dbSNP

📅 آخر تحديث: ٢٥ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٥ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 1 صور
الموسوعة الحرة

قاعدة بيانات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة [ 1 ] ( dbSNP ) هي أرشيف عام مجاني للتنوع الجيني داخل الأنواع المختلفة وعبرها ، تم تطويره واستضافته بواسطة المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) بالتعاون مع المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري (NHGRI).

على الرغم من أن اسم قاعدة البيانات يوحي بأنها تضم ​​مجموعة من تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) فقط، إلا أنها في الواقع تحتوي على نطاق واسع من التباين الجزيئي: تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة، وتعدد أشكال الحذف والإدخال القصيرة ( indels )، وعلامات الميكروساتلايت أو التكرارات الترادفية القصيرة (STRs)، وتعدد أشكال النوكليوتيدات المتعددة (MNPs)، والتسلسلات غير المتجانسة، والمتغيرات المسماة. [ 2 ] تقبل قاعدة بيانات dbSNP تعدد الأشكال المحايد ظاهريًا، وتعدد الأشكال المقابل للأنماط الظاهرية المعروفة، والمناطق الخالية من التباين. وقد أُنشئت في سبتمبر 1998 لتكملة GenBank ، وهي مجموعة NCBI من تسلسلات الأحماض النووية والبروتينات المتاحة للجمهور. [ 2 ]

في عام 2017، أوقف المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI) دعم جميع الكائنات غير البشرية في قاعدة بيانات dbSNP. [ 3 ] اعتبارًا من الإصدار 153 (الذي صدر في أغسطس 2019)، جمعت قاعدة بيانات dbSNP ما يقرب من ملياري إدخال تمثل أكثر من 675 مليون متغير مختلف للإنسان العاقل .

غاية

dbSNP هو مورد إلكتروني مصمم لمساعدة باحثي علم الأحياء . يهدف إلى أن يكون قاعدة بيانات موحدة تضم جميع الاختلافات الجينية المحددة، والتي يمكن استخدامها لدراسة طيف واسع من الظواهر الطبيعية ذات الأساس الجيني. على وجه التحديد، يُسهّل الوصول إلى التباين الجزيئي المُفهرس في dbSNP الأبحاث الأساسية، مثل رسم الخرائط الفيزيائية، وعلم الوراثة السكانية ، ودراسة العلاقات التطورية، بالإضافة إلى إمكانية تحديد كمية التباين في موقع محدد بسرعة وسهولة. علاوة على ذلك، يُرشد dbSNP الأبحاث التطبيقية في علم الصيدلة الجينية وارتباط التباين الجيني بالصفات الظاهرية. [ 4 ] ووفقًا لموقع المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI)، فإن "الاستثمار طويل الأجل في هذا البحث المبتكر والمثير [dbSNP] لا يُبشّر فقط بتطوير علم الأحياء البشري، بل يُبشّر أيضًا بإحداث ثورة في ممارسة الطب الحديث".

أ) تُرسل مصادر متعددة البيانات، ويُخصص لكل متغير رقم تعريف فريد (ss#). ب) يجمع dbSNP سجلات ss# المتطابقة في مجموعة مرجعية واحدة (rs#) تحتوي على بيانات من كل ss#. ج) يمكن للمستخدمين استرجاع البيانات لسجلات rs# محددة وتحليل هذه المتغيرات. د) تُسهم بيانات dbSNP في دعم البحوث السريرية والتطبيقية. معرّفات ss# وrs# في هذا الشكل هي أمثلة فقط. NCBI: المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية؛ OMIM: الوراثة المندلية عبر الإنترنت في الإنسان؛ GWAS: دراسة الارتباط على مستوى الجينوم.

استسلام

1. المصدر

في الأصل، كان dbSNP يقبل بيانات أي كائن حي من مصادر متنوعة، تشمل مختبرات الأبحاث الفردية، وجهود اكتشاف تعدد الأشكال الجينية التعاونية، ومراكز تسلسل الجينوم واسعة النطاق، وقواعد بيانات SNP الأخرى (مثل اتحاد SNP، و HapMap ، وغيرها)، والشركات الخاصة. [ 5 ] في 1 سبتمبر 2017، توقف dbSNP عن قبول بيانات المتغيرات غير البشرية، وبعد شهرين، توقفت مواقع الويب التفاعلية وخدمات NCBI ذات الصلة عن عرض هذه البيانات. الآن، يقتصر dbSNP على قبول وعرض بيانات المتغيرات البشرية فقط.

2. أنواع السجلات

يحصل كل متغير مُرسَل على رقم تعريف SNP خاص به ("ss#"). [ 5 ] يُعدّ رقم الوصول هذا مُعرّفًا ثابتًا وفريدًا لهذا الإدخال. كما تحصل سجلات SNP المُرسَلة الفريدة على رقم تعريف SNP مرجعي ("rs#"؛ "مجموعة refSNP"). مع ذلك، من المُرجّح أن يتم إرسال أكثر من سجل واحد للمتغير إلى قاعدة بيانات dbSNP، لا سيما بالنسبة للمتغيرات ذات الأهمية السريرية. ولمعالجة هذا الأمر، تقوم قاعدة بيانات dbSNP بشكل روتيني بتجميع سجلات SNP المُرسَلة المُتطابقة في سجل SNP مرجعي واحد، وهو أيضًا مُعرّف فريد وثابت (انظر أدناه). [ 4 ]

3. كيفية التقديم

لإرسال بيانات التباين إلى قاعدة بيانات dbSNP، يجب أولاً الحصول على مُعرّف المُرسِل، الذي يُحدد المختبر المسؤول عن الإرسال. [ 4 ] بعد ذلك، يُطلب من المؤلف إكمال ملف الإرسال الذي يحتوي على المعلومات والبيانات ذات الصلة. يجب أن تتضمن السجلات المُرسلة المعلومات العشر الأساسية المذكورة في الجدول التالي. [ 4 ] تشمل المعلومات الأخرى المطلوبة للإرسال معلومات الاتصال، ومعلومات النشر (العنوان، المجلة، المؤلفون، السنة)، ونوع الجزيء ( الحمض النووي الجينومي ، الحمض النووي التكميلي ، الحمض النووي للميتوكوندريا ، الحمض النووي للبلاستيدات الخضراء )، والكائن الحي. [ 4 ]

عنصرتوضيح
سياق التسلسل (مطلوب)يُعدّ تحديد موقع التباين المُراد تقديمه عنصرًا أساسيًا في عملية الإرسال إلى قاعدة بيانات dbSNP. وتشترط dbSNP حاليًا، كحد أدنى، تقديم موقع التباين كموقع مُؤكّد على تسلسلات RefSeq أو INSDC.
الأليلات (مطلوبة)تحدد الأليلات كل فئة من فئات التباين. يُعرّف dbSNP متغيرات النوكليوتيدات المفردة في نظام الإرسال الخاص به على أنها G أو A أو T أو C، ولا يسمح برموز IUPAC الغامضة، مثل N، في تعريف الأليل للتباين.
الطريقة (مطلوبة)يُعرّف كل مُقدّم بيانات الطرق المستخدمة في طلبه إما كتقنيات لتحليل التباين أو كتقنيات لتقدير ترددات الأليلات. يُصنّف dbSNP الطرق حسب فئة الطريقة لتسهيل الاستعلامات باستخدام "التقنية التجريبية العامة" كحقل استعلام. ويُقدّم مُقدّم البيانات جميع التفاصيل الأخرى للتقنيات في وصف نصي حرّ للطريقة.
أصل الأليل المؤكد (مطلوب)يمكن للمُقدِّم تقديم بيان (تأكيد) مدعوم بأدلة تجريبية تُثبت أن أحد المتغيرات له أصل أليلي مُحدد. يتم تلخيص التأكيدات الخاصة بمتغير SNP مرجعي واحد، وتُعطى قيمة سمة تُشير إلى أنه من أصل جرثومي أو غير معروف.
عدد السكان (مطلوب)يُعرّف كل مُقدّم عينات السكان إما على أنها المجموعة المستخدمة لتحديد الاختلافات في البداية، أو على أنها المجموعة المستخدمة لتحديد مقاييس ترددات الأليلات الخاصة بكل مجموعة سكانية. وقد تكون هذه المجموعات السكانية واحدة في بعض التصاميم التجريبية.
حجم العينة (اختياري)يحتوي dbSNP على حقلين لحجم العينة. يُشير الحقل الأول، SNPASSAY SAMPLE SIZE، إلى عدد الكروموسومات في العينة المستخدمة لتحديد أو اكتشاف التباين مبدئيًا. أما الحقل الثاني، SNPPOPUSE SAMPLE SIZE، فيُشير إلى عدد الكروموسومات المستخدمة كمقام في حساب تقديرات ترددات الأليلات.
ترددات الأليلات الخاصة بكل مجموعة سكانية (اختياري)تُرسل بيانات التردد إلى قاعدة بيانات dbSNP على شكل تعدادات للأليلات أو فترات تردد مُصنفة، وذلك تبعًا لدقة الطريقة التجريبية المستخدمة في القياس. تحتوي قاعدة بيانات dbSNP على سجلات ترددات الأليلات لعينات سكانية محددة، يُحددها كل مُرسل، وتُستخدم هذه السجلات في التحقق من صحة المتغيرات المُرسلة.
ترددات الأنماط الجينية الخاصة بكل مجموعة سكانية (اختياري)على غرار الأليلات، فإن الأنماط الجينية لها ترددات في المجموعات السكانية التي يمكن إرسالها إلى dbSNP، وتستخدم في التحقق من صحة الاختلافات المقدمة.
الأنماط الجينية الفرديةيقبل dbSNP الأنماط الجينية الفردية من العينات المقدمة من المتبرعين الذين وافقوا على تخزين تسلسل الحمض النووي الخاص بهم في قاعدة بيانات عامة (مثل HapMap أو مشروع 1000 جينوم).
معلومات التحقق (اختياري)تُظهر التحليلات التي تم التحقق منها مباشرة من قبل مقدم الطلب من خلال قسم التحقق نوع الأدلة المستخدمة لتأكيد الاختلاف.

يطلق

تُتاح المعلومات الجديدة التي يحصل عليها dbSNP للجمهور بشكل دوري عبر سلسلة من "التحديثات" (أي مراجعات وإصدارات البيانات). [ 4 ] لا يوجد جدول زمني محدد لإصدار التحديثات الجديدة؛ بل تُصدر التحديثات عادةً عند توفر نسخة جديدة من الجينوم، بافتراض وجود بعض الاختلافات المُفهرسة المرتبطة بهذا الجينوم. [ 6 ] يحدث هذا كل 3-4 أشهر تقريبًا. قد تتحسن تسلسلات الجينوم بمرور الوقت، لذا يُعاد ربط المتغيرات النوكليوتيدية المفردة المرجعية ("refSNP") من التحديثات السابقة، بالإضافة إلى المتغيرات النوكليوتيدية المفردة المُقدمة حديثًا، بتسلسل الجينوم المُتاح حديثًا. تُجمع المتغيرات النوكليوتيدية المفردة المُقدمة المتعددة، إذا كانت تُشير إلى الموقع نفسه، في مجموعة refSNP واحدة ويُخصص لها رقم تعريف مرجعي. مع ذلك، إذا وُجد سجلان من مجموعة refSNP يُشيران إلى الموقع نفسه (أي متطابقان)، فسيقوم dbSNP أيضًا بدمج هذين السجلين. في هذه الحالة، يُمثل مُعرّف رقم refSNP الأصغر (أي السجل الأقدم) كلا السجلين، بينما تُصبح مُعرّفات أرقام refSNP الأكبر قديمة. ولا تُستخدم هذه المُعرّفات القديمة مرة أخرى للسجلات الجديدة. عند دمج سجلين من سجلات refSNP، يتم تتبع التغيير، ويمكن استخدام مُعرّفات أرقام refSNP السابقة كاستعلام بحث. تُقلل عملية دمج السجلات المتطابقة هذه من التكرار في قاعدة بيانات dbSNP. [ 6 ]

هناك استثناءان لمعايير الدمج المذكورة أعلاه. أولاً، لا يتم دمج التباينات بين الفئات المختلفة (مثل تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة وتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة التفاضلي). ثانياً، تُصنف تعددات أشكال النوكليوتيدات المفردة المرجعية ذات الأهمية السريرية، والتي ورد ذكرها في الأدبيات العلمية، على أنها "ثمينة"؛ ولا يتم إجراء أي دمج من شأنه إزالة مثل هذه التعددات، لأنه قد يُسبب لاحقاً ارتباكاً. [ 6 ]

استرجاع

1. كيفية

يمكن البحث في قاعدة بيانات dbSNP باستخدام أداة البحث Entrez SNP. تتوفر مجموعة متنوعة من الاستعلامات للبحث، منها: معرّف رقم ss، معرّف رقم refSNP، اسم الجين، طريقة تجريبية، فئة سكانية، تفاصيل سكانية، منشور، علامة، أليل، كروموسوم، موقع قاعدة، نطاق التغاير الزيجوتي، أو رقم الإصدار. [ 6 ] [ 7 ] بالإضافة إلى ذلك، يمكن استرجاع العديد من النتائج في وقت واحد باستخدام استعلامات الدفعات. [ 6 ] تُعيد عمليات البحث معرّفات أرقام refSNP التي تطابق مصطلح الاستعلام، وملخصًا للمعلومات المتاحة لمجموعة refSNP تلك.

2. الأدوات/البيانات

تتضمن المعلومات المتاحة لمجموعة refSNP المعلومات الأساسية من كل طلب على حدة (انظر "الطلب")، بالإضافة إلى المعلومات المتاحة من دمج البيانات من عدة طلبات (مثل التغاير الزيجوتي، وتكرارات الأنماط الجينية). تتوفر العديد من الأدوات لفحص مجموعة refSNP بمزيد من التفصيل. تُظهر خريطة العرض موقع التباين في الجينوم والتباينات الأخرى القريبة. كما تُظهر أداة أخرى، وهي عرض الجين، موقع التباين داخل الجين (إن وُجد)، والرمز القديم والجديد، والأحماض الأمينية المشفرة بواسطة كليهما، وما إذا كان التغيير مرادفًا أم غير مرادف. يُظهر عارض التسلسل موقع المتغير بالنسبة للإنترونات والإكسونات والمتغيرات الأخرى القريبة والبعيدة. كما تتوفر أيضًا خاصية رسم الخرائط ثلاثية الأبعاد، والتي تُظهر صورًا ثلاثية الأبعاد للبروتين المشفر.

يرتبط dbSNP أيضًا بالعديد من موارد NCBI الأخرى بما في ذلك قواعد بيانات النيوكليوتيدات والبروتينات والجينات والتصنيف والبنية ، بالإضافة إلى PubMed و UniSTS و PMC و OMIM وUniGene.

3. حالة التحقق

تُحدد قائمة حالة التحقق فئات الأدلة التي تدعم وجود متغير جيني. وتشمل هذه الفئات ما يلي: (1) تقديمات مستقلة متعددة؛ (2) بيانات التردد أو النمط الجيني؛ (3) تأكيد المُقدِّم؛ (4) رصد جميع الأليلات في كروموسومين على الأقل؛ (5) تحديد النمط الجيني بواسطة مشروع HapMap ؛ و(6) تسلسله في مشروع الألف جينوم . [ 6 ]

مشاكل في جودة البيانات

شككت العديد من المجموعات البحثية في جودة البيانات الموجودة في قاعدة بيانات dbSNP، [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] ، حيث تشتبه في ارتفاع معدلات النتائج الإيجابية الكاذبة نتيجةً لأخطاء في تحديد النمط الجيني وقراءة القواعد. ويمكن إدخال هذه الأخطاء بسهولة في dbSNP إذا استخدم المُرسِل (1) محاذاة معلوماتية حيوية غير دقيقة لتسلسلات الحمض النووي المتشابهة جدًا ولكنها مختلفة، و/أو (2) تفاعلات البلمرة المتسلسلة (PCR) باستخدام بادئات لا تستطيع التمييز بين تسلسلات الحمض النووي المتشابهة ولكنها مختلفة. [ 8 ] ميتشل وآخرون. استعرضت دراسة (2004) [ 9 ] أربع دراسات [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] وخلصت إلى أن قاعدة بيانات dbSNP تُظهر معدل نتائج إيجابية خاطئة يتراوح بين 15 و17% بالنسبة للنيوكليوتيدات المفردة المتغيرة (SNPs)، وأن تردد الأليل الأقل شيوعًا يزيد عن 10% لحوالي 80% من النيوكليوتيدات المفردة المتغيرة التي لا تُمثل نتائج إيجابية خاطئة. وبالمثل، ذكرت دراسة موسيميسي وآخرون (2010) [ 8 ] أن ما يصل إلى 8.32% من النيوكليوتيدات المفردة المتغيرة ثنائية الأليل في قاعدة بيانات dbSNP هي نتاج تسلسلات الحمض النووي شديدة التشابه (أي الجينات المتماثلة)، ويشيرون إلى هذه المدخلات باسم اختلافات النيوكليوتيدات المفردة (SNDs). قد لا تكون معدلات الخطأ المرتفعة في قاعدة بيانات dbSNP مفاجئة: فمن بين 23.7 مليون مدخل مرجعي للنيوكليوتيدات المفردة المتغيرة (refSNP) للبشر، تم التحقق من صحة 14.5 مليون مدخل فقط، مما يترك 9.2 مليون مدخل متبقية كمرشحة للنيوكليوتيدات المفردة المتغيرة. مع ذلك، ووفقًا لموسيميسي وآخرون (2010) [ 8 ]، فإن رمز التحقق المُقدّم في سجل refSNP لا يُفيد إلا جزئيًا: إذ أن التحقق من HapMap وحده هو ما قلّل عدد SNDs (3% مقابل 8%)، لكن الاكتفاء بهذه الطريقة يُزيل أكثر من نصف SNPs الحقيقية في dbSNP. ويشير هؤلاء الباحثون أيضًا إلى أن أحد مصادر البيانات المُقدّمة من مجموعة لي يعاني من أخطاء كثيرة: 20% من هذه البيانات عبارة عن SNDs (مقابل 8% للبيانات الأخرى). ومع ذلك، وكما يُشير الباحثون، فإن تجاهل جميع هذه البيانات سيؤدي إلى إزالة العديد من SNPs الحقيقية.

قد تُعيق الأخطاء في قاعدة بيانات dbSNP دراسات ارتباط الجينات المرشحة [ 14 ] والبحوث القائمة على النمط الفرداني [ 15 ] . كما قد تزيد هذه الأخطاء من الاستنتاجات الخاطئة في دراسات الارتباط [ 8 ] ، إذ يتطلب زيادة عدد المتغيرات النوكليوتيدية المفردة (SNPs) التي يتم اختبارها عن طريق اختبار متغيرات خاطئة إجراء المزيد من اختبارات الفرضيات. مع ذلك، لا يمكن ربط هذه المتغيرات الخاطئة بالصفات، مما يؤدي إلى انخفاض مستوى الدلالة الإحصائية (ألفا) أكثر من اللازم لإجراء اختبار دقيق في حال اختبار المتغيرات الصحيحة فقط، وبالتالي يرتفع معدل النتائج السلبية الكاذبة. وقد اقترح موسيميسي وآخرون (2010) [ 8 ] أن يقوم مؤلفو دراسات الارتباط السلبية بفحص دراساتهم السابقة بحثًا عن متغيرات خاطئة (SNDs)، والتي يمكن استبعادها من التحليل.

كيفية الاستشهاد بالبيانات من قاعدة بيانات dbSNP

يمكن الإشارة إلى التسلسلات الفردية باستخدام أرقام تعريف مجموعات refSNP الخاصة بها (مثل rs206437). يجب الإشارة إلى قاعدة بيانات dbSNP باستخدام ورقة شيري وآخرون لعام 2001 : شيري، إس تي، وارد، إم إتش، خولودوف، إم، بيكر، جيه، فان، إل، سميغيلسكي، إي إم، سيروتكين، كيه. (2001). dbSNP: قاعدة بيانات NCBI للتنوع الجيني. أبحاث الأحماض النووية، 29: 308-311. [ 5 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ ويلر دي إل، باريت تي، بنسون دي إيه، وآخرون (يناير 2007). "موارد قواعد بيانات المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 35 (عدد قواعد البيانات): D5–12. doi : 10.1093/nar/gkl1031 . PMC 1781113. PMID 17170002 .   
  2. شيري ، إس. تي.، وورد، إم.؛ سيروتكين، ك. (1999). "dbSNP - قاعدة بيانات لتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة وأنواع أخرى من التباين الجيني الطفيف" . أبحاث الجينوم . 9 (8): 677-679 . doi : 10.1101/gr.9.8.677 . PMID 10447503. S2CID 10775908 .  
  3. ↑ "التخلص التدريجي من دعم بيانات الكائنات الحية غير البشرية في dbSNP وdbVar" . 2017-05-09 . تم الاطلاع عليه في 9 يوليو 2017 .
  4. 1 2 3 4 5 6 Kitts A; Sherry S (2009). "قاعدة بيانات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (dbSNP) لتغير تسلسل النوكليوتيدات" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (الولايات المتحدة).{{cite journal}}يتطلب الاستشهاد بالمجلة ( مساعدة )|journal=
  5. شيري إس تي، وارد إم إتش، خولودوف إم، بيكر جيه، فان إل، سميغيلسكي إي إم، سيروتكين كيه، وآخرون ( 2001). "dbSNP: قاعدة بيانات NCBI للتنوع الجيني" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 29 ( 1 ): 308-311 . doi : 10.1093 / nar / 29.1.308 . PMC 29783. PMID 11125122 .   
  6. 1 2 3 4 5 6 المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI) (2010). "قاعدة بيانات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (dbSNP): الأسئلة الشائعة" . المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (الولايات المتحدة).{{cite journal}}يتطلب الاستشهاد بالمجلة ( مساعدة )|journal=
  7. ↑ فيليبس، سي (2007). "الموارد الإلكترونية لتحليل تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة: مراجعة وخارطة طريق". التكنولوجيا الحيوية الجزيئية . 35 (1): 65-97 . doi : 10.1385/MB:35:1:65 . PMID 17401150. S2CID 8569553 .  
  8. 1 2 3 4 5 6 موسيميسي إل، آرثر جيه دبليو، تشيونغ إف إس، هوك إس، ليبمان إس، رايشاردت جيه كيه، وآخرون . (يناير 2010). "قد تؤدي الاختلافات في النوكليوتيدات المفردة (SNDs) في قاعدة بيانات dbSNP إلى أخطاء في دراسات التنميط الجيني والتنميط الفرداني" . الطفرات البشرية . 31 (1): 67-73 . doi : 10.1002/humu.21137 . PMC 2797835. PMID 19877174 .   
  9. 1 2 ميتشل، أ.أ.، زويك، م.إ.، تشاكرافارتي، أ.، كاتلر، د.ج.، وآخرون (2004). "الاختلافات في معدلات تأكيد dbSNP وتوزيعات تردد الأليلات الناتجة عن اختلاف معدلات وأنماط أخطاء التنميط الجيني" . المعلوماتية الحيوية . 20 (7): 1022-1032 . doi : 10.1093/bioinformatics/bth034 . PMID 14764571 .  
  10. 1 2 كارلسون سي إس، إيبرلي إم إيه، ريدر إم جيه، سميث جيه دي، كروغلياك إل، نيكرسون دي إيه، وآخرون (2003). "يُعدّ استخدام متغيرات النوكليوتيدات المفردة الإضافية وتحليلات عدم التوازن الارتباطي ضروريًا لدراسات الارتباط على مستوى الجينوم الكامل لدى البشر" . مجلة علم الوراثة الطبيعية . 33 (4): 518-521 . doi : 10.1038/ng1128 . PMID 12652300. S2CID 11640599 .   
  11. 1 2 كتلر دي جيه، زويك إم إي، كاراسكيلو إم إم، يوهن سي تي، توبين كيه بي، كاشوك سي، ماثيوز دي جيه، شاه إن إيه، إلشلر إي إي، وارينغتون جيه إيه، تشاكرافارتي إيه، وآخرون . (2001). "الكشف عن التباين عالي الإنتاجية والتنميط الجيني باستخدام المصفوفات الدقيقة" . أبحاث الجينوم . 11 (11): 1913-1925 . doi : 10.1101/gr.197201 . PMC 311146. PMID 11691856 .   
  12. 1 2 غابرييل إس بي؛ شافنر إس إف؛ نغوين إتش؛ مور جيه إم؛ روي جيه؛ بلومنشتيل بي؛ هيغينز جيه؛ ديفيليس إم؛ لوخنر إيه؛ فاغارت إم؛ ليو-كورديرو إس إن؛ روتيمي سي؛ أديمو إيه؛ كوبر آر؛ وارد آر؛ لاندر إي إس؛ دالي إم جيه؛ ألتشولر دي؛ وآخرون . (2003). "بنية كتل النمط الفرداني في الجينوم البشري" . مجلة ساينس . 296 (5576): 2225-2229 . رمز Bibcode : 2002Sci...296.2225G . doi : 10.1126/science.1069424 . PMID 12029063. S2CID 10069634 .   
  13. 1 2 رايش دي إي، غابرييل إس بي، ألتشولر دي، وآخرون (2003). "جودة واكتمال قواعد بيانات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة" . علم الوراثة الطبيعية . 33 (4): 457-458 . doi : 10.1038/ng1133 . PMID 12652301. S2CID 6303430 .   
  14. ↑ دفورنيك، ف.، لونغ، ج. ر.، شيونغ، د. هـ.، ليو، ب. ي.، تشاو، ل. ج.، شين، هـ.، تشانغ، ي. ي.، ليو، ي. ج.، روشا-سانشر، س.، شياو، ب.، ريكر، ر. ر.، دينغ، هـ. و.، وآخرون . (2004). " القيود الحالية لبيانات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP) المتاحة للعموم في دراسات الاضطرابات المعقدة: اختبار لعشرة جينات مرشحة للسمنة وهشاشة العظام" . مجلة BMC Genetics . 5 : 4. doi : 10.1186/1471-2156-5-4 . PMC 395827. PMID 15113403 .   
  15. ↑ دي باكر، بي. آي.؛ يلينسكي، ر.؛ بير، آي.؛ غابرييل، إس. بي.؛ دالي، إم. جيه.؛ ألتشولر، د.؛ وآخرون . (2005). "الكفاءة والقوة في دراسات الارتباط الجيني". مجلة نيتشر جينيتكس . 37 (11): 1217-1223 . doi : 10.1038/ng1669 . PMID 16244653. S2CID 15464860 .