فيروس كورونا بيتا
| فيروس كورونا بيتا | |
|---|---|
| صورة مجهرية إلكترونية لفيروس كورونا الفأري (MHV)، هيكل تخطيطي وجينوم | |
| تصنيف الفيروسات | |
| (غير مصنف): | فايروس |
| العالَم : | ريبوفيريا |
| المملكة: | أورثورنافيراي |
| الشعبة: | بيسوفريكوتا |
| فصل: | بيسونوفيريسيتس |
| طلب: | نيدوفيراليس |
| عائلة: | الفيروسات التاجية |
| الفصيلة الفرعية: | فيروسات كورونا الأورثو |
| جنس: | فيروس كورونا بيتا |
| الأجناس الفرعية والأنواع | |
|
انظر النص | |
فيروس كورونا بيتا (β-CoVs أو Beta-CoVs) هو أحد الأجناس الأربعة ( ألفا وبيتاوجاما ودلتا ) من فيروسات كورونا . الفيروسات الأعضاء هي فيروسات مغلفة ذات سلسلة موجبة من الحمض النووي الريبي تصيب الثدييات ، بما في ذلك البشر . الخفافيش والقوارض هي الخزان الطبيعي لفيروسات كورونا بيتا. القوارض هي الخزان للجنس الفرعي Embecovirus ، بينما الخفافيش هي الخزان للجنس الفرعي الآخر. [1]
تتكون كل جنس من أجناس فيروسات كورونا من سلالات فيروسية مختلفة، ويحتوي جنس فيروسات بيتا كورونا على أربعة سلالات من هذا القبيل: A، B، C، D. في الأدبيات القديمة، يُعرف هذا الجنس أيضًا باسم "فيروسات كورونا من المجموعة 2". ينتمي الجنس إلى الفصيلة الفرعية Orthocoronavirinae في عائلة Coronaviridae ، من رتبة Nidovirales .
الفيروسات التاجية بيتا ذات الأهمية السريرية الأكبر فيما يتعلق بالبشر هي OC43 و HKU1 (والتي يمكن أن تسبب نزلات البرد الشائعة ) من السلالة A، و SARS-CoV-1 و SARS-CoV-2 (أسباب السارس وكوفيد -19 على التوالي) من السلالة B، [2] و MERS-CoV (سبب MERS ) من السلالة C. MERS-CoV هو أول فيروس كورونا بيتا ينتمي إلى السلالة C المعروف أنه يصيب البشر. [3] [4]
علم أصول الكلمات
اسم "فيروس كورونا بيتا" مشتق من الكلمة اليونانية القديمة βῆτα ( bē̂ta ، " الحرف الثاني من الأبجدية اليونانية ")، وκορώνη (korṓnē، "إكليل الزهور")، والتي تعني التاج، والتي تصف مظهر النتوءات السطحية التي تُرى تحت المجهر الإلكتروني والتي تشبه الهالة الشمسية . يتم إنشاء هذا الشكل بواسطة peplomers الفيروسية (S) ، وهي بروتينات تملأ سطح الفيروس وتحدد اتجاه المضيف . تم تسمية رتبة Nidovirales على اسم الكلمة اللاتينية nidus ، والتي تعني "العش". يشير إلى إنتاج هذه الرتبة لمجموعة متداخلة من mRNAs الفرعية الجينومية 3' أثناء العدوى. [5]
بناء

تم حل العديد من هياكل بروتينات السنبلة. يتم تصنيف مجال ربط المستقبلات في بروتين السنبلة لفيروسات ألفا وبيتا كورونا باسم InterPro : IPR018548 . [6] يتجمع بروتين السنبلة، وهو آلة اندماج من النوع 1 ، في ثلاثي ( PDB : 3jcl، 6acg )؛ يشبه هيكله الأساسي هيكل بروتينات باراميكسوفيروس F (الاندماج). [7] استخدام المستقبلات ليس محفوظًا جدًا؛ على سبيل المثال، بين فيروس ساربيكو ، فقط سلالة فرعية تحتوي على السارس تشترك في مستقبل ACE2 .
تختلف فيروسات الجنس الفرعي Embecovirus عن جميع الفيروسات الأخرى في هذا الجنس في أنها تحتوي على بروتين إضافي أقصر (8 نانومتر) يشبه السنبلة يسمى هيماجلوتينين استريز (HE) ( P15776 ). ويُعتقد أنه تم اكتسابه من فيروس الإنفلونزا C. [ 5] [8]
الجينوم
.jpg/440px-Temi_a_1736644_f0001_oc_(1).jpg)
تتمتع فيروسات كورونا بحجم جينوم كبير يتراوح من 26 إلى 32 كيلو قاعدة. يشبه الهيكل العام لجينوم β-CoV هيكل فيروسات كورونا الأخرى، مع وجود بولي بروتين نسخي ORF1ab ( rep ، pp1ab ) يسبق العناصر الأخرى. ينقسم هذا البولي بروتين إلى 16 بروتينًا غير بنيوي (انظر شرح UniProt لـ SARS rep ، P0C6X7 ).
اعتبارًا من مايو 2013، يحتوي GenBank على 46 جينومًا كاملاً منشورًا لفيروسات كورونا α- (المجموعة 1)، وβ- (المجموعة 2)، وγ- (المجموعة 3)، وδ- (المجموعة 4). [9]
إعادة التركيب
يمكن أن يحدث إعادة التركيب الجيني عندما يوجد جينوم فيروسي أو أكثر في نفس الخلية المضيفة. يُظهر الجمل العربي Beta-CoV HKU23 تنوعًا وراثيًا في مجموعة الإبل الأفريقية. [10] يساهم في هذا التنوع العديد من أحداث إعادة التركيب التي حدثت في الماضي بين فيروسات بيتا كورونافيروس ذات الصلة الوثيقة من الجنس الفرعي Embecovirus . [10] كما يبدو أن فيروس بيتا كورونافيروس، Human SARS-CoV ، كان له تاريخ معقد من إعادة التركيب بين فيروسات كورونا السلفية التي كانت موجودة في العديد من مجموعات الحيوانات المختلفة. [11] [12]
التسبب في المرض

تصيب فيروسات كورونا ألفا وبيتا الخفافيش بشكل أساسي، لكنها تصيب أيضًا أنواعًا أخرى مثل البشر والإبل والقوارض . [13] [14] [15] تسبب فيروسات كورونا بيتا التي تسببت في أوبئة لدى البشر عمومًا الحمى وأعراض الجهاز التنفسي. وهي تشمل:
- SARS-CoV ، المسبب لمرض السارس .
- فيروس كورونا الشرق الأوسط ، المسبب لمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية .
- سارس-كوف-2 ، المسبب لمرض كوفيد-19 .
تصنيف

ضمن جنس فيروس كورونا بيتا (مجموعة 2 من فيروسات كورونا)، تم التعرف تقليديًا على أربعة أجناس فرعية أو سلالات (A وB وC وD). [5] كما تم تسمية السلالات الأربعة باستخدام الحروف اليونانية أو الأرقام. [9] تمت إضافة جنس فرعي خامس، فيروس هيبكوفايروس ، مؤخرًا. [16] تشمل الأجناس الفرعية والأنواع الأعضاء: [17]
فيروس إمبيكو(سلالة أ)
فيروس كورونا الصيني Rattus HKU24
فيروس كورونا البشري HKU1
فيروس كورونا الفأري
فيروس ساربيكوفا(سلالة ب)
فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة (SARSr-CoV أو SARS-CoV)
- فيروس كورونا المسبب لمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة (SARS-CoV أو SARS-CoV-1)
- متلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة فيروس كورونا 2 (SARS-CoV-2)
- فيروس كورونا الشبيه بالسارس WIV1 (Bat SL-CoV-WIV1)
- فيروس كورونا الخفاشي RaTG13
| فيروسات كورونا |
|---|
فيروس الميربيكو(سلالة ج)
فيروس كورونا القنفذ 1
المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية (MERS-CoV) فيروس كورونا
الخفاشي Pipistrellus HKU5
فيروس كورونا الخفاشي Tylonycteris HKU4
نوبيكوفيرويس(سلالة د)
فيروس إيدولون الخفافيش الفيروسي التاجي C704
فيروس خفاش روسيتوس GBDC1
فيروس خفاش روسيتوس HKU9
فيروس هيبكوفايروس
فيروس بات إتش بي بيتا كورونا تشجيانغ 2013
انظر أيضا
مراجع
- ^ Wartecki, Adrian; Rzymski, Piotr (يونيو 2020). "حول فيروسات كورونا وارتباطاتها بالبيئة المائية ومياه الصرف الصحي". المياه . 12 (6): 1598. doi : 10.3390/w12061598 .
- ^ "التطور التطوري لفيروسات بيتا كورونا الشبيهة بسارس". nextstrain . تم الاسترجاع في 18 يناير 2020 .
- ^ ProMED. MERS-CoV–Eastern Mediterranean (06) (http://www.promedmail.org/)
- ^ Memish, ZA; Zumla, AI; Al-Hakeem, RF; Al-Rabeeah, AA; Stephens, GM (2013). "مجموعة عائلية من عدوى فيروس كورونا المسبب لمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية". مجلة نيو إنجلاند الطبية . 368 (26): 2487–94. doi : 10.1056/NEJMoa1303729 . PMID 23718156.
- ^ اي بي سي وو ، باتريك سي واي. هوانغ، يي؛ لاو ، سوزانا ك.ب. يوين ، كووك يونج (2010/08/24). “جينوميات فيروس كورونا وتحليل المعلوماتية الحيوية”. الفيروسات . 2 (8): 1804–20. دوى : 10.3390/v2081803 . بمك 3185738 . بميد 21994708.
- ^ هوانغ ، سي. تشى، ي. لو، جي؛ وانغ، س؛ يوان ، ص . وو ، ص. تشانغ، ص. يان، ج؛ جاو، جي إف (1 نوفمبر 2016). “مجال ربط المستقبلات المفترض لبروتين سبايك HKU9 المشتق من فيروس كورونا المشتق من الخفافيش: تطور أشكال ربط مستقبلات فيروس كورونا بيتا”. الكيمياء الحيوية . 55 (43): 5977–88. دوى : 10.1021/acs.biochem.6b00790 . بمك 7075523 . بميد 27696819.
- ^ Walls, Alexandra C.; Tortorici, M. Alejandra; Bosch, Berend-Jan; Frenz, Brandon; Rottier, Peter JM; DiMaio, Frank; Rey, Félix A.; Veesler, David (8 فبراير 2016). "بنية المجهر الإلكتروني المبرد لثلاثي بروتين سبايك الفيروس التاجي". Nature . 531 (7592): 114–117. Bibcode :2016Natur.531..114W. doi : 10.1038/nature16988. PMC 5018210. PMID 26855426.
- ^ بيكرز ، مارك جي جي. لانج، ييفي؛ فييتسما، لوريس J.؛ هولسويت ، روبن جي جي. بوت، ستيفاني أه دي؛ فليت، أرنو إل دبليو فان؛ مارجين، إيرينا؛ جروت-ميجنس، جولاندا دي إف دي؛ كوبيفيلد، فرانك جي إم فان؛ لانجيريس، مارتين أ؛ هويزينجا ، إريك ج. (2017/03/08). “تكيف فيروس بيتا كورونا مع البشر ينطوي على فقدان تدريجي لنشاط الهيماجلوتينين-إيستيراز ليكتين”. مضيف الخلية والميكروب . 21 (3): 356-366. دوى : 10.1016/j.chom.2017.02.008 . ISSN 1931-3128. بمك 7104930 . بميد 28279346.
- ^ ab Cotten, Matthew; Lam, Tommy T.; Watson, Simon J.; Palser, Anne L.; Petrova, Velislava; Grant, Paul; Pybus, Oliver G.; Rambaut, Andrew; Guan, Yi; Pillay, Deenan; Kellam, Paul; Nastouli, Eleni (2013-05-19). "التسلسل الكامل للجينوم والتحليل التطوري لفيروس بيتا كورونا البشري الجديد". الأمراض المعدية الناشئة . 19 (5): 736–42B. doi :10.3201/eid1905.130057. PMC 3647518. PMID 23693015 .
- ^ ab كشف تنوع فيروس كورونا HKU23 في الإبل الأفريقية عن أحداث إعادة تركيب متعددة بين فيروسات بيتا كورونا ذات الصلة الوثيقة من جنس Embecovirus. So RTY، وآخرون. J Virol. 2019. PMID 31534035
- ^ Stanhope MJ, Brown JR, Amrine-Madsen H. Evidence from the evolutionary analysis of nucleotide sequences for a recombinant history of SARS-CoV. Infect Genet Evol. 2004 Mar;4(1):15-9. PMID 15019585
- ^ Zhang XW, Yap YL, Danchin A. Testing the hypothesis of a recombinant origin of the SARS-associated coronavirus. Arch Virol. 2005 Jan;150(1):1-20. Epub 2004 Oct 11. PMID 15480857
- ^ Woo, PC; Wang, M.; Lau, SK; Xu, H.; Poon, RW; Guo, R.; Wong, BH; Gao, K.; Tsoi, HW; Huang, Y.; Li, KS; Lam, CS; Chan, KH; Zheng, BJ; Yuen, KY (2007). "تحليل مقارن لاثني عشر جينومًا لثلاثة فيروسات تاجية جديدة من المجموعة 2c والمجموعة 2d يكشف عن سمات فريدة للمجموعة والمجموعات الفرعية". مجلة علم الفيروسات . 81 (4): 1574-1585. doi :10.1128/JVI.02182-06. PMC 1797546. PMID 17121802 .
- ^ لاو ، كورونا. وو، جهاز الكمبيوتر؛ ييب، CC. مروحة، ري؛ هوانغ، Y.؛ وانغ، م. قوه، ر. لام، CS؛ تسانغ، أيه كيه؛ لاي، ك. تشان، خ. تشي، XY؛ تشنغ، بج. يوين، كنتاكي (2012). “عزل وتوصيف مجموعة فرعية من فيروس بيتا كورونافيروس A التاجي، فيروس كورونا الأرنب HKU14، من الأرانب المنزلية”. مجلة علم الفيروسات . 86 (10): 5481–96. دوى :10.1128/JVI.06927-11. بمك 3347282 . بميد 22398294.
- ^ تشانغ، وي؛ تشنغ، شياو شوانغ؛ أغواندا، برنارد؛ أمة، شيلا؛ تشاو، كاي؛ ليشوتي، جاكلين؛ وانغ، نينغ. تشن، جينغ؛ لي، باي؛ يانغ، شينغ لو؛ ماني، شايليندرا؛ نجيوا، كيسا-جوما؛ تشو، يان؛ هو، بن؛ أونيووك، سامسون أوموندي؛ يان، بنج. أندرسون، دانييل E.؛ وانغ لين فا. تشو، بنغ؛ شي ، تشنغ لي (24 أكتوبر 2019). “أدلة مصلية على الإصابة بفيروس كورونا المسبب لمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية وفيروس كورونا المرتبط بـ HKU8 في الإبل الكينية”. الميكروبات والالتهابات الناشئة . 8 (1): 1528-1534. دوى :10.1080/22221751.2019.1679610. PMC 6818114 . PMID 31645223.
- ^ وونغ، أنطونيو سي بي؛ لي، شين؛ لاو، سوزانا كي بي؛ وو، باتريك سي واي (2019). "علم الأوبئة العالمي لفيروسات كورونا الخفافيش". الفيروسات . 11 (2): 174. doi : 10.3390/v11020174 . PMC 6409556. PMID 30791586 .
- ^ "تصنيف الفيروسات: إصدار 2019". talk.ictvonline.org . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاسترجاع في 20 يونيو 2020 .
روابط خارجية
- فيروسات كورونا
- فيرالزون: فيروس كورونا بيتا
- قاعدة بيانات وتحليل مسببات الأمراض الفيروسية (ViPR): الفيروسات التاجية
