مثبط الريبونوكلياز
مثبط الريبونوكلياز (RI) هو بروتين كبير (~450 بقايا، ~49 كيلو دالتون)، حمضي (pI ~4.7)، غني بالليوسين ، يشكل معقدات شديدة التماسك مع بعض أنواع الريبونوكلياز . [ 2 ]
يحتوي بروتين RI على نسبة عالية بشكلٍ ملحوظ من السيستين (حوالي 6.5%، مقارنةً بـ 1.7% في البروتينات النموذجية) وهو حساس للأكسدة. كما أنه غني بالليوسين (21.5%، مقارنةً بـ 9% في البروتينات النموذجية) وقليل نسبيًا في الأحماض الأمينية الكارهة للماء الأخرى، وخاصةً الفالين ، والإيزوليوسين ، والميثيونين ، والتيروسين ، والفينيل ألانين .
بناء

يُعدّ RI بروتينًا كلاسيكيًا غنيًا بالليوسين، يتكون من حلزونات ألفا وخيوط بيتا متناوبة على طول هيكله الأساسي. تلتف عناصر البنية الثانوية هذه حول بعضها البعض في شكل لولبي منحني يميني يشبه حدوة الحصان . تُشكّل خيوط بيتا المتوازية الجدار الداخلي، بينما تُشكّل حلزونات ألفا الجدار الخارجي لحذوة الحصان. يبدو أن البنية مُستقرة بفضل وجود الأسباراجين المدفون عند قاعدة كل لفة، أثناء انتقالها من حلزون ألفا إلى خيط بيتا. يتراوح طول تكرارات ألفا-بيتا بين 28 و29 حمضًا أمينيًا، مُشكّلةً وحدةً فعليًا من 57 حمضًا أمينيًا تُطابق بنيتها الجينية (يُشفّر كل إكسون وحدةً من 57 حمضًا أمينيًا).
الارتباط بالريبونوكليازات

يُعدّ انجذاب RI للريبونوكليازات من بين أعلى الانجذابات في أي تفاعل بين البروتينات ؛ إذ يبلغ ثابت تفكك معقد RI- RNase A نطاق الفيمتومولار (fM) في الظروف الفيزيولوجية. وعلى الرغم من هذا الانجذاب العالي، فإن RI قادر على الارتباط بمجموعة واسعة من RNases A على الرغم من تشابه تسلسلها المنخفض نسبيًا . وتشير الدراسات البيوكيميائية والتركيبات البلورية لمعقدات RI-RNase A إلى أن التفاعل يخضع في معظمه لتفاعلات كهروستاتيكية ، ولكنه يشمل أيضًا مساحة سطحية كبيرة مدفونة . [ 3 ] [ 4 ] يُعدّ انجذاب RI للريبونوكليازات مهمًا، نظرًا لأن العديد من الريبونوكليازات لها تأثيرات سامة ومثبطة للخلايا ترتبط ارتباطًا وثيقًا بقدرتها على الارتباط بـ RI. [ 5 ]
لا تستطيع مثبطات الريبونوكلياز في الثدييات الارتباط ببعض أفراد عائلة الريبونوكلياز البنكرياسي من أنواع أخرى. وعلى وجه الخصوص، فإن إنزيمات الريبونوكلياز البرمائية ، مثل رانبيرناز وأمفيناز من ضفدع النمر الشمالي ، تفلت من مثبطات الريبونوكلياز في الثدييات ، وقد لوحظ أن لها سمية خلوية متفاوتة ضد الخلايا السرطانية . [ 6 ]
انظر أيضاً
- ثيوسيانات الغوانيدينيوم - مثبط كيميائي لإنزيم RNase.
مراجع
- 1 2 PDB : 2BNH ;Kobe B, Deisenhofer J (1993). "البنية البلورية لمثبط الريبونيوكلياز الخنزيري، وهو بروتين يحتوي على تكرارات غنية بالليوسين". Nature . 366 ( 6457): 751–6 . Bibcode : 1993Natur.366..751K . doi : 10.1038/366751a0 . PMID 8264799. S2CID 34579479 .
- ↑ شابيرو ر (2001). "مثبط الريبونوكلياز السيتوبلازمي". الريبونوكليازات - الجزء أ . طرق في علم الإنزيمات. المجلد 341. الصفحات 611-628 . doi : 10.1016/S0076-6879(01)41180-3 . ISBN 9780121822422PMID 11582809
- ↑ لي إف إس، شابيرو آر، فالي بي إل (يناير 1989). "تثبيط ارتباط قوي للأنجيوجينين والريبونوكلياز أ بواسطة مثبط الريبونوكلياز المشيمي". الكيمياء الحيوية . 28 (1): 225-30 . doi : 10.1021/bi00427a031 . PMID 2706246 .
- ↑ باباجورجيو، أ. س.، شابيرو، ر.، أشاريا، ك. ر. (سبتمبر 1997). "التعرف الجزيئي على أنجيوجينين البشري بواسطة مثبط الريبونيوكلياز المشيمي - دراسة بلورية بالأشعة السينية بدقة 2.0 أنجستروم" . مجلة EMBO . 16 (17): 5162-5177 . doi : 10.1093/emboj/16.17.5162 . PMC 1170149. PMID 9311977 .
- ↑ ماكاروف، أ. أ.، وإيلينسكايا، أ. ن. (أبريل 2003). "الريبونوكليازات السامة للخلايا: أسلحة جزيئية وأهدافها" . رسائل FEBS . 540 ( 1-3 ): 15-20 . Bibcode : 2003FEBSL.540...15M . doi : 10.1016/s0014-5793(03)00225-4 . PMID 12681476. S2CID 30324366 .
- ↑ أرديلت دبليو، شوجين ك، دارزينكيويتش ز (يونيو 2008). "أونكوناز وأمفيناز، إنزيمات الريبونيوكلياز المضادة للأورام من بويضات رانا بيبيينز" . التكنولوجيا الحيوية الصيدلانية الحالية . 9 (3): 215-225 . doi : 10.2174/138920108784567245 . PMC 2586917. PMID 18673287 .
للمزيد من القراءة
- كوبي ب، دايزن هوفر ج (مارس 1995). "أساس بنيوي للتفاعلات بين التكرارات الغنية بالليوسين والروابط البروتينية". نيتشر . 374 ( 6518): 183-186 . Bibcode : 1995Natur.374..183K . doi : 10.1038/374183a0 . PMID 7877692. S2CID 4364436 .
- كوبي ب، دايزن هوفر ج (ديسمبر 1996). "آلية تثبيط الريبونيوكلياز بواسطة بروتين مثبط الريبونيوكلياز بناءً على التركيب البلوري لمركبه مع الريبونيوكلياز أ". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 264 (5): 1028-1043 . doi : 10.1006/jmbi.1996.0694 . PMID 9000628 .
- باباجورجيو، أ. س.، شابيرو، ر.، أشاريا، ك. ر. (سبتمبر 1997). "التعرف الجزيئي على أنجيوجينين البشري بواسطة مثبط الريبونيوكلياز المشيمي - دراسة بلورية بالأشعة السينية بدقة 2.0 أنغستروم" . مجلة EMBO . 16 (17): 5162-5177 . doi : 10.1093/emboj/16.17.5162 . PMC 1170149. PMID 9311977 .
- سوزوكي م، ساكسينا س ك، بوكس إي، بريل ر ج، فاسانداني ف م، لادنر ج إي، سونغ س، يول ر ج (مارس 1999). "هندسة السمية الخلوية بوساطة المستقبلات في الريبونيوكليازات البشرية عن طريق الحجب الفراغي لتفاعل المثبط". مجلة نيتشر للتكنولوجيا الحيوية . 17 (3): 265-270 . doi : 10.1038/7010 . PMID 10096294. S2CID 23140257 .
- شابيرو ر، رويز-غوتيريز م، تشين سي زد (سبتمبر 2000). "تحليل تفاعلات مثبط الريبونيوكلياز البشري مع أنجيوجينين وريبونيوكلياز أ عن طريق الطفرات: أهمية بقايا المثبط داخل مقابل خارج "النقطة الساخنة" الطرفية C"". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 302 (2): 497– 519. doi : 10.1006/jmbi.2000.4075 . PMID 10970748 .
- بريتشر إل إي، أبيل آر إل، راينز آر تي (أبريل 2000). "متغير من إنزيم الريبونيوكلياز أ ذو نشاط تحفيزي منخفض ولكن سمية خلوية عالية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 275 (14): 9893-9896 . doi : 10.1074/jbc.275.14.9893 . PMID 10744660 .
- ياكوفليف جي آي، ميتكيفيتش في إيه، ماكاروف إيه إيه (2006). "مثبطات الريبونوكلياز". البيولوجيا الجزيئية . 40 (6): 867-874 . doi : 10.1134/S0026893306060045 . S2CID 31887913 .
- نطاقات البروتين
- مثبطات الهيدرولاز
- بروتينات LRR
