التباين البنيوي في الجينوم البشري

📅 آخر تحديث: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 2 صور
الموسوعة الحرة
التباين الهيكلي

يُعرَّف التباين البنيوي في الجينوم البشري عمليًا بأنه تغيرات جينومية، تختلف بين الأفراد، وتشمل أجزاءً من الحمض النووي أكبر من 1 كيلو قاعدة (kb)، وقد تكون مجهرية أو دون المجهرية. [ 1 ] يميز هذا التعريف هذه التغيرات عن المتغيرات الأصغر حجمًا التي يقل حجمها عن 1 كيلو قاعدة، مثل الحذف القصير، والإدخال، وتغيرات النوكليوتيدات المفردة .

يمتلك البشر جينومًا بالغ التعقيد والتشابك، خضع للتطور والتغيير عبر الزمن . يُحفظ حوالي 99.9% من تسلسل الحمض النووي في الجينوم البشري بين الأفراد من جميع أنحاء العالم، مع وجود بعض الاختلافات. [ 1 ] تُعتبر تعددات أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) المساهم الأكبر في التباين الجيني لدى البشر، نظرًا لوفرتها وسهولة اكتشافها. [ 2 ] يُقدّر وجود ما لا يقل عن 10 ملايين من تعددات أشكال النوكليوتيدات المفردة ضمن البشر، ولكن توجد أيضًا أنواع أخرى كثيرة من المتغيرات الجينية، وتختلف هذه الأنواع اختلافًا كبيرًا في نطاقها. [ 1 ] يتراوح التباين بين الجينومات في البشر من تعددات أشكال النوكليوتيدات المفردة إلى تغييرات جذرية في النمط النووي البشري . [ 3 ]

يُعزى التباين الظاهري بين الأفراد في المجتمع البشري إلى التنوع الجيني البشري. وتوجد أنواع مختلفة من هذا التنوع ، ويخضع لدراسات مستفيضة لفهم أهميته بشكل أفضل. وقد أدت هذه الدراسات إلى اكتشافات تربط بين المتغيرات الجينية وأنماط ظاهرية معينة ، فضلاً عن آثارها في الأمراض . في البداية، وقبل ظهور تقنيات تسلسل الحمض النووي ، كان التباين يُدرس ويُلاحظ حصريًا على المستوى المجهري. وعلى هذا المستوى، اقتصرت الملاحظات على الاختلافات في عدد الكروموسومات وبنيتها . وتُعتبر هذه المتغيرات، التي يبلغ حجمها 3 ميجابايت أو أكثر، متغيرات بنيوية مجهرية. [ 1 ] هذا الحجم كبير بما يكفي لرؤيته باستخدام المجهر، ويشمل اختلالات الصيغة الصبغية ، والاختلافات الشكلية، وإعادة ترتيب الكروموسومات. [ 1 ] ومع ظهور تقنية تسلسل الحمض النووي، فُتح المجال لاكتشاف اختلافات تسلسلية أصغر حجمًا وأكثر عددًا بشكل هائل، بما في ذلك تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) والتكرارات المصغرة. يشمل ذلك أيضًا الانقلابات الصغيرة، والتضاعفات، والإدخالات، والحذوفات التي يقل حجمها عن 1 كيلوبايت. [ 1 ] في مشروع الجينوم البشري، تم بنجاح تحديد تسلسل الجينوم البشري، مما وفر جينومًا مرجعيًا للمقارنة بين التباين الجيني. مع تحسن تقنيات التسلسل والجينوم المرجعي ، تم اكتشاف المزيد من التباينات بأحجام مختلفة، أكبر من 1 كيلوبايت ولكنها أصغر من التباينات المجهرية. تُعتبر هذه التباينات، التي يتراوح حجمها من 1 كيلوبايت إلى 3 ميجابايت تقريبًا، تباينات بنيوية دون مجهرية. [ 1 ] يُعتقد أن هذه التباينات البنيوية المكتشفة حديثًا تلعب دورًا بالغ الأهمية في التنوع الظاهري وقابلية الإصابة بالأمراض.

أنواع المتغيرات الهيكلية

يُعدّ التباين البنيوي نوعًا مهمًا من التباين الجيني البشري الذي يُسهم في التنوع الظاهري. [ 2 ] توجد متغيرات بنيوية مجهرية ودون مجهرية، تشمل الحذف والتضاعف والتغيرات ذات العدد الكبير من النسخ، بالإضافة إلى الإدخالات والانقلابات والانتقالات. [ 1 ] هذه عدة أنواع مختلفة من المتغيرات البنيوية في الجينوم البشري، وهي متميزة تمامًا عن بعضها البعض. الانتقال هو إعادة ترتيب كروموسومي ، على مستوى الكروموسومات أو داخلها، حيث يتغير موضع جزء من الكروموسوم دون تغيير في محتوى الحمض النووي الكلي. [ 1 ] يُعتبر جزء الحمض النووي الذي يزيد طوله عن 1 كيلوبايت، ويوجد في نسختين أو أكثر لكل جينوم أحادي الصيغة الصبغية، حيث تشترك النسخ المختلفة في أكثر من 90% من التسلسل نفسه، تضاعفات قطاعية أو تكرارات منخفضة النسخ. [ 1 ] هذه مجرد أمثلة قليلة من بين العديد من أنواع المتغيرات البنيوية المعروفة في الجينوم البشري. يوضح الشكل 1 جدولًا يُبين هذه الأشكال المختلفة من المتغيرات البنيوية، بالإضافة إلى أشكال أخرى.

الانقلاب هو جزء من الحمض النووي على الكروموسوم ينعكس اتجاهه مقارنةً بالجينوم المرجعي. [ 1 ] أُجريت العديد من الدراسات لتحديد الانقلابات نظرًا لدورها الكبير في العديد من الأمراض. وجدت إحدى الدراسات أن 40% من مرضى الهيموفيليا أ لديهم انقلاب في جين العامل الثامن في منطقة معينة يبلغ حجمها 400 كيلوبايت. [ 4 ] وُجد أن نقطة انكسار الانقلاب تقع حول تكرار قطاعي، وهو ما يُلاحظ في العديد من حالات الانقلاب الأخرى. [ 4 ]

يصعب فهم كيفية نشوء كل متغير بنيوي فهمًا كاملًا. كان معروفًا سابقًا أن التسلسلات المتكررة على الكروموسوم تزيد من احتمالية إعادة التركيب المتماثل غير الأليلي. [ 5 ] يمكن أن تُسبب هذه التسلسلات المتكررة حذفًا، أو تكرارًا، أو انقلابًا، أو تكرارًا معكوسًا للكروموسومات. يوضح الشكل 2 نواتج هذه الآلية الناتجة عن تكرار التسلسل. أُجريت دراسة على مجموعات جينات مستقبلات الشم، حيث تساءل الباحثون عما إذا كانت هناك علاقة بين إعادة الترتيب الطبيعي للكروموسوم 8p والتسلسلات المعكوسة المتكررة. لاحظ الباحثون أن إعادة ترتيب الكروموسومات ناتجة في الواقع عن إعادة التركيب المتماثل في تكرارات 8p. لذلك، استنتجوا أن الركيزة المستخدمة لإجراء عمليات إعادة الترتيب على المستوى داخل الكروموسوم هي جينات مستقبلات الشم. [ 5 ] كشف هذا الاكتشاف عن دور التكرارات المعكوسة في التأثير على تطور المتغيرات البنيوية. تُعد الآليات والطرق التي يتم بها إنتاج المتغيرات الهيكلية مهمة لفهم تطور هذه الأنواع من المتغيرات الجينية بشكل أفضل.

آلية التباين الهيكلي

تنوع عدد النسخ

تُعرَّف متغيرات عدد النسخ بأنها أجزاء من الحمض النووي (DNA) التي يوجد عدد نسخها متغيرًا عند مقارنتها بالجينوم المرجعي، ويتجاوز  حجمها 1 كيلوبايت. [ 1 ] هذا التعريف واسع النطاق، ويشمل الحذف والتضاعف ومتغيرات عدد النسخ الكبيرة. إذا وُجد متغير عدد النسخ في 1% أو أكثر من السكان، فإنه يُعتبر أيضًا تعددًا شكليًا لعدد النسخ. [ 1 ] أُجريت دراسة حول التباين العالمي في عدد النسخ في الجينوم البشري، والتي تساءلت عن خصائص متغيرات عدد النسخ فيه. كان من المعروف أن تباين عدد النسخ في الجينوم البشري مهم، ولكن في ذلك الوقت، لم يكن مفهومًا تمامًا. يتميز تباين الجينوم البشري نفسه بتنوعه الكبير، حيث توجد أنواع عديدة تشمل الانقلابات والتضاعف والتعددات النوكليوتيدية المفردة (SNPs) وغيرها. قام الباحثون بمسح جينومات 270 فردًا من مجموعات سكانية متنوعة، بحثًا عن متغيرات عدد النسخ باستخدام تقنيات مثل مصفوفات التعددات النوكليوتيدية المفردة (SNP). [ 6 ] أظهرت نتائجهم أن العديد من متغيرات عدد النسخ لها ترتيبات محددة من عدم التوازن الارتباطي، مما كشف عن تباين عدد النسخ في جميع المجموعات السكانية المختلفة. [ 6 ] وخلصت الدراسة إلى أن 12% من الجينوم يحتوي على متغيرات عدد النسخ. ووجد أنها تشارك في جزء أكبر من الحمض النووي في كل جينوم مقارنةً بتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة. [ 6 ] كان هذا اكتشافًا لافتًا للنظر، إذ من المعروف أن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة هو الأكثر عددًا في الجينوم البشري. ومع ذلك، من حيث الحجم، وُجد أن هذه الأنواع من المتغيرات البنيوية لها وجود أكبر في الجينوم البشري.

استمر البحث في دراسة تباينات عدد النسخ، حيث كشفت العديد من الدراسات عن مدى انتشارها وأهميتها. أُجريت دراسةٌ استفسرت عن دور تنظيم هذه التباينات، وتساءلت عن نوع التضاعفات التي تمثلها. كان معروفًا أن تباين عدد النسخ يلعب دورًا كبيرًا في العديد من الأمراض البشرية، ولكن في ذلك الوقت لم تكن الدراسات واسعة النطاق حول هذه التضاعفات قد أُجريت. قرر الباحثون تسلسل 130 نقطة انقطاع من 112 فردًا، تحتوي على 119 تباينًا معروفًا في عدد النسخ، وذلك باستخدام تقنية تسلسل الجينوم الكامل وتقنية التسلسل من الجيل التالي. [ 7 ] ووجدوا أن التضاعفات المتتالية تُشكل 83% من تباينات عدد النسخ، بينما تُشكل التضاعفات الثلاثية 8.4%، والتضاعفات المتجاورة 4.2%، والانتقالات الإدخالية 2.5%، وإعادة الترتيبات المعقدة الأخرى 1.7%. [ 7 ] كانت معظم متغيرات عدد النسخ عبارة عن تكرارات متتالية، مما جعلها النوع الأكثر شيوعًا من متغيرات عدد النسخ في الجينوم البشري، وفقًا لنتائج الدراسة التي أُجريت على هذه المجموعة السكانية. كانت هناك حاجة إلى مزيد من البحث حول الجانب الآلي لتكوين المتغيرات البنيوية. أُجريت دراسة ركزت على آليات متغيرات عدد النسخ المسببة للأمراض النادرة والمثيرة للاهتمام . كان الباحثون على دراية بأهمية تباين عدد النسخ في التباين البنيوي للجينوم ومساهمته في الأمراض الوراثية البشرية، إلا أن الآليات الفعلية لمعظم متغيرات عدد النسخ الجديدة، والقليلة منها المسببة للأمراض، لم تكن معروفة. استخدموا تقنيات التسلسل لتحديد مناطق نقاط الانقطاع للعديد من متغيرات عدد النسخ المسببة للأمراض النادرة، وهو ما يُعد أكبر وأعمق تحليل لمتغيرات عدد النسخ. لاحظوا أن السمات المعمارية الجينومية بالغة الأهمية في الجينوم البشري، وأنها مرتبطة بنحو 81% من نقاط الانقطاع. [ 8 ] وخلصوا إلى أن التكرارات المتتالية والحذف الجزئي، وهما نادران ومسببان للأمراض، لا يحدثان في الجينوم البشري صدفةً. بل إنها تنشأ من العديد من السمات المعمارية الجينومية المختلفة. [ 8 ] لقد كانت نتيجة مثيرة للاهتمام للغاية، حيث أن بعض السمات المعمارية للجينوم جعلت من الممكن والمحتمل تطور بعض المتغيرات البنيوية النادرة والممرضة.

يمكن اعتبار التباين البنيوي أحد مسارات تعديل الجينوم للتكيف عبر التطور. أُجريت دراسة على النظام الغذائي للأسلاف وتطور عدد نسخ جين الأميليز البشري. أصبح استهلاك النشا مكونًا رئيسيًا في النظام الغذائي البشري مع تطور المجتمعات الزراعية. الأميليز هو الإنزيم المسؤول عن تكسير النشا، ويختلف عدد نسخه. [ 9 ] أدت هذه الملاحظات إلى التساؤل عما إذا كانت الاختلافات في استهلاك النشا بين مختلف المجموعات السكانية تُشكل ضغوطًا انتقائية طبيعية على إنزيم الأميليز. اختبر الباحثون الاختلافات في التعبير البروتيني للأميليز في لعاب مجموعات سكانية مختلفة، وقارنوا هذا التعبير بعدد نسخه في جينوماتهم. [ 9 ] ثم قارنوا استهلاك النشا لدى المجموعات السكانية المختلفة بعدد نسخ جين الأميليز لديهم. ووجدوا أن التعبير البروتيني للأميليز في لعاب الأشخاص الذين لديهم عدد نسخ أعلى من جين الأميليز في جينوماتهم كان أعلى، كما وُجد ارتباط بين مجموعات الأشخاص الذين يتبعون نظامًا غذائيًا غنيًا بالنشا وعدد نسخ أكبر من جين الأميليز. [ 9 ] وقد أسفرت هذه الدراسة عن نتائج مثيرة حيث أثبت التباين الهيكلي وجود دور في تطور السكان البشريين من خلال زيادة عدد نسخ الأميليز بمرور الوقت.

نجح مشروع الألف جينوم في إنتاج تسلسل الحمض النووي للجينوم البشري. وقد وفّر المشروع كمًّا هائلًا من بيانات التسلسل من العديد من المجموعات السكانية لتحليلها، بالإضافة إلى جينوم بشري مرجعي للمقارنة والدراسات المستقبلية. استغلت إحدى الدراسات هذا المورد لدراسة الاختلافات في التباين البنيوي بين الجينومات انطلاقًا من بيانات تسلسل الجينوم الكامل. كان من المعروف أن الأمراض البشرية تتأثر بالتضاعفات والحذف، وأن تحليل عدد النسخ شائع، إلا أن متغيرات عدد النسخ متعددة الأليلات (mCNVs) لم تحظَ بالدراسة الكافية. حصل الباحثون على بياناتهم من مشروع الألف جينوم، وحللوا 849 جينومًا مختلفًا من مجموعات سكانية متنوعة، تم تسلسلها بهدف تحديد متغيرات عدد النسخ متعددة الأليلات الكبيرة. [ 10 ] ومن خلال تحليلهم، وجدوا أن متغيرات عدد النسخ متعددة الأليلات تُحدث معظم التباين الجيني في جرعة الجينات مقارنةً بالمتغيرات البنيوية الأخرى، وأن تباين التعبير الجيني ينتج عن تنوع جرعة الجينات التي تُحدثها متغيرات عدد النسخ متعددة الأليلات. [ 10 ] أكدت الدراسة على الأهمية الكبيرة التي تتمتع بها المتغيرات الهيكلية، وخاصة mCNVs، في جرعة الجينات مما يؤدي إلى تعبيرات جينية متغيرة وتنوع النمط الظاهري البشري في السكان.

الآثار المترتبة على المرض

مرض شاركو-ماري توث (CMT)

توجد عدة اختلافات بنيوية في الجينوم البشري تم رصدها، لكنها لم تُؤدِّ إلى أي تأثيرات ظاهرية واضحة. [ 1 ] مع ذلك، هناك بعض الاختلافات التي تلعب دورًا في جرعة الجين، مما قد يُؤدي إلى أمراض وراثية أو أنماط ظاهرية مميزة. يمكن أن تؤثر الاختلافات البنيوية بشكل مباشر على التعبير الجيني، كما هو الحال مع اختلافات عدد النسخ، أو بشكل غير مباشر من خلال تأثيرات الموقع. [ 1 ] قد يكون لهذه التأثيرات آثار كبيرة على قابلية الإصابة بالأمراض. أول تأثير لجرعة الجين تم رصده، والذي يُعتبر مرضًا سائدًا متنحيًا ناتجًا عن إعادة ترتيب الحمض النووي الموروث، هو مرض شاركو-ماري-توث (CMT). معظم الارتباطات التي وُجدت مع مرض شاركو-ماري-توث كانت مع تكرار ترادفي بطول 1.5 ميجابايت في المنطقة 17p11.2-p12 في جين PMP22. [ 11 ] الآلية المقترحة للاختلاف البنيوي موضحة في الشكل 2. عندما يمتلك الفرد ثلاث نسخ من الجين الطبيعي، ينتج عن ذلك النمط الظاهري للمرض. [ 11 ] من ناحية أخرى، إذا كان لدى الفرد نسخة واحدة فقط من جين PMP22، فإن النتيجة هي اعتلال عصبي وراثي مختلف سريريًا مع قابلية للإصابة بشلل الضغط . [ 11 ] أدت الاختلافات في جرعة الجين إلى ظهور أنماط ظاهرية مرضية مختلفة بشكل كبير، مما كشف عن الدور المهم الذي يلعبه التباين الهيكلي في النمط الظاهري وقابلية الإصابة بالمرض.

قابلية الإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية

ازدادت شعبية دراسات التباين البنيوي نتيجةً لاكتشاف أدوارها وتأثيراتها المحتملة في الجينوم البشري. يُعدّ تباين عدد النسخ نوعًا مهمًا جدًا من التباين البنيوي، وقد خضع لدراسات مستفيضة. اختبرت إحدى الدراسات تأثير جين CCL3L1 على قابلية الإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية / الإيدز، وذلك بفحص ما إذا كان لعدد نسخ هذا الجين أي تأثير على قابلية الفرد للإصابة بالفيروس. وقد قام الباحثون بأخذ عينات من أفراد ومجموعات سكانية مختلفة لقياس عدد نسخ جين CCL3L1 لديهم ، ومقارنته بخطر إصابتهم بفيروس نقص المناعة البشرية. ووجدوا أن هناك ارتباطًا بين ارتفاع عدد نسخ جين CCL3L1 وقابلية الإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية والإيدز، حيث كان الأفراد الأكثر عرضة للإصابة بالفيروس لديهم عدد نسخ منخفض من هذا الجين . [ 12 ] وقد أظهرت هذه الدراسة أن هذا الاختلاف في عدد النسخ قد يلعب دورًا هامًا في قابلية الإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية. كما اختبرت دراسة أخرى، ركزت على آلية مرض السمنة لدى الإنسان، ما إذا كان التباين البنيوي لجين NPY4R ذا دلالة إحصائية في السمنة. أظهرت دراسات سابقة وجود ارتباط بين تغير عدد النسخ في المنطقة 10q11.22 والسمنة، وأن العديد من تغيرات عدد النسخ مرتبطة بها. وكشف تحليل تغير عدد النسخ أن جين NPY4R يُظهر معدل فقدان أعلى بكثير لتغير عدد النسخ في المنطقة 10q11.22 لدى المرضى. [ 13 ] في المقابل، لوحظ ارتفاع في معدل اكتساب تغير عدد النسخ في المنطقة نفسها لدى مجموعة المقارنة. دفع هذا الباحثين إلى استنتاج أن جين NPY4R يلعب دورًا هامًا في آلية حدوث السمنة نتيجة لتغير عدد نسخه. [ 13 ] وقد أسهمت الدراسات التي تناولت تغير عدد النسخ، بالإضافة إلى المتغيرات البنيوية الأخرى، في تقديم رؤى جديدة حول الأدوار المهمة التي تؤديها هذه المتغيرات في الجينوم البشري.

فُصام

خضعت العوامل المساهمة في تطور مرض الفصام لدراسات مستفيضة. وقد أُجريت دراسة حديثة للغاية حول الآلية والجينات المسؤولة عن تطور هذا المرض. وقد سبق أن تبين أن التباين في موضع MHC يرتبط بتطور الفصام. ووجدت هذه الدراسة أن هذا الارتباط ناتج جزئيًا عن جينات المكون المكمل 4 (C4)، مما يشير إلى أن متغيرات أليلات جينات C4 تساهم في تطور الفصام. [ 14 ] ساعد عدم التوازن الارتباطي الباحثين على تحديد المتغير البنيوي لجين C4 لدى الفرد من خلال دراسة الأنماط الفردية للنيوكليوتيدات المفردة (SNP). كانت الأنماط الفردية للنيوكليوتيدات المفردة وأليلات C4 مرتبطة، وهذا ما يفسر عدم التوازن الارتباطي بينها، أي أنها تنفصل معًا. [ 14 ] ارتبط متغير بنيوي واحد لجين C4 بالعديد من الأنماط الفردية المختلفة للنيوكليوتيدات المفردة، بينما ارتبطت أنماط فردية مختلفة للنيوكليوتيدات المفردة بمتغير بنيوي واحد فقط لجين C4. [ 14 ] يعود ذلك إلى عدم التوازن الارتباطي الذي مكّن الباحثين من تحديد المتغير البنيوي لـ C4 بسهولة من خلال دراسة النمط الفرداني للنيوكليوتيدات المفردة المتغيرة (SNP). وقد أشارت بياناتهم إلى ذلك، إذ أظهرت النتائج أن المتغيرات البنيوية لـ C4 تُعبّر عن بروتين C4A بمستويات مختلفة، وأن هذا الاختلاف في مستويات التعبير الأعلى لبروتين C4A يرتبط بارتفاع معدلات الإصابة بالفصام. [ 14 ] وقد تبين أن الأليلات المختلفة للمتغيرات البنيوية لنفس الجين لها أنماط ظاهرية مختلفة، وتختلف في قابلية الإصابة بالمرض. تُظهر هذه الدراسات مدى اتساع نطاق تأثير التباين البنيوي وأهميته في الجينوم البشري، وتتجلى أهميته في مساهمته في التنوع الظاهري وقابلية الإصابة بالأمراض.

التوجهات المستقبلية

أُجريت العديد من الدراسات لفهم التباين البنيوي في الجينوم البشري بشكل أفضل. وقد شهد البحث تقدماً كبيراً، إلا أن أهميته لا تزال غير مفهومة تماماً. ولا تزال هناك العديد من الأسئلة التي لم تتم الإجابة عليها، مما يستدعي إجراء المزيد من الدراسات حول هذا الموضوع. تستهدف الدراسات الحالية عادةً المناطق "الفريدة" من الجينوم، لكنها لا تستطيع رصد التأثير الظاهري للمتغيرات البنيوية في المناطق الجينومية المتكررة والمضاعفة والمعقدة. [ 15 ] من الصعب جداً دراسة هذا الأمر باستخدام تقنيات الجينوم الحالية، ولكن قد يتغير هذا مع تطور تقنيات التسلسل في المستقبل. ولتحسين فهم التأثير الظاهري للمتغيرات البنيوية، يجب إنشاء قواعد بيانات ضخمة للأنماط الجينية والظاهرية للأفراد لإجراء ارتباطات دقيقة. وقد مهدت مشاريع ضخمة مثل مشروع فك شفرة الاضطرابات النمائية، ومشروع UK10K، واتحاد المعايير الدولية لمصفوفات علم الجينوم الخلوي، الطريق لإنشاء قواعد بيانات تُمكّن الباحثين من إجراء هذه الدراسات بسهولة أكبر. [ 15 ]

بالإضافة إلى ذلك، شهدت تقنيات إنتاج الخلايا الجذعية المحفزة متعددة القدرات، التي تحمل جينات لأمراض محددة، نموًا وتطورًا ملحوظًا. وقد أدى ذلك إلى توفير نماذج مناسبة لإعادة إنتاج الطفرات البنيوية المسببة للأمراض، مثل الانتقالات والتضاعفات والانقلابات. [ 15 ] وسيساهم التقدم المستقبلي في التقنيات وجهود بناء قواعد البيانات الضخمة في تمهيد الطريق لدراسات ذات جودة أعلى وفهم أعمق للتنوع البنيوي في الجينوم البشري.

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 Feuk, L.; Carson, AR; Schere, SW (2006). " التنوع البنيوي في الجينوم البشري". Nature Reviews Genetics . 7 (2): 85–97 . doi : 10.1038 /nrg1767 . PMID 16418744. S2CID 17255998 .  
  2. 1 2 نغوين، دي كيو؛ ويبر، سي؛ بونتينغ، سي بي (2006). "تحيز الانتقاء على متغيرات عدد النسخ البشرية" . PLOS Genetics . 2 (2): e20. CiteSeerX 10.1.1.276.7715 . doi : 10.1371/journal.pgen.0020020 . PMC 1366494. PMID 16482228 .   
  3. ^ كيد، جي إم. كوبر، جنرال موتورز؛ دوناهيو، WF؛ هايدن، HS. سامباس، ن.؛ جريفز، ت؛ هانسن، ن.؛ تيوج، ب. ألكان، سي. أنتوناتشي، ف. هاوجين، إي. زر، T.؛ يامادا، NA؛ تسانغ، ب. نيومان، ليرة تركية. توزون، إي. تشنغ، Z .؛ ابلينج، جلالة. تسنيم، ن.؛ ديفيد، ر. جيليت، دبليو؛ فيلبس، كا؛ ويفر، م. سارانغا، د.؛ العلامة التجارية، أ؛ تاو، دبليو. غوستافسون، إي. ماكيرنان، ك.؛ تشن، L.؛ ماليج، م.؛ سميث، دينار؛ كورن، جي إم؛ مكارول، سا؛ ألتشولر، دا؛ بيفر، دا؛ دورشنر، م. ستاماتويانوبولوس، ج .؛ شوارتز، د.؛ نيكرسون، د.أ.؛ موليكين، ج.س.؛ ويلسون، ر.ك.؛ برون، ل.؛ أولسون، م.ف.؛ كاول، ر.؛ سميث، د.ر.؛ إيشلر، إ.إ. (2008). "رسم خرائط وتسلسل التباين البنيوي من ثمانية جينومات بشرية" . مجلة نيتشر . 453 (7191): 56-64 . Bibcode : 2008Natur.453...56K . doi : 10.1038/nature06862 . PMC 2424287. PMID 18451855 .  
  4. 1 2 لاكيش، د.؛ كازازيان، سمو؛ أنتوناراكيس، SE؛ جيتشيير، ج. (1993). "إن الانقلابات التي تعطل جين العامل الثامن هي سبب شائع للهيموفيليا الشديدة A". نات. جينيت . 5 (3): 236-241 . دوى : 10.1038 / ng1193-236 . بميد 8275087 . S2CID 25636383 .  
  5. 1 2 جيليو، إس. برومان، كيلوواط. ماتسوموتو، ن.؛ كالفاري، V.؛ جيميلي، ج.؛ نيومان، T.؛ أوهاشي، ه.؛ فولير، ل.؛ لاريزا، د.؛ جيوردا، ر. ويبر، JL. ليدبيتر، د. ظفاردي، O. (2001). "مجموعات جينات المستقبلات الشمية، وتعدد أشكال الانعكاس الجينومي، وإعادة ترتيب الكروموسومات الشائعة" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 68 (4): 874– 83. دوى : 10.1086/319506 . بمك 1275641 . بميد 11231899 .  
  6. 1 2 3 ريدون، آر؛ إيشيكاوا، إس؛ فيتش، KR. فيوك، L.؛ بيري، غ. أندروز، تي دي؛ فيجلر، ه.؛ شابيرو، MH؛ كارسون، أر. تشن، دبليو؛ تشو، إيك. دالير، س. فريمان، JL. جونزاليس، JR. جراتاكوس، م. هوانغ، J.؛ كالايتزوبولوس، د.؛ كومورا، د.؛ ماكدونالد، الابن. مارشال، سي آر؛ مي، ر. مونتغمري، L.؛ نيشيمورا، ك.؛ أوكامورا، ك. شين، ف. سومرفيل، إم جي؛ تشيندا، J.؛ فالسيسيا، أ؛ وودوارك، C .؛ يانغ، ف؛ تشانغ، J.؛ زرجال، ت.؛ تشانغ، J.؛ أرمنغول، ل.؛ كونراد، مدافع؛ إستيفيل، إكس؛ تايلر-سميث، سي.؛ كارتر، إن بي؛ أبوراتاني، إتش.؛ لي، سي.؛ جونز، كيه دبليو؛ شير، إس دبليو؛ هيرلز، إم إي (2006). " التنوع العالمي في عدد النسخ في الجينوم البشري" . مجلة نيتشر . 444 (7118): 444-454 . Bibcode : 2006Natur.444..444R . doi : 10.1038/nature05329 . PMC 2669898. PMID 17122850 .  
  7. نيومان ، س.؛ هيرميتز، ك.إ.؛ ويكسلبلات، ب.؛ رود، م.ك. (2015). "يكشف التسلسل الجيني من الجيل التالي لتغيرات عدد النسخ المتكررة أن معظمها متكرر بشكل متتالي، وأن بعضها يُنشئ جينات اندماجية عند نقاط الانقطاع" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 96 (2): 208-220 . doi : 10.1016/j.ajhg.2014.12.017 . PMC 4320257. PMID 25640679 .  
  8. 1 2 فيسيرز، إل إي؛ بهات، إس إس؛ جانسن، آي إم؛ شيا، زد؛ لالاني، إس آر؛ بفوندت، آر؛ ديروينسكا، ك؛ دي فريس، بي بي؛ جيليسن، سي؛ هويشن، إيه؛ نيستيروك، إم؛ فيسنيوفيتسكا-كوالنيك، بي؛ سميك، إم؛ برونر، إتش جي؛ تشيونغ، إس دبليو؛ فان كيسل، إيه جي؛ فيلتمان، جيه إيه؛ ستانكيويتش، بي. (2009). "الحذف الجزئي المرضي النادر والتضاعفات المتتالية تتوسطها التماثلات الجزئية وتحفزها البنية الجينومية المحلية" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 18 (19): 3579-3593 . doi : 10.1093/hmg/ddp306 . PMID 19578123 . 
  9. بيري ، جي إتش ؛ دوميني، إن جيه؛ كلاو، كيه جي؛ لي، إيه إس؛ فيجلر، إتش؛ ريدون، آر؛ فيرنر، جيه؛ فيلانيا، إف إيه؛ ماونتن، جيه إل؛ ميسرا، آر؛ كارتر، إن بي؛ لي، سي؛ ستون، إيه سي (2007). " النظام الغذائي وتطور تباين عدد نسخ جين الأميليز البشري" . علم الوراثة الطبيعية . 39 (10): 1256-1260 . doi : 10.1038/ng2123 . PMC 2377015. PMID 17828263 .  
  10. 1 2 هاندساكر، ر. إي.؛ فان دورين، ف.؛ بيرمان، ج. ر.؛ جينوفيز، ج.؛ كاشين، س.؛ بوتجر، ل. م.؛ مكارول، س. أ. (2015). "تغيرات كبيرة في عدد النسخ متعددة الأليلات لدى البشر" (ملف PDF) . علم الوراثة الطبيعية . 47 (3): 296-303 . doi : 10.1038/ng.3200 . PMC 4405206. PMID 25621458 .  
  11. لوبسكي ، جيه آر ؛ دي أوكا-لونا، آر إم؛ سلاوجنهاوبت، إس؛ بنتاو، إل؛ غوزيتا، في؛ تراسك، بي جيه؛ ساوسيدو-كارديناس، أو؛ باركر، دي إف؛ كيليان، جيه إم؛ غارسيا، سي إيه؛ تشاكرافارتي، إيه؛ باتيل، بي آي (1991). "تضاعف الحمض النووي المرتبط بمرض شاركو-ماري-توث من النوع 1A". الخلية . 66 ( 2): 219-232 . doi : 10.1016/0092-8674(91)90613-4 . PMID 1677316. S2CID 13155635 .  
  12. ↑ غونزاليس، إي.؛ كولكارني، هـ.؛ بوليفار، هـ.؛ مانغانو، أ.؛ سانشيز، ر.؛ كاتانو، ج.؛ نيبس، ر. ج.؛ فريدمان، ب. إ.؛ كينونيس، م. ب.؛ بامشاد، م. ج.؛ مورثي، ك. ك.؛ روفين، ب. هـ.؛ برادلي، و.؛ كلارك، ر. أ.؛ أندرسون، س. أ.؛ أوكونيل، ج.؛ أغان، ب. ك.؛ أهوجا، س. س.؛ بولونيا، ر.؛ سين، ل.؛ دولان، م. ج.؛ أهوجا، س. ك. (2005). "تأثير التضاعفات القطعية المحتوية على جين CCL3L1 على قابلية الإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية من النوع الأول/الإيدز". مجلة ساينس . 307 (5714): 1434-1440 . Bibcode : 2005Sci...307.1434G . doi : 10.1126/ science.1101160 . PMID 15637236. S2CID 8815153 .  
  13. 1 2 آيرتس، إي؛ بيكرز، س.؛ زيجرز، د.؛ فان هورينبيك، ك.؛ ماسا، ج.؛ فيريجكن، أ.؛ فيرهولست، إس إل؛ فان غال، LF؛ فان هول، دبليو (2016). "يشير تحليل CNV وفحص الطفرات إلى دور مهم لجين NPY4R في السمنة البشرية" . بدانة . 24 (4): 970-6 . دوى : 10.1002/oby.21435 . بميد 26921218 . 
  14. 1 2 3 4 سيكار، أ.؛ بيالاس، أ.ر.؛ دي ريفيرا، هـ.؛ ديفيس، أ.؛ هاموند، ت.ر.؛ كاميتاكي، ن.؛ تولي، ك.؛ بريسومي، ج.؛ باوم، م.؛ فان دورين، ف.؛ جينوفيز، ج.؛ روز، س.أ.؛ هاندساكر، ر.إ.؛ دالي، م.ج.؛ كارول، م.س.؛ ستيفنز، ب.؛ مكارول، س.أ. (2016). "خطر الإصابة بالفصام نتيجة التباين المعقد في المكون 4 من نظام المتممة" . مجلة نيتشر . 530 (7589): 177-183 . Bibcode : 2016Natur.530..177 . doi : 10.1038/nature16549 . PMC 4752392. PMID 26814963 .  
  15. 1 2 3 فايشنفيلدت، ج.؛ سيمونز، أ.؛ سبيتز، ف.؛ كوربل، ج. أو. (2013). "التأثير الظاهري للتغيرات البنيوية الجينومية: رؤى من وإلى الأمراض البشرية". مجلة نيتشر ريفيوز جينيتكس . 14 (2): 125-138 . doi : 10.1038/nrg3373 . PMID 23329113. S2CID 27469511 .