فيروسات نيدو

📅 آخر تحديث: ٣ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٣ أغسطس ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 3 صور
الموسوعة الحرة

رتبة الفيروسات العشية ( Nidovirales) هيرتبة من الفيروسات المغلفة ذات،والتي تصيب الفقاريات واللافقاريات. تشمل الكائنات المضيفة الثدييات والطيور والزواحف والبرمائيات والأسماك والمفصليات والرخويات والديدان الطفيلية . [ 1 ] تضم هذه الرتبة عائلات الفيروسات التاجية (Coronaviridae ) والفيروسات الشريانية (Arteriviridae ) والفيروسات الرونية (Roniviridae ) والفيروسات التوبانية ( Tobaniviridae ) والفيروساتالميزونية (Mesoniviridae ) . [ 2 ]

تحتوي الفيروسات المنتمية لهذه الرتبة على غلاف فيروسي وجينوم من الحمض النووي الريبي أحادي السلسلة موجب الاتجاه ، مُغطى ومُذيّل بذيل متعدد الأدينين . [ 3 ] سُميت فيروسات نيدو نسبةً إلى الكلمة اللاتينية nidus ، التي تعني عش، حيث تُنتج جميع الفيروسات في هذه الرتبة مجموعة متداخلة من الحمض النووي الريبي الرسول الفرعي في الطرف 3' أثناء العدوى. [ 4 ]

علم الفيروسات

بناء

مقارنة بين الجينومات والبروتينات لعائلات مختلفة من فيروسات نيدوفيروس

تمتلك فيروسات نيدو غلافًا فيروسيًا وجينومًا من الحمض النووي الريبي أحادي السلسلة موجب الاتجاه، مُغطى بغطاء ومُذيّل بذيل متعدد الأدينين. [ 3 ] تُنتج هذه المجموعة بروتينات هيكلية منفصلة عن البروتينات غير الهيكلية. تُشفّر البروتينات الهيكلية في المنطقة 3' من الجينوم ، ويتم التعبير عنها من مجموعة من جزيئات الحمض النووي الريبي الرسول الفرعية .

تحتوي الفيروسات المنتمية إلى هذه المجموعة على بروتياز رئيسي واحد ، وما بين بروتياز واحد وثلاثة بروتيازات مساعدة، والتي تُشارك بشكل أساسي في التعبير عن جين النسخ . كما أن هذه البروتيازات مسؤولة عن تنشيط أو تعطيل بروتينات محددة في الوقت المناسب من دورة حياة الفيروس، مما يضمن حدوث التضاعف في الوقت المناسب.

الجينوم

يمكن تمييز فيروسات نيدو عن فيروسات الحمض النووي الريبي الأخرى من خلال مجموعة من سبعة نطاقات محفوظة - 5'-TM2-3CLpro-TM3-RdRp-Zm-HEL1-NendoU-3' - حيث تُشفّر النطاقات الثلاثة الأولى في ORF1a ، بينما تُشفّر النطاقات الأربعة المتبقية في ORF1b . يُعدّ كل من TM2 وTM3 نطاقين غشائيين ؛ وRdRp هو بوليميراز الحمض النووي الريبي المعتمد على الحمض النووي الريبي ؛ وZm هو نطاق ارتباط بمجموعة الزنك مُدمج مع إنزيم الهيليكاز (HEL1)؛ و3CLpro هو بروتياز شبيه بـ 3C ؛ وNendoU هو إنزيم نوكلياز داخلي متخصص في اليوريديلات . يحتوي 3CLpro على ثنائي هيستيدين - سيستين محفز ، وهو مُرتبط بالبروتياز الرئيسي لفيروس كورونا المسبب لمتلازمة الالتهاب الرئوي الحاد (Mpro).

تحتوي معظم، وليس كل، جزيئات الحمض النووي الريبوزي الفرعية لفيروسات نيدوفيروس على تسلسل قائد 5′ مشتق من الطرف 5′ للحمض النووي الريبوزي الجينومي. يحدث انزياح الإطار الذي يُولّد انزياح إطار القراءة المفتوح 1b عند تسلسل سباعي النوكليوتيدات UUUAAAC "الزلق" الموجود في اتجاه 5′ من كودون التوقف الخاص بـ ORF1a وبنية عقدة كاذبة افتراضية في الحمض النووي الريبوزي .

تم تحديد العديد من البروتينات في جينومات فيروسات نيدو ، لكن وظائفها لم تُحدد بعد. تشمل الإنزيمات الأخرى التي قد تكون موجودة في الجينوم بروتيازات شبيهة بالباباين ، وإنزيمات ربط ADP-ريبوز/بولي(ADP-ريبوز) أو فوسفاتاز ADP-ريبوز 1''-فوسفات، وفوسفودايستراز النيوكليوتيد الحلقي .

علم الوراثة العرقي

علم الوراثة وتنظيم نطاق pp1ab لفيروسات نيدوفيروس مختارة. [ 5 ]

يمكن تقسيم رتبة Nidovirales إلى مجموعتين فرعيتين اعتمادًا على حجم الجينوم: تلك التي تحتوي على جينومات كبيرة (26.3-31.7 كيلوبايت) والتي تشمل Coronaviridae و Roniviridae (فيروسات nido الكبيرة) وتلك التي تحتوي على جينومات صغيرة (فيروسات nido الصغيرة) - وهي مجموعة فرعية تشمل Arteriviridae ذات الصلة البعيدة (12.7-15.7 كيلوبايت).

تحتوي الفيروسات الكبيرة من نوع نيدوفيروس على جينين: جين ناقل ميثيل 2'-O وجين إكسوريبونوكلياز 3'–5' (ExoN)، وهو جين نادر جدًا بالنسبة لفيروسات الحمض النووي الريبي. كما تحتوي أيضًا على جين هيليكاز من العائلة الفائقة 1 ، وجين إندونوكلياز خاص باليوريديلات (وهو إنزيم فريد من نوعه في فيروسات نيدوفيروس)، بالإضافة إلى العديد من البروتيازات.

تُعدّ فيروسات نيدوفيروس، كمجموعة، صاحبة أكبر جينومات RNA بين الفيروسات. ومن أكبر الجينومات المُبلّغ عنها لفيروسات RNA فيروس نيدوفيروس Crassostrea gigas (CGNV) [ 6 ] وفيروس نيدوفيروس Pacific oyster 1 (PONV 1)؛ [ 7 ] وهما مُجزّآن، ويبلغ حجمهما حوالي 64 كيلوبايت، ويُصيبان محار المحيط الهادئ . وهما ينتميان إلى مجموعة واسعة الانتشار من الفيروسات التي تنتمي إلى عائلة Megarnaviridae المُقترحة. [ 7 ] سابقًا، كان أكبر جينوم مُبلّغ عنه هو جينوم فيروس نيدوفيروس الخلايا الإفرازية للبلاناريا (PSCNV) غير المُجزّأ، والذي يبلغ حجمه 41.1 كيلوبايت [ 8 ] ويُصيب دودة بلاناريا المُسطّحة . [ 9 ]

التصنيف

يتم الاعتراف بالرتب الفرعية والعائلات التالية (- virineae تشير إلى الرتب الفرعية و- viridae تشير إلى العائلات): [ 10 ]

شجرة تصنيف رتبة الفيروسات العشية

انظر أيضاً

مراجع

  1. ^ أوغاندو، ناتاشا س. فيرون، فرانسوا؛ ديكرولي، إتيان؛ كانارد، برونو؛ بوستوما، كلارا سي؛ شنايدر، إريك ج. (2019). "الحالة الغريبة لفيروس Nidovirus Exoribonuclease: دوره في تخليق الحمض النووي الريبي (RNA) ودقة النسخ" . الحدود في علم الأحياء الدقيقة . 10 : 1813. دوى : 10.3389/fmicb.2019.01813 . ISSN 1664-302X . بمك 6693484 . بميد 31440227 .   
  2. ↑ "اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV)" . talk.ictvonline.org . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2020-06-08 .
  3. 1 2 كينغ، أندرو إم كيو؛ آدامز، مايكل جيه؛ كارستنز، إريك بي؛ ليفكوفيتز، إليوت جيه، محرران. (2012-01-01). "رتبة - نيدوفيراليس" . تصنيف الفيروسات . إلسيفير. ص 784-794 . doi : 10.1016/B978-0-12-384684-6.00066-5 . ISBN  978-0-12-384684-6. PMC 7150239 . S2CID 218627729 . تم الاسترجاع بتاريخ 2020-06-08 .  
  4. ↑ أنطوان أ. ف. دي فريس؛ ماريان س. هورزينك؛ بيتر ج. م. روتييه؛ راؤول ج. دي غروت (1997). " تنظيم جينوم فيروسات نيدو: أوجه التشابه والاختلاف بين فيروسات الشرايين، وفيروسات تورو، وفيروسات كورونا" . ندوات في علم الفيروسات . 8 (1): 33-47 . CiteSeerX 10.1.1.462.1825 . doi : 10.1006/smvy.1997.0104 . PMC 7128191. PMID 32288441. S2CID 85383257 .    
  5. ^ جولييفا ، اناستازيا أ. جوربالينيا ، ألكسندر إي. (يناير 2021). "منظور nidovirus على SARS-CoV-2" . الاتصالات البحثية البيوكيميائية والفيزيائية الحيوية . 538 : 24– 34. دوى : 10.1016/j.bbrc.2020.11.015 . بمك 7664520 . بميد 33413979 .  
  6. ↑ نيومان، بنيامين و.؛ سمارت، ألكساندريا؛ جيلمر، أوريان؛ سميث، ريدموند ب.؛ فاس، جوزيف؛ بوكر، نيكولاي؛ سامبورسكي، ديمتري ف.؛ بارتنشلاغر، رالف؛ سيتز، ستيفان؛ غوربالينيا، ألكسندر إي.؛ كاليسكان، نيفا؛ لاوبر، كريس (18 فبراير 2025). "جينومات الحمض النووي الريبي العملاقة: أدوار المضيف، واستطالة الترجمة، وبنية الجينوم، والبروتيوم في فيروسات نيدو" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 122 (7) e2413675122. doi : 10.1073/pnas.2413675122 . PMC 11848433. PMID 39928875 .  
  7. 1 2 تشونغ، كيفن شو؛ تشان، إيمي م.؛ ميلر، كريستينا م.؛ سوندرز، روب؛ ساتل، كورتيس أ. (19 أغسطس 2025). "تم تحديد فيروس نيدوفيروس متباين تطوريًا ذو جينوم كبير بشكل استثنائي في محار المحيط الهادئ الذي يتعرض لنفوق جماعي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 122 (33) e2426923122. doi : 10.1073/pnas.2426923122 . PMC 12377751 . 
  8. ↑ "متصفح التصنيف (فيروس بلانيدو 1)" . www.ncbi.nlm.nih.gov . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2020-06-08 .
  9. ↑ صابري، أمير؛ جوليايفا، أناستاسيا أ.؛ بروباشر، جون ل.؛ نيومارك، فيليب أ.؛ غوربالينيا، ألكسندر إي. (2018-11-01). "فيروس نيدوفيروس في الديدان المسطحة يوسع حدود حجم جينوم الحمض النووي الريبي" . مجلة PLOS للأمراض . 14 (11) e1007314. doi : 10.1371/journal.ppat.1007314 . ISSN 1553-7374 . PMC 6211748. PMID 30383829 .   
  10. ↑ "تصنيف الفيروسات: إصدار 2019" . talk.ictvonline.org . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاطلاع عليه بتاريخ 30 أبريل 2020 .