إنزيم بوليميراز الحمض النووي الثالث الكامل

إنزيم بوليميراز الحمض النووي III الكامل هو المركب الإنزيمي الأساسي المسؤول عن تضاعف الحمض النووي في بدائيات النوى . اكتشفه توماس كورنبرغ (ابن آرثر كورنبرغ ) ومالكولم جيفتير عام 1970. يتميز هذا المركب بقدرة عالية على معالجة النيوكليوتيدات (أي عدد النيوكليوتيدات المضافة لكل عملية ارتباط)، وبالتحديد فيما يتعلق بتضاعف جينوم الإشريكية القولونية ، يعمل بالتنسيق مع أربعة بوليميرازات أخرى للحمض النووي ( بوليميراز I ، بوليميراز II ، بوليميراز IV ، وبوليميراز V ). وباعتباره الإنزيم الكامل الأساسي المسؤول عن عملية التضاعف، يتمتع إنزيم بوليميراز الحمض النووي III الكامل أيضًا بقدرات تصحيح الأخطاء التي تحدث أثناء التضاعف، وذلك من خلال نشاط الإكسونوكلياز الذي يقرأ من 3' إلى 5' ويُركّب من 5' إلى 3'. يُعد بوليميراز الحمض النووي III أحد مكونات الريبليسوم ، الموجود عند شوكة التضاعف.
عناصر
يتكون الريبلسوم من العناصر التالية:
- إنزيمان من إنزيمات بوليميراز الحمض النووي III ، يتكون كل منهما من وحدات فرعية α و ε و θ . (ثبت وجود نسخة ثالثة من بوليميراز الحمض النووي III في الريبليسوم. [ 1 ] )
- وحدتان β ( dnaN ) تعملان كملاقط DNA منزلقة ، وهما تحافظان على ارتباط البوليميراز بالحمض النووي.
- وحدتان τ ( dnaX ) تعملان على تكوين ثنائي من اثنين من الإنزيمات الأساسية (الوحدات الفرعية α و ε و θ).
- وحدة γ واحدة (تُعرف أيضًا باسم dnaX) تعمل كحامل مشبك لقطع أوكازاكي المتأخرة ، مما يساعد وحدتي β الفرعيتين على تكوين وحدة والارتباط بالحمض النووي. تتكون وحدة γ من 5 وحدات فرعية γ، تشمل 3 وحدات فرعية γ، ووحدة فرعية δ واحدة ( holA )، ووحدة فرعية δ' واحدة ( holB ). تشارك الوحدة الفرعية δ في نسخ الشريط المتأخر.
- يشكل كل من Χ ( holC ) و Ψ ( holD ) معقدًا بنسبة 1:1 ويرتبطان بـ γ أو τ. يمكن لـ X أيضًا أن يتوسط عملية التحول من بادئ الحمض النووي الريبي إلى الحمض النووي. [ 2 ]
نشاط
يقوم بوليميراز الحمض النووي الثالث بتخليق أزواج القواعد بمعدل حوالي 1000 نيوكليوتيد في الثانية. [ 3 ] يبدأ نشاط بوليميراز الحمض النووي الثالث بعد انفصال السلسلة عند منشأ التضاعف. ولأن تخليق الحمض النووي لا يمكن أن يبدأ من الصفر ، يتم تخليق بادئ الحمض النووي الريبي ، المكمل لجزء من الحمض النووي أحادي السلسلة، بواسطة البرايميز ( بوليميراز الحمض النووي الريبي ).
(!" للـ RNA ، و"$" للـ DNA ، و"*" للبوليميراز )
--------> * * * * ! ! ! ! _ _ _ _ _ _ _ _ | الحمض النووي الريبوزي ( RNA) | <-- هيكل الريبوز (السكر)-الفوسفات GUAU | Pol | <-- بادئ الحمض النووي الريبي * * * * |_ _ _ _| <--الرابطة الهيدروجينية CATAGCATCC <-- قالب الحمض النووي أحادي السلسلة ( ssDNA ) _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ <-- هيكل ديوكسي ريبوز (سكر)-فوسفات $ $ $ $ $ $ $ $ $ $
إضافة إلى 3'OH
مع تقدم عملية التضاعف وتحرك الريبليسوم للأمام، يصل بوليميراز الحمض النووي الثالث إلى بادئ الحمض النووي الريبي ويبدأ في تكرار الحمض النووي، مضيفًا إلى 3'OH من البادئ:
* * * * ! ! ! ! _ _ _ _ _ _ _ _ | الحمض النووي | <-- هيكل ديوكسي ريبوز (سكر)-فوسفات GUAU | Pol | <-- بادئ الحمض النووي الريبي * * * * |_III_ _| <--الرابطة الهيدروجينية CATAGCATCC <-- قالب الحمض النووي أحادي السلسلة ( ssDNA ) _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ <-- هيكل ديوكسي ريبوز (سكر)-فوسفات $ $ $ $ $ $ $ $ $ $
تخليق الحمض النووي
يقوم إنزيم بوليميراز الحمض النووي III بتخليق سلسلة متصلة أو متقطعة من الحمض النووي، وذلك بحسب ما إذا كان ذلك يحدث على السلسلة الرائدة أو المتأخرة ( قطعة أوكازاكي ) من الحمض النووي. يتميز إنزيم بوليميراز الحمض النووي III بقدرة عالية على مواصلة عملية التخليق، وبالتالي، يُخلّق الحمض النووي بسرعة كبيرة. تُعزى هذه القدرة العالية جزئيًا إلى مشابك بيتا التي تُثبّت سلاسل الحمض النووي.
-----------> * * * * ! ! ! ! $ $ $ $ $ $ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _| الحمض النووي | <-- هيكل ديوكسي ريبوز (سكر)-فوسفات GUAUCGTAGG| Pol | <-- بادئ الحمض النووي الريبي * * * * * * * * * *|_III_ _| <--الرابطة الهيدروجينية CATAGCATCC <-- قالب الحمض النووي أحادي السلسلة ( ssDNA ) _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ <-- هيكل ديوكسي ريبوز (سكر)-فوسفات $ $ $ $ $ $ $ $ $ $
إزالة البرايمر
بعد تضاعف المنطقة المطلوبة، يُزال بادئ الحمض النووي الريبوزي (RNA) بواسطة بوليميراز الحمض النووي الأول (DNA polymerase I) عبر عملية ترجمة الشق . يسمح إزالة بادئ الحمض النووي الريبوزي لإنزيم ربط الحمض النووي (DNA ligase) بربط الشق بين الحمض النووي (DNA dNA nick) في القطعة الجديدة والسلسلة السابقة. يُعد بوليميراز الحمض النووي الأول والثالث (DNA polymerase I & III)، إلى جانب العديد من الإنزيمات الأخرى، ضروريًا لدقة وكفاءة تضاعف الحمض النووي.
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ رييس-لاموث، ر.، شيرات، د.، ليك، م. (2010). "القياس الكمي وبنية آلية تضاعف الحمض النووي النشطة في الإشريكية القولونية" . مجلة ساينس . 328 (5977): 498-501 . Bibcode : 2010Sci...328..498R . doi : 10.1126/science.1185757 . PMC 2859602. PMID 20413500 .
- ↑ أولسون، إم دبليو، دالمان، إتش جي، ماكهنري، سي إس (ديسمبر 1995). "مركب DnaX لإنزيم بوليميراز الحمض النووي III الكامل من الإشريكية القولونية. يعمل مركب χψ عن طريق زيادة ألفة تاو وجاما لدلتا دلتا إلى نطاق ذي صلة فسيولوجية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 270 (49): 29570-29577 . doi : 10.1074/jbc.270.49.29570 . PMID 7494000 .
- ↑ كيلمان ز، أودونيل م (1995). "إنزيم بوليميراز الحمض النووي الثالث الكامل: بنية ووظيفة آلة تضاعف الكروموسوم". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية 64 : 171-200 . doi : 10.1146 /annurev.bi.64.070195.001131 . PMID 7574479 .
روابط خارجية
- نظرة عامة في جامعة ولاية أوريغون
- DNA+بوليميراز+III في رؤوس الموضوعات الطبية (MeSH) التابعة للمكتبة الوطنية الأمريكية للطب
- القضاء على البكتيريا الممرضة - كيفية إيقاف عمل مركب بوليميراز الحمض النووي الرئيسي
- EC 2.7.7
- تضاعف الحمض النووي
- الإنزيمات
- المركبات البروتينية
