بكتيريا بيلاجيباكتيراليس

تُعدّ رتبة " كانديداتوس بيلاجيبكتيراليس" رتبةً ضمن شعبة ألفا بروتيوبكتيريا ، وتتألف من بكتيريا بحرية حرة المعيشة تُشكّل ما يقارب ثلث الخلايا الموجودة على سطح المحيط. ^{[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]} وبشكل عام، يُقدّر أن أفراد رتبة بيلاجيبكتيراليس يُشكّلون ما بين ربع ونصف جميع الخلايا بدائية النواة في المحيط. ^{[ 5 ]}

في البداية، عُرفت هذه المجموعة التصنيفية فقط من خلال بيانات الميتاجينوم ، وكانت تُعرف باسم مجموعة SAR11 . صُنفت في البداية ضمن رتبة الريكتسيات، ثم رُفعت لاحقًا إلى رتبة مستقلة، ثم وُضعت كرتبة شقيقة للريكتسيات في تحت فئة الريكتسيات. ^{[ 4 ]} وهي تضم النوع البحري شديد الوفرة Pelagibacter ubique .

تتميز البكتيريا في هذه الرتبة بصغر حجمها غير المعتاد. ^{[ 6 ]} ونظرًا لصغر حجم جينومها ومحدودية وظائفها الأيضية، أصبحت بكتيريا بيلاجيبكتيراليس كائنًا نموذجيًا لنظرية التبسيط . ^{[ 5 ]}

تُعدّ بكتيريا P. ubique والأنواع ذات الصلة بها من الكائنات قليلة التغذية (الكاسحة) وتتغذى على الكربون العضوي والنيتروجين المذابين. ^{[ 3 ]} وهي غير قادرة على تثبيت الكربون أو النيتروجين، ولكنها تستطيع إتمام دورة حمض الستريك ( دورة كريبس) مع تجاوز الجليوكسيلات ، كما أنها قادرة على تخليق جميع الأحماض الأمينية باستثناء الجلايسين، ^{[ 7 ]} بالإضافة إلى بعض العوامل المساعدة. ^{[ 8 ]} ولديها أيضًا حاجة غير عادية وغير متوقعة للكبريت المختزل. ^{[ 9 ]}

 يمتلك كل من P. ubique وأفراد المجموعة الفرعية المحيطية الأولى عملية استحداث الجلوكوز ، ولكن ليس مسار تحلل الجلوكوز النموذجي ، في حين أن المجموعات الفرعية الأخرى قادرة على تحلل الجلوكوز النموذجي. ^{[ 10 ]}

على عكس البكتيريا الزرقاء ، وبكتيريا الكبريت الخضراء ، والبكتيريا الأرجوانية ، لا تُنتج بكتيريا P. ubique جزيئات ATP من الضوء عبر عملية التمثيل الضوئي ، فهي لا تستخدم الضوء لزيادة طاقة الرابطة بين زوج الإلكترونات. بل تستخدم آلية تتضمن بروتين رودوبسين (بما في ذلك التخليق الحيوي للريتينول ) لإنتاج ATP من الضوء. ^{[ 11 ]}

تُعد بكتيريا SAR11 مسؤولة عن جزء كبير من غاز الميثان المذاب في سطح المحيط. وهي تستخلص الفوسفات من حمض الميثيل فوسفونيك . ^{[ 12 ]}

على الرغم من أن التصنيف يستمد اسمه من النوع النمطي P. ubique ( النوع المرشح )، إلا أن هذا النوع لم يُنشر بشكل صحيح بعد، وبالتالي لا يتمتع اسم الرتبة ولا اسم النوع بوضع تصنيفي رسمي. ^{[ 13 ]}

حالياً، ينقسم النظام إلى خمس مجموعات فرعية: ^{[ 14 ]}

• المجموعة الفرعية Ia، المحيط المفتوح، المجموعة التاجية - تشمل P. ubique HTCC1062
• المجموعة الفرعية Ib، المحيط المفتوح، الفرع الشقيق للمجموعة Ia
• المجموعة الفرعية الثانية، الساحلية، من القاعدة إلى Ia + Ib
• المجموعة الفرعية الثالثة، مياه مالحة، قاعدية للمجموعة الأولى والثانية إلى جانب مجموعتها الشقيقة الرابعة
• المجموعة الفرعية الرابعة، والمعروفة أيضًا باسم مجموعة LD12، المياه العذبة ^{[ 15 ]}
• المجموعة الفرعية الخامسة، التي تضم بكتيريا ألفا بروتيو HIMB59، هي المجموعة الأساسية لبقية المجموعات.

ينتج عن ما سبق مخطط تصنيفي لرتبة Pelagibacterales على النحو التالي:

أشارت دراسة أجراها باحثون من جامعة هاواي في مانوا وجامعة ولاية أوريغون عام 2011 إلى أن جين SAR11 قد يكون سلف الميتوكوندريا في معظم الخلايا حقيقية النواة. ^{[ 2 ]} ومع ذلك، قد تكون هذه النتيجة ناتجة عن تحيز في التركيب الجيني. ^{[ 16 ]}

• يوديديموناس