مراقبة الحمض النووي الريبوزي المرسال

📅 آخر تحديث: ٢٨ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٨ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 6 صور
الموسوعة الحرة

آليات مراقبة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) هي مسارات تستخدمها الكائنات الحية لضمان دقة وجودة جزيئات الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA). توجد عدة آليات مراقبة داخل الخلايا، تعمل في مراحل مختلفة من مسار تكوين الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) للكشف عن النسخ التي لم تتم معالجتها بشكل صحيح وتفكيكها.

ملخص

تُعدّ ترجمة نسخ الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) إلى بروتينات جزءًا أساسيًا من المبادئ المركزية لعلم الأحياء الجزيئي . مع ذلك، فإن جزيئات mRNA عُرضة للعديد من أخطاء الدقة التي قد تُؤدي إلى أخطاء في ترجمة mRNA إلى بروتينات عالية الجودة . [ 1 ] آليات مراقبة الحمض النووي الريبوزي هي طرق تستخدمها الخلايا لضمان جودة ودقة جزيئات mRNA. [ 2 ] ويتحقق ذلك عمومًا من خلال وسم جزيئات mRNA الشاذة لتحليلها بواسطة مختلف النيوكليازات الداخلية . [ 3 ]

تم توثيق مراقبة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) في البكتيريا والخميرة. وفي حقيقيات النوى، من المعروف أن هذه الآليات تعمل في كل من النواة والسيتوبلازم . [ 4 ] تؤدي فحوصات دقة جزيئات mRNA في النواة إلى تحلل النسخ غير المعالجة بشكل صحيح قبل تصديرها إلى السيتوبلازم. وتخضع النسخ لمزيد من المراقبة بمجرد وصولها إلى السيتوبلازم. تقيّم آليات المراقبة السيتوبلازمية نسخ mRNA بحثًا عن وجود أو غياب كودونات التوقف المبكرة. [ 3 ] [ 4 ]

من المعروف حاليًا أن ثلاث آليات مراقبة تعمل داخل الخلايا : مسار تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول بوساطة الهراء (NMD)؛ ومسارات تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول بوساطة عدم التوقف (NSD)؛ ومسار تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول بوساطة عدم الذهاب (NGD).

تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول بوساطة الهراء

يُعدّ UPF1 إنزيمًا حالًا للولب محفوظًا ، ويخضع لعملية فسفرة أثناء عملية تحلل الحمض النووي الريبوزي الوسيط (NMD). ويُحفّز هذه الفسفرة بواسطة كيناز SMG1. تتطلب هذه العملية وجود UPF2 وUPF3. أما إزالة الفسفرة من UPF1 فتُحفّزها بروتينات SMG5 وSMG6 وSMG7. [ 5 ]

ملخص

تُعدّ آلية تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) بوساطة كودونات التوقف المبكر (PTCs) آليةً أساسيةً في الكشف عن نسخ mRNA التي تحتوي على كودونات توقف مبكرة (PTCs) وتحللها. تنشأ هذه الكودونات في الخلايا عبر آلياتٍ مختلفة، منها: الطفرات الجرثومية في الحمض النووي، والطفرات الجسدية في الحمض النووي، وأخطاء النسخ ، وأخطاء معالجة mRNA بعد النسخ. [ 5 ] [ 6 ] قد يؤدي عدم التعرف على هذه النسخ من mRNA وتحللها إلى إنتاج بروتينات مبتورة، ما قد يُلحق الضرر بالكائن الحي. وبتحفيز تحلل عديدات الببتيد المبتورة من الطرف الكربوكسيلي ، تحمي آلية NMD الخلايا من التأثيرات الضارة للطفرات السائدة السلبية واكتساب الوظيفة . [ 7 ] وقد ثبت تورط كودونات التوقف المبكرة في حوالي 30% من الأمراض الوراثية ؛ لذا، تلعب آلية NMD دورًا حيويًا في ضمان بقاء الكائن الحي ولياقته. [ 8 ] [ 9 ]

يتشكل مُركّب مراقبة يتألف من بروتينات مختلفة ( eRF1 ، eRF3 ، Upf1 ، Upf2، وUpf3) ويقوم بفحص الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) بحثًا عن كودونات التوقف المبكرة. [ 5 ] ويبدأ تشكل هذا المُركّب عند توقف الترجمة المبكر. فإذا تم الكشف عن كودون توقف مبكر، يتم إرسال إشارة إلى نسخة mRNA للتحلل - أي أن عملية الكشف مرتبطة بالتحلل. [ 3 ] [ 10 ] [ 11 ]

تم تحديد سبعة جينات smg (smg1-7) وثلاثة جينات UPF (Upf1-3) في الخميرة Saccharomyces cerevisiae والديدان Caenorhabditis elegans كعوامل أساسية مؤثرة في عملية NMD. [ 12 ] [ 13 ] جميع هذه الجينات محفوظة في ذبابة الفاكهة Drosophila melanogaster وفي الثدييات الأخرى، حيث تلعب أدوارًا حاسمة في NMD. توجد ثلاثة مكونات محفوظة في عملية NMD في جميع حقيقيات النوى. [ 14 ] وهي معقدات Upf1/SMG-2 وUpf2/SMG-3 وUpf3/SMG-4. يُعد Upf1/SMG-2 بروتينًا فسفوريًا في الكائنات متعددة الخلايا، ويُعتقد أنه يُساهم في NMD من خلال نشاطه الفسفوري. مع ذلك، لا تزال التفاعلات الدقيقة بين هذه البروتينات وأدوارها في NMD محل جدل. [ 11 ] [ 12 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ]

الآلية في الثدييات

تتم عملية تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول غير المنطقي في الثدييات عن طريق وصلة الإكسون-إكسون. تتميز هذه الوصلة بمجموعة من البروتينات التي تُشكل مُركب وصلة الإكسون (EJC). يقوم مُركب وصلة الإكسون (EJC) بتجنيد بروتين UPF1/SMG بواسطة عوامل النسخ eRF1/eRF3. تؤدي تفاعلات هذه البروتينات إلى تجميع مُركب المراقبة. هذا المُركب هو المسؤول في النهاية عن تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول غير المنطقي. [ 5 ]

يجب التمييز بين كودون التوقف المبكر وكودون التوقف الطبيعي، بحيث يُحفز الأول فقط استجابة تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA). وقد لوحظ أن قدرة كودون التوقف المبكر على إحداث تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول تعتمد على موقعه النسبي بالنسبة لعنصر التسلسل اللاحق والبروتينات المرتبطة به. [ 1 ] أظهرت الدراسات أن النيوكليوتيدات التي تقع على بُعد أكثر من 50-54 نيوكليوتيدًا قبل وصلة الإكسون الأخيرة يمكنها استهداف الحمض النووي الريبوزي الرسول للتحلل. [ 1 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 17 ] أما تلك التي تقع بعد هذه المنطقة فلا تستطيع ذلك. وبالتالي، تقع كودونات التوقف المبكر على بُعد أكثر من 50-54 نيوكليوتيدًا قبل حدود الإكسون الأخيرة ، بينما تقع كودونات التوقف الطبيعية داخل الإكسونات الطرفية. [ 18 ] تُحدد مُركبات وصلة الإكسون (EJCs) حدود الإكسونات. تُعدّ معقدات وصل الإكسونات (EJCs) معقدات بروتينية متعددة تتجمع أثناء عملية التضفير في موضع يبعد حوالي 20-24 نيوكليوتيدًا عن موقع التضفير. [ 19 ] يوفر هذا المعقد معلومات الموقع اللازمة للتمييز بين كودونات التوقف المبكرة وكودونات التوقف الطبيعية. ويبدو أن التعرف على كودونات التوقف المبكرة يعتمد على تعريفات وصلات الإكسونات. يشير هذا إلى دور الجسيم التضفيري في تحلل الحمض النووي الريبوزي الوسيط (NMD) لدى الثدييات. [ 17 ] [ 20 ] وقد بحثت الدراسات إمكانية مشاركة الجسيم التضفيري في تحلل الحمض النووي الريبوزي الوسيط لدى الثدييات، وخلصت إلى أن هذا احتمال وارد. [ 18 ] علاوة على ذلك، لوحظ أن آليات تحلل الحمض النووي الريبوزي الوسيط لا تُفعّل بواسطة النسخ غير المنطقية الناتجة عن جينات لا تحتوي بشكل طبيعي على إنترونات (مثل: الهيستون H4، وHsp70، ومستقبل الميلانوكورتين-4). [ 7 ]

عندما يصل الريبوسوم إلى موقع إنهاء الترجمة المبكر (PTC)، يتفاعل عاملَا الترجمة eRF1 وeRF3 مع معقدات EJC المتبقية عبر جسر متعدد البروتينات. [ 21 ] وتُعد تفاعلات UPF1 مع معقد الإنهاء ومع UPF2 /UPF3 في معقدات EJC المتبقية بالغة الأهمية. فهذه التفاعلات هي التي تُوجه mRNA للتحلل السريع بواسطة النيوكليازات الداخلية. [ 18 ] [ 21 ]

يُفترض أن تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) بوساطة كودونات التوقف غير المنطقية في اللافقاريات يتم بوساطة وجود منطقة غير مترجمة زائفة في الطرف 3' (3'UTR). وتتميز هذه المناطق الزائفة عن المناطق الطبيعية التي تلي كودونات التوقف الطبيعية. ويعود هذا الاختلاف إلى غياب البروتينات الرابطة الموجودة عادةً في المناطق الطبيعية، ومنها بروتين ربط ذيل عديد الأدينين (PABP). [ 5 ]

الآلية في اللافقاريات

أظهرت دراسات أجريت على كائنات حية مثل الخميرة ( Saccharomyces cerevisiae) وذبابة الفاكهة (Drosophila melanogaster) والديدان الأسطوانية (Caenorhabditis elegans) أن التعرف على كودونات التوقف المبكرة (PTC) في اللافقاريات لا يعتمد على حدود الإكسونات. [ 20 ] تشير هذه الدراسات إلى أن تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول غير الطبيعي (NMD) في اللافقاريات يحدث بشكل مستقل عن عملية التضفير. ونتيجة لذلك، فإن معقدات وصل الإكسونات (EJCs)، المسؤولة عن تحديد حدود الإكسونات، ليست ضرورية في تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول غير الطبيعي في اللافقاريات. [ 3 ] وقد طُرحت عدة نماذج لتفسير كيفية تمييز كودونات التوقف المبكرة عن كودونات التوقف الطبيعية في اللافقاريات. أحد هذه النماذج يقترح وجود عنصر تسلسلي في اتجاه المصب يعمل بشكل مشابه لوصلات الإكسونات في الثدييات. [ 11 ] ويقترح نموذج آخر أن سمة شائعة في الحمض النووي الريبوزي الرسول، مثل ذيل متعدد الأدينين في الطرف 3'، قد توفر المعلومات الموضعية اللازمة للتعرف. [ 22 ] يقترح نموذج آخر، يُطلق عليه اسم "نموذج 3'UTR الزائف"، إمكانية التمييز بين إنهاء الترجمة المبكر والإنهاء الطبيعي بفضل خصائص جوهرية قد تسمح له بالتعرف على وجوده في بيئة غير مناسبة. [ 3 ] ومع ذلك، لم يتم إثبات هذه الآليات بشكل قاطع حتى الآن.

الآلية في النباتات

توجد آليتان للتعرف على كودون إنهاء الترجمة المبكر (PTC) في النباتات: إما بناءً على بُعده عن مُركَّب وصل الإكسون (EJC) (كما هو الحال في الفقاريات)، أو بناءً على ذيل البولي-أ. وتحفز آلية تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) في النباتات تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول الذي يحتوي على منطقة غير مترجمة 3' (3'UTR) أطول من 300 نيوكليوتيد، ولذلك فإن نسبة الحمض النووي الريبوزي الرسول ذي المناطق غير المترجمة 3' الأطول أقل بكثير في النباتات مقارنةً بالفقاريات. [ 23 ] [ 24 ]

تجنب الأمراض العصبية العضلية

يُعتقد عمومًا أن جزيئات mRNA التي تحمل طفرات غير منطقية تُستهدف للتحلل عبر مسارات NMD. ويبدو أن وجود كودون التوقف المبكر هذا، على بُعد حوالي 50-54 نيوكليوتيدًا من الطرف 5' لوصلة الإكسون، هو المحفز للتحلل السريع؛ ومع ذلك، لوحظ أن بعض جزيئات mRNA التي تحمل كودون توقف مبكرًا قادرة على تجنب الكشف والتحلل. [ 17 ] [ 25 ] بشكل عام، تمتلك جزيئات mRNA هذه كودون التوقف في وقت مبكر جدًا من إطار القراءة (أي أن كودون التوقف المبكر قريب من كودون البدء AUG). ويبدو هذا متناقضًا مع النموذج المقبول حاليًا لـ NMD، حيث أن هذا الموضع يقع على بُعد 5' كبير من وصلة الإكسون-إكسون. [ 26 ]

وقد ثبت ذلك في بروتين بيتا غلوبولين. إذ أن جزيئات mRNA الخاصة ببروتين بيتا غلوبولين، والتي تحتوي على طفرة توقف في بداية الإكسون الأول من الجين، تكون أكثر استقرارًا من جزيئات mRNA الحساسة لآلية NMD. ولا تزال الآلية الدقيقة لتجنب الكشف غير معروفة. وقد أشير إلى أن البروتين الرابط للبولي أدينين (PABP) يلعب دورًا في هذا الاستقرار. [ 27 ] كما أظهرت دراسات أخرى أن وجود هذا البروتين بالقرب من كودون التوقف المبكر (PTC) القريب من كودون البدء AUG يعزز استقرار جزيئات mRNA الحساسة لآلية NMD. ولوحظ أن هذا التأثير الوقائي لا يقتصر على محفز بروتين بيتا غلوبولين فقط. [ 25 ] وهذا يشير إلى أن آلية تجنب آلية NMD هذه قد تكون شائعة في أنواع أخرى من الأنسجة لمجموعة متنوعة من الجينات. وقد يتطلب الأمر إعادة النظر في النموذج الحالي لآلية NMD بعد إجراء المزيد من الدراسات.

تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) بوساطة غير متوقفة

ملخص

mRNA غير المتوقف: يؤدي ترجمة mRNA بدون كودون توقف إلى ترجمة الريبوسوم إلى منطقة ذيل البولي أدينين 3'، مما ينتج عنه توقف الريبوسوم. يتم إنقاذ الريبوسوم عبر مسارين مختلفين، وتعتمد الآليات على وجود أو غياب بروتين Ski7. [ 28 ]

تُشارك عملية التحلل غير المتوقف (NSD) في الكشف عن نسخ mRNA التي تفتقر إلى كودون التوقف وتحللها. [ 29 ] [ 30 ] قد تنشأ هذه النسخ من mRNA من آليات مختلفة، مثل إضافة الأدينين المبكر إلى الطرف 3' أو إشارات إضافة عديد الأدينين الخفية ضمن المنطقة المشفرة للجين. [ 31 ] يُشكل غياب كودون التوقف مشكلة كبيرة للخلايا، حيث تتوقف الريبوسومات المسؤولة عن ترجمة mRNA عند الطرف 3'، مما يمنعها من إخراج mRNA. [ 32 ] وبالتالي، قد تُحاصر الريبوسومات مع mRNA غير المتوقف، فلا تكون متاحة لترجمة جزيئات mRNA الأخرى إلى بروتينات. تحل عملية التحلل غير المتوقف هذه المشكلة عن طريق تحرير الريبوسومات المتوقفة ووضع علامة على mRNA غير المتوقف لتحلله داخل الخلية بواسطة النيوكليازات. تتكون عملية التحلل غير المتوقف من مسارين متميزين، يُرجح أنهما يعملان معًا لتحلل mRNA غير المتوقف. [ 29 ] [ 30 ]

مسار التزلج 7

ينشط هذا المسار عند توفر بروتين Ski7 في الخلية. يُعتقد أن بروتين Ski7 يرتبط بالموقع A الفارغ للريبوسوم. يسمح هذا الارتباط للريبوسوم بطرد جزيء mRNA غير المتوقف العالق، مما يحرر الريبوسوم ويسمح له بترجمة نسخ أخرى. يرتبط بروتين Ski7 الآن بجزيء mRNA غير المتوقف، وهذا الارتباط هو الذي يوجه جزيء mRNA غير المتوقف للتعرف عليه بواسطة الإكسوسوم السيتوبلازمي . يعمل معقد Ski7-الإكسوسوم على إزالة ذيل الأدينين من جزيء mRNA بسرعة، مما يسمح للإكسوسوم بتحليل النسخة من الطرف 3' إلى الطرف 5'. [ 29 ] [ 30 ]

مسار غير مخصص للتزلج 7

لوحظ نوع ثانٍ من آلية NSD في الخميرة. في هذه الآلية، يؤدي غياب Ski7 إلى فقدان بروتينات PABP الرابطة لذيل البولي-أ بفعل الريبوسوم المسؤول عن الترجمة. ثم يؤدي إزالة هذه البروتينات إلى فقدان غطاء 5'm7G الواقي . ويؤدي فقدان هذا الغطاء إلى تحلل سريع للنسخة بواسطة إنزيم إكسونيوكلياز داخلي 5'-3' مثل XrnI. [ 30 ]

تدهور غير قابل للتنفيذ

تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول بوساطة عدم بدء العملية.

يُعدّ تحلل عدم الانتقال (NGD) أحدث آليات المراقبة المكتشفة. [ 33 ] ولذلك، لا يزال فهمه غير مكتمل. ورغم أن الأهداف الحقيقية لتحلل عدم الانتقال غير مفهومة جيدًا، إلا أنها تبدو أنها تتكون في الغالب من نسخ mRNA التي توقفت عليها الريبوسومات أثناء الترجمة. يمكن أن يحدث هذا التوقف نتيجةً لعوامل متنوعة، بما في ذلك البنى الثانوية القوية ، التي قد تعيق فعليًا حركة آلية الترجمة على طول النسخة. [ 33 ] من المرجح أن يرتبط Dom34/Hbs1 بالقرب من الموقع A للريبوسومات المتوقفة، وقد يُسهّل إعادة تدوير المركبات. [ 34 ] في بعض الحالات، تُقطع النسخة أيضًا بطريقة نووية داخلية بالقرب من موقع التوقف؛ ومع ذلك، لا تزال هوية الإنزيم النووي الداخلي المسؤول محل جدل. بعد ذلك، تُحلل جزيئات mRNA المجزأة بالكامل بواسطة الإكسوسوم بطريقة من 3' إلى 5'، وبواسطة Xrn1 بطريقة من 5' إلى 3'. [ 33 ] لا يُعرف حاليًا كيف تُحرر هذه العملية الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) من الريبوسومات، ومع ذلك، فإن Hbs1 يرتبط ارتباطًا وثيقًا ببروتين Ski7 الذي يلعب دورًا واضحًا في تحرير الريبوسومات في اضطراب نقص الانتباه مع فرط النشاط (NSD) بوساطة Ski7. يُفترض أن Hbs1 قد يلعب دورًا مشابهًا في اضطراب نقص الانتباه مع فرط النشاط (NGD). [ 5 ] [ 35 ]

تطور

من الممكن تحديد التاريخ التطوري لهذه الآليات من خلال ملاحظة حفظ البروتينات الرئيسية المتورطة في كل آلية. على سبيل المثال: يرتبط بروتين Dom34/Hbs1 بآلية NGD؛ [ 33 ] ويرتبط بروتين Ski7 بآلية NSD؛ [ 29 ] وترتبط بروتينات eRF بآلية NMD. [ 6 ] ولتحقيق هذه الغاية، أُجريت عمليات بحث مكثفة باستخدام برنامج BLAST لتحديد مدى انتشار هذه البروتينات في أنواع مختلفة من الكائنات الحية. وقد تبيّن أن بروتين NGD Hbs1 وبروتين NMD eRF3 موجودان فقط في حقيقيات النوى. مع ذلك، فإن بروتين NGD Dom34 موجود في جميع حقيقيات النوى والعتائق . يشير هذا إلى أن آلية NGD كانت على ما يبدو أول آلية متطورة لمراقبة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA). ويبدو أن بروتين NSD Ski7 يقتصر وجوده على أنواع الخميرة، مما يشير إلى أن آلية NSD هي أحدث آلية متطورة للمراقبة. وهذا يجعل آلية NMD، بشكل افتراضي، ثاني آلية متطورة للمراقبة. [ 36 ]

آلية تطورية مقترحة لتطوير بروتينات مكونات مراقبة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA). [ 36 ]

مراجع

  1. 1 2 3 عمراني ن، ساكس إم إس، جاكوبسون أ (يونيو 2006). "هراء مبكر: تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول يحل مشكلة ترجمية". مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 7 (6): 415-25 . doi : 10.1038/nrm1942 . PMID 16723977. S2CID 32685692 .  
  2. ↑ مور ، إم جيه (سبتمبر 2005). "من الميلاد إلى الموت: الحياة المعقدة للرنا المرسال في حقيقيات النوى". مجلة ساينس . 309 (5740): 1514-1518 . رمز Bibcode : 2005Sci...309.1514M . doi : 10.1126/science.1111443 . PMID 16141059. S2CID 35180502 .  
  3. 1 2 3 4 5 عمراني إن، غانيسان آر، كيرفيستين إس، مانغوس دي إيه، غوش إس، جاكوبسون إيه (نوفمبر 2004). "يعمل 3'-UTR المزيف على تعزيز الإنهاء الشاذ ويؤدي إلى تحلل الرنا المرسال بوساطة هراء" . طبيعة . 432 (7013): 112– 8. بيب كود : 2004Natur.432..112A . دوى : 10.1038 / طبيعة03060 . بميد 15525991 . 
  4. 1 2 3 فاسكن إم بي، كوربيت إيه إتش (يونيو 2005). "المعالجة أو الفناء: مراقبة الجودة في تكوين الحمض النووي الريبوزي الرسول". مجلة نيتشر للبيولوجيا التركيبية والجزيئية . 12 (6): 482-488 . doi : 10.1038/nsmb945 . PMID 15933735. S2CID 28033127 .  
  5. 1 2 3 4 5 6 7 Chang YF, Imam JS, Wilkinson MF (2007). "مسار مراقبة الحمض النووي الريبوزي (RNA) المُعتمد على تحلل الحمض النووي الريبوزي غير المنطقي". Annual Review of Biochemistry . 76 : 51–74 . doi : 10.1146/annurev.biochem.76.050106.093909 . PMID 17352659 . 
  6. 1 2 3 ريهوينكل ج، رايس ج، إيزورالدي إي (نوفمبر 2006). "تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول بوساطة كودون التوقف: الجينات المستهدفة والتنوع الوظيفي للمؤثرات". اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 31 (11): 639-46 . doi : 10.1016/j.tibs.2006.09.005 . PMID 17010613 . 
  7. 1 2 3 ماكوات، ل. إي. (فبراير 2004). "تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول بوساطة كودون التوقف: التضفير، والترجمة، وديناميكيات معقدات البروتين النووي الريبوزي الرسول". مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 5 (2): 89-99 . doi : 10.1038/nrm1310 . PMID 15040442. S2CID 29469668 .  
  8. ↑ هولبروك، جيه. إيه.، نيو-يليك، جي.، هينتز، إم. دبليو.، كولوزيك، إيه. إي. (أغسطس 2004). " تحلل الحمض النووي الريبوزي الوسيط بالهراء يقترب من التطبيق السريري". علم الوراثة الطبيعية . 36 (8): 801-808 . doi : 10.1038/ng1403 . PMID 15284851. S2CID 23188275 .  
  9. ↑ ميندل جيه تي، شريفي إن إيه، مايرز جيه إل، مارتينيز-موريلو إف، ديتز إتش سي (أكتوبر 2004). "مراقبة الهراء تنظم التعبير عن فئات متنوعة من نسخ الثدييات وتخفف الضوضاء الجينومية" . علم الوراثة الطبيعية . 36 (10): 1073-1078 . doi : 10.1038/ng1429 . PMID 15448691 . 
  10. ↑ ليجون، ف.، وماكوات، ل. إ. (يونيو 2005). "الروابط الآلية بين تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول بوساطة كودون التوقف وتضفير الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي في خلايا الثدييات". الرأي الحالي في بيولوجيا الخلية . 17 (3): 309-315 . doi : 10.1016/j.ceb.2005.03.002 . PMID 15901502 . 
  11. 1 2 3 كونتي إي، إيزورالدي إي (يونيو 2005). "تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول بوساطة كودون التوقف: رؤى جزيئية واختلافات آلية بين الأنواع". الرأي الحالي في بيولوجيا الخلية . 17 (3): 316-25 . doi : 10.1016/j.ceb.2005.04.005 . PMID 15901503 . 
  12. 1 2 كالي بي إم، كوتشما إس إل، لاثام جيه، أندرسون بي (فبراير 1999). "يُعدّ الجين smg-7 ضروريًا لمراقبة الحمض النووي الريبوزي الرسول في دودة Caenorhabditis elegans" . علم الوراثة . 151 (2): 605-16 . doi : 10.1093/genetics/151.2.605 . PMC 1460488. PMID 9927455 .  
  13. ^ ياماشيتا أ، كاشيما الأول، أونو إس (ديسمبر 2005). “دور SMG-1 في اضمحلال الرنا المرسال بوساطة هراء”. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - البروتينات والبروتيوميات . 1754 ( 1– 2): 305– 15. دوى : 10.1016/j.bbapap.2005.10.002 . بميد 16289965 . 
  14. 1 2 كيم واي كيه، فوريك إل، ديغروزيلير إل، ماكوات إل إي (يناير 2005). "يستقطب بروتين Staufen1 في الثدييات بروتين Upf1 إلى مناطق 3'UTR محددة من mRNA لتحفيز تحلل mRNA" . مجلة Cell . 120 (2): 195-208 . doi : 10.1016/j.cell.2004.11.050 . PMID 15680326 . 
  15. ↑ لونغمان د، بلاسترك ر.هـ، جونستون إ.ل، كاسيريس ج.ف (مايو 2007). "رؤى آلية وتحديد عاملين جديدين في مسار NMD في الدودة الأسطوانية C. elegans" . الجينات والتطور . 21 (9): 1075-1085 . doi : 10.1101/gad.417707 . PMC 1855233. PMID 17437990 .  
  16. ↑ غاتفيلد د، أونترهولزنر ل، سيكاريلي ف د، بورك ب، إيزورالدي إي (أغسطس 2003). "تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول بوساطة كودون التوقف في ذبابة الفاكهة: عند تقاطع مسارات الخميرة والثدييات" . مجلة EMBO . 22 (15): 3960-70 . doi : 10.1093/emboj/ cdg371 . PMC 169044. PMID 12881430 .  
  17. 1 2 3 ناجي إي، ماكوات إل إي (يونيو 1998). "قاعدة لتحديد موقع كودون الإنهاء داخل الجينات المحتوية على الإنترونات: متى يؤثر الكودون غير المنطقي على وفرة الحمض النووي الريبوزي". اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 23 (6): 198-199 . doi : 10.1016/S0968-0004(98)01208-0 . PMID 9644970 . 
  18. 1 2 3 بلاير تي جيه، ميلز دي جيه، هورتون إيه إيه (يونيو 1979). "بيروكسدة الدهون في الجزء الميكروسومي والدهون الميكروسومية المستخلصة من أورام الكبد المُستحثة بواسطة DAB" . المجلة البريطانية للسرطان . 39 (6): 773-778 . doi : 10.1128/mcb.18.9.5272 . PMC 109113. PMID 9710612 .  
  19. ↑ نيو-يليك جي، جيرينغ إن إتش، ثيرمان آر، فريد يو، هينتز إم دبليو، كولوزيك إيه إي (فبراير 2001). "التضفير وتكوين النهاية 3' في تعريف معقدات البروتين النووي الريبوزي الرسول (mRNPs) لبروتين بيتا غلوبين البشري القادرة على التحلل بوساطة كودون التوقف المبكر" . مجلة EMBO . 20 (3): 532-540 . doi : 10.1093/emboj/ 20.3.532 . PMC 133467. PMID 11157759 .  
  20. 1 2 Behm-Ansmant I, Gatfield D, Rehwinkel J, Hilgers V, Izaurralde E (مارس 2007). "دور محفوظ لبروتين ربط عديد الأدينين السيتوبلازمي 1 (PABPC1) في تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) بوساطة كودون التوقف" . مجلة EMBO . 26 (6): 1591-1601 . doi : 10.1038/sj.emboj.7601588 . PMC 1829367. PMID 17318186 .  
  21. 1 2 كاشيما، إي.، ياماشيتا، أ.، إيزومي، ن.، كاتاكا، ن.، موريشيتا، ر.، هوشينو، س.، أونو، م.، دريفوس، ج.، أونو، س. (فبراير 2006). " ارتباط مُركّب SMG-1-Upf1-eRF1-eRF3 (SURF) الجديد بمُركّب وصلة الإكسون يُحفّز فسفرة Upf1 وتحلّل mRNA بوساطة كودون التوقف" . الجينات والتطور . 20 (3): 355-367 . doi : 10.1101/gad.1389006 . PMC 1361706. PMID 16452507 .  
  22. ↑ بالانيسوامي ف، مورايس ك.س، ويلوز س.ج، ويلوز ج (مايو 2006). "يترسب النيوكليوفوسمين بشكل انتقائي على الحمض النووي الريبوزي الرسول أثناء إضافة ذيل عديد الأدينين" . مجلة نيتشر للبيولوجيا التركيبية والجزيئية . 13 (5): 429-35 . doi : 10.1038/nsmb1080 . PMC 2811576. PMID 16604083 .  
  23. ↑ شوارتز إيه إم، كوماروفا تي في، سكولاتشيف إم في، زفيريفا إيه إس، دوروخوف آي، أتابيكوف جي جي (ديسمبر 2006). "استقرار الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) في النباتات يعتمد على طول المنطقة غير المترجمة 3'". الكيمياء الحيوية. بيوكيميا . 71 (12): 1377-84 . doi : 10.1134/s0006297906120145 . PMID 17223792. S2CID 1527080 .  
  24. ↑ نيكو تي، كيريني إف، سزابادكاي إل، بينكوفيتش إيه إتش، ماجور بي، سونكولي بي، ميراي زد، بارتا إي، نيميك إي، كوفيل جيه، سيلهافي دي (يوليو 2013). "يخضع تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) في النباتات ، بوساطة كودون التوقف، لسيطرة دوائر تنظيم ذاتي مختلفة، ويمكن تحفيزه بواسطة مركب شبيه بمركب وصل الإكسون (EJC)" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 41 (13): 6715-28 . doi : 10.1093/nar/gkt366 . PMC 3711448. PMID 23666629 .  
  25. 1 2 إيناسيو أ، سيلفا آل، بينتو جيه، جي إكس، مورغادو أ، ألميدا إف، فاوستينو بي، لافينها جيه، ليبهابر إس إيه، روماو إل (يوليو 2004). "تفشل الطفرات الهراء على مقربة من كود البدء في تحفيز تحلل الحمض النووي الريبوزي المرسال (mRNA) بوساطة هراء كامل" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 279 (31): 32170– 80. دوى : 10.1074/jbc.m405024200 . بميد 15161914 . 
  26. ^ سيلفا آل، بيريرا إف جيه، مورغادو أ، كونغ جيه، مارتينز آر، فاوستينو بي، ليبهابر إس إيه، روماو إل (ديسمبر 2006). "يتم تثبيط اضمحلال الرنا المرسال المعتمد على UPF1 المعتمد على الهراء في النصوص التي تحمل إطار قراءة مفتوح قصير مستقل عن سياق التسلسل" . الحمض النووي الريبي . 12 (12): 2160–70 . دوى : 10.1261/rna.201406 . بمك 1664719 . بميد 17077274 .  
  27. ↑ سيلفا إيه إل، ريبيرو بي، إيناسيو إيه، ليبهاير إس إيه، رومانو إل (مارس 2008). "قرب البروتين الرابط لمتعدد الأدينين من كودون إنهاء مبكر يمنع تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) بوساطة كودون الإنهاء المبكر في الثدييات" . الحمض النووي الريبوزي . 14 (3): 563-76 . doi : 10.1261/rna.815108 . PMC 2248256. PMID 18230761 .  
  28. ↑ غارنو، ن. ل.، ويلوز، ج.، ويلوز، س. ج. (فبراير 2007). "طرق تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) الرئيسية والفرعية". مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 8 (2): 113-126 . doi : 10.1038/nrm2104 . PMID 17245413. S2CID 14107577 .  
  29. 1 2 3 4 فان هوف أ، فريشماير ب أ، ديتز هـ س، باركر ر (مارس 2002). "التعرف على الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) الذي يفتقر إلى كودون إنهاء وتحلله بواسطة الإكسوسومات". مجلة ساينس . 295 (5563): 2262-2264 . Bibcode : 2002Sci...295.2262V . doi : 10.1126/science.1067272 . PMID 11910110. S2CID 35345349 .  
  30. 1 2 3 4 فريشماير، ب. أ.، فان هوف، أ.، أودونيل، ك.، غيريريو، أ. ل.، باركر، ر.، ديتز، هـ. س. (مارس 2002). "آلية مراقبة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) التي تقضي على النسخ التي تفتقر إلى كودونات الإنهاء". مجلة ساينس . 295 (5563): 2258-2261 . رمز Bibcode : 2002Sci...295.2258F . doi : 10.1126/science.1067338 . PMID 11910109. S2CID 40843312 .  
  31. ↑ تيمبرلي آر جيه، سينيكا إس إتش، تونسكا كيه، بارتنيك إي، بيندوف إل إيه، لايتولرز آر إن، تشزانوفسكا-لايتولرز زد إم (سبتمبر 2003). "دراسة حذف جزئي ممرض في الحمض النووي للميتوكوندريا تكشف عن مسار تحلل إزالة الأدينين المعتمد على الترجمة في الميتوكوندريا البشرية" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 12 (18): 2341-2348 . doi : 10.1093/hmg/ddg238 . PMID 12915481 . 
  32. ↑ كارزاي، أ. و.، روش، إ. د.، ساور، ر. ت. (يونيو 2000). "نظام SsrA-SmpB لوسم البروتينات، والتحلل الموجه، وإنقاذ الريبوسوم". مجلة Nature Structural Biology . 7 (6): 449-455 . doi : 10.1038/75843 . PMID 10881189 . 
  33. 1 2 3 4 دوما إم كيه، باركر آر (مارس 2006). "الانقسام الداخلي للرنا المرسال حقيقي النواة مع توقفات في استطالة الترجمة" . نيتشر . 440 ( 7083): 561-564 . Bibcode : 2006Natur.440..561D . doi : 10.1038/nature04530 . PMC 1839849. PMID 16554824 .  
  34. ↑ كوباياشي ك، كيكونو إي، كوروها ك، سايتو ك، إيتو ك، إيشيتاني ر، إينادا ت، نوريكي أو (أكتوبر 2010). "الأساس البنيوي لمراقبة الحمض النووي الريبوزي الرسول بواسطة بروتين بيلوتا الأثري ومركب EF1α المرتبط بـ GTP" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 107 (41): 17575-17579 . Bibcode : 2010PNAS..10717575K . doi : 10.1073/pnas.1009598107 . PMC 2955123. PMID 20876129 .  
  35. ↑ غرايل م، شاييه م، فان تيلبورغ هـ (مارس 2008). "بنية بروتين Dom34 في الخميرة: بروتين مرتبط بعامل إنهاء الترجمة Erf1 ويشارك في تحلل No-Go" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 283 (11): 7145-54 . doi : 10.1074/jbc.M708224200 . PMID 18180287 . 
  36. 1 2 أتكينسون جي سي، بالدوف إس إل، هاوريلوك في (أكتوبر 2008). "تطور تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول غير المتوقف، وغير المكتمل، والوسيط بالهراء، ومكوناته المشتقة من عامل الإنهاء" . بي إم سي بيولوجيا التطور . 8 (1): 290. رمز Bibcode : 2008BMCEE...8..290A . doi : 10.1186/1471-2148-8-290 . PMC 2613156. PMID 18947425 .