NDUFB5

إن البروتين NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 5, 16kDa هو بروتين يُشفَّر في الإنسان بواسطة جين NDUFB5 . [ 5 ] يُعدّ بروتين NDUFB5 وحدة فرعية من إنزيم NADH dehydrogenase (ubiquinone) ، الموجود في الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ، وهو الأكبر بين مُركَّبات سلسلة نقل الإلكترون الخمسة . [ 6 ]

بناء

يقع جين NDUFB5 على الذراع q للكروموسوم 3 في الموضع 26.33، ويبلغ طوله 19713 زوجًا من القواعد النيتروجينية. يزن بروتين NDUFB5 21.7 كيلو دالتون ويتكون من 189 حمضًا أمينيًا. [ 7 ] [ 8 ] يُعد NDUFB5 وحدة فرعية من إنزيم نازع هيدروجين NADH (يوبيكوينون) ، وهو أكبر معقدات التنفس. يتميز هذا الإنزيم ببنية على شكل حرف L، حيث يحتوي على نطاق غشائي طويل كاره للماء ، ونطاق محب للماء في الذراع المحيطي الذي يضم جميع مراكز الأكسدة والاختزال المعروفة وموقع ارتباط NADH. [ 6 ] يُعد NDUFB5 واحدًا من حوالي 31 وحدة فرعية كارهة للماء تُشكل المنطقة الغشائية للمعقد الأول، وهو من الوحدات الفرعية غير المحفزة لهذا المعقد. لوحظ أن النطاق الكاره للماء في الطرف الأميني لديه القدرة على الانطواء على شكل حلزون ألفا يمتد عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا، بينما يتفاعل النطاق المحب للماء في الطرف الكربوكسيلي مع الوحدات الفرعية الكروية للمركب الأول. يشير التركيب المحفوظ للغاية المكون من نطاقين إلى أن هذه السمة ضرورية لوظيفة البروتين، وأن النطاق الكاره للماء يعمل كمرساة لمركب نازعة هيدروجين NADH (يوبيكوينون) في الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. [ 5 ]

وظيفة

يشفر جين NDUFB5 البشري وحدة فرعية من المركب الأول لسلسلة التنفس ، والذي ينقل الإلكترونات من NADH إلى يوبيكوينون . [ 5 ] مع ذلك، يُعد NDUFB5 وحدة فرعية مساعدة في المركب، ويُعتقد أنه لا يشارك في عملية التحفيز. [ 9 ] في البداية، يرتبط NADH بالمركب الأول وينقل إلكترونين إلى حلقة الأيزوالوكسازين في الذراع الاصطناعية للفلافين أحادي النوكليوتيد (FMN) لتكوين FMNH₂ . تنتقل الإلكترونات عبر سلسلة من تجمعات الحديد والكبريت (Fe-S) في الذراع الاصطناعية، وأخيرًا إلى الإنزيم المساعد Q10 (CoQ)، الذي يُختزل إلى يوبيكوينول (CoQH₂ ) . يُغير تدفق الإلكترونات حالة الأكسدة والاختزال للبروتين، مما يؤدي إلى تغيير في بنيته وانزياح في قيمة pKa للسلسلة الجانبية القابلة للتأين، والتي بدورها تضخ أربعة أيونات هيدروجين خارج مصفوفة الميتوكوندريا. [ 6 ]

مراجع

  1. 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000136521 Ensembl ، مايو 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000027673 Ensembl ، مايو 2017
  3. "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  4. "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  5. 1 2 3 "Entrez Gene: NDUFB5 NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 5, 16kDa" .
  6. 1 2 3 فويت د ، فويت جي جي ، برات سي دبليو (2013). "الفصل 18". أساسيات الكيمياء الحيوية: الحياة على المستوى الجزيئي ( الطبعة الرابعة). هوبوكين، نيوجيرسي: وايلي. الصفحات 581-620 . ISBN   978-0-470-54784-7.
  7. زونغ، ن. س.، لي، هـ.، لام، م. ب.، خيمينيز، ر. س.، كيم، س. س.، دينغ، ن.، كيم، أ. ك.، تشوي، ج. هـ.، زيلايا، إ.، ليم، د.، ماير، د.، أوديبيرغ، ج.، فانغ، س.، لو، هـ. ج.، شو، ت.، فايس، ج.، دوان، هـ.، أولين، م.، ييتس، ج. ر.، أبوايلر، ر.، جي، ج.، هيرمياكوب، هـ.، بينغ، ب. (أكتوبر 2013). " دمج بيولوجيا وطب بروتينات القلب من خلال قاعدة معرفية متخصصة" . مجلة أبحاث الدورة الدموية . 113 (9): 1043-1053 . doi : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . PMC 4076475. PMID 23965338 .  
  8. "نازعة هيدروجين NADH [ يوبيكوينون ] 1 الوحدة الفرعية 5 من المركب الفرعي بيتا" . قاعدة بيانات أطلس بروتينات العضيات القلبية (COPaKB) . مؤرشف من الأصل بتاريخ 21-07-2018 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 18-07-2018 .
  9. "NDUFB5 - نازعة هيدروجين NADH [ يوبيكوينون ] 1 الوحدة الفرعية 5 من المركب الفرعي بيتا" . UniProt: مركز معلومات البروتينات . اتحاد UniProt . تم الاطلاع عليه في 2 أبريل 2015 .