حركية الإنزيم

علم حركية الإنزيمات هو دراسة معدلات التفاعلات الكيميائية المحفزة بالإنزيمات . في هذا العلم، يُقاس معدل التفاعل وتُدرس تأثيرات تغيير ظروفه. ويمكن لدراسة حركية الإنزيم بهذه الطريقة أن تكشف آلية التفاعل التحفيزي لهذا الإنزيم، ودوره في عمليات الأيض ، وكيفية تنظيم نشاطه، وكيف يمكن للدواء أو المُعدِّل ( المثبط أو المنشط ) أن يؤثر على معدل التفاعل.
الإنزيم، الذي يُرمز له غالبًا بالحرف "E" في التفاعلات، هو جزيء بروتيني يعمل كمحفز حيوي لتسهيل وتسريع التفاعل الكيميائي في الخلية أو أي بيئة بيولوجية أخرى. ويتم ذلك من خلال ارتباطه بجزيء واحد أو أكثر، يُسمى الركيزة (S)، والتي يعمل عليها الإنزيم لتكوين الناتج المطلوب. ترتبط الركيزة بالموقع النشط للإنزيم لتكوين مُركب الإنزيم-الركيزة (ES)، ثم تتحول إلى مُركب الإنزيم-الناتج (EP)، ومن ثم إلى الناتج أو النواتج (P)، عبر حالة انتقالية (ES*). تُعرف هذه السلسلة من الخطوات بآلية التفاعل .
- E + S ⇄ ES ⇄ ES* ⇄ EP ⇄ E + P
عندما ترتبط الإنزيمات بركائز متعددة، مثل إنزيم ديهيدروفولات ريدوكتاز ، يمكن أن تُظهر حركية الإنزيم أيضًا تسلسل ارتباط هذه الركائز وتسلسل إطلاق النواتج. ومن أمثلة الإنزيمات التي ترتبط بركائز واحدة وتُطلق نواتج متعددة ، إنزيمات البروتياز التي تشطر ركيزة بروتينية واحدة إلى منتجين من عديد الببتيد . بينما تقوم إنزيمات أخرى بربط ركيزتين معًا، مثل إنزيم بوليميراز الحمض النووي الذي يربط نيوكليوتيدًا بالحمض النووي . على الرغم من أن هذه الآليات غالبًا ما تكون سلسلة معقدة من الخطوات، إلا أن هناك عادةً خطوة واحدة مُحددة لمعدل التفاعل تُحدد الحركية العامة للعملية بأكملها. قد تكون هذه الخطوة تفاعلًا كيميائيًا أو تغييرًا في بنية الإنزيم أو الركائز، مثل تلك المُشاركة في إطلاق النواتج من الإنزيم.
تُعدّ معرفة بنية الإنزيم مفيدة في تفسير البيانات الحركية. فعلى سبيل المثال، يمكن أن تُشير البنية إلى كيفية ارتباط الركائز والنواتج أثناء التحفيز، والتغيرات التي تحدث خلال التفاعل، وحتى دور بقايا الأحماض الأمينية المُحددة في الآلية. بعض الإنزيمات تُغير شكلها بشكل ملحوظ أثناء الآلية؛ في مثل هذه الحالات، من المفيد تحديد بنية الإنزيم بوجود نظائر الركيزة المرتبطة به، وغيابها، والتي لا تخضع للتفاعل الإنزيمي.
ليست جميع المحفزات البيولوجية إنزيمات بروتينية: فالمحفزات القائمة على الحمض النووي الريبوزي (RNA) ، مثل الريبوزيمات والريبوسومات ، ضرورية للعديد من الوظائف الخلوية ، كعملية ربط الحمض النووي الريبوزي وترجمة البروتينات . ويكمن الفرق الرئيسي بين الريبوزيمات والإنزيمات في أن محفزات الحمض النووي الريبوزي تتكون من النيوكليوتيدات ، بينما تتكون الإنزيمات من الأحماض الأمينية . كما أن الريبوزيمات تؤدي مجموعة محدودة من التفاعلات، على الرغم من إمكانية تحليل آلياتها وحركيتها وتصنيفها باستخدام نفس الأساليب.
المبادئ العامة

يستخدم التفاعل المحفز بواسطة الإنزيم نفس المواد المتفاعلة وينتج نفس النواتج التي ينتجها التفاعل غير المحفز. ومثل المحفزات الأخرى، لا تُغير الإنزيمات موضع التوازن بين المواد المتفاعلة والنواتج. [ 1 ] مع ذلك، وعلى عكس التفاعلات الكيميائية غير المحفزة، تُظهر التفاعلات المحفزة بالإنزيمات حركية تشبع. عند تركيز معين للإنزيم وتركيزات منخفضة نسبيًا للمواد المتفاعلة، يزداد معدل التفاعل خطيًا مع تركيز المادة المتفاعلة؛ وتكون جزيئات الإنزيم حرة إلى حد كبير لتحفيز التفاعل، ويعني ازدياد تركيز المادة المتفاعلة ازدياد معدل التقاء جزيئات الإنزيم وجزيئات المادة المتفاعلة. ولكن عند تركيزات عالية نسبيًا للمواد المتفاعلة، يقترب معدل التفاعل بشكل تقاربي من الحد الأقصى النظري؛ حيث تشغل المواد المتفاعلة جميع المواقع النشطة للإنزيم تقريبًا، مما يؤدي إلى التشبع، ويُحدد معدل التفاعل بمعدل دوران الإنزيم الذاتي. [ 2 ] يُرمز إلى تركيز المادة المتفاعلة الواقع في منتصف المسافة بين هاتين الحالتين الحديتين بالرمز K<sub> M</sub> . وبالتالي، فإن K M هو تركيز المادة المتفاعلة الذي تكون عنده سرعة التفاعل نصف السرعة القصوى. [ 2 ]
تتمثل الخاصيتان المهمتان لحركية الإنزيمات في مدى سهولة تشبع الإنزيم بالركيزة، وأقصى معدل يمكن أن يصل إليه. معرفة هاتين الخاصيتين تشير إلى ما قد يفعله الإنزيم في الخلية، ويمكن أن توضح كيفية استجابة الإنزيم للتغيرات في هذه الظروف. [ 3 ]
فحوصات الإنزيمات

تُعدّ فحوصات الإنزيمات إجراءات مخبرية تقيس معدل تفاعلات الإنزيمات. ولأن الإنزيمات لا تُستهلك في التفاعلات التي تحفزها، فإن هذه الفحوصات عادةً ما تتبع التغيرات في تركيز كلٍّ من المواد المتفاعلة والناتجة لقياس معدل التفاعل. وتتعدد طرق القياس، منها الفحوصات الطيفية الضوئية التي ترصد التغير في امتصاص الضوء بين النواتج والمتفاعلات، والفحوصات الإشعاعية التي تعتمد على دمج أو إطلاق النشاط الإشعاعي لقياس كمية الناتج المتكون بمرور الوقت. وتُعدّ الفحوصات الطيفية الضوئية الأكثر ملاءمةً لأنها تسمح بقياس معدل التفاعل بشكل مستمر. ورغم أن الفحوصات الإشعاعية تتطلب إزالة العينات وعدّها (أي أنها فحوصات غير مستمرة)، إلا أنها عادةً ما تكون شديدة الحساسية وقادرة على قياس مستويات منخفضة جدًا من نشاط الإنزيم. [ 4 ] ومن الطرق المشابهة استخدام مطياف الكتلة لرصد دمج أو إطلاق النظائر المستقرة أثناء تحول المادة المتفاعلة إلى ناتج. وفي بعض الأحيان، قد تفشل إحدى الفحوصات، وتكون هناك حاجة ماسة إلى إيجاد طرق لإعادة إجراء الفحص الفاشل. [ 5 ]
تستخدم أكثر فحوصات الإنزيمات حساسيةً أشعة الليزر المركزة عبر المجهر لمراقبة التغيرات في جزيئات الإنزيم المفردة أثناء تحفيزها لتفاعلاتها. وتعتمد هذه القياسات إما على تغيرات تألق العوامل المساعدة خلال آلية تفاعل الإنزيم، أو على الأصباغ الفلورية المضافة إلى مواقع محددة من البروتين لرصد الحركات التي تحدث أثناء التحفيز. [ 6 ] توفر هذه الدراسات رؤية جديدة لحركية وديناميكية الإنزيمات المفردة، على عكس حركية الإنزيمات التقليدية التي ترصد السلوك المتوسط لمجموعات من ملايين جزيئات الإنزيم. [ 7 ] [ 8 ]
يُظهر الشكل أعلاه مثالًا لمنحنى تقدم تفاعل إنزيمي . يُنتج الإنزيم الناتج بمعدل أولي خطي تقريبًا لفترة قصيرة بعد بدء التفاعل. ومع تقدم التفاعل واستهلاك المادة المتفاعلة، يتباطأ المعدل باستمرار (طالما لم تصل المادة المتفاعلة إلى مستويات التشبع). لقياس المعدل الأولي (والأقصى)، تُجرى عادةً فحوصات الإنزيم عندما يكون التفاعل قد قطع شوطًا بنسبة قليلة فقط نحو اكتماله. يعتمد طول فترة المعدل الأولي على ظروف الفحص، وقد يتراوح من أجزاء من الثانية إلى ساعات. مع ذلك، تسمح أجهزة خلط السوائل بسرعة بإجراء قياسات حركية سريعة بمعدلات أولية تقل عن ثانية واحدة. [ 9 ] تُعد هذه الفحوصات السريعة جدًا ضرورية لقياس حركية ما قبل حالة الاستقرار. [ 10 ]
تركز معظم دراسات حركية الإنزيمات على الجزء الأولي، ذي الخطية التقريبية، من تفاعلات الإنزيم. مع ذلك، من الممكن أيضًا قياس منحنى التفاعل الكامل ومطابقة هذه البيانات مع معادلة معدل غير خطية . تُسمى هذه الطريقة لقياس تفاعلات الإنزيم بتحليل منحنى التقدم. يُعد هذا النهج مفيدًا كبديل للحركية السريعة عندما يكون المعدل الأولي سريعًا جدًا بحيث يتعذر قياسه بدقة. [ 11 ]
تُقدّم إرشادات معايير الإبلاغ عن بيانات علم الإنزيمات الحد الأدنى من المعلومات اللازمة للإبلاغ الشامل عن بيانات الحركية والتوازن من دراسات أنشطة الإنزيمات، بما في ذلك الظروف التجريبية ذات الصلة. وقد وُضعت هذه الإرشادات للإبلاغ عن بيانات الإنزيمات الوظيفية بدقة وموثوقية. [ 12 ]
تفاعلات الركيزة الواحدة
تشمل الإنزيمات ذات آليات الركيزة الواحدة الإيزوميرازات مثل إيزوميراز ثلاثي فوسفات الإيزوميراز أو ميوتيز ثنائي فوسفوجليسيرات ، والليازات داخل الجزيئية مثل أدينيلات سيكلاز ، والريبوزيم المطرقة الرأس ، وهو لياز الحمض النووي الريبي. [ 13 ] مع ذلك، لا تندرج بعض الإنزيمات التي لها ركيزة واحدة فقط ضمن هذه الفئة من الآليات. يُعد الكاتالاز مثالًا على ذلك، حيث يتفاعل الإنزيم مع جزيء أول من ركيزة بيروكسيد الهيدروجين ، فيتأكسد ثم يُختزل بواسطة جزيء ثانٍ من الركيزة. على الرغم من وجود ركيزة واحدة، فإن وجود وسيط إنزيمي مُعدَّل يعني أن آلية عمل الكاتالاز هي في الواقع آلية بينغ بونغ، [ 14 ] وهو نوع من الآليات التي نناقشها في قسم تفاعلات الركائز المتعددة أدناه.
حركية ميكايليس-مينتين
بما أن التفاعلات المحفزة بالإنزيمات قابلة للإشباع، فإن معدل تحفيزها لا يُظهر استجابة خطية لزيادة تركيز المادة المتفاعلة. إذا تم قياس المعدل الأولي للتفاعل على مدى نطاق من تركيزات المادة المتفاعلة (يُشار إليها بـ [S])، فإن معدل التفاعل الأولي (يزداد معدل التفاعل مع زيادة تركيز الركيزة [S]. ومع ذلك، عندما يرتفع تركيز الركيزة [S]، يصبح الإنزيم مشبعًا بالركيزة ويصل المعدل الأولي إلى Vmax ، وهو أقصى معدل للإنزيم. [ 15 ]
في نموذج ميكايليس-مينتين الحركي لتفاعل أحادي الركيزة، يحدث تفاعل ثنائي الجزيئات أولي بين الإنزيم (E) والركيزة (S) لتكوين معقد الإنزيم-الركيزة (ES). يزداد معدل التفاعل الإنزيمي مع زيادة تركيز الركيزة حتى مستوى معين يُسمى Vmax ؛ عند Vmax ، لا تؤدي زيادة تركيز الركيزة إلى أي زيادة في معدل التفاعل لعدم وجود المزيد من الإنزيم (E) المتاح للتفاعل مع الركيزة (S). هنا، يصبح معدل التفاعل معتمدًا على معقد ES، ويتحول التفاعل إلى تفاعل أحادي الجزيء من الرتبة الصفرية. على الرغم من أن الآلية الإنزيمية لهذا التفاعل الأحادي الجزيء غير واضحة،قد تكون هذه العملية معقدة للغاية، ولكن عادةً ما توجد خطوة إنزيمية واحدة تحدد معدل التفاعل، مما يسمح بنمذجة هذا التفاعل كخطوة تحفيزية واحدة ذات ثابت معدل أحادي الجزيء ظاهري k<sub> cat</sub> . إذا كان مسار التفاعل يمر عبر وسيط واحد أو عدة وسائط، فسيكون k<sub> cat</sub> دالةً لعدة ثوابت معدل أولية، بينما في أبسط الحالات، وهي حالة تفاعل أولي واحد (مثل عدم وجود وسائط)، سيكون مطابقًا لثابت المعدل الأولي أحادي الجزيء k <sub>2 </sub>. يُطلق على ثابت المعدل أحادي الجزيء الظاهري k<sub> cat</sub> أيضًا اسم عدد مرات التحول ، ويشير إلى الحد الأقصى لعدد التفاعلات الإنزيمية المحفزة في الثانية الواحدة. [ 16 ]
تصف معادلة مايكليس-مينتين [ 17 ] كيف يعتمد معدل التفاعل (الابتدائي) v 0 على موضع توازن ارتباط الركيزة وثابت المعدل k 2. [ 18 ]
- (معادلة مايكليس-مينتين)
مع الثوابت
تُعدّ معادلة مايكليس-مينتين أساسًا لمعظم حركيات الإنزيمات أحادية الركيزة. ويقوم هذا النموذج على فرضيتين أساسيتين (إلى جانب الفرضية العامة التي تنص على أن الآلية لا تتضمن تثبيطًا للوسيط أو الناتج، ولا وجود للتأثير التآزري أو التعاوني ). الفرضية الأولى هي ما يُعرف بفرضية شبه الحالة المستقرة (أو فرضية الحالة المستقرة الزائفة)، وهي أن تركيز الإنزيم المرتبط بالركيزة (وبالتالي الإنزيم غير المرتبط أيضًا) يتغير ببطء شديد مقارنةً بتركيز كل من الناتج والركيزة، وبالتالي يمكن اعتبار التغير في تركيز المركب مع مرور الوقت مساويًا للصفر. [ 19 ]
.
الافتراض الثاني هو أن تركيز الإنزيم الكلي لا يتغير بمرور الوقت، وبالتالي
.
يُعرَّف ثابت ميكايليس ( K<sub> M</sub>) تجريبيًا بأنه التركيز الذي يكون عنده معدل تفاعل الإنزيم نصف V<sub> max</sub> ، ويمكن التحقق من ذلك باستبدال [S] = K<sub> M </sub> في معادلة ميكايليس-مينتين، ويمكن أيضًا رؤيته بيانيًا. إذا كانت الخطوة الإنزيمية المحددة للمعدل بطيئة مقارنةً بتفكك الركيزة ()، يُقارب ثابت ميكايليس ( K<sub> M </sub>) ثابت تفكك معقد ES ( K <sub>D</sub>) . [ 20 ] إذاصغير مقارنة بـثم المصطلحكما يتشكل القليل جداً من مركب ES، وبالتاليلذلك، فإن معدل تكوين المنتج هو
وبالتالي، يعتمد معدل تكوين الناتج على تركيز الإنزيم وكذلك على تركيز المادة المتفاعلة، وتشبه المعادلة تفاعلًا ثنائي الجزيئات بثابت معدل من الرتبة الثانية الزائفة.هذا الثابت هو مقياس للكفاءة التحفيزية . تصل الإنزيمات الأكثر كفاءة إلىتتراوح قيمها بين 10⁸ و10¹⁰ مول⁻¹ ثانية⁻¹ . تتميز هذه الإنزيمات بكفاءة عالية لدرجة أنها تحفز التفاعل بفعالية في كل مرة تصادف فيها جزيء الركيزة، وبذلك تكون قد وصلت إلى الحد النظري الأعلى للكفاءة ( حد الانتشار ) ؛ ويُشار إليها أحيانًا بالإنزيمات المثالية حركيًا. [ 21 ] لكن معظم الإنزيمات بعيدة كل البعد عن الكمال: القيم المتوسطة لـوتدور حولو[ 22 ]
الاستخدام المباشر لمعادلة مايكليس-مينتين لتحليل حركية المسار الزمني
يمكن استخدام السرعات المرصودة والمتوقعة من معادلة مايكليس-مينتين لنمذجة مسار اختفاء المادة المتفاعلة وإنتاج الناتج مباشرةً، وذلك من خلال دمج معادلة مايكليس-مينتين في معادلة الحركية الكيميائية من الرتبة الأولى. إلا أن هذا لا يتحقق إلا بإدراك المشكلة المرتبطة باستخدام عدد أويلر في وصف الحركية الكيميائية من الرتبة الأولى، حيث أن e − k ثابت مُجزأ يُدخل خطأً منهجياً في الحسابات، ويمكن إعادة كتابته كثابت واحد يُمثل المادة المتفاعلة المتبقية بعد كل فترة زمنية. [ 23 ]
في عام 1983، استنتج ستيوارت بيل (وكذلك بشكل مستقل سانتياغو شنيل وكلاوديو ميندوزا في عام 1997) حلاً مغلقاً لتحليل حركية مسار الزمن لآلية مايكليس-مينتين. [ 24 ] [ 25 ] الحل، المعروف باسم معادلة شنيل-ميندوزا، [ 26 ] له الشكل التالي:
حيث W[ ] هي دالة لامبرت-W [ 27 ] [ 28 ] وحيث F(t) هي
هذه المعادلة مضمنة في المعادلة أدناه، التي حصل عليها بيربيران-سانتوس، والتي تكون صالحة أيضًا عندما يكون تركيز الركيزة الأولي قريبًا من تركيز الإنزيم، [ 29 ]
حيث W[ ] هي مرة أخرى دالة لامبرت-W.
الرسوم البيانية الخطية لمعادلة مايكليس-مينتين

الرسم البياني لـ v مقابل [S] أعلاه ليس خطيًا؛ فمع أنه خطي مبدئيًا عند تركيزات [S] المنخفضة، إلا أنه ينحني ليبلغ حد التشبع عند تركيزات [S] العالية. قبل ظهور تقنيات مطابقة المنحنيات غير الخطية الحديثة على الحواسيب، كان من الصعب تقدير K<sub> M</sub> و V <sub>max </sub> بدقة بسبب هذه اللاخطية. لذلك، طوّر العديد من الباحثين نماذج خطية لمعادلة مايكليس-مينتين، مثل مخطط لاينويفر-بيرك، ومخطط إيدي-هوفستي، ومخطط هانز-وولف. جميع هذه التمثيلات الخطية مفيدة لتصوير البيانات، ولكن لا يُنصح باستخدام أي منها لتحديد المعاملات الحركية، إذ تتوفر برامج حاسوبية بسهولة تتيح تحديدًا أكثر دقة باستخدام طرق الانحدار غير الخطي. [ 30 ]
يُعدّ مخطط لاينويفر-بيرك، أو مخطط المقلوب المزدوج، طريقة شائعة لعرض البيانات الحركية. ويتم إنتاجه بأخذ مقلوب طرفي معادلة مايكليس-مينتين. [ 31 ] هذه هي الصيغة الخطية لمعادلة مايكليس-مينتين ، وتنتج خطًا مستقيمًا معادلته y = mx + c، حيث يتقاطع مع المحور y عند 1/ Vmax ، ويتقاطع مع المحور x عند −1/ KM .
لا يمكن أخذ أي قيم تجريبية عند تركيز سالب لـ 1/[S]؛ فالقيمة الحدية الدنيا 1/[S] = 0 ( نقطة التقاطع مع المحور الصادي ) تُشير إلى تركيز لانهائي للمادة المتفاعلة، حيث 1/v = 1/V max ، وبالتالي، فإن نقطة التقاطع مع المحور السيني هي استقراء للبيانات التجريبية المأخوذة عند التركيزات الموجبة. وبشكل عام، يُشوّه مخطط لاينويفر-بيرك أهمية القياسات المأخوذة عند تركيزات منخفضة للمادة المتفاعلة، وبالتالي قد يُعطي تقديرات غير دقيقة لـ V max و K M. [ 32 ] يُعد مخطط إيدي-هوفستي طريقة رسم خطية أكثر دقة . في هذه الحالة، يتم رسم v مقابل v /[S]. في التمثيل الخطي الشائع الثالث، مخطط هانز-وولف ، يتم رسم [S]/ v مقابل [S]. بشكل عام، يُمكن أن يُساعد توحيد البيانات في تقليل حجم العمل التجريبي وزيادة موثوقية النتائج، وهو مناسب للتحليل البياني والرقمي على حد سواء. [ 33 ]
الأهمية العملية للثوابت الحركية
تُعدّ دراسة حركية الإنزيمات مهمة لسببين أساسيين. أولًا، تُساعد في فهم آلية عمل الإنزيمات، وثانيًا، تُساعد في التنبؤ بسلوكها في الكائنات الحية. تُعتبر الثوابت الحركية المذكورة أعلاه، K<sub> M</sub> و V<sub> max</sub> ، بالغة الأهمية لفهم كيفية عمل الإنزيمات معًا للتحكم في عمليات الأيض . [ 34 ] ولا يُعدّ إجراء هذه التنبؤات أمرًا يسيرًا، حتى بالنسبة للأنظمة البسيطة. على سبيل المثال، يتكوّن الأوكسالوأسيتات بواسطة إنزيم نازع هيدروجين الماليت داخل الميتوكوندريا . ويمكن استهلاك الأوكسالوأسيتات بعد ذلك بواسطة إنزيمات سينثاز السترات ، أو فوسفينول بيروفات كاربوكسي كيناز ، أو أسبارتات أمينوترانسفيراز ، ليُغذي دورة حمض الستريك ، أو استحداث الجلوكوز ، أو تخليق حمض الأسبارتيك ، على التوالي. ويتطلب التنبؤ بكمية الأوكسالوأسيتات الداخلة في كل مسار معرفة تركيز الأوكسالوأسيتات، بالإضافة إلى تركيز وحركية كل من هذه الإنزيمات. يبلغ هدف التنبؤ بسلوك المسارات الأيضية أقصى درجات تعقيده عند دمج كميات هائلة من بيانات الحركية والتعبير الجيني في نماذج رياضية للكائنات الحية بأكملها. وبدلاً من ذلك، يتمثل أحد التبسيطات المفيدة لمشكلة نمذجة الأيض في تجاهل حركية الإنزيمات الأساسية والاعتماد فقط على معلومات حول قياس العناصر في شبكة التفاعلات ، وهي تقنية تُعرف بتحليل توازن التدفق . [ 35 ] [ 36 ]
حركية ميكايليس-مينتين مع وسيط
يمكن للمرء أيضًا أن ينظر في الحالة الأقل بساطة
حيث يوجد مركب مع الإنزيم ومركب وسيط، ويتحول المركب الوسيط إلى ناتج في خطوة ثانية. في هذه الحالة، لدينا معادلة مشابهة جدًا [ 37 ].
لكن الثوابت مختلفة
نرى ذلك في الحالة الحديةوبالتالي عندما تكون الخطوة الأخيرة منبما أن هذه الخطوة أسرع بكثير من الخطوة السابقة، فإننا نحصل مرة أخرى على المعادلة الأصلية. رياضياً، لدينا إذنو[ 38 ]
تفاعلات متعددة الركائز
تتبع التفاعلات متعددة الركائز معادلات سرعة معقدة تصف كيفية ارتباط الركائز وتسلسلها. يصبح تحليل هذه التفاعلات أبسط بكثير إذا تم تثبيت تركيز الركيزة A وتغيير تركيز الركيزة B. في ظل هذه الظروف، يتصرف الإنزيم تمامًا مثل إنزيم أحادي الركيزة، ويعطي رسم بياني لـ v مقابل [S] ثوابت K<sub> M</sub> و V <sub>max</sub> الظاهرية للركيزة B. إذا أُجريت مجموعة من هذه القياسات عند تراكيز ثابتة مختلفة من A، يمكن استخدام هذه البيانات لتحديد آلية التفاعل. بالنسبة لإنزيم يأخذ ركيزتين A و B ويحولهما إلى منتجين P و Q، يوجد نوعان من الآليات: آلية المعقد الثلاثي وآلية الإنزيم المُستبدل. [ 39 ]
آليات معقدة ثلاثية [ 40 ]

في هذه الإنزيمات، يرتبط كلا الركيزتين بالإنزيم في الوقت نفسه لتكوين معقد ثلاثي EAB. قد يكون ترتيب الارتباط عشوائيًا (في آلية عشوائية) أو يجب أن ترتبط الركائز بتسلسل محدد (في آلية مرتبة). عند رسم مجموعة من منحنيات v مقابل [S] (A ثابتة، B متغيرة) لإنزيم ذي آلية معقد ثلاثي في مخطط Lineweaver-Burk ، ستتقاطع مجموعة الخطوط الناتجة. [ 41 ]
تشمل الإنزيمات ذات آليات المعقد الثلاثي غلوتاثيون إس- ترانسفيراز ، [ 42 ] ديهيدروفولات ريدوكتاز [ 43 ] وبوليميراز الحمض النووي . [ 44 ]
آليات الإنزيم البديل ("بينغ بونغ") [ 45 ]
يمكن أن توجد الإنزيمات ذات آلية الإنزيم المُستبدل في حالتين: E وشكل مُعدَّل كيميائيًا من الإنزيم E*؛ يُعرف هذا الإنزيم المُعدَّل بالوسيط . في هذه الآليات، يرتبط الركيزة A، مُحوِّلًا الإنزيم إلى E*، على سبيل المثال، عن طريق نقل مجموعة كيميائية إلى الموقع النشط، ثم يُحرَّر. فقط بعد تحرير الركيزة الأولى، يمكن للركيزة B الارتباط والتفاعل مع الإنزيم المُعدَّل، مُعيدًا تكوين الشكل E غير المُعدَّل. عند رسم مجموعة من منحنيات v مقابل [S] (A ثابت، B متغير) لإنزيم ذي آلية إنزيم مُستبدل في مخطط Lineweaver-Burk، ستُنتج مجموعة من الخطوط المتوازية. يُسمى هذا المخطط بالمخطط الثانوي . [ 46 ] [ 47 ]
تشمل الإنزيمات ذات آليات الإنزيمات المُستبدلة بعض إنزيمات الأكسدة والاختزال مثل بيروكسيداز الثيوريدوكسين ، [ 48 ] وإنزيمات النقل مثل أسيل نيورامينات سيتيديل ترانسفيراز، [49] وإنزيمات السيرين البروتينية مثل التربسين والكيموتريبسين . [ 50 ] تُعد إنزيمات السيرين البروتينية عائلة شائعة ومتنوعة من الإنزيمات، بما في ذلك الإنزيمات الهاضمة (التربسين، والكيموتريبسين، والإيلاستاز)، والعديد من إنزيمات سلسلة تخثر الدم ، وغيرها الكثير. في هذه الإنزيمات، يُعد الوسيط E* نوعًا من إنزيمات الأسيل يتكون من خلال مهاجمة بقايا السيرين في الموقع النشط لرابطة ببتيدية في ركيزة بروتينية. [ 51 ]
تأثيرات الذاكرة
يمكن لكلا النوعين من الآليات إظهار ذاكرة إنزيمية ، مع اختلاف الأسباب والنتائج اختلافًا كبيرًا في الحالتين. في آليات المعقدات الثلاثية، يكون ذلك ممكنًا إذا تضمنت الآلية عمليات بطيئة ولم تكن خطوات الارتباط في حالة شبه توازن، لأن المركبات الوسيطة قد تُزال بسرعة كبيرة. وهذا قد يُولّد تعاونية ، حتى في الإنزيمات أحادية الوحدة. [ 52 ] في آلية الإنزيم المُستبدل، لا حاجة لخطوات بطيئة لتوليد تأثيرات الذاكرة. بدلًا من ذلك، بالنسبة لإنزيم له عدة ركائز بديلة، قد تختلف الخصائص الحركية لنصف التفاعل الثاني باختلاف الركائز في نصف التفاعل الأول، على الرغم من أن الإنزيم المُستبدل نفسه يبدو أنه قد تحوّل. [ 53 ]
التحفيز العكسي ومعادلة هالدين [ 54 ]
External factors may limit the ability of an enzyme to catalyse a reaction in both directions (whereas the nature of a catalyst in itself means that it cannot catalyse just one direction, according to the principle of microscopic reversibility).[55] We consider the case of an enzyme that catalyses the reaction in both directions:
The steady-state, initial rate of the reaction is
is positive if the reaction proceed in the forward direction () and negative otherwise.
Equilibrium requires that , which occurs when . This shows that thermodynamics forces a relation between the values of the four rate constants.
The values of the forward and backward maximal rates, obtained for , , and , , respectively, are and , respectively. Their ratio is not equal to the equilibrium constant, which implies that thermodynamics does not constrain the ratio of the maximal rates. This explains that enzymes can be much "better catalysts" (in terms of maximal rates) in one particular direction of the reaction.[56]
One can also derive the two Michaelis constants and . The Haldane equation is the relation .
Therefore, thermodynamics constrains the ratio between the forward and backward values, not the ratio of values.
Non-Michaelis–Menten kinetics

تتبع العديد من الأنظمة الإنزيمية المختلفة سلوكًا غير ميكايليس-مينتين. ومن الأمثلة القليلة على ذلك حركية الإنزيمات ذاتية التحفيز، والإنزيمات التعاونية والتنظيمية، والإنزيمات السطحية والخلوية، والإنزيمات المتتابعة، وما إلى ذلك. تُنتج بعض الإنزيمات منحنىً شعاعيًا (v /[S])، والذي غالبًا ما يشير إلى ارتباط تعاوني للركيزة بالموقع النشط. وهذا يعني أن ارتباط جزيء ركيزة واحد يؤثر على ارتباط جزيئات الركيزة اللاحقة. ويشيع هذا السلوك في الإنزيمات متعددة الوحدات ذات المواقع النشطة المتفاعلة. [ 57 ] هنا، تشبه آلية التعاون آلية الهيموجلوبين ، حيث يؤدي ارتباط الركيزة بموقع نشط واحد إلى تغيير ألفة المواقع النشطة الأخرى لجزيئات الركيزة. يحدث التعاون الإيجابي عندما يزيد ارتباط جزيء الركيزة الأول من ألفة المواقع النشطة الأخرى للركيزة. ويحدث التعاون السلبي عندما يقلل ارتباط الركيزة الأولى من ألفة الإنزيم لجزيئات الركيزة الأخرى. [ 58 ] تشمل الإنزيمات المُعدِّلة للتفاعلات الكيميائية إنزيم تيروسيل tRNA-سينثيتاز في الثدييات، والذي يُظهر تعاونًا سلبيًا، [ 59 ] وإنزيم أسبارتات ترانسكاربامويلاز البكتيري [ 60 ] وإنزيم فوسفوفركتوكيناز، واللذان يُظهران تعاونًا إيجابيًا. [ 61 ] يُعد التعاون شائعًا، ويمكن أن يُساعد في تنظيم استجابات الإنزيمات للتغيرات في تركيزات ركائزها. يجعل التعاون الإيجابي الإنزيمات أكثر حساسية لتركيز الركيزة [S]، ويمكن أن تُظهر أنشطتها تغيرات كبيرة ضمن نطاق ضيق من تركيز الركيزة. في المقابل، يجعل التعاون السلبي الإنزيمات غير حساسة للتغيرات الطفيفة في تركيز الركيزة [S]. [ 62 ]
تُستخدم معادلة هيل [ 63 ] غالبًا لوصف درجة التعاونية كميًا في حركيات التفاعلات غير الميكايليس-مينتين. يقيس معامل هيل المُشتق n مدى تأثير ارتباط الركيزة بموقع نشط واحد على ارتباطها بالمواقع النشطة الأخرى. يشير معامل هيل الأقل من 1 إلى تعاونية سلبية، بينما يشير المعامل الأكبر من 1 إلى تعاونية إيجابية . [ 64 ]
حركية ما قبل حالة الاستقرار

في اللحظة الأولى بعد مزج الإنزيم مع الركيزة، لا يتكون أي ناتج ولا توجد مركبات وسيطة . تُسمى دراسة الملّي ثواني القليلة التالية من التفاعل حركية ما قبل حالة الاستقرار. ولذلك، تهتم حركية ما قبل حالة الاستقرار بتكوين واستهلاك المركبات الوسيطة للإنزيم والركيزة (مثل ES أو E*) حتى الوصول إلى تركيزات حالة الاستقرار . [ 65 ]
طُبِّق هذا النهج لأول مرة على تفاعل التحلل المائي المحفز بواسطة الكيموتريبسين . [ 66 ] غالبًا ما يُعدّ الكشف عن وسيطٍ ما دليلًا حاسمًا في دراسة آلية عمل الإنزيم. على سبيل المثال، في آليات بينغ بونغ الموضحة أعلاه، يمكن للقياسات الحركية السريعة تتبع إطلاق الناتج P وقياس تكوين وسيط الإنزيم المُعدَّل E*. [ 67 ] في حالة الكيموتريبسين، يتكون هذا الوسيط من خلال هجوم السيرين النيوكليوفيلي على الركيزة في الموقع النشط وتكوين وسيط الإنزيم الأسيل. [ 68 ]
في الشكل، يُنتج الإنزيم E* بسرعة خلال الثواني الأولى من التفاعل. ثم يتباطأ معدل الإنتاج مع الوصول إلى حالة الاستقرار. تُمثل هذه المرحلة السريعة من التفاعل دورة واحدة للإنزيم. وبالتالي، فإن كمية الناتج المُحرر في هذه المرحلة، والموضحة كنقطة تقاطع مع المحور الصادي في الرسم البياني، تُعطي أيضًا كمية الإنزيم الفعال الموجود في العينة. [ 69 ]
الآليات الكيميائية
يتمثل أحد الأهداف المهمة لقياس حركية الإنزيم في تحديد الآلية الكيميائية لتفاعل الإنزيم، أي تسلسل الخطوات الكيميائية التي تحول المادة المتفاعلة إلى ناتج. ستوضح الطرق الحركية المذكورة أعلاه معدلات تكوين المركبات الوسيطة وتحولها المتبادل، لكنها لا تستطيع تحديد ماهية هذه المركبات الوسيطة بدقة. [ 70 ]
غالبًا ما تُسهم القياسات الحركية التي تُجرى في ظروف محلولية مختلفة أو على إنزيمات أو ركائز مُعدّلة تعديلًا طفيفًا في إلقاء الضوء على هذه الآلية الكيميائية، إذ تكشف عن الخطوة أو الوسائط المحددة لمعدل التفاعل. على سبيل المثال، يُعد كسر الرابطة التساهمية مع ذرة الهيدروجين خطوة شائعة لتحديد معدل التفاعل. ويمكن تحديد أي من عمليات نقل الهيدروجين المحتملة هي الخطوة المحددة لمعدل التفاعل من خلال قياس التأثيرات الحركية لاستبدال كل ذرة هيدروجين بالديوتيريوم ، وهو نظيره المستقر . سيتغير معدل التفاعل عند استبدال ذرة الهيدروجين الحرجة، وذلك بسبب تأثير النظير الحركي الأساسي ، والذي يحدث لأن الروابط مع الديوتيريوم أصعب كسرًا من الروابط مع الهيدروجين. [ 71 ] من الممكن أيضًا قياس تأثيرات مماثلة مع استبدالات نظائرية أخرى، مثل 13C / 12C و 18 O/ 16O ، لكن هذه التأثيرات أقل وضوحًا. [ 72 ]
يمكن أيضًا استخدام النظائر للكشف عن مصير أجزاء مختلفة من جزيئات الركيزة في النواتج النهائية. على سبيل المثال، يصعب أحيانًا تحديد مصدر ذرة الأكسجين في الناتج النهائي، إذ قد تكون قادمة من الماء أو من جزء من الركيزة. ويمكن تحديد ذلك من خلال الاستبدال المنهجي لنظير الأكسجين المستقر 18O في الجزيئات المختلفة المشاركة في التفاعل، والتحقق من وجود هذا النظير في الناتج. [ 73 ] كما يمكن توضيح الآلية الكيميائية من خلال دراسة الحركية وتأثيرات النظائر في ظل ظروف أس هيدروجيني مختلفة، [ 74 ] أو بتغيير أيونات المعادن أو العوامل المساعدة الأخرى المرتبطة ، [ 75 ] أو بالطفرات الموجهة للموقع لبقايا الأحماض الأمينية المحفوظة، أو بدراسة سلوك الإنزيم في وجود نظائر للركيزة (الركائز). [ 76 ]
تثبيط وتنشيط الإنزيم

مثبطات الإنزيمات هي جزيئات تقلل أو توقف نشاط الإنزيم، بينما منشطات الإنزيمات هي جزيئات تزيد من معدل التحفيز الإنزيمي. قد تكون هذه التفاعلات قابلة للعكس (أي أن إزالة المثبط تعيد نشاط الإنزيم) أو غير قابلة للعكس (أي أن المثبط يعطل الإنزيم بشكل دائم). [ 77 ]
مثبطات قابلة للعكس
تقليديًا، تُصنَّف مثبطات الإنزيمات العكوسة إلى تنافسية وغير تنافسية وغير تنافسية ، وفقًا لتأثيرها على ثابت ميكايليس-مينتين (K <sub> M </sub> ) والسرعة القصوى (V <sub>max</sub> ). وتنتج هذه التأثيرات المختلفة عن ارتباط المثبط بالإنزيم (E)، أو بمركب الإنزيم-الركيزة (ES)، أو بكليهما، على التوالي. وينشأ تقسيم هذه الفئات من مشكلة في اشتقاقها، مما يستلزم استخدام ثابتَي ارتباط مختلفين لحدث ارتباط واحد. إن ارتباط المثبط وتأثيره على النشاط الإنزيمي أمران مختلفان تمامًا، وهي مشكلة أخرى لا تُراعيها المعادلات التقليدية. في التثبيط غير التنافسي، يؤدي ارتباط المثبط إلى تثبيط الإنزيم بنسبة 100% فقط، دون الأخذ في الاعتبار أي احتمال بين هذين الحدين. [ 78 ] في التثبيط غير التنافسي، يرتبط المثبط بالإنزيم في موقعه التغايري؛ وبالتالي، تبقى ألفة الارتباط، أو مقلوب ثابت ميكايليس- مينتين ( K <sub> M </sub>)، للركيزة مع الإنزيم ثابتة. من جهة أخرى، ستنخفض قيمة Vmax مقارنةً بالإنزيم غير المُثبَّط. في مخطط لاينويفر-بيرك، يُوضَّح وجود مُثبِّط غير تنافسي بتغيّر في نقطة التقاطع مع المحور الصادي، المُعرَّفة بـ 1/Vmax . أما نقطة التقاطع مع المحور السيني، المُعرَّفة بـ −1/ Km ، فستبقى ثابتة. في التثبيط التنافسي، يرتبط المُثبِّط بالإنزيم في الموقع النشط، مُنافسًا الركيزة. ونتيجةً لذلك، ستزداد قيمة Km بينما ستبقى قيمة Vmax ثابتة . [ 79 ] كما أن الصيغة الشائعة لمصطلح التثبيط تُخفي العلاقة بين ارتباط المُثبِّط بالإنزيم وعلاقته بأي مصطلح ارتباط آخر، سواءً أكانت معادلة مايكليس-مينتين أو منحنى استجابة الجرعة المرتبط بارتباط الليجاند بالمستقبل. [ 80 ] ولتوضيح هذه العلاقة، يُمكن إجراء إعادة الترتيب التالية:
إضافة صفر إلى المقام ([I]-[I])
القسمة على [I]+K i
توضح هذه الصيغة أنه على غرار معادلة مايكليس-مينتين، حيث يعتمد معدل التفاعل على نسبة مجموعة الإنزيم المتفاعلة مع الركيزة، فإن تأثير المُثبِّط هو نتيجة لنسبة مجموعة الإنزيم المتفاعلة مع المُثبِّط. المشكلة الوحيدة في هذه المعادلة بصيغتها الحالية هي أنها تفترض تثبيطًا مطلقًا للإنزيم عند ارتباط المُثبِّط، بينما في الواقع قد يكون هناك نطاق واسع من التأثيرات، بدءًا من تثبيط كامل لتحويل الركيزة (100%) وصولًا إلى ما يزيد قليلًا عن 0%. [ 81 ] ولمراعاة ذلك، يمكن تعديل المعادلة للسماح بدرجات مختلفة من التثبيط بإضافة حد دلتا Vmax .
أو
يُمكن لهذا المصطلح تحديد النشاط الإنزيمي المتبقي عند تفاعل المُثبِّط مع الإنزيمات الفردية في المجموعة. مع ذلك، فإنّ تضمين هذا المصطلح يُتيح إمكانية التنشيط إذا كانت قيمة Vmax الثانوية أعلى من القيمة الأولية. [ 82 ] ولمراعاة إمكانية التنشيط أيضًا، يُمكن إعادة كتابة الصيغة باستبدال المُثبِّط "I" بمصطلح مُعدِّل يُشار إليه هنا بـ "X".
على الرغم من أن هذه المصطلحات تُسهّل التعامل مع التأثيرات الحركية المتعلقة بالسرعة القصوى لمعادلة مايكليس-مينتين، إلا أنها تُبرز مشاكل محتملة في المصطلح المستخدم لوصف التأثيرات المتعلقة بثابت مايكليس-مينتين ( K <sub> M </sub>). في معظم الحالات، ينبغي أن يرتبط ثابت مايكليس- مينتين ( K <sub>M</sub>) بألفة الإنزيم للركيزة، والذي قد ينتج مباشرةً عن تفاعلات الإنزيم مع مثبطاته. لذا، يُفترض أن يكون مصطلح مشابه للمصطلح المقترح أعلاه لتعديل السرعة القصوى (V <sub>max</sub>) مناسبًا في معظم الحالات: [ 83 ]
مثبطات غير قابلة للعكس
يمكن لمثبطات الإنزيمات أيضًا أن تُعطّل الإنزيمات بشكلٍ لا رجعة فيه، عادةً عن طريق تعديل بقايا الموقع النشط بروابط تساهمية. هذه التفاعلات، التي قد تُسمى ركائز الانتحار، تتبع دوال اضمحلال أُسّي ، وعادةً ما تكون قابلة للإشباع. دون التشبع، تتبع حركية من الدرجة الأولى بالنسبة للمثبط. يمكن تصنيف التثبيط غير العكوس إلى نوعين متميزين. يُعدّ الوسم بالتقارب نوعًا من التثبيط غير العكوس، حيث تُعدّل مجموعة وظيفية شديدة التفاعل بقايا حرجة تحفيزيًا على البروتين المستهدف لإحداث التثبيط. من ناحية أخرى، يتضمن التثبيط القائم على الآلية ارتباط المثبط، يليه تغييرات بوساطة الإنزيم تُحوّل الأخير إلى مجموعة تفاعلية تُعدّل الإنزيم بشكلٍ لا رجعة فيه. [ 84 ]
آليات التحفيز

يُعدّ نموذج التوافق المُستحثّ النموذج المُفضّل لتفاعل الإنزيم مع الركيزة. [ 85 ] يقترح هذا النموذج أن التفاعل الأولي بين الإنزيم والركيزة يكون ضعيفًا نسبيًا، لكن هذه التفاعلات الضعيفة تُحفّز بسرعة تغييرات بنيوية في الإنزيم تُعزّز الارتباط. كما تُقرّب هذه التغييرات البنيوية البقايا التحفيزية في الموقع النشط من الروابط الكيميائية في الركيزة التي ستتغير في التفاعل. [ 86 ] يُمكن قياس التغييرات البنيوية باستخدام الاستقطاب الدائري أو قياس التداخل ثنائي الاستقطاب . بعد حدوث الارتباط، تعمل آلية أو أكثر من آليات التحفيز على خفض طاقة الحالة الانتقالية للتفاعل من خلال توفير مسار كيميائي بديل. تشمل آليات التحفيز: التحفيز عن طريق إجهاد الرابطة؛ والتحفيز عن طريق التقارب والتوجيه؛ والتحفيز عن طريق مانحات أو مستقبلات البروتونات في الموقع النشط؛ والتحفيز التساهمي؛ والنفق الكمومي . [ 67 ] [ 87 ] يمكن للإنزيمات تسريع تفاعلات نقل الهيدروجين عن طريق النفق الكمومي، وهي ظاهرة تمر فيها الجسيمات مثل البروتونات أو الإلكترونات عبر حاجز طاقة بدلاً من المرور فوقه، وذلك بسبب طبيعتها الموجية. [ 88 ]
لا يمكن لحركية الإنزيمات أن تثبت أنماط التحفيز التي يستخدمها الإنزيم. مع ذلك، قد تشير بعض البيانات الحركية إلى احتمالات يمكن دراستها بتقنيات أخرى. على سبيل المثال، قد تشير آلية "بينغ بونغ" ذات حركية ما قبل حالة الاستقرار في مرحلة الانفجار إلى أهمية التحفيز التساهمي في آلية هذا الإنزيم. بدلاً من ذلك، قد تشير ملاحظة تأثير قوي للأس الهيدروجيني على Vmax دون KM إلى أن أحد الأحماض الأمينية في الموقع النشط يحتاج إلى أن يكون في حالة تأين معينة لحدوث التحفيز . [ 89 ]
تاريخ
في عام ١٩٠٢، اقترح فيكتور هنري نظرية كمية لحركية الإنزيمات، [ ٩٠ ] ولكن في ذلك الوقت لم تكن الأهمية التجريبية لتركيز أيون الهيدروجين معروفة بعد. بعد أن حدد بيتر لوريتز سورنسن مقياس الأس الهيدروجيني اللوغاريتمي وقدم مفهوم التخزين المؤقت في عام ١٩٠٩، [ ٩١ ] أعاد الكيميائي الألماني ليونور مايكليس والدكتورة مود ليونورا مينتين (باحثة ما بعد الدكتوراه في مختبر مايكليس آنذاك) تجارب هنري وأكدا معادلته، والتي تُعرف الآن عمومًا باسم حركية مايكليس-مينتين (وأحيانًا أيضًا حركية هنري-مايكليس-مينتين ). [ ٩٢ ] وقد طُوِّر عملهما لاحقًا بواسطة جي إي بريغز وجيه بي إس هالدين ، اللذين استنتجا معادلات حركية لا تزال تُعتبر على نطاق واسع اليوم نقطة انطلاق في نمذجة النشاط الإنزيمي. [ ٩٣ ]
تمثلت المساهمة الرئيسية لمنهج هنري-ميكايليس-مينتين في تصور تفاعلات الإنزيمات على مرحلتين. [ 94 ] في المرحلة الأولى، يرتبط الركيزة بالإنزيم بشكل عكسي، مكونًا معقد الإنزيم-الركيزة. يُطلق على هذا المعقد أحيانًا اسم معقد ميكايليس. بعد ذلك، يحفز الإنزيم الخطوة الكيميائية في التفاعل ويحرر الناتج. تُوصف حركية العديد من الإنزيمات بشكل كافٍ بواسطة نموذج ميكايليس-مينتين البسيط، ولكن جميع الإنزيمات لها حركات داخلية لا يأخذها النموذج في الحسبان، ويمكن أن يكون لها مساهمات كبيرة في حركية التفاعل الكلية. يمكن نمذجة ذلك من خلال إدخال عدة مسارات ميكايليس-مينتين مرتبطة بمعدلات متذبذبة، [ 95 ] [ 96 ] [ 97 ] وهو امتداد رياضي لآلية ميكايليس-مينتين الأساسية. [ 98 ]
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ رايتون إم إس، إيبينغ دي دي (1993). الكيمياء العامة ( الطبعة الرابعة). بوسطن: هوتون ميفلين. رقم ISBN 978-0-395-63696-1.
- 1 2 فروم إتش جيه، هارجروف إم إس (2012) حركية الإنزيمات. في: أساسيات الكيمياء الحيوية. سبرينغر، برلين، هايدلبرغ
- ↑ أوكس 2014 ، ص 90
- ↑ دانسون م، إيزنثال ر (2002). فحوصات الإنزيمات: منهج عملي . أكسفورد [أكسفوردشاير]: مطبعة جامعة أكسفورد. ISBN 978-0-19-963820-8.
- ↑ بوثنر ب، تشافيز ر، وي ج، ستروب س، فونغ كيو، شنييمان أ، سيوزداك ج (مايو 2000). "رصد التحفيز الإنزيمي باستخدام مطياف الكتلة" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 275 (18): 13455-13459 . doi : 10.1074/jbc.275.18.13455 . PMID 10788458 .
- ↑ شي إكس إس، لو إتش بي (يونيو 1999). "علم الإنزيمات على مستوى الجزيء الواحد" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 274 (23): 15967-15970 . doi : 10.1074/jbc.274.23.15967 . PMID 10347141 .
- ↑ لو إتش بي (يونيو 2004). "دراسات طيفية لجزيء واحد لديناميكيات التغيرات التركيبية في التفاعلات الإنزيمية". التكنولوجيا الحيوية الصيدلانية الحالية . 5 (3): 261-269 . doi : 10.2174/1389201043376887 . PMID 15180547 .
- ↑ شنيل جيه آر، دايسون إتش جيه ، رايت بي إي (2004). "بنية وديناميكية ووظيفة التحفيز لإنزيم ديهيدروفولات ريدوكتاز". المراجعة السنوية للفيزياء الحيوية وبنية الجزيئات الحيوية . 33 : 119-140 . doi : 10.1146/annurev.biophys.33.110502.133613 . PMID 15139807 .
- ↑ جيبسون كيو إتش (1969). " [ 6 ] الخلط السريع: التدفق المتوقف". الخلط السريع: التدفق المتوقف . طرق في علم الإنزيمات. المجلد 16. الصفحات 187-228 . doi : 10.1016/S0076-6879(69)16009-7 . ISBN 978-0-12-181873-9.
- ↑ ريندرز إم، فرير جي إم، توي دي، هيردوين بي (سبتمبر 2019). "تحليل حركي كامل قبل حالة الاستقرار لدمج النيوكليوتيدات المفردة بواسطة بوليميرازات الحمض النووي". البروتوكولات الحالية في كيمياء الأحماض النووية . 78 (1) e98. doi : 10.1002/cpnc.98 . PMID 31529783 .
- ↑ دوجلبي، آر. جي. (1995). " [ 3 ] تحليل منحنيات تقدم الإنزيم باستخدام الانحدار غير الخطي". تحليل منحنيات تقدم الإنزيم باستخدام الانحدار غير الخطي . طرق في علم الإنزيمات. المجلد 249. الصفحات 61-90 . doi : 10.1016/0076-6879(95)49031-0 . ISBN 978-0-12-182150-0PMID 7791628
- ^ كوردوفا-إيسازا أ، خيمينيز-مارمول إس، غيرا واي، سالاس ساردوي إي (يناير 2023). "مثبطات الإنزيمات من الجورجونيين والمرجان الناعم" . المخدرات البحرية . 21 (2): 104. دوى : 10.3390/md21020104 . بمك 9963996 . بميد 36827145 .
- ↑ موراي جيه بي، دونهام سي إم، سكوت دبليو جي (يناير 2002). "يبدو أن التغير التكويني المعتمد على الرقم الهيدروجيني، وليس الخطوة الكيميائية، هو العامل المحدد لمعدل تفاعل انشطار ريبوزيم رأس المطرقة" . مجلة البيولوجيا الجزيئية . 315 (2): 121-130 . doi : 10.1006/jmbi.2001.5145 . PMID 11779233. S2CID 18102624 .
- ↑ دايسروث أ، داونس أ.ل. (يوليو 1970). "الكاتالاز: الخصائص الفيزيائية والكيميائية، وآلية التحفيز، والدور الفيزيولوجي". المراجعات الفيزيولوجية . 50 (3): 319-375 . Bibcode : 1970PhyRv..50..319D . doi : 10.1152/physrev.1970.50.3.319 . PMID 4912904 .
- ↑ أوكس 2014 ، الصفحات 88-90
- ↑ دياس غوميز م، وودلي ج م (أكتوبر 2019). "اعتبارات عند قياس أداء المحفزات الحيوية" . مجلة Molecules (بازل، سويسرا) . 24 (19): 3573. doi : 10.3390/molecules24193573 . PMC 6804192. PMID 31623317 .
- ↑ ميكايليس إل. ومنتن إم إل كينيتك دير إنفيرتينويركونغ بيوتشيم. ز.1913؛ 49:333–369 الترجمة الإنجليزية تم الوصول إليها في 6 أبريل 2007
- ↑ أوكس 2014 ، ص 88
- ↑ بريغز، جي إي، وهالدين ، جي بي (1925). "ملاحظة حول حركية عمل الإنزيم" . المجلة البيوكيميائية . 19 (2): 338-339 . doi : 10.1042/bj0190338 . PMC 1259181. PMID 16743508 .
- ↑ سيبرت، إليانور؛ تريسي، تيموثي س. (2021)، "أساسيات حركية الإنزيمات: حركية إنزيمات ميكايليس-مينتين وغير ميكايليس (غير النمطية)" ، في ناجار، سواتي؛ أرجيكار، أوبيندرا أ.؛ تويدي، دونالد (محررون)، حركية الإنزيمات في استقلاب الأدوية: الأساسيات والتطبيقات ، المجلد 2342، نيويورك، نيويورك: سبرينغر الولايات المتحدة، الصفحات 3-27 ، doi : 10.1007/978-1-0716-1554-6_1 ، ISBN 978-1-0716-1554-6PMID 34272689 ، تم الاطلاع عليه بتاريخ 27 أبريل 2026
- ↑ ستروبولو، م. إي.، فالكوني، م.، كاكوري، أ. م.، ديزيديري، أ. (سبتمبر 2001). " إنزيمات فائقة الكفاءة" . علوم الحياة الخلوية والجزيئية . 58 (10): 1451-1460 . doi : 10.1007/PL00000788 . PMC 11337273. PMID 11693526. S2CID 24874575 .
- ↑ بار-إيفن أ، نور إ، سافير ي، ليبرمايستر و، دافيدي د، توفيق د.س، ميلو ر (مايو 2011). "الإنزيم متوسط الكفاءة: الاتجاهات التطورية والفيزيائية الكيميائية التي تشكل معايير الإنزيم". الكيمياء الحيوية . 50 (21): 4402-4410 . doi : 10.1021/bi2002289 . PMID 21506553 .
- ↑ والش ر، مارتن إي، دارفيش س (يناير 2010). "طريقة لوصف التفاعلات المحفزة بالإنزيمات من خلال الجمع بين معلمات حركية الإنزيم في الحالة المستقرة والتغيرات الزمنية". مجلة بيوكيميكا وبيوفيزيكا أكتا (BBA) - مواضيع عامة . 1800 (1): 1-5 . doi : 10.1016/j.bbagen.2009.10.007 . PMID 19840832 .
- ↑ بيال، إس . إل. (ديسمبر 1983). "حساب الحل الصريح لمعادلة مايكليس-مينتين". مجلة علم حركية الدواء وعلم الصيدلة الحيوية . 11 (6): 641-657 . doi : 10.1007/BF01059062 . PMID 6689584. S2CID 32571415 .
- ↑ شنيل إس، ميندوزا سي (1997). "حل مغلق الشكل لحركية الإنزيم المعتمدة على الزمن". مجلة البيولوجيا النظرية . 187 (2): 207-212 . Bibcode : 1997JThBi.187..207S . doi : 10.1006/jtbi.1997.0425 .
- ↑ إيليرتسن ج، شنيل س، والشر س (مايو 2024). "تفاعل مايكليس-مينتين عند تركيزات منخفضة للركيزة: حركية من الرتبة الأولى الزائفة وشروط الفصل الزمني" . نشرة البيولوجيا الرياضية . 86 (6) 68. doi : 10.1007/s11538-024-01295-z . PMC 11069484. PMID 38703247 .
- ↑ غودار سي تي، سوناد جيه آر، دوجلبي آر جي (يناير 1999). "تقدير المعلمات باستخدام حل مباشر لمعادلة مايكليس-مينتين المتكاملة". بيوشيميكا إت بيوفيزيكا أكتا (BBA) - بنية البروتين وعلم الإنزيمات الجزيئية . 1429 (2): 377-383 . doi : 10.1016/s0167-4838(98)00247-7 . PMID 9989222 .
- ↑ غودار سي تي، هاريس إس كيه، ماكينيرني إم جيه، سوفليتا جيه إم (ديسمبر 2004). "تحليل منحنى التقدم للتفاعلات الحركية للإنزيمات والميكروبات باستخدام حلول صريحة تعتمد على دالة لامبرت دبليو". مجلة أساليب علم الأحياء الدقيقة . 59 (3): 317-326 . doi : 10.1016/j.mimet.2004.06.013 . PMID 15488275 .
- ↑ بيربيران-سانتوس، م. ن. (2010). "معالجة عامة لحركية إنزيم هنري مايكليس-مينتين: حلول متسلسلة دقيقة وحلول تحليلية تقريبية" (ملف PDF) . مجلة ماتش للاتصالات في الكيمياء الرياضية والحاسوبية . 63 : 283.
- ↑ جونز ، م. إي. (ديسمبر 1992). "تحليل مُقدِّرات المربعات الصغرى الموزونة جبريًا لمعاملات الإنزيم" . المجلة البيوكيميائية . 288 (الجزء 2): 533-538 . doi : 10.1042/bj2880533 . PMC 1132043. PMID 1463456 .
- ↑ لينويفر، هانز؛ بيرك، دين (مارس 1934). "تحديد ثوابت تفكك الإنزيم". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 56 (3): 658-666 . Bibcode : 1934JAChS..56..658L . doi : 10.1021/ja01318a036 . ISSN 0002-7863 .
- ↑ تسينغ إس جيه، هسو جيه بي (أغسطس 1990). "مقارنة بين إجراءات تقدير المعلمات لنموذج مايكليس-مينتين". مجلة البيولوجيا النظرية . 145 (4): 457-464 . Bibcode : 1990JThBi.145..457T . doi : 10.1016/S0022-5193(05)80481-3 . PMID 2246896 .
- ↑ برافو آي جي، بوستو إف، دي أرياغا دي، فيريرو إم إيه، رودريغيز-أباريسيو إل بي، مارتينيز-بلانكو إتش، ريغليرو إيه (سبتمبر 2001). "مخطط مُعَيَّر كأداة جديدة وموفرة للوقت في تحليل حركية الإنزيمات المعقدة" . مجلة الكيمياء الحيوية . 358 (الجزء 3): 573-583 . doi : 10.1042/ bj3580573 . PMC 1222113. PMID 11577687 .
- ↑ ماكدونالد إيه جي، تيبتون كيه إف (يناير 2022). " موثوقية المعلمات وفهم وظيفة الإنزيم" . الجزيئات . 27 (1): 263. doi : 10.3390/molecules27010263 . PMC 8746786. PMID 35011495 .
- ^ ألماس إي، كوفاكس ب، فيسيك تي، أولتفاي زد إن، باراباسي آل (فبراير 2004). "التنظيم العالمي للتدفقات الأيضية في بكتيريا الإشريكية القولونية ". طبيعة . 427 (6977): 839–843 . أرخايف : q-bio/0403001 . بيب كود : 2004Natur.427..839A . دوى : 10.1038 / طبيعة02289 . بميد 14985762 . S2CID 715721 .
- ↑ ريد جيه إل، فو تي دي، شيلينغ سي إتش، بالسون بي أو (2003). "نموذج موسع على مستوى الجينوم لبكتيريا الإشريكية القولونية K-12 (iJR904 GSM/GPR)" . علم الأحياء الجينومي . 4 (9) R54. Bibcode : 2003GenBi...4..R54R . doi : 10.1186 / gb-2003-4-9-r54 . PMC 193654. PMID 12952533 .
- ↑ للاطلاع على الاشتقاق الكامل، انظر هنا
- ↑ جالاناكيس، سي إم، باتسيورا، أ، جيكاس، ف (2015). "نمذجة حركية الإنزيمات كأداة لتحسين صناعة الأغذية: نهج عملي قائم على الإنزيمات المحللة للنشا". مراجعات نقدية في علوم وتغذية الأغذية . 55 (12): 1758-1770 . doi : 10.1080/10408398.2012.725112 . PMID 24758273 .
- ↑ هندسون، في. جيه.، وشاو، دبليو. في. (مارس 2003). "آلية تفاعل المعقد الثلاثي ذي الترتيب العشوائي لإنزيم أسيتيل ترانسفيراز السيرين من الإشريكية القولونية ". الكيمياء الحيوية . 42 (10): 3113-3119 . doi : 10.1021/bi0267893 . PMID 12627979 .
- ↑ نينهاوس ك، نينهاوس غو (2017). "آليات مختلفة لتكوين المركب التحفيزي في اثنين من إنزيمات ديوكسيجيناز معالجة التربتوفان-ل" . فرونتيرز إن موليكولار بيوساينسز . 4 94. doi : 10.3389/fmolb.2017.00094 . PMC 5758539. PMID 29354636 .
- ↑ بيساريسي أ (ديسمبر 2023). "التثبيط الإنزيمي المختلط وغير التنافسي: الآليات الكامنة وعدم أهمية النموذج الرسمي ثنائي الموقع من الناحية الآلية" . مجلة تثبيط الإنزيم والكيمياء الطبية . 38 (1) 2245168. doi : 10.1080/14756366.2023.2245168 . PMC 10683834. PMID 37577806 .
- ↑ دير هـ، راينيمر ب، هوبر ر (مارس 1994). "البنية البلورية بالأشعة السينية لإنزيمات غلوتاثيون إس-ترانسفيراز السيتوبلازمية. دلالات على بنية البروتين، والتعرف على الركيزة، والوظيفة التحفيزية". المجلة الأوروبية للكيمياء الحيوية . 220 (3): 645-661 . doi : 10.1111/j.1432-1033.1994.tb18666.x . PMID 8143720 .
- ↑ ستون إس آر، موريسون جيه إف (يوليو 1988). "إنزيم ديهيدروفولات ريدوكتاز من الإشريكية القولونية : الآلية الحركية باستخدام NADPH وفوسفات ثنائي نيوكليوتيد الأدينين أسيتيل بيريدين المختزل كركائز". الكيمياء الحيوية . 27 (15): 5493-5499 . doi : 10.1021/bi00415a016 . PMID 3052577 .
- ↑ فيشر، ب. أ. (1994). الآلية الإنزيمية لبوليميرازات الحمض النووي التضاعفية في حقيقيات النوى العليا . التقدم في أبحاث الأحماض النووية والبيولوجيا الجزيئية. المجلد 47. الصفحات 371-397 . doi : 10.1016/S0079-6603(08)60257-3 . ISBN 978-0-12-540047-3PMID 8016325
- ↑ بي إيه إل، ميغاريتي سي إف، تيمسون دي جيه (يناير 2019). "إنزيم NAD(P)H كينون أوكسيدوريدوكتاز (NQO1): إنزيم يحتاج إلى قدرٍ كافٍ من الحركة، في المواضع المناسبة تمامًا" . تقارير العلوم البيولوجية . 39 (1) BSR20180459. doi : 10.1042/BSR20180459 . PMC 6328894. PMID 30518535 .
- ↑ أ. كورنيش-باودن . أساسيات حركية الإنزيم ، الطبعة المنقحة، بورتلاند: لندن، إنجلترا، (1995) ص 30-37، 56-57.
- ↑ JN Rodriguez-Lopez, MA Gilabert, J. Tudela, RNF Thorneley, and F. Garcia-Canovas. Biochemistry , 2000, 39 , 13201-13209.
- ↑ أكرمان إس إي، مولر إس (أغسطس 2003). "يشارك بيروكسيريدوكسين 2-سيستين PfTrx-Px1 في الدفاع المضاد للأكسدة لمتصورة المنجلية". علم الطفيليات الجزيئي والكيميائي الحيوي . 130 (2): 75-81 . doi : 10.1016/S0166-6851(03)00161-0 . PMID 12946843 .
- ^ برافو إي جي، بارالو إس، فيريرو إم إيه، رودريغيز-أباريسيو إل بي، مارتينيز-بلانكو إتش، ريجليرو أ (سبتمبر 2001). "الخصائص الحركية لإنزيم أسيل نيورامينات سيتيديل ترانسفيراز من الباستوريلا هيموليتيكا A2" . مجلة الكيمياء الحيوية . 358 (الجزء 3): 585-598 . دوى : 10.1042/bj3580585 . بمك 1222114 . بميد 11577688 .
- ↑ كراوت ج (1977). "بروتيازات السيرين: بنية وآلية التحفيز". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 46 (1): 331-358 . Bibcode : 1977ARBio..46..331K . doi : 10.1146/annurev.bi.46.070177.001555 . PMID 332063 .
- ↑ ليو، بين؛ سكوفيلد، كريستوفر جيه؛ ويلموث، روبرت سي. (2006). "تحليلات بنيوية على المركبات الوسيطة في تحفيز سيرين بروتياز" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 281 (33): 24024-24035 . doi : 10.1074/jbc.M600495200 . ISSN 0021-9258 . PMID 16754679 .
- ↑ كورنيش-باودن، أثيل؛ كارديناس، ماريا لوز (1987). "التعاونية في الإنزيمات أحادية الوحدة". مجلة البيولوجيا النظرية 124 ( 1): 1-23 . Bibcode : 1987JThBi.124....1C . doi : 10.1016/s0022-5193(87)80248-5 . PMID 3309473 .
- ↑ جاراباك، ريبيكا؛ ويستلي، جون (1974). "الذاكرة الإنزيمية: نتيجة الحركة التوافقية". الكيمياء الحيوية . 13 (16): 3237-3239 . doi : 10.1021/bi00713a007 . PMID 4842741 .
- ↑ نور إي، فلامهولز أ، ليبرمايستر دبليو، بار-إيفن أ، ميلو ر (سبتمبر 2013). "ملاحظة حول حركية عمل الإنزيم: تحليل يُبرز التأثيرات الديناميكية الحرارية". رسائل FEBS . 587 (17): 2772-2777 . Bibcode : 2013FEBSL.587.2772N . doi : 10.1016/j.febslet.2013.07.028 . PMID 23892083 .
- ↑ تولمان ، آر سي (يوليو 1925). "مبدأ الانعكاسية المجهرية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 11 (7): 436-439 . Bibcode : 1925PNAS...11..436T . doi : 10.1073/pnas.11.7.436 . PMC 1086044. PMID 16587035 .
- ↑ كورنيش-باودن أ (2012). أساسيات حركية الإنزيمات . وايلي-بلاك ويل.
بعض الإنزيمات أكثر فعالية كمحفزات في اتجاه معين من الاتجاه الآخر. كمثال بارز، فإن المعدلات المحددة للتفاعل الأمامي المحفز بواسطة ميثيونين أدينوسيل ترانسفيراز أكبر بحوالي 10⁵
من
تلك الخاصة بالاتجاه العكسي، على الرغم من أن ثابت التوازن قريب من الواحد (صفحة 59).
- ↑ ريكارد ج، كورنيش-باودن أ (يوليو 1987). "الإنزيمات التعاونية والتنظيمية: بعد 20 عامًا" . المجلة الأوروبية للكيمياء الحيوية . 166 (2): 255-272 . doi : 10.1111/j.1432-1033.1987.tb13510.x . PMID 3301336 .
- ↑ ها إس إتش، فيريل جيه إي (مايو 2016). "العتبات والحساسية المفرطة الناتجة عن التعاونية السلبية" . مجلة ساينس . 352 (6288): 990-993 . Bibcode : 2016Sci...352..990H . doi : 10.1126/science.aad5937 . PMC 5184821. PMID 27174675 .
- ↑ وارد، دبليو إتش، وفيرشت، إيه آر (يوليو 1988). "إنزيم تيروسيل-ترنا سينثيتاز يعمل كجزيء ثنائي غير متماثل في شحن الترنا. تفسير منطقي لنشاط نصف المواقع". الكيمياء الحيوية . 27 (15): 5525-5530 . doi : 10.1021/bi00415a021 . PMID 3179266 .
- ↑ هيلمشتيدت ك، كرابمان س، براوس جي إتش (سبتمبر 2001). "التنظيم التآزري للنشاط التحفيزي: إنزيم ترانسكاربامويلاز الأسبارتات في الإشريكية القولونية مقابل إنزيم ميوتيز الكورزمات في الخميرة " . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 65 (3): 404-21 ، جدول المحتويات. doi : 10.1128/MMBR.65.3.404-421.2001 . PMC 99034. PMID 11528003 .
- ↑ شيرمر تي، إيفانز بي آر (يناير 1990). " الأساس البنيوي للسلوك التآزري لإنزيم فوسفوفركتوكيناز". مجلة نيتشر . 343 (6254): 140-145 . Bibcode : 1990Natur.343..140S . doi : 10.1038/343140a0 . PMID 2136935. S2CID 4272821 .
- ↑ فيفولي م، بانغ ج، هارمر ن ج (نوفمبر 2017). "إنزيم متعدد الوحدات ذو موقع نصفي يحقق تعاونيته دون تغييرات بنيوية" . تقارير علمية . 7 (1) 16529. Bibcode : 2017NatSR...716529V . doi : 10.1038/ s41598-017-16421-2 . PMC 5705639. PMID 29184087 .
- ↑ هيل إيه في (1910). "الآثار المحتملة لتجمع جزيئات الهيموجلوبين على منحنيات تفككه". مجلة علم وظائف الأعضاء 40 : iv– vii.
- ↑ برينز هـ (مارس 2010). "معاملات هيل، منحنيات الاستجابة للجرعة ، والآليات التآثرية" . مجلة الكيمياء الحيوية . 3 (1): 37-44 . doi : 10.1007/s12154-009-0029-3 . PMC 2816740. PMID 19779939 .
- ↑ ساسا أ، بيرد دبليو إيه، شوك دي دي، ويلسون إس إتش (أغسطس 2013). "قياس حركية حالة الاستقرار، وحالة ما قبل الاستقرار، ودورة واحدة لنشاط جليكوزيلاز الحمض النووي" . مجلة التجارب المصورة (78) e50695. doi : 10.3791/50695 . PMC 3855924. PMID 23995844 .
- ↑ هارتلي، بي إس، وكيلبي ، بي إيه (فبراير 1954). "تفاعل إسترات بارا-نيتروفينيل مع الكيموتريبسين والأنسولين" . المجلة البيوكيميائية . 56 (2): 288-297 . doi : 10.1042/bj0560288 . PMC 1269615. PMID 13140189 .
- 1 2 فيرشت، آلان (1999). البنية والآلية في علم البروتين: دليل لتحفيز الإنزيم وطَيّ البروتين . سان فرانسيسكو: دبليو إتش فريمان. ISBN 978-0-7167-3268-6.
- ↑ وايتينغ إيه كيه، بيتيكولاس دبليو إل (يناير 1994). "تفاصيل وسيط الإنزيم الأسيل وثقب الأوكسي أنيون في تحفيز سيرين بروتياز". الكيمياء الحيوية . 33 (2): 552-561 . doi : 10.1021/bi00168a021 . PMID 8286385 .
- ↑ بيندر إم إل، بيغي-كانتون إم إل، بليكلي آر إل، بروباشر إل جيه، فيدر جيه، غونتر سي آر، وآخرون . (ديسمبر 1966). "تحديد تركيز محاليل الإنزيمات المحللة: ألفا-كيموتريبسين، تريبسين، باباين، إيلاستاز، سوبتيليزين، وأسيتيل كولين إستراز". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 88 (24): 5890-5913 . Bibcode : 1966JAChS..88.5890B . doi : 10.1021/ja00976a034 . PMID 5980876 .
- ↑ كليلاند، دبليو دبليو (أبريل 1990). "الكفاءة الحركية للوسائط الإنزيمية: حقيقة أم خيال؟". الكيمياء الحيوية . 29 (13): 3194-3197 . doi : 10.1021/bi00465a006 . PMID 2334688 .
- ↑ كليلاند، دبليو دبليو (يناير 2005). "استخدام تأثيرات النظائر لتحديد آليات الإنزيمات". أرشيف الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية . 433 (1): 2-12 . Bibcode : 2005ArBB..433....2C . doi : 10.1016/j.abb.2004.08.027 . PMID 15581561 .
- ↑ نورثروب، د.ب. (1981). "تأثير النظائر على التفاعلات المحفزة بالإنزيمات". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 50 : 103-131 . doi : 10.1146/annurev.bi.50.070181.000535 . PMID 7023356 .
- ↑ بايلي ، تي. أ.، وريتنماير، أ. و. (1986). "التحول الحيوي للأدوية: دراسات آلية باستخدام النظائر المستقرة". مجلة علم الصيدلة السريرية . 26 (6): 448-451 . doi : 10.1002/j.1552-4604.1986.tb03556.x . PMID 3734135. S2CID 39193680 .
- ↑ كليلاند، دبليو دبليو (1982). "استخدام تأثيرات النظائر لتوضيح آليات الإنزيمات". مراجعات سي آر سي النقدية في الكيمياء الحيوية . 13 (4): 385-428 . doi : 10.3109/10409238209108715 . PMID 6759038 .
- ↑ كريستيانسن، د. و. ، وكوكس، ج. د. (1999). "التحفيز بواسطة هيدروكسيد مُنشَّط بالمعادن في إنزيمات الزنك والمنغنيز المعدنية". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 68 : 33-57 . doi : 10.1146/annurev.biochem.68.1.33 . PMID 10872443 .
- ↑ كراوت، د. أ.، كارول، ك. س.، هيرشلاج، د. (2003). "تحديات في آلية عمل الإنزيم وطاقته". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 72 : 517-571 . doi : 10.1146/annurev.biochem.72.121801.161617 . PMID 12704087 .
- ↑ أوكس، ريموند س. (2012). الكيمياء الحيوية . بيرلينجتون، ماساتشوستس: جونز وبارتليت للنشر. ص 98. ISBN 978-1-4496-6137-3.
- ↑ والش ر، مارتن إي، دارفيش س (ديسمبر 2011). "محدودية تصنيفات المثبطات التقليدية". علم الأحياء التكاملي . 3 (12): 1197-1201 . doi : 10.1039/c1ib00053e . PMID 22038120 .
- ↑ كليلاند، دبليو دبليو (فبراير 1963). "حركية التفاعلات المحفزة بالإنزيمات مع اثنين أو أكثر من الركائز أو النواتج. الجزء الثالث: التنبؤ بالسرعة الابتدائية وأنماط التثبيط عن طريق الفحص". مجلة بيوكيميكا وبيوفيزيكا أكتا . 67 : 188-196 . doi : 10.1016/0006-3002(63)91816-x . PMID 14021669 .
- ↑ ستريلو جيه، ديوي دبليو، إيفرسن بي دبليو، وآخرون. فحوصات آلية عمل الإنزيمات. 1 مايو 2012 [تم التحديث في 1 أكتوبر 2012]. في: ماركوسيان إس، غروسمان إيه، باسكير إتش، وآخرون، المحررون. دليل إرشادي للفحص [إنترنت]. بيثيسدا (ماريلاند): شركة إيلي ليلي والمركز الوطني لتطوير العلوم الانتقالية؛ 2004. PMID 22553872
- ↑ والش ر (2024)، المشكلة الأساسية في نظرية تثبيط الإنزيم (نسخة أولية)، doi : 10.32388/EHYCT1
- ↑ كوبلاند، روبرت أ. (10 أبريل 2000). الإنزيمات . جون وايلي وأولاده. ص 100. ISBN 0-471-35929-7.
- ↑ والش ر، مارتن إي، دارفيش س (مايو 2007). "معادلة متعددة الاستخدامات لوصف حركية تثبيط وتنشيط الإنزيمات العكوسة: نمذجة بيتا-جالاكتوزيداز وبوتيريل كولينستراز". بيوشيميكا إت بيوفيزيكا أكتا (BBA) - مواضيع عامة . 1770 (5): 733-746 . doi : 10.1016/j.bbagen.2007.01.001 . PMID 17307293 .
- ↑ هو سي، دونغ إكس (2019). "مثبطات التيروزين كيناز غير العكوسة التي تستهدف السيستين والتفاعلات الرئيسية". الكيمياء الطبية الحالية . 26 (31): 5811-5824 . doi : 10.2174/0929867325666180713124223 . PMID 30009703 .
- ↑ كوشلاند، د. إي. (فبراير 1958). "تطبيق نظرية خصوصية الإنزيم على تخليق البروتين" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 44 (2): 98-104 . Bibcode : 1958PNAS...44...98K . doi : 10.1073 / pnas.44.2.98 . PMC 335371. PMID 16590179 .
- ↑ هامس، جي جي (يوليو 2002). "تغيرات بنيوية متعددة في التحفيز الإنزيمي". الكيمياء الحيوية . 41 (26): 8221-8228 . Bibcode : 2002Bioc...41.8221H . doi : 10.1021/bi0260839 . PMID 12081470 .
- ↑ سوتكليف إم جيه، سكراتون إن إس (يوليو 2002). "إطار مفاهيمي جديد لتحفيز الإنزيمات. نفق الهيدروجين المقترن بديناميكيات الإنزيم في إنزيمات الفلافوبروتين والكينوبروتين". المجلة الأوروبية للكيمياء الحيوية . 269 (13): 3096-3102 . doi : 10.1046/j.1432-1033.2002.03020.x . PMID 12084049 .
- ↑ أينسلي ج، لودولا أ، مولهولاند أ ج، كريستوف س ز، كارابينتشيفا-كريستوفا ت ج (2018). "دراسات مشتركة في ميكانيكا الكم والميكانيكا الجزيئية لآليات التفاعلات الإنزيمية". التقدم في كيمياء البروتين وعلم الأحياء البنيوي . 113 : 1-32 . doi : 10.1016/bs.apcsb.2018.07.001 . ISBN 978-0-12-813916-5PMID 30149903
- ↑ نورثروب دي بي، سيمبسون إف بي (أبريل 1997). "ما وراء حركية الإنزيم: التحديد المباشر للآليات بواسطة مطياف الكتلة ذي التدفق المتوقف". الكيمياء الحيوية العضوية والطبية . 5 (4): 641-644 . doi : 10.1016/s0968-0896(97)00020-5 . PMID 9158861 .
- ^ هنري الخامس (1902). "النظرية العامة لعمل بعض الانواع". كومبت. مزق. أكاد. الخيال العلمي. باريس . 135 : 916 – 919.
- ^ سورنسن بل (1909). "Enzymstudien {II}. Über die Messung und Bedeutung der Wasserstoffionenkonzentration bei enzymatischen Prozessen" [ دراسات الإنزيمات III: حول قياس وأهمية تركيز أيون الهيدروجين في العمليات الأنزيمية ] . الكيمياء الحيوية. ز. (باللغة الألمانية). 21 : 131 – 304.
- ↑ مايكليس إل ، مينتين إم (1913). "حركية عمل الإنفرتيز " . مجلة الكيمياء الحيوية (بالألمانية). 49 : 333-369 .مايكليس إل، مينتين إم إل، جونسون كيه إيه، جودي آر إس (أكتوبر 2011). "ثابت مايكليس الأصلي: ترجمة ورقة مايكليس-مينتين لعام 1913" . الكيمياء الحيوية . 50 (39): 8264-8269 . doi : 10.1021/bi201284u . PMC 3381512. PMID 21888353 .
- ↑ بريغز، جي إي، وهالدين ، جي بي (1925). "ملاحظة حول حركية عمل الإنزيم" . المجلة البيوكيميائية . 19 (2): 338-339 . doi : 10.1042/bj0190338 . PMC 1259181. PMID 16743508 .
- ↑ كورنيش-باودن أ (سبتمبر 2013). "أصول حركية الإنزيمات". رسائل FEBS . 587 (17): 2725-2730 . Bibcode : 2013FEBSL.587.2725C . doi : 10.1016/j.febslet.2013.06.009 . PMID 23791665 .
- ↑ فلومنبوم، أو.، فيلونيا، ك.، لوس، د.، ماسو، س.، كوتليت، م.، إنجلبورغس، ي.، وآخرون . (فبراير 2005). "الانحلال الأسي الممتد والارتباطات في النشاط التحفيزي لجزيئات الليباز المفردة المتذبذبة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 102 (7): 2368-2372 . Bibcode : 2005PNAS..102.2368F . doi : 10.1073/pnas.0409039102 . PMC 548972. PMID 15695587 .
- ↑ English BP, Min W, van Oijen AM, Lee KT, Luo G, Sun H, et al. (فبراير 2006). "جزيئات إنزيمية مفردة دائمة التذبذب: إعادة النظر في معادلة مايكليس-مينتين". Nature Chemical Biology . 2 (2): 87–94 . Bibcode : 2006NatCB...2...87E . doi : 10.1038/nchembio759 . PMID 16415859. S2CID 2201882 .
- ↑ لو إتش بي، شون إل، شي إكس إس (ديسمبر 1998). "ديناميكيات الإنزيمات على مستوى الجزيء الواحد". مجلة ساينس . 282 (5395): 1877-1882 . رمز Bibcode : 1998Sci...282.1877P . doi : 10.1126/science.282.5395.1877 . PMID 9836635 .
- ↑ Xue X, Liu F, Ou-Yang ZC (سبتمبر 2006). "معادلة مايكليس-مينتين لجزيء واحد تتجاوز الاضطراب شبه الساكن". Physical Review E. 74 ( 3 الجزء 1) 030902. arXiv : cond-mat/0604364 . Bibcode : 2006PhRvE..74c0902X . doi : 10.1103 /PhysRevE.74.030902 . PMID 17025584. S2CID 41674948 .
فهرس
أوكس، ريموند س (2014). الكيمياء الحيوية . بيرلينجتون، ماساتشوستس: جونز وبارتليت للنشر. ISBN 978-1-4496-6137-3.
روابط خارجية
- حركية الإنزيم
- التحفيز
