NDUFA6

إنزيم نازع هيدروجين NADH [يوبيكوينون] 1 ألفا ، الوحدة الفرعية 6، هو إنزيم يُشفَّر في الإنسان بواسطة جين NDUFA6 . [ 5 ] وهو ينتمي إلى عائلة بروتينات LYRM الفائقة ، التي تتميز بنمط محفوظ من الليوسين والتيروسين والأرجينين . [ 6 ] بروتين NDUFA6 هو وحدة فرعية من نازع هيدروجين NADH (يوبيكوينون) ، الموجود في الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ، وهو أكبر معقدات سلسلة نقل الإلكترون الخمسة . [ 7 ]

بناء

يقع جين NDUFA6 على الذراع الطويلة للكروموسوم 22 في الموضع 13.2، ويمتد على طول 5359 زوجًا من القواعد النيتروجينية. [ 5 ] ينتج هذا الجين بروتينًا بوزن 18 كيلو دالتون، يتكون من 154 حمضًا أمينيًا . [ 8 ] [ 9 ] يُعد NDUFA6 وحدة فرعية من إنزيم نازع هيدروجين NADH (يوبيكوينون) ، وهو أكبر معقدات التنفس الخلوي. يتميز هذا الإنزيم ببنية على شكل حرف L، حيث يحتوي على نطاق غشائي طويل كاره للماء ، ونطاق محب للماء في الذراع الطرفية، والذي يضم جميع مراكز الأكسدة والاختزال المعروفة وموقع ارتباط NADH. [ ٧ ] لوحظ أن النطاق الكاره للماء في الطرف الأميني (N-terminal) لديه القدرة على الانطواء على شكل حلزون ألفا يمتد عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا، بينما يتفاعل النطاق المحب للماء في الطرف الكربوكسيلي (C-terminal) مع الوحدات الفرعية الكروية للمركب الأول. يشير التركيب المحفوظ للغاية المكون من نطاقين إلى أن هذه السمة ضرورية لوظيفة البروتين، وأن النطاق الكاره للماء يعمل كمرساة لمركب نازعة هيدروجين NADH (يوبيكوينون) في الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. يُعد NDUFA6 أحد حوالي ٣١ وحدة فرعية كارهة للماء تُشكل المنطقة العابرة للغشاء في المركب الأول. يتكون التركيب الثانوي المتوقع في الأساس من حلزون ألفا، ولكن النصف الكربوكسيلي الطرفي من البروتين لديه قدرة عالية على اتخاذ شكل حلزوني ملتف. يحتوي الجزء الأميني الطرفي على صفيحة بيتا افتراضية غنية بالأحماض الأمينية الكارهة للماء، والتي قد تعمل كإشارة استيراد للميتوكوندريا. كما تم تحديد جينات كاذبة ذات صلة على أربعة كروموسومات أخرى. [ 5 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ]

وظيفة

يشفر جين NDUFA6 البشري وحدة فرعية من المركب الأول لسلسلة التنفس ، والذي ينقل الإلكترونات من NADH إلى يوبيكوينون . [ 5 ] في البداية، يرتبط NADH بالمركب الأول وينقل إلكترونين إلى حلقة الأيزوالوكسازين في الذراع الاصطناعية للفلافين أحادي النوكليوتيد (FMN) لتكوين FMNH₂ . تنتقل الإلكترونات عبر سلسلة من تجمعات الحديد والكبريت (Fe-S) في الذراع الاصطناعية، وأخيرًا إلى الإنزيم المساعد Q10 (CoQ)، الذي يُختزل إلى يوبيكوينول (CoQH₂ ) . يُغير تدفق الإلكترونات حالة الأكسدة والاختزال للبروتين، مما يؤدي إلى تغيير في بنيته وانزياح في قيمة pKa للسلسلة الجانبية القابلة للتأين، والتي بدورها تضخ أربعة أيونات هيدروجين خارج مصفوفة الميتوكوندريا. [ 7 ]

مراجع

  1. 1 2 3 ENSG00000184983، ENSG00000272765، ENSG00000281013، ENSG00000277365 GRCh38: إصدار Ensembl 89: ENSG00000273397، ENSG00000184983، ENSG00000272765، ENSG00000281013، ENSG00000277365 Ensembl ، مايو 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000022450 Ensembl ، مايو 2017
  3. "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  4. "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  5. 1 2 3 4 "Entrez Gene: NDUFA6 NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 6" .
  6. دوناليك، فيت؛ دوليزال، بافيل (مايو 2024). "تركيب بروتينات LYRM في حقيقيات النوى المبكرة لتنظيم القدرة الأيضية للميتوكوندريا الناشئة" . علم الأحياء المفتوح . 14 (5). doi : 10.1098/rsob.240021 . ISSN 2046-2441 . PMC 11293456. PMID 38772414 .   
  7. 1 2 3 دونالد فويت؛ جوديث جي فويت؛ شارلوت دبليو برات (2013). "18". أساسيات الكيمياء الحيوية : الحياة على المستوى الجزيئي ( الطبعة الرابعة). هوبوكين، نيوجيرسي: وايلي. ص 581 – 620. ISBN    9780470547847.
  8. زونغ، ن. س.، لي، هـ.، لام، م. ب.، خيمينيز، ر. س.، كيم، س. س.، دينغ، ن.، كيم، أ. ك.، تشوي، ج. هـ.، زيلايا، إ.، ليم، د.، ماير، د.، أوديبيرغ، ج.، فانغ، س.، لو، هـ. ج.، شو، ت.، فايس، ج.، دوان، هـ.، أولين، م.، ييتس، ج. ر.، أبوايلر، ر.، جي، ج.، هيرمياكوب، هـ.، بينغ، ب. (أكتوبر 2013). " دمج بيولوجيا وطب بروتينات القلب من خلال قاعدة معرفية متخصصة" . مجلة أبحاث الدورة الدموية . 113 (9): 1043-1053 . doi : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . PMC 4076475. PMID 23965338 .  
  9. "NDUFA6 - نازعة هيدروجين NADH [ يوبيكوينون ] 1 الوحدة الفرعية ألفا 6 من المركب الفرعي" . قاعدة بيانات أطلس بروتينات العضيات القلبية (COPaKB) .
  10. إيماهازيون تي، بيسكو إيه، جيلينستين يو، بروكس إيه جيه (نوفمبر 1998). "تحديد مواقع 15 جينًا من جينات المركب الأول لسلسلة نقل الإلكترون البشرية باستخدام تقنية التهجين الإشعاعي القائمة على الإنترونات". علم الوراثة الخلوية . 82 ( 1-2 ): 115-119 . doi : 10.1159/000015082 . PMID 9763677. S2CID 46818955 .  
  11. إيماهازيون تي، بروكس إيه جيه (نوفمبر 1998). "تحديد مواقع جينات سلسلة نقل الإلكترون NDUFA2، وNDUFA6، وNDUFA7، وNDUFB8، وNDUFS8 باستخدام تقنية التهجين الإشعاعي القائمة على الإنترونات". علم الوراثة الخلوية . 82 ( 1-2 ): 114. doi : 10.1159/000015081 . PMID 9763676. S2CID 46861680 .  
  12. تون سي، هوانغ دي إم، ديمبسي إيه إيه، ليو سي سي (يناير 1998). "تحديد البنية الأولية لخمس وحدات فرعية من إنزيم NADH-يوبيكوينون أوكسيدوريدوكتاز البشري". مجلة بحوث الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية . 241 (2): 589-94 . doi : 10.1006/bbrc.1997.7707 . PMID 9425316 . 

للمزيد من القراءة

تتضمن هذه المقالة نصًا من المكتبة الوطنية الأمريكية للطب ، وهو متاح للعموم .