القطار التالي
Nextstrain هو مشروع تعاوني بين باحثين في سياتل ، الولايات المتحدة [ 1 ] وبازل ، سويسرا [ 2 ] ، وهو يوفر مجموعة من الأدوات مفتوحة المصدر لتصور الجينات الكامنة وراء انتشار تفشي الفيروسات . [ 3 ]
يهدف مشروع Nextstrain إلى دعم تدابير الصحة العامة والمراقبة من خلال تسهيل فهم انتشار وتطور مسببات الأمراض . وقد بدأ العمل على منصة Nextstrain في عام 2015. [ 2 ] ويُتاح الكود البرمجي الذي طورته Nextstrain للعموم، عبر مواقع مثل GitHub.com ، كما تتوفر بياناتها ويمكن الاطلاع عليها بصيغة يسهل الوصول إليها عبر صفحات الموقع الإلكتروني. [ 4 ]
التطبيقات
وفقًا لموقعهم الإلكتروني، يحتفظ فريق Nextstrain بتحليل جينومي محدّث لمسببات الأمراض التالية: [ 5 ]
- إنفلونزا الطيور
- HPAI (أمريكا الشمالية)
- حمى الضنك
- الإيبولا (على الصعيد العالمي وفي جمهورية الكونغو الديمقراطية، 2013-2016 )
- فيروس معوي D68
- فيروس العوز المناعي البشري
- فيروس ميتابنوموفيروس البشري
- حمى لاسا
- الحصبة
- فيروس جدري القرود (جمهورية الكونغو الديمقراطية)
- النكاف
- فيروس داء الكلب
- الفيروس المخلوي التنفسي
- فيروس الحصبة الألمانية
- فيروس سارس-كوف-2 (أيضًا: توقعات نسبة السلالة/الفرع )
- الإنفلونزا الموسمية
- مرض الدرن
- فيروس غرب النيل (الأمريكتان)
- حمى صفراء
- يرسينيا الطاعونية
- فيروس زيكا
تستند القائمة أعلاه إلى قائمة "التحليلات المميزة" في الصفحة الرئيسية. يمكنكم الاطلاع على قائمة كاملة بالتحليلات التي يُجريها فريق Nextstrain في قسم "مسببات الأمراض الأساسية". كما يمكنكم العثور على تحليلات إضافية في قسمي "المجموعات" و"المجتمع".
جائحة كوفيد-19
تم الاستشهاد بـ Nextstrain ونتائجها على نطاق واسع خلال جائحة كوفيد-19 . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
الجوائز
في مارس 2017، فازت شركة Nextstrain بجائزة العلوم المفتوحة الافتتاحية ، وهي مبادرة من المعاهد الوطنية للصحة، بالتعاون مع مؤسسة ويلكوم ترست ومعهد هوارد هيوز الطبي (HHMI). [ 10 ]
في مايو 2020، حصل نيكسترين وتريفور بيدفورد (أستاذ مشارك، مركز فريد هاتشينسون لأبحاث السرطان ) [ 11 ] على جائزة ويبي للإنجاز الخاص عن أداة الويب. [ 12 ]
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ ريتشاردز، سارة إليزابيث (26 مارس 2020). "كيف يمكن لطفرات فيروس كورونا تتبع انتشاره - ودحض نظريات المؤامرة" . www.nationalgeographic.com . مؤرشف من الأصل في 24 ديسمبر 2020. تم الاطلاع عليه في 25 ديسمبر 2020 .
- 1 2 "انتشار سلالة جديدة من فيروس سارس-كوف-2 في جميع أنحاء أوروبا صيف 2020" . www.unibas.ch . 29 أكتوبر 2020. مؤرشف من الأصل في 16 ديسمبر 2020. تم الاطلاع عليه في 25 ديسمبر 2020 .
- ↑ رضا، نوشين (6 أبريل 2020). "السلالة التالية: الحمض النووي الريبي، والحمض النووي، وكوفيد-19 " . earlycareervoice.professional.heart.org . مؤرشف من الأصل في 25 يناير 2021. تم الاطلاع عليه في 25 ديسمبر 2020 .
- ↑ هادفيلد، جيمس؛ ميجيل، كولين؛ بيل، سيدني؛ هودلستون، جون؛ بوتر، بارني؛ كاليندر، تشارلتون؛ وآخرون . (22 مايو 2018). كيلسو، جانيت (محررة). "السلالة التالية: تتبع تطور مسببات الأمراض في الوقت الحقيقي" . المعلوماتية الحيوية . 34 (23): 4121-4123 . doi : 10.1093/bioinformatics/bty407 . ISSN 1367-4803 . PMC 6247931. PMID 29790939 .
- ↑ "Nextstrain: تتبع تطور مسببات الأمراض في الوقت الفعلي، قسم 'استكشاف مسببات الأمراض'" . nextstrain.org . مؤرشف من الأصل بتاريخ 26 ديسمبر 2020. تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 ديسمبر 2020 .
- ↑ دريك، جون (19 ديسمبر 2020). "العلم وراء إغلاق لندن خلال فترة عيد الميلاد بسبب فيروس كورونا" . www.forbes.com . مؤرشف من الأصل في 22 ديسمبر 2020. تم الاطلاع عليه في 25 ديسمبر 2020 .
- ↑ هودكروفت إي بي، زوبر إم، نادو إس، فوغان تي جي، كروفورد كيه إتش، ألتهاوس سي إل، رايشموث إم إل، بوين جيه إي، وولس إيه سي، كورتي دي، بلوم جيه دي، فيسلر دي، ماتيو دي، هيرناندو إيه، كوماز آي، غونزاليس-كانديلاس إف (يوليو 2021). "انتشار متحور من فيروس سارس-كوف-2 في أوروبا صيف 2020". مجلة نيتشر . 595 (7869): 707-712 . doi : 10.1038/s41586-021-03677-y . hdl : 10612/22151 . PMID 34098568 .
- ↑ "فرقة العمل العلمية الوطنية السويسرية المعنية بفيروس كوفيد-19" . sciencetaskforce.ch . تم الاطلاع عليه بتاريخ 21 ديسمبر 2021 .
- ↑ "السلالة التالية، التسلسل، وجائحة فيروس كورونا المستجد (SARS-CoV-2)" (ملف PDF) . www.medartbasel.ch . 2020. تم الاطلاع عليه بتاريخ 21 ديسمبر 2021 .
- ↑ «أداة تتبع الفيروسات عبر الإنترنت Nextstrain تفوز بجائزة العلوم المفتوحة الافتتاحية | المعهد الوطني للعلوم الطبية العامة» . nigms.nih.gov . تم الاطلاع عليه بتاريخ 19 ديسمبر 2025 .
- ↑ "أربعون شخصية بارزة في مجال الرعاية الصحية تحت سن الأربعين" . fortune.com . مؤرشف من الأصل بتاريخ 20 أكتوبر 2020. تم الاطلاع عليه بتاريخ 29 ديسمبر 2020 .
- ↑ "جائزة ويبي للإنجاز الخاص" . winners.webbyawards.com . مؤرشف من الأصل بتاريخ 10 أكتوبر 2021. تم الاطلاع عليه بتاريخ 29 ديسمبر 2020 .
روابط خارجية
- قواعد بيانات الجينوم
- المنظمات الطبية والصحية الدولية
