نيل1

الموسوعة الحرة
نيل1
الهياكل المتاحة
قاعدة بيانات البروتينالبحث عن نظائر: PDBe RCSB
المعرفات
أسماء مستعارةNEIL1 ، FPG1، NEI1، hFPG1، nei مثل DNA glycosylase 1
معرفات خارجيةأوميم : 608844; إم جي آي : 1920024; هومولوجيني : 11616؛ بطاقات الجينات : NEIL1؛ OMA :NEIL1 - أخصائيو تقويم العظام
نظائرها
صِنفبشرالفأر
دخول

79661

72774

فرقة موسيقية

ENSG00000140398

ENSMUSG00000032298

يونيبروت

س96في4

س8ك4س6

تسلسل مرجعي (mRNA)

NM_001256552
NM_024608
NM_001352519
NM_001352520

رقم ن م_028347
رقم ن م_001357409

RefSeq (بروتين)

NP_001243481
NP_078884
NP_001339448
NP_001339449

رقم NP_082623
رقم NP_001344338

الموقع (UCSC)العدد 15: 75.35 – 75.36 ميجا بايتالعدد 9: 57.05 – 57.06 ميجا بايت
البحث في PubMed[3][4]
ويكي بيانات
عرض/تحرير الإنسانعرض/تحرير الماوس

إن إندونوكلياز VIII-like 1 هو إنزيم يتم ترميزه في البشر بواسطة جين NEIL1 . [5] [6]

ينتمي NEIL1 إلى فئة من جليكوزيلات الحمض النووي المتماثلة مع عائلة Fpg/Nei البكتيرية. تبدأ هذه الجليكوزيلات الخطوة الأولى في إصلاح استئصال القاعدة عن طريق شق القواعد التالفة بواسطة أنواع الأكسجين التفاعلية (ROS) وإدخال كسر في خيط الحمض النووي من خلال تفاعل اللياز المرتبط. [6]

الأهداف

يتعرف NEIL1 على (يستهدف) ويزيل بعض القواعد التالفة بـ ROS ثم يقطع الموقع الأباسي عن طريق إزالة β وδ، تاركًا نهايات الفوسفات 3' و5'. يتعرف NEIL1 على البيريميدينات المؤكسدة ، والفورماميدوبيريميدينات، وبقايا الثايمين المؤكسدة عند مجموعة الميثيل، وكلا المتماكبين الفراغيين لثايمين جليكول . [7] يبدو أن أفضل الركائز لـ NEIL1 البشري هي آفات الهيدانتوين ، والغوانيدينوهيدانتوين، والسبيروإيمينوديهيدانتوين وهي منتجات أكسدة أخرى لـ 8-أوكسو جي . NEIL1 قادر أيضًا على إزالة الآفات من الحمض النووي أحادي السلسلة وكذلك من هياكل الحمض النووي الفقاعية والمتشعبة. نظرًا لأن التعبير عن NEIL1 يعتمد على دورة الخلية، ولأنه يعمل على هياكل الحمض النووي المتشعب ويتفاعل مع PCNA و FEN-1 ، فقد تم اقتراح أن NEIL1 يعمل في إصلاح الحمض النووي المرتبط بالتضاعف.

نقص في السرطان

NEIL1 هو أحد جينات إصلاح الحمض النووي الأكثر فرطًا في الميثيل في سرطان الخلايا الحرشفية في الرأس والرقبة (HNSCC). [8] عندما تم تقييم 160 جينًا لإصلاح الحمض النووي البشري بحثًا عن الميثيل الشاذ في أورام سرطان الخلايا الحرشفية في الرأس والرقبة، كان 62٪ من الأورام مفرطة الميثيل في منطقة المحفز NEIL1، مما تسبب في قمع RNA الرسول NEIL1 وبروتين NEIL1. عندما تم تقييم 8 جينات لإصلاح الحمض النووي في أورام سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC)، [9] كان 42٪ مفرط الميثيل في منطقة المحفز NEIL1. كان هذا هو نقص إصلاح الحمض النووي الأكثر شيوعًا الموجود بين جينات إصلاح الحمض النووي الثمانية التي تم اختبارها. كان NEIL1 أيضًا أحد ستة جينات لإصلاح الحمض النووي وجد أنها مفرطة الميثيل في مناطق المحفز الخاصة بها في سرطان القولون والمستقيم . [10]

في حين أن جينات إصلاح الحمض النووي الأخرى، مثل MGMT و MLH1 ، غالبًا ما يتم تقييمها من أجل القمع فوق الجيني في العديد من أنواع السرطان، [ بحاجة لمصدر ] لا يتم تقييم النقص فوق الجيني لـ NEIL1 عادةً، ولكن قد يكون له أهمية في مثل هذه السرطانات أيضًا.

يبدو أن تلف الحمض النووي هو السبب الأساسي الكامن وراء السرطان. [11] إذا كان إصلاح الحمض النووي ناقصًا، يميل تلف الحمض النووي إلى التراكم. قد يؤدي هذا التلف الزائد في الحمض النووي إلى زيادة الأخطاء الطفرية أثناء تكرار الحمض النووي بسبب تخليق الآفات المعرضة للخطأ . قد يؤدي تلف الحمض النووي الزائد أيضًا إلى زيادة التغيرات الجينية بسبب الأخطاء أثناء إصلاح الحمض النووي. [12] [13] قد تؤدي مثل هذه الطفرات والتغيرات الجينية إلى ظهور السرطان (انظر الأورام الخبيثة ).

في سرطان القولون، تسبب طفرات خط الخلايا الجرثومية في جينات إصلاح الحمض النووي 2-5% فقط من الحالات. [14] ومع ذلك، فإن مثيلة منطقة المحفز لجينات إصلاح الحمض النووي (بما في ذلك NEIL1 [10] )، ترتبط غالبًا بسرطان القولون وقد تكون عاملًا سببيًا مهمًا لهذه السرطانات. [ بحاجة لمصدر ]

الاحتفاظ بالذاكرة

يعمل NEIL1 على تعزيز الاحتفاظ بالذاكرة المكانية قصيرة المدى . وقد عانت الفئران التي تفتقر إلى NEIL1 من ضعف الاحتفاظ بالذاكرة في اختبار متاهة المياه. [15]

الوقاية من السكتة الدماغية

كما يحمي NEIL1 من الخلل الوظيفي في المخ الناجم عن السكتة الدماغية الإقفارية والوفاة لدى الفئران. [15] يسبب نقص NEIL1 تلفًا في المخ ونتيجة وظيفية معيبة في نموذج الفأر للسكتة الدماغية.

انظر أيضا

مراجع

  1. ^ abc GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000140398 – Ensembl ، مايو 2017
  2. ^ abc GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000032298 – Ensembl ، مايو 2017
  3. ^ "مرجع PubMed البشري:". المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  4. ^ "مرجع PubMed الخاص بالفأرة:". المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  5. ^ Hazra TK, Izumi T, Boldogh I, Imhoff B, Kow YW, Jaruga P, Dizdaroglu M, Mitra S (مارس 2002). "تحديد وتوصيف جليكوزيلات الحمض النووي البشري لإصلاح القواعد المعدلة في الحمض النووي التالف تأكسديًا". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 99 (6): 3523–8 . doi : 10.1073/pnas.062053799 . PMC 122556. PMID  11904416 . 
  6. ^ ab “Entrez Gene: NEIL1 nei endonuclease VIII-like 1 (E. coli)”.
  7. ^ Nemec AA, Wallace SS, Sweasy JB (أكتوبر 2010). "Variant base excision repair protein: contributors to genomic instability". Seminars in Cancer Biology . 20 (5): 320– 8. doi :10.1016/j.semcancer.2010.10.010. PMC 3254599. PMID  20955798 . 
  8. ^ Chaisaingmongkol J، Popanda O، Warta R، Dyckhoff G، Herpel E، Geiselhart L، Claus R، Lasitschka F، Campos B، Oakes CC، Bermejo JL، Herold-Mende C، Plass C، Schmezer P (ديسمبر 2012). “تحدد الشاشة اللاجينية لجينات إصلاح الحمض النووي البشري مثيلة المروج الشاذة لـ NEIL1 في سرطان الخلايا الحرشفية في الرأس والرقبة”. الجين الورمي . 31 (49): 5108–16 . دوى : 10.1038/onc.2011.660 . بميد  22286769.
  9. ^ Do H, Wong NC, Murone C, John T, Solomon B, Mitchell PL, Dobrovic A (2014). "إعادة تقييم حاسمة لميثلة جين إصلاح الحمض النووي في سرطان الرئة ذو الخلايا غير الصغيرة". التقارير العلمية . 4 : 4186. رمز Bibcode : 2014NatSR...4E4186D. doi : 10.1038/srep04186. PMC 3935198. PMID  24569633 . 
  10. ^ ab Farkas SA, Vymetalkova V, Vodickova L, Vodicka P, Nilsson TK (أبريل 2014). "تغيرات مثيلة الحمض النووي في الجينات التي تحورت بشكل متكرر في سرطان القولون والمستقيم المتفرق وفي جينات مسار إصلاح الحمض النووي وإشارات Wnt/β-catenin". Epigenomics . 6 (2): 179– 91. doi :10.2217/epi.14.7. PMID  24811787.
  11. ^ Kastan MB (2008). "استجابات تلف الحمض النووي: الآليات والأدوار في الأمراض البشرية: محاضرة جائزة GHA Clowes التذكارية لعام 2007". Mol. Cancer Res . 6 (4): 517– 24. doi : 10.1158/1541-7786.MCR-08-0020 . PMID  18403632.
  12. ^ O'Hagan HM, Mohammad HP, Baylin SB (2008). "يمكن أن تؤدي عمليات كسر السلسلة المزدوجة إلى إسكات الجينات وبدء ميثلة الحمض النووي المعتمدة على SIRT1 في جزيرة CpG للمروج الخارجي". PLOS Genetics . 4 (8): e1000155. doi : 10.1371/journal.pgen.1000155 . PMC 2491723. PMID  18704159 . 
  13. ^ Cuozzo C، Porcellini A، Angrisano T، Morano A، Lee B، Di Pardo A، Messina S، Iuliano R، Fusco A، Santillo MR، Muller MT، Chiariotti L، Gottesman ME، Avvedimento EV (يوليو 2007). “تلف الحمض النووي، والإصلاح الموجه بالتماثل، ومثيلة الحمض النووي”. بلوس علم الوراثة . 3 (7): هـ110. دوى : 10.1371/journal.pgen.0030110 . بمك 1913100 . بميد  17616978. 
  14. ^ Jasperson KW, Tuohy TM, Neklason DW, Burt RW (يونيو 2010). "Hereditary and familial colon cancer". Gastroenterology . 138 (6): 2044– 58. doi :10.1053/j.gastro.2010.01.054. PMC 3057468. PMID 20420945  . 
  15. ^ ab Canugovi C, Yoon JS, Feldman NH, Croteau DL, Mattson MP, Bohr VA (سبتمبر 2012). "Endonuclease VIII-like 1 (NEIL1) promotes short-term spatial memory retention and protects from ischemic stroke-induced brain dysfunction and death in mice". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 109 (37): 14948– 53. Bibcode :2012PNAS..10914948C. doi : 10.1073/pnas.1204156109 . PMC 3443144. PMID  22927410 . 

قراءة إضافية

  • تاكاو م، كانو س، كوباياشي ك، تشانغ كيو إم، يوني س، فان دير هورست جي تي، ياسوي أ (نوفمبر 2002). "إن إنزيم الجليكوزيلاز الاحتياطي في الفئران التي تم تعديل جينها من خلال الجين Nth1 هو نظير وظيفي لإنزيم ني (إندونوكلياز VIII). مجلة الكيمياء الحيوية . 277 (44): 42205–13 . doi : 10.1074/jbc.M206884200 . PMID  12200441.
  • مورلاند آي، رولسيث في، لونا إل، روجنيز تي، بيوراس إم، سيبيرج إي (نوفمبر 2002). "جليكوزيلات الحمض النووي البشري لعائلة Fpg/MutM البكتيرية: مسار بديل لإصلاح 8-أوكسوجوانين ومنتجات الأكسدة الأخرى في الحمض النووي". أبحاث الأحماض النووية . 30 (22): 4926-36 . doi :10.1093/nar/gkf618. PMC  137166. PMID  12433996 .
  • Bandaru V, Sunkara S, Wallace SS, Bond JP (يوليو 2002). "جليكوزيلاز الحمض النووي البشري الجديد الذي يزيل الضرر التأكسدي للحمض النووي وهو متماثل مع نوكلياز Escherichia coli الداخلي VIII". إصلاح الحمض النووي . 1 (7): 517–29 . doi :10.1016/S1568-7864(02)00036-8. PMID  12509226.
  • Dou H, Mitra S, Hazra TK (ديسمبر 2003). "إصلاح القواعد المؤكسدة في هياكل فقاعات الحمض النووي بواسطة جليكوزيلات الحمض النووي البشرية NEIL1 وNEIL2". مجلة الكيمياء الحيوية . 278 (50): 49679-84 . doi : 10.1074/jbc.M308658200 . PMID  14522990.
  • كاتافوتشي أ، ناكانو تي، ماساوكا أ، تيراتو إتش، إيواي إس، هاناوكا إف، إيدي إتش (أبريل 2004). “الخصوصية التفاضلية لمتجانسات نوكلياز الإنسان والإشريكية القولونية III و VIII للآفات القاعدية المؤكسدة”. مجلة الكيمياء البيولوجية . 279 (14): 14464– 71. دوى : 10.1074/jbc.M400393200 . بميد  14734554.
  • Bandaru V, Cooper W, Wallace SS, Doublié S (يونيو 2004). "الإفراط في الإنتاج والتبلور والتحليل البلوري الأولي لإنزيم إصلاح الحمض النووي البشري الجديد الذي يتعرف على تلف الحمض النووي التأكسدي". Acta Crystallographica القسم D. 60 ( الجزء 6): 1142–4 . doi :10.1107/S0907444904007929. PMID  15159582.
  • Doublié S, Bandaru V, Bond JP, Wallace SS (يوليو 2004). "يكشف التركيب البلوري للإنزيم البشري المشابه للإنزيم VIII-like 1 (NEIL1) عن نمط إصبع خالٍ من الزنك مطلوب لنشاط الجليكوزيلاز". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 101 (28): 10284– 9. Bibcode :2004PNAS..10110284D. doi : 10.1073/pnas.0402051101 . PMC  478564. PMID  15232006 .
  • Wiederhold L, Leppard JB, Kedar P, Karimi-Busheri F, Rasouli-Nia A, Weinfeld M, Tomkinson AE, Izumi T, Prasad R, Wilson SH, Mitra S, Hazra TK (يوليو 2004). "إصلاح استئصال قاعدة الحمض النووي المستقل عن نوكلياز AP ​​في الخلايا البشرية". الخلية الجزيئية . 15 (2): 209–20 . doi : 10.1016/j.molcel.2004.06.003 . PMID  15260972.
  • شينمورا كيه، تاو هـ، جوتو م، إيغاراشي هـ، تانيجوتشي ت، مايكاوا م، تاكيزاكي ت، سوجيمورا هـ (ديسمبر 2004). "تعطيل الطفرات في جين إصلاح الاستئصال القاعدي البشري NEIL1 في سرطان المعدة". التسرطن . 25 (12): 2311–7 . doi : 10.1093/carcin/bgh267 . PMID  15319300.
  • Mokkapati SK، Wiederhold L، Hazra TK، Mitra S (سبتمبر 2004). "تحفيز نشاط جليكوزيلات الحمض النووي لـ OGG1 بواسطة NEIL1: تعاون وظيفي بين جليكوزيلات الحمض النووي البشرية". الكيمياء الحيوية . 43 (36): 11596- 604. doi :10.1021/bi049097i. PMID  15350146.
  • Zhang QM, Yonekura S, Takao M, Yasui A, Sugiyama H, Yonei S (يناير 2005). "أنشطة جليكوزيلات الحمض النووي لبقايا الثايمين المؤكسدة في مجموعة الميثيل هي وظائف لإنزيمات hNEIL1 وhNTH1 في الخلايا البشرية". إصلاح الحمض النووي . 4 (1): 71– 9. doi :10.1016/j.dnarep.2004.08.002. PMID  15533839.
  • Das A, Hazra TK, Boldogh I, Mitra S, Bhakat KK (أكتوبر 2005). "تحريض جليكوزيلاز الحمض النووي المؤكسد للقاعدة البشرية NEIL1 بواسطة أنواع الأكسجين التفاعلية". مجلة الكيمياء الحيوية . 280 (42): 35272– 80. doi : 10.1074/jbc.M505526200 . PMID  16118226.
  • Rual JF، Venkatesan K، Hao T، Hirozane-Kishikawa T، Dricot A، Li N، Berriz GF، Gibbons FD، Dreze M، Ayivi-Guedehoussou N، Klitgord N، Simon C، Boxem M، Milstein S، Rosenberg J، Goldberg DS، تشانغ LV، وونغ إس إل، فرانكلين جي، لي إس، ألبالا جي إس، ليم جي، Fraughton C، Llamosas E، Cevik S، Bex C، Lamesch P، Sikorski RS، Vandenhaute J، Zoghbi HY، Smolyar A، Bosak S، Sequerra R، Doucette-Stamm L، Cusick ME، Hill DE، Roth FP، Vidal M ( أكتوبر 2005). “نحو خريطة بروتينية لشبكة التفاعل بين البروتين والبروتين البشري”. طبيعة . 437 (7062): 1173– 8. رمز Bibcode : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Ocampo-Hafalla MT، Altamirano A، Basu AK، Chan MK، Ocampo JE، Cummings A، Boorstein RJ، Cunningham RP، Teebor GW (أبريل 2006). "إصلاح جليكول الثايمين بواسطة hNth1 وhNeil1 يتم تعديله عن طريق اقتران القواعد والترابط بين السيس والترانس". إصلاح الحمض النووي . 5 (4): 444–54 . doi :10.1016/j.dnarep.2005.12.004. PMID  16446124.
  • Broderick P، Bagratuni T، Vijayakrishnan J، Lubbe S، Chandler I، Houlston RS (2006). "تقييم جينات NTHL1 وNEIL1 وNEIL2 وMPG وTDG وUNG وSMUG1 في الاستعداد العائلي للإصابة بسرطان القولون والمستقيم". BMC Cancer . 6 : 243. doi : 10.1186/1471-2407-6-243 . PMC  1624846. PMID  17029639 .
  • كاتافوتشي أ، ماتسوبارا م، تيراتو هـ، إيواي س، هاناوكا ف، إيد هـ (2007). "خصوصية الضرر الذي تسببه جليكوزيلات الحمض النووي البشري في الآفات المؤكسدة للبيريميدين". سلسلة ندوات الأحماض النووية . 48 (1): 175-6 . doi : 10.1093/nass/48.1.175 . PMID  17150535.
تم الاسترجاع من "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=NEIL1&oldid=1237252652"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate