مثبط الريبونوكلياز

مثبط الريبونوكلياز (RI) هو بروتين كبير (~450 بقايا، ~49 كيلو دالتون)، حمضي (pI ~4.7)، غني بالليوسين ، يشكل معقدات شديدة التماسك مع بعض أنواع الريبونوكلياز . [ 2 ]

يحتوي بروتين RI على نسبة عالية بشكلٍ ملحوظ من السيستين (حوالي 6.5%، مقارنةً بـ 1.7% في البروتينات النموذجية) وهو حساس للأكسدة. كما أنه غني بالليوسين (21.5%، مقارنةً بـ 9% في البروتينات النموذجية) وقليل نسبيًا في الأحماض الأمينية الكارهة للماء الأخرى، وخاصةً الفالين ، والإيزوليوسين ، والميثيونين ، والتيروسين ، والفينيل ألانين .

بناء

منظر جانبي لمثبط الريبونوكلياز الخنزيري؛ [ 1 ] يتم تلوين الشريط من الأزرق ( الطرف N ) إلى الأحمر ( الطرف C ).

يُعدّ RI بروتينًا كلاسيكيًا غنيًا بالليوسين، يتكون من حلزونات ألفا وخيوط بيتا متناوبة على طول هيكله الأساسي. تلتف عناصر البنية الثانوية هذه حول بعضها البعض في شكل لولبي منحني يميني يشبه حدوة الحصان . تُشكّل خيوط بيتا المتوازية الجدار الداخلي، بينما تُشكّل حلزونات ألفا الجدار الخارجي لحذوة الحصان. يبدو أن البنية مُستقرة بفضل وجود الأسباراجين المدفون عند قاعدة كل لفة، أثناء انتقالها من حلزون ألفا إلى خيط بيتا. يتراوح طول تكرارات ألفا-بيتا بين 28 و29 حمضًا أمينيًا، مُشكّلةً وحدةً فعليًا من 57 حمضًا أمينيًا تُطابق بنيتها الجينية (يُشفّر كل إكسون وحدةً من 57 حمضًا أمينيًا).

الارتباط بالريبونوكليازات

مركب ريبونوكلياز I (أصفر) ومثبط (حلزونات وردية) غير متجانس رباعي الوحدات، بشري.

يُعدّ انجذاب RI للريبونوكليازات من بين أعلى الانجذابات في أي تفاعل بين البروتينات ؛ إذ يبلغ ثابت تفكك معقد RI- RNase A نطاق الفيمتومولار (fM) في الظروف الفيزيولوجية. وعلى الرغم من هذا الانجذاب العالي، فإن RI قادر على الارتباط بمجموعة واسعة من RNases A على الرغم من تشابه تسلسلها المنخفض نسبيًا . وتشير الدراسات البيوكيميائية والتركيبات البلورية لمعقدات RI-RNase A إلى أن التفاعل يخضع في معظمه لتفاعلات كهروستاتيكية ، ولكنه يشمل أيضًا مساحة سطحية كبيرة مدفونة . [ 3 ] [ 4 ] يُعدّ انجذاب RI للريبونوكليازات مهمًا، نظرًا لأن العديد من الريبونوكليازات لها تأثيرات سامة ومثبطة للخلايا ترتبط ارتباطًا وثيقًا بقدرتها على الارتباط بـ RI. [ 5 ]

لا تستطيع مثبطات الريبونوكلياز في الثدييات الارتباط ببعض أفراد عائلة الريبونوكلياز البنكرياسي من أنواع أخرى. وعلى وجه الخصوص، فإن إنزيمات الريبونوكلياز البرمائية ، مثل رانبيرناز وأمفيناز من ضفدع النمر الشمالي ، تفلت من مثبطات الريبونوكلياز في الثدييات ، وقد لوحظ أن لها سمية خلوية متفاوتة ضد الخلايا السرطانية . [ 6 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 PDB : 2BNH ​;Kobe B, Deisenhofer J (1993). "البنية البلورية لمثبط الريبونيوكلياز الخنزيري، وهو بروتين يحتوي على تكرارات غنية بالليوسين". Nature . 366 ( 6457): 751–6 . Bibcode : 1993Natur.366..751K . doi : 10.1038/366751a0 . PMID 8264799. S2CID 34579479 .  
  2. شابيرو ر (2001). "مثبط الريبونوكلياز السيتوبلازمي". الريبونوكليازات - الجزء أ . طرق في علم الإنزيمات. المجلد 341. الصفحات 611-628 . doi : 10.1016/S0076-6879(01)41180-3 . ISBN   9780121822422PMID 11582809 
  3. لي إف إس، شابيرو آر، فالي بي إل (يناير 1989). "تثبيط ارتباط قوي للأنجيوجينين والريبونوكلياز أ بواسطة مثبط الريبونوكلياز المشيمي". الكيمياء الحيوية . 28 (1): 225-30 . doi : 10.1021/bi00427a031 . PMID 2706246 . 
  4. باباجورجيو، أ. س.، شابيرو، ر.، أشاريا، ك. ر. (سبتمبر 1997). "التعرف الجزيئي على أنجيوجينين البشري بواسطة مثبط الريبونيوكلياز المشيمي - دراسة بلورية بالأشعة السينية بدقة 2.0 أنجستروم" . مجلة EMBO . 16 (17): 5162-5177 . doi : 10.1093/emboj/16.17.5162 . PMC 1170149. PMID 9311977 .  
  5. ماكاروف، أ. أ.، وإيلينسكايا، أ. ن. (أبريل 2003). "الريبونوكليازات السامة للخلايا: أسلحة جزيئية وأهدافها" . رسائل FEBS . 540 ( 1-3 ): 15-20 . Bibcode : 2003FEBSL.540...15M . doi : 10.1016/s0014-5793(03)00225-4 . PMID 12681476. S2CID 30324366 .  
  6. أرديلت دبليو، شوجين ك، دارزينكيويتش ز (يونيو 2008). "أونكوناز وأمفيناز، إنزيمات الريبونيوكلياز المضادة للأورام من بويضات رانا بيبيينز" . التكنولوجيا الحيوية الصيدلانية الحالية . 9 (3): 215-225 . doi : 10.2174/138920108784567245 . PMC 2586917. PMID 18673287 .  

للمزيد من القراءة