راك سي اس 203

راك سي اس 203
تصنيف الفيروسات تعديل هذا التصنيف
(غير مصنف): فايروس
العالَم : ريبوفيريا
المملكة: أورثورنافيراي
الشعبة: بيسوفريكوتا
فصل: بيسونوفيريسيتس
طلب: نيدوفيراليس
عائلة: الفيروسات التاجية
جنس: فيروس كورونا بيتا
الجنس الفرعي: فيروس ساربيكوفا
صِنف:
أَضْنَى:
راك سي اس 203

RacCS203 هو سلالة مشتقة من الخفافيش من فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة، تم جمعها من خفافيش حدوة الحصان المدببة من مواقع في تايلاند وقام فريق لين فا وانج بتسلسلها. لديها تشابه تسلسلي بنسبة 91.5٪ مع SARS-CoV-2 وهي الأكثر ارتباطًا بسلالة RmYN02 . يرتبط بروتين سبايك الخاص بها ارتباطًا وثيقًا بسنايك RmYN02، وكلاهما متباعدان للغاية عن سبايك SARS-CoV-2. [1] [2]

علم الوراثة التطوري

شجرة التطور

شجرة النشوء والتطور القائمة على تسلسلات الجينوم الكامل لفيروس SARS-CoV-2 والفيروسات التاجية ذات الصلة هي: [3] [4]

فيروس كورونا المرتبط بـ SARS‑CoV‑2

( الخفاش ) Rc-o319 ، 81% إلى SARS-CoV-2، Rhinolophus cornutus ، إيواتي ، اليابان [5]

الخفافيش SL-ZXC21 ، 88% إلى SARS-CoV-2، Rhinolophus Pusillus ، تشوشان ، تشجيانغ [6]

الخفافيش SL-ZC45 ، 88% إلى SARS-CoV-2، Rhinolophus Pusillus ، تشوشان، تشجيانغ [6]

آكل النمل الحرشفي SARSr-CoV-GX، 85.3% إلى SARS-CoV-2، Manis javanica ، مهرب من جنوب شرق آسيا [7]

آكل النمل الحرشفي SARSr-CoV-GD، 90.1% إلى SARS-CoV-2، Manis javanica ، مهرب من جنوب شرق آسيا [8]

الخفافيش RshSTT182، 92.6% لـ SARS-CoV-2، رينولوفوس شاميلي ، ستيونج ترينج ، كمبوديا [9]

الخفافيش RshSTT200، 92.6% لـ SARS-CoV-2، Rhinolophus Shameli ، ستيونغ ترينج، كمبوديا [9]

(Bat) RacCS203، 91.5% لـ SARS-CoV-2، Rhinolophus acuminatus ، Chachoengsao ، تايلاند [4]

(الخفافيش) RmYN02 ، 93.3% لـ SARS-CoV-2، Rhinolophus malayanus ، Mengla ، Yunnan [10]

(الخفافيش) RpYN06 ، 94.4% لـ SARS-CoV-2، Rhinolophus Pusillus ، شيشوانغباننا ، يونان [3]

(الخفافيش) RaTG13 ، 96.1% لـ SARS-CoV-2، Rhinolophus affinis ، موجيانغ ، يوننان [11]

(الخفافيش) BANAL-52، 96.8% إلى SARS-CoV-2، Rhinolophus malayanus ، فينتيان ، لاوس [12]

سارس-كوف-2

سارس-كوف-1 ، 79% إلى سارس-كوف-2

مقارنة الجينوم

SARS-CoV-2 مقارنة بفيروسات SARSr-CoV الأخرى (حسب النوكليوتيدات٪) [13]
أَضْنَى الجينوم كامل الطول أو آر إف 1 أب س إدارة النتائج أو آر إف 3أ هـ م أو آر إف 6 أو آر إف 7أ أو آر إف 7ب أو آر إف 8 ن أو آر إف 10
را تي جي 13 96.10% 96.50% 92.30% 86.30% 96.30% 99.60% 95.50% 98.40% 95.60% 99.20% 97.00% 96.90% 99.20%
ر م ي ن 02 93.60% 97.10% 72.50% 61.90% 96.40% 98.70% 94.80% 96.80% 96.20% 91.00% 48.70% 97.30% 99.20%
راك سي اس 203 91.50% 94.30% 71.30% 61.60% 91.90% 99.10% 94.60% 96.20% 92.40% 93.90% 91.60% 93.20% 99.20%
ج.د/1/2019 90.20% 90.20% 83.70% 86.90% 93.20% 99.10% 93.30% 95.70% 93.40% 91.70% 92.10% 96.20% 99.20%
SL-ZC45 87.70% 89.00% 75.50% 62.50% 87.80% 98.70% 93.40% 94.60% 88.80% 94.70% 88.50% 91.10% 99.20%
SL-ZXC21 87.50% 88.70% 74.90% 61.60% 88.90% 98.70% 93.40% 94.60% 89.10% 95.50% 88.50% 91.20% 99.20%
جي اكس-بي4 ال 85.40% 84.80% 83.60% 80.00% 86.80% 97.40% 91.30% 90.90% 86.60% 83.50% 81.30% 91.00% 88.90%
جي اكس-بي 5 ال 85.20% 84.60% 83.30% 79.90% 87.00% 97.40% 91.30% 90.90% 86.40% 83.50% 80.70% 91.00% 94.00%
فيروس كورونا المستجد 79.30% 79.70% 72.30% 71.90% 75.30% 93.50% 85.50% 75.50% 82.10% 83.80% 45.80% 88.20% 93.20%
ار سي-او319 79.20% 79.80% 72.20% 70.10% 83.30% 97.40% 86.60% 86.60% 78.40% 77.30% 52.30% 88.30% 94.90%
SARS-CoV-2 مقارنة بفيروسات SARSr-CoV الأخرى (حسب نسبة الأحماض الأمينية) [13]
أَضْنَى الجينوم كامل الطول أو آر إف 1 أب س إدارة النتائج أو آر إف 3أ هـ م أو آر إف 6 أو آر إف 7أ أو آر إف 7ب أو آر إف 8 ن أو آر إف 10
را تي جي 13 98.50% 97.30% 90.10% 97.80% 100.00% 99.60% 100.00% 97.50% 97.70% 95.00% 99.10% 97.40%
ر م ي ن 02 98.80% 72.40% 63.20% 96.70% 100.00% 98.70% 96.70% 95.90% 83.70% 28.20% 98.60% 97.40%
راك سي اس 203 97.30% 72.30% 63.70% 97.50% 100.00% 99.10% 98.40% 95.90% 93.00% 94.20% 95.70% -
ج.د/1/2019 96.70% 90.00% 96.90% 97.10% 100.00% 98.70% 96.70% 97.50% 95.40% 95.00% 97.90% 97.40%
SL-ZC45 95.60% 80.20% 65.90% 90.90% 100.00% 98.70% 93.40% 87.60% 93.00% 94.20% 94.30% 97.40%
SL-ZXC21 95.20% 79.70% 65.90% 92.00% 100.00% 98.70% 93.40% 88.40% 93.00% 94.20% 94.30% -
جي اكس-بي4 ال 92.50% 92.30% 86.60% 89.50% 100.00% 98.20% 95.10% 88.40% - 87.60% 93.60% 73.70%
جي اكس-بي 5 ال 92.50% 92.40% 86.60% 89.80% 100.00% 98.20% 95.10% 88.40% 72.10% 87.60% 93.80% 84.20%
فيروس كورونا المستجد 86.10% 75.80% 73.10% 72.40% 94.70% 90.50% 67.20% 85.30% 81.40% - 90.50% 81.60%
ار سي-او319 87.60% 76.20% 73.50% 87.00% 98.70% 91.00% 83.60% 73.80% 69.80% 26.80% 89.50% 86.80%

انظر أيضا

  • RaTG13 ، تشابه بنسبة 96.2% مع SARS-COV-2
  • RmYN02 ، تشابه بنسبة 93.3% مع SARS-COV-2

مراجع

  1. ^ واشارابلوسادي، س؛ تان، سي دبليو. مانيورن ، ف. دوينجكاي ، ف. تشو، ف؛ جويجيندا ، واي. كايوبوم، تي؛ شيا، WN؛ أمبوت، دبليو؛ ليم، بل. ووراتشوتسويبتراكون ، ك . تشن، VC. سيريشان ، ن. روتشيسريسارود ، سي . رودبان، أ؛ نوراديشانون ، ك. فايشانا، تي؛ جانتارات، ن؛ ثونجنومتشيما، ب؛ تو، ج؛ كريميري ، جي. ستوكس، مم؛ هيماتشودا، تي؛ وانغ ، إل إف (9 فبراير 2021). “دليل على انتشار فيروسات كورونا المرتبطة بـ SARS-CoV-2 في الخفافيش والبانغولين في جنوب شرق آسيا”. اتصالات الطبيعة . 12 (1): 972. بيب كود :2021NatCo..12..972W. doi : 10.1038/s41467-021-21240-1 . PMC  7873279 . PMID  33563978.
  2. ^ "فيروس كورونا: علماء الخفافيش يجدون أدلة جديدة". بي بي سي نيوز . 10 فبراير 2021.
  3. ^ ab Zhou H, Ji J, Chen X, Bi Y, Li J, Wang Q, et al. (أغسطس 2021). "تحديد فيروسات كورونا الخفافيش الجديدة يلقي الضوء على الأصول التطورية لفيروس سارس-كوف-2 والفيروسات ذات الصلة". Cell . 184 (17): 4380–4391.e14. doi :10.1016/j.cell.2021.06.008. PMC 8188299. PMID  34147139 . 
  4. ^ أب Wacharapluesadee S، Tan CW، Maneeorn P، Duengkae P، Zhu F، Joyjinda Y، et al. (فبراير 2021). “دليل على انتشار فيروسات كورونا المرتبطة بـ SARS-CoV-2 في الخفافيش والبانجولين في جنوب شرق آسيا”. اتصالات الطبيعة . 12 (1): 972. بيب كود :2021NatCo..12..972W. دوى : 10.1038/s41467-021-21240-1 . بمك 7873279 . بميد  33563978. 
  5. ^ Murakami S, Kitamura T, Suzuki J, Sato R, Aoi T, Fujii M, et al. (ديسمبر 2020). "اكتشاف ووصف فيروس ساربيكو الخفاش المرتبط من الناحية التطورية بفيروس سارس-كوف-2، اليابان". الأمراض المعدية الناشئة . 26 (12): 3025-3029. doi :10.3201/eid2612.203386. PMC 7706965. PMID  33219796 . 
  6. ^ ab Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (يونيو 2020). "فيروس كورونا الخفاش الجديد المرتبط ارتباطًا وثيقًا بفيروس سارس-كوف-2 يحتوي على إدخالات طبيعية في موقع انقسام S1/S2 لبروتين سبايك". علم الأحياء الحالي . 30 (11): 2196–2203.e3. doi :10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627. PMID  32416074 . 
  7. ^ لام تي تي، جيا إن، تشانغ واي دبليو، شوم إم إتش، جيانغ جي إف، تشو إتش سي، وآخرون. (يوليو 2020). “التعرف على الفيروسات التاجية المرتبطة بـ SARS-CoV-2 في حيوانات البنغولين الماليزية”. طبيعة . 583 (7815): 282-285. بيب كود :2020Natur.583..282L. دوى :10.1038/s41586-020-2169-0. بميد  32218527. S2CID  214683303.
  8. ^ شياو ك، تشاي جي، فنغ واي، تشو إن، تشانغ إكس، زو جي جي، وآخرون. (يوليو 2020). “عزل فيروس كورونا المرتبط بـ SARS-CoV-2 من البنغولين الماليزي”. طبيعة . 583 (7815): 286-289. بيب كود :2020Natur.583..286X. دوى :10.1038/s41586-020-2313-x. بميد  32380510. S2CID  256822274.
  9. ^ أ ب ديلاون د، هول الخامس، كارلسون إي، حسنين أ، أوو تي بي، بيداليوك أ، وآخرون. (نوفمبر 2021). “فيروس تاجي جديد مرتبط بـ SARS-CoV-2 في الخفافيش من كمبوديا”. اتصالات الطبيعة . 12 (1): 6563. بيب كود :2021NatCo..12.6563D. دوى :10.1038/s41467-021-26809-4. بمك 8578604 . بميد  34753934. 
  10. ^ Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (يونيو 2020). "فيروس كورونا الخفاش الجديد المرتبط ارتباطًا وثيقًا بفيروس سارس-كوف-2 يحتوي على إدخالات طبيعية في موقع انقسام S1/S2 لبروتين سبايك". علم الأحياء الحالي . 30 (11): 2196–2203.e3. doi :10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627. PMID  32416074 . 
  11. ^ Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (مارس 2020). "تفشي الالتهاب الرئوي المرتبط بفيروس كورونا الجديد من المحتمل أن يكون من أصل خفافيش". Nature . 579 (7798): 270–273. Bibcode :2020Natur.579..270Z. doi :10.1038/s41586-020-2012-7. PMC 7095418. PMID  32015507 . 
  12. ^ تمام إس، فونجفايلوث ك، باكويرو إي، منير إس، بونومي إم، ريجنولت بي، وآخرون. (أبريل 2022). “الفيروسات التاجية الخفافيش المرتبطة بـ SARS-CoV-2 والمعدية للخلايا البشرية”. طبيعة . 604 (7905): 330-336. بيب كود :2022Natur.604..330T. دوى :10.1038/s41586-022-04532-4. بميد  35172323. S2CID  246902858.
  13. ^ أب Wacharapluesadee، Supaporn؛ تان، تشي واه؛ مانيورن، باتارابول؛ دوينجكاي، براتيب؛ تشو فنغ. جويجيندا، يوثانا؛ كايوبوم، ثونجتشاي؛ شيا، وان ني؛ أمبوت، ويناسارين؛ ليم، بنج لي. ووراتشوتسويبتراكون، كانثيتا (2021-02-09). “دليل على انتشار فيروسات كورونا المرتبطة بـ SARS-CoV-2 في الخفافيش والبانجولين في جنوب شرق آسيا”. اتصالات الطبيعة . 12 (1): 972. بيب كود :2021NatCo..12..972W. دوى :10.1038/s41467-021-21240-1. ISSN  2041-1723. بمك 7873279 . PMID  33563978. 
تم الاسترجاع من "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=RacCS203&oldid=1189484686"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate