معهد علم الجينوم وعلم الأحياء التكاملي

📅 آخر تحديث: ٢٨ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٨ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 1 صور
الموسوعة الحرة

الحرم الجنوبي لمعهد علم الجينوم والبيولوجيا الجزيئية التابع لمجلس البحث العلمي والصناعي

معهد علم الجينوم والبيولوجيا التكاملية التابع لمجلس البحث العلمي والصناعي ( CSIR-IGIB ) هو معهد بحث علمي مكرس بشكل أساسي للبحوث البيولوجية. وهو جزء من مجلس البحث العلمي والصناعي (CSIR) في الهند. [ 1 ]

تأسس المعهد في عام 1977 باسم مركز التكنولوجيا البيوكيميائية مع التركيز الأساسي على البحوث البيوكيميائية، ولكنه حول تركيزه البحثي منذ ذلك الحين إلى علم الأحياء التكاملي.

موقع

يضم المعهد حرمين جامعيين في دلهي. الحرم الشمالي هو الأقدم بينهما، ويقع ضمن حرم جامعة دلهي ، على طريق مول مقابل قاعة اليوبيل. أما الحرم الجديد فيقع في جنوب دلهي ، على طريق ماثورا في سوخديف فيهار.

تاريخ

تأسس معهد علم الجينوم والبيولوجيا التكاملية (IGIB) عام 1977 تحت اسم مركز التكنولوجيا البيوكيميائية (CBT). وفي عام 1998، أُنشئت وحدة علم الجينوم الوظيفي ، مع تحول التركيز من البحوث الكيميائية إلى بحوث علم الجينوم. وفي عام 2002، أُعيد تسمية المعهد إلى "معهد علم الجينوم والبيولوجيا التكاملية". شغل سمير ك. براماشاري منصب المدير المؤسس، وتلاه راجيش س. جوخال وأنوراغ أغراوال . [ 2 ]

الإنجازات

في عام 2009، قام فريق من المعهد بتسلسل جينوم سمكة الزيبرا البرية ، والذي يبلغ طوله حوالي 1.7 مليار زوج قاعدي. وبذلك أصبحت هذه السمكة، التي موطنها الأصلي منطقة جبال الهيمالايا ، أول فقاري يتم تسلسل جينومه بالكامل في الهند، حيث كان العلماء الهنود سابقًا يقتصرون على تسلسل جينومات البكتيريا والنباتات. [ 3 ] [ 4 ]

في ديسمبر 2009، أجرى علماء في معهد علم الجينوم والبيولوجيا الجزيئية (IGIB) أول عملية إعادة تسلسل للجينوم البشري في الهند. [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] كما تعاون المعهد في فك شفرة أول جينوم سريلانكي [ 8 ] [ 9 ] وجينوم ماليزي. [ 10 ] والمعهد عضو في اتحاد الجينوم الشخصي المفتوح. [ 11 ]

جائحة كوفيد-19

يضطلع المعهد بدور رائد في فهم السلالات الجديدة من فيروس سارس-كوف-2 في الهند [ 12 ] [ 13 ] وفي جميع أنحاء العالم. [ 14 ] كما يحتفظ المعهد بعدد من الموارد المعلوماتية التي تُعدّ أساسية لتحديد وتوصيف السلالات الناشئة من فيروس سارس-كوف-2. [ 15 ] [ 16 ]

أفاد باحثون في المعهد عن أول نهج عالي الإنتاجية [ 17 ] يعتمد على تقنية التسلسل الجيني من الجيل التالي للكشف عن فيروس SARS-CoV-2 ودراسة وبائيته الجينية. [ 18 ] وقد استُخدم هذا النهج على نطاق واسع لفهم الوبائيات الجينية لفيروس SARS-CoV-2 في ولاية كيرالا ، [ 19 ] مما أثر بشكل كبير على السياسات والاستعدادات [ 20 ] في الولاية للحد من انتشار الوباء، فضلاً عن تطبيق سياسات قائمة على الأدلة. [ 21 ]

لعب المعهد دوراً أساسياً في ابتكار مفهوم المختبرات الضخمة لاختبارات كوفيد-19 والمراقبة الجينومية [ 22 ] ، والتي وفرت أيضاً البيانات الوبائية الجينية لولايات تشمل كيرالا [ 23 ] ، وأندرا براديش [ 24 ] ، وماهاراشترا [ 25 ] .

أبلغ باحثون في المعهد أيضًا عن أولى حالات الإصابة المتكررة بفيروس كوفيد-19 في البلاد [ 26 ] ، بالإضافة إلى تحديد سلالة جديدة من فيروس سارس-كوف-2 في الهند تُسمى I/A3i. [ 27 ] كما اكتشف باحثون في المعهد سلالة ناشئة تحمل طفرة N440K في البروتين الشوكي، والمرتبطة بالإفلات المناعي. [ 28 ] [ 29 ] وقد تم الحفاظ على مجموعة شاملة من الموارد الحاسوبية لفهم جينومات فيروس سارس-كوف-2 وعلم الأوبئة الجينية الخاص به. [ 16 ] كما أبلغ المعهد عن إحدى أولى الحالات التي تم تحديد خصائصها الجينية لعدوى اختراق لقاح كوفيد-19. [ 30 ]

لعب الباحثون في المعهد دوراً أساسياً في تطوير جهاز COVIDSure، [ 31 ] وهو عبارة عن مجموعة أدوات تعتمد على تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي لتشخيص كوفيد-19، ويستخدم الآن على نطاق واسع في الهند وتسوقه شركة Trivitron Healthcare. [ 32 ]

قام باحثون في معهد CSIR-IGIB بتطوير اختبار يُسمى FELUDA يعتمد على تقنية تحرير الجينات CRISPR، وهو اختبار عالي الكفاءة وسريع، لمواجهة محدودية قدرة البلاد على إجراء الاختبارات، وقد حصل على موافقة الهيئة العامة لمراقبة الأدوية في الهند . وقد تم ترخيص الاختبار لمجموعة تاتا لإنتاجه تجارياً. [ 33 ]

كما يلعب المعهد دوراً رائداً في التحالف الوطني لعلم جينوم كوفيد-19 [ 34 ] ويتولى صيانة موارد المعلوماتية ولوحات المعلومات. [ 15 ]

علم جينوم الأمراض الوراثية النادرة

أطلق المعهد برنامجًا فريدًا من نوعه لاستخدام أحدث تقنيات علم الجينوم لفهم الأمراض الوراثية النادرة في الهند، وريادته في تطبيق علم الجينوم في الطب الدقيق في العيادات. ومن بين البرامج التي تم إطلاقها في هذا الصدد برنامج "علم الجينوم لفهم الأمراض النادرة، شبكة التحالف الهندي" (GUaRDIAN). [ 35 ] وتُعدّ GUaRDIAN شبكة تعاونية واسعة النطاق تضم أطباء من مختلف أنحاء الهند، يسعون إلى استخدام علم الجينوم في الممارسة السريرية، بهدف فهم التركيب الجيني للأمراض الوراثية النادرة في الهند. [ 36 ]

يهدف هذا التحالف إلى استخدام أحدث تقنيات علم الجينوم لتمكين تحديد الاختلافات الجينية في الأمراض، ومساعدتها للأطباء على الوصول إلى تشخيص دقيق للأمراض الوراثية النادرة. وإلى جانب العمل الوثيق مع الأطباء، يسعى التحالف إلى تعزيز التعليم والتوعية، ونشر استخدام تقنيات علم الجينوم على نطاق واسع في البيئات السريرية، بالإضافة إلى وضع ونشر أعلى معايير توليد البيانات الجينومية وتفسيرها في الهند. [ 37 ]

خلال السنوات القليلة الماضية، تمكنت الشبكة من العمل عن كثب مع الأطباء لتقديم أدلة عملية على تطبيق علم الجينوم في الطب الدقيق. [ 38 ] [ 39 ] [ 40 ] كما يوجد برنامج شامل لإحالة المرضى. [ 41 ]

برنامج IndiGen للصحة العامة

يهدف برنامج IndiGen لعلم جينوم الصحة العامة [ 42 ] إلى إجراء تسلسل الجينوم الكامل لألف فرد هندي يمثلون مجموعات عرقية متنوعة من الهند. ستوفر البيانات المُولَّدة ضمن برنامج IndiGen أساسًا لترددات الأليلات للمتغيرات الجينية في علم الأوبئة الجينية، وستساعد في اتخاذ القرارات السياسية. ستشكل ترددات المتغيرات الجينية ذات الأهمية السريرية نموذجًا لتمكين أساليب التشخيص للأمراض الوراثية الشائعة، وكذلك لتحسين العلاجات من خلال علم الصيدلة الجينية. كما يُتاح مورد شامل يوفر إمكانية البحث في البيانات. [ 43 ]

مراكز التوسع (الفروع)

يقع الحرم الجامعي الرئيسي لمعهد علم الجينوم والبيولوجيا الجزيئية (IGIB) في شارع مول رود، نيودلهي، بالقرب من الحرم الجامعي الشمالي لجامعة دلهي. وقد أدى تحالف المعهد مع شركات التكنولوجيا الحيوية والصيدلانية إلى نموه وإنشاء مركزين فرعيين له، أحدهما في جنوب دلهي (ملحق IGIB في مركز TCGA، أوخلا) والآخر في غرب دلهي في ناراينا.

الاجتماعات الدولية

كان معهد علم الجينوم والبيولوجيا الجزيئية (IGIB) أحد المضيفين المشاركين للاجتماع الثالث عشر لمنظمة الجينوم البشري (HUGO) في عام 2008، والذي عقد في مركز حيدر أباد الدولي للمؤتمرات . [ 44 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ موقع مجلس البحوث العلمية والصناعية في الهند مؤرشف بتاريخ 27-09-2015 على موقع Wayback Machine .
  2. ↑ أنوراغ أغراوال (عالم طبي)
  3. ↑ صفحة ويب جينوم سمكة الزيبرا مؤرشفة في 19 يوليو 2018 في Wayback Machine 'معهد علم الجينوم وعلم الأحياء التكاملي' (IGIB)
  4. ↑ فك شفرة لغز الجينوم، صحيفة إنديان إكسبريس ، 5 يوليو 2009.
  5. ↑ علماء هنود يفككون شفرة الجينوم البشري، صحيفة إنديان إكسبريس ، 10 ديسمبر 2009
  6. ↑
  7. ↑ مجموعة من المقالات الإخبارية والبيانات الصحفية حول مشروع الجينوم الهندي ، 10 ديسمبر 2009
  8. ↑ "الجينوم السريلانكي" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 17 يناير 2013 .{{cite web}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link )
  9. ↑ ديساناياكي في إتش، ساماراكون بي إس، سكاريا الخامس، باتواري أ، سيفاسوبو إس، جوخال آر إس، وآخرون . (2012). “مشروع الجينوم الشخصي السريلانكي: نظرة عامة”. مجلة سريلانكا للمعلوماتية الطبية الحيوية . 1 (2): 4- 8. أُرشف بتاريخ 5 أبريل 2013 في أرشيف الإنترنت (Wayback Machine).
  10. ↑ "مستلزمات يوم الزفاف" .
  11. ↑ "اتحاد OpenPGx" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 18 ديسمبر 2017. تم الاطلاع عليه بتاريخ 7 نوفمبر 2018 .
  12. ↑ دانديكار، فيكاس. "الجينوم يلتقي بـ GitHub: باستخدام الأدوات التقنية، يتعقب صائدو الفيروسات في الهند قاتلاً متغير الشكل" . صحيفة إيكونوميك تايمز . تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 أغسطس 2021 .
  13. ↑ "كيف يتتبع أحد أبرز معاهد البحوث في الهند متحورات فيروس سارس-كوف-2 الجديدة" . صحيفة إنديان إكسبريس . 3 أغسطس 2021. تاريخ الاطلاع: 14 أغسطس 2021 .
  14. ↑ "تعرّف على الأشخاص الذين يحذرون العالم من سلالات كوفيد الجديدة" . مجلة إم آي تي ​​للتكنولوجيا . تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 أغسطس 2021 .
  15. 1 2 "المراقبة الجينومية لفيروس كوفيد-19" . clingen.igib.res.in . تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 أغسطس 2021 .
  16. 1 2 "علم الأوبئة الجيني لمسببات الأمراض الجديدة والناشئة في الهند" . clingen.igib.res.in . تم الاطلاع عليه بتاريخ 30 أكتوبر 2020 .
  17. ↑ «خطط جارية لإنشاء مختبرات ضخمة في أربع ولايات لتعزيز المراقبة» . صحيفة هندوستان تايمز . 24 سبتمبر 2020. تاريخ الاطلاع: 30 أكتوبر 2020 .
  18. ↑ بهويار، راهول سي؛ جاين، أبهيناف؛ سيغال، باراس؛ ديفاكار، موهيت كومار؛ شارما، ديشا؛ عمران، محمد؛ جولي، باني؛ رانجان، جيان؛ روفينا، ميرسي؛ شارما، سوميت؛ سيواش، سانجاي (2021). "الكشف عالي الإنتاجية وعلم الأوبئة الجيني لفيروس SARS-CoV-2 باستخدام تقنية التسلسل الجيني من الجيل التالي COVIDSeq" . PLOS One . 16 (2) e0247115. Bibcode : 2021PLoSO..1647115B . bioRxiv 10.1101/2020.08.10.242677 . doi : 10.1371/journal.pone.0247115 . PMC 7888613 .  
  19. ↑ مايا، سي. (12 سبتمبر 2020). "السفر بين الولايات جلب سلالات فيروس كورونا إلى ولاية كيرالا: دراسة" . صحيفة ذا هندو . ISSN 0971-751X . تاريخ الاسترجاع: 30 أكتوبر 2020 . 
  20. ↑ بهاجات، شاليني فينوجوبال (23 مايو 2021). "بينما تتعثر الهند، ترسم إحدى الولايات مسارها الخاص في مواجهة كوفيد-19" . صحيفة نيويورك تايمز . ISSN 0362-4331 . تاريخ الاسترجاع: 28 مايو 2021 . 
  21. ↑ «بيناراي يدعو إلى ارتداء الكمامات المزدوجة؛ المزيد من القيود مُخطط لها في ولاية كيرالا» . صحيفة إنديان إكسبريس . 1 مايو 2021. تاريخ الاطلاع: 28 مايو 2021 .
  22. ↑ كوشي، جاكوب (12 أغسطس 2020). "فيروس كورونا | مجلس البحوث العلمية والصناعية يقترح إنشاء "مختبرات ضخمة" لتعزيز اختبارات كوفيد-19" . صحيفة ذا هندو . الرقم الدولي الموحد للدوريات 0971-751X . تاريخ الاسترجاع 14 أغسطس 2021 . 
  23. ↑ رادهاكريشنان، تشاندني؛ ديفاكار، موهيت كومار؛ جاين، أبهيناف؛ فيسواناثان، براسانث؛ بهويار، راهول سي؛ جولي، باني؛ عمران، محمد؛ شارما، ديشا؛ روفينا، ميرسي؛ رانجان، جيان؛ سيغال، باراس (2021). "رؤى أولية حول علم الأوبئة الجيني لعزلات فيروس سارس-كوف-2 من ولاية كيرالا تشير إلى انتشار محلي من حالات دخول محدودة" . مجلة فرونتيرز إن جينيتكس . 12 630542. doi : 10.3389/fgene.2021.630542 . ISSN 1664-8021 . PMC 8010186. PMID 33815467 .   
  24. ↑ راني، بالافالي روجا؛ عمران، محمد؛ لاكشمي، ج. فيجايا؛ جولي، باني؛ أفسار، س.؛ جاين، أبهيناف؛ ديفاكار، موهيت كومار؛ سوريش، بانيام؛ شارما، ديشا؛ راجيش، نامبي؛ بهويار، راهول س. (3 أغسطس 2021). "رؤى من الجينومات وعلم الأوبئة الجيني لعزلات فيروس SARS-CoV-2 من ولاية أندرا براديش" . علم الأوبئة والعدوى . 149 e181. doi : 10.1017/S0950268821001424 . ISSN 0950-2688 . PMC 8367868 .  
  25. ↑ «ولاية ماهاراشترا تتواصل مع معهد علم الجينوم والبيولوجيا الجزيئية (IGIB) لإجراء تسلسل الجينوم لعينات فيروس كورونا» . صحيفة إنديان إكسبريس . 3 مايو 2021. تاريخ الاطلاع: 14 أغسطس 2021 .
  26. ↑ غوبتا، فيفيك؛ بهويار، راهول سي؛ جاين، أبهيناف؛ سريفاستافا، سوراب؛ أوبادياي، راشمي؛ عمران، محمد؛ جولي، باني؛ ديفاكار، موهيت كومار؛ شارما، ديشا؛ سيغال، باراس؛ رانجان، جيان (2020). "إعادة العدوى بدون أعراض لدى اثنين من العاملين في مجال الرعاية الصحية من الهند بفيروس كورونا 2 المسبب لمتلازمة الالتهاب التنفسي الحاد الوخيم، والمختلف جينيًا" . الأمراض المعدية السريرية . 73 (9): e2823– e2825 . doi : 10.1093/cid/ciaa1451 . PMC 7543380. PMID 32964927 .  
  27. ^ بانو، صوفيا؛ جولي، بني؛ موخيرجي، بايل؛ سينغ، بريا؛ خان، شجوفتا؛ زافيري، لاموك؛ شامبافي، ساكشي؛ جور، نامامي؛ ريدي، شاشيكالا؛ كافيري، ك؛ سرينيفاسان ، سيفاسوبرامانيان (2020). "مجموعة نشوءية متميزة من عزلات SARS-CoV-2 الهندية" . منتدى مفتوح للأمراض المعدية . 7 (11) منaa434. دوى : 10.1093/أوفيد/ofaa434 . بمك 7543508 . بميد 33200080 .  
  28. ^ “تم العثور على طفرة Covid-19 الهندية 'N440k' في ثلث جينومات الفيروس التاجي في ولاية أندرا براديش” . ديكان هيرالد . 27 ديسمبر 2020 . تم الاسترجاع في 28 ديسمبر 2020 .
  29. ↑ جولي، بني؛ روفينا، الرحمة؛ شامناث، عفراء؛ عمران، محمد؛ بهيار، راهول سي؛ ديفاكار، موهيت كومار؛ راني، بالافي روجا؛ رانجان، جيان؛ سيجال، باراس؛ شاندراسيخار، بولالا؛ أفسار، س. (26 ديسمبر 2020). “علم الأوبئة الوراثية للمتغيرات المرتبطة بالهروب المناعي من جينومات SARS-CoV-2 العالمية”. bioRxiv 10.1101/2020.12.24.424332 . 
  30. ^ ي، بينا فيلومينا؛ جولي، بني؛ جون، نيثو؛ بهيار، راهول سي؛ مجيد، نيشا؛ سينثيفيل، فيجنيشوار؛ ف، فيروز سي؛ روفينا، الرحمة؛ فاسوديفان، بيندو؛ عمران، محمد؛ فيسواناثان، براسانث (24 مايو 2021). "المسح الجيني لعدوى لقاح السارس- CoV-2 لدى العاملين في مجال الرعاية الصحية من ولاية كيرالا، الهند" . مجلة العدوى . 83 (2): 237-279 . دوى : 10.1016/j.jinf.2021.05.018 . ردمك 0163-4453 . بمك 8143909 . بميد 34044037 .   
  31. ↑ "تقنيات مجلس البحوث العلمية والصناعية للتخفيف من آثار كوفيد-19" (ملف PDF) . مجلس البحوث العلمية والصناعية . 14 أغسطس 2021.
  32. ↑ "مجموعة اختبار COVIDsure Multiplex Realtime RT-PCR | اختبار RT-PCR نوعي لفيروس كوفيد-19" . trivitron.com . تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 أغسطس 2021 .
  33. ^ راجالاكشمي، نيرانجانا (28 أكتوبر 2020). "موضح: كيف يعمل اختبار فيلودا لكوفيد-19 في الهند؟" . علم الأسلاك . تم الاسترجاع في 30 أكتوبر 2020 .
  34. ↑ "INSACOG | قسم التكنولوجيا الحيوية" . حكومة الهند، وزارة العلوم والتكنولوجيا . تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 سبتمبر 2021 .
  35. ↑ "شبكة تحالف الهند لعلم الجينوم لفهم الأمراض النادرة (GUaRDIAN)" . مؤرشف من الأصل في 16 مايو 2021. تم الاطلاع عليه في 17 سبتمبر 2015 .
  36. ↑ سيفاسوبو إس، سكاريا في، وآخرون (مجموعة غارديان) (سبتمبر 2019). "علم جينوم الأمراض الوراثية النادرة - تجارب من الهند" . علم الجينوم البشري . 14 (1) 52. doi : 10.1186/s40246-019-0215-5 . PMC 6760067. PMID 31554517 .   
  37. ↑ سكاريا ف، سيفاسوبو س (2015). تحليل وتفسير تسلسل الإكسوم - دليل للأطباء ( الطبعة الأولى). دار ريدرز بارادايس. رقم ISBN  978-93-82110-58-3أُرشف من الأصل في 12 أبريل 2016. تم الاطلاع عليه في 17 سبتمبر 2015 .
  38. ^ غوبتا أ، شارما واي كيه، فيلاريكال إس كيه، جاياراجان آر، ديكسيت الخامس، فيرما أ، وآخرون . (أبريل 2016). "التسلسل الكامل للإكسوم يحل معضلة التشخيص في حالة نادرة من داء النهايات الثؤلولية المتفرقة" . مجلة الأكاديمية الأوروبية للأمراض الجلدية والتناسلية . 30 (4): 695– 7. دوى : 10.1111/jdv.12983 . بميد 25622760 . S2CID 35181817 .   
  39. ↑ غوبتا أ، شارما ي، ديو ك، فيلاريكال س، جاياراجان ر، ديكسيت ف، وآخرون (2015). "تقرير حالة: يساعد تسلسل الإكسوم الكامل في التشخيص الجزيئي الدقيق لدى أشقاء يعانون من حالة نادرة من التزامن بين تضاعف 22q12 الموروث من الأب وداء السماك غير المتلازمي المتنحي" . F1000Research . 4 : 446. doi : 10.12688/f1000research.6779.1 . PMC 4648218. PMID 26594337 .   
  40. ↑ فيلاريكال إس كيه، باتواري إيه، سينغ إم، كوماري آر، فاروق إم، ماستر دي سي، وآخرون (2014). "يكشف تسلسل الإكسوم عن طفرة جديدة، p.L325H، في جين KRT5 المرتبط بمرض انحلال البشرة الفقاعي البسيط من نوع كوبنر السائد وراثيًا في عائلة كبيرة من غرب الهند" . تنوع الجينوم البشري . 1 (1) 14007. doi : 10.1038/hgv.2014.7 . PMC 4785511. PMID 27081501 .   
  41. ↑ "صفحة إحالة المرضى - علم الجينوم لفهم الأمراض النادرة - شبكة التحالف الهندي (GUaRDIAN)" . مؤرشفة من الأصل في 4 مارس 2016. تم الاطلاع عليها في 17 سبتمبر 2015 .
  42. ↑ "علم الجينوم من أجل الصحة العامة" . sites.google.com . تم الاطلاع عليه بتاريخ 3 سبتمبر 2019 .
  43. ^ جاين، ابهيناف؛ بهيار، راهول سي؛ باندير، كافيتا؛ ميشري، أنوشري؛ شارما، ديشا؛ عمران، محمد؛ سينثيفيل، فيجنيشوار؛ ديفاكار، موهيت كومار؛ روفينا، الرحمة؛ جولي، بني؛ باترا، أروشي (2020). "IndiGenomes: مورد شامل للمتغيرات الجينية من أكثر من 1000 جينوم هندي" . أبحاث الأحماض النووية . 49 (د1): د1225 – د1232. دوى : 10.1093/نار/gkaa923 . بمك 7778947 . بميد 33095885 .  
  44. ↑ موقع HGM-2008 مؤرشف في 2 أكتوبر 2016 على موقع Wayback Machine .