TMEM69
TMEM69 ، المعروف أيضًا باسم البروتين الغشائي 69 ، هو بروتين يُشفَّر في البشر بواسطة جين TMEM69 . [ 5 ] ومن السمات البارزة لهذا البروتين وجود خمسة أجزاء غشائية. [ 6 ]
معلومات أساسية
| أرقام الوصول | موقع | المعرفات | MW | باي |
|---|---|---|---|---|
| mRNA: NM_016486.3 البروتين: NP_057570.2 [ 5 ] | 1p34.1 | HSPC229، C1orf154، FLJ21029، LOC51249 | 27.6 كيلو دالتون | 10.3 |
جين
يقع جين TMEM69 على الكروموسوم 1p34.1، ويغطي مسافة 7.24 كيلوبايت. [ 7 ] وهو موجود على السلسلة الموجبة في التسلسل الجينومي من 46152886 إلى 46160121، ويُشفّر نسخة mRNA أولية تحتوي على 3 إكسونات ويبلغ طولها 6262 زوجًا قاعديًا. ويُتوقع أن تُشفّر ثلاث نسخ بديلة جين TMEM69. [ 8 ]
حي جين
| اسم الجين | موقع | توجيه | وظيفة | |
|---|---|---|---|---|
| GPBP1L1 (بروتين ربط المحفز الغني بـ GC-1-شبيه 1) | 1p34.1 | ناقص | وظائف في تنظيم النسخ [ 9 ] | |
| CCDC17 (نطاق ملفوف يحتوي على 17) | 1p34.1 | ناقص | لم يتم العثور على معلومات وظيفية | |
| MAST2 (كيناز سيرين/ثريونين المرتبط بالأنابيب الدقيقة 2) | 1p34.1 | زائد | وظائف في بروتين متعدد معقد في نضج الحيوانات المنوية. ينظم تخليق IL-12 المحفز بواسطة الليبوبوليسكاريد في البلاعم [ 10 ] || | |
| IPP (الببتيد المُحفز بواسطة جسيم داخل الصهريج) | 1 ص34-ص32 | ناقص | يتفاعل مع الأكتين [ 11 ] | |
وظيفة
لم يُفهم بعدُ الدور الدقيق لبروتين TMEM69 من قِبَل المجتمع العلمي. ومع ذلك، يُعتقد أنه يلعب دورًا كبروتين داعم في مُركَّب مُستقبلات البروتين المقترن ببروتين G في الضفدع الاستوائي Xenopus tropicalis . وقد ثَبُتَ أنه يُشكِّل عنقودًا مع جين xtGPR54-2 IPP، وبروتين GPBP1 في السقالة 41. [ 12 ] يُعدُّ هذا المُركَّب جزءًا من مُستقبل بروتين مقترن ببروتين G، والذي يعمل كمُستقبل لربيطة الربط، الكيسبيبتين، في الغشاء البلازمي لخلايا الدماغ. [ 12 ]
بروتين
يبلغ طول TMEM69 247 حمضًا أمينيًا . ويحتوي على خمسة أجزاء عابرة للغشاء بالإضافة إلى نطاق ذي وظيفة غير معروفة، DUF3429، والذي يمتد من الأحماض الأمينية 91 إلى 232. [ 13 ]

الميزات المتوقعة
خصائص TMEM69 التي تم التنبؤ بها باستخدام أدوات المعلوماتية الحيوية :
- الوزن الجزيئي: 27.6 كيلو دالتون. [ 7 ]
- نقطة التعادل الكهربائي: 10.3 [ 14 ]
- التعديل ما بعد الترجمة : يتوقع برنامج NetPhos على ExPASy وجود مواقع فسفرة متعددة . توقع NetPhos وجود 7 مواقع فسفرة للحمض الأميني سيرين في المواضع 12، 27، 33، 85، 93، 183، و234؛ وموقع واحد للثريونين في الموضع 26؛ وموقعين للتيروسين في الموضعين 57 و159. [ 15 ] توقع برنامج NetGlyc على ExPASy وجود 5 مواقع غلكزة في المواضع 7، 60، 73، 156، و239.
- الأجزاء العابرة للغشاء: يحتوي TMEM69 على 5 مناطق عابرة للغشاء تقع في المواضع 97-117، 122-142، 159-179، 185-205، و216-236. [ 16 ]
تعبير
يُعبَّر عن بروتين TMEM69 بشكل واسع النطاق بمستويات منخفضة في جميع أنحاء جسم الإنسان، على الرغم من أن بيانات تحليل التعبير الجيني (EST Profile) تُظهر أن تعبيره مرتفع بشكل خاص في الأنسجة العصبية الصماء مثل الكبد واللوزة الدماغية والحصين والوطاء . [ 17 ] وقد وُجد أن تعبير TMEM69 أقل من المعدل الطبيعي لدى المرضى الذين يعانون من تصلب الشرايين . [ 18 ]
التشابه
المتماثلات
يُعدّ جين TMEM69 محفوظًا بشكل كبير في العديد من الكائنات الحية. ورغم أنه يُظهر أعلى درجات الحفظ بين نظائره في الثدييات، إلى جانب الحبليات الأخرى مثل الأسماك والطيور والبرمائيات، إلا أن هناك بعض الحفظ في النباتات والحشرات والفطريات والبكتيريا. [ 13 ]
| الجنس/النوع | الاسم الشائع للكائن الحي | رقم الوصول | تطابق التسلسل | الطول (AAs) | |
|---|---|---|---|---|---|
| مكاكا فاسيكولاريس | قرد المكاك آكل السرطان | EHH61428.1 | 89% | 246 | |
| Callithrix jacchus | قرد | XP_002750811.1 | 83% | 249 | |
| Mus musculus | فأر المنزل | AAI06179.1 | 69% | 245 | |
| زينوبوس تروبيكاليس | ضفدع | NP_001016103.1 | 49% | 253 | |
| Rattus norvegicus | فأر | EDL90276.1 | 70% | 247 | |
| Oryctolagus cuniculus | أرنب | XP_002715715 | 74% | 250 | |
| أنوليس كارولينينسيس | سحلية | XP_003220264.1 | 50% | 257 | |
| سمكة الزيبرا (Danio rerio) | سمكة الزيبرا | XP_685684.1 | 49% | 249 | |
| سمك السلمون الأطلسي | سمك السلمون | NP_001134056.1 | 50% | 259 | |
| دافيا بوليكس | برغوث الماء | EFX84634.1 | 35% | 208 | |
| Ostreococcus tauri | الطحالب الخضراء | XP_003081614.1 | 34% | 166 | |
| الزائفة البوتيدية W619 | بكتيريا التربة | YP_001748891.1 | 32% | 152 | |
| شيزوفيلوم كوميون | الفطريات | XP_003035659.1 | 27% | 363 | |
الموازاة
لم يتم العثور على أي جينات مماثلة لـ TMEM69.
حفظ
يُعدّ بروتين TMEM69 محفوظًا جيدًا في مجموعة متنوعة من الكائنات الحية. على الرغم من وجود معظم نظائره في الثدييات المشيمية، إلا أن بعضها موجود في البكتيريا والفطريات. أبعد نظير وُجد أنه يُظهر تشابهًا تسلسليًا مع TMEM69 هو Pseudomonas putida W619 ، وهو نوع من بكتيريا التربة. [ 19 ] ويُعدّ الجزء الثاني من الجزء العابر للغشاء في TMEM69 محفوظًا بشكل خاص حتى في أبعد النظائر، بما في ذلك Pseudomonas putida W619 . في النظائر الدقيقة، تُحفظ جميع المجالات الخمسة العابرة للغشاء. [ 20 ] تُعدّ المجالات المحفوظة الموجودة ضمن TMEM69 جزءًا من DUF3429، وهي عائلة من البروتينات غير المُصنّفة الموجودة في البكتيريا وحقيقيات النوى. [ 13 ]
مراجع
- 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000159596 – Ensembl ، مايو 2017
- 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000055900 – Ensembl ، مايو 2017
- ↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- ↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
- 1 2 "Entrez Gene: TMEM69 Transmembrane Protein 69" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 22 أبريل 2012 .
- ↑ "Expasy: SOSUI" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 15 مايو 2012. تم الاطلاع عليه بتاريخ 15 أبريل 2012 .
- 1 2 "TMEM69" . تم الاسترجاع في 2 فبراير 2012 .
- ↑ "متغيرات النسخ™EM69" . مؤرشف من الأصل في 3 مارس 2012. تم الاطلاع عليه في 13 فبراير 2012 .
- ↑ "NCBI:Gene" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 13 أبريل 2012 .
- ↑ "NCBI:Gene" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 13 أبريل 2012 .
- ↑ "NCBI:Gene" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 13 أبريل 2012 .
- 1 2 "التطور الجزيئي لأشكال متعددة من الكيسبيبتينات ومستقبلات GPR54 في الفقاريات" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 22 أبريل 2012 .
{{cite web}}: CS1 maint: deprecated archiveal service ( link ) - 1 2 3 "BLAST" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 16 فبراير 2012 .
- ↑ "Computer pI/Mw" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 28 مارس 2010. تم الاطلاع عليه بتاريخ 11 أبريل 2012 .
- ↑ "NetPhos" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 13 أبريل 2012 .
- ↑ "UniProtKB" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 22 فبراير 2012 .
- ↑ "بطاقات الجينات" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 18 أبريل 2012 .
- ↑ "GEOProfiles" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 22 فبراير 2012 .
- ↑ "متصفح جينوم Ensembl: TMEM69" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 22 أبريل 2012 .
- ↑ "Biology Workbench: CLUSTALW" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 22 أبريل 2012 .
تتضمن هذه المقالة نصًا من المكتبة الوطنية الأمريكية للطب ، وهو متاح للعموم .
- الجينات الموجودة على الكروموسوم البشري 1
