بروتياز داخل الغشاء

البروتيازات داخل الغشاء ( IMPs )، والمعروفة أيضًا باسم البروتيازات القاطعة داخل الغشاء ( I-CLiPs )، هي إنزيمات تتميز بقدرتها على قطع النطاقات العابرة للغشاء في البروتينات الغشائية المتكاملة . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] جميع البروتيازات داخل الغشاء المعروفة هي بروتينات غشائية متكاملة ذات نطاقات عابرة للغشاء متعددة، وتقع مواقعها النشطة داخل الطبقة الدهنية الثنائية للأغشية الخلوية . [ 4 ] تُعد البروتيازات داخل الغشاء مسؤولة عن التحلل البروتيني في عملية الإشارات الخلوية المعروفة باسم التحلل البروتيني المنظم داخل الغشاء (RIP). [ 1 ] [ 5 ]

لا ترتبط البروتيازات داخل الغشاء تطورياً بالبروتيازات الذائبة الكلاسيكية ، إذ طورت مواقعها التحفيزية من خلال التطور التقاربي . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]

على الرغم من اكتشافها مؤخراً، إلا أن البروتيازات داخل الغشاء تحظى باهتمام بحثي كبير نظراً لوظائفها البيولوجية الرئيسية وأهميتها في الأمراض البشرية. [ 5 ]

تصنيف

هناك أربع مجموعات من البروتيازات داخل الغشاء، تتميز بآليتها التحفيزية : [ 5 ]

بناء

البروتيازات داخل الغشاء هي بروتينات غشائية متكاملة ، وهي بروتينات متعددة المواقع عابرة للغشاء، تحتوي على حلزونات متعددة عابرة للغشاء . [ 5 ] [ 17 ] تقع مواقعها النشطة داخل هذه الحلزونات، وتشكل بيئة مائية ضمن الطبقة الدهنية الثنائية الكارهة للماء . يُعتقد أن معظم البروتيازات داخل الغشاء تعمل كجزيئات أحادية، باستثناء بروتين البريسينيلين الذي ينشط فقط ضمن معقد بروتين غاما سيكريتاز . [ 17 ]

تم تحديد الخصائص الهيكلية لجميع المجموعات الأربع من البروتيازات داخل الغشاء باستخدام علم البلورات بالأشعة السينية أو المجهر الإلكتروني المبرد . [ 17 ]

النشاط الإنزيمي

تقوم ثلاث من المجموعات الأربع للبروتيازات الغشائية الداخلية بفصل ركائزها ضمن نطاقات عابرة للغشاء ، ويقع الرابط القابل للفصل داخل الغشاء. أما المجموعة المتبقية، وهي بروتيازات الغلوتاميل Rce1 ، فتفصل الطرف الكربوكسيلي لبروتينات CAAX . [ 17 ] تكون حركية البروتيازات الغشائية الداخلية أبطأ عمومًا من حركية البروتيازات الذائبة. [ 18 ] [ 19 ] لا تزال خصوصية الركيزة غير مفهومة تمامًا ، وتختلف اختلافًا كبيرًا بين الإنزيمات، ويُعرف مُركب غاما سيكريتاز على وجه الخصوص بتعدد ركائزه. [ 18 ] [ 20 ] وقد أُبلغ عن أن كلاً من بروتياز المعين وغاما سيكريتاز يمتلكان آلية غير عادية للتعرف على الركيزة، حيث يميزان الركائز عن غير الركائز فقط بعد تكوين مُركب بروتيني ، مما يُفسر بطء حركية الإنزيم لديهما. [ 19 ]

توزيع

توجد البروتيازات داخل الغشاء في جميع نطاقات الحياة ، وتنتشر المجموعات الأربع على نطاق واسع. [ 5 ] في حقيقيات النوى ، تحتوي جميع العضيات المرتبطة بالغشاء، باستثناء البيروكسيسومات، على بروتياز واحد على الأقل داخل الغشاء. [ 5 ]

اكتشاف

على الرغم من أن البروتيازات الذائبة تُعد من بين أقدم الإنزيمات وأكثرها دراسةً، إلا أن البروتيازات الغشائية اكتُشفت حديثًا نسبيًا. [ 21 ] [ 18 ] وقد اقترح باحثون يدرسون مرض الزهايمر ، مثل دينيس سيلكو ، التحلل البروتيني داخل الغشاء في تسعينيات القرن الماضي كآلية محتملة لمعالجة بروتين طليعة الأميلويد . [ 22 ] وكانت إمكانية حدوث التحلل المائي داخل الغشاء الكاره للماء مثيرةً للجدل في البداية. [ 21 ] [ 18 ] وكان أول بروتياز غشائي تم تحديده تجريبيًا هو بروتياز الموقع 2 في عام 1997. [ 9 ]

مراجع

  1. براون ، إم إس ؛ يي، جيه؛ راوسون، آر بي؛ غولدشتاين، جيه إل (18 فبراير 2000). "التحلل البروتيني المنظم داخل الغشاء: آلية تحكم محفوظة من البكتيريا إلى البشر" . الخلية . 100 (4): 391-398 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80675-3 . PMID 10693756 . 
  2. أوربان، إس؛ فريمان، إم (أكتوبر 2002). "يتحكم التحلل البروتيني داخل الغشاء في مسارات إشارات متنوعة عبر التطور". الرأي الحالي في علم الوراثة والتطور . 12 (5): 512-518 . doi : 10.1016/s0959-437x(02)00334-9 . PMID 12200155 . 
  3. وولف، إم إس؛ كوبان، آر (20 أغسطس 2004). "التحلل البروتيني داخل الغشاء: الموضوع والاختلافات". مجلة ساينس . 305 (5687): 1119-1123 . رمز Bibcode : 2004Sci...305.1119W . doi : 10.1126/science.1096187 . PMID 15326347 . 
  4. إيريز، إي؛ فاس، د؛ بيبي، إي (21 مايو 2009). "كيف تُخفي البروتيازات داخل الغشاء تفاعلات التحلل المائي في الغشاء". مجلة نيتشر . 459 (7245): 371-378 . رمز Bibcode : 2009Natur.459..371E . doi : 10.1038/nature08146 . PMID 19458713 . 
  5. 1 2 3 4 5 6 كوهنلي، ناتالي؛ ديديرير، فيرينا؛ ليمبرغ، ماريوس ك. (15 أغسطس 2019). "نظرة عامة على التحلل البروتيني داخل الغشاء: من الإشارات إلى تحلل البروتين" . مجلة علوم الخلية . 132 (16): jcs217745. doi : 10.1242/jcs.217745 . PMID 31416853 . 
  6. كونين، إي. في.؛ ماكاروفا، ك. س.؛ روغوزين، آي. بي.؛ دافيدوفيتش، ل.؛ ليتيلير، م. س.؛ بيليغريني، ل. (2003). "المعينات: عائلة شبه منتشرة من بروتيازات السيرين داخل الغشاء، والتي يُحتمل أنها تطورت من خلال عمليات نقل جيني أفقي متعددة قديمة" . علم الأحياء الجينومي . 4 (3): R19. doi : 10.1186 / gb-2003-4-3-r19 . PMC 153459. PMID 12620104 .  
  7. ليمبرغ، إم كيه؛ فريمان، إم. (1 نوفمبر 2007). "الآثار الوظيفية والتطورية للتحليل الجينومي المُحسَّن للبروتيازات الغشائية المعينية" . أبحاث الجينوم . 17 (11): 1634-1646 . doi : 10.1101/gr.6425307 . PMC 2045146. PMID 17938163 .  
  8. وولف، م.س. (3 فبراير 2009). " البروتيازات القاطعة للغشاء الداخلي" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 284 (21): 13969-13973 . doi : 10.1074/jbc.R800039200 . PMC 2682844. PMID 19189971 .  
  9. 1 2 راوسون، آر بي؛ زيلينسكي، NG؛ نيهاوان، د؛ أيها ج. ساكاي، ج؛ حسن، طن متري؛ تشانغ، تي واي؛ براون، MS؛ غولدشتاين، JL (ديسمبر 1997). "الاستنساخ التكميلي لـ S2P، الجين الذي يشفر البروتين المعدني المفترض المطلوب للانقسام داخل الغشاء لـ SREBPs" . الخلية الجزيئية . 1 (1): 47-57 . دوى : 10.1016/s1097-2765(00)80006-4 . بميد 9659902 . 
  10. وولف، إم إس؛ شيا، دبليو؛ أوستازيفسكي، بي إل؛ ديهل، تي إس؛ كيمبرلي، دبليو تي؛ سيلكو، دي جيه (8 أبريل 1999). "وجود حمضين أسبارتيك عبر الغشاء في بروتين بريسينيلين-1 ضروري لتحلل بروتين بريسينيلين الداخلي ونشاط إنزيم غاما سيكريتاز". مجلة نيتشر . 398 (6727): 513-517 . رمز Bibcode : 1999Natur.398..513W . doi : 10.1038/19077 . PMID 10206644 . 
  11. ^ دي ستروبير، ب. أنيرت، دبليو؛ كوبيرز، ف. سافتيج، ف؛ كريسارتس ، ك. موم، شبيبة. شروتر، EH؛ شريفيرز، V؛ وولف، MS؛ راي، WJ. الماعز، أ؛ كوبان، ر (8 أبريل 1999). "إن الأنزيم البروتيني الذي يعتمد على البريسينيلين -1 والذي يشبه جاما سيكريتيز يتوسط في إطلاق مجال Notch داخل الخلايا". طبيعة . 398 (6727): 518–22 . بيب كود : 1999Natur.398..518D . دوى : 10.1038/19083 . بميد 10206645 . 
  12. ويهوفن، أ؛ بينز، ك؛ ليمبرغ، م ك؛ أشمان، ك؛ مارتوليو، ب (21 يونيو 2002). "تحديد ببتيداز ببتيد الإشارة، وهو بروتياز أسبارتيك من نوع بريسينيلين". مجلة ساينس . 296 (5576): 2215-2218 . رمز Bibcode : 2002Sci...296.2215W . doi : 10.1126/science.1070925 . PMID 12077416 . 
  13. ^ فريدمان، إي. هاوبين، إي؛ مايلاندت، ك؛ شليجر، س؛ فروجد ، س. ليختنثالر، SF؛ كون، PH؛ ستوفر ، د. روفيلي ، ج. مارتوجليو، ب (أغسطس 2006). "SPPL2a وSPPL2b يعززان التحلل البروتيني داخل الغشاء لـ TNFalpha في الخلايا الجذعية المنشطة لتحفيز إنتاج IL-12". بيولوجيا الخلية الطبيعية . 8 (8): 843– 8. دوى : 10.1038 / ncb1440 . بميد 16829952 . 
  14. أوربان، إس؛ لي، جيه آر؛ فريمان، إم (19 أكتوبر 2001). "يُعرّف بروتين rhomboid-1 في ذبابة الفاكهة عائلة من بروتيازات السيرين الغشائية المفترضة" . مجلة Cell . 107 (2): 173-182 . doi : 10.1016/s0092-8674(01)00525-6 . PMID 11672525 . 
  15. هامبتون، شاهيناز إي.؛ دور، تيموثي إم.؛ شميدت، والتر ك. (4 مارس 2018). "Rce1: الآلية والتثبيط" . مراجعات نقدية في الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية . 53 (2): 157-174 . doi : 10.1080/10409238.2018.1431606 . PMC 5874806. PMID 29424242 .  
  16. ^ مانولاريديس، يوانيس؛ كولكارني، كيران؛ دود، روجر ب. أوجاساوارا، ساتوشي؛ تشانغ، زيجو. بينيفا، جانكا؛ أورايلي، نيكولا؛ هانراهان، سارة ج. طومسون، أندرو J.؛ كرونين، نورا؛ ايواتا، لذلك؛ بارفورد ، ديفيد (ديسمبر 2013). "آلية معالجة بروتين CAAX فارنيسيلاتي بواسطة بروتياز داخل الغشاء Rce1" . طبيعة . 504 (7479): 301– 305. بيب كود : 2013Natur.504..301M . دوى : 10.1038 / طبيعة 12754 . بمك 3864837 . بميد 24291792 .  
  17. 1 2 3 4 صن، لينفنغ؛ لي، شياوتشون؛ شي، ييغونغ (أبريل 2016). "علم الأحياء البنيوي للبروتيازات داخل الغشاء: رؤى آلية من رومبويد وS2P إلى غاما سيكريتاز". الرأي الحالي في علم الأحياء البنيوي . 37 : 97-107 . doi : 10.1016/j.sbi.2015.12.008 . PMID 26811996 . 
  18. 1 2 3 4 بيرد، هيستر أ؛ بارنيول-زيكوتا، مارتا؛ يانغ، جيان. فيرهيلست ، ستيفن إتش إل (15 نوفمبر 2019). “اكتشاف الأدوار الخلوية للبروتياز داخل الغشاء”. ACS البيولوجيا الكيميائية . 14 (11): 2372–2388 . دوى : 10.1021/acschembio.9b00404 . بميد 31287658 . 
  19. 1 2 ساندرز، تشارلز ر .؛ هاتشيسون، جيمس م. (أغسطس 2018). " خصائص الغشاء التي تُشكّل تطور إنزيمات الغشاء" . الرأي الحالي في البيولوجيا التركيبية . 51 : 80-91 . doi : 10.1016/j.sbi.2018.03.013 . PMC 6158105. PMID 29597094 .  
  20. غونر جي، ليشتنثالر إس إف (سبتمبر 2020). "مجموعة ركائز إنزيم غاما سيكريتاز/بريسينيلين" . ندوات في بيولوجيا الخلية والتطور . 105 : 27-42 . doi : 10.1016/j.semcdb.2020.05.019 . PMID 32616437 . 
  21. 1 2 باشكوفسكي، ساندرا؛ هسياو، جاكلين ميليسا؛ يونغ، جيسون سي؛ مونتر، ليزا ماري (يونيو 2019). "اكتشاف البروتيازات والتحلل البروتيني داخل الغشاء". الكيمياء الحيوية وبيولوجيا الخلية . 97 (3): 265-269 . Bibcode : 2019BCB....97.0186P . doi : 10.1139/bcb-2018-0186 . hdl : 1807/90632 . PMID 30102867 . 
  22. سيلكو، دينيس ج. (أغسطس 1996). "بروتين بيتا النشواني وعلم الوراثة لمرض الزهايمر" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 271 (31): 18295-18298 . doi : 10.1074/jbc.271.31.18295 . PMID 8756120 .