الملاقط الجزيئية

الشكل 1. ثلاثي نيتروفلورين مرتبط في ملاقط جزيئية كما ورد في تقرير لين وزملاؤه. [ 1 ]
الشكل 2. جزيء فوليرين مرتبط في جزيء بوكي كاتشر من خلال تفاعلات التراص العطرية . [ 2 ]

الملاقط الجزيئية ، والمشابك الجزيئية ، هي جزيئات مضيفة ذات تجاويف مفتوحة قادرة على ربط جزيئات ضيف. [ 3 ] قد يربط التجويف المفتوح للملاقط الجزيئية جزيئات الضيف باستخدام روابط غير تساهمية ، تشمل الروابط الهيدروجينية ، والتناسق المعدني ، والقوى الكارهة للماء ، وقوى فان دير فالس ، وتفاعلات π–π ، و/أو التأثيرات الكهروستاتيكية. تُعد هذه المركبات مجموعة فرعية من المستقبلات الجزيئية الحلقية الكبيرة ، وتتميز بنيتها بأن "الذراعين" اللذين يربطان جزيء الضيف بينهما متصلان من طرف واحد فقط، مما يُضفي على جزيئات المستقبل هذه مرونة معينة (نموذج التوافق المُستحث).

تاريخ

استُخدم مصطلح "الملاقط الجزيئية" لأول مرة من قِبل ويتلوك. [ 4 ] طُوِّرت فئة المضيفات ونُشرت على نطاق واسع من قِبل زيمرمان في منتصف الثمانينيات إلى أوائل التسعينيات [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] ، ولاحقًا من قِبل كلارنر. [ 8 ]

أمثلة

ترتبط بعض الملاقط الجزيئية بجزيئات عطرية . [ 1 ] تتكون هذه الملاقط الجزيئية من زوج من أذرع الأنثراسين متباعدة بمسافة تسمح للجزيئات العطرية بالتفاعل مع كليهما عبر روابط π–π (انظر الشكل). بينما تتميز ملاقط جزيئية أخرى بزوج من البورفيرينات المرتبطة . [ 9 ]

يرتبط نوع آخر من الملاقط الجزيئية بالفوليرين . [ 2 ] تتكون هذه " الملاقط الباكي " من ملقطين من الكورانولين يُكملان سطح جزيء الفوليرين المحدب (الشكل 2 ). وقد حُسب ثابت الارتباط ( Ka ) بقيمة 8600 مول⁻¹ باستخدام مطيافية الرنين النووي المغناطيسي للبروتون . 

وصف ستورمر وزملاؤه شقوقًا قادرة على التقاط جزيئات السيكلوهكسان أو الكلوروفورم. ومن المثير للاهتمام أن تفاعلات باي لعبت أدوارًا رئيسية في التقاط الجزيئات الضيفة وكذلك في معدل تكوين الشقوق. [ 10 ]

الشكل 3. السلسلة الجانبية الأليفاتية لليسين المرتبطة داخل تجويف ملقط البنزين الجزيئي المستبدل بالفوسفات بواسطة التفاعلات الكهروستاتيكية، و CH-p، والتفاعلات الكارهة للماء التي أبلغ عنها كلارنر وشرادر وزملاؤهما. [9،10]

ترتبط الملاقط الجزيئية القابلة للذوبان في الماء والمُستبدلة بالفوسفات، والمصنوعة من بدائل فينيل ونوربورنينيل متناوبة ، بالسلاسل الجانبية الأليفاتية الموجبة الشحنة للأحماض الأمينية القاعدية، مثل الليسين والأرجينين (الشكل 3). [ 11 ] [ 12 ] أما المركبات المشابهة ، والتي تُسمى "المشابك الجزيئية"، والتي تكون جدرانها الجانبية مسطحة وليست محدبة، فتفضل احتواء حلقات البيريدينيوم المسطحة (على سبيل المثال، حلقة النيكوتيناميد في NAD(P)+) بين جدرانها الجانبية المستوية من النفثالين (الشكل 4). [ 13 ] تجعل أنماط الارتباط الحصرية المتبادلة هذه المركبات أدوات قيّمة لدراسة التفاعلات البيولوجية الحاسمة للسلاسل الجانبية للأحماض الأمينية القاعدية في الببتيدات والبروتينات، وكذلك NAD(P) + والعوامل المساعدة المماثلة. على سبيل المثال، كلا النوعين من المركبات يثبطان تفاعلات أكسدة الإيثانول بواسطة نازعة هيدروجين الكحول أو الجلوكوز-6-فوسفات بواسطة نازعة هيدروجين الجلوكوز-6-فوسفات ، [ 14 ] على التوالي.

الشكل 4. مُركّب المضيف والضيف ذو البنية الشطيرية المزدوجة، والمكوّن من مشبك جزيئي مُستبدل بالفوسفات وثنائي نيوكليوتيد الأدينين والنيكوتيناميد (NAD + ، وهو العامل المساعد للعديد من إنزيمات الأكسدة والاختزال). ترتبط حلقة النيكوتيناميد (الموقع النشط لـ NAD + ) بين جدران النفثالين الجانبية للمشبك، كما ورد في تقرير كلارنر وشرادر وأوكسنفيلد وزملائهم. [11]

تُثبّط الملاقط الجزيئية، دون المشابك، بكفاءة تكوين القليلات والتجمعات السامة للبروتينات المولدة للأميلويد المرتبطة بأمراض مختلفة. ومن الأمثلة على ذلك البروتينات المتورطة في مرض الزهايمر - بروتين بيتا أميلويد (Aβ) وتاو؛ [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] ألفا-سينوكلين، الذي يُعتقد أنه يُسبب مرض باركنسون واعتلالات السينوكلين الأخرى [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] [ 21 ] ويتورط في إصابات الحبل الشوكي ؛ [ 22 ] هنتنغتين الطافر، الذي يُسبب مرض هنتنغتون؛ [ 23 ] عديد ببتيد أميلويد الجزر (أميلين)، الذي يقتل خلايا بيتا البنكرياسية في داء السكري من النوع الثاني ؛ [ 24 ] الترانسثيريتين (TTR)، الذي يُسبب اعتلال الأعصاب النشواني العائلي، واعتلال عضلة القلب النشواني العائلي، والداء النشواني الجهازي الشيخوخي؛ [ 25 ] الطفرات المُعرّضة للتكتل في بروتين كابت الورم p53 ؛ [ 26 ] وبروتينات السائل المنوي التي يُعزز تكتلها عدوى فيروس نقص المناعة البشرية . [ 27 ] ومن المهم ذكره أن الملاقط الجزيئية أثبتت فعاليتها وأمانها ليس فقط في المختبر، بل أيضًا في النماذج الحيوانية لأمراض مختلفة، [ 28 ] [ 29 ] مما يُشير إلى إمكانية تطويرها كأدوية ضد الأمراض الناجمة عن تكتل البروتينات غير الطبيعي، والتي لا يوجد لها علاج حاليًا. كما ثبت أنها تُدمر أغشية الفيروسات المغلفة، مثل فيروس نقص المناعة البشرية، وفيروس الهربس، وفيروس التهاب الكبد الوبائي سي، [ 27 ] مما يجعلها مرشحة جيدة لتطوير مبيدات الميكروبات.

تُظهر الأمثلة السابقة التفاعلية والتخصص المحتملين لهذه الجزيئات. يمكن لتجويف الارتباط بين الذراعين الجانبيين للملقط أن يتطور ليرتبط بجزيء ضيف مناسب بتخصص عالٍ، وذلك تبعًا لتكوين الملقط. وهذا ما يجعل هذه الفئة من الجزيئات الكبيرة مستقبلات جزيئية اصطناعية حقيقية ذات تطبيقات مهمة في علم الأحياء والطب. [ 30 ] [ 31 ] [ 32 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ١ ٢ أ. بيتيجان؛ ر. ج. خوري؛ ن. كيريتساكاس؛ ج. م. لين (٢٠٠٤). "الأجهزة الديناميكية. تبديل الشكل وربط الركيزة في الملاقط الجزيئية النانوية الميكانيكية التي يتم التحكم فيها بالأيونات". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية ١٢٦ (٢١): ٦٦٣٧-٦٦٤٧ . Bibcode : 2004JAChS.126.6637P . doi : 10.1021/ja031915r . PMID 15161291 . 
  2. 1 2 أ. سيغولا؛ ف. ر. فرونتشيك؛ ر. سيغولا؛ ب. و. رابيدو؛ م. م. أولمستيد (2007). "مُستقبِل بوكي مزدوج التقعر للهيدروكربون". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية 129 ( 13): 3842-3843 . Bibcode : 2007JAChS.129.3842S . doi : 10.1021/ja070616p . PMID 17348661. S2CID 25154754 .  
  3. هاردوين-ليروج، م.؛ هودوم، ب.؛ سال، م. (2011). "المشابك والملاقط الجزيئية التي تستضيف جزيئات محايدة" (ملف PDF) . مجلة الجمعية الكيميائية . 40 (1): 30-43 . doi : 10.1039/B915145C . PMID 21038068 . 
  4. تشين سي.-و.؛ ويتلوك إتش دبليو "الملاقط الجزيئية - نموذج بسيط للتداخل ثنائي الوظيفة"، مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية 1978، 100، 4921
  5. Zimmerman, SC; VanZyl, CM "Rigid molecular tweezers: synthesis, characterization, and complexation chemistry of a diacridine", J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 7894.
  6. Zimmerman, SC; Wu, W. "A rigid molecular tweezers with an active site carboxylic acid: exceptionly efficient receptor for adenine in an organic solvent", J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 8054.
  7. Zimmerman, SC "Rigid molecular tweezers as hosts for the complexing of neutral guest", Top. Curr. Chem. 1993, 165, 71.
  8. ف. ج. كلارنر وب. كاليرت (2003). "الملاقط والمشابك الجزيئية كمستقبلات اصطناعية. التعرف الجزيئي والديناميكيات في معقدات المستقبل-الركيزة". مجلة أبحاث الكيمياء 36 (12): 919-932 . doi : 10.1021/ar0200448 . PMID 14674783. S2CID 29313731 .  
  9. X. Huang; N. Fujioka; G. Pescitelli; F. Koehn; RT Williamson; K. Nakanishi; N. Berova (2002). "تحديد التكوين المطلق للأمينات الثانوية بواسطة مضيف بورفيرين الزنك ثنائي الأبعاد الحساس لـ CD". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية 124 (17): 10320-10335 . Bibcode : 2002JAChS.12410320H . doi : 10.1021/ja020520p . PMID: 12197735. S2CID : 33852448 .  
  10. ستورمر، مارتن جيه؛ ويكراماسينغ، واسانثا أ؛ بيريل، كارل أ؛ هوكليس، ديفيد سي آر؛ سكيلتون، برايان دبليو؛ سوبوليف، ألكسندر ن؛ وايت، آلان إتش؛ ماك، جيفري واي دبليو؛ فيرلي، ديفيد بي. (2017-12-08). "تأثيرات الفراغية الإلكترونية على فصل الديينوفيل تؤثر على تخليق ديلز-ألدر للشقوق الجزيئية" (ملف PDF) . المجلة الأوروبية للكيمياء العضوية . 2017 (45): 6793-6796 . doi : 10.1002/ejoc.201701319 . ISSN 1099-0690 . 
  11. م. فوكينز، ت. شرادر، و ف. ج. كلارنر. ملقط جزيئي لليسين والأرجينين. مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية 2005؛ 127: 14415-14421.
  12. ب. تالبيرسكي؛ ف. باستكوفسكي؛ ف. ج. كلارنر؛ ت. شرادر (2008). "المشبك الجزيئي والملقط يقدمان آليات جديدة لتثبيط الإنزيم". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية 130 (30): 9824-9828 . Bibcode : 2008JAChS.130.9824T . doi : 10.1021/ja801441j . PMID 18605724 . 
  13. ج. بولكوفسكا؛ ف. باستكوفسكي؛ ت. شرادر؛ ف.-ج. كلارنر؛ ج. زيناو؛ ف. كوزيول؛ س. أوكسنفيلد (2009). "دراسة تجريبية ونظرية مشتركة لنمط ارتباط NAD+ المعتمد على الرقم الهيدروجيني بواسطة مشابك جزيئية قابلة للذوبان في الماء". مجلة الكيمياء العضوية الفيزيائية 22 (30): 779-790 . doi : 10.1002/poc.1519 .
  14. ^ م. كيرش. ب. تالبيرسكي؛ جيه بولكوفسكا؛ واو باستكوفسكي؛ تي شالر؛ هـ. دي جروت؛ F.-G. كلارنر. ت. شريدر (2009). “آلية تثبيط G6PD الفعال بواسطة مقطع جزيئي”. أنجو. الكيمياء. كثافة العمليات. إد. 48 (16): 2886–2890 . دوى : 10.1002/anie.200806175 . بميد 19283805 . 
  15. إس سينها، دي إتش جيه لوبيز، زد دو، إي إس بانغ، إيه شانموغام، إيه لوماكين، بي تالبيرسكي، إيه تينشتات، كيه ماكدانيال، آر باكشي، بي واي كو، إم إيرمان، جي بي بينيديك، جيه إيه لو، إف جي كلارنر، تي شرادر، سي وانغ، وجي بيتان. الملاقط الجزيئية المتخصصة بالليسين مثبط واسع النطاق لتجمع وسمية بروتينات الأميلويد. مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية 2011؛ ​​133(42): 16958-16969 .
  16. إس سينها، زد دو، بي مايتي، إف جي كلارنر، تي شرادر، سي وانغ، وجي بيتان. مقارنة بين ثلاثة مثبطات لتكوين الأميلويد: سكر سكيلو-إينوزيتول، ومتعدد الفينول إيبيغالوكاتشين غالات، والجزيء CLR01. مجلة ACS Chem. Neurosci. 2012؛ 3(6): 451–458 .
  17. X Zheng, DY Liu, FG Klärner, T Schrader, G Bitan, and MT Bowers. Amyloid β-protein Assembly: The Effect of Molecular Tweezer CLR01 and CLR03. J. Phys. Chem. B, 2015; 119: 4831–4841 .
  18. S Prabhudesai*، S Sinha*، A Attar، A Kotagiri، AG Fitzmaurice، R Lakshmanan، MI Ivanova، JA Loo، FG Klärner، T Schrader، M Stahl، G Bitan#، و JM Bronstein#. مثبط "الملقط الجزيئي" الجديد للسمية العصبية لـ α-Synuclein في المختبر وفي الجسم الحي. العلاج العصبي. 2012؛ 9(2): 464-476 .
  19. إس أشاريا، بي إم سافاي، بي وونجكونجكاتيب، إم آي إيفانوفا، أ العطار، إف جي كلارنر، تي شريدر، جي إيه لو، جي بيتان، إل جي لابيدوس. الأساس الجزيئي لمنع تجميع α-Synuclein بواسطة الملقط الجزيئي. جي بيول. الكيمياء. 2014; 289(15):10727–10737 .
  20. لولا، إل بارنهيل، جي بيتان، إم آي إيفانوفا، بي نغوين، كو أودونيل، إم سي ستال، سي ياماشيرو، إف جي كلارنر، تي شريدر، إيه ساغاستي، وجي إم برونشتاين، إنفيرون. المنظور الصحي. 2016; 124: 1766-1775. أرشفة 2017-07-05 في آلة Wayback.
  21. ريختر، فرانزيسكا؛ سوبرامانيام، سودهاكار ر.؛ ماجن، إيدو؛ لي، باتريك؛ هايز، جين؛ عطار، عايدة؛ تشو، تشوني؛ فرانش، نيكولاس ر.؛ بوف، نيكولاس (2017-06-05). "ملقط جزيئي يُحسّن العجز الحركي لدى الفئران التي تُفرط في التعبير عن بروتين ألفا-سينوكلين" . العلاجات العصبية . 14 (4): 1107-1119 . doi : 10.1007/s13311-017-0544-9 . ISSN 1933-7213 . PMC 5722755. PMID 28585223 .   
  22. SM Fogerson, AJ van Brummen, DJ Busch, SR Allen, R Roychaudhuri, S Banks, FG Klärner, T Schrader, G Bitan, and JR Morgan, Reducing synuclein accumulate improves neuronal survival after spinal cord injury, Exp. Neurol. 2016; 278: 105–115 .
  23. ^ فوبل، توبياس؛ برافو رودريجيز، كيني؛ ميتال، سوميت؛ فاشاراجاني، شيفانج؛ نوت، ديفيد؛ شارما، ابهيشيك؛ ستاينهوف، آن؛ فاتوبا، أولواسيون؛ إلريشمان ، جيسا (2017/04/26). "تثبيط تجميع هنتنغتين إكسون -1 بواسطة الملقط الجزيئي CLR01" . مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 139 (16): 5640–5643 . بيب كود : 2017JAChS.139.5640V . دوى : 10.1021/jacs.6b11039 . ISSN 0002-7863 . بمك 5506490 . بميد 28406616 .   
  24. DHJ Lopes, A Attar, G Nair, EY Hayden, Z Du, K McDaniel, S Dutt, K Bravo-Rodriguez, S Mittal, FG Klärner, C Wang, E Sanchez-Garcia, T Schrader, and G Bitan (2015) Molecular tweezers inhibit islet amyloid polypeptide assembly and toxicity by a new mechanism, ACS Chem. Biol. 2015; 10: 1555–1569 .
  25. ن فيريرا، أ. بيريرا-هنريك، أ العطار، ف.ج.كلارنر، ت. شريدر، ج. بيتان، إل جاليس، إم جي سارايفا، و م.ر. ألميدا. ملاقط جزيئية تستهدف الداء النشواني Transthyretin. العلاج العصبي. 2014; 11: 450-461 .
  26. جي هيرتسوغ، إم دي شمويلي، إل ليفي، إل إنجل، إي غازيت، إف جي كلارنر، تي شرادر، جي بيتان، ودي سيغال. الملقط الجزيئي الخاص باللايسين، CLR01، ينظم تكتل نطاق ربط الحمض النووي p53 الطافر ويمنع سميته، الكيمياء الحيوية، 2015؛ 54: 3729-3738 .
  27. 1 2 E Lump، LM Castellano، C Meier، J Seeliger، N Erwin، B Sperlich، CM Stürzel، S Usmani، RM Hammond، J von Einem، G Gerold، F Kreppel، K Bravo-Rodriguez، T Pietschmann، VM Holmes، D Palesch، O Zirafi، D Weissman، A Sowislok، B Wettig، C Heid، F. Kirchhoff، T Weil، FG Klärner، T Schrader، G Bitan، E Sanchez-Garcia، R Winter، J Shorter، and Jan Münch، ملقط جزيئي يستفز الأميلويدات المنوية والعدوى بفيروس نقص المناعة البشرية، eLife، 2015؛ 4:e05397 .
  28. أ. عطار، س. ريبولي، إ. ريكاردي، ب. مايتي، د. د. لي بوما، ت. ليو، ج. هايز، م. ر. جونز، ك. ليشتي-كايزر، ف. يانغ، ج. د. غيل، تش. تسينغ، م. تان، س. و. شي، ج. ل. ستراودينغر، ف. ج. كلارنر، ت. شرادر، س. أ. فراوتشي، س. غراسي، ج. بيتان. حماية الخلايا العصبية الأولية ودماغ الفأر من مرض الزهايمر باستخدام الملاقط الجزيئية. الدماغ. 2012؛ 135 (الجزء 12): 3735-3748 .
  29. أ. عطار، و. ت. س. تشان، ف. ج. كلارنر، ت. شرادر، وج. بيتان. السلامة والخصائص الدوائية للملاقط الجزيئية CLR01 - مثبط واسع الطيف لسمية بروتينات الأميلويد. BMC Pharm. Tox. 2014؛ 15(23): doi:10.1186/2050-6511-15-23 .
  30. FG Klärner و T Schrader. التفاعلات العطرية بواسطة الملاقط والمشابك الجزيئية في الأنظمة الكيميائية والبيولوجية. Acc. Chem. Res. 2013؛ 46: 967–978 .
  31. أ. عطار وج. بيتان. تعطيل التجميع الذاتي وسمية قليل الوحدات البروتينية المولدة للأميلويد بواسطة "الملاقط الجزيئية" - من أنبوب الاختبار إلى النماذج الحيوانية، Curr. Pharm. Des. 2014؛ 20: 2469-2483 .
  32. T Schrader, G Bitan, and FG Klärner, Molecular Tweezers for Lysine and Arginine – Powerful Inhibitors of Pathologic Protein Aggregation, Chem. Commun. 2016: 52: 11318–11334.