Saccharomyces pastorianus

Saccharomyces pastorianus هي خميرة تستخدم صناعيا لإنتاج بيرة لاجر ، وقد سميت تكريما للويس باستور من قبل الألماني ماكس ريس في عام 1870. [ 2 ] يبدو أن الجينوم المعقد لهذه الخميرةهو نتيجة التهجين بين نوعين نقيين في مجموعة أنواع Saccharomyces ، وهو عامل أدى إلى صعوبة في وضع تصنيف مناسب للأنواع.

كان اسم Saccharomyces carlsbergensis، وهو مرادف غير مستخدم حاليًا، ولا يزال يُستخدم في الأدبيات العلمية، ولكنه غير صالح، إذ أن اسم Saccharomyces pastorianus (Reess 1870) له الأسبقية التصنيفية. يُنسب اسم S. carlsbergensis عادةً إلى إميل كريستيان هانسن من الفترة التي عمل فيها لدى مصنع كارلسبرغ الدنماركي للجعة عام 1883، [ 3 ] ولكن في الواقع لم يصفه هانسن رسميًا كنوع مستقل [ 4 ] حتى عام 1908، إلى جانب مرادف آخر هو Saccharomyces monacensis. [ 5 ] تُحفظ السلالات النموذجية لكلا المرادفين حاليًا في بنوك الخميرة تحت الاسم التصنيفي S. pastorianus. [ 6 ]

تاريخ

وُصفت سلالات خميرة التخمير السفلي، كما تُعرف، في نورمبرغ منذ القرن الرابع عشر [ 7 ] ، وظلت جزءًا لا غنى عنه من ثقافة التخمير في كل من فرانكونيا وبافاريا في جنوب ألمانيا حتى العصر الحديث. [ 8 ] [ 9 ] خلال طفرة الدراسات الفطرية العلمية في القرن التاسع عشر، صُنفت الخميرة المسؤولة عن إنتاج ما يُسمى بـ"التخمير السفلي" تصنيفًا علميًا، وهو Saccharomyces pastorianus ، على يد العالم الألماني ماكس ريس عام 1870. [ 10 ]

في عام 1883، نشر الدنماركي إميل هانسن نتائج بحثه في مصنع كارلسبرغ للجعة في كوبنهاغن، ووصف عزل مزرعة خميرة نقية مواتية أطلق عليها اسم "Unterhefe Nr. I" (خميرة التخمير السفلي رقم 1)، [ 11 ] وهي مزرعة حددها على أنها مطابقة للعينة التي تبرع بها مصنع سباتن للجعة في ميونيخ لشركة كارلسبرغ عام 1845. [ 12 ] وسرعان ما دخلت هذه الخميرة حيز الإنتاج الصناعي في كوبنهاغن عام 1884 تحت اسم خميرة كارلسبرغ رقم ​​1. [ 13 ]

في عام 1904، نشر هانسن مجموعة أعمال مهمة أعاد فيها تصنيف الخمائر المختلفة التي عمل عليها من حيث الأنواع، بدلاً من تصنيفها كسلالات أو أنواع فرعية من النوع نفسه كما كان يفعل سابقًا. [ 14 ] صنف هانسن في هذا العمل نوعًا منفصلاً من الخميرة المعزولة من مصنع كارلسبرغ للجعة باسم S. pastorianus ، وهو اسم مشتق من ريس (1870) ونُسب إليه. أُدرجت هذه السلالة في المركز الوطني لزراعة الخمائر (CBS) عام 1935 تحت اسم السلالة CBS 1538، Saccharomyces pastorianus Reess ex Hansen 1904. وفي منشور لاحق عام 1908، أعاد هانسن تصنيف الخميرة الأصلية "Unterhefe Nr. I" لتصبح النوع الجديد Saccharomyces carlsbergensis ، وخميرة أخرى "Unterhefe Nr. II" لتصبح النوع الجديد Saccharomyces monacensis . [ 15 ] تم نسب التصنيف إلى هانسن 1908 [ 16 ] ودخلت الخمائر إلى Centraalbureau voor Schimmelcultures في عام 1947 باسم CBS 1513 و CBS 1503 على التوالي.

منذ أوائل القرن العشرين، صُنفت سلالات خميرة التخمير السفلي في صناعة البيرة عادةً تحت اسم S. carlsbergensis في الأدبيات العلمية، ورُفض الاسم الصحيح السابق الذي أطلقه ريس على خميرة التخمير السفلي عام 1870 دون وجه حق. تم تصحيح هذا الوضع باستخدام تقنيات إعادة تحديد مواقع الحمض النووي في عام 1985، عندما أعاد فوغان-مارتيني وكورتزمان اسم النوع إلى S. pastorianus تحت السلالة النمطية CBS 1538، وصنفا النوعين السابقين اللذين حددهما هانسن عام 1908، وهما S. carlsbergensis CBS 1513 و S. monacensis CBS 1503، [ 17 ] كمرادفين. كما كشفت هذه التجارب بوضوح، ولأول مرة، عن الطبيعة الهجينة لأنواع خميرة تخمير البيرة، على الرغم من أن أحد الأنواع الأصلية صُنف بشكل خاطئ لاحقًا. [ 18 ] ومع ذلك، استمر الجدل في الأدبيات العلمية خلال العقود الأخيرة من القرن العشرين بشأن التصنيف الصحيح، حيث استخدم المؤلفون كلا الاسمين بشكل متبادل لوصف خميرة البيرة.

علم الجينوم

من المعروف أن خميرة البيرة Saccharomyces pastorianus هي هجين بين نوعين من الخميرة، هما Saccharomyces cerevisiae وخميرة Saccharomyces أخرى، منذ عام 1985 على الأقل [ 19 إلا أن طبيعة سلالتيها الأصليتين وتصنيفها الصحيح ظلا موضع نقاش واسع. وقد طُرحت عدة سلالات مرشحة لتكون السلالة الأصلية غير Saccharomyces cerevisiae ، مثل CBS 1503 (المعروفة سابقًا باسم S. monacensis ) [ 20 ] [ 21 ] وCBS 395 (السلالة النمطية لـ S. uvarum )، وهي سلالة لا يزال تصنيفها محل جدل كبير [ 22 ] [ 23 ] . أما السلالة الأكثر شيوعًا فهي CBS 380 (السلالة النمطية لـ S. bayanus ) التي تُنسب إليها السلالة الأصلية الثانية [ 24 ] .

في عام ٢٠١١، طُرحت فرضية مفادها أن تسلسل الجينوم غير المُحدد ينتمي إلى نوع طبيعي لم يُصنف بعد. [ ٢٥ ] وقد تأكد هذا الافتراض بعد فترة وجيزة باكتشاف نوع جديد في الأرجنتين، وهو Saccharomyces eubayanus ، الذي يتطابق جينومه بنسبة ٩٩٪ مع الجزء غير المُخصص للخميرة (non- cerevisiae) من جينوم S. pastorianus ، مما يؤكد بشكل قاطع أنه النوع الأبوي الثاني. تتضمن عملية التدجين فقدان جين SUL1. كما ثبت أن S. bayanus CBS 380 هو هجين شقيق مُشتق من S. eubayanus (مع إدخال جين S. pastorianus في موضع SUL1) و S. uvarum . [ ٢٦ ]

أفادت دراسة أجريت عام 2014 باكتشاف خميرة S. eubayanus في الصين والتبت ومنغوليا، مما يؤكد وجود هذا النوع. والأهم من ذلك، أن الأجزاء المتسلسلة من جينومين من جبال الهيمالايا تتشابه بنسبة 99.82% مع الأجزاء المقابلة غير المرتبطة بخميرة S. pastorianus . [ 27 ] وحتى عام 2014، اتفقت معظم الجهات العلمية على أن خميرة S. pastorianus، التي تتخمر في قاع البرسيم ، نشأت نتيجة تهجين بين نوعي S. eubayanus و S. cerevisiae من المنطقة القطبية الشمالية ، لكنها لم تتوصل إلى إجماع حول ما إذا كان هذا التزاوج قد حدث في آسيا أم أوروبا (من المحتمل أن سلالة شبيهة بالسلالة التبتية عبرت طريق الحرير إلى أوروبا وتزاوجت هناك). [ 28 ] كشفت دراسة أجريت عام 2016 أنه على الرغم من أن الجينوم الفرعي لـ eubayanus ينحدر في الغالب من المجموعة القطبية الشمالية (التي تشمل سلالات جبال الهيمالايا)، فإنه لا يبدو أن هناك سلالة واحدة من eubayanus نشأت منها مجموعتا pastorianus . بدلاً من ذلك، فإن الاختلافات الجينية بين المجموعة القطبية الشمالية موجودة في pastorianus . [ 29 ]

العمل الجينومي المستقبلي

يبدو أن النقاش حول التصنيف قد انتهى، ولذا يركز البحث الجديد الآن على التباين الملحوظ داخل أفراد خميرة S. pastorianus الأصلية. كشفت تحليلات خمائر تخمير البيرة المخمرة على البارد (لاغر) أنه يمكن تصنيفها إلى مجموعتين بناءً على تركيب الحمض النووي الخاص بها، وهما نوع فروهبرغ ونوع ساز. [ 30 ] [ 31 ] وفي عام 2008، تم التوصل إلى استنتاج إضافي مفاده أن المجموعتين ناتجتان عن حدثي تهجين منفصلين، حيث أن الخميرة الأم S. cerevisiae تنحدر من أصل مختلف في تخمير البيرة. [ 32 ] تُصنف مجموعتا خمائر تخمير البيرة المخمرة على البارد (لاغر) إما كنوع أول: نوع ساز، وهي سلالات ثلاثية الصيغة الصبغية يبدو أنها فقدت أجزاءً كبيرة من جينوم S. cerevisiae الخاص بها . تشمل هذه السلالات CBS 1513 (المصنفة سابقًا باسم S. carlsbergensis ) وCBS 1503 (المصنفة سابقًا باسم S. monacensis )، أو النوع 2: نوع فروهبرغ، وهي سلالات رباعية الصبغيات تحتوي على مجموعات شبه كاملة من الجينومات من كلا الأبوين. وتشمل هذه السلالة Weihenstephan WS 34/70 التي تُعتبر قريبة من السلالة النمطية لـ S. pastorianus CBS 1538. [ 33 ] [ 34 ]

في عام ٢٠١٥، نجح الباحثون في ابتكار أنواع جديدة من خميرة تخمير البيرة (لاغر) عن طريق تهجين سلالات مختارة من خميرة Saccharomyces cerevisiae مع خميرة Saccharomyces eubayanus . ورثت هذه الخمائر الهجينة الجديدة خصائص مفيدة من كلا السلالتين الأصليتين (مثل استخدام المالتوتريوز، وتحمل البرد، والتكتل )، وتفوقت عليهما أثناء التخمير (تخمير أسرع وإنتاجية كحول أعلى). ومن المتوقع أن يزداد تنوع سلالات خميرة البيرة (لاغر) بشكل كبير في المستقبل. [ ٣٥ ]

في عام ٢٠١٩، وُجد أن سلالة الخميرة S. eubayanus الهيمالايية تحمل نسخًا متعددة من جين AGT1 (غير الموجود في سلالات باتاغونيا) بتشابه كبير مع نسخ S. pastorianus . لا تستطيع السلالة الهيمالايية النمو على المالتوز والمالتوتريوز، ومع ذلك فهي تحمل جينات وظيفية لإنزيم هيدرولاز المالتوز وجينات ناقل المالتوز SeMALT1 وSeAGT1. من ناحية أخرى، تمتلك S. cerevisiae جين منظم المالتوز MALx3، لكنها تفتقر إلى نواقل أو إنزيمات هيدرولاز وظيفية. ينتج عن تهجين السلالتين خميرة "تخمر سفلي" قادرة، على عكس السلالتين الأصليتين، على استخدام المالتوتريوز نظرًا لتكامل جينوماتهما (وهي حالة من حالات التفوق الهجين ). يمتلك الهجين مجموعة من الجينات المرتبطة بالمالتوز مشابهة جدًا لتلك الموجودة في S. pastorianus الحديثة . [ ٣٦ ]

تُجرى أبحاث مستمرة في مجال التهجين داخل النوع الواحد من الخميرة Saccharomyces . وقد أنتجت إحدى الدراسات هجائن جديدة من S. cerevisiae و S. arboricolus . وكانت نتائجها نموذجية لدراسات مماثلة، حيث كان أداء التخمر أكثر قوة، وأنتجت النسل/الهجائن مزيجًا من المواد الكيميائية الحسية المتطايرة. [ 37 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. نغوين، إتش في؛ ليغراس، جيه إل؛ نوفيغليز، سي؛ غاياردان، سي (2011). "فك شفرة تاريخ التهجين المؤدي إلى سلالة البيرة الكبيرة بناءً على الجينومات الفسيفسائية لسلالتي الخميرة Saccharomyces bayanus NBRC1948 وCBS380T" . PLOS ONE . 6 (10) e25821. Bibcode : 2011PLoSO...625821N . doi : 10.1371/journal.pone.0025821 . PMC 3187814. PMID 21998701 .  
  2. ^ ريس، م. 1870. Botanische Unter suchungen über die Alkoholgährungspilze. ص 29-30
  3. ^ هانسن المفوضية الأوروبية. 1883. Undersøgelser over Alkoholgjærsvampenes Fysiologi og Morfologi. ثانيا. Om Askosporedannelsen hos Slægten Saccharomyces. Meddelelser fra Carlsberg Laboratorie 2: 29–102.
  4. "Saccharomyces carlsbergensis" .
  5. ^ .هانسن، المفوضية الأوروبية 1908. أبحاث حول فسيولوجيا ومورفولوجيا التخمر الكحولي. الثالث عشر. دراسات جديدة حول أطباق البراسيري وقاعدة التخمير. سي آر تراف. مختبر، كارلسبرغ 7: 179-217.
  6. "Cbs 1513" .
  7. ^ Sprotte، J. (2005) Von 1303/1305 bis zum Jahre 2005. 700 Jahre Nürnberger Bier، in Jahrbuch der Gesellschaft für Geschichte des Brauwesens 2005، Institut für Gärungsgewerbe Berlin، الصفحات من 87 إلى 131.
  8. ^ أوتو بوشنر ورودولف موك. (1950) Die frühesten Verordnungen über das Brauwesen in der freien Reichsstadt Nürnberg، insbesondere das Gebot، nur Gerste zum Bierbrauen zu verwenden und der Übergang zur Untergärung، في: Deutsche Brauwirtschaft 59، S.367-369، 382-385.
  9. ^ Hackel-Stehr، K. (1987) Das Brauwesen في بايرن، Vom 14. مكرر 16. Jahrhundert. Insbesondere die Entstehung und Entwicklung des Reinheitsgebotes (1516). أطروحة افتتاحية، الجامعة التقنية، برلين.
  10. ^ ريس، م. 1870. Botanische Unter suchungen über die Alkoholgährungspilze . ص 29-30
  11. ^ هانسن المفوضية الأوروبية. 1883. Undersøgelser over Alkoholgjærsvampenes Fysiologi og Morfologi. ثانيا. Om Askosporedannelsen hos Slægten Saccharomyces. Meddelelser fra Carlsberg Laboratorie 2: 29–102
  12. Meussdoerffer, Franz G. "تاريخ شامل لصناعة البيرة." كتيب صناعة البيرة: العمليات والتكنولوجيا والأسواق (2009): 1-42.
  13. بولتون، كريستوفر، وديفيد كوين. خميرة التخمير والتخمير . جون وايلي وأولاده، 2008.
  14. ^ هانسن، المفوضية الأوروبية 1904. Grundlinien zur Systematik der Saccharomyceten. Zentralblatt für Bakteriologie und Parasitenkunde Abteilung 2. 12:529-538
  15. ^ هانسن، المفوضية الأوروبية 1908. أبحاث حول فسيولوجيا ومورفولوجيا التخمر الكحولي. الثالث عشر. دراسات جديدة حول أطباق البراسيري وقاعدة التخمير. سي آر تراف. مختبر، كارلسبرغ 7: 179-217
  16. ^ هانسن، المفوضية الأوروبية 1908. أبحاث حول فسيولوجيا ومورفولوجيا التخمر الكحولي. الثالث عشر. دراسات جديدة حول أطباق البراسيري وقاعدة التخمير. سي آر تراف. مختبر، كارلسبرغ 7: 179-217
  17. "قاعدة بيانات سي بي إس" .
  18. فوغان-مارتيني، آن، وكليتوس ب. كورتزمان. "صلة الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين بين أنواع جنس Saccharomyces بالمعنى الدقيق للكلمة." المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي 35.4 (1985): 508-511
  19. مارتيني، آن فوغان، وكليتوس ب. كورتزمان. "صلة الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين بين أنواع جنس Saccharomyces بالمعنى الدقيق للكلمة." المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي 35.4 (1985): 508-511
  20. بورستينغ سي، هوميل آر، شولتز إي آر، وآخرون. 1997. يحتوي Saccharomyces carlsbergensis على جينين وظيفيين يُشفّران بروتين ربط أسيل-CoA، أحدهما مشابه لجين ACB1 من S. cerevisiae والآخر مطابق لجين ACB1 من S. monacensis. Yeast 13: 1409–1421
  21. كاساريغولا، سيرج، وآخرون. "تحليل تركيب جينوم خميرة البيرة بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل، والتسلسل، وتهجين التسلسل شبه التيلوميري." المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري 51.4 (2001): 1607-1618
  22. فوغان-مارتيني أ، مارتيني أ (2011) الفصل 61 - خميرة ساكاروميسيس مايين إكس ريس (1870). في: الخمائر (الطبعة الخامسة). لندن: إلسيفير. الصفحات 733-746.
  23. بيريز-ترافيس، لورا، وآخرون. "حول تعقيد تصنيف Saccharomyces bayanus: التهجين والتطور المحتمل للأنواع الهجينة." PLoS ONE 9.4 (2014): e93729.
  24. فوغان-مارتيني أ، مارتيني أ (2011) الفصل 61 - خميرة ساكاروميسيس مايين إكس ريس (1870). في: الخمائر (الطبعة الخامسة). لندن: إلسيفير. الصفحات 733-746.
  25. نغوين، هو-فانغ، وآخرون. "فك شفرة تاريخ التهجين المؤدي إلى سلالة البيرة الكبيرة بناءً على الجينومات الفسيفسائية لسلالتي الخميرة Saccharomyces bayanus NBRC1948 وCBS380T." PLoS ONE 6.10 (2011): e25821
  26. ليبكيند، دييغو، وآخرون. "تدجين الميكروبات وتحديد السلالة الجينية البرية لخميرة تخمير البيرة." وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم 108.35 (2011): 14539-14544.
  27. بينغ، جيان، وآخرون. "دليل على أصل خميرة البيرة من شرق آسيا". علم الأحياء الحالي 24.10 (2014): R380-R381
  28. بوينتون، بريمروز جيه، ودنكان جريج. "علم البيئة وتطور أنواع الخميرة غير المستأنسة." الخميرة (2014).
  29. بيريس، ديفيد؛ لانغدون، كوين ك.؛ موريارتي، رايان ف.؛ سيلفستر، كايلا؛ بونتراغر، مارتن؛ شارون، غيوم؛ ليدوك، جان بابتيست؛ لاندري، كريستيان ر.؛ ليبكيند، دييغو؛ هيتينغر، كريس تود (6 يوليو 2016). " تشكلت الأصول المعقدة لهجائن تخمير البيرة من خلال التباين القائم في الخميرة البرية Saccharomyces eubayanus" . PLOS Genetics . 12 (7) e1006155. doi : 10.1371/journal.pgen.1006155 . PMC 4934787. PMID 27385107 .  
  30. رينيري إس، وآخرون. سلالات وراثية نقية ومختلطة من الخميرة Saccharomyces bayanus و Saccharomyces pastorianus ومساهمتها في جينوم سلالة تخمير البيرة. مجلة علم الأحياء الدقيقة التطبيقية والبيئية. يونيو 2006؛ 72(6): 3968-74
  31. والثر، أندريا، آنا هيسلبارت، ويورغن ويندلاند. "تسلسل جينوم خميرة Saccharomyces carlsbergensis، أول خميرة لاغر نقية في العالم." G3: Genes| Genomes| Genetics 4.5 (2014): 783-793
  32. دان، باربرا، وغافين شيرلوك. "إعادة بناء أصول الجينوم وتطور خميرة البيرة الهجينة Saccharomyces pastorianus." أبحاث الجينوم 18.10 (2008): 1610-1623.
  33. جيبسون، برايان ر.، وآخرون. "المقارنة بين علم وظائف الأعضاء وأداء التخمير لسلالات خميرة لاجر Saaz وFrohberg والنوع الأصلي Saccharomyces eubayanus." Yeast 30.7 (2013): 255-266.
  34. والثر، أندريا، آنا هيسلبارت، ويورغن ويندلاند. "تسلسل جينوم خميرة Saccharomyces carlsbergensis، أول خميرة لاغر نقية في العالم." G3: Genes| Genomes| Genetics 4.5 (2014): 783-793
  35. كروغيروس، كريستوفر؛ ماغالهايس، فريدريكو؛ فيدغرين، فيرفي؛ جيبسون، برايان (2015). "سلالات جديدة من خميرة البيرة ناتجة عن التهجين بين الأنواع" . مجلة علم الأحياء الدقيقة الصناعية والتكنولوجيا الحيوية . 42 (5): 769-778 . Bibcode : 2015JIMB...42..769K . doi : 10.1007/s10295-015-1597-6 . ​​PMC 4412690. PMID 25682107 .  
  36. ^ برويرز، ن؛ بريكويد، أ؛ جورتر دي فريس، أر. فان دن بروك، م؛ وينينج، إس إم؛ فان دن إيجندن، إل؛ ديدريش، JA؛ باي، السنة المالية؛ برونك، جي تي؛ داران ، ج ج (15 نوفمبر 2019). "تسلسل جينوم Saccharomyces eubayanus في جبال الهيمالايا يكشف عن علامات وراثية تشرح استهلاك المالتوتريوز المتجانس بواسطة Saccharomyces Pastorianus Hybrids" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 85 (22) e01516-19. بيب كود : 2019ApEnM..85E1516B . دوى : 10.1128/AEM.01516-19 . بمك 6821976 . بميد 31519660 .  
  37. وينانز، ماثيو جيه؛ ياماموتو، يوكي؛ فوجيمارو، يوكي؛ كوسابا، يوكي؛ غالاغر، جينيفر إي جي؛ كيتاغاكي، هيروشي (2020). "ميل خميرة Saccharomyces arboricola وهجائنها لإنتاج الساكي: تكشف الهجائن بين الأنواع عن قدرات تخمير متزايدة ونمط أيضي فسيفسائي" . التخمير . 6 : 14. doi : 10.3390/fermentation6010014 .