علم الأوبئة المرضية الجزيئية
علم الأوبئة المرضية الجزيئية ( MPE ، ويُعرف أيضًا بعلم الأوبئة المرضية الجزيئية ) هو فرع من فروع علم الأوبئة يجمع بين علم الأوبئة وعلم الأمراض . ويُعرَّف بأنه "علم أوبئة الأمراض الجزيئية وتنوعها ". [ 1 ] يشترك علم الأمراض وعلم الأوبئة في هدف واحد هو توضيح أسباب الأمراض، ويسعى علم الأوبئة المرضية الجزيئية إلى تحقيق هذا الهدف على المستويات الجزيئية والفردية والسكانية. عادةً ما يستخدم هذا العلم موارد وبيانات علم أمراض الأنسجة ضمن دراسات علم الأوبئة القائمة. ويشمل علم الأوبئة الجزيئية، بشكل عام، علم الأوبئة المرضية الجزيئية وعلم الأوبئة الجزيئية التقليدي الذي يستخدم أنظمة تصنيف الأمراض التقليدية.
عملية مرضية
تشير البيانات المستقاة من مشروع أطلس جينوم السرطان إلى أن تطور الأمراض عملية غير متجانسة بطبيعتها. [ 2 ] [ 3 ] لكل مريض مسار مرضي فريد ("مبدأ المرض الفريد")، وذلك بالنظر إلى تفرد العوامل البيئية المؤثرة وتأثيرها الفريد على العملية المرضية الجزيئية. [ 2 ] وقد تم اعتماد هذا المفهوم في الطب السريري إلى جانب الطب الدقيق والطب الشخصي .
المنهجية
في علم الأمراض الجزيئية، يُحلل الباحثون العلاقات المتبادلة بين عوامل التعرض (مثل العوامل البيئية والغذائية ونمط الحياة والعوامل الوراثية)؛ والتغيرات في الجزيئات الخلوية أو خارج الخلوية (البصمات الجزيئية للمرض)؛ وتطور المرض وتقدمه. [ 2 ] يمكن للباحثين تحليل الجينوم ، والميثيلوم ، والإبيجينوم ، والميتابولوم ، والترانسكريبتوم ، والبروتيوم ، والميكروبيوم ، والمناعة ، والإنتركتوم . ويمكن ربط عامل خطر محتمل ببصمات جزيئية محددة.
يُمكّن بحث MPE من تحديد مؤشر حيوي جديد ذي فائدة سريرية محتملة، باستخدام بيانات سكانية واسعة النطاق (مثل طفرة PIK3CA في سرطان القولون والمستقيم لاختيار المرضى للعلاج بالأسبرين ). [ 1 ] يمكن استخدام نهج MPE بعد دراسة ارتباط على مستوى الجينوم (GWAS)، ويُطلق عليه "نهج GWAS-MPE". [ 4 ] يمكن إجراء توصيف تفصيلي لنمط المرض النهائي عن طريق علم الأمراض الجزيئي أو علم الأنسجة المرضية البديل أو تحليل الكيمياء المناعية للأنسجة والخلايا المريضة ضمن GWAS. [ 5 ] [ 6 ]
كنهج بديل، يمكن فحص المتغيرات الجينية التي تُحددها دراسات الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) بالتزامن مع تحليل علم الأمراض الجزيئي للأنسجة المصابة. [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] لا يقتصر هذا النهج، الذي يجمع بين دراسات الارتباط على مستوى الجينوم وتحليل علم الأمراض الجزيئي، على توفير تقديرات أكثر دقة للتأثيرات، بل وحتى تأثيرات أكبر، لأنواع فرعية جزيئية محددة من المرض، بل يُقدم أيضًا رؤى ثاقبة حول آلية المرض من خلال ربط المتغيرات الجينية بالبصمات المرضية الجزيئية. [ 4 ] وبما أن التشخيص الجزيئي أصبح ممارسة سريرية روتينية، فإن بيانات علم الأمراض الجزيئي تُسهم في البحوث الوبائية.
تاريخ
بدأ علم الأمراض الجزيئية كتحليل لعوامل الخطر (مثل التدخين) والنتائج المرضية الجزيئية (مثل طفرات جين KRAS G12C في سرطان الرئة).
أصبحت الدراسات التي تبحث في العلاقة بين التعرض والبصمات المرضية الجزيئية للأمراض (وخاصة السرطان) شائعة بشكل متزايد طوال التسعينيات وأوائل العقد الأول من القرن الحادي والعشرين. [ 11 ]
كان استخدام علم الأمراض الجزيئي في علم الأوبئة يفتقر إلى المنهجيات والمبادئ التوجيهية الموحدة، فضلاً عن الخبراء متعددي التخصصات وبرامج التدريب. [ 12 ] تطلبت أبحاث علم الأمراض الجزيئي إطارًا مفاهيميًا ومنهجيات جديدة ( المنهج الوبائي ) لأن هذا العلم يدرس التباين في متغير النتيجة . [ 13 ]
استُخدم مصطلح "علم الأوبئة المرضية الجزيئية" من قِبل شوجي أوغينو ومئير ستامبفر في عام 2010. [ 14 ] وتطورت مبادئ محددة لهذا العلم بعد ذلك التاريخ. ويُستخدم نموذج علم الأوبئة المرضية الجزيئية على نطاق واسع عالميًا، [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] وكان موضوعًا للعديد من المؤتمرات الدولية. [ 26 ] [ 27 ] [ 28 ] وقد أُتيحت سلسلة اجتماعات علم الأوبئة المرضية الجزيئية الدولية، التي تأسست عام 2013، لمجتمع الباحثين حول العالم، وعُقدت خمسة اجتماعات حتى عام 2021. [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ] [ 32 ]
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 أوغينو إس، لوكهيد بي، جيوفانوتشي إي، مايرهاردت جيه إيه، فوكس سي إس، تشان إيه تي (يونيو 2014). " اكتشاف طفرة PIK3CA في سرطان القولون والمستقيم كعلامة حيوية تنبؤية محتملة: قوة ووعد علم الأوبئة المرضية الجزيئية" . مراجعة. أونكوجين . 33 (23): 2949-55 . doi : 10.1038/onc.2013.244 . PMC 3818472. PMID 23792451 .
- 1 2 3 أوغينو إس، لوكهيد بي، تشان إيه تي، نيشيهارا آر، تشو إي، وولبين بي إم، وآخرون . (أبريل 2013). "علم الأوبئة المرضي الجزيئي لعلم التخلق: علم تكاملي ناشئ لتحليل البيئة والمضيف والمرض" . مراجعة. علم الأمراض الحديث . 26 (4): 465-84 . doi : 10.1038 / modpathol.2012.214 . PMC 3637979. PMID 23307060 .
- ↑ أوغينو إس، فوكس سي إس، جيوفانوتشي إي (2012). "كم عدد الأنواع الفرعية الجزيئية؟ آثار مبدأ الورم الفريد في الطب الشخصي" . مراجعة. مراجعة الخبراء للتشخيص الجزيئي . 12 (6): 621-628 . doi : 10.1586/erm.12.46 . PMC 3492839. PMID 22845482 .
- 1 2 أوغينو إس، تشان إيه تي، فوكس سي إس، جيوفانوتشي إي (مارس 2011). "علم الأوبئة المرضي الجزيئي لأورام القولون والمستقيم: مجال ناشئ متعدد التخصصات ومتداخل التخصصات" . مراجعة. مجلة الأمعاء . 60 (3): 397-411 . doi : 10.1136/gut.2010.217182 . PMC 3040598. PMID 21036793 .
- ↑ شين هـ، فريدلي ب.ل، سونغ هـ، لورنسون ك، كانينغهام ج.م، راموس س.ج، وآخرون (2013). "يؤدي التحليل فوق الجيني إلى تحديد HNF1B كجين قابلية للإصابة بنوع فرعي محدد من سرطان المبيض" . دراسة أولية. Nature Communications . 4 : 1628. Bibcode : 2013NatCo...4.1628. doi : 10.1038 /ncomms2629 . PMC 3848248. PMID 23535649 .
- ↑ غارسيا-كلوساس م، كوتش ف ج، ليندستروم س، ميخائيليدو ك، شميدت م ك، بروك م ن، وآخرون . (أبريل 2013). "دراسات الارتباط على مستوى الجينوم تحدد أربعة مواقع خطر خاصة بسرطان الثدي السلبي لمستقبلات هرمون الإستروجين" . دراسة أولية. علم الوراثة الطبيعية . 45 (4): 392-398 ، 398e1-392. doi : 10.1038/ng.2561 . PMC 3771695. PMID 23535733 .
- ↑ غروبر إس بي، مورينو في، روزيك إل إس، رينرتس إتش إس، ليبكوفيتش إف، بونر جيه دي، وآخرون . (يوليو 2007). "التغير الجيني في 8q24 المرتبط بخطر الإصابة بسرطان القولون والمستقيم" . علم الأحياء والعلاج السرطاني . 6 (7): 1143-1147 . doi : 10.4161/cbt.6.7.4704 . PMID 17630503 .
- ↑ سلاتري إم إل، هيريك جيه، كورتين كيه، سامويتز دبليو، وولف آر كيه، كان بي جيه، دوجان دي، بوتر جيه دي، بيترز يو (فبراير 2010). "زيادة خطر الإصابة بسرطان القولون المرتبط بتعدد الأشكال الجينية لـ SMAD7" . أبحاث السرطان الأولية . 70 (4): 1479-85 . doi : 10.1158/0008-5472.CAN-08-1792 . PMC 2925533. PMID 20124488 .
- ↑ غارسيا-ألبينيز إكس، نان إتش، فاليري إل، موريكاوا تي، كوتشيبا إيه، فيبس إيه آي، وآخرون . (فبراير 2013). " التوصيف الظاهري والجزيئي للورم لسرطان القولون والمستقيم وعلاقته بمتغير SMAD7 المرتبط بالبقاء على قيد الحياة" . التسرطن الأولي . 34 (2): 292-298 . doi : 10.1093/carcin/bgs335 . PMC 3564438. PMID 23104301 .
- نان هـ، موريكاوا ت، سورينييمي م، إمامورا ي، فيرنر ل، كوتشيبا أ، وآخرون . (ديسمبر 2013). "استخدام الأسبرين، وتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة 8q24 rs6983267، وسرطان القولون والمستقيم وفقًا لتغيرات CTNNB1" . مجلة المعهد الوطني للسرطان . 105 (24): 1852-1861 . doi : 10.1093/jnci/ djt331 . PMC 3866156. PMID 24317174 .
- ↑ سلاتري ، إم إل (أكتوبر 2002). "علم وفن علم الأوبئة الجزيئي" . مجلة علم الأوبئة وصحة المجتمع (تعليق). 56 (10): 728-729 . doi : 10.1136/jech.56.10.728 . PMC 1732025. PMID 12239192 .
- ↑ شيرمان، إم إي، هاوات، دبليو، بلوز، إف إم، فارو، بي، هيويت، إس إم، غارسيا-كلوساس، إم (أبريل 2010). " علم الأمراض الجزيئي في الدراسات الوبائية: مدخل إلى الاعتبارات الرئيسية" . مراجعة. علم أوبئة السرطان، المؤشرات الحيوية والوقاية . 19 (4): 966-972 . doi : 10.1158/1055-9965.EPI-10-0056 . PMC 2852464. PMID 20332257 .
- ↑ أوغينو إس، بيك إيه إتش، كينغ إي إي، شيرمان إم إي، ميلنر دي إيه، جيوفانوتشي إي (2012). "أوغينو وآخرون يردون على "عالم الأوبئة في القرن الحادي والعشرين"" . المجلة الأمريكية لعلم الأوبئة . 176 (8): 672-4 . doi : 10.1093/aje/ kws229 . PMC 3571249. PMID 22935516 .
- ↑ أوغينو إس، ستامبفر إم (مارس 2010). "عوامل نمط الحياة وعدم استقرار الميكروساتلايت في سرطان القولون والمستقيم: المجال المتطور لعلم الأوبئة المرضية الجزيئية" . مجلة المعهد الوطني للسرطان (تعليق). 102 (6): 365-367 . doi : 10.1093/jnci/djq031 . PMC 2841039. PMID 20208016 .
- ↑ كورتين ك، سلاتري إم إل، سامويتز دبليو إس (أبريل 2011). "مثيلة جزر CpG في سرطان القولون والمستقيم: الماضي والحاضر والمستقبل" . مراجعة. مجلة أبحاث علم الأمراض الدولية . 2011 902674. doi : 10.4061/2011/902674 . PMC 3090226. PMID 21559209 .
- ↑ غالون ج، باجيس ف، مارينكولا إف إم، أنجيل إتش كيه، ثورين إم، لوغلي أ، وآخرون . (أكتوبر 2012). " تصنيف السرطان باستخدام مؤشر المناعة: فريق عمل عالمي" . مراجعة. مجلة الطب الانتقالي . 10 : 205. doi : 10.1186/1479-5876-10-205 . PMC 3554496. PMID 23034130 .
- ↑ كو سي إس، كوبر دي إن، وو إم، روكوس دي إتش، باويتان واي، سونغ آر، إياكوبيتا بي (أغسطس 2012). "اكتشاف الجينات في متلازمات السرطان العائلية عن طريق تسلسل الإكسوم: آفاق توضيح سرطان القولون والمستقيم العائلي من النوع X" . مراجعة. علم الأمراض الحديث . 25 (8): 1055-1068 . doi : 10.1038/modpathol.2012.62 . PMID 22522846 .
- ↑ كوشيول ج، لين س.و. (يوليو 2012). "هل يمكن استخدام المؤشرات المناعية النسيجية لدراسة التاريخ الطبيعي للسرطان؟" مراجعة . حوليات علم الأوبئة . 22 (7): 520-530 . doi : 10.1016/j.annepidem.2012.03.001 . PMC 3596808. PMID 22481034 .
- ↑ دوغان إس، شين آر، أنغ دي سي، جونسون إم إل، دانجيلو إس بي، بايك بي كيه، وآخرون . (نوفمبر 2012). "علم الأوبئة الجزيئي لطفرات EGFR وKRAS في 3026 حالة من سرطان الغدد الرئوية: زيادة قابلية النساء للإصابة بسرطانات KRAS الطافرة المرتبطة بالتدخين" . أبحاث السرطان السريرية الأولية . 18 (22): 6169-77 . doi : 10.1158/1078-0432.CCR-11-3265 . PMC 3500422. PMID 23014527 .
- ↑ سبيتز إم آر، كابوراسو إن إي، سيلرز تي إيه (ديسمبر 2012). "علم الأوبئة التكاملي للسرطان - الجيل القادم" . مجلة اكتشاف السرطان . 2 (12): 1087-1090 . doi : 10.1158/2159-8290.CD-12-0424 . PMC 3531829. PMID 23230187 .
- ↑ شانموغاناثان ر، بشير ن ب، أميرثالينغام ل، موثوكومار هـ، كاليابيرومال ر، شانموغام ك (يناير 2013). "التقنيات التقليدية والنانوية لتحليل مثيلة الحمض النووي" . مراجعة. مجلة التشخيص الجزيئي . 15 (1): 17-26 . doi : 10.1016/j.jmoldx.2012.06.007 . PMID 23127612 .
- ↑ هيوز لا، ميلوت V، دي شريفر J، دي ماعت م، سميت VT، Bovée JV، وآخرون . (أكتوبر 2013). "النمط الظاهري لميثيل جزيرة CpG: ما هو الاسم؟" . مراجعة. أبحاث السرطان . 73 (19): 5858-68 . دوى : 10.1158/0008-5472.CAN-12-4306 . اتش دي ال : 1765/60760 . بميد 23801749 .
- ↑ إسترهايز إم إم، كوفمان إس إتش (يوليو 2013). "المؤشرات الحيوية التشخيصية كامنة في جينوم المضيف المصاب". مراجعة. مراجعة الخبراء للتشخيص الجزيئي . 13 (6): 625-37 . doi : 10.1586/14737159.2013.811897 . PMID 23895131. S2CID 3463193 .
- ↑ هاغلاند إتش آر، سوريد كيه (يناير 2015). "الأيض الخلوي في التسرطن القولوني المستقيمي: تأثير نمط الحياة، والميكروبيوم المعوي، والمسارات الأيضية" . مراجعة. رسائل السرطان . 356 (2 الجزء أ): 273-280 . doi : 10.1016/j.canlet.2014.02.026 . hdl : 1956/8817 . PMID 24614287 .
- ↑ بيشهساري ف، مهدوينيا م، فاكا م، مالك زاده ر، مارياني-كوستانتيني ر (مايو 2014). "التحول الوبائي لسرطان القولون والمستقيم في البلدان النامية: العوامل البيئية، والمسارات الجزيئية، وفرص الوقاية" . مراجعة. المجلة العالمية لأمراض الجهاز الهضمي . 20 (20): 6055-72 . doi : 10.3748/wjg.v20.i20.6055 . PMC 4033445. PMID 24876728 .
- ↑ كولر إل إتش، براكن إم بي، أوغينو إس، برنتيس آر إل ، تريسي آر بي (نوفمبر 2013). "دور علم الأوبئة في عصر علم الأوبئة الجزيئي وعلم الجينوم: ملخص ندوة جمعية أبحاث علم الأوبئة لعام 2013 برعاية المجلة الأمريكية لعلم الأوبئة" . المجلة الأمريكية لعلم الأوبئة . 178 (9): 1350-1354 . doi : 10.1093/aje/kwt239 . PMC 3988450. PMID 24105654 .
- ↑ إيبلين إم، بوستيك آر إم، مو إل، أوغينو إس، برايثويت دي، كانيتسكي بي إيه (2014). "التحديات والفرص في البحوث الدولية للوقاية الجزيئية من السرطان: تقرير صادر عن الجمعية الأمريكية لعلم الأوبئة الجزيئية والبيئة ومجموعات الاهتمام الدولية بالوقاية من السرطان" . علم أوبئة السرطان، المؤشرات الحيوية والوقاية . 23 (11): 2613-2617 . doi : 10.1158/1055-9965.EPI-14-0848 . PMC 4221505. PMID 25277796 .
- ↑ أوغينو إس، كامبل بي تي، نيشيهارا آر، فيبس إيه آي، بيك إيه إتش، شيرمان إم إي، وآخرون (2015). " وقائع الاجتماع الدولي الثاني لعلم الأوبئة المرضية الجزيئية (MPE)" . أسباب السرطان ومكافحته . 26 (7): 959-72 . doi : 10.1007/s10552-015-0596-2 . PMC 4466011. PMID 25956270 .
- ↑ "مختبر أوغينو لعلم وظائف الأعضاء الجزيئية" . معهد دانا فاربر للسرطان. مؤرشف من الأصل بتاريخ 15 مايو 2019. تم الاطلاع عليه بتاريخ 7 أبريل 2020 .
- ↑ كامبل، بي تي، ريبيك، تي آر، نيشيهارا، آر، بيك، إيه إتش، بيج، سي بي، بوغدانوف، إيه إيه، وآخرون ( 2017). "وقائع الاجتماع الدولي الثالث لعلم الأوبئة المرضية الجزيئية (MPE)" . مراجعة. أسباب السرطان ومكافحته . 28 (2): 167-176 . doi : 10.1007/s10552-016-0845-z . PMC 5303153. PMID 28097472 .
- ↑ كامبل وآخرون. أسباب السرطان 2019
- ↑ "الصفحة الرئيسية" . mpemeeting.org .
للمزيد من القراءة
- غاو سي (2016). " علم الأوبئة المرضي الجزيئي في داء السكري وخطر الإصابة بسرطان الخلايا الكبدية" . المجلة العالمية لأمراض الكبد . 8 (27): 1119-1127 . doi : 10.4254/wjh.v8.i27.1119 . PMC 5037325. PMID 27721917 .
- ريسينيو تي، ميكولوتشي إل، تيتشي إم إف، كاباسو إيه (2017). " العناصر الغذائية النشطة بيولوجيًا وعلم التغذية الجيني في الأمراض المرتبطة بالعمر" . مجلة Molecules . 22 (1): 105. doi : 10.3390/molecules22010105 . PMC 6155887. PMID 28075340 .
- باتيل إتش، ساكسينا إس جي، بارو سي جيه، كانوار جيه آر، كابات إيه، كانوار آر كيه (2017). "السعي وراء حلم الطب الشخصي من خلال التحقق من صحة المؤشرات الحيوية في سرطان القولون والمستقيم". اكتشاف الأدوية اليوم . 22 (1): 111-119 . doi : 10.1016/j.drudis.2016.09.022 . PMID 27693431 .
- علم الأوبئة
- علم الأمراض
