قناة أنيونية تعتمد على الجهد

قنوات الأنيونات المعتمدة على الجهد ، أو بورينات الميتوكوندريا ، هي فئة من قنوات أيونات البورين الموجودة على الغشاء الخارجي للميتوكوندريا . [ 1 ] [ 2 ] وهناك جدل حول ما إذا كانت هذه القناة موجودة في غشاء سطح الخلية أم لا. [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]

يشكل هذا البروتين الرئيسي في الغشاء الخارجي للميتوكوندريا في حقيقيات النوى قناة انتقائية للأنيونات تعتمد على الجهد (VDAC)، وتعمل كمسام انتشار عام للجزيئات الصغيرة المحبة للماء . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] تتخذ القناة شكلاً مفتوحاً عند جهد غشائي منخفض أو معدوم، وشكلاً مغلقاً عند جهود أعلى من 30-40 ملي فولت. [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] تُسهّل VDAC تبادل الأيونات والجزيئات بين الميتوكوندريا والسيتوبلازم، ويتم تنظيمها من خلال التفاعلات مع بروتينات أخرى وجزيئات صغيرة. [ 13 ]

بناء

يحتوي هذا البروتين على حوالي 280 حمضًا أمينيًا، ويشكل برميلًا بيتا يمتد عبر الغشاء الخارجي للميتوكوندريا. [ 14 ] [ 15 ]

منذ اكتشافها عام 1976، أُجريت تحليلات واسعة النطاق لوظائف وبنية بروتينات VDAC. وقد برزت سمة بارزة للمسام: عند إعادة تكوينها في طبقات ثنائية من الدهون المستوية ، يحدث تحول يعتمد على الجهد بين حالة موصلية عالية انتقائية للأنيونات مع تدفق عالٍ للمستقلبات وحالة موصلية منخفضة انتقائية للكاتيونات مع مرور محدود للمستقلبات.

بعد أكثر من 30 عامًا من اكتشافه الأولي، في عام 2008، أُنجزت ثلاثة مشاريع هيكلية مستقلة لبروتين VDAC-1. حُلّ المشروع الأول باستخدام مطيافية الرنين النووي المغناطيسي متعددة الأبعاد . أما المشروع الثاني، فاعتمد على منهجية هجينة باستخدام بيانات علم البلورات. بينما خُصص المشروع الثالث لبلورات VDAC-1 في الفئران، والتي حُددت باستخدام تقنيات علم البلورات بالأشعة السينية . كشفت المشاريع الثلاثة للهياكل ثلاثية الأبعاد لبروتين VDAC-1 عن العديد من السمات الهيكلية. أولًا، يُمثل VDAC-1 فئة هيكلية جديدة من بروتينات الغشاء الخارجي ذات البنية الأسطوانية بيتا، والتي تحتوي على عدد فردي من الخيوط. ومن السمات الأخرى أن السلسلة الجانبية سالبة الشحنة للحمض الأميني E73 مُوجهة نحو البيئة الكارهة للماء للغشاء. يتوافق الهيكل ثلاثي الأبعاد ذو الـ 19 خيطًا، والذي تم الحصول عليه من مصادر تجريبية مختلفة في ثلاثة مختبرات مختلفة، مع بيانات المجهر الإلكتروني والمجهر الذري من مصادر الغشاء الأصلية، ويُمثل حالة ذات أهمية بيولوجية لبروتين VDAC-1. [ 13 ]

الآلية

عند جهد غشائي يتجاوز 30 ملي فولت (موجبًا كان أم سالبًا)، يتخذ VDAC حالة مغلقة، ويتحول إلى حالته المفتوحة بمجرد انخفاض الجهد دون هذا الحد. ورغم أن كلتا الحالتين تسمحان بمرور الأملاح البسيطة، إلا أن VDAC أكثر صرامة مع الأنيونات العضوية، وهي فئة تندرج ضمنها معظم المستقلبات . [ 16 ] لم تُحدد بعد الآلية الدقيقة لربط تغيرات الجهد بالتغيرات التركيبية داخل البروتين، لكن دراسات توماس وآخرون تشير إلى أنه عند تحول البروتين إلى الشكل المغلق، تؤدي تغيرات الجهد إلى إزالة جزء كبير من البروتين من القناة وتقليل نصف قطر المسام الفعال. [ 17 ] وقد أشير إلى العديد من بقايا الليسين ، بالإضافة إلى Glu-152، باعتبارها بقايا استشعارية مهمة بشكل خاص داخل البروتين. [ 18 ]

الوظيفة البيولوجية

تلعب قناة الأيونات المعتمدة على الجهد دورًا محوريًا في تنظيم التدفق الأيضي والطاقي عبر الغشاء الخارجي للميتوكوندريا. فهي تُشارك في نقل الأدينوسين ثلاثي الفوسفات ( ATP ) والأدينوسين ثنائي الفوسفات (ADP) والبيروفات والمالات وغيرها من المستقلبات، وبالتالي تتواصل بشكل مكثف مع الإنزيمات في المسارات الأيضية. [ 16 ] وقد وُجد أن إنزيمات السيتوبلازم المعتمدة على ATP، مثل هيكسوكيناز ، وجلوكوكيناز ، وجليسرول كيناز ، بالإضافة إلى إنزيم كرياتين كيناز الميتوكوندري ، ترتبط جميعها بقناة VDAC. هذا الارتباط يُقرّبها من ATP المُحرر من الميتوكوندريا. وعلى وجه الخصوص، يُفترض أن ارتباط هيكسوكيناز يلعب دورًا رئيسيًا في ربط تحلل الجلوكوز بالفسفرة التأكسدية . [ 17 ] علاوة على ذلك، تُعد قناة VDAC مُنظمًا هامًا لنقل أيونات الكالسيوم (Ca2 +) من وإلى الميتوكوندريا. لأن Ca 2+ هو عامل مساعد للإنزيمات الأيضية مثل نازعة هيدروجين البيروفات ونازعة هيدروجين الإيزوسيترات ، فإن إنتاج الطاقة والتوازن الداخلي يتأثران بنفاذية VDAC لـ Ca 2+ . [ 19 ]

أهمية المرض

ثبت أيضًا أن لبروتين VDAC دورًا في موت الخلايا المبرمج . [ 20 ] أثناء موت الخلايا المبرمج، يُعدِّل VDAC مسام نفاذية الميتوكوندريا لإطلاق عوامل محفزة لموت الخلايا المبرمج، مثل السيتوكروم ج . مع ذلك، لا يُعد VDAC مكونًا أساسيًا لمسام نفاذية الميتوكوندريا. على الرغم من أن السيتوكروم ج يلعب دورًا أساسيًا في الفسفرة التأكسدية داخل الميتوكوندريا، فإنه في السيتوسول يُنشِّط إنزيمات محللة للبروتين تُسمى الكاسبيز ، والتي تلعب دورًا رئيسيًا في موت الخلايا. [ 21 ] على الرغم من أن آلية إطلاق السيتوكروم ج بواسطة VDAC لم تُفهم بالكامل بعد، تشير بعض الأبحاث إلى أن تكوين قليل الوحدات بين الوحدات الفرعية قد يُنشئ مسامًا كبيرًا ومرنًا يمكن للسيتوكروم ج المرور من خلاله. [ 22 ] من العوامل الأكثر أهمية أن إطلاق السيتوكروم سي يُنظَّم أيضًا بواسطة عائلة بروتينات Bcl-2 : يتفاعل Bax مباشرةً مع VDAC لزيادة حجم المسام وتعزيز إطلاق السيتوكروم سي، بينما يُنتج Bcl-xL المضاد للاستماتة تأثيرًا معاكسًا تمامًا. [ 23 ] في الواقع، لقد ثبت أن الأجسام المضادة التي تثبط VDAC تتداخل أيضًا مع إطلاق السيتوكروم سي بوساطة Bax في كل من الميتوكوندريا المعزولة والخلايا الكاملة. [ 24 ] يشير هذا الدور المحوري في الاستماتة إلى أن VDAC هدف محتمل للأدوية الكيميائية.

أمثلة

تحتوي الخميرة على عضوين من هذه العائلة (الجينات POR1 و POR2)؛ بينما تحتوي الفقاريات على ثلاثة أعضاء على الأقل (الجينات VDAC1 و VDAC2 و VDAC3). [ 14 ]

يُشفّر البشر، كمعظم حقيقيات النوى العليا، ثلاثة أنواع مختلفة من بروتينات VDAC؛ وهي VDAC1 و VDAC2 و VDAC3 . وتُمثّل هذه البروتينات، إلى جانب TOMM40 و TOMM40L ، عائلة من بروتينات بيتا-باريل ذات صلة تطورية. [ 25 ]

تحتوي النباتات على أكبر عدد من قنوات VDAC. يشفر نبات الرشاد أربعة أنواع مختلفة من قنوات VDAC، ولكن قد يكون هذا العدد أكبر في أنواع أخرى. [ 26 ]

مراجع

  1. ^ هوجينبوم بي دبليو، سودا ك، إنجل أ، فوتياديس د (2007). “التجمعات فوق الجزيئية لقنوات الأنيونات المعتمدة على الجهد في الغشاء الأصلي”. جيه مول. بيول . 370 (2): 246–55 . دوى : 10.1016/j.jmb.2007.04.073 . بميد 17524423 . 
  2. بلاكلي-دايسون، إي؛ فورتي، إم (سبتمبر 2001). "قنوات VDAC" . مجلة IUBMB Life . 52 ( 3-5 ): 113-118 . doi : 10.1080/15216540152845902 . PMID 11798022. S2CID 38314888 .  
  3. سابيروف ر.ز، ميرزلياك ب.ج (يونيو 2012). "جدل قنوات VDAC في غشاء الخلية ولغز قنوات الأنيونات الكبيرة" . مجلة بيوشيميكا وبيوفيزيكا أكتا . 1818 (6): 1570-1580 . doi : 10.1016/j.bbamem.2011.09.024 . PMID 21986486 . 
  4. دي بينتو، ف.؛ ميسينا، أ.؛ لين، د. ج. ر.؛ لاوين، أ. (2010). "قناة انتقائية للأنيونات تعتمد على الجهد (VDAC) في غشاء البلازما" . رسائل FEBS . 584 (9): 1793-1799 . Bibcode : 2010FEBSL.584.1793D . doi : 10.1016/j.febslet.2010.02.049 . PMID: 20184885. S2CID : 3391282 .  
  5. نيهيج، سي.؛ ستينبلوك، سي.؛ بورش، تي.؛ بورنهاوزر، إم.؛ كوربيل، دي.؛ هوفلاك، بي. (2011). بورلونجان، سيزاريو في (محرر). "بروتينات سطح الخلية للخلايا اللحمية المتوسطة البشرية" . PLOS ONE . 6 (5) e20399. Bibcode : 2011PLoSO...620399N . doi : 10.1371/ journal.pone.0020399 . PMC 3102717. PMID 21637820 .  
  6. بنز ر (1994). "نفاذية المواد المذابة المحبة للماء عبر الأغشية الخارجية للميتوكوندريا: مراجعة حول بورينات الميتوكوندريا". بيوشيم. بيوفيز. أكتا . 1197 (2): 167-196 . doi : 10.1016/0304-4157(94)90004-3 . PMID 8031826 . 
  7. مانيلا، سي. أ. (1992). "مداخل ومخارج قنوات غشاء الميتوكوندريا". مجلة تريندز في العلوم البيوكيميائية ، 17 (8): 315-320 . doi : 10.1016/0968-0004(92)90444-E . PMID 1384178 . 
  8. ديهانيش م (1990). " التكوين الحيوي ووظيفة البورينات حقيقية النواة". إكسبيرينتيا . 46 (2): 146-153 . doi : 10.1007/BF02027310 . PMID 1689252. S2CID 2199583 .  
  9. فورتي إم، جاي إتش آر، مانيلا سي إيه (1987). "الوراثة الجزيئية لقناة أيون VDAC: النموذج البنيوي وتحليل التسلسل" . مجلة الطاقة الحيوية والأغشية الحيوية . 19 (4): 341-350 . doi : 10.1007/BF00768537 . PMID 2442148. S2CID 10219032 .  
  10. راوات، أديش؛ ماهالاكشمي، رادهاكريشنان (فبراير 2026). "التفاعل بين البروتين والدهون يتحكم في فتح قنوات الأيونات والطاقة الحيوية في VDAC3 الميتوكوندري البشري" . علم البروتين . 35 (2) e70486. doi : 10.1002/pro.70486 . ISSN 0961-8368 . PMC 12828989. PMID 41575209 عبر مكتبة وايلي الإلكترونية.   
  11. ^ شودري، أوم ب. أوجوال، رشنا؛ كواليس، وليام. كولسون، روب. ابرامسون، جيف. جراب ، مايكل (فبراير 2010). "الكهرباء الساكنة لـ VDAC: الآثار المترتبة على الانتقائية والبوابة" . مجلة البيولوجيا الجزيئية . 396 (3): 580-592 . دوى : 10.1016/j.jmb.2009.12.006 . بمك 3736979 . PMID 20005234 عبر Elsevier Science Direct.  
  12. ^ كولومبيني، ماركو. مانيلا ، كارمن أ. (يونيو 2012). "VDAC، الأيام الأولى" . الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية اكتا (BBA) - الأغشية الحيوية . 1818 (6): 1438–1443 . دوى : 10.1016/j.bbamem.2011.11.014 . بمك 3296906 . PMID 22120576 عبر Elsevier Science Direct.  
  13. 1 2 هيلر إس، أبرامسون جيه، مانيلا سي، فاغنر جي، زيث كيه (سبتمبر 2010). "البنية ثلاثية الأبعاد لبروتين VDAC تمثل التكوين الطبيعي" . مجلة Trends in Biochemical Sciences ، 35 (9): 514-521 . doi : 10.1016/j.tibs.2010.03.005 . PMC 2933295. PMID 20708406 .  
  14. 1 2 سامبسون إم جيه، لوفيل آر إس، دافيسون دي بي، كريجن دبليو جيه (1996). "جين جديد لقناة أنيونية تعتمد على الجهد في الميتوكوندريا لدى الفئران، يقع على الكروموسوم 8". علم الجينوم . 36 (1): 192-196 . doi : 10.1006/geno.1996.0445 . PMID 8812436 . 
  15. زيث ك (2010). "بنية وتطور بروتينات الغشاء الخارجي للميتوكوندريا ذات بنية برميل بيتا" . بيوشيم. بيوفيز. أكتا . 1797 ( 6-7 ): 1292-1299 . doi : 10.1016/j.bbabio.2010.04.019 . PMID 20450883 . 
  16. 1 2 بلاكلي-دايسون، إي. وفورتي، م. (2001). "قنوات VDAC" . مجلة IUBMB Life . 52 ( 3-5 ): 113-118 . doi : 10.1080/15216540152845902 . PMID 11798022. S2CID 38314888 .  
  17. 1 2 كولومبيني م، بلاكلي-دايسون إي، فورتي م (1996). "VDAC، قناة في الغشاء الخارجي للميتوكوندريا". قنوات الأيونات . المجلد 4. الصفحات 169-202 . doi : 10.1007/978-1-4899-1775-1_5 . ISBN   978-1-4899-1777-5PMID 8744209 
  18. توماس إل، بلاكلي-دايسون إي، كولومبيني إم، فورتي إم (يونيو 1993). "تحديد مواقع البقايا المكونة لمستشعر الجهد لقناة الأنيونات الانتقائية المعتمدة على الجهد" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 90 ( 12): 5446-5449 . Bibcode : 1993PNAS...90.5446T . doi : 10.1073/pnas.90.12.5446 . PMC 46737. PMID 7685903 .  
  19. شوشان-بارماتز، ف.؛ جينسل، د. (2003). "قناة الأنيون المعتمدة على الجهد: توصيفها، وتعديلها، ودورها في وظيفة الميتوكوندريا في حياة الخلية وموتها". بيوكيمياء الخلية وبيوفيزياءها . 39 (3): 279-292 . doi : 10.1385/CBB:39:3: 279 . PMID 14716081. S2CID 33628015 .  
  20. ليماسترز جيه جيه؛ هولمحمدوف إي. (2006). "قناة الأنيون المعتمدة على الجهد (VDAC) كمنظم للميتوكوندريا - التفكير خارج الصندوق" . بيوشيم. بيوفيز. أكتا . 1762 (2): 181-190 . doi : 10.1016/j.bbadis.2005.10.006 . PMID 16307870 . 
  21. تسوجيموتو واي، شيميزو إس (2002). "قناة الأنيون المعتمدة على الجهد: عنصر أساسي في موت الخلايا المبرمج". بيوشيمي . 84 ( 2-3 ): 187-193 . doi : 10.1016/S0300-9084(02)01370-6 . PMID 12022949 . 
  22. زالك ر؛ إسرائيلسون أ؛ غارتي إي إس؛ أزولاي-زوهار ح؛ شوشان-بارماتز ف. (2005). " حالات قليلة الوحدات لقناة الأنيون المعتمدة على الجهد وإطلاق السيتوكروم ج من الميتوكوندريا" . مجلة الكيمياء الحيوية. 386 ( 1): 73-83 . doi : 10.1042/BJ20041356 . PMC 1134768. PMID 15456403 .  
  23. شيميزو إس؛ ناريتا إم؛ تسوجيموتو واي. (1999). "بروتينات عائلة Bcl-2 تنظم إطلاق السيتوكروم سي المحفز للاستماتة عبر قناة VDAC الميتوكوندرية". نيتشر . 399 ( 6735): 483-487 . Bibcode : 1999Natur.399..483S . doi : 10.1038/20959 . PMID 10365962. S2CID 4423304 .  
  24. شيميزو إس؛ ماتسوكا واي؛ شينوهارا واي؛ يونيدا واي؛ تسوجيموتو واي. (2001). "الدور الأساسي لقناة الأنيون المعتمدة على الجهد في مختلف أشكال موت الخلايا المبرمج في خلايا الثدييات" . مجلة بيولوجيا الخلية . 152 (2): 237-250 . doi : 10.1083/jcb.152.2.237 . PMC 2199613. PMID 11266442 .  
  25. باي دي سي، حافظ إم، يونغ إم جيه، كورت دي إيه (يونيو 2012). "التحليل التطوري والتطور المشترك لعائلة بروتينات بيتا-باريل المكونة من بورين الميتوكوندريا (VDAC) وTom40" . بيوشيم. بيوفيز. أكتا . 1818 (6): 1502-1519 . doi : 10.1016/j.bbamem.2011.11.027 . PMID 22178864 . 
  26. ^ هومبلي إف، كرامر إي، بريفوست إم (يونيو 2012). "مصنع VDAC: حقائق وتكهنات" . الكيمياء الحيوية. بيوفيس. اكتا . 1818 (6): 1486–501 . دوى : 10.1016/j.bbamem.2011.11.028 . hdl : 2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/110370 . بميد 22155681 .