عامل ديبي-والر
يُستخدم عامل ديباي-والر (DWF)، نسبةً إلى بيتر ديباي وإيفار والر، في فيزياء المادة المكثفة لوصف توهين تشتت الأشعة السينية أو تشتت النيوترونات المتماسك الناتج عن الحركة الحرارية. [ 1 ] [ 2 ] ويُعرف أيضًا باسم عامل درجة الحرارة . غالبًا ما يُستخدم مصطلح "عامل ديباي-والر" كمصطلح عام يشمل عامل لامب-موسباور لتشتت النيوترونات غير المتماسك وطيف موسباور .
تعتمد دالة الموجة المشتتة (DWF) على متجه التشتت q . بالنسبة لقيمة معينة لـ q ، فإن DWF( q )يعطي نسبة التشتت المرن ؛ 1 – DWF( q )يُعطي هذا بدوره نسبة التشتت غير المرن (مع العلم أن هذا التفسير الاحتمالي ليس صحيحًا بشكل عام [ 3 ] ). في دراسات حيود الأشعة السينية ، يكون التشتت المرن فقط هو المفيد؛ ففي البلورات، يُنتج قمم انعكاس براغ واضحة . أما أحداث التشتت غير المرن فهي غير مرغوب فيها لأنها تُسبب خلفية منتشرة - إلا إذا تم تحليل طاقات الجسيمات المتشتتة، وفي هذه الحالة تحمل معلومات قيّمة (على سبيل المثال في تشتت النيوترونات غير المرن أو مطيافية فقدان طاقة الإلكترون ).
يُعطى التعبير الأساسي لـ DWF بالصيغة التالية
حيث u هي إزاحة مركز التشتت، ويشير إلى المتوسط الحراري أو المتوسط الزمني.
بافتراض التناسق في مراكز التشتت في المادة قيد الدراسة، فإن توزيع بولتزمان يعني أنيتوزع توزيعًا طبيعيًا بمتوسط صفر. عندئذٍ، باستخدام صيغة الدالة المميزة المقابلة ، على سبيل المثال، تأخذ دالة التوزيع التراكمي الشكل التالي:
لاحظ أنه على الرغم من أن المنطق المذكور أعلاه كلاسيكي، إلا أن الأمر نفسه ينطبق في ميكانيكا الكم.
وبافتراض تماثل الجهد التوافقي أيضًا ، يمكن كتابة
حيث يمثل q و u مقدار (أو القيم المطلقة) المتجهين q و u على التوالي، وهو متوسط مربع الإزاحة . في المنشورات البلورية، قيمغالباً ما يتم تقديمها حيثلاحظ أنه إذا كانت الموجة الساقطة لها طول موجيويتشتت بشكل مرن بزاوية، ثم
في سياق بنى البروتينات ، يُستخدم مصطلح عامل B. ويُعرَّف عامل B على النحو التالي:
يُقاس بوحدة أنغستروم مربع ( Ų) . يمكن اعتبار معاملات B مؤشرًا على الحركة الاهتزازية النسبية لأجزاء مختلفة من البنية. تنتمي الذرات ذات معاملات B المنخفضة إلى جزء من البنية يتميز بترتيب جيد، بينما تنتمي الذرات ذات معاملات B المرتفعة عمومًا إلى جزء من البنية يتميز بمرونة عالية. يحتوي كل سجل ATOM ( بصيغة ملف PDB ) لبنية بلورية مُودعة في بنك بيانات البروتين على معامل B لتلك الذرة.
الاشتقاق
مقدمة
تُعدّ تجارب التشتت طريقة شائعة لدراسة البلورات . تتضمن هذه التجارب عادةً استخدام مسبار (مثل الأشعة السينية أو النيوترونات ) وبلورة صلبة. قد يتفاعل مسبار مُحدد الخصائص، أثناء انتشاره نحو البلورة، مع البلورة ويتشتت بطريقة معينة. تسمح المعادلات الرياضية التي تربط نمط التشتت بخصائص المسبار وخصائص جهاز التجربة وخصائص البلورة، باستخلاص السمات المطلوبة للعينة البلورية.
يستند الاشتقاق التالي إلى الفصل الرابع عشر من كتاب سيمون " أساسيات الحالة الصلبة في أكسفورد " [ 5 ] ، وإلى تقرير "تسمية معلمات الإزاحة الذرية" لتروبلود وآخرون [ 6 ] (متوفر ضمن الروابط الخارجية ). يُنصح بالرجوع إلى هذه المصادر لمزيد من التفصيل. يمكن الاطلاع على معلومات أساسية حول ميكانيكا الكم ذات الصلة في كتاب ساكوراي ونابليتانو " ميكانيكا الكم الحديثة" [ 7 ] .
تتكون تجارب التشتت غالبًا من جسيم ذي زخم بلوري ابتدائيسقوط جسيم على جسم صلب. يمر الجسيم عبر جهد كهربائي موزع في الفضاء.ويخرج بزخم بلورييتم وصف هذا الوضع بواسطة قاعدة فيرمي الذهبية ، التي تعطي احتمالية الانتقال لكل وحدة زمنية.، إلى حالة الطاقة الذاتيةمن حالة الطاقة الذاتية بسبب الاضطراب الضعيف الناجم عن جهدنا.
- (1)
بإدخال مجموعة كاملة من حالات الموضع، ثم استخدام تعبير الموجة المستوية الذي يربط الموضع والزخم، نجد أن عنصر المصفوفة هو ببساطة تحويل فورييه للجهد.
- (2)
أعلاه، يُشار إلى طول العينة بـنفترض الآن أن المادة الصلبة لدينا عبارة عن بلورة دورية، حيث يتم تمييز كل خلية وحدة بواسطة متجه موضع الشبكة.يتم تحديد الموضع داخل خلية الوحدة بواسطة متجه بحيث يمكن التعبير عن الموضع الكلي في البلورة على النحو التاليبسبب ثبات الخلايا الوحدوية لدينا عند الانتقال، فإن التوزيع المحتمل لكل خلية يكون متطابقًا..
- (3)
معادلة لاوي
وفقًا لصيغة مجموع بواسون :
- (4)
هو متجه الشبكة المقلوبة للجهد الدوري ويمثل حجم الخلية الأولية . وبمقارنة (3) و(4)، نجد أنه يجب استيفاء معادلة لاوي لحدوث التشتت:
- (5)
(5) هو بيانٌ لقانون حفظ زخم البلورة. تتعرض الجسيمات المتناثرة في البلورة لتغير في متجه الموجة يساوي متجه الشبكة المقلوبة للبلورة. وعندما يحدث ذلك، يكون تأثيرها على عنصر المصفوفة ثابتًا محدودًا. وهكذا، نجد رابطًا هامًا بين الجسيمات المتناثرة والبلورة المشتتة. شرط لاوي، الذي ينص على وجوب حفظ زخم البلورة، يُكافئ شرط براغ .وهذا يتطلب تداخلاً بناءً للجسيمات المتناثرة. والآن بعد أن رأينا كيف يحدد العامل الأول في المعادلة (3) ما إذا كانت الجسيمات الساقطة ستتناثر أم لا، نتناول كيف يؤثر العامل الثاني على التناثر.
عامل البنية
الحد الثاني على الجانب الأيمن من (3) هو عامل البنية .
- (6)
بالنسبة لمتجه الشبكة المقلوبة المعطى (المقابل لمجموعة من مستويات الشبكة المصنفة بمؤشرات ميلر))، تتناسب شدة الجسيمات المتناثرة مع مربع عامل البنية.
- (7)
تتضمن الفقرة (6) جوانب مفصلة من بنية البلورة تستحق التمييز والمناقشة.
عامل ديبي-والر
إنّ دراسة عامل البنية (وافتراضنا بشأن الثبات الانتقالي) أمرٌ معقدٌ نظرًا لاحتمالية إزاحة الذرات في البلورة عن مواقعها الشبكية. وباعتبار جهد التشتت متناسبًا مع كثافة المادة المشتتة، نعيد كتابة عامل البنية.
- (8)
من المفهوم أن التكامل من هنا فصاعدًا يتم على الخلية الأساسية.تمثل كثافة المادة المشتتة. تشير الأقواس إلى المتوسط الزمني لكل خلية وحدة، متبوعًا بالمتوسط المكاني على جميع خلايا الوحدة. نفترض أيضًا أن كل ذرة تُزاح بشكل مستقل عن الذرات الأخرى.
- (9)
عدد الذرات في وحدة الخلية هووعامل شغل الذرةيكون.يمثل هذا النقطة في الخلية الأولية التي نرغب في معرفة كثافة المادة المشتتة لها.هي كثافة المادة المتناثرة من الذرةفي موضع منفصل عن الموضع النوويبواسطة متجه.هي دالة كثافة الاحتمال للإزاحة.هو موقع الشبكة المرجعي الذي تنطلق منه الذرةقد يتم نقله إلى منصب جديد. لو متناظر بدرجة كافية (مثلاً متناظر كروياً)،هو ببساطة متوسط موضع النواة. عند دراسة تشتت الأشعة السينية، تتكون كثافة المادة المتشتتة من كثافة الإلكترونات حول النواة. أما بالنسبة لتشتت النيوترونات، فلدينا- الدوال الموزونة بطول التشتتبالنسبة للنواة المعنية (انظر جهد فيرمي الزائف ). تجدر الإشارة إلى أننا افترضنا في المناقشة السابقة أن الذرات غير قابلة للتشوه. وبناءً على ذلك، يمكن تعويض المعادلة (9) في المعادلة (8) لحساب عامل البنية.
- ؛(10)
نرى الآن أن عامل البنية الكلي يمكن تمثيله كمجموع مرجح لعوامل البنيةلكل ذرة. اجعل الإزاحة بين الموقع في الفضاء الذي نرغب في معرفة كثافة التشتت له وموقع النواة المرجعي مساوية لمتغير جديدكرر نفس الشيء بالنسبة للإزاحة بين الموضع النووي المزاح والموضع النووي المرجعي. استبدل في (10).
- (11)
داخل الأقواس المربعة في (11)، نقوم بدمج كثافة المادة المتناثرة للذرةباستخدام دالة كثافة الاحتمال لبعض الإزاحات النووية. ثم، داخل الأقواس المعقوفة، نقوم بتحويل فورييه للالتفاف الناتج. الخطوة الأخيرة هي الضرب في طور يعتمد على الموضع المرجعي (مثل المتوسط) للذرةلكن، وفقًا لنظرية الالتفاف ، فإن تحويل فورييه للالتفاف يُعادل ضرب دالتي فورييه المُحوّلتين. نُساوي الإزاحة بين الموقع في الفضاء الذي نرغب في معرفة كثافة التشتت له وموقع النواة بمتغير جديد..
- (12)
استبدل (12) في (10).
- (13)
إنه:
- ؛،(14)
هو عامل الشكل الذري للذرة; فهو يحدد كيف يؤثر توزيع المادة المشتتة حول الموضع النووي على التشتت.هو عامل ديباي-والر الذري؛ وهو يحدد كيفية تأثير ميل النواة للإزاحة عن موضعها المرجعي في الشبكة على التشتت. ويُعطى التعبير لـيختلف افتتاح المقال بسبب قرار استخدام المتوسط الشبكي أو المتوسط الزمني.
معامل الإزاحة غير المتناحي، U
يُعدّ التقريب التوافقي أحد التبسيطات الشائعة للمعادلة (14)، حيث يتم نمذجة دالة كثافة الاحتمال على أنها دالة غاوسية . وبموجب هذا التقريب، يتم تجاهل الاضطراب الإزاحي الساكن، ويُفترض أن الإزاحات الذرية تتحدد كليًا بالحركة (وقد تم النظر في نماذج بديلة لا يكون فيها التقريب الغاوسي صالحًا في مكان آخر [ 8 ] ).
- ؛؛(15)
لقد أسقطنا الفهرس الذري.ينتمي إلى الشبكة المباشرة بينماسينتمي إلى الشبكة المقلوبة. باختيار الأساس اللابعدي المناسبنضمن ذلكسيكون لها وحدات طول وتصف الإزاحة. الموتريمثل (15) معامل الإزاحة غير المتناحي. وله بُعد (طول).وهو مرتبط بمتوسط مربعات الإزاحة. بالنسبة لمتوسط مربع الإزاحة على طول متجه الوحدةببساطة خذتستخدم المخططات ذات الصلة المعلماتأو ب بدلاً من(انظر إلى Trueblood et al. [ 6 ] لمناقشة أكثر تفصيلاً). وأخيرًا، يمكننا إيجاد العلاقة بين عامل ديباي-والر ومعامل الإزاحة غير المتناحي.
- (16)
من المعادلتين (7) و(14)، عامل ديباي-والريساهم في شدة الضوء المرصودة في تجربة حيود الأشعة السينية. وبناءً على المعادلة (16)، نرى أن عامل الإزاحة غير المتناحي لديناهو المسؤول عن تحديدبالإضافة إلى ذلك، يوضح (15) أنقد يكون مرتبطًا بشكل مباشر بدالة كثافة الاحتمالمن أجل الإزاحة النوويةمن الموضع المتوسط. ونتيجة لذلك، من الممكن إجراء تجربة تشتت على بلورة، ومطابقة الطيف الناتج لمختلف الذراتالقيم، واستخلاص ميل كل ذرة للإزاحة النووية من.
التطبيقات

تُعدّ معاملات الإزاحة غير المتناحية مفيدةً في كثير من الأحيان لتصوّر المادة. انطلاقًا من المعادلة (15)، يمكننا تعريف أشكال بيضاوية ذات احتمالية ثابتة والتي، أينهو ثابت ما. وقد استُخدمت هذه " الأشكال البيضاوية الاهتزازية " لتوضيح البنى البلورية. [ 9 ] بدلاً من ذلك، يمكن استخدام أسطح متوسط مربع الإزاحة على طوليمكن تعريفها بواسطةللاطلاع على المزيد من الصور ، يُرجى مراجعة الروابط الخارجية "معرض صور ORTEP المُتتبعة بالأشعة"، و"ورقة بحثية من تأليف روسيل وآخرون عام 2005 "، و"ورقة بحثية من تأليف كورستيليف ونولر عام 2009". كما يتم تحسين معاملات الإزاحة غير المتناحية في برامج (مثل GSAS-II [ 11 ] ) لتحليل أطياف التشتت أثناء عملية تحسين ريتفيلد .
يمكن أيضًا استخدام معامل B لتحليل الضرر الإشعاعي الناتج عن عملية علم البلورات بالأشعة السينية . يميل الضرر الإشعاعي الموضعي إلى الظهور على شكل زيادة في معامل B لذرات معينة "متضررة"، حيث تتحرك هذه الذرات بفعل الإشعاع الذي يُحدث تغييرات كيميائية. وبمقارنة معاملات B للذرات المعرضة للتلف (ذرات الأكسجين في السلسلة الجانبية للأسبارتات/الغلوتامات) والذرات غير المعرضة للتلف، يمكن تقدير درجة الضرر الإشعاعي الموجود. [ 12 ]
مراجع
- ^ ديباي ، بيتر (1913). "التدخل في Röntgenstrahlen und Wärmebewegung" . أنالين دير فيزيك (في المانيا). 348 (1): 49– 92. بيب كود : 1913AnP...348...49D . دوى : 10.1002/andp.19133480105 .
- ^ والر ، إيفار (1923). "Zur Frage der Einwirkung der Wärmebewegung auf die Interferenz von Röntgenstrahlen". Zeitschrift für Physik A (باللغة الألمانية). 17 (1): 398– 408. بيب كود : 1923ZPhy...17..398W . دوى : 10.1007/BF01328696 . S2CID 121962265 .
- ↑ ليبكين، هاري (2004). "فيزياء عوامل ديباي-والر". arXiv : cond-mat/0405023v1 .
- ↑ بهار، إيفيت؛ أتيلجان، علي رانا؛ إرمان، بوراك (1997). "التقييم المباشر للتقلبات الحرارية في البروتينات باستخدام جهد توافقي أحادي المعامل". الطي والتصميم . 2 (3): 173-181 . doi : 10.1016/S1359-0278(97)00024-2 . PMID 9218955 .
- ↑ سيمون، ستيفن هـ. (2013-06-20). أساسيات الحالة الصلبة من أكسفورد . مطبعة جامعة أكسفورد. ISBN 9780199680771. OCLC 1038069097 .
- 1 2 ترو بلود، ك.ن.؛ بورغي، هـ.ب.؛ بورزلاف، هـ.؛ دونيتز، ج.د.؛ غراماتشيولي، س.م.؛ شولز، هـ.هـ.؛ شمويلي، أ.؛ أبراهامز، س.س. (1996-09-01). "تسمية معلمات الإزاحة الذرية. تقرير لجنة فرعية معنية بتسمية معلمات الإزاحة الذرية" . مجلة أكتا كريستالوغرافيكا، القسم أ . 52 (5): 770-781 . رمز Bibcode : 1996AcCrA..52..770T . doi : 10.1107/s0108767396005697 . ISSN 0108-7673 .
- ↑ ساكوراي، جيه جيه؛ نابوليتانو، جيم (21-09-2017). ميكانيكا الكم الحديثة . مطبعة جامعة كامبريدج. doi : 10.1017/9781108499996 . ISBN 9781108499996.
- ↑ "3. ما وراء التقريب الغاوسي" . ww1.iucr.org . تم الاطلاع عليه بتاريخ 15-05-2019 .
- 1 2 بورنيت، مينيسوتا؛ جونسون، سي كيه (1996-07-01). ORTEP-III: برنامج أوك ريدج لرسم القطع الناقص الحراري لتوضيح بنية البلورات (تقرير). doi : 10.2172/369685 . OSTI 369685 .
- ↑ تورنروس، ك. و. (15-11-1994). "تحديد أوكتاهيدريدوسيلاسيسكويوكسان بواسطة حيود النيوترونات". مجلة أكتا كريستالوغرافيكا، القسم ج . 50 (11): 1646-1648 . رمز Bibcode : 1994AcCrC..50.1646T . doi : 10.1107/S0108270194005342 .
- ↑ "مساعدة لبرنامج GSAS-II" . subversion.xray.aps.anl.gov . تم الاطلاع عليه بتاريخ 30 أبريل 2019 .
- ↑ شيلي، كاثرين ل.؛ جارمان، إلسبيث ف. (14 مارس 2022). "قياس ومقارنة الضرر الإشعاعي في بنك بيانات البروتين" . نيتشر كوميونيكيشنز . 13 (1) 1314. Bibcode : 2022NatCo..13.1314S . doi : 10.1038/s41467-022-28934-0 . PMC 8921271. PMID 35288575 .
روابط خارجية
- ورقة بحثية من عام 2019 من تأليف كريستيانو ماليكا ودال كورسو. مقدمة عن عامل ديباي-والر وتطبيقاته في نظرية الكثافة الوظيفية - عامل B الذري المعتمد على درجة الحرارة: حساب من المبادئ الأولى
- معرض صور ORTEP بتقنية تتبع الأشعة - جامعة غلاسكو
- ورقة بحثية من تأليف روسيل وآخرون عام 2005 تصور الأشكال الإهليلجية الحرارية للإطار المعدني العضوي -
- ورقة بحثية من عام 2009 من تأليف كورستيليف ونولر تصور الأشكال الإهليلجية الحرارية للحمض النووي الريبوزي الناقل - تحليل الديناميكيات الهيكلية في الريبوسوم بواسطة التحسين البلوري بتقنية TLS
- ورقة كروكشانك المنشورة عام 1956 في مجلة أكتا كريستالوغرافيكا - تحليل الحركة الحرارية غير المتناحية للجزيئات في البلورات
- تقرير عام 1996 من إعداد ترو بلود وآخرون - تسمية معلمات الإزاحة الذرية، مؤرشف بتاريخ 30 أبريل 2016 في أرشيف الإنترنت (Wayback Machine).
- علم البلورات
- التشتت
- فيزياء المادة المكثفة
- بيتر ديباي
