس . 311 (5767): 1563-1567 . doi : 10.1126/science.1125248 . PMID 16543448. S2CID 82425866 .