ديوكسي ريبونوكلياز 1
إنزيم ديوكسي ريبونوكلياز I (يُشار إليه عادةً باسم DNase I ) هو إنزيم نووي داخلي من عائلة DNase، ويُشفّر بواسطة الجين البشري DNASE1 . [ 2 ] يعمل DNase I كإنزيم نووي يقطع الحمض النووي DNA بشكل تفضيلي عند روابط الفوسفودايستر المجاورة لنيوكليوتيد البيريميدين ، مُنتجًا عديدات نيوكليوتيدات منتهية بمجموعة فوسفات في الطرف 5' مع مجموعة هيدروكسيل حرة في الموضع 3'، ويُنتج في المتوسط رباعيات نيوكليوتيدات. يعمل هذا الإنزيم على الحمض النووي أحادي السلسلة، والحمض النووي ثنائي السلسلة، والكروماتين . بالإضافة إلى دوره كإنزيم نووي داخلي مُنظِّم للنفايات ، يُعتقد أنه أحد إنزيمات ديوكسي ريبونوكلياز المسؤولة عن تفتيت الحمض النووي DNA أثناء موت الخلايا المبرمج (الاستماتة) . [ 3 ]
يرتبط إنزيم DNase I ببروتين الأكتين الهيكلي الخلوي . ويرتبط بجزيئات الأكتين الأحادية بألفة عالية جدًا (أقل من نانومولار) ، وببوليمرات الأكتين بألفة أقل. وظيفة هذا التفاعل غير واضحة. مع ذلك، ولأن إنزيم DNase I المرتبط بالأكتين غير نشط إنزيميًا، فقد يكون معقد DNase- أكتين شكلًا تخزينيًا لإنزيم DNase I يمنع تلف المعلومات الوراثية. يُخزن هذا البروتين في حبيبات الزيموجين في الغلاف النووي، ويعمل عن طريق شطر الحمض النووي بطريقة داخلية.
تم تحديد ستة أليلات سائدة مشتركة على الأقل من جين DNASE 1، من DNASE1*1 إلى DNASE1*6، مع تمثيل تسلسل DNASE1*2 في هذا السجل. وقد ارتبطت الطفرات في هذا الجين، بالإضافة إلى عامل تعطيل ناتجه الإنزيمي، بمرض الذئبة الحمراء الجهازية (SLE) ، وهو مرض مناعي ذاتي . [ 4 ] [ 5 ] يُستخدم شكل مُعاد التركيب من هذا البروتين لعلاج أحد أعراض التليف الكيسي عن طريق تحليل الحمض النووي خارج الخلوي في البلغم وتقليل لزوجته. [ 6 ] وقد لوحظت متغيرات نسخ بديلة لهذا الجين، ولكن لم يتم تحديدها بدقة. [ 2 ]
في علم الجينوم
في علم الجينوم، يُعتقد أن المواقع شديدة الحساسية لـ DNase I تتميز بالكروماتين المفتوح والمتاح؛ لذلك، فإن اختبار حساسية DNase I هو منهجية مستخدمة على نطاق واسع في علم الجينوم لتحديد المناطق التي من المحتمل أن تحتوي على جينات نشطة [ 7 ].
خصوصية تسلسل DNase I
أُفيد مؤخرًا أن إنزيم DNase I يُظهر مستويات معينة من التخصص التسلسلي، والتي قد تعتمد على الظروف التجريبية. [ 8 ] وعلى عكس الإنزيمات الأخرى التي تتمتع بتخصص عالٍ تجاه الركائز، فإن إنزيم DNase I لا يقوم بالقطع بتخصص تسلسلي مطلق. ومع ذلك، يكون القطع في المواقع التي تحتوي على C أو G في نهايتها 3' أقل كفاءة.
مراجع
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- 1 2 "Entrez Gene: DNASE1 deoxyribonuclease I" .
- ↑ ساميجيما، ك. وإيرنشو، و.س. (2005). "تدمير الجينوم: دور النيوكليازات أثناء موت الخلايا المبرمج". نات ريف مول سيل بيول . 6 (9): 677-88 . doi : 10.1038/nrm1715 . PMID 16103871. S2CID 13948545 .
- ↑ حكيم أ، فورنروهر ب ج، أمان ك، لاوب ب، عابد يو أ، برينكمان ف، هيرمان م، فول ر إي، زيكلينسكي أ (2010). "يرتبط ضعف تحلل الفخاخ خارج الخلوية للعدلات بالتهاب الكلية الذئبي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 107 ( 21): 9813-9818 . Bibcode : 2010PNAS..107.9813H . doi : 10.1073/pnas.0909927107 . PMC 2906830. PMID 20439745 .
- ↑ ياسوتومو ك، هوريوكي ت، كاجامي س، وآخرون (2001). "طفرة DNASE1 لدى مرضى الذئبة الحمامية الجهازية". نات . جينيت . 28 (4): 313-314 . doi : 10.1038/91070 . PMID 11479590. S2CID 21277651 .
- ↑ شاك إس، كابون دي جيه، هيلميس آر، وآخرون (1991). "إنزيم ديوكسي ريبونيوكلياز البشري المؤتلف الأول يقلل من لزوجة بلغم التليف الكيسي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 87 (23): 9188-9192 . doi : 10.1073/pnas.87.23.9188 . PMC 55129. PMID 2251263 .
- ↑ بويل إيه بي، ديفيس إس، شولها إتش بي، ميلتزر بي، مارغوليس إي إتش، وينغ زد، فوري تي إس، كروفورد جي إي (2008). " رسم خرائط عالية الدقة وتوصيف الكروماتين المفتوح عبر الجينوم" . مجلة الخلية . 132 (2): 311-322 . doi : 10.1016/j.cell.2007.12.014 . PMC 2669738. PMID 18243105 .
- ↑ كوهي، هاشم؛ داون، توماس أ.؛ هوبارد، تيم ج.؛ مارينو-راميريز، ليوناردو (26 يوليو 2013). " مجموعات بيانات إمكانية الوصول إلى الكروماتين تُظهر تحيزًا بسبب خصوصية تسلسل إنزيم DNase I" . PLOS ONE . 8 (7) e69853. Bibcode : 2013PLoSO...869853K . doi : 10.1371/journal.pone.0069853 . PMC 3724795. PMID 23922824 .
للمزيد من القراءة
- لاخمان ، بي. جيه. (2003). "الذئبة وديسوكسي ريبونوكلياز". الذئبة . 12 (3): 202-206 . doi : 10.1191/0961203303lu357xx . PMID 12708782. S2CID 43058677 .
- ياسودا تي، أوازو إس، ساتو دبليو، وآخرون (1991). "ديوكسي ريبونوكلياز متعدد الأشكال وراثيًا لدى الإنسان: تنقية، وتوصيف، وتعدد ديوكسي ريبونوكلياز I في البول". مجلة الكيمياء الحيوية 108 (3): 393-398 . doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123212 . PMID 2277032 .
- كيشي ك، ياسودا ت، إيكيهارا ي، وآخرون (1990). "تعدد أشكال إنزيم ديوكسي ريبونوكلياز I (DNase I) في مصل الدم البشري: أوجه التشابه في الأنماط بين الإنزيمات المتماثلة من المصل والبول والكلى والكبد والبنكرياس" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 47 (1): 121-126 . PMC 1683738. PMID 2349940 .
- كابش دبليو، مانهرز إتش جي، سوك دي، وآخرون (1990). "البنية الذرية لمركب الأكتين: دي إن إيه 1". نيتشر . 347 ( 6288): 37-44 . Bibcode : 1990Natur.347...37K . doi : 10.1038/347037a0 . PMID 2395459. S2CID 925337 .
- كيشي ك، ياسودا ت، أوازو س، ميزوتا ك (1989). "التعدد الشكلي الجيني لإنزيم ديوكسي ريبونوكلياز I في بول الإنسان". علم الوراثة البشرية . 81 (3): 295-297 . doi : 10.1007/BF00279009 . PMID 2921043. S2CID 20420713 .
- روزنسترايش دي إل، تو جيه إتش، كينكيد بي آر، وآخرون (1988). "مثبط إنترلوكين 1 مشتق من بول الإنسان. تشابه مع ديوكسي ريبونوكلياز 1" . مجلة الطب التجريبي . 168 (5): 1767-1779 . doi : 10.1084/jem.168.5.1767 . PMC 2189114. PMID 3263467 .
- ياسودا تي، نادانو د، تاكيشيتا إتش، وآخرون . (1995). “التحليل الجزيئي للأليل الثالث لتعدد أشكال الديوكسيريبونوكلياز البشري I”. آن. همم. جينيت . 59 (الجزء 2): 139-47 . دوى : 10.1111/j.1469-1809.1995.tb00737.x . بميد 7625762 . S2CID 43729378 .
- ياسودا تي، كيشي كيه، ياناغاوا واي، يوشيدا إيه (1995). "بنية جين ديوكسي ريبونوكلياز I البشري (DNase I): تحديد استبدال النيوكليوتيد الذي يُولّد تعدد الأشكال الجيني الكلاسيكي". حوليات علم الوراثة البشرية . 59 (الجزء 1): 1-15 . doi : 10.1111/j.1469-1809.1995.tb01601.x . PMID 7762978. S2CID 23914004 .
- ياسودا تي، نادانو دي، إيدا آر، وآخرون (1995). "تحديد الموقع الكروموسومي لجين ديوكسي ريبونوكلياز I البشري، DNASE 1 (DNL1)، على النطاق 16p13.3 باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل". علم الوراثة الخلوية . 70 ( 3-4 ): 221-223 . doi : 10.1159/000134038 . PMID 7789176 .
- ياسودا تي، نادانو دي، تاكيشيتا إتش، وآخرون (1995). "الأساس الجزيئي للتعدد الشكلي الجيني لإنزيم ديوكسي ريبونوكلياز I البشري: تحديد استبدال النيوكليوتيد الذي يُنتج الأليل الرابع". رسائل FEBS . 359 ( 2-3 ): 211-214 . Bibcode : 1995FEBSL.359..211Y . doi : 10.1016/0014-5793(95)00037-A . PMID 7867802. S2CID 21461181 .
- ياسودا تي، نادانو دي، تينجو إي، وآخرون (1996). "التنميط الجيني لتعدد أشكال ديوكسي ريبونوكلياز I البشري بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل". الرحلان الكهربائي . 16 (10): 1889-93 . doi : 10.1002/elps.11501601310 . PMID 8586059. S2CID 35528773 .
- إيدا ر، ياسودا ت، تاكيشيتا هـ، وآخرون (1996). "تحديد استبدال النيوكليوتيد الذي يُولّد الموقع متعدد الأشكال الرابع في ديوكسي ريبونوكلياز I البشري (DNase I)". علم الوراثة البشرية 98 ( 4): 415-418 . doi : 10.1007/s004390050231 . PMID 8792814. S2CID 6393565 .
- إيدا ر، ياسودا ت، أوياما م، وآخرون (1998). "الأليل الخامس لتعدد أشكال ديوكسي ريبونوكلياز I البشري (DNase I)". الرحلان الكهربائي . 18 (11): 1936-1939 . doi : 10.1002/elps.1150181108 . PMID 9420147. S2CID 8969865 .
- ياسودا تي، تاكيشيتا إتش، إيدا آر، وآخرون (1999). "أليل جديد، DNASE1*6، لتعدد أشكال ديوكسي ريبونوكلياز I البشري يشفر استبدال الأرجينين بالسيستين المسؤول عن عدم استقراره". مجلة بحوث الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية ، 260 (1): 280-283 . Bibcode : 1999BBRC..260..280Y . doi : 10.1006/bbrc.1999.0900 . PMID 10381379 .
- أوليڤيري م، داغا أ، كانتوني س، وآخرون (2001). "إنزيم ديوكسي ريبونيوكلياز الأول (DNase I) يُحفز تحلل الحمض النووي بين النيوكليوسومات في الخلايا البشرية التي تخضع للاستماتة الخلوية المُحفزة بالأدوية". المجلة الأوروبية لعلم المناعة 31 ( 3): 743-751 . doi : 10.1002/1521-4141(200103)31:3 < 743::AID - IMMU743 > 3.0.CO ; 2-9 . PMID 11241278. S2CID 32330090 .
- أوتربين إل آر، غريسافا بي، دومينغيز آر (2001). " البنية البلورية للأكتين غير المرتبط في حالة ADP". مجلة ساينس . 293 (5530): 708-11 . doi : 10.1126/science.1059700 . PMID 11474115. S2CID 12030018 .
- ياسوتومو ك، هوريوكي ت، كاجامي س، وآخرون (2001). "طفرة في جين DNASE1 لدى مرضى الذئبة الحمامية الجهازية". نات . جينيت . 28 (4): 313-314 . doi : 10.1038/91070 . PMID 11479590. S2CID 21277651 .
- بالويبر إي، غالا إم، أكتوريس ك، وآخرون (2001). "تفاعل الأكتين المُرتبط بالأدينوزين ثنائي الفوسفات الريبوزي مع بروتينات ربط الأكتين" . رسائل FEBS . 508 (1): 131-135 . Bibcode : 2001FEBSL.508..131B . doi : 10.1016/S0014-5793(01)03040-X . PMID 11707283. S2CID 7241702 .
- تسوتسومي إس، كانيكو واي، أساو تي، وآخرون (2002). "يوجد إنزيم ديوكسي ريبونيوكلياز 1 في الخلايا الرئيسية لمعدة الإنسان والفئران". مجلة علم الأنسجة والكيمياء النسيجية ، 33 ( 9-10 ): 531-535 . doi : 10.1023/A:1014999624430 . PMID 12005024. S2CID 10324827 .
روابط خارجية
- ديوكسي ريبونوكلياز+I في رؤوس الموضوعات الطبية (MeSH) التابعة للمكتبة الوطنية الأمريكية للطب
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 16
- EC 3.1.21
- ديوكسي ريبونوكلياز
